趙 紅 曹亞從 張正海 張寶璽 白銳琴 趙園園 王立浩
(中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜花卉研究所,農(nóng)業(yè)部園藝作物生物學(xué)與種質(zhì)創(chuàng)新重點實驗室,北京 100081)
辣椒(Capsicumspp.)屬于茄科辣椒屬一年生或多年生植物(王立浩 等,2012),是一種世界性的重要蔬菜和調(diào)味品,果實含有豐富的VC,還是提煉辣椒素和辣椒紅素的原料,具有重要的經(jīng)濟價值(Reilly et al.,2001;Khan et al.,2014)。辣椒在我國的年栽培面積約150萬hm2,約占我國蔬菜種植面積的10%,對我國蔬菜市場的周年供應(yīng)具有重要意義(王立浩 等,2016)。
辣椒起源于美洲的熱帶和亞熱帶地區(qū)(Davenport,2004;Mongkolporn & Taylor,2011),研究認為至少存在4個主要起源中心:① 美國和墨西哥南部至南美西部;② 巴西和委內(nèi)瑞拉海岸東北部;③ 巴西東海岸;④ 玻利維亞和巴拉圭中部至阿根廷北部和中部。辣椒屬目前已經(jīng)鑒定的種共有35個(Carvalho et al.,2014);1983年國際植物遺傳資源委員會將辣椒栽培種劃分為5個,分別是一年生辣椒(Capsicum annuumL.)、灌木狀辣椒(Capsicum frutescensL.)、中國辣椒(Capsicum chinenseJacq)、 柔 毛 辣 椒(Capsicum pubesensRuiz & Pavon)和下垂辣椒(Capsicum baccatum var.PendulumL.)(IBPGR,1983)。其中一年生辣椒是世界上栽培最廣泛、經(jīng)濟價值最高,同時也是育種工作中應(yīng)用最多的栽培種(Rivera et al.,2016)。據(jù)報道這5個辣椒栽培種的馴化是獨立的(Andrews,1995),至少存在3個不同的馴化中心(Paran et al.,2007;Pickersgill,2007)。
近年來,國內(nèi)外學(xué)者在辣椒種質(zhì)表型性狀評價與相關(guān)性分析方面已開展了一些工作,為辣椒種質(zhì)資源遺傳多樣性相關(guān)研究奠定了基礎(chǔ)(Geleta et al.,2005;Bozokalfa et al.,2009;Thul et al.,2009;蔣向輝 等,2010;許先松 等,2011)。植物的農(nóng)藝性狀指標可以表征種質(zhì)的特點和相關(guān)性狀,根據(jù)表型差異來反映基因型差異具有重要的意義(李斌 等,2002;李梅 等,2005;詹永發(fā) 等,2010;Naegele et al.,2016),因此對種質(zhì)農(nóng)藝性狀的分析是研究遺傳多樣性的基礎(chǔ)(Lefebvre et al.,2001)。
中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜花卉研究所辣椒課題組前期在對我國1 907份辣椒資源分子標記分析的基礎(chǔ)上,建立了我國辣椒核心種質(zhì)資源(待發(fā)表)。本試驗通過對331份我國辣椒核心種質(zhì)資源的43個農(nóng)藝性狀進行多樣性評價以及聚類分析,旨在了解辣椒核心種質(zhì)資源的遺傳多樣性分布以及親緣關(guān)系,為辣椒種質(zhì)資源的分子評價、基因深度挖掘及遺傳改良提供理論參考。
表1 辣椒種質(zhì)資源質(zhì)量性狀的描述分組
