黃必錄(上海世鵬實(shí)驗(yàn)室科技發(fā)展有限公司,上海 200120)
細(xì)胞發(fā)生的各種功能減退并趨向死亡的現(xiàn)象稱“細(xì)胞衰老”。細(xì)胞衰老的過(guò)程就是細(xì)胞生命活力退化和功能改變的過(guò)程,而生命活力退化主要與管家基因轉(zhuǎn)錄活性逐漸下降有關(guān),功能改變與少數(shù)基因轉(zhuǎn)錄活性上升有關(guān)。那么,個(gè)體和細(xì)胞是如何衰老的?
個(gè)體是由成體干細(xì)胞和功能細(xì)胞組成的。由年輕的成體干細(xì)胞分化補(bǔ)充的功能細(xì)胞是年輕的功能細(xì)胞,個(gè)體就會(huì)顯得年輕;由衰老的成體干細(xì)胞分化補(bǔ)充的功能細(xì)胞是衰老的功能細(xì)胞,個(gè)體就會(huì)顯得衰老。因此,造成個(gè)體衰老的原因,歸根結(jié)底是由成體干細(xì)胞本身衰老造成的[1-2],而非干細(xì)胞數(shù)量的減少,因?yàn)槔夏陚€(gè)體中的毛囊干細(xì)胞數(shù)量不變,造血干細(xì)胞數(shù)量反而是年輕個(gè)體的5~20倍。據(jù)此,只要找到導(dǎo)致細(xì)胞衰老的原因,就能讓衰老的細(xì)胞或個(gè)體返老還童。
衰老理論或?qū)W說(shuō)至今已有300多個(gè),但卻沒(méi)有一個(gè)能自圓其說(shuō)。
主流觀點(diǎn)認(rèn)為,Hayflick界限是由端粒長(zhǎng)度決定的。然而,人端粒酶催化亞基(hTERT)基因轉(zhuǎn)染視網(wǎng)膜色素上皮細(xì)胞或成纖維細(xì)胞,細(xì)胞只能倍增20多次[3];約翰·拉穆納斯等[4]將hTERT modRNA遞送到成纖維細(xì)胞瞬間延伸端粒,即使多次延伸端粒,細(xì)胞最終都會(huì)衰老。至于為什么,他們認(rèn)為可能是由于細(xì)胞積累了非端粒的DNA損傷。然而,HeLa細(xì)胞也會(huì)迅速積累非端粒的DNA損傷[5],但HeLa細(xì)胞的分裂次數(shù)仍然是無(wú)限的。說(shuō)明端粒縮短不是導(dǎo)致細(xì)胞衰老和Haiflick界限的惟一原因,DNA損傷也不會(huì)導(dǎo)致細(xì)胞衰老。
①1997年,Sinclair等[6]認(rèn)為,酵母細(xì)胞積累染色體外環(huán)形rDNA(extrachromo-somal DNA circle,ERC)是導(dǎo)致衰老的原因。然而,有一種ERC水平?jīng)]有升高的酵母菌株壽命反而更短[7],說(shuō)明細(xì)胞衰老并非是由ERC積累造成的;②只有20和40個(gè)拷貝rDNA的酵母菌株,基因組整體會(huì)變得不穩(wěn)定性,據(jù)此認(rèn)為低拷貝數(shù)的rDNA導(dǎo)致的基因組的不穩(wěn)定性是導(dǎo)致酵母細(xì)胞衰老的原因[8]。然而,衰老的野生型酵母菌株,仍然還有100個(gè)rDNA拷貝,說(shuō)明酵母細(xì)胞衰老并非是基因組的不穩(wěn)定性造成的;③由于細(xì)胞衰老過(guò)程蛋白質(zhì)合成速率是逐漸下降的,而且蛋白質(zhì)合成過(guò)程需要消耗核糖體RNA(ribosomal RNA,rRNA),況且轉(zhuǎn)錄成rRNA的rDNA是多拷貝的,其拷貝數(shù)也會(huì)隨著細(xì)胞衰老而逐漸減少。那么,導(dǎo)致細(xì)胞衰老過(guò)程蛋白質(zhì)合成速率下降的原因,是不是因?yàn)閞DNA拷貝數(shù)減少而引起rRNA供不應(yīng)求?為此,1972年,Johnson等[9]就提出了細(xì)胞衰老的rDNA的選擇性丟失學(xué)說(shuō)。然而Johnson的觀點(diǎn)也是錯(cuò)誤的,因?yàn)樵诤?0個(gè)拷貝和140個(gè)拷貝rDNA的啤酒酵母細(xì)胞中,rRNA含量幾乎是相同的。
