王志龍 付 濤 林 立 林樂靜 李 文 劉 峰 朱文欣 陳際伸
(寧波城市職業(yè)技術(shù)學(xué)院/浙江園林綠化應(yīng)用技術(shù)協(xié)同創(chuàng)新中心,浙江 寧波 315100)
櫻屬(PrunusL.)植物隸屬薔薇科(Rosaceae),全世界約150 種,我國約50 種,居世界各國之首。野生櫻屬植物遍布我國各地,資源豐富,其表型具有較強(qiáng)的可塑性,種間雜交普遍,種間模糊,種內(nèi)變異較大;此外,氣候條件等環(huán)境因素差異巨大,導(dǎo)致變異幅度大,在資源分類中極易存在混亂與爭議[1-2]。如山櫻(P.serrulata)花廣泛分布于我國大部分地區(qū),日本和朝鮮也有分布,不同地區(qū)其各部分性狀變異非常大;華中櫻(P.conradinae)分布廣泛且各部分性狀變異也很大,如萼筒、總梗長短以及花序傘形或近傘形花序常因地理環(huán)境不同而變化;鐘花櫻(P.campanulata)主要分布于我國東南沿海省份。日本無野生種分布,并將其進(jìn)行引種繁殖。目前,日本許多優(yōu)良品種如寒櫻(P.campanulataKanzakura)、修善寺寒櫻(P.campanulataRubescens)、河津櫻(P.campanulataKawazu-zakura)、陽光櫻(P.campanulataYoukou)等紅色花系櫻花的親本均為鐘花櫻。然而,鐘花櫻與高盆櫻(P.cerasoides)近似,一些學(xué)者主張將其作為高盆櫻的變種,其分類地位尚不清晰;紅山櫻(P.jamasakura)與山櫻花接近,也常被定義為一個種。由于許多野生櫻屬植物種間模糊,界限不清晰,存在著許多過度類型,而種內(nèi)又存在著較大差異,這給我國野生櫻屬植物的分類帶來了極大困難,許多已經(jīng)命名的物種其分類地位仍有待考證。2003年《Flora of China》第九卷出版,對之前發(fā)表的新種作了相應(yīng)處理,如將垂枝毛櫻桃歸入毛櫻桃(P.tomentosa),將泰山野櫻花歸入山櫻等[3]。最近十年,又有新種(變種) 不斷被發(fā)現(xiàn),如武夷紅櫻(P.campanulatavar.Wuyiensis)[4]、磐安櫻(P.pananensis)[5]、雪落櫻(P.xueluoensis)[6]、沼生矮櫻(P.jingningensis)[7]等。
武夷紅櫻是2007年王賢榮等[4]和伊賢貴[8]在福建武夷山調(diào)查時發(fā)現(xiàn)的,因其外形與鐘花櫻形態(tài)相似而被定義為鐘花櫻變種,武夷紅櫻與鐘花櫻相比,盛開時花朵完全展開,花色十分艷麗。目前,武夷紅櫻僅見于福建武夷山地區(qū),其資源極其珍貴,觀賞價值極高,具有巨大市場價值。
對于已承認(rèn)的以及新發(fā)現(xiàn)的或有爭議的種(變種)大多根據(jù)形態(tài)學(xué)分類所得出的結(jié)論判斷,但植物的表型是自身遺傳物質(zhì)和所處環(huán)境共同作用的結(jié)果。同一物種所處的環(huán)境不同,其生態(tài)型也不同,往往表現(xiàn)為趨異進(jìn)化;而不同物種處于相同的環(huán)境條件下,其種間往往表現(xiàn)出趨同進(jìn)化的特征。因此,單純以形態(tài)的差異或變異作為鑒定物種的標(biāo)準(zhǔn),常出現(xiàn)偏差甚至錯誤。武夷紅櫻為我國分布特有種,其遺傳背景的研究對今后的資源保護(hù)和育種工作都具有重要意義。
2015年3-4月櫻花育種課題組成員先后從福建(117°24′~118°02′E,27°32′~27°55′N)、云南(25°N、102°E)、上海(121°.4′E、31°.2′N)、浙江(120°55′~122°16′E、28°51′~30°33′N)等地搜集了16 份櫻花種質(zhì)資源(表1),采其健康、無病害的幼葉用于試驗。
表1 16 份櫻屬植物樣品信息及其來源Table 1 Sixteen samples information and source of Cerasus plants
