吳杭航黃天壬鄧偉方向任靜靜甘膺元
作者單位:530021南寧1廣西醫(yī)科大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院實驗研究部;2廣西醫(yī)科大學(xué)研究生院
廣西肝癌高發(fā)區(qū)原發(fā)性肝細(xì)胞癌HBV X基因的整合及影響因素分析
吳杭航1,2黃天壬2鄧偉1方向1,2任靜靜1,2甘膺元1,2
作者單位:530021南寧1廣西醫(yī)科大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院實驗研究部;2廣西醫(yī)科大學(xué)研究生院
目的了解廣西肝癌高發(fā)區(qū)乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)X區(qū)基因在肝細(xì)胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)染色體中的整合及影響因素。方法以30例與HBV相關(guān)的原發(fā)性肝細(xì)胞癌患者為研究對象。提取HCC組織及癌旁組織標(biāo)本DNA作為模板,以HBV X基因上游序列和人類基因組Alu重復(fù)序列為引物,應(yīng)用重復(fù)序列-多聚酶鏈反應(yīng)(Alu-PCR)擴(kuò)增整合的HBV X片段及兩側(cè)的人類基因組DNA片段。擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行測序,計算目的片段整合率并分析相關(guān)的影響因素。結(jié)果18例HCC組織檢測到HBV X基因的整合片段,整合率為60.00%(18/30);26例癌旁組織檢測到HBV X基因的整合片段,整合率為86.67%(26/30)。癌旁組織HBV病毒整合率高于HCC組織,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=5.445,P=0.020)。不同性別、年齡、HBeAg、HBV DNA、ALT、AST的HCC癌組織及其癌旁組織H BV X基因整合率比較差異均無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05)。結(jié)論廣西肝癌高發(fā)區(qū)癌旁組織比HCC組織HBV整合率高,說明HBV整合發(fā)生在感染早期。HBV X基因整合與HCC患者性別、年齡、HBeAg、HBV DNA、ALT、AST無明顯關(guān)系。
肝腫瘤;乙型肝炎病毒X基因;整合;廣西
肝癌是我國常見的惡性腫瘤,死亡率居全部惡性腫瘤的第2位,占全世界肝癌死亡人數(shù)的51%[1-2]。廣西作為我國肝癌的高發(fā)區(qū),肝癌病死率居惡性腫瘤首位,高于全國平均水平[3]。乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)感染是肝癌發(fā)生的主要原因,患者HBsAg總陽性率為84.76%[4]。1980年Brechot等[5]首次發(fā)現(xiàn)在HBV感染的肝癌細(xì)胞中有HBV DNA整合到宿主基因。1995年Minami等[6]建立Alu-PCR用于檢測HBV病毒-細(xì)胞接頭序列。自此國內(nèi)外開始陸續(xù)報道肝癌組織中HBV整合的狀況及其致癌機(jī)制,但廣西肝癌高發(fā)區(qū)肝細(xì)胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)中HBV X基因的整合,目前未有相應(yīng)研究。本研究采用Alu-PCR方法擴(kuò)增整合HBV X片段及兩側(cè)人類基因組DNA片段,了解目的片段整合率并分析相關(guān)影響因素,為廣西HCC高發(fā)區(qū)HBV相關(guān)性HCC的病因研究提供依據(jù)。
1.1 研究對象
30例患者均來自廣西肝癌高發(fā)區(qū)扶綏縣,在廣西醫(yī)科大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院行肝癌切除術(shù),經(jīng)病理學(xué)檢查確診為原發(fā)性肝細(xì)胞癌。平均年齡45.4歲(33~70歲),其中男性25例,女性5例。收集研究對象的臨床資料及手術(shù)切除的HCC組織及癌旁組織(距離癌組織大于5 cm以外的肝組織)標(biāo)本,經(jīng)液氮速凍后儲存于-80℃冰箱備用。
1.2 主要試劑和儀器
組織DNA提取試劑盒、PCR試劑盒購自德國QIAGEN公司,UDG酶購自美國Thermo公司,PCR產(chǎn)物純化和全自動測序由北京六合華大基因科技公司完成。PCR儀購自德國Biometra公司,電泳儀購自美國Thermo公司。
