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      γ-氨基丁酸生物合成研究進(jìn)展

      2023-12-08 08:39:08賈世杰劉江花李國梁
      食品研究與開發(fā) 2023年23期
      關(guān)鍵詞:脫羧酶共培養(yǎng)谷氨酸

      賈世杰,劉江花,李國梁

      (陜西科技大學(xué)食品科學(xué)與工程學(xué)院,陜西 西安 710021)

      γ-氨基丁酸(γ-aminobutyric acid,GABA)是一種四碳非蛋白質(zhì)氨基酸,分子式為C4H9NO2,相對(duì)分子質(zhì)量103.12,呈白色結(jié)晶粉末狀,于19世紀(jì)末首次人工合成[1]。GABA 在醫(yī)藥食品領(lǐng)域應(yīng)用廣泛,富含GABA的食品有助于提高睡眠質(zhì)量、促進(jìn)新陳代謝、恢復(fù)腦細(xì)胞活力等[2],臨床上主要用于高血壓、癲癇、心率失常、睡眠障礙、焦慮和抑郁癥等疾病的治療[3]。隨著對(duì)GABA 生理功能研究的不斷深入,其市場(chǎng)需求量也隨之不斷提高。

      目前,GABA 的生產(chǎn)方法主要有化學(xué)合成、植物富集及生物合成?;瘜W(xué)合成主要以γ-丁內(nèi)酯、γ-鹵代丁腈、2-溴丙酸和戊二酸酐作為底物合成GABA[4],其反應(yīng)速度快、產(chǎn)量高,但存在原料毒性大、反應(yīng)環(huán)境嚴(yán)格、設(shè)備成本高、易產(chǎn)生有毒有害副產(chǎn)物、造成環(huán)境污染等問題,一定程度上限制了其在食品醫(yī)藥領(lǐng)域的應(yīng)用。相較于化學(xué)合成,通過低溫或高鹽脅迫處理從植物中富集GABA 操作簡(jiǎn)單、安全、環(huán)境友好,但其存在富集產(chǎn)率低和成本高的局限性,無法滿足市場(chǎng)需求[5]。生物合成是利用微生物將底物轉(zhuǎn)化為GABA,具有環(huán)境友好、反應(yīng)溫和、綠色環(huán)保的優(yōu)點(diǎn),適用于食品藥品領(lǐng)域,又因微生物具有繁殖周期短、生長(zhǎng)快及適應(yīng)性強(qiáng)等特點(diǎn)受到廣泛關(guān)注。

      盡管當(dāng)前生物合成GABA 已經(jīng)取得了一些進(jìn)展,但仍存在一系列瓶頸問題,影響進(jìn)一步提高其產(chǎn)量,其一是缺乏高效安全的底盤菌株,盡管常用的大腸桿菌具有比較完備的酶系統(tǒng),但其固有的內(nèi)毒素導(dǎo)致的安全性問題在一定程度上限制了它的應(yīng)用[6];乳酸菌系多為益生菌,其催化合成GABA 效率較高,但也受到調(diào)節(jié)因子和環(huán)境的抑制[7];霉菌和酵母菌的催化效率相對(duì)較差。此外,還存在因輔酶因子缺乏導(dǎo)致限速酶活性不高、菌株與限速酶最適pH 值和溫度不兼容、從頭合成底物利用率低、代謝負(fù)擔(dān)影響菌株生長(zhǎng)等問題。針對(duì)上述問題,已經(jīng)報(bào)道了相應(yīng)策略如篩選高產(chǎn)益生菌及誘變育種、構(gòu)建輔酶因子回補(bǔ)途徑、限速酶的定向改造、途徑改造、多菌株共培養(yǎng)等,但是目前還缺乏對(duì)GABA 生物合成產(chǎn)量提高策略的系統(tǒng)綜述,因此本文對(duì)當(dāng)前生物合成GABA 及其產(chǎn)量提高策略進(jìn)行了系統(tǒng)總結(jié)(見圖1),并對(duì)未來的發(fā)展方向進(jìn)行了展望。

      圖1 生物合成γ-氨基丁酸的產(chǎn)量提高策略Fig.1 Production increase measures for the biosynthesis of gamma-aminobutyric acid(GABA)