DNA甲基化水平會(huì)隨著年齡或細(xì)胞分裂次數(shù)的增加而下降,據(jù)此認(rèn)為DNA甲基化水平下降是導(dǎo)致細(xì)胞衰老的原因。然而,秀麗隱桿線蟲(chóng)等少數(shù)動(dòng)物中并不存在DNA胞嘧啶甲基化現(xiàn)象。還有,細(xì)胞的轉(zhuǎn)分化和重編程都會(huì)改變DNA甲基化模式和染色質(zhì)修飾,然而,惟有重編程才能讓細(xì)胞返老還童。至于原因筆者認(rèn)為是因?yàn)橹鼐幊痰募?xì)胞同時(shí)有端粒等重復(fù)序列DNA的拷貝數(shù)重置,而轉(zhuǎn)分化細(xì)胞沒(méi)有,說(shuō)明導(dǎo)致細(xì)胞衰老的原因不在于DNA甲基化模式或染色質(zhì)的修飾的改變。
考慮到被自由基破壞掉的大分子會(huì)很快被更新,因此,一定水平的自由基不一定會(huì)導(dǎo)致衰老,甚至有意想不到的好處。例如,有人發(fā)現(xiàn)百草枯會(huì)產(chǎn)生超氧化物和過(guò)氧化氫,但濃度為0.01~0.1 mmol/L的百草枯處理線蟲(chóng)不但不會(huì)縮短壽命,而且還使壽命最高延長(zhǎng)了58%。
人體衰老過(guò)程,是生理生化不斷變化的過(guò)程,而衰老過(guò)程一些所謂的與衰老有關(guān)的衰老基因或長(zhǎng)壽基因的排列、拷貝數(shù)都沒(méi)有發(fā)生任何變化,因此,衰老的根本原因不是基因出了問(wèn)題,基因僅僅是影響衰老快慢的眾多因素之一。據(jù)此說(shuō)明,在因果關(guān)系中,衰老細(xì)胞炎癥因子基因的高表達(dá)不是細(xì)胞衰老的原因,而是結(jié)果。
上個(gè)世紀(jì)60年代,Hayflick把年輕的細(xì)胞核植入去核的衰老的細(xì)胞質(zhì)中,結(jié)果細(xì)胞恢復(fù)了分裂,說(shuō)明決定細(xì)胞衰老的部位是細(xì)胞核,而非細(xì)胞質(zhì)。提示了在億萬(wàn)年的演化過(guò)程中,個(gè)體和細(xì)胞早已經(jīng)形成了完善的防御系統(tǒng),對(duì)代謝廢物、突變的線粒體、交聯(lián)的大分子等的代謝殘?jiān)寄軌蜻M(jìn)行選擇性地清除掉。因此,在導(dǎo)致細(xì)胞衰老的因果關(guān)系中,代謝殘?jiān)姆e累不是導(dǎo)致細(xì)胞衰老的原因,而是細(xì)胞衰老產(chǎn)生的結(jié)果。筆者在2002年4月1日科技日?qǐng)?bào)發(fā)表的《我們能長(zhǎng)生不老嗎》曾指出:“異?;蚴У木€粒體會(huì)被溶酶體識(shí)別吞食”。溶酶體選擇性吞食線粒體稱“線粒體自噬”(mitophagy),這一名詞由Lemasters[10]于2005年提出。還有很多衰老學(xué)說(shuō)也是錯(cuò)誤且漏洞百出的(由于篇幅有限,不在此贅述),因此迫切需要推出全新的衰老學(xué)說(shuō)。
