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    序列分析

    • 麥魚線粒體基因組序列測(cè)定與結(jié)構(gòu)特征分析
      粒體基因組;序列分析;系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化;物種鑒定 麥魚(Rhinogobius sp.) 屬鱸形目(Perciformes),鰕虎魚亞目(Gobioidei),鰕虎魚科(Gobiidae),吻鰕虎魚屬(Rhinogobius),為安徽省池州市東至縣所特有的小型魚類之一,因盛產(chǎn)于刈麥季節(jié)而定名,與著名的廬山石魚屬于同一種類[1]。迄今對(duì)于麥魚的研究甚少,麥魚準(zhǔn)確的物種鑒定、分類地位及遺傳多樣性尚未確定,現(xiàn)僅有根據(jù)形態(tài)學(xué)特征進(jìn)行的分類研究,其養(yǎng)殖潛力尚待評(píng)估與開(kāi)

      河北漁業(yè) 2023年9期2023-09-28

    • 河南省一例番鴨源小鵝瘟病毒株的鑒定及VP1基因序列分析
      鴨;小鵝瘟;序列分析中圖分類號(hào):S858.32 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:B 文章編號(hào):1673-1085(2023)08-0054-05小鵝瘟(Gosling plague)是由小鵝瘟病毒(Gosling plague virus,GPV)引起的一種急性或亞急性的敗血性傳染病。該病具有傳播快、發(fā)病率高及致死率高等特點(diǎn),給水禽生產(chǎn)造成巨大的經(jīng)濟(jì)損失。小鵝瘟病毒主要侵害30日齡以內(nèi)的雛鵝或雛番鴨,而隨著雛鵝或雛番鴨日齡的增大,其發(fā)病率及致死率會(huì)顯著下降[1-3]。GP

      家禽科學(xué) 2023年8期2023-08-28

    • 信息化創(chuàng)新課堂的實(shí)踐診斷與優(yōu)化之道
      進(jìn)行特征環(huán)節(jié)序列分析,借助樣本數(shù)據(jù)中教學(xué)課例的信息技術(shù)應(yīng)用特征進(jìn)行分析以了解課堂教學(xué)中的技術(shù)應(yīng)用特點(diǎn),依據(jù)課堂教學(xué)課例視頻對(duì)教師的TPACK知識(shí)能力進(jìn)行評(píng)分。通過(guò)研究獲取技術(shù)支持下的課堂教學(xué)特點(diǎn)、課堂技術(shù)應(yīng)用特點(diǎn)、教師的TPACK知識(shí)能力現(xiàn)狀及未來(lái)的改進(jìn)提升路向,為持續(xù)推進(jìn)教師數(shù)字素養(yǎng)提升培訓(xùn)、技術(shù)與課堂教學(xué)的深度融合提供數(shù)據(jù)支撐和學(xué)理建議。關(guān)鍵詞:創(chuàng)新課堂;技術(shù)應(yīng)用;序列分析;TPACK中圖分類號(hào):G434 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A本文系教育部教育技術(shù)與資源發(fā)展中

      中國(guó)電化教育 2023年8期2023-08-26

    • 教師間接語(yǔ)言助力課堂“提質(zhì)增效”
      過(guò)聚類分析和序列分析對(duì)教師間接語(yǔ)言的數(shù)量結(jié)構(gòu)進(jìn)行了探索。此外,研究選取接納情感、表?yè)P(yáng)、接受或利用學(xué)生想法三類研究不足且數(shù)量較少的間接語(yǔ)言,結(jié)合定量數(shù)據(jù)對(duì)其語(yǔ)句本身的教學(xué)意義進(jìn)行了歸納與總結(jié)。研究發(fā)現(xiàn),教師間接語(yǔ)言促進(jìn)了課堂互動(dòng)質(zhì)量提升和學(xué)生高效學(xué)習(xí)。文章最后提出了三類間接語(yǔ)言的設(shè)計(jì)和使用策略:及時(shí)接納學(xué)生感受、深度利用學(xué)生觀點(diǎn)、多運(yùn)用描述式表?yè)P(yáng),以期為教師課堂教學(xué)提供具體的教學(xué)指導(dǎo)。[關(guān)鍵詞] 自然語(yǔ)言處理; 話語(yǔ)分析; 教師間接語(yǔ)言; 聚類分析; 序列分

      電化教育研究 2023年7期2023-07-21

    • 小麥光溫敏雄性不育系BS237ω-黑麥堿基因克隆及序列分析
      :基因克隆:序列分析:乳糜瀉中圖分類號(hào):S512.1:Q785 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)號(hào):A 文章編號(hào):1001-4942(2023) 03-0001-08黑麥(Secale cereale L.)1R染色體短臂(1RS)取代普通小麥1B染色體短臂(1BS)形成的1BL/1RS易位系攜帶了抗葉銹、條銹和白粉病等優(yōu)良基因,具有抗性好、豐產(chǎn)性好、適應(yīng)性廣等優(yōu)點(diǎn),在育成的小麥品種中占有30%以上的比例。黑麥種子中的醇溶性儲(chǔ)藏蛋白被稱作黑麥堿(seca-lin),1RS的引入使

      山東農(nóng)業(yè)科學(xué) 2023年3期2023-05-30

    • 紡織品霉變微生物的分離純化與鑒定
      NA-ITS序列分析,并在NCBI核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)里比較序列同源性,鑒定為5個(gè)種,分別為謝瓦式曲霉、指狀青霉、聚曲多霉、米根霉和黑曲霉。文章利用形態(tài)學(xué)方法結(jié)合ITS序列分析鑒定霉菌種類,使得獲取結(jié)果更加快速和精準(zhǔn),為紡織品防霉基礎(chǔ)研究與抗霉材料研發(fā)提供參考。 關(guān)鍵詞: ?棉織物;霉菌;形態(tài)學(xué);序列分析;純化與鑒定中圖分類號(hào): TS117.6 文獻(xiàn)標(biāo)志碼: A文章編號(hào): 1001 7003(2022)03 0040 05引用頁(yè)碼: 031106DOI: 10.

