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    精神分裂癥錨蛋白重復(fù)序列3基因多態(tài)性及表達(dá)研究☆

    2016-12-14 03:53:20冉柳毅程宇琪董成龍姜紅燕吳桂霞楊舒然許秀峰
    關(guān)鍵詞:等位基因多態(tài)性外周血

    冉柳毅 程宇琪 董成龍 姜紅燕 吳桂霞 楊舒然 許秀峰

    ·論 著·

    精神分裂癥錨蛋白重復(fù)序列3基因多態(tài)性及表達(dá)研究☆

    冉柳毅*程宇琪*董成龍*姜紅燕*吳桂霞△楊舒然*許秀峰*

    目的 探討錨蛋白重復(fù)序列3(ankyrin repeat 3,ANK3)基因多態(tài)性和基因表達(dá)與精神分裂癥的關(guān)系。方法 采用TaqMan探針等位基因分型技術(shù)對(duì)456例中國(guó)漢族精神分裂癥患者(患者組)和495名正常對(duì)照者(對(duì)照組)ANK3基因多態(tài)性位點(diǎn)rs10994336、rs10994359進(jìn)行基因分型,并對(duì)基因型、等位基因、單體型頻率進(jìn)行比較;然后采用TaqMan探針及實(shí)時(shí)熒光定量PCR方法檢測(cè)另外30例急性期精神分裂癥患者和26名正常對(duì)照外周血ANK3基因mRNA的表達(dá)水平。結(jié)果 患者組與對(duì)照組rs10994336和rs10994359基因型、等位基因頻率分布的差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。單體型分析顯示,由rs10994336-rs10994359組成單體型C-C、C-T、T-C的頻率分布在患者組與對(duì)照組間差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。與對(duì)照組相比,急性期精神分裂癥患者外周血ANK3基因的mRNA表達(dá)水平略高,但差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。結(jié)論 本研究未發(fā)現(xiàn)ANK3基因位點(diǎn)rs10994336、rs10994359多態(tài)性與精神分裂癥的關(guān)聯(lián),急性期精神分裂癥患者外周血中ANK3基因的表達(dá)水平未見(jiàn)異常。

    精神分裂癥 錨蛋白重復(fù)序列3基因 多態(tài)性 基因表達(dá)

    目前認(rèn)為精神分裂癥是由遺傳因素和環(huán)境因素共同作用導(dǎo)致大腦發(fā)育異常[1]。遺傳因素在精神分裂癥的發(fā)病機(jī)制中扮演著重要角色,該病具有很高的遺傳度,雙生子研究顯示其遺傳度約80%[2]。位于10q21的錨蛋白重復(fù)序列3(ankyrin repeat 3,ANK3)基因編碼的Ankyrin-G在大腦中廣泛表達(dá)且參與神經(jīng)發(fā)育過(guò)程[3]。2011年全基因組關(guān)聯(lián)研究(genome wide association study,GWAS)發(fā)現(xiàn)ANK3基因多態(tài)性位點(diǎn)rs10994359與精神分裂癥和雙相情感障礙均具有關(guān)聯(lián)[4],2012年中國(guó)上海YUAN等[5]發(fā)現(xiàn)位點(diǎn)rs10994336與精神分裂癥有關(guān)聯(lián),但是北歐、德國(guó)的研究未能驗(yàn)證這一關(guān)聯(lián)[6-7]。ROUSSOS等[8]在尸檢研究中發(fā)現(xiàn)精神分裂癥患者大腦顳上回ANK3基因mRNA水平降低,WIRGENES等[9]在精神分裂癥患者外周血中發(fā)現(xiàn)ANK3基因mRNA水平增高。為進(jìn)一步明確ANK3基因與中國(guó)漢族精神分裂癥的關(guān)系,本研究在中國(guó)漢族樣本中分析ANK3基因的2個(gè)單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)位點(diǎn)rs10994336和rs10994359,并對(duì)急性期精神分裂癥患者外周血ANK3基因的表達(dá)水平進(jìn)行分析。