試驗所用辣椒材料來源于顧曉振等構(gòu)建的我國辣椒核心種質(zhì)(待發(fā)表)中根據(jù)表型調(diào)查確定的249份辣椒材料,根據(jù)分子標記分析,代表了我國總體種質(zhì)資源遺傳多樣性的75.6%,加上辣椒課題組從國內(nèi)引進和選育的自交系材料57份以及國外引進材料25份,共331份(表4)。各材料于2016年春定植在中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院廊坊試驗基地的日光溫室中,雙行定植,每份材料定植8株。
1.2.1 農(nóng)藝性狀調(diào)查 參照《辣椒種質(zhì)資源描述規(guī)范和數(shù)據(jù)標準》(李錫香和張寶璽,2006)進行田間性狀調(diào)查,調(diào)查的農(nóng)藝性狀分為質(zhì)量性狀和數(shù)量性狀。其中質(zhì)量性狀包括:株型、分枝性、主莖色、莖茸毛、葉形、葉色、葉緣、葉面茸毛、葉面特征、花冠色、花藥顏色、花柱顏色、花梗著生狀態(tài)、花柱長度、青熟果色、老熟果色、果面棱溝、果面特征、果肩形狀、果頂形狀、果臍附屬物、果基部宿存花萼、果形、熟性,共24個性狀;數(shù)量性狀包括:株高、開展度、葉片長、葉片寬、葉柄長、側(cè)枝數(shù)、最長側(cè)枝長度、花期、首花節(jié)位、商品果縱徑、商品果橫徑、果梗長度、果肉厚、單果質(zhì)量、單株果數(shù)、單株產(chǎn)量、單果種子數(shù)、種子千粒重、干物質(zhì)含量,共19個性狀。
1.2.2 試驗數(shù)據(jù)分析 利用SPSS 17.0軟件(Kang &Kim,2009)計算質(zhì)量性狀的頻率分布和變異系數(shù),數(shù)量性狀的極大值、極小值、變異幅度、均值、標準差和變異系數(shù)。各個性狀的Shannon信息指數(shù)(Shannon & Weaver,1949)由Bio-dap軟件計算得到,其中質(zhì)量性狀的分級標準(表1)參照《辣椒種質(zhì)資源描述規(guī)范和數(shù)據(jù)標準》和實際調(diào)查情況進行;數(shù)量性狀的分級標準根據(jù)各性狀數(shù)據(jù)的平均數(shù)(M)和標準差(S)將數(shù)據(jù)分為10級,從第1級Xi<(M-2S)到第10級Xi≥(M+2S),每0.5S為1級,每一組的相對頻率用于計算多樣性指數(shù)(趙香娜 等,2008)。基于43個植物學(xué)性狀的聚類分析采用GGT軟件計算遺傳距離,采用UPGMA(unweighted pair-group method with arithmetic means)的方法在MEGA軟件(Tamura et al.,2007)中構(gòu)建系統(tǒng)進化樹。
表2 331份辣椒種質(zhì)資源質(zhì)量性狀的分布頻率與變異系數(shù)
2.1.1 辣椒種質(zhì)資源質(zhì)量性狀多樣性 331份辣椒種質(zhì)資源質(zhì)量性狀的分布頻率和變異情況詳見表2。辣椒質(zhì)量性狀的變異系數(shù)在13.29%~56.42%之間,Shannon信息指數(shù)在0.17~2.41之間。果形的Shannon信息指數(shù)最高,為2.41,其變異系數(shù)也較高,為47.08%,說明其性狀表現(xiàn)形式十分豐富,共有13種,其中長羊角和短羊角的果形所占比例最大,分別為16.9%和14.8%。其次是果肩形狀和熟性,Shannon信息指數(shù)均為1.27。但是果肩形狀的變異系數(shù)更大,為50.93%,其中無果肩的頻率分布最高,為41.9%。果實熟性主要以早熟和中熟為主,頻率分別為47.0%和29.2%。主莖色的Shannon信息指數(shù)只有0.17,變異系數(shù)也較低,為18.75%;其性狀表現(xiàn)主要是綠色,為96.1%。老熟果色以紅色為主,所占頻率為93.7%,其Shannon信息指數(shù)和變異系數(shù)也很低,分別為0.25和17.11%。