利用試劑盒(上海萊楓生物科技有限公司)提取16 份材料的DNA,采用1.5%瓊脂糖凝膠進(jìn)行電泳檢測,Bio-Photometr 核酸檢測儀(德國Eppendorf 公司)檢測DNA 濃度和純度,再根據(jù)計算所得的DNA 濃度,將DNA 樣品溶液用溫?zé)岬腡ris-EDTA(TE)稀釋成50 ng·μL-1,-20℃保存?zhèn)溆?。PCR 反應(yīng)體系與擴(kuò)增程序參考付濤等[9]、吳月燕等[10]的方法。其中12 對引物序列由上海生工生物公司合成,引物信息見表2。
PCR 反應(yīng)體系參考付濤等[9]的方法。選擇4 個葉綠體間隔區(qū)序列trnH-psbA、rpl32-trnL、psbJ-petA和trnLtrnF作為鑒別序列(rbcL和matK片段在種水平上鑒別率較低,故未使用),其引物序列見表3。trnH-psbA、rpl32-trnL、psbJ-petA和trnL-trnF的擴(kuò)增程序均為:94℃預(yù)變性5 min;94℃變性30 s,58℃退火30 s,72℃延伸1 min,35 個循環(huán);最后72℃延伸10 min。PCR 產(chǎn)物送上海桑尼生物科技有限公司進(jìn)行雙向測序。
簡單重復(fù)序列(simple sequence repeats,SSR)分子標(biāo)記數(shù)據(jù)與DNA 條形碼數(shù)據(jù)處理:參考付濤等[9]和吳月燕等[10]的數(shù)據(jù)處理方法。
根據(jù)SSR 擴(kuò)增結(jié)果(圖1),利用NTSYSpc2.10e 軟件進(jìn)行Jaccard 相似性系數(shù)分析,計算不同物種間遺傳相似系數(shù),其范圍在0.653 1~0.918 4 之間(表4)。
表2 12 對引物的堿基序列及其相關(guān)信息Table 2 Base sequences and related information of twelve pairs of primers
表3 DNA 條形碼引物名稱及其序列Table 3 Primer names and sequences of DNA barcoding
由遺傳相似系數(shù)進(jìn)行UPGMA 聚類分析,構(gòu)建了16 份櫻屬植物的聚類關(guān)系圖(圖2)。結(jié)果表明,首先,野生早櫻、浙閩櫻、尾葉櫻與黑櫻桃被聚為一類;其次,武夷紅櫻、高盆櫻、華中櫻與鐘花櫻被聚為一類;再次,山櫻、郁李、毛櫻桃、雪落櫻與沼生矮櫻被聚為一類;最后,散毛櫻、崖櫻桃與迎春櫻單獨聚類。
聚類結(jié)果表明,武夷紅櫻與華中櫻親緣關(guān)系最近(武夷山地區(qū)無高盆櫻分布),推測武夷紅櫻遺傳背景較為復(fù)雜,可能為鐘花櫻與華中櫻的雜交種,或為華中櫻的變種等。
圖1 引物M6a 的SSR 擴(kuò)增圖Fig.1 SSR amplification using the M6a primer
表4 16 份櫻屬植物SSR 分析的遺傳相似系數(shù)Table 4 Genetic similarity coefficient of 16 samples of Cerasus plants based on SSR analysis
圖2 基于SSR 構(gòu)建的16 份櫻屬植物的UPGMA 聚類分析Fig.2 UPGMA dendrogram of the sixteen samples of Cerasus plants based on SSR
