賈桂鋒,王自唱,向興發(fā),武 墩,高 云,黎 煊,馮耀澤※
(1. 華中農(nóng)業(yè)大學(xué)工學(xué)院,武漢 430070;2. 農(nóng)業(yè)部長(zhǎng)江中下游農(nóng)業(yè)裝備重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,武漢 430070)
生豬養(yǎng)殖是中國(guó)畜牧業(yè)的重要部分,國(guó)家統(tǒng)計(jì)局?jǐn)?shù)據(jù)顯示全國(guó)近5 a生豬年均存欄量約45 712萬(wàn)頭,出欄量約70 402萬(wàn)頭。其養(yǎng)殖模式正向大規(guī)模工廠化方向發(fā)展,但由于養(yǎng)殖福利水平和健康監(jiān)測(cè)技術(shù)等發(fā)展滯后,降低了其生產(chǎn)效率[1]。因此研究豬的健康監(jiān)測(cè)技術(shù)對(duì)提高養(yǎng)殖福利水平與疾病預(yù)防能力具有重要價(jià)值,如對(duì)豬的采食量[2-3]、體質(zhì)量[4]、異常行為[5-6]等生理指標(biāo)監(jiān)測(cè)可提高養(yǎng)殖福利,保障生豬生產(chǎn)安全和豬肉品質(zhì)[7-8]。心率是豬的重要生命體征,不僅直接反映其健康狀態(tài)[9-10],還與環(huán)境因素密切相關(guān)[11],對(duì)豬的心率監(jiān)測(cè)可進(jìn)行早期疾病篩查和改善生存環(huán)境。心率通常根據(jù)心電信號(hào)提取,心電信號(hào)是伴隨心房除極、心室除極和復(fù)極等周期性活動(dòng)而產(chǎn)生的,主要由P波、QRS復(fù)波和T波構(gòu)成。在豬的典型心電信號(hào)中,QRS波群的幅值特征最為突出,電壓約(75.48 ± 34.00) mV,持續(xù)時(shí)間達(dá)(55.27 ± 7.02) ms[12]。因其特征顯著而易于提取,故將相鄰QRS波之間的RR間期(RR interval, RRI)作為心動(dòng)周期,以反映心臟活動(dòng)的節(jié)律,且RRI的變化可表征心率的變異性[13]。
無(wú)論人或動(dòng)物,實(shí)時(shí)、準(zhǔn)確地監(jiān)測(cè)心率及其變異性等重要生理參數(shù)對(duì)快速評(píng)估健康狀況是非常必要的[14-16],但基于生豬心電信號(hào)的QRS波群實(shí)時(shí)處理算法研究鮮有報(bào)道。張宏等[17]基于BMD101心電傳感器及無(wú)線射頻模塊 CC2430研制出豬的心電測(cè)量裝置,并通過(guò)動(dòng)物試驗(yàn)說(shuō)明該設(shè)計(jì)方案能夠正確采集心電信號(hào)并計(jì)算心率。余明等[18]結(jié)合經(jīng)驗(yàn)?zāi)B(tài)分解和獨(dú)立成分分析算法對(duì)豬的心電進(jìn)行抑制偽跡研究,可顯著提高心肺復(fù)蘇過(guò)程中除顫節(jié)律辨識(shí)的準(zhǔn)確性,相關(guān)研究未提及心電信號(hào)處理的實(shí)時(shí)性。此外,由于豬的依從性差,心電檢測(cè)過(guò)程中的隨機(jī)活動(dòng)導(dǎo)致電極接觸不穩(wěn),同時(shí)產(chǎn)生大量的肌電信號(hào),造成心電信號(hào)的基線起伏較大,含有大量噪聲,部分研究在麻醉的狀態(tài)下進(jìn)行采集[18-19]。因此,豬在正?;顒?dòng)時(shí)采集的心電信號(hào)是一種非平穩(wěn)信號(hào),給QRS波群實(shí)時(shí)處理造成困難。針對(duì)生豬心電處理的實(shí)時(shí)性問(wèn)題,本文根據(jù)其心電信號(hào)的特征提出一種 QRS波群識(shí)別的實(shí)時(shí)處理算法。