調(diào)控細(xì)胞分裂次數(shù)和衰老的底層物質(zhì)是什么?由于細(xì)胞衰老過(guò)程是一種逐漸發(fā)生穩(wěn)定的差異過(guò)程,而組蛋白、RNA等組份降解多少就能補(bǔ)充多少,以及大部分的DNA在一個(gè)生命周期中的排序和拷貝數(shù)都沒(méi)有發(fā)生改變,因此,決定細(xì)胞衰老和分裂次數(shù)的底層裝置只能是拷貝數(shù)可變的重復(fù)DNA[1]。
細(xì)胞衰老過(guò)程的表現(xiàn)是各種各樣的,但總結(jié)起來(lái)主要有5大特征:①染色質(zhì)逐漸固縮化或稱“衰老相關(guān)異染色質(zhì)聚集”。例如,在體外培養(yǎng)的細(xì)胞中,晚代細(xì)胞的細(xì)胞核里可以明顯地看到染色質(zhì)的固縮化,而早代只有輕微的固縮。②細(xì)胞的總蛋白質(zhì)合成速率逐漸下降。例如,和年輕大鼠相比,老年大鼠淋巴細(xì)胞的rRNA與信使RNA和蛋白質(zhì)合成下降了近20倍。③在同一種分化的細(xì)胞,基因表達(dá)譜會(huì)隨著年齡的增長(zhǎng)而逐步改變,因此,從胚胎到成年和老年過(guò)程的個(gè)體發(fā)育、成熟和衰老的本質(zhì)就是早中晚三個(gè)不同基因群程序化表達(dá)的結(jié)果[11]。例如,肝細(xì)胞在胎兒期表達(dá)早期基因群,如甲胎蛋白等,而不表達(dá)白蛋白;出生后停止表達(dá)甲胎蛋白,轉(zhuǎn)而表達(dá)中期基因群,如白蛋白等;老年期逐漸停止表達(dá)白蛋白,轉(zhuǎn)而表達(dá)晚期基因群,如衰老標(biāo)志蛋白2等。④線粒體生產(chǎn)三磷酸腺苷(adenosine triphosphate,ATP)速率逐漸下降[12]。⑤新陳代謝率逐漸下降。總之,與年輕細(xì)胞相比,衰老細(xì)胞的總蛋白質(zhì)合成速率和線粒體生產(chǎn)ATP速率都是下降的,這就是引起細(xì)胞衰老的主要原因,因?yàn)榫S持細(xì)胞的三維結(jié)構(gòu)、生長(zhǎng)、分裂、分化和新陳代謝都需要消耗蛋白質(zhì)(酶)和ATP。
細(xì)胞總蛋白質(zhì)合成速率的下降是由染色質(zhì)固縮化造成的,因?yàn)槿旧|(zhì)固縮化不利于DNA轉(zhuǎn)錄。而染色質(zhì)固縮化主要是由染色質(zhì)中的組蛋白乙酰化、磷酸化等修飾水平下降造成的?;虮磉_(dá)譜的改變與轉(zhuǎn)錄因子變化和染色質(zhì)中的DNA及組蛋白的各種化學(xué)修飾差異和水平改變有關(guān)。新陳代謝率下降與總蛋白質(zhì)和ATP的合成速率下降有關(guān)。因此,尋找細(xì)胞衰老機(jī)制主要集中在染色質(zhì)的組蛋白各種修飾水平的調(diào)控和線粒體合成ATP速率的調(diào)控。
組蛋白去乙酰化酶(histone deacetylases,HDACs)有3類,I類包括酵母和果蠅RPD3、HDA1和HST2,人HDAC1-3和HDAC8;II類 包 括HDAC4、5、6、7、9、10;III類包括酵母等的sirtuins(Sir2、Sir3和Sir4等)和哺乳動(dòng)物的SIRTs(SIRT1-SIRT7)。HDACs包括P300/CBP和P300/CBP相關(guān)蛋白因子(P300/CBP associated factor,PCAF),SRC1和MOZ。在人胚肺成纖維細(xì)胞復(fù)制性衰老過(guò)程中,P300和PCAF與總的HDACs活性都逐漸降低,但在HDACs中僅HDAC3降低顯著,應(yīng)是P300、PCAF總體降低程度大于HDAC3的降低,從而導(dǎo)致組蛋白H3和H4整體乙?;街饾u降低[13]。