      1 GABA 的生物合成

      1.1 GABA 生物合成途徑

      微生物發(fā)酵生產(chǎn)GABA 主要通過支路途徑和腐胺途徑進(jìn)行(見圖2)。支路途徑于1970年首次提出,由磷酸吡哆醛(pyridoxal phosphate,PLP)依賴的谷氨酸脫羧酶(glutamate decarboxylase,GAD)催化L-谷氨酸的α-脫羧形成GABA,是微生物生產(chǎn)GABA 的主要方式[8]。腐胺途徑是由腐胺、多胺或鳥氨酸經(jīng)一系列降解反應(yīng)合成GABA,由于腐胺及其代謝產(chǎn)物對(duì)宿主具有很強(qiáng)的毒性,采用此方法合成GABA 的報(bào)道較少[9]。此外,最新研究證明乳酸菌中存在一種新型的GABA合成路徑,以谷氨酸作為氨基供體,在γ-氨基丁酸轉(zhuǎn)氨酶(γ-aminobutyric acid transaminase,gabT)的作用下將琥珀酸半醛(succinic acid semialdehyde,SSA)轉(zhuǎn)化為GABA[10]。

      圖2 GABA 的合成途徑Fig.2 The synthetic pathway of GABA

      1.2 底盤菌株的選擇

      GABA 可以通過多種底盤菌株合成,主要包括大腸桿菌、乳酸菌、谷氨酸棒狀桿菌、酵母菌屬、枯草芽孢桿菌、少數(shù)霉菌、雙歧桿菌等。

      1.2.1 大腸桿菌

      大腸桿菌具有培養(yǎng)周期短、繁殖速度快、適應(yīng)性強(qiáng)等優(yōu)點(diǎn),是天然產(chǎn)物生物合成常用的細(xì)胞工廠。研究表明,大腸桿菌具有較為完備的酶系統(tǒng),在合成生物學(xué)中應(yīng)用較廣。在大腸桿菌中表達(dá)密碼子優(yōu)化的乳球菌谷氨酸脫羧酶B(glutamate decarboxylase B,gadB),以2 mol/L 葡萄糖作為底物,GABA 的平均產(chǎn)率達(dá)到40.94 g(/L·h),經(jīng)3 次補(bǔ)料培養(yǎng)后獲得614.15 g/L GABA,摩爾轉(zhuǎn)化率接近100%(見表1)[11],表明大腸桿菌在GABA 生產(chǎn)中具有較大潛力。但是革蘭氏陰性菌固有的內(nèi)毒素存在潛在毒性風(fēng)險(xiǎn),限制其在食品藥品領(lǐng)域的應(yīng)用,無內(nèi)毒素益生菌EscherichiacoliNissle 1917的發(fā)現(xiàn)為GABA 的合成帶來了新機(jī)遇,利用基因編輯工具CRISPR/Cas 改造Nissle 1917 合成GABA,其產(chǎn)量可達(dá)17.9 g/L[6]。雖然合成產(chǎn)量相較于其它大腸桿菌較低,但是作為益生菌,EscherichiacoliNissle 1917 滿足了安全性要求,在GABA 生物合成中有著更廣闊的應(yīng)用前景。

      表1 GABA 生物合成底盤菌株及產(chǎn)量Table 1 The chassis strains of GABA biosynthesis and their production

      1.2.2 乳酸菌

      乳酸菌是一種食品級(jí)的安全菌株,在自然界分布極為廣泛,具有豐富的物種多樣性,是研究分子生物學(xué)和基因工程的理想材料。利用乳酸菌作為底盤菌株生產(chǎn)GABA 由來已久,乳酸菌谷氨酸脫羧酶具有較好的催化活性,常被用來過表達(dá)生產(chǎn)GABA。利用靜息乳酸菌以谷氨酸鈉作為底物生產(chǎn)GABA,產(chǎn)量最高可達(dá)201.18 g/L,產(chǎn)率為20.118 g(/L·h),轉(zhuǎn)化率可達(dá)99.4%[12],表明利用乳酸菌生產(chǎn)GABA 具有巨大潛力(表1)。在乳酸菌中,氮調(diào)節(jié)劑(global transcriptional regulatory proteins of nitrogen metabolism,GlnR)可直接調(diào)節(jié)谷氨酸與GABA 轉(zhuǎn)化,能夠抑制谷氨酸脫羧酶基因gadB和GABA 逆轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白基因(γ-aminobutyrate antiporter,gadC)的轉(zhuǎn)錄,利用GlnR缺失菌株能夠合成284.7 g/L GABA,其產(chǎn)量是野生型菌株的9.8 倍[7]。乳酸菌生產(chǎn)GABA 也受到中堿性環(huán)境的限制,加入過量的谷氨酸,在保障底物充足的情況下,又能維持pH 值穩(wěn)定,利用這種pH 值自動(dòng)維持的體系,L.brevisCD0817 能夠合成(321.9±6.7)g/L GABA,產(chǎn)率為6.71 g/(L·h),這是一種低成本、相對(duì)簡(jiǎn)單的維持環(huán)境穩(wěn)定的方法,但也存在谷氨酸溶解度低、產(chǎn)率不高的問題[13]。

