共表達(dá)
- 長(zhǎng)鏈非編碼RNA共表達(dá)基因在卵巢上皮性癌的生物學(xué)作用
lncRNA 共表達(dá)且差異表達(dá)的基因（1）差異表達(dá)mRNA 芯片數(shù)據(jù)的獲取：①在美國(guó)國(guó)立生物技術(shù)中心（NCBI）的Gene Expression Omnibus（GEO）數(shù)據(jù)庫中檢索與OC 相關(guān)的mRNA 表達(dá)譜芯片數(shù)據(jù)集（檢索條件：研究類型為expression profiling by array、種屬為homo sapiens、病例和對(duì)照樣本數(shù)目均≥10 例、時(shí)間為自建庫至2022 年12 月31 日），隨后下載符合納入條件的mRNA 表達(dá)譜芯片數(shù)據(jù)
浙江臨床醫(yī)學(xué) 2023年4期2023-05-30
- 不同濃度氮處理毛竹水通道蛋白基因表達(dá)模式及其調(diào)控網(wǎng)絡(luò)
P基因和TF的共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)，篩選關(guān)鍵的基因，并用轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)驗(yàn)證，以期為后續(xù)開展基因功能提供參考依據(jù)。1 材料與方法1.1 實(shí)驗(yàn)材料選取在人工氣候室[光周期為16 h光/8 h暗、光照強(qiáng)度為300 μmol/(m2·s)、溫度為28 ℃、濕度為60%]培養(yǎng)2個(gè)月左右、且生長(zhǎng)狀態(tài)一致的毛竹幼苗用于實(shí)驗(yàn)，將其根部清洗干凈，然后放入含有不同濃度KNO3(N0=0 mmol/L，N6=6 mmol/L，N18=18 mmol/L)的改性木村B溶液中培養(yǎng)2周[8,11]
世界竹藤通訊 2022年6期2023-01-14
- 乳腺癌中垂體瘤轉(zhuǎn)化基因1對(duì)免疫浸潤(rùn)的影響及其預(yù)后價(jià)值
整合構(gòu)建的基因共表達(dá)數(shù)據(jù)庫[16]。利用Coexpedia 分析在乳腺癌中與PTTG1 表達(dá)顯著相關(guān)的基因，并選取排名前50 的基因做后續(xù)分析。1.3 富集分析使用R 語言中的clusterProfiler 包將PTTG1 共表達(dá)的前50 基因進(jìn)行GO 和KEGG 通路富集分析[17]。1.4 腫瘤免疫細(xì)胞浸潤(rùn)相關(guān)性分析通過TIMER 數(shù)據(jù)庫（https://cistrome.shinyapps.io/timer）分析PTTG1 的表達(dá)水平及其與6 種免疫
中國(guó)普通外科雜志 2022年11期2022-12-12
- 多組學(xué)聯(lián)合分析神經(jīng)膠質(zhì)瘤中SOX4表達(dá)差異及臨床意義*
.3 SOX4共表達(dá)基因篩選根據(jù)SOX4基因表達(dá)中位數(shù)分別將GBM和LGG分為高SOX4組和低SOX4組，運(yùn)用R軟件DESeq2(1.26.0)包[6]，以|log2(FC)|>1.5和adj.p value 1.4 SOX4共表達(dá)基因功能富集分析通過R軟件ClusterProfiler(3.14.3)[7]包對(duì)SOX4共表達(dá)基因分別進(jìn)行Gene ontology(GO)和通路Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(
- 長(zhǎng)鏈非編碼RNA HAGLROS在胃癌中的生物信息學(xué)分析
AGLROS的共表達(dá)基因從TCGA數(shù)據(jù)庫(https://portal.gdc.cancer.gov/)下載胃癌基因表達(dá)譜。采用R語言分析HAGLROS的共表達(dá)基因(選取的是蛋白質(zhì)編碼基因)，篩選標(biāo)準(zhǔn)為Pearson相關(guān)系數(shù)絕對(duì)值>0.3且P1.3 HAGLROS共表達(dá)基因的網(wǎng)絡(luò)互作分析及關(guān)鍵基因的篩選應(yīng)用STRING數(shù)據(jù)庫(https://cn.string-db.org/)進(jìn)行HAGLROS共表達(dá)基因的蛋白質(zhì)互作(PPI)網(wǎng)絡(luò)分析，再導(dǎo)入Cytosca
實(shí)用臨床醫(yī)藥雜志 2022年15期2022-09-03
- PARVG基因在腎透明細(xì)胞癌患者中的表達(dá)及臨床意義
rg/）是一個(gè)共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析以及可視化的在線工具，搜集了來自GEO數(shù)據(jù)庫關(guān)于人和小鼠的900多個(gè)數(shù)據(jù)集，并對(duì)每個(gè)數(shù)據(jù)集進(jìn)行了共表達(dá)分析，然后將共表達(dá)關(guān)系匯總成數(shù)據(jù)庫信息。通過在Coexpdia數(shù)據(jù)庫中檢索，獲得了在KIRC中PARVG基因的共表達(dá)基因網(wǎng)絡(luò)。1.6 Funrich軟件FunRich軟件主要用于基因和蛋白質(zhì)的功能富集和相互作用網(wǎng)絡(luò)分析。選取Coexpedia數(shù)據(jù)庫得到的“LLS分?jǐn)?shù)＞2”的17個(gè)基因，在“Gene enrichment”模塊下，
大理大學(xué)學(xué)報(bào) 2022年2期2022-04-02
- 孕中期羊水游離RNA中泌尿系統(tǒng)發(fā)育關(guān)鍵基因的篩選與生物學(xué)功能分析
。1.2 基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析 采用Olgio軟件對(duì)芯片檢測(cè)結(jié)果進(jìn)行讀取、背景校正以及歸一化。在獲取基因表達(dá)量后，利用SVA 軟件包去除批次效應(yīng)，使不同芯片檢測(cè)結(jié)果具有相似的均值和標(biāo)準(zhǔn)差。在不同樣品的檢測(cè)結(jié)果具有可比性的基礎(chǔ)上，利用WGCNA 軟件的動(dòng)態(tài)樹形剪切算法建立基因共表達(dá)模塊，進(jìn)行基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析，軟閾值設(shè)為12，最小類的大小設(shè)置為30。篩選得到的基因共表達(dá)模塊以不同顏色名稱表示。通過分析AfcfRNA 轉(zhuǎn)錄組中基因平均表達(dá)量和變異系數(shù)（CV%），
山東醫(yī)藥 2022年8期2022-03-31
- UdhA和博伊丁假絲酵母xylI基因共表達(dá)對(duì)木糖醇發(fā)酵的影響