株型以半直立為主,所占頻率為57.4%。分枝性以中等為主,所占頻率為79.0%。莖茸毛的Shannon信息指數(shù)也較高,為1.33,其表現(xiàn)形式以無茸毛和茸毛稀為主,所占頻率分別是34.9%和27.4%。葉形以長卵圓為主,所占頻率為75.8%。葉色以綠色為主,所占頻率為75.9%。葉緣以全緣為主,所占頻率為81.6%。葉茸毛表現(xiàn)形式以無茸毛和茸毛稀為主,所占頻率分別為39.2%和31.6%。葉面特征以平滑為主,所占頻率為73.2%?;ü谏园咨珵橹?,所占頻率為91.6%?;ㄋ庮伾宰仙珵橹?,所占頻率為72.6%?;ㄖ伾园咨珵橹鳎碱l率為82.5%?;üV鸂顟B(tài)的分布比較平均,下垂、側(cè)生和直立的分布頻率分別是33.1%、31.9%和33.7%。青熟果色的性狀表現(xiàn)也比較豐富,主要以綠色為主,所占頻率為67.8%。果面棱溝以無棱溝為主,所占頻率為56.0%。果面特征以微皺為主,所占頻率為62.3%。果頂形狀以細尖和鈍圓為主,所占頻率分別為45.2%和35.5%。果臍附屬物絕大部分沒有,所占頻率為88.0%。果基部宿存花萼以平展和下包為主,所占頻率分別為43.1%和41.3%。
2.1.2 辣椒種質(zhì)資源數(shù)量性狀多樣性 從表3可以看出,331份辣椒種質(zhì)資源數(shù)量性狀的變異系數(shù)范圍為16.92%~140.18%,Shannon信息指數(shù)為1.48~2.08。Shannon信息指數(shù)最大的3個性狀依次是:株高、開展度以及葉柄長,但它們的變異系數(shù)都較小。同時,變異系數(shù)最大的兩個性狀單果質(zhì)量和最長側(cè)枝長度的Shannon信息指數(shù)卻是最小的,只有1.48。商品果橫徑、果肉厚、單果種子數(shù)、單株果數(shù)以及單株產(chǎn)量的變異系數(shù)均超過了50%,Shannon信息指數(shù)也較高,在1.69~2.01之間。這說明辣椒資源果實的性狀表現(xiàn)變異十分豐富。
辣椒種質(zhì)資源數(shù)量性狀的分布情況如圖1所示,其符合正態(tài)分布的性狀有:開展度、葉片長、果梗長度、單果種子數(shù)、果肉厚、單果質(zhì)量以及干物質(zhì)含量。
表3 辣椒種質(zhì)資源數(shù)量性狀的描述及變異系數(shù)
圖1 331份辣椒種質(zhì)資源數(shù)量性狀的分布檢驗
基于43個農(nóng)藝性狀對331份辣椒種質(zhì)資源進行聚類(圖2),在遺傳距離為0.35時被分為兩大類(表4)。
圖2 331份辣椒種質(zhì)資源的聚類分析
表4 331份辣椒種質(zhì)資源的信息及分類
續(xù)表
群體Ⅰ共有40份材料,其中種間材料27份,一年生辣椒13份。其植物學(xué)性狀表現(xiàn)豐富,比如花冠色有白色、紫色、淺綠色以及白色帶綠色斑點;青熟果色有綠色、紫色等;果形小,果肉薄,果實成熟期一般極晚;辣椒素含量很高。根據(jù)各個材料不同性狀表現(xiàn)可以把群體Ⅰ細分為8個群體。群體Ⅰ-1包含1份材料,是海南黃燈籠椒,屬于中國辣椒(C. chinenseJacq)。其特點是老熟果色為黃色,果面皺縮,辣椒素含量高。群體Ⅰ-2含有2份材料,均是絨毛辣椒(C. pubesensRuiz & Pavon)。莖和葉面茸毛茂密,花冠顏色、花藥顏色以及花柱顏色均為紫色,花柱短于雄蕊,單節(jié)葉腋著生1~2朵花,花梗直立生長,果實成熟期極晚,并且種子種皮色為黑色。群體 Ⅰ-3含有9份材料,其中5份屬于中國辣椒(C. chinenseJacq),其余4份屬于下垂辣椒(C.baccatumvar.pendulumL.)