為了進(jìn)一步鑒定和確認(rèn)武夷紅櫻的分類地位,對武夷紅櫻、鐘花櫻與華中櫻的樹枝、花、葉片和果實形態(tài)特征進(jìn)行了比較。比較樹皮、小枝和嫩枝等樹枝的主要特征發(fā)現(xiàn),武夷紅櫻與華中櫻樹干顏色一致,均為灰褐色;小枝顏色和嫩枝顏色三者大體一致,為褐色和紫紅色;武夷紅櫻嫩枝有較多絨毛,而鐘花櫻與華中櫻光滑無毛(表7)。比較花柄、苞片、萼筒、萼片、花柱、雄蕊數(shù)目和花色等花的主要特征發(fā)現(xiàn)(表6),鐘花櫻和武夷紅櫻在花柄的總梗、花梗長度和雄蕊數(shù)目等數(shù)量性狀上差異較小且變異相對較小,而華中櫻變異范圍較大。此外,在一些質(zhì)量性狀上華中櫻變異也極大,如華中櫻花序呈傘形或傘形總狀(鐘花櫻傘形,武夷紅櫻傘形總狀),萼片直立或反轉(zhuǎn)(鐘花櫻直立,武夷紅櫻反轉(zhuǎn)明顯),花色為白色乃至粉紅色(鐘花櫻深紅色,武夷紅櫻紅色);在花柄絨毛、萼片形狀以及苞片顏色和形狀等質(zhì)量性狀上,武夷紅櫻與鐘花櫻、華中櫻之間均有明顯差異,如武夷紅櫻花柄披絨毛,而鐘花櫻、華中櫻無或極少;在花柱和萼筒性狀上,三者幾乎無明顯差異。通過比較葉片形態(tài)特征發(fā)現(xiàn)(表7),武夷紅櫻與鐘花櫻在幼葉顏色,成齡葉形狀、尖端類型、基部形狀、主脈顏色、葉柄顏色、托葉形狀上幾乎無差異,而與華中櫻差異較大。但武夷紅櫻在成齡葉鋸齒情況、正反面有無絨毛以及葉柄有無絨毛與鐘花櫻和華中櫻差異較大。通過比較果實的主要特征發(fā)現(xiàn)(表8),三者果實顏色差異較大,武夷紅櫻果實黑色,而鐘花櫻和華中櫻果實為紅色;此外,武夷紅櫻與鐘花櫻的果實形狀、果梗長以及種子表面棱紋特征幾乎無明顯差異,但與華中櫻差異較大。通過對樹枝、花、葉片和果實等形態(tài)特征的綜合比較,武夷紅櫻與鐘花櫻形態(tài)上更為接近,結(jié)合SSR 分析結(jié)果認(rèn)為,武夷紅櫻可能為鐘花櫻與華中櫻的雜交種。
表5 武夷紅櫻、鐘花櫻和華中櫻樹枝的形態(tài)特征比較Table 5 Comparison of morphological characteristics of branches in P.campanulata var. Wuyiensis, P.campanulata and P.conradinae
表6 武夷紅櫻、鐘花櫻和華中櫻花的形態(tài)特征比較Table 6 Comparison of morphological characteristics of flowers in P.campanulata var.Wuyiensis, P.campanulata and P.conradinae
為了進(jìn)一步驗證試驗結(jié)果,采用DNA 條形碼技術(shù)對武夷紅櫻(P.campanulatavar.Wuyiensis1 andP.campanulatavar.Wuyiensis2,以下簡稱PcW1 和PcW2,分別為武夷紅櫻不同單株)、鐘花櫻和華中櫻進(jìn)行分析。測序結(jié)果經(jīng)過DNAMAN 處理后,獲得完整的基因序列或序列長度一致的基因序列(完整基因的一部分) 用于后續(xù)分析。通過MEGA 的Sequence Data Explorer 功能比對序列信息(圖3),發(fā)現(xiàn)武夷紅櫻(PcW1 和CcW2)與華中櫻的葉綠體trnH-psbA間隔區(qū)序列完全一致,而比鐘花櫻多1 條含18 個堿基的序列(TTTATCATTACTTGTAAG)(圖3-A);武夷紅櫻與華中櫻的葉綠體rpl32-trnL間隔區(qū)序列含有1 條20 個堿基的序列(AATTATATATTATTATATAT),而武夷紅櫻與華中櫻的葉綠體rpl32-trnL間隔區(qū)序列完全一致。此外,PcW1 和PcW2 與鐘花櫻均有3 個位點差異,以及含1條60 個堿基的序列(TTATAATTATATATTAAAAATAT TATAATTATATATTAAAAGATATTATAATTATATATT)(圖3-B);武夷紅櫻(PcW1 和PcW2)與華中櫻的葉綠體petA-psbJ間隔區(qū)序列有1 個堿基位點差異,以及缺失1 條24 個堿基的序列(TCTGTTACTCACATCTGTTA CTCA),而與鐘花櫻有5 個位點差異(圖3-C);武夷紅櫻(PcW1 和PcW2)與華中櫻的葉綠體trnL-trnF間隔區(qū)序列有3 個位點差異,而與鐘花櫻有75(77)個位點差異,差異較大(圖3-D)。