      1.2.3 谷氨酸棒狀桿菌

      谷氨酸棒狀桿菌一般公認(rèn)為安全菌株,在合成氨基酸方面有著顯著優(yōu)勢(shì)。Wen 等[14]在谷氨酸棒狀桿菌中過表達(dá)來自大腸桿菌的突變谷氨酸脫羧酶(glutamate decarboxylase B mutant,gadBmut)(Glu89Gln/ΔC452-462),并結(jié)合谷氨酸脫羧酶分泌表達(dá)策略,GABA 的產(chǎn)量可達(dá)77.6 g/L GABA,產(chǎn)率為1.21 g/(L·h),每克葡萄糖可轉(zhuǎn)化為0.44 g GABA,這是首次報(bào)道利用谷氨酸棒狀桿菌胞外催化合成GABA。另外,為了緩解菌株生長(zhǎng)與高附加值產(chǎn)品合成之間對(duì)底物競(jìng)爭(zhēng)的矛盾,Wei等[15]創(chuàng)建了一個(gè)可調(diào)控的生長(zhǎng)階段依賴性自主雙功能遺傳開關(guān)(growth phase-dependent autonomous bifunctional genetic switch,GABS),能夠?qū)崿F(xiàn)谷氨酸棒狀桿菌從生長(zhǎng)模式到生產(chǎn)模式的狀態(tài)轉(zhuǎn)換,利用甘油作為底物發(fā)酵生產(chǎn)GABA,其產(chǎn)量可達(dá)45.6 g/L,每克甘油可轉(zhuǎn)化為0.4 g 的GABA。谷氨酸棒狀桿菌在合成GABA過程中具有良好的底物(谷氨酸)生產(chǎn)能力,但其基因組中不含谷氨酸脫羧酶基因,需要通過引入異源谷氨酸脫羧酶基因進(jìn)行表達(dá)。

      1.2.4 酵母菌

      酵母菌被廣泛用于釀造業(yè),其基因組中含有谷氨酸脫羧酶基因,因此具有發(fā)酵生產(chǎn)GABA 的潛力。Han 等[16]利用分離篩選出來的酵母菌PichiasilvicolaUL6-1 和Sporobolomycescarnicolor402-JB-1 在酵母提取物-蛋白胨-葡萄糖培養(yǎng)基中于30 ℃培養(yǎng)30 h,分別能夠合成136.5 μg/mL 和200.8 μg/mL GABA,由此可見,天然酵母菌的谷氨酸脫羧酶活性不佳。為解決野生型酵母產(chǎn)能弱的劣勢(shì),Yuan 等[17]在釀酒酵母菌中異源表達(dá)來自鏈霉菌屬的谷氨酸脫羧酶,經(jīng)十批補(bǔ)料發(fā)酵后,GABA 產(chǎn)量達(dá)到62.6 g/L,總摩爾轉(zhuǎn)化率為60.8%,極大地提高了GABA 的產(chǎn)量。此外,Zhang 等[18]利用克魯維酵母以豆渣作為原料生產(chǎn)GABA,在初始pH4.0、培養(yǎng)溫度35 ℃下發(fā)酵60 h,最高可獲得4.31 g/L GABA(表1)。但是目前基于酵母生產(chǎn)GABA 的產(chǎn)率相比于其它底盤菌株仍然較低。