因（xylI）共表達(dá)對(duì)木糖醇發(fā)酵的影響。[方法]將來源于博伊丁假絲酵母醛糖還原酶xylI基因克隆到pET28a（+）上，并在BL21（DE3）中表達(dá)，通過SDS-PAGE對(duì)表達(dá)產(chǎn)物的分子量和酶活進(jìn)行測(cè)定。隨即將xylI基因連接lacP啟動(dòng)子，構(gòu)建pWYZ-2質(zhì)粒并將其轉(zhuǎn)化到E.coli AI07菌株。進(jìn)一步將來源于E.coli W3110的UdhA基因克隆到pWYZ-2質(zhì)粒實(shí)現(xiàn)與xylI共表達(dá)，所構(gòu)建pWYZ-4質(zhì)粒轉(zhuǎn)化到E.coli AI07菌株，比較了
安徽農(nóng)業(yè)科學(xué) 2022年1期2022-02-14
- 羊水游離RNA中神經(jīng)發(fā)育關(guān)鍵基因分析*
錄組，結(jié)合基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析和組織特異性基因分析，試圖從AfcfRNA轉(zhuǎn)錄組中提取神經(jīng)系統(tǒng)發(fā)育相關(guān)的關(guān)鍵基因，為AfcfRNA轉(zhuǎn)錄組在產(chǎn)前診斷中應(yīng)用奠定基礎(chǔ)。1 資料與方法1.1一般資料 以孕中期正常胎兒的羊水為研究對(duì)象，從Gene Expression Omnibus數(shù)據(jù)庫中下載正常胎兒AfcfRNA的芯片檢測(cè)結(jié)果。納入標(biāo)準(zhǔn)：(1)核型分析結(jié)果正常；(2)單胎妊娠；(3)羊水采集時(shí)間為孕中期(孕13～27周)；(4)檢測(cè)平臺(tái)為Affymetrix Hum
國(guó)際檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)雜志 2022年1期2022-01-19
- MYC與BCL6蛋白在彌漫性大B細(xì)胞淋巴瘤中的病理分析
CL-6 蛋白共表達(dá)被稱為雙重表達(dá)淋巴瘤，檢出率高于基因分子學(xué)定義的雙重打擊淋巴瘤，且免疫組織化學(xué)染色法的操作方法簡(jiǎn)便、快速可滿足臨床諸多需求[4]。本研究分析在濮陽市安陽地區(qū)醫(yī)院確診為彌漫性大B 細(xì)胞淋巴瘤的患者，測(cè)定BCL-6、MYC 蛋白表達(dá)在彌漫性大B 細(xì)胞淋巴瘤患者中的表達(dá)情況，了解并表達(dá)彌漫性大B 細(xì)胞淋巴瘤患者的臨床病理特征和預(yù)后，以期為臨床提供有利參考依據(jù)。1 資料與方法1.1 臨床資料選取2017年8月至2021年8月在本院確診為彌漫性大
醫(yī)藥與保健 2021年12期2021-12-31
- TTF-1/p40共表達(dá)低分化非小細(xì)胞肺癌1例并文獻(xiàn)復(fù)習(xí)
1和p40彌漫共表達(dá)低分化NSCLC，并進(jìn)行二代測(cè)序，結(jié)合文獻(xiàn)探討其臨床病理學(xué)特征、免疫表型、診斷及鑒別診斷等，旨在提高對(duì)該類腫瘤的認(rèn)識(shí)水平。1 材料與方法1.1 臨床資料患者女性，58歲，無吸煙史，2019年8月因咳嗽半年余在外院行CT檢查示左上肺占位，考慮肺癌可能；兩肺多發(fā)結(jié)節(jié)、縱隔淋巴結(jié)增大，考慮轉(zhuǎn)移可能。顱腦MRI檢查考慮右側(cè)額葉轉(zhuǎn)移。全身骨掃描考慮T2、T3椎體轉(zhuǎn)移。行纖維支氣管鏡活檢，病理檢查示非小細(xì)胞肺癌(non-small cell lun
臨床與實(shí)驗(yàn)病理學(xué)雜志 2021年10期2021-12-13
- 基于lncRNA-mRNA共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)篩選胃癌分期相關(guān)的lncRNA*
NA-mRNA共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)，探索與胃癌分期相關(guān)的lncRNA及其調(diào)控關(guān)系，為研究胃癌的進(jìn)展機(jī)制及尋找胃癌治療的潛在靶點(diǎn)提供依據(jù)。方法 利用TCGA數(shù)據(jù)庫，收集胃癌RNA-seq數(shù)據(jù)及臨床信息數(shù)據(jù)；采用表達(dá)數(shù)量性狀位點(diǎn)(eQTL)分析與加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析(WGCNA)相結(jié)合的方法，構(gòu)建lncRNA-mRNA共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)模塊，結(jié)合臨床信息篩選與胃癌分期相關(guān)的模塊；采用Kruskal-Wallis秩和檢驗(yàn)篩選模塊內(nèi)胃癌不同分期差異表達(dá)的lncRNA。結(jié)果 獲得2
中國(guó)衛(wèi)生統(tǒng)計(jì) 2021年5期2021-11-22
- α-1,3-巖藻糖基轉(zhuǎn)移酶IV在肝癌轉(zhuǎn)移中的表達(dá)及機(jī)制研究
中的表達(dá)水平和共表達(dá)基因，進(jìn)行KEGG通路富集分析，探究FUT4在肝癌轉(zhuǎn)移中的表達(dá)及機(jī)制，以期為肝癌轉(zhuǎn)移的診斷和治療提供新的思路和依據(jù)。材料與方法一、實(shí)驗(yàn)材料(一)細(xì)胞 人肝癌細(xì)胞MHCC97L、MHCC97H、HCCLM3為本實(shí)驗(yàn)室凍存，復(fù)蘇使用；其中MHCC97L為低轉(zhuǎn)移潛能人肝癌細(xì)胞，MHCC97H、HCCLM3為高轉(zhuǎn)移潛能人肝癌細(xì)胞。(二)試劑 TGF-β1(美國(guó)R&D公司)，RNA提取試劑盒(廣東廣州美基生物科技有限公司)，逆轉(zhuǎn)錄試劑盒(美國(guó)Th
肝臟 2021年10期2021-11-19
- Genome-wide identification of the aquaporin gene family in wheat and their roles in salt and drought stress response
道蛋白的表達(dá)和共表達(dá)譜Under conditions of drought stress induced by mannitol (0.18mol/L) expression levels ofTaNIP4;03_3D,TaNIP3;03_6D,TaSIP2;02_4A,TaTIP2;02b_7BandTaNIP1;08_7Din leaves were similar to those under PEG-induced drought stress.