    1 對(duì)象與方法

    1.1研究對(duì)象

    1.1.1基因多態(tài)性研究對(duì)象 患者組來(lái)自2013年3月至2014年11月昆明醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院精神科、云南省精神衛(wèi)生中心精神分裂癥患者。入組標(biāo)準(zhǔn):①符合《美國(guó)精神障礙診斷與統(tǒng)計(jì)手冊(cè)第四版》(Diagnostic and Statistical Manual of Mental Disorders,Fourth Edition,DSM-Ⅳ)精神分裂癥診斷標(biāo)準(zhǔn),并由2名精神科副主任醫(yī)師或以上職稱醫(yī)師診斷;②漢族;③年齡<65歲。排除標(biāo)準(zhǔn):患有其他精神疾病或嚴(yán)重軀體疾病。共入組456例患者,男185例,女271例,年齡14~60歲,平均(34.2±11.1)歲。

    對(duì)照組來(lái)自昆明醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院的健康體檢者。入組標(biāo)準(zhǔn):①當(dāng)前或既往無(wú)患精神障礙;②漢族;③年齡<65歲。排除標(biāo)準(zhǔn):患有嚴(yán)重軀體疾病。共入組495名對(duì)照,男206名,女289名,年齡20~60歲,平均(35.2±10.1)歲?;颊呓M和對(duì)照組年齡(t=-1.41,P=0.16)和性別(χ2=0.11,P= 0.74)差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

    1.1.2基因表達(dá)研究對(duì)象 患者組來(lái)自2015年1~4月昆明醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院精神科門(mén)診和住院治療的急性期精神分裂癥患者。入組標(biāo)準(zhǔn):①符合DSM-Ⅳ精神分裂癥診斷標(biāo)準(zhǔn),由2名精神科副主任醫(yī)師或以上職稱醫(yī)師診斷,PANSS評(píng)分>60分;②漢族;③年齡<65歲。排除標(biāo)準(zhǔn):患有其他精神疾病或嚴(yán)重軀體疾病。共入組30例患者,其中5例mRNA擴(kuò)增失敗。25例患者納入分析,男10例,女15例,年齡15~44歲,平均(24.6±6.5)歲,病程0.5~15年,平均(3.8±3.9)年,PANSS評(píng)分62~101分,平均(78.3±9.5)分。

    對(duì)照組來(lái)自同期昆明醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院的健康體檢者及實(shí)習(xí)生。入組標(biāo)準(zhǔn):①當(dāng)前或既往無(wú)精神障礙史;②漢族;③年齡<65歲。排除標(biāo)準(zhǔn):患有嚴(yán)重軀體疾病。共入組26名對(duì)照,其中1名mRNA擴(kuò)增失敗。25名對(duì)照納入分析,男9名,女16名,年齡21~30歲,平均(25.7±2.2)歲。25例患者與25名對(duì)照者年齡(t=-0.79,P=0.44)和性別(χ2=0.09,P=0.77)差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

    研究對(duì)象中精神分裂癥患者及家屬均對(duì)本研究知情同意并簽署書(shū)面知情同意書(shū),所有對(duì)照本人簽署知情同意書(shū)。本研究得到昆明醫(yī)科大學(xué)倫理委員會(huì)審核批準(zhǔn)。

    1.2基因多態(tài)性研究方法

    1.2.1提取DNA 456例患者及495名對(duì)照各采集靜脈血2~5 mL置于乙二胺四乙酸管抗凝,采用AxyPrep血基因組DNA小量試劑盒(AxyPrepTMBlood Genomic DNA Miniprep Kit)提取基因組DNA,置于-80℃保存?zhèn)溆谩?/p>

    1.2.2基因分型 采用TaqMan探針基因分型技術(shù)對(duì)rs10994336、rs10994359位點(diǎn)進(jìn)行分型,引物和探針由美國(guó)ABI公司定制(探針序列號(hào)分別為:C_ 31344821_10,C_31344870_10),PCR反應(yīng)試劑Taq?Man? Genotyping Master Mix由美國(guó)ABI公司提供。PCR反應(yīng)體系為7.5 μL,包括模板2 μL,2× TaqMan?Genotyping Master Mix 5.0 μL,20×SNP Assay Mix 0.5 μL。反應(yīng)條件:95℃預(yù)變性10 min,(95℃變性15 s,60℃退火1 min)×40個(gè)循環(huán)。PCR反應(yīng)和熒光信號(hào)收集均在ABI7300實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀(96孔板)上進(jìn)行,以SDS 2.0圖像分析軟件Allelic Discrimination程序分析不同等位基因所標(biāo)識(shí)的FAM和VIC終點(diǎn)熒光信號(hào)強(qiáng)度,判定待測(cè)樣本的基因型。