      2 GABA 產(chǎn)量的提高

      2.1 篩選野生型高產(chǎn)菌株及誘變育種

      篩選天然高產(chǎn)菌株是提高GABA 產(chǎn)量的基本策略。Wang 等[28]從我國泡菜中分離的短乳酸桿菌NCL912,發(fā)酵48 h,GABA 的產(chǎn)量可達(dá)(205.8±8.0)g/L,此外,酵母菌、霉菌等也被篩選出來用于GABA 生產(chǎn),但產(chǎn)率均不高,需做進(jìn)一步改造。

      微生物誘變育種是以人工手段誘發(fā)微生物基因突變,改變其遺傳信息和功能,通過誘變育種能夠篩選性能優(yōu)越的突變菌株。Wu 等[30]通過大氣與室溫等離子體誘變過的紅曲霉具有固態(tài)發(fā)酵GABA 的能力,優(yōu)化底物配比后,GABA 的產(chǎn)量可達(dá)15.93 mg/g,但是誘變育種的不定向性與低頻性導(dǎo)致菌種選育工作量大,采用此方法生產(chǎn)GABA 的報(bào)道較少。

      2.2 限速酶優(yōu)化

      2.2.1 不同菌株來源的限速酶活性

      自然界中谷氨酸脫羧酶廣泛分布于各種微生物中,其來源不同,活性也存在差異,目前報(bào)道的少數(shù)乳酸菌屬、芽孢桿菌屬谷氨酸脫羧酶活性較高。GAD 限速酶活性比較見表2。

      表2 GAD 限速酶活性比較Table 2 Comparison of the activity of rate-limiting enzyme(glutamic acid decarboxylase)among different strains

      2.2.2 兩階段pH 值調(diào)控策略合成GABA

      在支路途徑生產(chǎn)GABA 中,谷氨酸脫羧酶(GAD)扮演了重要角色,以磷酸吡哆醛為輔酶、不可逆地將谷氨酸(L-glutamate,L-Glu)轉(zhuǎn)化為GABA,反應(yīng)過程中消耗H+并釋放CO2,使培養(yǎng)基中pH 值上升[38]。不同菌株來源的GAD 在低pH 值下發(fā)揮作用,即使是來自GAD 活性普遍較高的大腸桿菌和乳酸桿菌,在中性條件下也會(huì)急劇失活,而大多數(shù)微生物的最適生長(zhǎng)條件偏向于中性(見表3),因此導(dǎo)致了菌株與限速酶pH 值不兼容。采用兩階段pH 值發(fā)酵策略能在一定程度解決該問題,首先調(diào)節(jié)pH 值使得菌株快速生長(zhǎng),待菌株達(dá)到穩(wěn)定期后,調(diào)節(jié)到限速酶的最適pH 值,用于生產(chǎn)GABA。應(yīng)用此思路,利用來自L.brevisTCCC13007 建立了一個(gè)用于生產(chǎn)GABA 的兩步細(xì)胞生物轉(zhuǎn)化過程。首先,在7%的含味精培養(yǎng)基中,初始pH 值為6.0,隨后控制pH 值為4.6,發(fā)酵66 h 可獲得約38 g/L 的GABA,轉(zhuǎn)化率為98.6%[39]。在谷氨酸棒狀桿菌中引入來自乳酸菌谷氨酸脫羧酶和磷酸激酶,采用兩階段pH 值調(diào)控策略,最終產(chǎn)量達(dá)到70.6 g/L[40],兩階段pH 值調(diào)控策略對(duì)于GABA 的合成有效,但步驟較為繁瑣。

      表3 菌株與限速酶最適pH 值和溫度Table 3 Optimum pH values and temperatures for strains and the rate-limiting enzyme