      絲綢 2022年3期2022-03-19

    • 雞傳染性喉氣管炎實(shí)驗(yàn)室診斷與序列分析
      斷;PCR;序列分析中圖分類號(hào):S816.7 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:B文章編號(hào):1673-1085(2022)01-0006-06傳染性喉氣管炎(infectious laryngotracheitis, ILT)是由傳染性喉氣管炎類病毒(infectious laryngotracheitis virus, ILTV)引起的雞的一種急性、高度接觸性呼吸道傳染病。該病主要侵害雞喉頭和氣管的上皮細(xì)胞,同時(shí)也對(duì)鼻竇、氣囊和肺等組織產(chǎn)生影響,其特征為呼吸困難、咳嗽,喉和氣

      家禽科學(xué) 2022年1期2022-03-17

    • 黃獨(dú)微型塊莖環(huán)阿屯醇合酶基因克隆與序列分析
      序列,并進(jìn)行序列分析。通過(guò)黃獨(dú)微型塊莖轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫(kù)篩選得到 CAS基因的核心片段,利用RT-PCR 技術(shù)獲得CAS 基因保守片段,采用cDNA末端快速擴(kuò)增(RACE)技術(shù)獲得CAS 基因的 3′及 5′末端序列,并采用生物信息學(xué)方法進(jìn)行序列分析。結(jié)果表明,黃獨(dú)微型塊莖CAS基因編碼序列長(zhǎng)2 280 bp,編碼814 bp的氨基酸序列,相對(duì)分子量為86 665.17 u,等電點(diǎn)為 6.21。CAS蛋白主要是由α螺旋(3366%)、延伸鏈(21.62%)以及無(wú)

      江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2022年4期2022-03-11

    • 侵染廣西番茄的番茄黃化曲葉病毒的分子鑒定
      分子鑒定; 序列分析中圖分類號(hào): S 436.412.11文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼: ADOI: 10.16688/j.zwbh.2020278Molecular identification of Tomato yellow leaf curl virus in Guangxi provinceSU Qin1#, CUI Lixian1#, CHEN Qimin2, XIE Huiting1, CHEN jinqing1,QIN Bixia1, ZHU Yingzhi

      植物保護(hù) 2021年5期2021-10-12

    • “SH6”蘋果矮化中間砧SnRK2基因的克隆及生物信息學(xué)分析
      征。[結(jié)果]序列分析表明,SnRK2的CDS序列長(zhǎng)度:SnRK2.6為956 bp,SnRK2.7為1 013 bp,SnRK2.8為1 072 bp,分別編碼318、337和357個(gè)氨基酸的蛋白質(zhì);SnRK2蛋白無(wú)明顯的疏水性,主要定位于細(xì)胞質(zhì);3種SnRK2序列相似性較高,都具有PKc_like超級(jí)家族和S_TKc家族特有的結(jié)構(gòu)。[結(jié)論]這3種SnRK2基因可能在蘋果非生物脅迫方面發(fā)揮重要作用。關(guān)鍵詞?“SH6”;SnRK2;非生物脅迫;基因克隆;序列

      安徽農(nóng)業(yè)科學(xué) 2021年9期2021-06-22

    • 芒果細(xì)菌性角斑病菌內(nèi)切葡聚糖酶基因的克隆與表達(dá)分析
      糖酶;克隆;序列分析中圖分類號(hào):S435? ? ? 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:ACloning and Expression Analysis of Endo-1,4-β-D-glucanase Gene of Xanthomonas citri pv. mangiferaeindicaeYAO Quansheng, YANG Qian, LIU Feng*, ZHAN RulinSouth Subropical Crops Research Institute, Ch

      熱帶作物學(xué)報(bào) 2021年4期2021-06-15

    • 毛頭鬼傘漆酶基因的預(yù)測(cè)及其生物信息學(xué)分析
      生物信息學(xué);序列分析;三維結(jié)構(gòu)中圖分類號(hào): S188文獻(xiàn)標(biāo)志碼: A文章編號(hào):1002-1302(2021)05-0067-08漆酶(laccase,E.C.1.10.3.2)也稱對(duì)苯二酚氧化還原酶,能對(duì)酚類物質(zhì)進(jìn)行單電子氧化,利用氧作為最終的電子受體,生成水作為唯一副產(chǎn)品。漆酶主要參與生物合成、木質(zhì)素降解、形態(tài)發(fā)生及色素的生物合成等過(guò)程[1]。漆酶廣泛存在于植物[2]、真菌[3]、細(xì)菌[4]和昆蟲[5]中,真菌漆酶參與黑色素的產(chǎn)生、子實(shí)體的形成及植物發(fā)病

      江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2021年5期2021-04-22

    • 新西蘭兔RBM4基因的克隆、序列分析及組織表達(dá)
      基因;克隆;序列分析;表達(dá);新西蘭兔中圖分類號(hào): S852.2文獻(xiàn)標(biāo)志碼: A文章編號(hào):1002-1302(2021)02-0033-04收稿日期:2020-11-09基金項(xiàng)目:現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系建設(shè)專項(xiàng)(編號(hào):CARS-43-C-1)。作者簡(jiǎn)介:魏后軍(1986—),男,江蘇南京人,碩士,助理研究員,主要從事家兔疾病防治與獸醫(yī)生物技術(shù)研究。E-mail:whj280941235@126.com。通信作者:王芳,博士,研究員,主要從事家兔重要疫病致病機(jī)制