    1.3基因表達(dá)研究方法

    1.3.1總RNA提取及逆轉(zhuǎn)錄合成cDNA 30例患者和26名對(duì)照者各抽取靜脈血3 mL,2%的乙二胺四乙酸抗凝。采用Super超純?nèi)俁NA快速提取試劑盒(北京博凌科為生物科技有限公司)提取外周血總RNA。使用HiFi逆轉(zhuǎn)錄試劑盒(北京博凌科為生物科技有限公司)合成cDNA,cDNA合成的總體積40 μL,反應(yīng)體系及反應(yīng)條件參照試劑盒操作手冊(cè)。

    1.3.2ANK3基因表達(dá)水平檢測(cè) 使用TaqMan MGB探針?lè)ㄔ贏BI 7500型實(shí)時(shí)熒光定量PCR系統(tǒng)上進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量PCR擴(kuò)增,以檢測(cè)ANK3基因的mRNA表達(dá)水平。使用管家基因GUSB作為內(nèi)對(duì)照基因以標(biāo)化目的基因的表達(dá)水平。ANK3基因和GUSB基因表達(dá)的檢測(cè)探針(探針序列號(hào)分別為ANK3:Hs00241738_mL,GUSB:HS99999908_mL)均于美國(guó)ABI公司定制。每個(gè)樣本的ANK3基因和內(nèi)對(duì)照GUSB基因均重復(fù)3次,同時(shí)設(shè)立6個(gè)陰性對(duì)照孔。實(shí)時(shí)熒光定量PCR反應(yīng)體系共20 μL:cDNA模板6 μL,TaqMan Universal PCR MasterMix 10 μL,TaqMan MGB Probe+Primer 1 μL,RNase-free H2O 3 μL。反應(yīng)條件:50℃孵育2 min,95℃預(yù)變性10 min,(95℃變性15 s,60℃退火1 min)×40個(gè)循環(huán)?;颊呓MPCR擴(kuò)增失敗5例,對(duì)照組PCR擴(kuò)增失敗1例。采用比較循環(huán)數(shù)(cyclethreshold,CT)的方法進(jìn)行相對(duì)定量,使用SDS ver?sion 2.3軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)處理。實(shí)時(shí)熒光定量PCR的結(jié)果以CT值顯示,CT值為每個(gè)反應(yīng)管內(nèi)的熒光信號(hào)達(dá)到設(shè)定閾值時(shí)所經(jīng)歷的循環(huán)數(shù)。每個(gè)樣本的ΔCT值=單個(gè)樣本平均CT(ANK3基因)-單個(gè)樣本平均CT(GUSB基因)。以對(duì)照組的平均ΔCT值為參照標(biāo)準(zhǔn),計(jì)算每例患者的ΔΔCt值(每例患者的ΔΔCT值=每例患者ΔCT值-對(duì)照組平均ΔCT值),以2-ΔΔCt反映基因表達(dá)差異的倍數(shù),即目的基因的表達(dá)水平[10]。

    1.4統(tǒng)計(jì)學(xué)方法 基因多態(tài)性分析均在SHEsis遺傳分析在線軟件(http://analysis.bio-x.cn/)中進(jìn)行。采用χ2檢驗(yàn)進(jìn)行Hardy-Weinberg遺傳平衡度檢驗(yàn),以及兩組間等位基因和基因型頻率比較。統(tǒng)計(jì)效能采用Quanto 1.2.4軟件計(jì)算。計(jì)算兩位點(diǎn)間連鎖不平衡(linkage disequilibrium,LD)程度,用D'值度量,D'值范圍0~1,通常2個(gè)位點(diǎn)之間的D'值較高說(shuō)明LD程度較高。對(duì)rs10994336、rs10994359位點(diǎn)進(jìn)行單體型分析,舍棄在每組中頻率<3%的單體型,組間單體型頻率比較采用χ2檢驗(yàn),單體型與精神分裂癥的關(guān)聯(lián)用OR值及其95%CI分析。ANK3基因表達(dá)量使用SPSS 17.0進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,兩組間比較采用獨(dú)立樣本t檢驗(yàn)。檢驗(yàn)水準(zhǔn)α為0.05,雙側(cè)檢驗(yàn)。