      2.2.3 限速酶定向改造

      近年來,隨著結(jié)構(gòu)信息學(xué)的不斷進(jìn)步,GAD 的晶體結(jié)構(gòu)已被獲悉,通過在不同條件下對(duì)GAD 晶體結(jié)構(gòu)的分析發(fā)現(xiàn),GAD 的羧基端在酸性pH 值下大多是沒有結(jié)構(gòu)的,但接近中性條件時(shí),會(huì)形成類似于“塞”的結(jié)構(gòu),阻止了底物谷氨酸在中性pH 值下與活性位點(diǎn)的結(jié)合[41,45]。另外,研究發(fā)現(xiàn)幾個(gè)關(guān)鍵的氨基酸殘基與酶活性位點(diǎn)有關(guān),不同來源的GAD 關(guān)鍵位點(diǎn)不同,大腸桿菌的谷氨酸脫羧酶中Glu89 與pH 值協(xié)同活性相關(guān),雙重突變體Glu89Gln/ΔC452-466 不僅破壞了協(xié)同性,而且產(chǎn)生了在接近中性pH 值下仍保持活性的突變GAD[46]。而在乳酸菌谷氨酸脫羧酶中,則與17、294、312、346 號(hào)位氨基酸有關(guān),多重突變體K17T/D294G/E312S/Q346/ΔC11 表現(xiàn)出中性pH 值下的活性,酶的催化活性kcat/Km 達(dá)到3.91 m·mol/(L·S),與野生型相比提高了5 倍多[45]。而在巨大芽孢桿菌中酶的pH 值協(xié)同活性則與294 和467 號(hào)氨基酸有關(guān),突變體E294R/H467A 提高了pH 值的活性范圍[43]。在恥垢分枝桿菌中C 端缺失突變體GADMSMΔC 的Vmax 和Km 值在pH5.5 下分別為14.69 和5.70,在pH7.0 下分別為9.87和6.17。與野生型GAD 相比,GADMSMΔC 保持了更高的底物親和力和酶活性,即使在pH7.0 時(shí)也保持了78.5%的酶活性[47]。

      除了pH 值協(xié)同活性,酶對(duì)溫度的耐受性也是工業(yè)化要求之一,因此可以定向改造GAD 的熱穩(wěn)定性。乳酸菌谷氨酸脫羧酶突變體S325A 不僅提高了半熱致死溫度,且酶活性相較于野生型也有明顯增強(qiáng)[35]。大腸桿菌谷氨酸脫羧酶三重突變體Gln5Ile/Val6Asp/Thr7Gln 相較于野生型顯示出更高的熱穩(wěn)定性[48]。

      近期報(bào)道了一種基于序列的蛋白質(zhì)設(shè)計(jì)新策略,基于全一致序列設(shè)計(jì)的人工谷氨酸脫羧酶(Full consensus GAD,F(xiàn)cGAD)在耐熱性、耐酸性及催化活性較野生型有著明顯優(yōu)勢(shì),利用表達(dá)FcGAD 的大腸桿菌作為生物催化劑,實(shí)現(xiàn)了克級(jí)GABA 的合成[36]。隨著生物信息學(xué)的發(fā)展,基于共識(shí)序列設(shè)計(jì)蛋白質(zhì)為提高GABA產(chǎn)量提供了新思路。

      2.2.4 構(gòu)建輔酶因子回補(bǔ)途徑提高酶活性

      PLP 是谷氨酸脫羧酶重要的輔酶因子,機(jī)體缺乏PLP 會(huì)導(dǎo)致GAD 活性下降,因此可以通過構(gòu)建輔酶因子回補(bǔ)途徑來解決活性不足的問題。在大腸桿菌中共表達(dá)來自乳酸菌的GAD 與來自大腸桿菌磷酸吡哆醛激酶(pyridoxal kinase gene,pdxY),優(yōu)化培養(yǎng)和反應(yīng)條件,0.6 mol/L 谷氨酸鈉實(shí)現(xiàn)了100%轉(zhuǎn)化率[49]。同樣在大腸桿菌中表達(dá)來自釀酒酵母的pdx1 和pdx2 兩種磷酸激酶,以25 g/L 谷氨酸鈉為底物合成了13.2 g/L 的GABA,其合成產(chǎn)量相較于原始菌株有著明顯提高[50]。