      江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2021年2期2021-03-22

    • 廚余垃圾堆肥腐熟降解菌株的篩選與鑒定
      S rDNA序列分析進(jìn)行菌株種屬的鑒定,菌株Y1、Y3均屬于芽孢桿菌菌屬(Bacillus),其中菌株Y1為枯草芽孢桿菌(Bacillus subtilis),菌株Y3為貝萊斯芽孢桿菌(Bacillus velezensis)。關(guān)鍵詞:腐熟降解菌;纖維素酶活性;序列分析;芽孢桿菌中圖分類號(hào):S182;S141.4?? 文獻(xiàn)標(biāo)志碼: A文章編號(hào):1002-1302(2021)23-0213-06收稿日期:2021-07-02基金項(xiàng)目:國(guó)家自然科學(xué)基金面上項(xiàng)目

      江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2021年23期2021-01-02

    • 癭蚊科3種昆蟲核糖體DNA的克隆及序列分析
      克隆、測(cè)序及序列分析,并對(duì)ITS-1在麥紅吸漿蟲4個(gè)地理種群中的遺傳變異情況進(jìn)行分析。結(jié)果表明,從3種昆蟲中獲得的核糖體DNA序列包括:部分的18S rDNA(44 bp)、28S rDNA(37 bp),全部的ITS-1(487~535 bp),5.8S rDNA(121 bp)及ITS-2(336~352 bp)序列。3種昆蟲ITS序列的堿基差異百分比在17.21%~29.59%之間,共含有206個(gè)變異位點(diǎn)。ITS-1序列在麥紅吸漿蟲4個(gè)地理種群中比較

      植物保護(hù) 2020年6期2020-12-28

    • 基于數(shù)據(jù)場(chǎng)與3-D圖形表示的DNA序列分析
      -I基因? 序列分析中圖分類號(hào):Q78 ? ? ? ? ? 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A 文章編號(hào):1672-3791(2020)07(c)-0027-03DNA Sequence Analysis Based on Data Field and 3-D Graphical RepresentationZHENG Zhuo1? ZHAO Jialing1? LI Chun2*(1.School of Mathematics and Physics, Bohai Univ

      科技資訊 2020年21期2020-12-24

    • 番茄黃化曲葉病毒侵染危害海南番茄及其分子特征
      ;分子鑒定;序列分析;海南中圖分類號(hào): S432.41? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 文獻(xiàn)標(biāo)志碼: A 文章編號(hào):2095-1191(2020)08-1970-07Tomato yellow leaf curl virus infecting tomato in Hainanand its molecular characteristicsTANG Ya-fei1,2, ZHOU Yang3, ZHANG Li1, LI Zheng-g

      南方農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào) 2020年8期2020-11-02

    • 基于rDNA-ITS序列的甘肅甘南野生羊肚菌遺傳多樣性分析
      S;羊肚菌;序列分析;甘肅甘南中圖分類號(hào): S646.701 ?文獻(xiàn)標(biāo)志碼: A ?文章編號(hào):1002-1302(2020)17-0081-04羊肚菌(Morchella spp.)是羊肚菌科羊肚菌屬所有種類的總稱,是一類經(jīng)濟(jì)價(jià)值很高的珍稀野生食(藥)用真菌,具有較高的營(yíng)養(yǎng)價(jià)值和藥用價(jià)值[1]。據(jù)有關(guān)資料顯示,羊肚菌含有多種生理活性物質(zhì),尤其是蛋白質(zhì)含量極為豐富,同時(shí)還含有人體必需的各類氨基酸、維生素和鐵、鋅等多種礦質(zhì)元素[2-3]。在羊肚菌的分類學(xué)研究中

      江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2020年17期2020-10-26

    • 長(zhǎng)春花茉莉酸-異亮氨酸合成酶CrJAR1生物信息學(xué)分析與原核表達(dá)
      酸合成酶, 序列分析, 三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè), 原核表達(dá)中圖分類號(hào):Q943文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A文章編號(hào):1000-3142(2020)08-1181-07Abstract:Catharanthus roseus can produce a variety of terpeniod indole alkaloids, including a variety of natural anti-cancer, but the biosynthesis content is v

      廣西植物 2020年8期2020-10-20

    • 雞皮刺螨病的PCR診斷及18S rRNA·ITS·28S rRNA基因序列分析
      刺螨;診斷;序列分析中圖分類號(hào) S831.7 ?文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼 A文章編號(hào) 0517-6611(2020)18-0104-03Abstract An ectoparasite infection occurred in a laying hen farm in Jiangsu Province. It was suspected to be Dermanyssus gallinae disease by clinical inspection and micr

      安徽農(nóng)業(yè)科學(xué) 2020年18期2020-10-09

    • 柑橘大實(shí)蠅NPC2基因的序列分析和組織表達(dá)模式
      C2基因; 序列分析; 組織表達(dá)模式中圖分類號(hào): Q 966, S 436.66文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼: ADOI: 10.16688/j.zwbh.2019235Sequence analysis and tissue expression pattern of Niemann-Pick type C2 gene in Bactrocera minaxCHEN Jian, WANG Zhaoxiang, YANG Ling, YE Haixia, MAO Li, G

      植物保護(hù) 2020年4期2020-08-25

    • “自上而下”高分辨串聯(lián)質(zhì)譜法分析德谷胰島素的序列
      自上而下”的序列分析策略,采用高分辨串聯(lián)質(zhì)譜法對(duì)德谷胰島素的氨基酸序列及B鏈C末端側(cè)鏈非蛋白修飾序列進(jìn)行了全面的分析。優(yōu)化了德谷胰島素的還原條件及串聯(lián)質(zhì)譜的碰撞條件,結(jié)果表明,聯(lián)合使用50 mmol/L三(2-羧乙基)膦及6 mol/L鹽酸胍,在45℃下反應(yīng)40 min即可充分還原德谷胰島素為兩條獨(dú)立的肽鏈;還原產(chǎn)物經(jīng)Accucore C18色譜柱分離,采用靜電場(chǎng)軌道阱高分辨串聯(lián)質(zhì)譜分析,當(dāng)高能碰撞誘導(dǎo)裂解能量分別為20(A鏈)與25(B鏈)時(shí),可獲得最豐