經(jīng)驗(yàn)?zāi)B(tài)分解算法(empirical mode decomposition,EMD)是一種非線性、非平穩(wěn)信號(hào)分解算法,具有自適應(yīng)性、完備性等特點(diǎn)[20],自提出以來(lái)已應(yīng)用于多種領(lǐng)域研究,如機(jī)械故障診斷、人的心電信號(hào)處理等[21-22]。心電信號(hào)處理主要是QRS波識(shí)別應(yīng)用中研究較多,研究結(jié)果表明EMD算法對(duì)QRS波群具有較高識(shí)別正確率[23-26]。然而EMD算法是一種非實(shí)時(shí)的信號(hào)處理方法,難以滿足實(shí)時(shí)處理信號(hào)的需求[27]。
為實(shí)現(xiàn)對(duì)QRS波群的實(shí)時(shí)檢測(cè),本文在EMD算法基礎(chǔ)上提出一種短時(shí)經(jīng)驗(yàn)?zāi)B(tài)分解處理方法。其思路是對(duì)心電信號(hào)進(jìn)行實(shí)時(shí)分段,然后對(duì)每段數(shù)據(jù)進(jìn)行EMD分解,再根據(jù)分解得到的本征模函數(shù)(intrinsic mode function,IMF)提取QRS波群的特征參數(shù),以準(zhǔn)確地識(shí)別R波的位置,繼而提取RR間期,計(jì)算心率數(shù)據(jù)。最后通過(guò)動(dòng)物試驗(yàn)驗(yàn)證ST-EMD算法的實(shí)時(shí)性和有效性。
EMD算法是希爾伯特-黃變換(hilbert-huang transform,HT)的核心部分,目的是將復(fù)雜信號(hào) x(t)分解成不同特征尺度的 IMF,滿足停止條件時(shí)即停止分解,剩余信號(hào)稱為殘余分量r(t),x(t)、imfk(t)和r(t)之間的關(guān)系如式(1)所示。
IMF函數(shù)需要滿足2個(gè)條件,即極值與過(guò)0點(diǎn)的個(gè)數(shù)相等或最多相差為 1個(gè),且在任意一點(diǎn)由信號(hào)極大值和極小值構(gòu)成包絡(luò)線的均值為0。因此IMF是一個(gè)窄帶信號(hào),具有相應(yīng)的物理意義。由此可見(jiàn),EMD算法實(shí)質(zhì)是一種篩選方法,從復(fù)雜信號(hào)x(t)中篩選出一系列具有一定物理意義的窄帶信號(hào)IMF,其分解過(guò)程可參考文獻(xiàn)[20],在此不再贅述。
由于EMD算法不具有實(shí)時(shí)性,針對(duì)此問(wèn)題,通過(guò)對(duì)數(shù)據(jù)分段提出 ST-EMD算法,使其能準(zhǔn)確、實(shí)時(shí)處識(shí)別QRS波群。ST-EMD算法主要步驟有數(shù)據(jù)分段、EMD分解、QRS波特征提取和識(shí)別等部分。
1.2.1 對(duì)心電信號(hào)進(jìn)行分段
在數(shù)學(xué)上表達(dá)為信號(hào)x(t)與寬度為N矩形窗相乘,如公式(2)所示。
窗寬N即為數(shù)據(jù)段的長(zhǎng)度,其決定了信號(hào)處理的實(shí)時(shí)性,當(dāng)采樣頻率 Ts一定時(shí),信號(hào)處理結(jié)果輸出時(shí)刻相對(duì)數(shù)據(jù)采集時(shí)刻的延遲時(shí)間td可由式(3)表示。其中,tEMD表示長(zhǎng)度為N的數(shù)據(jù)段進(jìn)行EMD分解所需的時(shí)間。
可見(jiàn),數(shù)據(jù)段長(zhǎng)度N越短,實(shí)時(shí)性越強(qiáng),但在EMD分解信號(hào)時(shí)會(huì)產(chǎn)生端點(diǎn)效應(yīng),即在信號(hào)的兩端會(huì)產(chǎn)生發(fā)散,逐漸向內(nèi)“污染”整個(gè)數(shù)據(jù)樣本,使得分解結(jié)果嚴(yán)重失真[20,28]。因此數(shù)據(jù)段越短,受端點(diǎn)效應(yīng)的影響越嚴(yán)重。為緩解端點(diǎn)效應(yīng)同時(shí)又保證實(shí)時(shí)性,在數(shù)據(jù)分段時(shí)可與上一段的部分?jǐn)?shù)據(jù)重疊。