?;ü陬伾鳟?,有白色、淺綠色以及白色帶褐色斑點;花梗直立生長;果形小,果肉??;青熟果色為黃綠色或淺綠色,老熟果色為黃、橘紅以及紅色;果實成熟期極晚;辣味極重。群體 Ⅰ-4包含3份材料,均為一年生辣椒(C.annuumL.),成熟期早,單株果數(shù)多,果形為長羊角形,果大,單果種子數(shù)多,有辣味。群體 Ⅰ-5只有1份材料,是引自韓國的紫葉小辣椒。植株高大,主莖色為綠色帶紫色條紋;花冠顏色、花藥顏色以及花柱顏色均為紫色;單果質(zhì)量小,青熟果為紫色;辣味輕。群體 Ⅰ-6包含2份材料,均來自遼寧省。花冠顏色為白色,花藥顏色為藍色;果肉薄、果實大、單產(chǎn)高,果實成熟期適中。群體 Ⅰ-7包含4份材料,均為一年生辣椒(C. annuumL.)。分枝性弱,果基部宿存萼片平展。群體 Ⅰ-8包含18份材料,其中11份為灌木狀辣椒(C. frutescensL.),占61.1%。植株高大,分枝性中弱,葉片顏色為淺綠色;花冠色多為淺綠色,花藥為紫色,單節(jié)葉腋著生1~3朵花;果實成熟期極晚,果形多為短羊角形,果肉薄,果基部宿存萼片形態(tài)為下包,辣味重。
續(xù)表
群體Ⅱ共有291份材料,絕大多數(shù)為一年生辣椒(C. annuumL.),3份中國辣椒(C.chinenseJacq)和1份下垂辣椒(C. baccatumvar. pendulumL.),其植物學(xué)性狀主要表現(xiàn)為中度分枝性,主莖色為綠色,花冠顏色為白色,花藥顏色多數(shù)為紫色;花梗著生狀態(tài)有下垂、直立和側(cè)生;青熟果顏色各異,有黃白、黃綠、淺綠、綠、深綠、紫色;果實熟性多為早熟和中熟。根據(jù)各個材料的不同植物學(xué)性狀表現(xiàn)又可以將群體Ⅱ分為兩個群體。群體Ⅱ-1包含127份材料。果形多樣,其中燈籠椒占49.5%,羊角椒占22.1%;果形較大,單果質(zhì)量大,單產(chǎn)高;果基部宿存萼片形態(tài)多為平展;絕大多數(shù)果實無辣味。群體 Ⅱ-2包含164份材料。植株較高,葉形多為長卵圓形(81.8%);果形多為羊角形和指形,所占比例為90.5%;果臍多細尖,無果肩,果肉薄,單果質(zhì)量輕;果基部宿存萼片形態(tài)多為下包;果實熟性多為早熟,并且95.2%的果實有辣味。
辣椒種質(zhì)資源質(zhì)量性狀的Shannon信息指數(shù)較大的依次為果形、莖茸毛、果肩形狀、熟性,其變異系數(shù)也較大。其中果形、果肩形狀以及熟性都與果實有關(guān),說明果實的變異十分豐富。Shannon信息指數(shù)較低的有主莖色、老熟果色和果臍附屬物,其變異系數(shù)也較小,說明它們的遺傳較穩(wěn)定。花柱顏色的變異系數(shù)是最大的,但是其Shannon信息指數(shù)卻很小,說明Shannon信息指數(shù)和變異系數(shù)并不是呈正相關(guān)的。數(shù)量性狀Shannon信息指數(shù)最大的3個性狀依次是:株高、開展度以及葉柄長;商品果橫徑、果肉厚、單果種子數(shù)、單株果數(shù)以及單株產(chǎn)量的變異系數(shù)均超過了50%。與質(zhì)量性狀的變異相比,數(shù)量性狀的變異較大,遺傳資源較豐富;而質(zhì)量性狀的遺傳較穩(wěn)定,這與詹永發(fā)等(2008)、李寧等(2015)對辣椒資源多樣性的研究結(jié)果一致。但本試驗中株高、商品果橫徑、單果種子數(shù)以及種子千粒重的多樣性高于詹永發(fā)等(2008)的研究結(jié)果;在果形、花梗著生狀態(tài)、首花節(jié)位等11個性狀的多樣性高于李寧等(2015)的研究結(jié)果。本試驗結(jié)果表明,我國辣椒核心種質(zhì)資源植物學(xué)性狀表現(xiàn)豐富,涵蓋變異類型廣,具有很高的育種價值。