    2 結(jié)果

    2.1精神分裂癥ANK3基因多態(tài)性

    2.1.1Hardy-Weinberg平衡檢驗(yàn) ANK3基因2個(gè)SNPs位點(diǎn)rs10994336和rs10994359的基因型分布在患者組和對(duì)照組中均符合Hardy-Weinberg平衡定律(均P>0.05),具有群體代表性。

    2.1.2樣本統(tǒng)計(jì)效能 rs10994336最小等位基因頻率(minor allele frequency,MAF)為0.218,統(tǒng)計(jì)效能(1-β)為0.958;rs10994359的MAF為0.306,統(tǒng)計(jì)效能(1-β)為0.979。

    2.1.3基因型和等位基因分布 患者組與對(duì)照組間rs10994336、rs10994359位點(diǎn)的基因型和等位基因頻率分布差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。見(jiàn)表1。

    2.1.4連鎖不平衡及單體型關(guān)聯(lián)分析 對(duì)2個(gè)SNPs位點(diǎn)(rs10994336、rs10994359)進(jìn)行相鄰位點(diǎn)間LD分析,結(jié)果顯示D'=0.961,提示2個(gè)SNPs位點(diǎn)之間存在LD現(xiàn)象。對(duì)2個(gè)SNPs位點(diǎn)構(gòu)成的單體型進(jìn)行分析,由rs10994336-rs10994359組成的單體型C-C(P=0.80)、C-T(P=0.41)、T-C(P=0.45)頻率分布在兩組間的差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,T-T型因?yàn)轭l率<0.03而未納入分析。見(jiàn)表2。

    2.2急性期精神分裂癥患者外周血中ANK3基因mRNA的相對(duì)表達(dá)水平 急性期精神分裂癥患者組ANK3基因mRNA相對(duì)表達(dá)水平為(1.12±0.22),略高于對(duì)照組(1.02±0.24),但差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(t=1.39,P=0.16)。

    3 討論

    表1 患者組和對(duì)照組ANK3基因2個(gè)SNPs位點(diǎn)基因型和等位基因分布[n(%)]

    近年來(lái),精神分裂癥“神經(jīng)發(fā)育假說(shuō)”得到越來(lái)越多證據(jù)支持[1],ANK3基因編碼的Ankyrin-G在神經(jīng)發(fā)育過(guò)程中必不可少[3],在中樞神經(jīng)系統(tǒng)中具有影響離子通道集聚與動(dòng)作電位產(chǎn)生、維護(hù)神經(jīng)細(xì)胞的極性、神經(jīng)發(fā)生、神經(jīng)保護(hù)等功能[11-13]。ANK3基因遺傳變異和表達(dá)異常介導(dǎo)神經(jīng)發(fā)育異常,這些均與精神分裂癥相關(guān)[5,8]。本研究對(duì)456例中國(guó)漢族精神分裂癥患者和495名健康對(duì)照者的 ANK3基 因多 態(tài) 性位 點(diǎn) rs10994336和rs10994359進(jìn)行分析,沒(méi)有發(fā)現(xiàn)2個(gè)位點(diǎn)與精神分裂癥之間的關(guān)聯(lián)。隨后比較30例急性期精神分裂癥患者和26名健康對(duì)照者外周血ANK3基因mRNA的表達(dá)水平,也沒(méi)有發(fā)現(xiàn)急性期精神分裂癥患者外周血ANK3基因表達(dá)水平異常。

    表2 患者組和對(duì)照組rs10994336-rs10994359單體型頻率[n(%)]