- 淚腺良性淋巴上皮病變基因網(wǎng)絡(luò)分析及關(guān)鍵樞紐基因鑒定
據(jù)，構(gòu)建了基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)，并鑒定其中的關(guān)鍵致樞紐病基因，有助于在分子水平上系統(tǒng)全面明確BLEL的發(fā)病機(jī)制，對(duì)BLEL的治療也有一定的啟示作用。1 資料與方法1.1 數(shù)據(jù)獲取本研究選取了Gene Expression Omnibus(www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)數(shù)據(jù)庫中編號(hào)為GSE76497的數(shù)據(jù)集，該數(shù)據(jù)集中包括18例BLEL和作為對(duì)照的18例眼眶海綿狀血管瘤。該數(shù)據(jù)集也曾被Adzavon等[2]和Li等[3]用于研究BLEL的發(fā)病
腫瘤基礎(chǔ)與臨床 2021年4期2021-08-26
- 高世代回交玉米矮稈種質(zhì)的轉(zhuǎn)錄組分析
與糖酵解相關(guān)。共表達(dá)分析結(jié)果表明，編碼果糖-1，6-雙磷酸酶的基因與多個(gè)差異表達(dá)基因存在功能關(guān)聯(lián)。該研究結(jié)果揭示了玉米矮稈材料中的基因表達(dá)調(diào)控，為后續(xù)玉米株高調(diào)控節(jié)點(diǎn)的發(fā)掘提供了參考。關(guān)鍵詞：?矮稈;高世代回交群體;轉(zhuǎn)錄組測(cè)序;共表達(dá);玉米中圖分類號(hào)：?S513.035.3??文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼：?A??文章編號(hào)：?1000-4440（2021）02-0280-09Abstract：?Plant height affects plant type and is r
江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào) 2021年2期2021-06-30
- 全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析精子發(fā)生中RNA結(jié)合蛋白質(zhì)的動(dòng)態(tài)表達(dá)
.4 RBPs共表達(dá)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)分析：WGCNA(Weighted Gene Co-Expression Network Analysis)稱為加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析，通過計(jì)算基因間表達(dá)關(guān)系鑒定表達(dá)模式相似的基因模塊(Module，ME)，位于同一模塊的基因共表達(dá)程度較高并且具有相似的調(diào)控作用。利用該方法分析RBPs在精子發(fā)生中的共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)，算法軟閾值設(shè)置為22，其他為默認(rèn)參數(shù)。2 結(jié)果2.1 RBPs在精子發(fā)生中的階段特異性及動(dòng)態(tài)表達(dá)模式目前小鼠物種RBPs
基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)與臨床 2021年6期2021-06-17
- 基于差異共表達(dá)分析的肝癌特異性基因的篩選與驗(yàn)證
用［6］。差異共表達(dá)分析（Differential coexpression analysis，DCA）可以作為DEA的補(bǔ)充，通過比較共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)，認(rèn)為具有強(qiáng)烈改變的連接性的基因在疾病表型中起重要作用。隨著公開轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究的快速積累，結(jié)合多個(gè)轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究的共表達(dá)分析，可以提供更準(zhǔn)確和穩(wěn)健的結(jié)果［7］。本文在Marjan等研究5種人類組織的差異共表達(dá)和平均表達(dá)水平的混雜效應(yīng)的基礎(chǔ)上，結(jié)合GEO數(shù)據(jù)庫篩選25個(gè)肝組織數(shù)據(jù)集，根據(jù)肝癌發(fā)生、發(fā)展的3個(gè)階段，構(gòu)建了新
黑龍江大學(xué)自然科學(xué)學(xué)報(bào) 2021年1期2021-04-15
- 膽管細(xì)胞型肝癌lncRNA-mRNA 共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)的高通量基因芯片篩查分析
篩選分析，構(gòu)建共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)，獲取與腫瘤相關(guān)lncRNAmRNA，為膽管細(xì)胞型肝癌的診斷和治療提供依據(jù)。1 資料與方法1.1 標(biāo)本收集選取2017 年1 月—6 月新疆醫(yī)科大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院（以下簡(jiǎn)稱“我院”）肝膽外科手術(shù)切除的5 例膽管細(xì)胞型肝癌新鮮組織標(biāo)本。標(biāo)本自手術(shù)中離體后立即取樣，注明標(biāo)識(shí)后置入液氮中保存。5 例經(jīng)病理證實(shí)均為膽管細(xì)胞型肝癌患者，女3 例，男2 例；年齡37～55 歲，中位年齡45.2 歲；腫瘤均單發(fā)，最大徑介于2.2～4.7 cm，平均
中國(guó)醫(yī)藥導(dǎo)報(bào) 2021年3期2021-03-08
- ZnT8在胰腺癌發(fā)生和發(fā)展中的作用
、拷貝數(shù)變化、共表達(dá)基因，生存預(yù)后情況、以及GO功能富集分析按條目或功能分類，以及構(gòu)建共表達(dá)基因蛋白質(zhì)互作圖，得到密切相關(guān)基因.本研究旨在為探索ZnT8在胰腺癌的疾病發(fā)生和發(fā)展機(jī)制作用方面做基礎(chǔ)工作，探尋其作為胰腺癌預(yù)防診斷指標(biāo)和治療靶點(diǎn).1 實(shí)驗(yàn)材料與方法本研究選取了TCGA數(shù)據(jù)庫的胰腺癌泛癌圖譜(Pancreatic Adenocarinoma，PanCancer Atlas)中的184個(gè)胰腺癌患者臨床樣本挖掘數(shù)據(jù)，通過cBioportal(https