      2.3 支路途徑改造

      2.3.1 一步法途徑改造

      一步法合成GABA 是指在培養(yǎng)基中直接補(bǔ)充底物谷氨酸(或谷氨酸鈉),在谷氨酸脫羧酶的作用下生成GABA,其受到幾個(gè)關(guān)鍵基因調(diào)控:gadB編碼谷氨酸脫羧酶,能夠?qū)⒐劝彼徂D(zhuǎn)化為GABA;gadC編碼轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白,負(fù)責(zé)將胞外的谷氨酸轉(zhuǎn)運(yùn)到胞內(nèi),將合成GABA 轉(zhuǎn)運(yùn)到胞外,其轉(zhuǎn)運(yùn)效率受到pH 值的影響,當(dāng)pH 值高于6.5 時(shí),其羧基末端塞子狀結(jié)構(gòu)域閉合,阻斷向內(nèi)開放[51];gabT編碼GABA 轉(zhuǎn)氨酶,能夠?qū)ABA轉(zhuǎn)化為琥珀酸半醛;gabP編碼逆轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白,負(fù)責(zé)將胞外的GABA 轉(zhuǎn)運(yùn)至胞內(nèi)。在重塑代謝網(wǎng)絡(luò)提高產(chǎn)量的策略中,需要上調(diào)谷氨酸流向GABA 的通量,即上調(diào)gadB和gadC的轉(zhuǎn)錄與翻譯水平,下調(diào)降解途徑及逆轉(zhuǎn)運(yùn)途徑,即敲除gabT與gabP途徑。應(yīng)用此策略,過表達(dá)與GABA 生物合成和轉(zhuǎn)運(yùn)相關(guān)的基因gadA、gadB和gadC,同時(shí)敲除降解相關(guān)基因gabT,以及逆轉(zhuǎn)運(yùn)通道gabP,構(gòu)建的菌株獲得了19.79 g/L 的GABA,轉(zhuǎn)化率達(dá)到93.8%[20]。在敲除gabT的大腸桿菌突變體中,聯(lián)合表達(dá)gadB和gadC,10 g/L 的谷氨酸鈉中可產(chǎn)生5.46 g/L 的GABA,摩爾轉(zhuǎn)化率高達(dá)89.5%[52]。應(yīng)用支架在大腸桿菌中共表達(dá)gadB和gadC,10 g/L 的谷氨酸鈉中可產(chǎn)生5.65 g/L 的GABA,摩爾轉(zhuǎn)化率高達(dá)93%[19]。在大腸桿菌中共表達(dá)gadBM4-2和gadCΔC,最終產(chǎn)量達(dá)到(307.50±5.94)g/L[53]。

      2.3.2 從頭設(shè)計(jì)合成途徑

      在GABA 的合成中,除了利用谷氨酸(或谷氨酸鈉)作為底物,還可以利用其它碳源如纖維素、葡萄糖、木糖、甘油和甲醇等原料,既能節(jié)約資源,又能生產(chǎn)高附加值產(chǎn)品。但由于這些底物利用率低,直接以其作為底物合成GABA 效率不高,因此需要根據(jù)碳源種類開發(fā)高利用菌株,并進(jìn)行途徑改造提高GABA 的產(chǎn)量。例如,Wei 等[15]為了構(gòu)建高甘油利用率的谷氨酸棒狀桿菌,首先,過表達(dá)甘油跨膜通道(aquaglyceroporin,GlpF)、甘油脫氫酶(glycerol dehydrogenase,DhaD)、ATP 依賴的二羥基丙酮激酶(ATP-dependent dihy droxyacetone kinase,DhaK)、磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(phosphoenolpyruvate carboxylase,PPC)、丙酮酸羧化酶(pyruvate carboxylase,PC)、檸檬酸合酶(citrate synthase,GltA)等,提高甘油利用率;然后,調(diào)控α-酮戊二酸碳流偏向谷氨酸合成途徑,過表達(dá)gad、gadC,獲得高產(chǎn)GABA 的菌株。在構(gòu)建高利用甘油的大腸桿菌生產(chǎn)GABA 的菌株中,首先采用進(jìn)化和代謝工程篩選出甘油適應(yīng)性高的菌株,然后失活一些非必要的代謝基因,使得更多碳通量流向GABA,提高了GABA 的產(chǎn)量[54]。

      途徑改造雖然能夠?qū)⑻纪扛咝?dǎo)向目標(biāo)產(chǎn)物,但改造過程繁瑣,一些關(guān)鍵基因的缺失可能導(dǎo)致無法滿足菌株正常的生長(zhǎng)發(fā)育需求,造成菌株濃度低下,產(chǎn)量沒有大幅提高甚至下降的情況。因此,平衡生長(zhǎng)與代謝壓力之間的矛盾是關(guān)鍵。已有研究報(bào)道了一些敏感性元件,可以克服微生物生長(zhǎng)繁殖與代謝壓力之間的矛盾,使碳源優(yōu)先滿足菌株生長(zhǎng)發(fā)育,待菌群達(dá)到穩(wěn)定后,再用于產(chǎn)物代謝。如利用對(duì)生長(zhǎng)期敏感的GPP啟動(dòng)子調(diào)控生長(zhǎng)模式到生產(chǎn)模式的轉(zhuǎn)換[15]。利用對(duì)溫度敏感的啟動(dòng)子,如冷休克基因CSPA 啟動(dòng)子,通過對(duì)溫度的改變實(shí)現(xiàn)從生長(zhǎng)模式到生產(chǎn)模式的轉(zhuǎn)變[55]。利用對(duì)底物專一的啟動(dòng)子,如木糖啟動(dòng)子,在利用玉米芯水解物發(fā)酵生產(chǎn)附加值產(chǎn)品時(shí),葡萄糖優(yōu)先用來滿足生長(zhǎng)后,在木糖啟動(dòng)子的作用下進(jìn)入生產(chǎn)模式[56]。