持續(xù)抑制抑癌蛋白P53會(huì)使成纖維細(xì)胞無(wú)限增殖[14];敲除P53基因可使肝細(xì)胞無(wú)限增殖[15],說(shuō)明P53是衰老的主控因子,P53也會(huì)間接使染色質(zhì)固縮化,這與P53本身和P53廣泛調(diào)控的下游基因P21、P16、Rb等有關(guān)[16]。過(guò)表達(dá)Rb或P16INK4a能使染色質(zhì)固縮化[17-18]。P53分布于細(xì)胞的核漿、核仁、線粒體等結(jié)構(gòu),P53會(huì)抑制rDNA轉(zhuǎn)錄、線粒體生產(chǎn)ATP、細(xì)胞周期、端粒酶逆轉(zhuǎn)錄酶(telomerace reverse transcriptase,TERT)活性(TERT能增加線粒體呼吸鏈活性和抗氧化能力[19]),等等。SIRT1或SIRT2可使P53去乙?;鴨适Щ钚訹20]。因此,隨著衰老過(guò)程SIRT1減少,P53活性會(huì)上升。
SIRTs會(huì)與一些重復(fù)DNA結(jié)合而沉默其轉(zhuǎn)錄和復(fù)制,例如,Sir2與Net1(核仁蛋白)和Cdcl4(磷酸酯酶)一起負(fù)責(zé)沉默rDNA區(qū)域的轉(zhuǎn)錄[21]。Sir2、Sir3和Sir4一起負(fù)責(zé)沉默端粒[22]。RPD3和HDA1也會(huì)沉默端粒和rDNA。rDNA拷貝數(shù)減少時(shí)沉默因子濃度會(huì)升高從而增加了端粒沉默[23]。這暗示了端??s短和rDNA拷貝數(shù)減少會(huì)加強(qiáng)沉默端粒和rDNA,從而減少rRNA并抑制蛋白質(zhì)合成。同時(shí)端粒和rDNA附近的基因也可能會(huì)被沉默。由于rRNA會(huì)與核糖體蛋白(ribosomal protein,RP)結(jié)合生成核糖體,因此,抑制rRNA的轉(zhuǎn)錄會(huì)留下更多的游離的RP。而游離的 RP 會(huì)與泛素連接酶MDM2結(jié)合而阻礙細(xì)胞各部位P53的MDM2降解途徑,導(dǎo)致P53 水平升高[24-25]。也就是說(shuō),端粒DNA和rDNA的拷貝數(shù)減少會(huì)抑制rDNA轉(zhuǎn)錄,使P53水平升高。
染色質(zhì)沉默需要Sir2、Sir3和Sir4等參與,Sir2負(fù)責(zé)組蛋白的脫乙酰化,Sir3通過(guò)與低乙酰化的組蛋白H3和H4的氨基尾部作用以阻止DNA轉(zhuǎn)錄,Sir4與組蛋白的尾部相互作用可以使沉默染色質(zhì)更穩(wěn)定。Sir4也定位在線粒體中(哺乳動(dòng)物SIRT4與酵母Sir4蛋白同源),SIRT4會(huì)抑制線粒體中谷氨酰胺代謝進(jìn)入三羧酸循環(huán),從而抑制ATP的生成。過(guò)表達(dá)SIRT4會(huì)抑制細(xì)胞增殖。
P53與HDAC2轉(zhuǎn)錄水平呈明顯的正相關(guān)性。利用Pathcards數(shù)據(jù)庫(kù)(http://pathcards.genecards.org/)中的“P53 Signaling SuperPath”會(huì)發(fā)現(xiàn),大量的HDAC家族蛋白(包括HDAC1~3和HDAC5~11)均參與了P53相關(guān)的超級(jí)通路[26]。提示了隨著細(xì)胞衰老導(dǎo)致的P53水平和活性的逐漸上升,會(huì)上調(diào)HDACs水平,從而導(dǎo)致組蛋白H3和H4整體乙?;街饾u降低,以致使DNA轉(zhuǎn)錄速率逐漸降低。