辣椒一年生栽培種的性狀表現(xiàn)相對單一,遺傳背景較為狹窄,多樣性指數(shù)低;而其余4個栽培種以及野生種材料的植物學(xué)性狀表現(xiàn)十分豐富,遺傳多樣性較高,比如花冠色涵蓋白、淺綠、紫色以及白色帶褐色斑點。依據(jù)辣椒植物學(xué)性狀的聚類分析結(jié)果基本可以將試驗材料按照材料來源以及所屬種區(qū)分為兩大群體,各群體間性狀表現(xiàn)差異明顯,群體Ⅰ的遺傳多樣性遠遠高于群體Ⅱ,其中群體Ⅰ大部分為除一年生栽培種之外的其他辣椒種,群體Ⅱ中絕大多數(shù)為一年生栽培種。這與夏碧波等(2017)對30份國外引進辣椒資源的形態(tài)學(xué)聚類分析結(jié)果一致。從聚類分析結(jié)果可以看出,一年生辣椒、中國辣椒以及灌木狀辣椒三者間的親緣關(guān)系更為相近,這一結(jié)論覃成等(2015)也曾提到過。聚類結(jié)果并沒有完全將同一種的材料聚類到一起,比如265號和267號(C. chinenseJacq)和一年生辣椒歸為一類,原因可能是在系統(tǒng)聚類時沒有將植物學(xué)性狀表現(xiàn)的主次區(qū)分或者由于栽培環(huán)境的影響使其性狀發(fā)生改變,以及某些材料部分性狀數(shù)據(jù)的缺失等等。
種質(zhì)資源的遺傳多樣性是育種工作的基礎(chǔ),而對種質(zhì)資源遺傳多樣性的研究可以挖掘出優(yōu)異資源,從而為育種者提供重要信息。本試驗采用表型調(diào)查的方法,具有簡單、方便、直觀的特點,但是在深度挖掘種質(zhì)的優(yōu)異基因方面有所欠缺,因此在后續(xù)的工作中有必要將農(nóng)藝性狀調(diào)查與分子標記結(jié)合起來,更加精準地把握辣椒種質(zhì)資源中的優(yōu)異性狀,進一步為育種工作提供有力信息。
蔣向輝,佘朝文,許棟,張青樺,趙旺.2010.應(yīng)用形態(tài)學(xué)與RAPD標記對朝天椒遺傳多樣性的分析.西南農(nóng)業(yè)學(xué)報,23(3):810-813.
李斌,顧萬春,盧寶明.2002.白皮松天然群體種實性狀表型多樣性研究.生物多樣性,10(2):181-188.
李梅,韓海榮,康峰峰.2005.遼東櫟天然群體表型多樣性研究.北京林業(yè)大學(xué)學(xué)報,27(5):10-16.
李寧,王飛,姚明華,焦春海,尹延旭.2015.國內(nèi)外辣椒種質(zhì)資源表型性狀多樣性及相關(guān)性分析.辣椒雜志,(1):8-13.
李錫香,張寶璽.2006.辣椒種質(zhì)資源描述規(guī)范和數(shù)據(jù)標準.北京:中國農(nóng)業(yè)出版社:66-75.
覃成,程蛟文,吳智明,羅希榕,胡開林.2015.辣椒基因組學(xué)的研究進展.農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報,23(7):953-966.
王立浩,毛勝利,張正海,張寶璽.2012.辣椒分子遺傳育種研究進展.辣椒雜志,(1):1-9.
王立浩,張正海,曹亞從,張寶璽.2016.“十二五”我國辣椒遺傳育種研究進展及其展望.中國蔬菜,(1):1-7.
夏碧波,李穎,王恒明,李濤,徐小萬,吳智明.2017.國外引進辣椒資源形態(tài)學(xué)性狀的聚類分析.分子植物育種,15(8):3318-3330.
許先松,劉志欽,林曉丹,牟少亮,官德義,何水林.2011.基于形態(tài)及SRAP標記的辣椒資源遺傳多樣性及親緣關(guān)系比較.福建農(nóng)林大學(xué)學(xué)報:自然科學(xué)版,40(1):48-53.
詹永發(fā),姜虹,韓世玉,楊紅,劉崇政,賴衛(wèi).2008.朝天椒種質(zhì)材料的遺傳多樣性研究.貴州農(nóng)業(yè)科學(xué),36(4):8-10.