1.3 組織DNA提取
采用德國QIAGEN公司DNA提取試劑盒,方法參照說明書進(jìn)行操作。
1.4 Alu-PCR引物
[7]設(shè)計引物,第一輪PCR擴(kuò)增引物為HBV上游序列pUTP和正/反向的人類基因組重復(fù)序列Alu UP5/T3-515。在合成pUTP和UP5/T3-515時,用dUTP代替dTTP。第二輪PCR擴(kuò)增引物位于pUTP下游的HBV序列MM37和ALU正/反向序列UP6/ MidT3。第三輪“半巢式”PCR擴(kuò)增引物為HBV序列MM60和UP6/MidT3。見表1。
表1 Alu-HBV-PCR引物序列
1.5 Alu-PCR擴(kuò)增HBV X基因整合片段
第一輪PCR反應(yīng)以組織DNA為模板,總量不超過1 000 ng,反應(yīng)體系總體積為100μL,其中引物pUTP、UP5/T3-515各2 uL,Taq DNA聚合酶50μL,加去離子水至100μl。反應(yīng)條件:94℃預(yù)變性3 min;94℃變性30 s,56℃退火30 s,72℃延伸1 min,共35個循環(huán);72℃延伸10 min。PCR反應(yīng)結(jié)束后,產(chǎn)物16℃水浴1min,每PCR反應(yīng)液加入UDG酶5U,37℃消化60 min,使含有dUTP的DNA位點斷裂,95℃10min終止反應(yīng)。第二輪PCR反應(yīng)體系總體積100μL,取第一輪反應(yīng)產(chǎn)物3μL為模板,引物MM37、UP6/MidT3各2μL,Taq DNA聚合酶50μL,去離子水43μL。反應(yīng)條件:94℃預(yù)變性3min;94℃變性30 s,48℃退火30 s,72℃延伸1min,共35個循環(huán);72℃延伸10min。第三輪PCR反應(yīng)體系與第二輪相同,取第二輪反應(yīng)產(chǎn)物10μL,稀釋500倍作為第三輪PCR模板,引物MM60、UP6/MidT3各2μL,Taq DNA聚合酶50μL,模板46μL。反應(yīng)條件:94℃預(yù)變性3 min;94℃變性30 s,60℃(正向)/56℃(反向)退火30 s,72℃延伸1min,共35個循環(huán);72℃延伸10min。
1.6 測序及目的片段整合分析
取第三輪PCR產(chǎn)物10μL經(jīng)1.5%瓊脂糖凝聚電泳觀察擴(kuò)增結(jié)果,出現(xiàn)陽性條帶的標(biāo)本送北京六合華大公司(廣州)進(jìn)行純化,并經(jīng)ABI3730x1基因分析儀進(jìn)行雙向測序。結(jié)果經(jīng)NCBIBLAST(https://blast.ncbi. nlm.nih.gov/Blast.cgi)分析HBV X基因整合的基本情況。
1.7 統(tǒng)計學(xué)分析
采用SPSS 16.0軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析。計數(shù)資料采用百分率表示,樣本率的比較采用χ2檢驗或確切概率法。以P<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。
2.1 HBV X基因整合片段的擴(kuò)增及測序結(jié)果
在30例HCC癌組織及其配對的癌旁組織中,擴(kuò)增出陽性條帶25例,其中正向PCR結(jié)果9例,反向PCR結(jié)果4例,同時為正向和反向PCR結(jié)果12例,部分電泳結(jié)果見圖1;陽性條帶純化后測序成功18例,其中正向PCR結(jié)果3例,反向PCR結(jié)果12例,同時為正向和反向PCR結(jié)果3例,共21根條帶,測序峰如圖2所示。在癌旁組織中擴(kuò)增出陽性條帶29例,其中正向PCR結(jié)果1例,反向PCR結(jié)果3例,同時為正向和反向PCR結(jié)果24例,部分電泳結(jié)果見圖1;陽性條帶純化后測序成功26例,其中正向PCR結(jié)果和反向PCR結(jié)果各7例,同時為正向和反向PCR結(jié)果12例,共38根條帶。8P和11P反向反應(yīng)各有兩個測序結(jié)果,測序峰如圖3所示。
2.2 HBV X基因整合率
在30例研究對象中,總整合率為73.33%(44/60),肝癌組織中18例檢測到HBV X基因整合片段,整合率為60.00%(18/30);癌旁組織中26例檢測到HBV X基因整合片段,整合率為86.67%(26/30)。癌旁組織HBV病毒整合率高于HCC組織(χ2=5.445,P=0.020)。
2.3 HBV X基因整合與HBV感染指標(biāo)的關(guān)系