小鼠衰老細(xì)胞的端粒長(zhǎng)度還剩很長(zhǎng),人類衰老細(xì)胞的端粒長(zhǎng)度還剩約5 kb或相當(dāng)兒童細(xì)胞端粒長(zhǎng)度的一半,因此,把衰老細(xì)胞P53活性升高的事實(shí)理解成端粒過(guò)短導(dǎo)致DNA損傷而激活P53基因表達(dá)是不合理的。P53主要集中在核仁區(qū),也會(huì)與端粒結(jié)合蛋白TRF1、TRF2、TRBP1結(jié)合而存儲(chǔ)在端粒上[27-28]。P53會(huì)在核仁中降解[29-30]。核仁中的MDM2也是重要的P53降解途徑。SIRTs也主要通過(guò)泛素化途徑降解。
綜上所述,筆者提出了“細(xì)胞衰老的端粒DNA和rDNA共調(diào)控學(xué)假說(shuō)”是由于染色體中的端粒DNA和rDNA會(huì)結(jié)合并降解細(xì)胞中的HDACs和P53等因子,HDACs也會(huì)通過(guò)沉默rDNA轉(zhuǎn)錄而間接抑制細(xì)胞各部位的P53的降解,因此,端粒DNA和rDNA的總拷貝數(shù)決定著HDACs和P53等因子在基因組中的有效濃度和DNA與染色質(zhì)的化學(xué)修飾和狀態(tài)。由于HDACs會(huì)參與組蛋白去乙?;统聊瑀DNA,P53等因子也會(huì)上調(diào)HDACs,因此會(huì)降低組蛋白H3和H4整體乙?;剑瑥亩鴮?dǎo)致染色質(zhì)固縮化和抑制rDNA等基因的轉(zhuǎn)錄,這些因素都共同阻遏了蛋白質(zhì)的合成。而增加的P53、SIRT4和減少的與呼吸相關(guān)蛋白(已觀察到線粒體中很多酶活性發(fā)生增齡性下降)以及TERT會(huì)共同阻遏線粒體合成ATP。因此,隨著染色體中的端粒DNA和rDNA的拷貝數(shù)不斷減少(HDACs雖然是呈增齡性下降,但相對(duì)于組蛋白乙?;高€是上升的),加載到染色體和線粒體上有效性的HDACs和P53等因子就會(huì)越來(lái)越多,從而使染色質(zhì)固縮化程度越來(lái)越高,總RNA、蛋白質(zhì)和ATP的合成速率就會(huì)越來(lái)越低,從而導(dǎo)致細(xì)胞越來(lái)越衰老。據(jù)此筆者認(rèn)為,如單一增加染色體的端粒長(zhǎng)度或rDNA拷貝數(shù),只能增加野生型細(xì)胞分裂次數(shù)而無(wú)法讓細(xì)胞永生化,要讓野生型細(xì)胞真正實(shí)現(xiàn)返老還童和永生化,必須同時(shí)增加染色體的端粒長(zhǎng)度和rDNA的拷貝數(shù)。
當(dāng)然,端粒DNA和rDNA還會(huì)結(jié)合很多因子,其中有些因子也會(huì)參與DNA和染色質(zhì)修飾與狀態(tài),例如,已鑒定的與核仁相關(guān)的蛋白約有4 500種,但為了簡(jiǎn)化細(xì)胞衰老模型,暫不討論這些。此外,細(xì)胞中的著絲粒、轉(zhuǎn)座子、衛(wèi)星序列等也屬于多拷貝的重復(fù)DNA序列,SIRT1會(huì)結(jié)合并抑制酵母和哺乳動(dòng)物細(xì)胞中的主要衛(wèi)星重復(fù)序列。SIRT6在Line1(一種重復(fù)DNA的轉(zhuǎn)座子)元件包裝成抑制性異染色質(zhì)。因此,只要這些重復(fù)DNA拷貝數(shù)會(huì)隨著細(xì)胞衰老而減少或增加,就有可能與細(xì)胞衰老有關(guān),有必要進(jìn)行研究。