表7 武夷紅櫻、鐘花櫻和華中櫻葉片的形態(tài)特征比較Table 7 Comparison of morphological characteristics of leaves in P.campanulata var.Wuyiensis, P.campanulata and P.conradinae
表8 武夷紅櫻、鐘花櫻和華中櫻果實的形態(tài)特征比較Table 8 Comparison of morphological characteristics of fruits in P.campanulata var.Wuyiensis, P.campanulata and P.conradinae
運(yùn)用MEGA 4.0 軟件,基于K2-P 距離模型進(jìn)行trnH-psbA+rpl32-trnL+petA-psbJ+trnL-trnF序列的進(jìn)化樹構(gòu)建(圖4),結(jié)果顯示,武夷紅櫻(PcW1 和CcW2)與華中櫻聚為一類,而與鐘花櫻相距較遠(yuǎn),這與SSR 結(jié)果相一致,均表明武夷紅櫻與華中櫻在基因水平上相似度更高,加之葉綠體基因呈母系遺傳的特點,再結(jié)合形態(tài)特征,說明武夷紅櫻為鐘花櫻(父本)與華中櫻(母本)的雜交種。
SSR 分子標(biāo)記技術(shù)已廣泛應(yīng)用于物種分類系統(tǒng)比較、種質(zhì)鑒定、指紋圖譜構(gòu)建、輔助育種等方面,目前分子標(biāo)記技術(shù)也廣泛應(yīng)用于櫻屬植物的相關(guān)研究[16-17]。如趙慶杰等[18]利用特征序列擴(kuò)增區(qū)域(sequence characterized amplified regions,SCAR)分子標(biāo)記技術(shù)鑒定了櫻花品種;宗宇等[19]開發(fā)了中國櫻桃轉(zhuǎn)錄組的SSR 分子標(biāo)記及鑒定研究;何恒流等[20]利用SSR 分子技術(shù)分析了陜西7 個毛櫻桃自然居群的遺傳多樣性;陳潔[21]利用SSR 技術(shù)分析了山櫻花居群的遺傳多樣性;Cantini 等[22]用桃、甜櫻桃和酸櫻桃的10 對SSR 引物繪制了59 份四倍體酸櫻桃種質(zhì)資源指紋圖譜;張琪靜等[23]利用SSR 分子技術(shù)對相關(guān)櫻桃品種進(jìn)行了遺傳多樣性分析,并開發(fā)了甜櫻桃的指紋檢索系統(tǒng);李苗苗[24]利用葉綠體微衛(wèi)星(chloroplast microsatellite,cpSSR)與簡單重復(fù)序列間擴(kuò)增(inter-simple sequence repeat,ISSR)分子標(biāo)記技術(shù)分別對我國櫻屬植物和中國櫻桃進(jìn)行了地理親緣關(guān)系以及遺傳結(jié)構(gòu)和多樣性的研究。本研究前期利用ISSR 分子標(biāo)記技術(shù)對39 個日本櫻花品種進(jìn)行了聚類分析,探討了彼此間的親緣關(guān)系,并將其分為7 組,與前人研究結(jié)果一致,表明ISSR比較適用于櫻花的品種分類[25]。本研究通過SSR 技術(shù)對16 種櫻屬植物進(jìn)行了聚類分析,探討了彼此間的親緣關(guān)系,結(jié)果表明絕大部分與形態(tài)分類相一致,說明SSR 分子標(biāo)記技術(shù)適合櫻屬種水平的親緣關(guān)系分析,但武夷紅櫻并未與原種鐘花櫻聚為一類,而與華中櫻聚為一類,因此,初步判定武夷紅櫻并不是由鐘花櫻單獨一個種進(jìn)化而來,可能還攜帶有其他近緣種的“血統(tǒng)”,如華中櫻。然而形態(tài)上武夷紅櫻與鐘花櫻更為接近,因此,武夷紅櫻的分類地位有待商榷。在相同材料下,引物越多、擴(kuò)增位點越豐富、多態(tài)性越高,得到的聚類結(jié)果越準(zhǔn)確。本研究僅采用12 對引物對16 份材料進(jìn)行了擴(kuò)增,且大部分標(biāo)記為EST-SSR 標(biāo)記,擴(kuò)增位點相對較少,多態(tài)性指數(shù)相對偏低,可能導(dǎo)致試驗存在較大誤差,不能充分反映物種間真實的親緣關(guān)系,或者得到明顯有悖于形態(tài)學(xué)分類的結(jié)果,因此,后續(xù)試驗還需加大引物數(shù)量,最好將EST-SSR 和gSSR 進(jìn)行混合搭配,可較為準(zhǔn)確地對櫻亞屬植物進(jìn)行鑒別與分類。