      分析化學(xué) 2020年8期2020-08-21

    • 蝴蝶蘭PhNAC1基因序列分析及對(duì)低溫脅迫的響應(yīng)
      低溫脅迫, 序列分析中圖分類號(hào): Q785;Q786 ?文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼: A文章編號(hào): 1000-3142(2020)06-0845-09開(kāi)放科學(xué)(資源服務(wù))標(biāo)識(shí)碼(OSID) :Abstract: NAC transcription factors are involved in many processes of plant development, which play an important role in stress response. The

      廣西植物 2020年6期2020-07-30

    • 羰基鐵對(duì)小鼠腸道大腸桿菌豐度的影響
      物;胃腸道;序列分析,DNA;大腸桿菌;小鼠[中圖分類號(hào)] R574.4;R378.21 ?[文獻(xiàn)標(biāo)志碼] A ?[文章編號(hào)] 2096-5532(2020)02-0137-03doi:10.11712/jms.2096-5532.2020.56.072 [開(kāi)放科學(xué)(資源服務(wù))標(biāo)識(shí)碼(OSID)][網(wǎng)絡(luò)出版] http://kns.cnki.net/kcms/detail/37.1517.R.20200417.1001.020.html;2020-04-1

      青島大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版) 2020年2期2020-06-08

    • 兔出血癥病毒2型的分離鑒定與序列分析
      vp60基因序列分析和病毒復(fù)制試驗(yàn),對(duì)采集的病死家兔肝臟樣本進(jìn)行病原鑒定。HA結(jié)果顯示,部分病死家兔的肝臟樣本不能引起血凝現(xiàn)象;RT-PCR結(jié)果顯示,樣品中出現(xiàn)了RHDV2的特異性條帶。對(duì)新發(fā)現(xiàn)毒株cDNA的RT-PCR產(chǎn)物進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn),所擴(kuò)增vp60基因核苷酸序列與經(jīng)典RHDV vp60基因核苷酸序列的一致性為77.5%~80.1%,與RHDV2 vp60基因核苷酸序列的一致性為93.6%~96.1%,并且與RHDV2處于同一個(gè)進(jìn)化分支。病毒復(fù)制試驗(yàn)結(jié)

      江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào) 2020年2期2020-05-27

    • 百日菊白粉菌的分子檢測(cè)與鑒定
      轉(zhuǎn)錄間隔區(qū);序列分析中圖分類號(hào):S435.672? 文獻(xiàn)標(biāo)志碼: A? 文章編號(hào):1002-1302(2020)06-0098-06百日菊(Zinnia elegans Jacq.)別稱百日草,為中藥材,以全草入藥。百日菊也是一年生草花主栽品種之一,其色彩豐富,花大、艷麗,花期長(zhǎng)達(dá)百日,故得百日菊之美名。白粉病是百日菊常見(jiàn)的最重要病害之一,在生長(zhǎng)區(qū)幾乎每年都普遍發(fā)生[1-3]。百日菊被白粉菌侵染后,最初葉片出現(xiàn)白色粉狀斑點(diǎn),后病斑擴(kuò)大或相連成片,發(fā)病后期葉

      江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2020年6期2020-05-21

    • 16種微生物蛋白酶的生物信息學(xué)分析
      物;蛋白酶;序列分析;生物信息學(xué);理化性質(zhì);蛋白結(jié)構(gòu);信號(hào)肽中圖分類號(hào): S188+.3文獻(xiàn)標(biāo)志碼: A文章編號(hào):1002-1302(2020)04-0065-08收稿日期:2018-12-14基金項(xiàng)目:北京市自然科學(xué)基金(編號(hào):2182019);北京市教育委員會(huì)項(xiàng)目(編號(hào):1-PXM2018-014306-000057/7);國(guó)家自然科學(xué)基金青年科學(xué)基金(編號(hào):51708005);北京電子科技職業(yè)學(xué)院重點(diǎn)課題(編號(hào):2019-KXZ);北京市優(yōu)秀人才資助

      江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2020年4期2020-04-16

    • 交互行為分析軟件GSEQ在課堂觀察中的應(yīng)用
      的規(guī)律。滯后序列分析法能解決這一問(wèn)題,交互行為分析軟件GSEQ能夠有效地處理行為序列數(shù)據(jù),幫助分析課堂中的師生交互模式。本文以小學(xué)科學(xué)課的觀察數(shù)據(jù)為例,通過(guò)數(shù)據(jù)獲取、數(shù)據(jù)處理、數(shù)據(jù)分析三個(gè)步驟完成交互行為分析?!娟P(guān)鍵詞】序列分析;GSEQ;數(shù)據(jù)處理;數(shù)據(jù)分析【中圖分類號(hào)】G434? 【文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼】A【論文編號(hào)】1671-7384(2020)02、03-116-04GSEQ軟件介紹GSEQ是一種用于分析基于時(shí)間先后順序的觀測(cè)數(shù)據(jù)的計(jì)算機(jī)程序。它可以計(jì)算各種簡(jiǎn)