進(jìn)一步分析影響HBV X基因整合的因素,結(jié)果顯示,不同性別、年齡、HBeAg、HBV DNA、ALT、AST的HCC癌組織及其癌旁組織HBV X基因整合率差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05)。見表2。
圖1 HBV X基因擴(kuò)增部分電泳結(jié)果
圖2 樣本6T測序結(jié)果峰圖
圖3 樣本6P測序結(jié)果峰圖
表2 HBV X基因整合的影響因素分析[n(%)]
(續(xù)表)
HBV整合到宿主基因是HBV感染過程常見的現(xiàn)象,有研究顯示,85%~90%的HBV相關(guān)HCC組織可檢測到HBV DNA整合[8]。隨后大量研究發(fā)現(xiàn),HBV攜帶者、HBV肝炎患者、肝硬化及HCC患者均可檢測到HBV DNA整合[9],可見HBV整合是HCC發(fā)生發(fā)展過程中的一個重要環(huán)節(jié)。
本研究為提高整合率,同時應(yīng)用正向和反向HBV-Alu-PCR方法,對廣西肝癌高發(fā)區(qū)HBsAg陽性的HCC組織及其配對癌旁組織中整合的HBV序列進(jìn)行分析,探討整合HBVDNA與HBV致癌的相關(guān)性。結(jié)果發(fā)現(xiàn),癌旁組織HBV整合率(86.67%)高于HCC組織(60.00%)。而賀良等[10]采用Alu-PCR技術(shù)檢測HCC標(biāo)本,發(fā)現(xiàn)40例HCC中HBV X基因整合率為45.00%。張婷等[11]采用Alu-PCR和LM-PCR方法檢測肝癌組織和癌旁組織,發(fā)現(xiàn)肝癌組織HBV X基因整合率(65.0%)稍低于癌旁組織(67.5%),本研究與張婷等[11]研究結(jié)果一致,且癌旁組織的整合率遠(yuǎn)高于癌組織,說明HBV DNA的整合是慢性乙型肝炎發(fā)展成肝癌過程中的一個早期事件。此外,本研究的總體整合率高于國內(nèi)其他研究[12-14],說明廣西肝癌高發(fā)區(qū)HBV X基因整合與HCC的發(fā)生有密切關(guān)系,可能是本地區(qū)HCC發(fā)生率高于全國水平的原因之一。本研究中12例HCC組織和4例癌旁組織未檢測出HBV X基因整合序列,可能本身未整合或者HBx的整合序列出現(xiàn)在引物HBx下游或引物Alu上游,也可能整合基因在HBV的S區(qū)或C區(qū)[10]。
進(jìn)一步分析HBV X基因整合條帶與HCC的關(guān)系,結(jié)果發(fā)現(xiàn),陽性條帶測序的長度在335~1008 bp之間,其中2例癌旁組織檢測到2個條帶,說明HBV基因截短插入宿主基因,片段長度不一,整合可發(fā)生在不同的位置[15],與屠紅等[16]的研究結(jié)果一致。進(jìn)一步證實截短的HBV X基因產(chǎn)物可影響HCC的發(fā)生發(fā)展,而不需要HBV全長整合入宿主基因發(fā)揮致癌作用。
關(guān)于HBV X基因整合與HBV感染指標(biāo)及肝功能的關(guān)系,本研究結(jié)果顯示HBV X基因的整合率在不同性別、年齡、HBeAg、HBVDNA、ALT、AST的HCC患者中的分布差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05)。賀良等[10]發(fā)現(xiàn)HBV整合與HCC患者性別、年齡、AFP、癌栓及復(fù)發(fā)等無關(guān),與HBV DNA、腫瘤大小、分化程度呈正相關(guān)。Sung等[17]發(fā)現(xiàn),HBV整合的HCC患者年齡低于未整合者,并認(rèn)為HBV DNA與致癌基因整合,是HCC患者未經(jīng)肝硬化過程而直接發(fā)生癌變的原因之一。本研究并未得到類似結(jié)論,可能與研究例數(shù)較少有關(guān),也可能說明廣西肝癌高發(fā)區(qū)的HBV X基因整合與性別、年齡及HBV感染指標(biāo)的關(guān)系并不密切。當(dāng)?shù)厝巳褐械腍BV基因型及亞型、不同患者體內(nèi)HBV準(zhǔn)種的特征及優(yōu)勢株以及HBV的某些突變點可能是影響其整合率的關(guān)鍵因素,需在今后的研究中加以驗證。
越來越多的證據(jù)顯示HBV DNA的整合與HCC有關(guān),闡明與肝癌發(fā)生發(fā)展有關(guān)的整合位點,對未來指導(dǎo)基因診斷和治療具有重要意義[18]。本研究對廣西肝癌高發(fā)區(qū)的HCC組織和癌旁組織HBV X基因整合率及臨床資料進(jìn)行分析,證實了HBV DNA的整合是HCC發(fā)生過程中的一個早期事件,為本地區(qū)研究整合HBV DNA與HBV致癌機(jī)制提供了依據(jù)。