另外,數(shù)據(jù)段分段時(shí)需要避免截?cái)郠RS復(fù)波,否則破壞其在IMF中表現(xiàn)出的特征,降低識(shí)別正確率,導(dǎo)致QRS波漏檢。因此需要數(shù)據(jù)段的起點(diǎn)和終點(diǎn)均要選擇恰當(dāng),避免截?cái)郠RS復(fù)波。
經(jīng)上述分析,ST-EMD的分段方法如圖1所示。首先搜索當(dāng)前數(shù)據(jù)段Xi最新QRS復(fù)波的位置QRS(k),在此基礎(chǔ)上再向前取α倍的RRI對(duì)應(yīng)的數(shù)據(jù)點(diǎn)作為下一個(gè)數(shù)據(jù)段 Xi+1的起點(diǎn)。同樣地,以 Xi的最新 QRS復(fù)波位置QRS(k)為基礎(chǔ)向后取1+β倍的RRI對(duì)應(yīng)的數(shù)據(jù)點(diǎn)為Xi+1的終點(diǎn)。α、β可取0.5,即數(shù)據(jù)段的起點(diǎn)和終點(diǎn)均位于心電信號(hào)R波之間的中心點(diǎn)。這樣既保證Xi+1與Xi有一定的重疊,減緩端點(diǎn)效應(yīng),又避免兩端點(diǎn)截?cái)郠RS波群。同時(shí)也保證下一個(gè)數(shù)據(jù)段 Xi+1中至少包含一個(gè) QRS波群,有利于提高算法的穩(wěn)定性。一般RRI具有變異性,所以數(shù)據(jù)段的長(zhǎng)度也隨之做自適應(yīng)地調(diào)整。
1.2.2 對(duì)分段數(shù)據(jù)進(jìn)行EMD分解
根據(jù) EMD算法對(duì)分段數(shù)據(jù)進(jìn)行分解,得到一系列IMF。為了減少EMD計(jì)算時(shí)間,提高實(shí)時(shí)性,在篩選IMF過(guò)程中降低迭代次數(shù),且當(dāng)選擇出具有QRS波群特征的IMF時(shí)立即停止分解。
圖1 心電數(shù)據(jù)分段方法Fig.1 Segmenting method of electrocardiogram signal
1.2.3 基于IMF函數(shù)提取QRS波群特征
正確識(shí)別QRS波群需要基于IMF提取其特征參數(shù),因此需要分析QRS波與IMF函數(shù)的內(nèi)在聯(lián)系,確定其特征表現(xiàn)在哪些IMF中及其提取方法。對(duì)一段豬的心電信號(hào)經(jīng)EMD分解后得到的IMF如圖2所示。分析可見(jiàn),第一IMF分量的能量隨著時(shí)間的變化趨勢(shì)與QRS波群呈一一對(duì)應(yīng)關(guān)系,而第二IMF中這種對(duì)應(yīng)關(guān)系顯著減弱,其余的IMF則未反映出明顯的特征。所以,QRS波群的特征應(yīng)從第一IMF分量中提取。
由于第一IMF能量分布與QRS波有顯著對(duì)應(yīng)關(guān)系,因此適合采用能量窗變換法提取其特征參數(shù)[29],該方法計(jì)算流程如下。
1)計(jì)算第一IMF的差分信號(hào),記為D;
2)對(duì)D平方運(yùn)算即得瞬時(shí)功率P;
3)在一定寬度的時(shí)間窗內(nèi)對(duì) P積分,窗寬的選擇較為關(guān)鍵,與豬的 QRS波寬度相關(guān)[30]。經(jīng)分析心電信號(hào)得其平均持續(xù)時(shí)間為0.033 s,則窗口的寬度為該時(shí)間段內(nèi)的采樣點(diǎn)數(shù),約 17個(gè)數(shù)據(jù)點(diǎn),積分后得到能量信號(hào)E。
4)計(jì)算能量的均值作為閾值,當(dāng)E中有數(shù)據(jù)大于閾值時(shí),即此數(shù)據(jù)段內(nèi)存在QRS波群,再根據(jù)R波極大值的特征可準(zhǔn)確確定其位置。
圖2 基于EMD算法的豬心電信號(hào)分解Fig.2 Results of pig’s electrocardiogram processing by EMD