各種生物都有一個(gè)相對(duì)固定的發(fā)育成熟和衰老死亡的時(shí)間表,因此,個(gè)體發(fā)育成熟和衰老的本質(zhì)就是基因群按照預(yù)定的時(shí)間表進(jìn)行程序化表達(dá)的結(jié)果。如上述的肝細(xì)胞基因群的順序表達(dá)譜。由于肝細(xì)胞癌變時(shí)會(huì)重新合成甲胎蛋白,因此,由衰老驅(qū)動(dòng)的基因順序表達(dá)是可逆的,或者說(shuō),這種基因調(diào)控方式與細(xì)胞分化的基因調(diào)控不一樣,因?yàn)榧?xì)胞分化的基因調(diào)控通常是很穩(wěn)定且不可逆的,肝細(xì)胞不會(huì)因?yàn)榘┳兌兂善つw細(xì)胞等其它分化類型的細(xì)胞。
關(guān)于衰老的遺傳程序?qū)W說(shuō)也不少,但都沒(méi)有說(shuō)明這種遺傳程序是如何運(yùn)作的。由于大部分基因在個(gè)體的一生都是不變的,那么,不變的基因是如何實(shí)現(xiàn)基因的程序化表達(dá)?衰老的生命周期程序驅(qū)動(dòng)學(xué)說(shuō)[31-32]認(rèn)為,要實(shí)現(xiàn)基因的程序化表達(dá),就需要一個(gè)時(shí)序驅(qū)動(dòng)器來(lái)驅(qū)動(dòng)基因按照時(shí)間順序進(jìn)行表達(dá),這和計(jì)算機(jī)硬盤(pán)、軟盤(pán)或光盤(pán)都需要一個(gè)驅(qū)動(dòng)器的原理是一樣的。基因組相當(dāng)于數(shù)據(jù)庫(kù),染色體上端粒和rDNA相當(dāng)于數(shù)據(jù)庫(kù)的索引,不同長(zhǎng)度的端粒和不同拷貝數(shù)的rDNA就會(huì)有不同的基因表達(dá)譜。因此,隨著端粒DNA和rDNA的拷貝數(shù)不斷因增齡而減少,就可驅(qū)動(dòng)基因群進(jìn)行程序化表達(dá)。端粒DNA和rDNA就是驅(qū)動(dòng)基因群程序化表達(dá)的時(shí)序驅(qū)動(dòng)器,驅(qū)動(dòng)機(jī)制是以劑量效應(yīng),如拷貝數(shù)決定基因表達(dá)的位置效應(yīng)或表觀遺傳修飾因子或轉(zhuǎn)錄因子的有效濃度,通過(guò)調(diào)控DNA或組蛋白的甲基化、乙?;刃揎梺?lái)修改表觀遺傳譜,特別是通過(guò)增減相關(guān)基因的DNA甲基化水平來(lái)實(shí)現(xiàn)基因的差異化或程序化的表達(dá),依據(jù)如:①2013年,德克薩斯大學(xué)達(dá)拉斯西南醫(yī)學(xué)中心的Guido Stadler認(rèn)為,端粒越短,DUX4表達(dá)活性越強(qiáng),隨著端粒逐漸縮短,DUX4表達(dá)活性最多上升10倍。②SV40病毒及大T抗原轉(zhuǎn)染細(xì)胞會(huì)激活端粒酶,DNA甲基化水平會(huì)重新上升[33]。③DNA甲基轉(zhuǎn)移酶Dnmt3a的表達(dá)水平會(huì)隨增齡而下調(diào),而該基因缺失的造血干細(xì)胞會(huì)在不同的染色體區(qū)域表現(xiàn)出甲基化升高或者降低的現(xiàn)象,從而改變了基因表達(dá)譜[34]。此外,還發(fā)現(xiàn)端粒酶能直接調(diào)控基因表達(dá)。④不同拷貝數(shù)的rDNA會(huì)有不同分布的異染色質(zhì)/常染色質(zhì),從而改變了基因表達(dá)譜[35-36]。