南京曉莊學(xué)院學(xué)報(bào) 2021年6期2021-02-28
- 成釉細(xì)胞瘤患者lncRNA-mRNA共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析及作用研究
NA-mRNA共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)，對(duì)異常表達(dá)的lncRNA及mRNA進(jìn)行生物信息學(xué)分析，尋找與成釉細(xì)胞瘤發(fā)生發(fā)展相關(guān)的靶基因，為成釉細(xì)胞瘤的分子機(jī)制研究及臨床治療提供理論基礎(chǔ)。1 資料與方法1.1 研究對(duì)象本研究所選成釉細(xì)胞瘤患者組織芯片表達(dá)譜數(shù)據(jù)集GES38494及GES132472下載自美國(guó)國(guó)立生物信息中心(National Center for Biotechnology Information, NCBI)公共數(shù)據(jù)庫基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫(Gene Express
口腔醫(yī)學(xué) 2020年10期2020-11-12
- p-AXL與c-MYC和/或BCL-2共表達(dá)在彌漫大B細(xì)胞性淋巴瘤中的臨床意義
CL-2 蛋白共表達(dá)的臨床意義，以及p-AXL 與MYC斷裂基因之間的臨床病理聯(lián)系。1 材料與方法1.1 選擇入組病例本研究納入2012年至2017年在中山大學(xué)附屬第一醫(yī)院確診為原發(fā)性DLBCL的病例394例，根據(jù)以下標(biāo)準(zhǔn)篩選出118 例DLBCL 進(jìn)行研究。入組標(biāo)準(zhǔn)：明確診斷為DLBCL；年齡＞18 歲；送檢組織直徑＞1 cm。剔除標(biāo)準(zhǔn)：合并其他重大疾病，如惡性腫瘤、艾滋病、移植術(shù)后；由其它類型淋巴瘤轉(zhuǎn)化而來；既往有淋巴瘤病史者。本研究經(jīng)中山大學(xué)附屬第一
中山大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)科學(xué)版) 2020年4期2020-08-17
- 基于多數(shù)據(jù)庫分析FAM72A在肝癌中的表達(dá)及意義
在肝癌組織中的共表達(dá)基因cBioPortal數(shù)據(jù)庫(cBio Cancer Genomics Portal)是一個(gè)可視化、多維度分析癌癥基因組數(shù)據(jù)網(wǎng)站。整合了miRNA表達(dá)、DNA甲基化等多種數(shù)據(jù)類型。本研究利用其分析TCGA數(shù)據(jù)庫中FAM72A在肝癌組織中的共表達(dá)基因(spearman相關(guān)系數(shù)的>0.3為正相關(guān)，>0.8為高度正相關(guān))。1.6 FAM72A共表達(dá)基因的GO富集功能分析及KEGG通路富集分析DAVID數(shù)據(jù)庫(The Database for
安徽醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào) 2020年7期2020-08-05
- 活動(dòng)性肺結(jié)核患者外周血髓樣樹突狀細(xì)胞中BTLA與B7-H4共表達(dá)檢測(cè)及臨床意義
A及B7-H4共表達(dá)情況進(jìn)行了檢測(cè)，分析其與mDC表面成熟標(biāo)志分子CD83、抗原遞呈分子HLA-DR以及共刺激分子CD86表達(dá)的相關(guān)性，探究其臨床意義。資料與方法1.研究對(duì)象:46例活動(dòng)性肺結(jié)核患者及23例健康對(duì)照均來自廣東醫(yī)科大學(xué)附屬厚街醫(yī)院。排除標(biāo)準(zhǔn)：①妊娠;②酗酒;③年齡65歲;④HIV陽性;⑤其他傳染病和慢性疾病(如糖尿病);⑥近1個(gè)月內(nèi)服用激素等治療的患者。根據(jù)抗結(jié)核藥物治療情況，本研究中將活動(dòng)性肺結(jié)核患者分為抗MTB藥物治療前(prior tr
醫(yī)學(xué)研究雜志 2020年6期2020-07-03
- 轉(zhuǎn)錄因子Bach1在小鼠胚胎發(fā)育時(shí)期的生物信息學(xué)分析
5］。加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析（weighted gene co-expression network analysis，WGCNA）是利用基因表達(dá)數(shù)據(jù)構(gòu)建無標(biāo)度網(wǎng)絡(luò)的系統(tǒng)生物學(xué)方法。它能尋找協(xié)同基因模塊，探索基因網(wǎng)絡(luò)和感興趣的表型之間的關(guān)系，以及網(wǎng)絡(luò)中的中樞基因。WGCNA 分析方法目前已成為胚胎發(fā)育研究領(lǐng)域的一種重要生物信息學(xué)分析手段［6-8］。我們?cè)谇捌谘芯恐邪l(fā)現(xiàn)，Bach1 維持人胚胎干細(xì)胞的干細(xì)胞特性，通過募集去泛素化酶Usp7 來穩(wěn)定多能性因子，
復(fù)旦學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版) 2020年3期2020-06-17
- 利用WGCNA鑒定玉米株高和穗位高基因共表達(dá)模塊
高和穗位高基因共表達(dá)模塊馬 娟 曹言勇 王利鋒 李晶晶 王 浩 范艷萍 李會(huì)勇*河南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院糧食作物研究所, 河南鄭州 450002株高和穗位高是玉米株型的重要影響因子, 與產(chǎn)量性狀緊密相關(guān)。加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析(weighted gene co-expression network analysis, WGCNA)是探索基因網(wǎng)絡(luò)與特定性狀間關(guān)聯(lián)關(guān)系的重要方法, 為株高和穗位高相關(guān)基因的挖掘提供新途徑。本研究利用鄭58、掖478、昌7-2和黃早四及其
作物學(xué)報(bào) 2020年3期2020-02-20
- 共表達(dá)分子伴侶提高漆酶在畢赤酵母中的分泌