      中小學(xué)信息技術(shù)教育 2020年3期2020-04-03

    • 白樺8個(gè)MYB基因的克隆及其序列分析
      MYB基因;序列分析中圖分類號(hào): S188文獻(xiàn)標(biāo)志碼: A文章編號(hào):1002-1302(2019)18-0093-05收稿日期:2018-05-15基金項(xiàng)目:黑龍江省教育廳項(xiàng)目(編號(hào):1352MSYYB002);研究生創(chuàng)新項(xiàng)目(編號(hào):kjcx2018-80mdjnu)。作者簡(jiǎn)介:王蓮萍(1994—),女,黑龍江省鶴崗人,碩士研究生,主要從事植物分子生物學(xué)與基因工程研究。E-mail:928718821@qq.com。通信作者:任如意,博士,教授,主要從事植

      江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2019年18期2019-11-28

    • 一株新城疫病毒F基因的克隆及其遺傳進(jìn)化分析
      基因;克隆;序列分析;遺傳進(jìn)化;雞中圖分類號(hào):Q78? ? ? ? ?文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A文章編號(hào):0439-8114(2019)15-0132-04DOI:10.14088/j.cnki.issn0439-8114.2019.15.031? ? ? ? ? ?開(kāi)放科學(xué)(資源服務(wù))標(biāo)識(shí)碼(OSID):Cloning and genetic evolution analysis of one strain of newcastle disease virusXU

      湖北農(nóng)業(yè)科學(xué) 2019年15期2019-09-15

    • 苧麻BnNramp2基因的克隆與生物信息學(xué)分析
      基因;克隆;序列分析;苧麻中圖分類號(hào):S563.101文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A文章編號(hào): 1000-4440( 2019) 03-0749-04重金屬是主要的環(huán)境污染物之一,所有重金屬對(duì)生物都有潛在的危害作用[1-6]。天然抗性相關(guān)巨噬細(xì)胞蛋白家族(Natural resistance-associated macrophage protein, NRAMP)是一類廣泛存在于微生物、植物、動(dòng)物中的古老且高度保守的膜整合蛋白家族,參與大多數(shù)有機(jī)體的金屬離子(如Fe2+

      江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào) 2019年3期2019-09-10

    • 青花菜BoMYB基因的克隆與序列分析
      息學(xué)手段進(jìn)行序列分析,包括尋找同源序列、同源序列蛋白質(zhì)翻譯比對(duì)、分析翻譯所得蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)和二級(jí)結(jié)構(gòu),預(yù)測(cè)結(jié)構(gòu)域和構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)。從青花菜中克隆得到的BoMYB基因,其編碼263個(gè)氨基酸,蛋白序列中具有2個(gè)SANT結(jié)構(gòu)域。對(duì)比在擬南芥中的研究推測(cè),該基因可能在滲透脅迫響應(yīng)中起作用。系統(tǒng)發(fā)育分析結(jié)果表明,BoMYB與歐洲油菜的MYB聚為一組,它們與擬南芥的MYB處于不同分支。對(duì)BoMYB基因的克隆與序列進(jìn)行分析,為探究青花菜MYB基因的表達(dá)、功能及抗逆機(jī)理

      種子科技 2019年1期2019-09-10

    • 亞麻COBRA基因家族的鑒定與生物信息學(xué)分析
      A基因家族;序列分析;系統(tǒng)進(jìn)化分析中圖分類號(hào):S565.9 ? ? ?文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A ? ? ?文章編號(hào):1001-1463(2019)09-0033-06doi:10.3969/j.issn.1001-1463.2019.09.009Abstract:The COBRA gene encodes the glycosylphosphatidylinositol anchoring protein, which is a regulator of seco

      甘肅農(nóng)業(yè)科技 2019年9期2019-09-10

    • 小麥TaBESl/BZR1基因的克隆及其在祖先種和六倍體小麥中的序列比較
      /BZRl;序列分析中圖分類號(hào):$512.1 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A 文章編號(hào):1000-4440(2019)01-0238-03高溫、凍害、土壤鹽漬化等非生物脅迫已經(jīng)成為小麥穩(wěn)產(chǎn)高產(chǎn)的重要限制因素。解決這一問(wèn)題的根本途徑在于培育抗逆性強(qiáng)的小麥新品種,并在生產(chǎn)上進(jìn)行大面積應(yīng)用,而挖掘和利用與抗逆性密切相關(guān)的關(guān)鍵基因能夠?yàn)榕嘤鼓嫘詮?qiáng)的小麥品種提供重要的基因資源,因而與抗逆性相關(guān)的信號(hào)通路及信號(hào)通路上的關(guān)鍵基因的功能及序列特征的解析業(yè)已成為研究人員關(guān)注的熱點(diǎn)。油菜素

      江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào) 2019年1期2019-09-10

    • 菜粉蝶HSP20基因的克隆及溫度脅迫下表達(dá)分析
      ;基因克隆;序列分析;溫度脅迫;表達(dá)分析中圖分類號(hào): S433.4? ? ? ? ? ? ? ? ? ?文獻(xiàn)標(biāo)志碼: A 文章編號(hào):2095-1191(2019)02-0286-06Abstract:【Objective】Heat shock protein 20 gene(HSP20) from Pieris rapae was cloned and its expression under temperature stress was detected

      南方農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào) 2019年2期2019-09-10

    • 高活性纖溶酶菌株篩選與基因克隆表達(dá)
      基因克隆; 序列分析; 表達(dá)中圖分類號(hào):Q939.9 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A 文章編號(hào):1008-0457(2019)02-0001-07 ? ? 國(guó)際DOI編碼:10.15958/j.cnki.sdnyswxb.2019.02.001Abstract: In this study, 13 Maotai-flavor producing strains isolated from samples such as daqu, fermented grains and

      山地農(nóng)業(yè)生物學(xué)報(bào) 2019年2期2019-09-10

    • 大花杓蘭親環(huán)素基因的克隆及生物信息學(xué)分
      統(tǒng)發(fā)育樹(shù), 序列分析中圖分類號(hào):Q949.95文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A文章編號(hào):1000-3142(2019)05-0633-08Cloning and bioinformatics analysis of cyclophilin gene(CmCyP) from Cypripedium macranthumFU Yajuan1,2, ZHANG Jian3, LIU Huan1, HOU Xiaoqiang1,2*( 1. College of Life Scie

