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    巴什拜羊BPI基因的克隆與真核表達(dá)

    2015-10-20 21:11:33陳冬梅等
    江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2015年9期
    關(guān)鍵詞:基因克隆

    陳冬梅等

    摘要:從巴什拜羊外周血多形核粒細(xì)胞(PMN)中提取總RNA,經(jīng)RT-PCR擴(kuò)增出巴什拜羊BPI基因片段,將其克隆至pPIC9K載體中,構(gòu)建真核表達(dá)質(zhì)粒pPIC9K-BPI,經(jīng)PCR、酶切及測序鑒定正確后,電轉(zhuǎn)化至畢赤酵母GS115中并用甲醇誘導(dǎo)表達(dá),SDS-PAGE鑒定重組BPI蛋白的表達(dá),通過微量肉湯稀釋法檢測重組BPI蛋白的抑菌活性。結(jié)果表明:RT-PCR擴(kuò)增獲得597 bp巴什拜羊BPI基因;經(jīng)PCR、酶切及測序鑒定證實成功構(gòu)建BPI基因的真核表達(dá)載體,SDS-PAGE檢測結(jié)果表明,重組BPI蛋白成功表達(dá),通過抑菌試驗表明表達(dá)的重組BPI蛋白具有明顯抑菌活性。

    關(guān)鍵詞:巴什拜羊;殺菌性;通透性增加蛋白;畢赤酵母;基因克??;真核表達(dá)

    中圖分類號: Q785文獻(xiàn)標(biāo)志碼: A文章編號:1002-1302(2015)09-0039-04

    收稿日期:2014-09-16

    我國是養(yǎng)羊大國,新疆維吾爾自治區(qū)是我國主要的綿羊生產(chǎn)基地,巴什拜羊是新疆乃至國內(nèi)外不可多見的綿羊地方優(yōu)良品種,具有特殊的生物學(xué)特性[1],原產(chǎn)自新疆維吾爾自治區(qū)裕民縣。該羊具有生長發(fā)育速度快、生產(chǎn)性能高、抗病力強(qiáng)等特征,其羔羊成活率達(dá)95%以上,是發(fā)展我國重要的羊品種資源[2]。殺菌性/通透性增加蛋白(BPI)主要存在于人、哺乳動物的多形核粒細(xì)胞(PMN)嗜天青顆粒中,是PMN的主要抗菌成分[3-5],具有殺菌、中和內(nèi)毒素以及促進(jìn)補(bǔ)體活化增強(qiáng)調(diào)理功能的作用。Vander等發(fā)現(xiàn),BPI蛋白可以誘導(dǎo)血管內(nèi)皮細(xì)胞的凋亡,抑制血管生成,在體外血管生成試驗中,在1.8 μmol/L濃度下作用24 h后BPI蛋白能夠抑制81%的血管生成,這一發(fā)現(xiàn)使BPI蛋白有望用于治療癌癥或與血管形成有關(guān)的疾病[6]。BPI蛋白在抗真菌感染[7]、抗弓形蟲感染[8]等領(lǐng)域也有非常重要的意義。2005年,美國食品藥品管理局批準(zhǔn)rBPI21/rBPI23進(jìn)行Ⅱ~Ⅲ期臨床試驗,該臨床試驗主要研究兒童急性腦膜炎菌血癥、出血、腹腔感染、肝切除以及膽囊纖維化導(dǎo)致的嚴(yán)重感染,還有其他革蘭氏陰性菌、內(nèi)毒素進(jìn)入血液循環(huán)而造成的致病、致死等癥狀 [9]。Levy證實了rBPI21不僅可以降低病死率,顯著降低血液IL-6的水平,還可以減少感染性并發(fā)癥和成人呼吸窘迫綜合征的發(fā)生率[10]。周紅等從豬PMN 中提取了豬源BPI 蛋白,發(fā)現(xiàn)豬源性BPI 蛋白具有中和內(nèi)毒素、殺滅革蘭氏陰性菌的作用[11] 。朱璟研究BPI基因?qū)ωi抗F18大腸桿菌感染的功能及機(jī)理[12]。2004年,Alexander等用腺病毒介導(dǎo)的BPI轉(zhuǎn)基因小鼠模型進(jìn)行體內(nèi)外試驗,均顯示腺病毒為載體的重組BPI介導(dǎo)的基因轉(zhuǎn)化可以進(jìn)行細(xì)胞外分泌,且分泌的BPI蛋白可以中和脂多糖LPS,并且減少致炎細(xì)胞因子TNF-α和巨噬細(xì)胞炎癥蛋白-2(MIP-2)的產(chǎn)生[13]。但有關(guān)羊BPI基因的功能還未見報道。本試驗從巴什拜羊外周血中提取多形核粒細(xì)胞PMN總RNA,經(jīng)RT-PCR獲得BPI目的基因片段,構(gòu)建巴什拜羊BPI真核表達(dá)載體,并對其表達(dá)產(chǎn)物進(jìn)行生物活性檢測,旨在為進(jìn)一步深入研究巴什拜羊重組BPI蛋白的生物學(xué)功能奠定基礎(chǔ)。