由于衰老是一種主動(dòng)的基因程序,是進(jìn)化選擇的結(jié)果。因此,隨著年齡增長(zhǎng),有益的基因會(huì)逐漸沉默,有害的基因表達(dá)會(huì)上升,以此實(shí)現(xiàn)破壞細(xì)胞和個(gè)體。例如,炎癥因子IL27Ra的受體在衰老的造血干細(xì)胞中高表達(dá)[37]。據(jù)報(bào)道,阿爾茨海默病(Alzheimer’s disease,AD)患者神經(jīng)元中的淀粉樣前蛋白基因啟動(dòng)子區(qū)的甲基化程度會(huì)隨著年齡的增加而下降,導(dǎo)致該基因表達(dá)上升,從而使神經(jīng)元死亡。由于AD是神經(jīng)干細(xì)胞衰老造成的,由衰老的神經(jīng)干細(xì)胞分化補(bǔ)充的神經(jīng)元也是衰老的,因此,最有效根治AD的方法是更換為年輕的神經(jīng)干細(xì)胞或逆轉(zhuǎn)原位神經(jīng)干細(xì)胞衰老。
細(xì)胞衰老過(guò)程中,P53基因的啟動(dòng)子DNA甲基化水平隨增齡而降低,P53基因的信使RNA表達(dá)升高[38]。也有文獻(xiàn)報(bào)道,有些促進(jìn)細(xì)胞周期的基因中的啟動(dòng)子甲基化過(guò)高。這樣一低一高就會(huì)導(dǎo)致永久性的細(xì)胞周期停滯。
新陳代謝率越高,能量消耗也越快,衰老也越快,因此,目前惟一證明能夠顯著延長(zhǎng)動(dòng)物壽命的途徑就是熱量限制(calorie restriction,CR)。細(xì)胞衰老的端粒DNA和rDNA共調(diào)控學(xué)說(shuō)認(rèn)為,CR主要是通過(guò)沉默端粒DNA和rDNA的轉(zhuǎn)錄,從而減緩端粒DNA和rDNA拷貝丟失來(lái)延壽的。
由于新陳代謝過(guò)程需要消耗蛋白質(zhì),而蛋白質(zhì)合成過(guò)程需要合成占RNA總量82%的rRNA,因此,核糖體生物合成占據(jù)了多達(dá)80%的能量[39]。新陳代謝會(huì)促進(jìn)端粒轉(zhuǎn)錄[40],隨著端粒DNA轉(zhuǎn)錄成RNA量的提高,當(dāng)端粒附近RNA水平升高,端粒的丟失速度會(huì)加快[41]。一種早衰癥是因核纖層蛋白A突變,導(dǎo)致端粒聚集了一些與端粒相關(guān)的非編碼RNA而加速端??s短的。因此,新陳代謝都會(huì)使端粒DNA和rDNA轉(zhuǎn)錄,從而導(dǎo)致端粒DNA和rDNA拷貝的丟失。
由于端粒DNA和rDNA是多拷貝的串聯(lián)重復(fù)序列,本來(lái)穩(wěn)定性很差,在轉(zhuǎn)錄或復(fù)制時(shí)需要?jiǎng)冸x掉組蛋白,裸露出DNA,并解開(kāi)DNA雙鏈,此時(shí)很容易受到各種因素的損傷和干擾而導(dǎo)致拷貝的丟失,如端粒或核仁組織區(qū)聚集著RNA、氧自由基損傷(果蠅16SrDNA的拷貝數(shù)在氧壓力下會(huì)減少)、放射線、復(fù)制叉阻遏蛋白Fob1。RecQ螺旋酶家族(WRN)的基因突變會(huì)導(dǎo)致一種早衰癥(“Wemer綜合癥”,是缺乏WRN時(shí),靜止復(fù)制叉被一些復(fù)雜的重組過(guò)程或者刪除機(jī)制所分解而加速端粒縮短導(dǎo)致早衰)、端粒相關(guān)鋅指蛋白、營(yíng)養(yǎng)狀況,等等。在人類細(xì)胞也發(fā)現(xiàn)能夠自己合成內(nèi)源性的增加DNA突變的蛋白質(zhì)和一些能夠修剪端粒的蛋白質(zhì),或阻礙端粒DNA復(fù)制的蛋白,在端粒DNA和rDNA復(fù)制、損傷的修復(fù)或通過(guò)重組修復(fù)過(guò)程,都有可能導(dǎo)致端粒DNA和rDNA拷貝的丟失。