      廣西植物 2019年5期2019-09-10

    • 廣東省番茄黃化曲葉病毒的分子鑒定及序列分析
      分子鑒定; 序列分析中圖分類號(hào): S 432.41文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼: ADOI: 10.16688/j.zwbh.2018333番茄黃化曲葉病是世界范圍內(nèi)嚴(yán)重影響番茄生產(chǎn)的一種重要病害,已給熱帶和亞熱帶地區(qū)的番茄生產(chǎn)造成嚴(yán)重?fù)p失[1]。在我國(guó),蔡健和等1994年首次在廣西報(bào)道了該病害的發(fā)生[2]。2006年以來(lái),番茄黃化曲葉病在全國(guó)范圍大面積暴發(fā)和流行。在廣東,何自福等2003年率先報(bào)道番茄黃化曲葉病危害番茄[3],到目前為止,廣東省幾乎所有番茄產(chǎn)區(qū)均有該病害的

      植物保護(hù) 2019年4期2019-09-04

    • 侵染‘舞美’蘋果的蘋果銹果類病毒檢測(cè)與全序列分析
      -PCR; 序列分析中圖分類號(hào): S 432.1文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼: ADOI: 10.16688/j.zwbh.2018233蘋果銹果病在遼寧[1]、新疆[2]、山東[3]、河北[4]等蘋果主產(chǎn)區(qū)均有發(fā)生,近年來(lái)呈不斷蔓延趨勢(shì),已成為制約我國(guó)蘋果產(chǎn)業(yè)健康發(fā)展的主要限制因子。該病的病原為蘋果銹果類病毒Apple scar skin viroid (ASSVd),屬于馬鈴薯紡錘塊莖類病毒科Pospiviroidae蘋果銹果類病毒屬Apscarviroid[5]。AS

      植物保護(hù) 2019年4期2019-09-04

    • 椰子織蛾CSP基因的克隆與序列分析
      ;基因克隆;序列分析;系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)中圖分類號(hào): S433.4? 文獻(xiàn)標(biāo)志碼: A? 文章編號(hào):1002-1302(2019)03-0043-03高度發(fā)達(dá)的化學(xué)感受系統(tǒng)對(duì)昆蟲與環(huán)境中的化學(xué)信息聯(lián)系具有重要作用。昆蟲在長(zhǎng)期進(jìn)化過(guò)程中,發(fā)展演變出復(fù)雜的化學(xué)信息感受機(jī)制。例如,在覓食、尋偶、產(chǎn)卵等行為中,通過(guò)敏銳的嗅覺(jué)、味覺(jué)、觸覺(jué)等功能,感受各種環(huán)境化學(xué)因子的刺激,從而進(jìn)行精巧的化學(xué)通信,以適應(yīng)環(huán)境選擇,保持種群繁衍[1]。昆蟲發(fā)達(dá)的化學(xué)感受系統(tǒng)功能的發(fā)揮是基于昆蟲

      江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2019年3期2019-08-10

    • 豬流行性腹瀉毒株S基因分離鑒定及序列分析
      毒;S基因;序列分析中圖分類號(hào):S858.285.3?? 文獻(xiàn)標(biāo)志碼: A? 文章編號(hào):1002-1302(2019)11-0071-03豬流行性腹瀉病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)引起的豬流行性腹瀉病(porcine epidemic diarrhea,PED)是一種高死亡率的腸道傳染病,會(huì)在豬群中引起各個(gè)年齡段豬暴發(fā)急性腹瀉,多發(fā)于仔豬和胎豬,其臨床癥狀主要以豬水樣腹瀉、嘔吐和脫水為主。1971年,英國(guó)首

      江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2019年11期2019-07-22

    • 中華鱘免疫分子CD22的克隆及生物信息學(xué)挖掘
      ;CD22;序列分析;功能預(yù)測(cè)中圖分類號(hào)? ? S917.4? ? ? ? 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼? ? A? ? ? ? 文章編號(hào)? ?1007-5739(2019)09-0204-03Abstract? ? In order to study the structure of CD22 and its possible corresponding functions,the Acipenser sinensis CD22 cDNA(CsCD22)was clone

      現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技 2019年9期2019-07-03

    • 江蘇省揚(yáng)州市水仙病毒檢測(cè)鑒定與序列分析
      經(jīng)克隆測(cè)序和序列分析發(fā)現(xiàn),所得序列包含3種不同的類型,分別與水仙普通潛隱病毒 Narcissus common latent virus (NCLV)、水仙退化病毒 Narcissus degeneration virus (NDV)和水仙黃條病毒Narcissus yellow stripe virus (NYSV)有93%、98%和99%的相似性,表明江蘇水仙受到了NCLV、NDV、NYSV 3種病毒侵染。這是江蘇水仙上第一次發(fā)現(xiàn)NCLV、NDV、NY

      植物保護(hù) 2019年6期2019-02-10

    • 豬流行性腹瀉病毒HB201602株的分離鑒定及S1基因序列分析
      ;分離鑒定;序列分析;系統(tǒng)發(fā)育樹(shù);遺傳變異中圖分類號(hào):S852.65+1 ? ? ? ? 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A文章編號(hào):0439-8114(2019)24-0227-05DOI:10.14088/j.cnki.issn0439-8114.2019.24.055 ? ? ? ? ? 開(kāi)放科學(xué)(資源服務(wù))標(biāo)識(shí)碼(OSID):Isolation and identification of HB201602 strain of porcine epidemicdiarr