    1材料與方法

    1.1試驗動物、菌株與載體

    本試驗所用的5只巴什拜羊由石河子大學(xué)動物科技學(xué)院試驗站提供。巴斯德畢赤酵母GS115菌株及表達(dá)載體pPIC9K為新疆農(nóng)墾科學(xué)院獸醫(yī)研究所薄新文研究員饋贈,DH5ɑ菌株由石河子大學(xué)動物科技學(xué)院生化實驗室保存。抑菌試驗所用的大腸桿菌(Escherichia coli)ATCC25922、沙門氏菌(Salmonella spp.)ATCC14028、金黃色葡萄球菌(Staphylococcus aureu)ATCC25923均為石河子大學(xué)動物科技學(xué)院中獸醫(yī)實驗室饋贈。

    1.2主要試劑

    反轉(zhuǎn)錄試劑盒,限制性內(nèi)切酶SnaBⅠ、NotⅠ、SacⅠ和Taq聚合酶均購自TaKaRa公司;T4 DNA連接酶購自天根生化科技有限公司;蛋白marker購自Fermentas公司;酵母基因組DNA快速提取試劑盒、質(zhì)粒小量提取制備試劑盒、瓊脂糖凝膠DNA回收試劑盒、DNA marker DL 2501、DNA Marker DL 2503購自上海捷瑞生物工程有限公司;D-山梨醇、酵母氮堿(YNB)、G418、生物素均購自北京索萊寶科技有限公司;普通肉湯培養(yǎng)基中的蛋白胨、酵母提取物購自上海坤肯生物化工有限公司;中性粒細(xì)胞分離液購自天津市灝洋生物制品科技有限責(zé)任公司。

    1.3目的片段的擴(kuò)增及重組表達(dá)質(zhì)粒pPIC9K-BPI的構(gòu)建

    巴什拜羊BPI基因cDNA全長序列由筆者所在實驗室通過cDNA末端快速擴(kuò)增技術(shù)(RACE)獲得,登錄號為KF523344。根據(jù)該基因的ORF設(shè)計活性段表達(dá)引物,上游引物為5′-TACGTA ATGACCAACCCAGGCATCGTG-3′,下游引物為5′-GCGGCCGCTCATAGTTTGGTTGTCACTGGCAG-3′。通過頸靜脈采集巴什拜羊血液,用肝素抗凝,按照中性粒細(xì)胞分離液說明書方法分離外周血中性粒細(xì)胞。用Trizol法抽提巴什拜羊中性粒細(xì)胞總RNA。提取的總RNA用無菌DEPC水溶解,用瓊脂糖凝膠電泳檢測RNA的完整性。以提取的PMN總RNA為模板,反轉(zhuǎn)錄合成cDNA,再以cDNA模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增。反應(yīng)條件:94 ℃ 5 min;94 ℃ 40 s,54 ℃ 30 s,72 ℃ 60 s,32個循環(huán);72 ℃延伸10 min,4 ℃ 保存。用 NotⅠ、SnaBⅠ分別對巴什拜羊BPI基因及pPIC9K表達(dá)載體進(jìn)行雙酶切,用T4 DNA連接酶在16 ℃連接過夜,將10 μL連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化于100 μL感受態(tài)細(xì)胞DH5α,涂布于含有 100 mg/L 氨芐青霉素的LB瓊脂板上,于37 ℃恒溫箱中靜止過夜培養(yǎng)。挑取單個菌落,接種于5 mL含有 100 mg/L氨芐青霉素的LB液體培養(yǎng)基中,37 ℃ 220 r/min振蕩過夜培養(yǎng)。取2~3 mL菌液,提取質(zhì)粒,進(jìn)行雙酶切、PCR鑒定,同時將 1 mL 菌液和5 μL質(zhì)粒送往北京六合華大基因科技股份有限公司測序,將測序結(jié)果正確的重組質(zhì)粒命名為pPIC9K-BPI。