根據(jù)提出的 ST-EMD算法在計(jì)算機(jī)上編程實(shí)現(xiàn),算法流程圖如圖 3所示。主要有算法初始化、數(shù)據(jù)分段參數(shù)確定、信號(hào)采集、EMD分解、特征提取和QRS波檢驗(yàn)等步驟。
圖3 ST-EMD算法的實(shí)現(xiàn)流程Fig.3 Flow of ST-EMD for algorithm implementing
試驗(yàn)動(dòng)物為同一窩出生的3頭仔豬,豬齡為50 d,平均體重18.2 kg。試驗(yàn)時(shí)間為2017年8月22日,地點(diǎn)在安徽省臨泉縣老集鎮(zhèn)徐莊村生豬養(yǎng)殖戶。心電信號(hào)由基于BMD101傳感器設(shè)計(jì)的穿戴式無(wú)線采集系統(tǒng)實(shí)時(shí)采集[17],電極放置在豬的前腹兩側(cè),采樣頻率為512 Hz。采集后的心電數(shù)據(jù)經(jīng)藍(lán)牙通信傳輸至計(jì)算機(jī),由ST-EMD算法處理。每頭豬的采集時(shí)間為120 s,共采集184 320點(diǎn)數(shù)據(jù),其中一頭豬的前35 s心電信號(hào)及其處理結(jié)果如圖4所示,算法將識(shí)別出的QRS波用黑點(diǎn)標(biāo)記。
圖4 ST-EMD算法對(duì)豬的QRS波識(shí)別結(jié)果Fig.4 Result of pig’s QRS identified by ST-EMD algorithm
由圖4可知ST-EMD算法能夠準(zhǔn)確識(shí)別心電信號(hào)中的QRS波,同時(shí)可看出心電波形存在隨機(jī)性的基線漂移,特別在第5~10和25~33 s時(shí)間段內(nèi)由于豬的活動(dòng)導(dǎo)致的電極接觸不穩(wěn)或肌電干擾等因素造成基線漂移和干擾,證實(shí)豬在正常活動(dòng)狀態(tài)下檢測(cè)的心電是一種非平穩(wěn)信號(hào)。ST-EMD算法在受干擾的情況下仍能正確識(shí)別出信號(hào)中QRS波,說(shuō)明該算法具有較好的適應(yīng)性和抗干擾能力,但當(dāng)基線漂移過(guò)于急劇時(shí)會(huì)超出算法的抗干擾能力而可能導(dǎo)致QRS波識(shí)別錯(cuò)誤。
3個(gè)樣本信號(hào)的QRS波群識(shí)別結(jié)果和與實(shí)時(shí)性相關(guān)的延遲時(shí)間參數(shù)見(jiàn)表1。由處理結(jié)果可知算法對(duì)信號(hào)的平均分段長(zhǎng)度為0.69 s(不包括數(shù)據(jù)重疊部分),數(shù)據(jù)段的平均處理時(shí)間為0.03 s,即平均總滯后時(shí)間為0.72 s。說(shuō)明對(duì)于豬的心電信號(hào),ST-EMD算法在數(shù)據(jù)采集后0.72 s即可識(shí)別出QRS復(fù)波,輸出實(shí)時(shí)心率數(shù)據(jù)。在滯后的這段時(shí)間內(nèi),95.8%的時(shí)間用于等待數(shù)據(jù)采集,而信號(hào)處理只占用4.2%的時(shí)間,即算法計(jì)算時(shí)間對(duì)信號(hào)處理的實(shí)時(shí)性影響不大,ST-EMD的實(shí)時(shí)性還是得益于對(duì)數(shù)據(jù)的分段。
將ST-EMD算法識(shí)別的QRS波與實(shí)際QRS波(由人工識(shí)別和標(biāo)記)數(shù)據(jù)對(duì)比,3個(gè)樣本信號(hào)的識(shí)別正確率分別為100%,98.9%和100%,平均正確率為99.6%,即該方法對(duì)QRS波群具有較強(qiáng)的辨識(shí)能力。