storis中共表達(dá)PDI 使重組菌IFNβ-HAS 表達(dá)量提高了90%。為提高漆酶的表達(dá)水平，作者擬通過表達(dá)蛋白質(zhì)折疊（BIP、ERO1）、囊泡運(yùn)輸（SEC53、SEC1）、脅迫應(yīng)激（HAC1、GCN4）等相關(guān)6 種分子伴侶，以期提高Cerrenasp. WR1 漆酶在重組P. pastoris中的表達(dá)水平。1 材料與方法1.1 材料1.1.1 菌株及質(zhì)粒Cerrenasp. WR1 來源的漆酶（GeneID：899203）：由南京金斯瑞公司按照P. p
食品與生物技術(shù)學(xué)報(bào) 2019年11期2020-01-19
- 基于角質(zhì)酶共表達(dá)策略的大腸桿菌胞外生產(chǎn)耐高溫α-淀粉酶及其發(fā)酵條件優(yōu)化
有角質(zhì)酶基因的共表達(dá)載體pETDuet-cutinase：均由作者所在實(shí)驗(yàn)室保藏。1.2 試劑與培養(yǎng)基限制性內(nèi)切酶NcoI 和HindIII、 堿性磷酸酶（CIAP）、瓊脂糖和標(biāo)準(zhǔn)核酸相對(duì)分子質(zhì)量：均購(gòu)自大連寶生物工程有限公司；質(zhì)粒小提試劑盒和DNA回收試劑盒：購(gòu)自田根生化科技有限公司；蛋白質(zhì)標(biāo)準(zhǔn)相對(duì)分子質(zhì)量和蛋白質(zhì)電泳試劑盒：購(gòu)自上海碧云天生物科技有限公司； 異丙基-β-D-硫代半乳糖 苷 （Isopropyl β -D -1 -Thiogalactop
食品與生物技術(shù)學(xué)報(bào) 2019年11期2020-01-19
- 利用加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析構(gòu)建食管腺癌預(yù)后樞紐基因網(wǎng)絡(luò)
，通過加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析（weighted gene co-expression network analysis，WGC原NA）研究腫瘤的RNA-seq數(shù)據(jù)，篩選與預(yù)后相關(guān)的模塊及樞紐基因，并根據(jù)表達(dá)譜信息構(gòu)建多個(gè)樞紐基因的共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)關(guān)系。現(xiàn)將結(jié)果報(bào)道如下。1 資料和方法1.1 數(shù)據(jù)來源與預(yù)處理 9例正常食管組織和78例食管腺癌組織的基因表達(dá)數(shù)據(jù)及臨床預(yù)后數(shù)據(jù)均來源于免費(fèi)、開源的TCGA數(shù)據(jù)庫（https://cancergenome.nih.gov
浙江醫(yī)學(xué) 2019年20期2019-11-16
- 細(xì)胞分裂周期蛋白6拷貝數(shù)變異與肺腺癌患者預(yù)后關(guān)系的研究△
CDC6基因的共表達(dá)基因的相關(guān)性分析采用Spearman相關(guān)性分析，以Spearman≥0.3，P＜0.01篩選CDC6基因的共表達(dá)基因。采用Kaplan-Meier法繪制生存曲線，生存率的比較采用Log-rank檢驗(yàn)。使用在線分析軟件DAVID 6.8[10]對(duì)差異基因的共表達(dá)基因進(jìn)行GO功能富集分析，使用在線數(shù)據(jù)庫KOBAS 3.0軟件[9]對(duì)差異基因的共表達(dá)基因進(jìn)行KEGG通路分析，GO/KEGG使用超幾何檢驗(yàn)。以P＜0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。2
癌癥進(jìn)展 2019年19期2019-11-08
- 蘇博美利奴羊毛囊發(fā)育相關(guān)lncRNA與mRNA共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建
NA與mRNA共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建陳華峰1,2，田可川2，黃錫霞1，阿布來提·蘇來曼1，何軍敏3，田月珍2，徐新明2，付雪峰2，趙冰茹4，朱樺1，哈尼克孜·吐拉甫2（1新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科學(xué)學(xué)院，烏魯木齊 830052；2新疆畜牧科學(xué)院畜牧研究所，烏魯木齊 830011；3甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科學(xué)技術(shù)學(xué)院，蘭州 730070；4中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院，北京 100083）【】隨著高通量測(cè)序技術(shù)的發(fā)展和完善，海量的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)隨之涌現(xiàn)，基因網(wǎng)絡(luò)的方法也越來越多被用
中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué) 2019年19期2019-10-12
- 基于TCGA數(shù)據(jù)庫分析TET1在肺腺癌的表達(dá)及其相關(guān)分析
獲取TET1的共表達(dá)基因后，與來源于TCGA和GEO的LUAD數(shù)據(jù)集所共有的高表達(dá)基因（P-value＜0.001，|FoldChange|＞2.02）進(jìn)行venn圖分析，找出確定的基因組，并將基因組集導(dǎo)入DAVID分析工具［7］進(jìn)行GO基因集富集分析和通路分析，并使用funrich3.1.3導(dǎo)出效果圖。1.3 統(tǒng)計(jì)分析 采用SPSS 20.0統(tǒng)計(jì)軟件。生存分析使用Kaplan-Meier和Log-rank檢驗(yàn)，P＜0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。其它基因表達(dá)
浙江臨床醫(yī)學(xué) 2019年6期2019-07-30
- 腐敗梭菌α毒素和產(chǎn)氣莢膜梭菌ε毒素的共表達(dá)及其免疫效力評(píng)價(jià)