    1.4重組表達(dá)質(zhì)粒pPIC9K-BPI的轉(zhuǎn)化與鑒定

    按Riffault等的方法[14]制備感受態(tài)酵母菌GS115,取80 μL 感受態(tài)GS115與20 μL線性化的重組表達(dá)質(zhì)粒pPIC9K-BPI混合,電擊轉(zhuǎn)化后涂布于MD平板上,28 ℃孵育3 d,每天觀察菌落的生長情況。挑取單菌落,用酵母基因組DNA快速提取試劑盒提取酵母基因組DNA,以其為模板,分別用表達(dá)引物和用酵母載體上的通用引物(α-Factor:5′-TACTATTGCCAGCATTGCTGC-3′、3′AOX1:5′-GCAAATGGCATTCTGACATCC-3′)進(jìn)行基因型、表型鑒定。PCR產(chǎn)物通過瓊脂糖凝膠電泳分析,根據(jù)擴(kuò)增片段的大小判斷酵母染色體中是否有目的基因片段插入?;蛐丸b定中PCR的反應(yīng)條件:94 ℃ 5 min;94 ℃ 40 s,63 ℃ 30 s,72 ℃ 40 s,32個循環(huán);72 ℃延伸10 min,4 ℃保存。若能夠擴(kuò)增出1條目的條帶,再進(jìn)行表型鑒定,表型鑒定的反應(yīng)條件:94 ℃ 5 min;94 ℃ 40 s,54 ℃ 30 s,72 ℃ 60 s,32個循環(huán);72 ℃延伸 10 min,4 ℃ 保存。在表型鑒定中,若能擴(kuò)增出2條帶,一條是含有目的基因片段的擴(kuò)增條帶,另一條是野生型AOX1基因的擴(kuò)增帶,約為 2.2 kb,則為陽性轉(zhuǎn)化子即Mut+(甲醇利用野生型)表型特征。

    1.5重組菌株GS115/pPIC9K-BPI的表達(dá)與SDS-PAGE分析

    將PCR鑒定正確的重組酵母菌GS115/pPIC9K-BPI接種于50 mL YPD培養(yǎng)基中,于28 ℃培養(yǎng)至D值為4時,6 000 r/min離心3 min,收集菌體。將富集的菌體轉(zhuǎn)接于250 mL BMMY培養(yǎng)基中繼續(xù)培養(yǎng)。每隔24 h加入終濃度為0.5%的甲醇誘導(dǎo)表達(dá)。同時按0、24、48、72、96、108 h分別取1 mL菌液樣品,離心收集上清、菌體,并將上清、菌體分別進(jìn)行SDS-PAGE鑒定。

    1.6抑菌試驗檢測表達(dá)產(chǎn)物的活性

    1.6.1不同濃度的重組BPI蛋白對大腸桿菌、沙門氏菌、金黃色葡萄球菌的抑制作用在配好的普通肉湯培養(yǎng)基中加入重組BPI蛋白,使其終濃度分別為5、10、20、40、80 μg/mL,將大腸桿菌、沙門氏菌、金黃色葡萄球菌稀釋至濃度為0.01億CFU/mL,取30 μL接種于含有各種濃度重組蛋白的肉湯培養(yǎng)基中。另外在不含重組BPI蛋白的肉湯培養(yǎng)基中分別加入30 μL大腸桿菌、沙門氏菌、金黃色葡萄球菌作為陽性對照,不含細(xì)菌也不含有重組蛋白的普通肉湯培養(yǎng)基設(shè)為陰性對照。在96孔板中以微量稀釋法測定重組BPI蛋白的抑菌活性,37 ℃培養(yǎng)12 h后使用酶標(biāo)儀在600 nm波長下進(jìn)行觀察并記錄其D值[15]。重復(fù)3次,取平均值(下同)。