圖3 trnH-psbA、rpl32-trnL、petA-psbJ 和trnL-trnF 的序列對比圖Fig.3 Sequence comparison on trnH-psbA, rpl32-trnL, petA-psbJ and trnL-trnF
圖4 基于trnH-psbA+rpl32-trnL+ petA-psbJ+trnL-trnF 序列構(gòu)建的進(jìn)化樹Fig.4 Neighbor-joining tree based on trnH-psbA+rpl32-trnL+ petA-psbJ+trnL-trnF sequences
DNA 條形碼已逐漸應(yīng)用于新種或隱存種的發(fā)現(xiàn)、分類學(xué)修訂以及資源利用等方面[26]。目前,植物DNA 條形碼的研究主要集中于葉綠體基因組和核基因組,已在不同科、屬、種中廣泛應(yīng)用[27]。葉綠體基因組具有呈單親遺傳且進(jìn)化速率較快等特點,是篩選植物DNA 條形碼的重要區(qū)域之一。此外,通過比較雜交后代與親本的葉綠體基因序列的差異,可以確定雜交后代親本類型,如Ohta 等[28]通過rpl16-rpl14 序列標(biāo)記認(rèn)為大葉早櫻為日本櫻花的母本。本試驗通過4 個葉綠體基因序列(trnH-psbA+rpl32-trnL+petA-psbJ+trnLtrnF)對武夷紅櫻、鐘花櫻與華中櫻進(jìn)行對比發(fā)現(xiàn),武夷紅櫻與華中櫻的trnH-psbA和rpl32-trnL序列完全一致,而與鐘花櫻均有不同程度的差異;此外,武夷紅櫻與華中櫻的petA-psbJ和trnL-trnF序列差異也明顯小于與鐘花櫻之間的差異,尤其是trnL-trnF序列,武夷紅櫻與華中櫻僅有3 個位點差異,而與鐘花櫻卻有75(77)個位點差異,因此,推薦trnL-trnF序列作為鑒定武夷紅櫻與鐘花櫻的標(biāo)準(zhǔn)條形碼序列?;诮M合序列構(gòu)建的進(jìn)化樹表明,武夷紅櫻與華中櫻聚為一類,而與鐘花櫻相聚較遠(yuǎn),再結(jié)合SSR 和形態(tài)觀測結(jié)果,確定武夷紅櫻為華中櫻與鐘花櫻的自然雜交種,由于葉綠體基因呈母系遺傳,因此,確定華中櫻為母本,鐘花櫻為父本。
形態(tài)學(xué)分類有其固有缺陷,如比較依賴齊全的標(biāo)本等;單純依賴分子手段也容易出現(xiàn)明顯違背形態(tài)學(xué)分類的結(jié)果,主要是因為并非所有堿基的變化都會引起植物性狀的差異,因此,形態(tài)學(xué)結(jié)合分子手段才能較為準(zhǔn)確地對一個物種的分類地位進(jìn)行準(zhǔn)確劃分[29-31]。本研究利用SSR 分子標(biāo)記與DNA 條形碼技術(shù)等分子生物學(xué)和遺傳學(xué)知識并結(jié)合形態(tài)觀測的方法,確立了武夷紅櫻的親本,由于武夷紅櫻在基因水平上與華中櫻更為接近,但形態(tài)上卻與鐘花櫻更為相似,因此,建議將武夷紅櫻升級為介于鐘花櫻與華中櫻之間的一個獨立的種。
本研究通過SSR 分子標(biāo)記技術(shù)對16 個櫻屬種進(jìn)行聚類分析,發(fā)現(xiàn)武夷紅櫻與華中櫻親緣關(guān)系更近,而與鐘花櫻關(guān)系較遠(yuǎn),推測鐘花櫻和華中櫻可能與武夷紅櫻有父母本關(guān)系,或武夷紅櫻為華中櫻的變種。形態(tài)觀測表明武夷紅櫻與鐘花櫻形態(tài)上更為接近。最后通過4 個葉綠體基因序列(trnH-psbA、rpl32-trnL、petApsbJ和trnL-trnF)比對分析表明武夷紅櫻與華中櫻序列一致性較高,最終得出武夷紅櫻為鐘花櫻與華中櫻的自然雜交種,其父本為鐘花櫻,母本為華中櫻。