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[2017-03-31收稿][2017-04-15修回][編輯江德吉]
Analysis of hepatitis B virus X gene integration and potential risk factors of integration in patientsw ith hepatocellular carcinoma in the high-incidence area of Guangxi
Wu Hanghang1,2,Huang Tianren2,Deng Wei1,F(xiàn)ang Xiang1,2,Ren Jingjing1,2,Gan Yingyuan1,2(1Department of Research,Affiliated Tumor Hospital of GuangxiMedical University,2Graduate School of GuangxiMedical University,Nanning 530021,P.R.China)
Huang Tianren.E-mail:tianrenhuang@sina.com Deng Wei.E-mail:9608946@qq.com
Objective To analyze integration ofhepatitis B virus(HBV)X gene into the genome of primary hepatocellular carcinoma(HCC)tumors and surrounding tissue,and to explore potential risk factors of such integration in patients from the HCC high-incidence area of Guangxi.Methods DNA was extracted from HCC tissue and adjacent non-tumor liver tissue of 30 patientswith HBV-related HCC.Primers were designed to amplify the HBV X sequence and human Alu repeats by Alu-PCR,and PCR products were Sangersequenced.Results Among the 30 patients,18(60.00%)showed integration of the HBV X gene into HCC tumors,compared to 26(86.67%)who showed X gene integration into adjacent liver tissue(χ2=5.445,P=0.020).Incidence of X gene integration did not vary significantly with sex,age,HbeAg status,HBV DNA load,ALT or AST in HCC tissue or adjacent non-tumorous liver tissue(P>0.05). Conclusions Incidence of HBV integration is higher in non-tumorous tissues than in tumorous tissues in patients with HBV-related HCC in Guangxi.HBV integration appears to occur in early stages of HCC development.HBV X gene integration does not appear to be influenced by sex,age,HBeAg status,HBV DNA load,ALT or AST.
Hepatocellular carcinoma;Hepatitis B virus X gene;Integration;Guangxi
R735.7
A
1674-5671(2017)03-05
10.3969/j.issn.1674-5671.2017.03.02
國家自然科學(xué)基金資助項目(81660561,81260319);廣西高??茖W(xué)技術(shù)研究資助項目(KY2015ZD025,ZD2014039)
黃天壬。E-mail:tianrenhuang@sina.com鄧偉。E-mail:9608946@qq.com