實(shí)驗(yàn)構(gòu)建了可以共表達(dá)腐敗梭菌α毒素和產(chǎn)氣莢膜梭菌ε毒素的雙基因表達(dá)載體，探究了共表達(dá)產(chǎn)物的反應(yīng)原性、毒性和相互作用等生物學(xué)特性，并將其制成基因工程滅活疫苗，評(píng)價(jià)了該疫苗的免疫效力，為羊快疫和腸毒血癥基因工程多聯(lián)疫苗的研制提供了試驗(yàn)基礎(chǔ)。1 材料與方法1.1 實(shí)驗(yàn)材料 腐敗梭菌C55－1株、D型氣莢膜梭菌C60－3株、腐敗梭菌毒素和D型產(chǎn)氣莢膜梭菌毒素及其抗毒素羊血清均由中國(guó)獸醫(yī)藥品監(jiān)察所保存，自誘導(dǎo)培養(yǎng)基由中國(guó)獸醫(yī)藥品監(jiān)察所配制。pETDuet－1 購(gòu)自
中國(guó)獸藥雜志 2019年2期2019-03-12
- 白蟻及其共生菌來源的4種木質(zhì)纖維素酶的共表達(dá)
木質(zhì)纖維素酶的共表達(dá)杜嬌，姜淑喆，未建華，申玉龍，倪金鳳山東大學(xué) 微生物技術(shù)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，山東 青島 266200杜嬌, 姜淑喆, 未建華, 等. 白蟻及其共生菌來源的4種木質(zhì)纖維素酶的共表達(dá).生物工程學(xué)報(bào), 2019, 35(2): 244–253.Du J, Jiang SZ, Wei JH, et al. Co-expression of lignocellulase from termite and their endosymbionts. Ch
生物工程學(xué)報(bào) 2019年2期2019-02-26
- 基于生物信息學(xué)技術(shù)探討宮頸癌腫瘤組織中p53突變、共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)及臨床轉(zhuǎn)歸分析
中p53突變、共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)及臨床轉(zhuǎn)歸分析趙子騫，梁新苗，張飛躍，趙培慶255036 山東，淄博實(shí)驗(yàn)中學(xué)（趙子騫、梁新苗）；255036 山東，淄博市中心醫(yī)院婦科（張飛躍），轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)中心（趙培慶）利用生物信息學(xué)技術(shù)探討 p53 在宮頸癌的突變、共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)及在疾病預(yù)后中的預(yù)測(cè)能力，為宮頸癌的診斷與預(yù)后判斷提供一定的理論基礎(chǔ)。利用癌癥基因組圖譜數(shù)據(jù)庫對(duì)靶標(biāo)分子 p53 進(jìn)行檢索，發(fā)現(xiàn)其突變及可能的作用分子與網(wǎng)絡(luò)。p53 基因在宮頸癌中的突變率約為 9%，通過 ST
中國(guó)醫(yī)藥生物技術(shù) 2019年1期2019-02-18
- 與多形性膠質(zhì)母細(xì)胞瘤患者生存期相關(guān)的權(quán)重基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建
究采用權(quán)重基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)（Weighted Gene Co-Expression Network，WGCNA）分析構(gòu)建了多形性膠質(zhì)母細(xì)胞瘤權(quán)重基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)，并與患者生存期進(jìn)行相關(guān)性分析，篩選出與生存期顯著相關(guān)的共表達(dá)模塊，并進(jìn)一步利用通路富集分析軟件對(duì)模塊中的基因進(jìn)行通路分析，從而為多形性膠質(zhì)母細(xì)胞瘤臨床治療提供參考依據(jù)。1 資料與方法1.1 一般資料本研究納入的膠質(zhì)瘤患者臨床資料和膠質(zhì)瘤組織RNA測(cè)序數(shù)據(jù)全部從TCGA數(shù)據(jù)庫獲得。TCGA數(shù)據(jù)庫共收錄了
中國(guó)醫(yī)藥科學(xué) 2019年24期2019-02-15
- S-亞胺還原酶和葡萄糖脫氫酶共表達(dá)系統(tǒng)的構(gòu)建及手性胺的合成
單質(zhì)粒雙啟動(dòng)子共表達(dá)系統(tǒng)，并以大腸桿菌為表達(dá)宿主實(shí)現(xiàn)了輔酶NADPH的再生，以全細(xì)胞為催化劑催化手性仲胺的合成。由于很多亞胺在水溶液中不穩(wěn)定，因此，本研究選取了pH中性條件下在水溶液中幾乎不會(huì)水解的亞胺2-甲基吡咯啉（2MPN）為模式底物，檢驗(yàn)雙酶共表達(dá)的全細(xì)胞催化劑的反應(yīng)效率。同時(shí)，本研究探究了溫度、pH及有機(jī)溶劑對(duì)胞內(nèi)雙酶反應(yīng)的影響，進(jìn)一步優(yōu)化了全細(xì)胞雙酶反應(yīng)的條件，旨為亞胺還原酶高效合成手性胺奠定基礎(chǔ)。1 材料與方法1.1 材料1.1.1 菌種和質(zhì)粒
生物技術(shù)通報(bào) 2019年1期2019-01-23
- MYC/Bcl-2蛋白共表達(dá)與彌漫性大B細(xì)胞淋巴瘤臨床特征的關(guān)系及其對(duì)預(yù)后的影響
過表達(dá)則稱為“共表達(dá)”，提示更差的預(yù)后。而MYC/Bcl-2的共表達(dá)與DLBCL預(yù)后的關(guān)系報(bào)道較少。本研究收集武漢大學(xué)人民醫(yī)院（以下簡(jiǎn)稱“我院”）DLBCL患者的臨床資料，結(jié)合免疫組化結(jié)果，探討MYC/Bcl-2的共表達(dá)與彌漫性大B細(xì)胞淋巴瘤臨床特征的關(guān)系及其對(duì)預(yù)后的影響，現(xiàn)報(bào)道如下：1 資料與方法1.1 一般資料收集2012年1月～2014年1月我院經(jīng)病理確診的DLBCL的患者共59例。治療前Hans分型參照2008年WHO關(guān)于造血與淋巴組織腫瘤分類標(biāo)準(zhǔn)
中國(guó)醫(yī)藥導(dǎo)報(bào) 2018年31期2018-12-20
- 彌漫大B細(xì)胞淋巴瘤中MYC和BCL-2蛋白共表達(dá)的臨床病理意義
BCL-2蛋白共表達(dá)的臨床病理意義胡名娟1*，李國(guó)偉1，歐陽小明2(1.廣州市花都區(qū)人民醫(yī)院病理科，廣東 廣州510800；2.廣州醫(yī)科大學(xué)附屬第二醫(yī)院病理科)目的檢測(cè)彌漫大B細(xì)胞淋巴瘤(DLBCL)中MYC和BCL-2蛋白表達(dá)狀況，探討MYC/BCL-2共表達(dá)在DLBCL中的臨床意義和預(yù)后評(píng)估價(jià)值。方法回顧性分析76例確診并采用利妥昔單抗初治的非特指型DLBCL病例的Ann Arbor分期、標(biāo)準(zhǔn)國(guó)際預(yù)后指數(shù)評(píng)分(IPI)、免疫組化Hans分型和臨床療效等