    1.6.23個不同濃度重組BPI蛋白對大腸桿菌的抑制作用在普通肉湯培養(yǎng)基中加入重組BPI蛋白,使其終濃度為20、40、80 μg/mL,將30 μL大腸桿菌加入其中。陰性對照與陽性對照設(shè)置同上。37 ℃下分別培養(yǎng)1、2、3、4、5 h,設(shè)置酶標(biāo)儀在600 nm波長下,對96孔板進(jìn)行掃描,測定D值,保存數(shù)據(jù)。

    1.7數(shù)據(jù)處理

    數(shù)據(jù)以“平均值±標(biāo)準(zhǔn)差”表示,采用SPSS 13.0軟件對所測數(shù)據(jù)進(jìn)行Two-way ANOVA方差分析,比較重組BPI蛋白的抑菌效果。

    2結(jié)果與分析

    2.1RNA的完整性與純度

    從巴什拜羊PMN中提取的總RNA進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳檢測,可見明顯的28S、18S、5S條帶(圖1),說明提取總RNA基本沒有降解,具有較好的完整性。對其進(jìn)行紫外分光光度分析得出D260 nm/D280 nm的值>1.8,表明RNA具有較高的純度,符合反轉(zhuǎn)錄要求。

    2.2重組表達(dá)質(zhì)粒pPIC9K-BPI的PCR與雙酶切鑒定

    重組表達(dá)型質(zhì)粒pPIC9K-BPI經(jīng)Not、SnaBⅠ雙酶切和PCR鑒定,均得到了大小為597 bp的條帶,與預(yù)期片段大小相符合(圖2、圖3)。測序結(jié)果正確,表明目的片段已正確插入到真核表達(dá)載體中。

    2.3重組菌株GS115/pPIC9K-BPI的PCR鑒定

    挑取YPD-G418平板上的單個菌落,以重組菌株的

    DNA為模板,分別進(jìn)行基因型、表型鑒定。在基因型鑒定中可見陽性轉(zhuǎn)化子條帶大小為597 bp,與預(yù)期條帶大小相符合(圖4)。在表型鑒定中,用酵母通用引物進(jìn)行PCR 擴(kuò)增鑒定,可見陽性轉(zhuǎn)化子能擴(kuò)增出2條帶,一條是含有目的基因片段的擴(kuò)增條帶,約597 bp,另一條是野生型AOX1基因的擴(kuò)增帶,約2.2 kb,為Mut+(甲醇利用野生型)表型PCR鑒定特征(圖5)。

    2.4重組菌株GS115/pPIC9K-BPI表達(dá)產(chǎn)物的SDS-PAGE分析

    將重組菌株GS115/pPIC9K-BPI經(jīng)甲醇誘導(dǎo)表達(dá)后,分別收集上清、菌體,上清經(jīng)過SDS-PAGE分析,在約43 ku處出現(xiàn)條帶,與預(yù)期目的蛋白分子量相符,在空載質(zhì)粒對照組和0 h表達(dá)載體未見有條帶,表明BPI蛋白成功表達(dá)(圖6),收集的菌體沒有表達(dá)出目的蛋白。

    2.5抑菌試驗檢測重組BPI的蛋白活性

    表1表明,各試驗組細(xì)菌的陽性對照組(肉湯培養(yǎng)基中

    分別加入大腸桿菌、沙門氏菌、金黃色葡萄球菌)D值基本一致,陰性對照組(肉湯培養(yǎng)基)的D值也基本一致。當(dāng)?shù)鞍诐舛葹?、10 μg/mL時, 大腸桿菌組、沙門氏菌組與金黃色葡萄球菌組的D值差異不顯著。當(dāng)?shù)鞍诐舛葹?0 μg/mL時,大腸桿菌組、沙門氏菌組的D值顯著低于金黃色葡萄球菌組。當(dāng)?shù)鞍诐舛葹?0、80 μg/mL時,大腸桿菌、沙門氏菌組的D值極顯著低于金黃色葡萄球菌組。由此可見,重組BPI蛋白的濃度在20 μg/mL以上可以抑制大腸桿菌、沙門氏菌的生長,對金黃色葡萄球菌沒有抑制作用。