詹永發(fā),楊紅,涂祥敏,劉崇政,田應(yīng)書.2010.辣椒品種資源的遺傳多樣性和聚類分析.貴州農(nóng)業(yè)科學(xué),38(11):12-15.
趙香娜,李桂英,劉洋,陸平,頓寶慶,岳美琪,張璞.2008.國內(nèi)外甜高粱種質(zhì)資源主要性狀遺傳多樣性及相關(guān)性分析.植物遺傳資源學(xué)報,9(3):302-307.
Andrews J.1995.Peppers:The Domesticated Capsicums.Austin:University of Texas Press.
Bozokalfa M K,Esiyok D,Turhan K.2009.Patterns of phenotypic variation in a germplasm collection of pepper(Capsicum annuumL.)from Turkey.Spanish Journal of Agricultural Research,7(1):83-95.
Carvalho S I C,Ragassi C F,Bianchetti L B,Reifschneider F J B,Buso G S C,F(xiàn)aleiro F G.2014.Morphological and genetic relationships between wild and domesticated forms of peppers(Capsicum frutescensL. andC.chinenseJacquin).Genetics and Molecular Research,13(3):7447-7464.
Davenport L J.2004.Genera Solanacearum:The genera of Solanaceae illustrated,arranged according to a new system by Armando T.Hunziker.Systematic Botany,29(1):221-222.
Geleta L F,Labuschagne M T,Viljoen C D.2005.Genetic variability in pepper(Capsicum annuumL.)estimated by morphological data and amplified fragment length polymorphism markers.Biodiversity and Conservation,14(10):2361-2375.
IBPGR.1983.Genetic resources ofCapsicum:a global plan of action.Rome:IBPGR Secretariat.
Kang B S,Kim K S.2009.SPSS 17.0:Statistical analysis of the social sciences.Seoul:Hannarae Academy.
Khan F A,Mahmood T,Ali M,Saeed A,Maalik A.2014.Pharmacological importance of an ethnobotanical plant:Capsicum annuumL.Natural Product Research,28(16):1267-1274.
Lefebvre V,Goffinet B,Chauvet J C,Caromel B,Signoret P,Brand R,Palloix A.2001.Evaluation of genetic distances between pepper inbred lines for cultivar protection purposes:comparison of AFLP,RAPD and phenotypic data.Theoretical Applied Genetics,102(5):741-750.
Mongkolporn O,Taylor P W J.2011.‘Capsicum’ Wild Crop Relatives:Genomic and Breeding Resources.Berlin:Springer-Verlag:43-57.
Naegele R P,Mitchell J,Hausbeck M K.2016.Genetic diversity,population structure,and heritability of fruit traits inCapsicum annuum.PLoS One,11(7):e0156969.
Paran I,Ben-Chaim A,Kang B C,Jahn M.2007.Capsicums.Vegetables.Berlin:Springer-Verlag:209-226.
Pickersgill B.2007.Domestication of plants in the Americas:insights from Mendelian and molecular genetics.Annals of Botany,100(5):925-940.
Reilly C A,Crouch D J,Yost G S,F(xiàn)atah A A.2001.Determination of capsaicin,dihydrocapsaicin,and nonivamide in self-defense weapons by liquid chromatography-mass spectrometry and liquid chromatography-tandem mass spectrometry.Journal of Chromatography A,912(2):259-267.
Rivera A,Monteagudo A B,Igartua E,Taboada A,Gar cí a-Ulloa A,Pomar F,Silvar C.2016.Assessing genetic and phenotypic diversity in pepper(Capsicum annuumL.)landraces from North-West Spain.Scientia Horticulturae,203:1-11.
Shannon C E,Weaver W.1949.The Mathematical Theory of Communication.Urbana,Illinois:University of Illinois:117.
Tamura K,Dudley J,Nei M,Kumar S.2007.MEGA4:molecular evolutionary genetics analysis(MEGA)software version 4.0.Molecular Biology and Evolution,24(8):1596-1599.
Thul S T,Lal R K,Shasany A K,Darokar M P,Gupta A K,Gupta M M,Khanuja S P S.2009.Estimation of phenotypic divergence in a collection of Capsicum species for yield-related traits.Euphytica,168(2):189-196.