雖然 ST-EMD算法具有一定的自適應(yīng)性和抗干擾能力,但當(dāng)受環(huán)境顯著影響或豬的突然劇烈運(yùn)動(dòng)時(shí),會(huì)造成心電信號(hào)的基線突變、信噪比降低,繼而增加 QRS波群識(shí)別錯(cuò)誤率。為確保算法正確提取心率,在算法校驗(yàn)階段采用滑動(dòng)中值濾波器以剔除因算法識(shí)別錯(cuò)誤而產(chǎn)生的異常值[31-32]。經(jīng)7點(diǎn)滑動(dòng)中值濾波后,3個(gè)樣本信號(hào)實(shí)時(shí)心率的均值分別為(137.47±6.47)、(133.01±9.80)和(128.00±6.51) bmp,均處在正常范圍82~172 bmp之內(nèi)[12]。
由上述試驗(yàn)結(jié)果可知,ST-EMD算法不僅具備實(shí)時(shí)處理能力,且對(duì)QRS波群的識(shí)別正確率較高。為確保實(shí)時(shí)心率正確提取,采用滑動(dòng)中值濾波算法進(jìn)一步剔除錯(cuò)誤心率值。因此,該算法的設(shè)計(jì)是合理有效的,適用于生豬心電信號(hào)實(shí)時(shí)處理。
表1 ST-EMD算法對(duì)豬的QRS波識(shí)別的正確率和延遲時(shí)間Table 1 Accuracy and delay time of pig’s QRS identified by ST-EMD algorithm
豬在健康監(jiān)測(cè)中由于依從性差而造成心電信號(hào)呈現(xiàn)非平穩(wěn)特征,給實(shí)時(shí)心率計(jì)算帶來(lái)困難。本文針對(duì)生豬心電的實(shí)時(shí)處理需求,并根據(jù)信號(hào)的非平穩(wěn)特征提出一種具有實(shí)時(shí)處理能力的 ST-EMD算法,通過(guò)動(dòng)物試驗(yàn)表明該算法具有如下特性。
1)ST-EMD算法能夠正確處理非平穩(wěn)特性的心電信號(hào)并準(zhǔn)確識(shí)別QRS波,3個(gè)樣本信號(hào)中QRS波的正確識(shí)別率分別為100%,98.9%和100%,平均正確率為99.6%,從心電信號(hào)采集到識(shí)別出QRS波的平均時(shí)間為0.72 s。說(shuō)明本文提出的 ST-EMD算法思路是正確的,且具備實(shí)時(shí)處理能力。
2)該算法通過(guò)對(duì)數(shù)據(jù)分段并根據(jù)信號(hào)特征自主決定分段的起點(diǎn)及數(shù)據(jù)段長(zhǎng)度,且QRS波的判別閾值由第一IMF的能量均值決定,因此ST-EMD是一種是非監(jiān)督的、不依賴先驗(yàn)知識(shí)的算法,即該算法不僅具備實(shí)時(shí)性,還具有較好的自適應(yīng)性。
3)由于ST-EMD對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行分段,可使得受干擾的數(shù)據(jù)段與未受干擾的數(shù)據(jù)段隔離開(kāi)來(lái),減小噪聲干擾對(duì)信號(hào)的影響范圍,從而使得算法具有一定的抗干擾能力。此外,對(duì)計(jì)算的實(shí)時(shí)心率進(jìn)行滑動(dòng)中值濾波,可消除因心電基線漂移或噪聲等因素而導(dǎo)致的異常值,以確保提取正確的心率信息。
綜上所述,ST-EMD算法適用于豬的心電實(shí)時(shí)健康監(jiān)護(hù),具有一定的應(yīng)用價(jià)值。因具有實(shí)時(shí)處理能力,也可推廣到其他應(yīng)用領(lǐng)域,如對(duì)實(shí)時(shí)性要求較高的自動(dòng)控制系統(tǒng),通過(guò)對(duì)系統(tǒng)輸出信號(hào)的特征識(shí)別,再反饋給系統(tǒng)進(jìn)行下一步控制,以滿足控制的實(shí)時(shí)性。文中提出的ST-EMD算法是以心電QRS識(shí)別為應(yīng)用背景的,若對(duì)其他類型的信號(hào)處理需要重新分析信號(hào)特征,進(jìn)一步研究與應(yīng)用背景相吻合的分段和特征提取方法后才能應(yīng)用于其他領(lǐng)域。
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