也就是說(shuō),無(wú)論細(xì)胞分裂還是不分裂,端粒DNA和rDNA的拷貝數(shù)都會(huì)逐漸減少,這可能就是導(dǎo)致“復(fù)制型衰老”和“時(shí)序型衰老”的共同機(jī)制。例如,不分裂的心肌細(xì)胞的端粒也會(huì)縮短[42],不分裂的老年大腦、心臟和骨骼肌細(xì)胞rDNA拷貝數(shù)量明顯減少[9]。據(jù)此,適當(dāng)沉默端粒DNA和rDNA轉(zhuǎn)錄、減少DNA損傷因素和增強(qiáng)對(duì)損傷的DNA修復(fù)水平,都會(huì)延緩端??s短和rDNA拷貝的丟失,從而延長(zhǎng)壽命。相反,與DNA修復(fù)有關(guān)的基因突變會(huì)加速衰老。由于DNA的轉(zhuǎn)錄與修復(fù)無(wú)法同時(shí)進(jìn)行,而SIRTs能沉默轉(zhuǎn)錄,因此,CR延長(zhǎng)酵母菌壽命是通過(guò)上調(diào)Sir2而沉默端粒DNA與rDNA的轉(zhuǎn)錄,從而減緩端粒DNA和rDNA拷貝的丟失。CR也能上調(diào)SIRT1和SIRT6而延遲非人類靈長(zhǎng)類動(dòng)物模型的衰老。SIRT1和 SIRT6能調(diào)節(jié)TERT表達(dá),抗氧化和促進(jìn)DNA修復(fù)??顾ダ纤幚着撩顾啬芤种苖TOR而沉默rDNA轉(zhuǎn)錄[43-44]。據(jù)此筆者推測(cè),其他能抑制mTOR或沉默rDNA的藥物或條件都有一定抗衰老作用。
由于P53和SIRTs都能夠沉默端粒DNA和rDNA,因此既能抑制蛋白質(zhì)合成,也能減少其拷貝的丟失。但是,過(guò)度沉默rDNA會(huì)影響蛋白質(zhì)合成,使衰老的細(xì)胞更加衰老。而減少沉默則會(huì)增加端粒DNA和rDNA拷貝丟失速度而加速衰老,因此,過(guò)少沉默和過(guò)度沉默都會(huì)促進(jìn)衰老。例如,P53不足和過(guò)度激活都可以促進(jìn)衰老[45]。
由于端粒DNA和rDNA能夠結(jié)合很多種蛋白質(zhì),特別是可能會(huì)影響P53的降解,因此,染色體兩端的端粒DNA的作用,不只是通常認(rèn)為的類似鞋帶末端的塑料封套保護(hù)鞋帶不會(huì)松開(kāi)那樣保護(hù)染色體的線性DNA,rDNA也不只是用來(lái)轉(zhuǎn)錄rRNA的。因此,筆者提出了“細(xì)胞衰老的端粒DNA和rDNA共調(diào)控假說(shuō)”,據(jù)此假說(shuō)有可能研究出不改變細(xì)胞分化類型讓細(xì)胞返老還童和永生化的技術(shù),以解決CAR-T細(xì)胞因短命導(dǎo)致療效欠佳的問(wèn)題、源自胚胎期壽命與宿主相當(dāng)?shù)膶?duì)宿主產(chǎn)生免疫耐受性的記憶T細(xì)胞衰老造成的自身免疫性疾病的問(wèn)題,以及用于NK細(xì)胞、腫瘤浸潤(rùn)淋巴細(xì)胞、心肌細(xì)胞、間充質(zhì)干細(xì)胞和造血干細(xì)胞,等等,各種成體干細(xì)胞的返老還童或無(wú)限擴(kuò)增和無(wú)限保持活力,用于治療癌癥、讓衰竭的器官恢復(fù)活力以替代器官移植或大幅度延長(zhǎng)個(gè)體壽命甚至逆轉(zhuǎn)個(gè)體衰老。
致謝:上海世鵬實(shí)驗(yàn)室科技發(fā)展有限公司董事長(zhǎng)宋世鵬先生對(duì)本文提供資助。