      2.4 共培養(yǎng)策略

      單菌株細(xì)胞工廠改造增加了宿主生長(zhǎng)發(fā)育的代謝負(fù)擔(dān),容易導(dǎo)致目標(biāo)化合物產(chǎn)量不高,多菌株共培養(yǎng)減小單個(gè)菌株代謝的負(fù)擔(dān),且減少了生物合成途徑設(shè)計(jì),是提高目標(biāo)化合物合成產(chǎn)量的有效策略[57]。利用嗜熱鏈球菌與乳酸菌共培養(yǎng)發(fā)酵生產(chǎn)高含量GABA牛奶,嗜熱鏈球菌水解特定肽滿足了乳酸菌的生長(zhǎng),同時(shí),嗜熱鏈球菌分解代謝產(chǎn)生的乳酸所產(chǎn)生的酸性環(huán)境維持了乳酸菌中的GAD 活性,提高了GABA 含量[58]。糞腸球菌與融合魏斯氏菌共培養(yǎng)合成的GABA 產(chǎn)量更高,發(fā)酵時(shí)間更短[59]。釀酒酵母菌與植物乳桿菌共培養(yǎng)發(fā)酵桑椹飲料,合成了更高產(chǎn)量的GABA[60]?;卺劸平湍概c大腸桿菌共培養(yǎng)生產(chǎn)羥基酪醇的思路[61],利用谷氨酸棒狀桿菌與大腸桿菌共培養(yǎng),前者為后者提供底物谷氨酸,后者催化谷氨酸合成GABA 或許會(huì)成為可能。目前,共培養(yǎng)策略生產(chǎn)GABA 還僅僅應(yīng)用在一些功能性飲品中,直接用于GABA 高產(chǎn)量合成的尚未報(bào)道。

      3 總結(jié)與展望

      GABA 作為一種具有多種生理活性的物質(zhì),被廣泛用于開發(fā)以健康為導(dǎo)向的產(chǎn)品,而化學(xué)合成易產(chǎn)生有毒副產(chǎn)物,植物富集效率低,難以滿足日漸增長(zhǎng)的市場(chǎng)需求,生物合成因綠色環(huán)保且具有較高的生物轉(zhuǎn)化率而備受關(guān)注,但目前生物合成GABA 仍然存在一系列瓶頸問題,很大程度上制約了GABA 產(chǎn)量的進(jìn)一步提高。本文系統(tǒng)總結(jié)了目前報(bào)道的提高GABA 生物合成產(chǎn)量的策略,主要包括:通過酶的定向改造解決限速酶與菌株最適生長(zhǎng)環(huán)境(溫度或pH 值)不兼容的問題,利用生物信息學(xué)進(jìn)行蛋白結(jié)構(gòu)功能化設(shè)計(jì);通過構(gòu)建回補(bǔ)途徑以廉價(jià)的磷酸吡哆醇替代磷酸吡哆醛作為底物生成輔酶因子,利用代謝途徑改造能夠有效提高底物利用率和目標(biāo)物產(chǎn)量,多菌株共培養(yǎng)分擔(dān)代謝壓力等。另外,選用安全高效底盤菌株如乳酸菌、谷氨酸棒狀桿菌能夠提高合成GABA 的安全性,使其直接應(yīng)用于食品醫(yī)藥領(lǐng)域。在提高底物利用率的基礎(chǔ)上,擴(kuò)大底物選擇范圍,選擇便宜易得的底物,如大豆水解液、玉米芯水解液等也是合成GABA 且降低生產(chǎn)成本的有效策略。

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