中南醫(yī)學(xué)科學(xué)雜志 2017年3期2017-12-25
- 膀胱癌相關(guān)lncRNA及其共表達(dá)mRNA的初步篩選與功能預(yù)測(cè)
ncRNA及其共表達(dá)mRNA的初步篩選與功能預(yù)測(cè)舒靜1，黃夢(mèng)鴿1，田強(qiáng)1，姜源1，陳俊霞2(1西南醫(yī)科大學(xué)附屬醫(yī)院，四川瀘州 646000；2重慶醫(yī)科大學(xué))目的 篩選出在膀胱癌組織中特異性表達(dá)的長(zhǎng)鏈非編碼RNA(lncRNA)及其共表達(dá)mRNA，并進(jìn)行初步驗(yàn)證及功能預(yù)測(cè)。方法 采用lncRNA v4.0芯片篩選4對(duì)膀胱癌和癌旁組織中l(wèi)ncRNA及其共表達(dá)mRNA的差異表達(dá)譜，通過聚類分析比較二者表達(dá)差異；采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR(qRT-PCR)法對(duì)5個(gè)異常
山東醫(yī)藥 2017年20期2017-07-01
- 兩種半纖維素酶在畢赤酵母中的共表達(dá)
與篩選，獲得了共表達(dá)菌株GS115/DSB-ManA。其熱穩(wěn)定性檢測(cè)結(jié)果表明，該共表達(dá)菌株產(chǎn)出的DSB與ManA均有較高的熱穩(wěn)定性。重組菌株兩種酶的成功表達(dá)為復(fù)合酶制劑的研究和生產(chǎn)奠定了基礎(chǔ)。關(guān)鍵詞：木聚糖酶（DSB）；甘露聚糖酶ManA；畢赤酵母（Pichia pastoris）；共表達(dá)中圖分類號(hào)：Q19 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼：A 文章編號(hào)：0439-8114（2017）10-1971-02DOI：10.14088/j.cnki.issn0439-8114.201
湖北農(nóng)業(yè)科學(xué) 2017年10期2017-06-22
- 共表達(dá)磷脂酶C促進(jìn)葡萄糖異構(gòu)酶在大腸桿菌中的胞外表達(dá)
214122）共表達(dá)磷脂酶C促進(jìn)葡萄糖異構(gòu)酶在大腸桿菌中的胞外表達(dá)姜 琪， 宿玲恰， 吳 敬， 陳 晟*（食品科學(xué)與技術(shù)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，江南大學(xué)，江蘇 無錫 214122）磷脂酶C（PLC）能夠水解細(xì)胞膜主要成分磷脂，使細(xì)胞膜通透性增強(qiáng)，從而能夠釋放出胞內(nèi)物質(zhì)。作者構(gòu)建了PLC與天然胞內(nèi)定位蛋白葡萄糖異構(gòu)酶（GI）共表達(dá)的重組大腸桿菌，搖瓶發(fā)酵胞外上清液中GIC酶活達(dá)到3.4 U/mL，占胞外和胞內(nèi)總酶活的93%，表明GIC成功實(shí)現(xiàn)了胞外表達(dá)。將胞外上清液
食品與生物技術(shù)學(xué)報(bào) 2017年3期2017-05-03
- PPK和GMAS共表達(dá)重組菌株的構(gòu)建及其在L-茶氨酸合成中的應(yīng)用
PK和GMAS共表達(dá)重組菌株的構(gòu)建及其在L-茶氨酸合成中的應(yīng)用李元*，劉珊*，?？≈袊?guó)科學(xué)院天津工業(yè)生物技術(shù)研究所，天津 300308李元, 劉珊, ?？? PPK和GMAS共表達(dá)重組菌株的構(gòu)建及其在L-茶氨酸合成中的應(yīng)用. 生物工程學(xué)報(bào), 2016, 32(12): 1745-1749.Li Y, Liu S, Zhu J. Construction of recombinant strains co-expressing PPK and GMAS fo
生物工程學(xué)報(bào) 2016年12期2016-12-28
- Ⅰ，Ⅱ期宮頸癌組織HIF-1α與COX-2蛋白共表達(dá)對(duì)預(yù)后的影響及機(jī)制*
COX-2蛋白共表達(dá)對(duì)預(yù)后的影響及機(jī)制*羅愛華，豐大利，付娟，李欣（三峽大學(xué)第二人民醫(yī)院暨宜昌市第二人民醫(yī)院 腫瘤放化療科，湖北 三峽 443000）目的探討Ⅰ，Ⅱ期宮頸癌組織中HIF-1α與COX-2蛋白的共表達(dá)對(duì)預(yù)后的影響及可能的機(jī)制。方法免疫組織化學(xué)法分析71例宮頸癌標(biāo)本的HIF-1α和COX-2的共表達(dá)情況；RT-PCR法檢測(cè)標(biāo)本中HIF-1α mRNA和COX-2 mRNA的表達(dá)水平。χ2檢驗(yàn)分析不同表達(dá)組患者1、2和3年存活率的差異；采用KM生
中國(guó)現(xiàn)代醫(yī)學(xué)雜志 2016年16期2016-08-29
- 黃色短桿菌ilvN基因定點(diǎn)突變和ilvBN、ilvC串聯(lián)表達(dá)對(duì)L-纈氨酸產(chǎn)量的影響
酸異構(gòu)還原酶；共表達(dá)引 言L-纈氨酸(valine)是一種支鏈氨基酸，廣泛應(yīng)用于醫(yī)藥、食品及調(diào)味劑、動(dòng)物飼料和化妝品等行業(yè)[1-3]。目前，發(fā)酵法、直接提取法和化學(xué)合成法是工業(yè)生產(chǎn)L-纈氨酸的3種主要方法[4]。微生物發(fā)酵為首選，常用生產(chǎn)菌株主要由棒桿菌和短桿菌選育而來，其中以谷氨酸棒狀桿菌和黃色短桿菌為代表[5]。誘變和代謝工程育種在L-纈氨酸生產(chǎn)菌種選育中最為常用[6]。誘變育種操作簡(jiǎn)單，技術(shù)要求低，但工作量大、周期長(zhǎng)、突變不定向性及副產(chǎn)物雜酸多，提純
化工學(xué)報(bào) 2016年7期2016-08-06
- 家蠶生物反應(yīng)器共表達(dá)豬α+γ干擾素的生產(chǎn)研究
家蠶生物反應(yīng)器共表達(dá)豬α+γ干擾素的生產(chǎn)研究丁 農(nóng)， 張金衛(wèi)， 李江濤， 魚南洋， 馮世民， 沈建華， 徐森華(湖州市農(nóng)業(yè)科學(xué)研究院，浙江湖州 313000)近年來，隨著基因工程技術(shù)的發(fā)展，家蠶生物反應(yīng)器(家蠶BmNPV桿狀病毒表達(dá)載體系統(tǒng))生產(chǎn)轉(zhuǎn)基因生物活性物質(zhì)的良好特性被生物學(xué)家所認(rèn)識(shí)，許多基因工程產(chǎn)品通過家蠶這一優(yōu)良生物反應(yīng)器得到表達(dá)，家蠶生物反應(yīng)器成為免疫學(xué)和基因工程真核生物表達(dá)系統(tǒng)等研究領(lǐng)域的重大進(jìn)展之一[1]。采用家蠶生物反應(yīng)器技術(shù)成功地表達(dá)了