      湖北農(nóng)業(yè)科學(xué) 2019年24期2019-02-06

    • 杜梨響應(yīng)鹽脅迫CIPK01的克隆及表達(dá)分析
      IPK基因;序列分析;基因表達(dá);抗逆基因;抗逆機(jī)制中圖分類號(hào): S661.201文獻(xiàn)標(biāo)志碼: A文章編號(hào):1002-1302(2019)21-0115-05收稿日期:2018-08-03基金項(xiàng)目:國(guó)家自然科學(xué)基金(編號(hào):31372051、31772287);江蘇省自然科學(xué)基金(編號(hào):BK20151361)。作者簡(jiǎn)介:王影(1993—),女,安徽宿州人,碩士研究生,主要從事果樹(shù)種質(zhì)資源與分子育種研究。E-mail:1759068060@qq.com。通信作者

      江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2019年21期2019-01-03

    • 一株犬瘟熱病毒部分基因片段的特性分析
      測(cè);L基因;序列分析犬瘟熱(canine distemper,CD)是一種由犬瘟熱病毒(can‘inedistemper virus,CDV)引起的多宿主的烈性、急性、高度接觸性的病毒性傳染病。CDV可引發(fā)多種動(dòng)物患病,致死率極高。CD分布全球,很多國(guó)家和地區(qū)均有報(bào)道家養(yǎng)或野生動(dòng)物感染CD的案例,同時(shí)在過(guò)去的幾十年中,其感染宿主范圍在不斷擴(kuò)大。我國(guó)很多地區(qū)大型毛皮動(dòng)物養(yǎng)殖場(chǎng)、動(dòng)物園甚至保護(hù)區(qū)內(nèi)均有動(dòng)物感染CD而死亡的報(bào)道。同時(shí)國(guó)寶大熊貓、旗艦物種東北虎等多

      中國(guó)動(dòng)物保健 2018年3期2018-12-27

    • 大白菜、蘿卜蕪菁花葉病毒系統(tǒng)進(jìn)化及CP序列分析
      ;系統(tǒng)進(jìn)化;序列分析中圖分類號(hào):S436.341.1+1+S436.31 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)號(hào):A 文章編號(hào):1001-4942(2018)08-0100-06Phylogenetic Evolution and CP Nucleotide Sequence Analysis ofTuMV in Chinese Cabbage and RadishWu Bin1, Zhang Mei1, Jiang Shanshan1, Zhang Ansheng1,Cui Han

      山東農(nóng)業(yè)科學(xué) 2018年8期2018-11-22

    • 云南切梢小蠹熱激蛋白20基因克隆及序列分析
      )進(jìn)行克隆和序列分析,為研究該蟲在高溫環(huán)境下的抗逆機(jī)制打下基礎(chǔ)?!痉椒ā坎捎胏DNA末端快速擴(kuò)增技術(shù)(Rapid amplification of cDNA ends,RACE)克隆云南切梢小蠹成蟲TynHSP20基因cDNA序列,并對(duì)其序列進(jìn)行生物信息學(xué)分析?!窘Y(jié)果】克隆獲得的TynHSP20基因cDNA序列長(zhǎng)671 bp,含開(kāi)放閱讀框597 bp,5'端非編碼序列和部分3'端非編碼序列分別為44和33 bp。該基因編碼198個(gè)氨基酸,預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)分子量為

      南方農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào) 2018年12期2018-09-10

    • 芒果乙烯受體ETR1和ERS1基因的克隆及序列分析
      ;基因克隆;序列分析中圖分類號(hào): S667.703.6 文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A 文章編號(hào):2095-1191(2018)06-1053-08Abstract:【Objective】Ethylene receptor ETR1 and ERS1 genes(MiETR1 and MiERS1) from mango(Mangnifera indica L.) were cloned,and bioinformatics analysis was conducted

      南方農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào) 2018年6期2018-09-10

    • 沙田柚生長(zhǎng)素響應(yīng)基因SAUR的鑒定及序列分析
      53。氨基酸序列分析表明,該基因編碼的氨基酸與克萊門柚和甜橙SAUR基因編碼的氨基酸的同源性分別為100%、99%。系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)顯示,沙田柚SAUR基因與克萊門柚和甜橙的親緣關(guān)系很近,屬同一進(jìn)化分支。[結(jié)論]研究結(jié)果可為今后深入研究沙田柚自交不親和機(jī)理提供參考。關(guān)鍵詞 沙田柚;自交不親和;SAUR基因;序列分析中圖分類號(hào) S188 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼 A 文章編號(hào) 0517-6611(2018)22-0081-04Abstract[Objective]To stud

      安徽農(nóng)業(yè)科學(xué) 2018年22期2018-05-14

    • 大鼠MKK3蛋白的生物信息學(xué)分析
      ;MKK3;序列分析;生物信息學(xué)分析中圖分類號(hào) Q789 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼A 文章編號(hào) 0517-6611(2018)13-0114-04Bioinformatic Analysis of Rat MKK3 ProteinZHAO Xiaofeng,WU Guimei,JIN Lei et al(National Demonstration Center for Experimental Basic Medical Science Education, Xuzh

      安徽農(nóng)業(yè)科學(xué) 2018年13期2018-05-14

    • 青楊天牛觸角味覺(jué)受體基因的鑒定
      ;味覺(jué)受體;序列分析中圖分類號(hào) S763.38 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼 A 文章編號(hào) 0517-6611(2018)13-0111-03Identification of Saperda populnea Antennal Gustatory Receptor GeneWANG Jiatong1, ZHANG Jian2, CHENG Bin2 et al(1.School of Life Sciences, Northeast Normal University,