    3結(jié)論與討論

    本試驗選用pPIC9K表達(dá)載體,并在巴斯德畢赤酵母表達(dá)系統(tǒng)進(jìn)行表達(dá)。pPIC9K載體可以快速篩選高拷貝整合轉(zhuǎn)化子,并且具有來自轉(zhuǎn)座子Tn903的卡那霉素耐藥基因,能夠根據(jù)基因劑量效應(yīng),對G418的抗性水平快速篩選出高拷貝的轉(zhuǎn)化子,高拷貝整合的轉(zhuǎn)化子能夠提高外源基因的表達(dá)量[16]。本試驗中,筆者充分利用該載體的特性,先進(jìn)行高拷貝整合的轉(zhuǎn)化子篩選,然后再進(jìn)行表達(dá),結(jié)果發(fā)現(xiàn)重組蛋白表達(dá)量高達(dá)28 mg/mL。巴斯德畢赤酵母作為真核表達(dá)系統(tǒng),具有嚴(yán)格調(diào)控外源蛋白的表達(dá)、加工修飾表達(dá)產(chǎn)物、表達(dá)量高、營養(yǎng)要求低等優(yōu)點。此外,巴斯德畢赤酵母中表達(dá)產(chǎn)物可分泌至胞外,有利于表達(dá)產(chǎn)物的分離純化[17]。本試驗選用pPIC9K表達(dá)載體,構(gòu)建pPIC9K-BPI表達(dá)質(zhì)粒,并在巴斯德畢赤酵母表達(dá)系統(tǒng)進(jìn)行表達(dá),結(jié)果表明,用此技術(shù)表達(dá)重組蛋白高效、穩(wěn)定、表達(dá)產(chǎn)物易于純化。天然BPI蛋白由456個氨基酸殘基組成的堿性蛋白,含N端、C端、中間連接單位3部分組成,經(jīng)蛋白酶水解后可裂解為N端片段、C端片段,N端功能片段具有天然BPI的完整殺菌、中和細(xì)菌脂多糖(LPS)等活性[18]。目前有2種BPI蛋白獲取方法,但使用柱層析法獲得的BPI蛋白工作量大,獲取量低,成本高。而Gazzno-Santoro等用逆轉(zhuǎn)錄PCR的方法獲得分子量為23 ku的重組蛋白rBPI23,由于具有較高的活性,且容易獲取,廣泛應(yīng)用于臨床試驗,將人的BPI N-末端的 cDNA 擴(kuò)增轉(zhuǎn)入細(xì)胞載體后通過田倉鼠卵細(xì)胞中表達(dá)重組蛋白[19]。由于目前國內(nèi)外采用基因工程方法在豬、鼠、兔和牛上都獲得了重組BPI蛋白。在此之前,筆者所在實驗室通過RACE技術(shù)獲得了巴什拜羊BPI基因全長cDNA序列(GenBank登錄號為KF523344),本試驗根據(jù)此序列設(shè)計特異性引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,克隆出巴什拜羊BPI N-端序列,并在巴斯德畢赤酵母中成功表達(dá)出43 ku的含有199個氨基酸的重組BPI蛋白,經(jīng)過抑菌試驗檢測該重組蛋白具有明顯的抑菌活性,為研究綿羊BPI蛋白的其他生物學(xué)功能奠定基礎(chǔ)。PMN細(xì)胞內(nèi)諸多抗菌成分中,BPI是唯一能夠直接對革蘭氏陰性菌發(fā)揮殺菌作用和中和內(nèi)毒素作用的抗菌物質(zhì),被譽(yù)為“超級抗生素”[20]。本試驗中巴什拜羊重組BPI蛋白對G-菌均具有殺菌活性,但對G+無明顯效果。研究發(fā)現(xiàn),BPI的N端、C端均含有1個非極性的脂質(zhì)結(jié)合口袋,該非極性口袋為BPI與LPS相互作用的位點。BPI分子N端的堿性氨基酸殘基比酸性氨基酸殘基多16個,而C端的堿性氨基酸殘基比酸性氨基酸殘基少2個。BPI蛋白分子N端和C端電荷的不對稱分布促使的帶正電荷的N端更加能夠促進(jìn)BPI分子與G-菌細(xì)胞壁上帶負(fù)電荷的LPS之間的結(jié)合而起殺菌作用[21]。

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