    迄今為止,對(duì)于位點(diǎn)rs10994336與精神分裂癥關(guān)系的研究結(jié)論存有爭(zhēng)議。YUAN等[5]在中國(guó)上海進(jìn)行的研究中發(fā)現(xiàn)該位點(diǎn)與精神分裂癥有關(guān)聯(lián);然而TESLI等[6]和GELLA等[7]在北歐和德國(guó)人群中發(fā)現(xiàn)該位點(diǎn)多態(tài)性與精神分裂癥的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)無(wú)關(guān)。本研究結(jié)論與TESLI等[6]和GELLA等[7]研究結(jié)論一致。比較本研究樣本和YUAN等[5]研究樣本的等位基因頻率,發(fā)現(xiàn)這2個(gè)研究的對(duì)照樣本中該位點(diǎn)等位基因頻率分布具有一定差異(本研究的MAF為0.218,YUAN等[5]研究的MAF為0.26),這提示該位點(diǎn)可能因?yàn)闃颖緛?lái)源地域不同而存在人群差異。另外,精神分裂癥的發(fā)病機(jī)制極為復(fù)雜,具有很高的遺傳異質(zhì)性,這可能也是導(dǎo)致研究結(jié)論不一致的原因。2011年精神疾病基因組學(xué)協(xié)會(huì)精神分裂癥工作小組[4]進(jìn)行大樣本GWAS,發(fā)現(xiàn)ANK3基因的一個(gè)新關(guān)聯(lián)位點(diǎn)rs10994359。遺憾的是,本研究未能重復(fù)該位點(diǎn)的陽(yáng)性結(jié)果,分析原因可能是因?yàn)闃颖玖俊⑦z傳背景、生活環(huán)境等差異所致。由于本研究?jī)H考察rs10994336和rs10994359 2個(gè)位點(diǎn)與精神分裂癥的關(guān)系,因此不能排除ANK3基因區(qū)域內(nèi)其他位點(diǎn)對(duì)精神分裂癥易患風(fēng)險(xiǎn)的貢獻(xiàn)。在本研究基因表達(dá)水平分析中,沒(méi)有發(fā)現(xiàn)急性期精神分裂癥患者外周血ANK3基因mRNA表達(dá)水平異常。由于基因表達(dá)在中樞和外周血中的復(fù)雜性[8-9],ANK3基因在腦中的表達(dá)水平及其與精神分裂癥的關(guān)系尚有待進(jìn)一步研究。

    本研究從基因多態(tài)性、基因表達(dá)2個(gè)層面對(duì)ANK3基因與精神分裂癥的關(guān)系展開(kāi)研究,2個(gè)層次的研究結(jié)果一致,即在本研究人群中未發(fā)現(xiàn)ANK3基因?qū)穹至寻Y的發(fā)生發(fā)展產(chǎn)生影響。在基因多態(tài)性研究中,本研究的統(tǒng)計(jì)功效較大,假陰性的可能性較小,結(jié)果對(duì)未來(lái)中國(guó)漢族精神分裂癥ANK3基因的研究有一定參考價(jià)值。

    不同人種以及相同人種在不同區(qū)域產(chǎn)生的遺傳背景差異是群體遺傳學(xué)研究結(jié)果難以得到重復(fù)性驗(yàn)證的主要原因之一。本研究只涉及ANK3基因的2個(gè)位點(diǎn),忽視了該基因區(qū)域內(nèi)其他位點(diǎn),在今后的研究中可以進(jìn)行高密度的SNPs檢測(cè)。而本研究中基因表達(dá)分析的樣本量偏小,限制了該部分分析的統(tǒng)計(jì)功效,未來(lái)研究將進(jìn)一步擴(kuò)大樣本量,以期獲得更嚴(yán)謹(jǐn)?shù)慕Y(jié)果。

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    (責(zé)任編輯:肖雅妮)

    R749.3

    A

    10.3969/j.issn.1002-0152.2016.09.007

    ☆國(guó)家自然科學(xué)基金(編號(hào):81160171)

    *昆明醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院精神科(昆明 650032)△云南省精神衛(wèi)生中心

    ?(E-mail:xfxu2004@sina.com)

    2016-03-14)

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