      安徽農(nóng)業(yè)科學(xué) 2018年13期2018-05-14

    • 青稞核糖體蛋白基因HbRPL11的克隆、序列分析及原核表達(dá)
      了測(cè)序鑒定和序列分析,同時(shí)構(gòu)建了原核表達(dá)載體pET28a(+)-RPL11,轉(zhuǎn)化入大腸桿菌BL21(DE3)后利用IPTG 誘導(dǎo)外源蛋白質(zhì)表達(dá)并利用SDS-PAGE凝膠電泳檢測(cè)?!窘Y(jié)果】成功擴(kuò)增出了青稞核糖體蛋白基因HbRPL11的CDS全長(zhǎng)序列,得到了重組蛋白。【結(jié)論】青稞核糖體蛋白基因HbRPL11的CDS全長(zhǎng)序列大小為543 bp。經(jīng)生物信息學(xué)分析,HbRPL11編碼的蛋白質(zhì)含有181個(gè)氨基酸,相對(duì)分子質(zhì)量為24KD,理論等電點(diǎn)(pI)為5.17,總

      農(nóng)家科技下旬刊 2017年9期2017-11-12

    • 大鯢泛素結(jié)合酶玞gsUBE2L3基因克隆及其在免疫應(yīng)答中的表達(dá)分析
      BE2L3;序列分析;免疫應(yīng)答中圖分類號(hào)S966.6文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼A文章編號(hào)0517-6611(2017)22-0093-05Abstract[Objective] To study the role of ubiquitinconjugating enzyme cgsUBE2L3 gene during the immune response in Chinese giant salamander (Andrias davidianus). [Method]

      安徽農(nóng)業(yè)科學(xué) 2017年22期2017-10-14

    • 沙田柚GDSL酯酶/脂肪酶基因的鑒定及序列分析
      脂肪酶基因;序列分析;鑒定中圖分類號(hào): S666.301文獻(xiàn)標(biāo)志碼: A文章編號(hào):1002-1302(2017)11-0045-04[HS)][HT9.SS]植物自交不親和是指具有完全花且能夠產(chǎn)生雌雄配子,雌蕊的柱頭或花柱能特異性識(shí)別與自體基因型相同的花粉,導(dǎo)致花粉不萌發(fā)或花粉管停止生長(zhǎng)的一種現(xiàn)象[1]。在高等植物中,據(jù)估計(jì)有超過(guò)一半的顯花植物表現(xiàn)出自交不親和性,這種現(xiàn)象在被子植物中尤其明顯[2]。自交不親和對(duì)植物保持遺傳多樣性以及雜種優(yōu)勢(shì)有著極其重要的作

      江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2017年11期2017-08-12

    • 新城疫病毒SD強(qiáng)毒株全長(zhǎng)cDNA克隆的構(gòu)建及序列分析
      的成功構(gòu)建和序列分析為后續(xù)的反向遺傳操作奠定了關(guān)鍵的技術(shù)基礎(chǔ)。關(guān)鍵詞:新城疫病毒;基因組全長(zhǎng)cDNA;重組質(zhì)粒;序列分析中圖分類號(hào):S852.65+9.5:Q781 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)號(hào):A 文章編號(hào):1001-4942(2017)07-0012-04Abstract The whole genomic cDNA sequence of SD virulent strain of Newcastle disease virus was amplified in se

      山東農(nóng)業(yè)科學(xué) 2017年7期2017-07-29

    • 山東省芋花葉病毒病的田間調(diào)查及鑒定
      病病原鑒定、序列分析和遺傳進(jìn)化分析。結(jié)果顯示,芋花葉病毒的檢出率為55.9%,在5個(gè)地區(qū)皆有分布。5個(gè)DsMV分離物cp基因的核苷酸序列相似性為88.5%~91.9%,氨基酸序列相似性為93.4%~97.5%;與國(guó)內(nèi)外已報(bào)道代表性DsMV分離物cp基因的核苷酸與氨基酸的序列相似性分別為74.8%~99.4%、79.7%~99.1%。遺傳進(jìn)化分析顯示,DsMV山東分離物與日本分離物(Ds23)、中國(guó)分離物(ND和ZAN)和美國(guó)分離物(DsMV-U2)親緣關(guān)系

      中國(guó)蔬菜 2017年7期2017-07-10

    • 新疆油雞禽流感病毒Xj14分離株P(guān)A基因的克隆與序列分析
      基因;克??;序列分析中圖分類號(hào): S852.65+7文獻(xiàn)標(biāo)志碼: A文章編號(hào):1002-1302(2017)08-0020-03禽流感(avian influenza,AI)是由A型流感病毒(avian influenza virus,AIV)引起的病毒性傳染病。自Homme等1966年從威斯康辛州患有溫和呼吸道疾病的火雞中分離到第1株H9N2亞型禽流感病毒之后,該亞型病毒在世界范圍內(nèi)呈廣泛流行的趨勢(shì)[1-4]。我國(guó)1994年首次從廣東省的發(fā)病雞群中分離到

      江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2017年8期2017-06-30

    • 洋蔥AcPME基因的克隆及序列分析
      E);克隆;序列分析中圖分類號(hào):S633.201文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)號(hào):A文章編號(hào):1001-4942(2017)06-0007-07AbstractThe sequence of AcPME gene was obtained through rapid amplification of cDNA ends (RACE) based on the sample of onion flower bud. The GenBank accession number was

      山東農(nóng)業(yè)科學(xué) 2017年6期2017-06-29

    • 廣西家蠶核型多角體病毒株gp64基因克隆與序列分析
      基因;克?。?span id="j5i0abt0b" class="hl">序列分析;微進(jìn)化;廣西中圖分類號(hào): S884.51 文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A 文章編號(hào):2095-1191(2017)02-0328-08Abstract:【Objective】This research aimed to understand gp64 gene conservation of Bombyx mori nucleopolyhedrovirus(BmNPV) Guangxi isolates and master the specific

      南方農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào) 2017年2期2017-05-30

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