安徽農(nóng)業(yè)科學(xué) 2016年1期2016-02-26
- 一對(duì)2型糖尿病老年雙生子基因表達(dá)譜動(dòng)態(tài)變化比較
基因?yàn)殡p生子的共表達(dá)基因，通過FatiGO Compare工具比較兩組共表達(dá)基因功能注釋的異同。結(jié)果分別篩選到大、小雙的共表達(dá)基因473和529個(gè)，其中相同的共表達(dá)基因功能富集于“T細(xì)胞活化調(diào)節(jié)” 基因本體(GO)類，不同的共表達(dá)基因功能差異體現(xiàn)在分子功能調(diào)節(jié)及刺激反應(yīng)2個(gè)GO類別。結(jié)論免疫功能基因的異常表達(dá)是該對(duì)雙生子T2DM隨病程延長(zhǎng)而穩(wěn)定出現(xiàn)的共性特征。關(guān)鍵詞〔〕2型糖尿??；同卵雙生子；共表達(dá)基因；基因表達(dá)譜中圖分類號(hào)〔〕R587.1〔文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼〕A
中國(guó)老年學(xué)雜志 2015年5期2015-12-31
- 共表達(dá)蛋白質(zhì)折疊輔助因子對(duì)畢赤酵母分泌表達(dá)IFNβ-HSA融合蛋白質(zhì)的影響
。有文獻(xiàn)報(bào)道，共表達(dá)分子伴侶BiP能夠促進(jìn)畢赤酵母分泌外源蛋白質(zhì)[7]；但也有研究表明，BiP的過量共表達(dá)會(huì)對(duì)外源蛋白質(zhì)表達(dá)造成負(fù)面影響[8]。分析其原因可能是過表達(dá)BiP將導(dǎo)致其輔助分子伴侶Lhs1p或內(nèi)質(zhì)網(wǎng)腔內(nèi)ATP等含量不足，過多的BiP不再能發(fā)揮分子伴侶活性，從而使蛋白質(zhì)進(jìn)入ERAD途徑而被降解[9-10]。二硫鍵異構(gòu)酶（PDI）能夠加速對(duì)蛋白質(zhì)的進(jìn)一步折疊，主要負(fù)責(zé)二硫鍵的形成和異構(gòu)化，能夠防止新生多肽多聚體產(chǎn)生，而且能使錯(cuò)誤折疊的蛋白質(zhì)重新正確
食品與生物技術(shù)學(xué)報(bào) 2014年12期2014-12-25
- 攜帶pGRIM-19-si-survivin共表達(dá)質(zhì)粒的減毒沙門菌對(duì)前列腺癌移植瘤的體內(nèi)抑制作用*
rvivin 共表達(dá)質(zhì)粒的基礎(chǔ)上，以減毒沙門菌作為運(yùn)載體，觀察其對(duì)裸鼠前列腺癌皮下移植瘤的抑瘤效應(yīng)，并探討相關(guān)機(jī)制。材 料 和 方 法1 動(dòng)物雄性裸鼠，30只，4～6周齡，質(zhì)量18～20 g，購(gòu)于中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院實(shí)驗(yàn)動(dòng)物研究所。2 主要材料psi-survivin質(zhì)粒、psi-scramble質(zhì)粒、pGRIM-19質(zhì)粒、pGRIM-19-si-survivin重組質(zhì)粒和DU145細(xì)胞株由吉林大學(xué)前列腺疾病防治研究中心饋贈(zèng)；減毒人傷寒沙門氏菌Ty21a由美國(guó)馬
中國(guó)病理生理雜志 2014年6期2014-08-08
- Delta-catenin和Rac1蛋白在肺癌組織中共表達(dá)的臨床意義
白在肺癌組織中共表達(dá)的臨床意義張俊毅1，董彩鳳2（1.赤峰學(xué)院醫(yī)學(xué)院病理教研室；2.赤峰學(xué)院附屬醫(yī)院呼吸內(nèi)科，內(nèi)蒙古 赤峰 024000）張俊毅，男，漢族，1977年3月出生于內(nèi)蒙古烏蘭察布市商都縣。2000年畢業(yè)于內(nèi)蒙古醫(yī)科大學(xué)臨床醫(yī)學(xué)專業(yè)，2003-2006年于河北醫(yī)科大學(xué)攻讀病理學(xué)碩士學(xué)位，2007-2010年于中國(guó)醫(yī)科大學(xué)攻讀病理學(xué)博士學(xué)位，2012年9月進(jìn)入汕頭大學(xué)醫(yī)學(xué)院基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)博士后流動(dòng)站從事博士后科研工作?，F(xiàn)任赤峰學(xué)院醫(yī)學(xué)院副教授，呼吸內(nèi)科副
- “雙打擊”B細(xì)胞淋巴瘤的研究進(jìn)展
Bcl-2蛋白共表達(dá)(MYC/Bcl-2 protein coexpression)”，其發(fā)生率遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于根據(jù)分子遺傳學(xué)定義的DHL，甚至可以發(fā)生在非生發(fā)中心來源的DLBCL中，這與傳統(tǒng)意義上的DHL存在本質(zhì)的區(qū)別。對(duì)于MYC/Bcl-2蛋白共表達(dá)的DLBCL，目前的共識(shí)是其預(yù)后顯著差于無共表達(dá)的DLBCL。在迄今為止樣本量最大的1項(xiàng)研究中，Hu等［15］分析了466例接受R-CHOP方案治療的DLBCL，發(fā)現(xiàn)MYC/Bcl-2共表達(dá)的發(fā)生率為34%，并且具
中國(guó)癌癥雜志 2014年10期2014-06-01
- 慢病毒載體系統(tǒng)介導(dǎo)hUC-MSC綠色熒光蛋白和熒光素酶共表達(dá)技術(shù)體系的建立
熒光素酶基因的共表達(dá)，且該雙外源蛋白的共表達(dá)對(duì)hUC-MSC的生長(zhǎng)增殖無顯著影響。慢病毒載體系統(tǒng)介導(dǎo)hUCMSC綠熒光蛋白和熒光素酶共表達(dá)技術(shù)體系的建立不僅極大地方便了其體內(nèi)轉(zhuǎn)歸的示蹤，同時(shí)也為基因工程修飾干細(xì)胞提供了強(qiáng)有力的手段。材料和方法一、材料1.細(xì)胞和質(zhì)粒：hUC-MSC來源于福州總醫(yī)院泌尿外科實(shí)驗(yàn)室干細(xì)胞組，取P4代細(xì)胞。人胚腎上皮細(xì)胞系HEK293T購(gòu)自美國(guó)典型培養(yǎng)物保藏中心（ATCC）。慢病毒表達(dá)載體pLEXMCS購(gòu)自美國(guó)Open Biosy
中華細(xì)胞與干細(xì)胞雜志(電子版) 2013年3期2013-12-06