菅建國(guó),賈彥彬
(1.包頭醫(yī)學(xué)院第一附屬醫(yī)院檢驗(yàn)科,內(nèi)蒙古包頭 014010; 2.包頭醫(yī)學(xué)院第二附屬醫(yī)院內(nèi)蒙古消化病研究所,
內(nèi)蒙古包頭 014030;3.包頭醫(yī)學(xué)院病原生物學(xué)教研室,內(nèi)蒙古包頭 014060)
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包頭地區(qū)漢族人群PSCA基因rs2294008多態(tài)性與非賁門(mén)胃癌的關(guān)聯(lián)研究
菅建國(guó)1,賈彥彬2,3△
(1.包頭醫(yī)學(xué)院第一附屬醫(yī)院檢驗(yàn)科,內(nèi)蒙古包頭 014010; 2.包頭醫(yī)學(xué)院第二附屬醫(yī)院內(nèi)蒙古消化病研究所,
內(nèi)蒙古包頭 014030;3.包頭醫(yī)學(xué)院病原生物學(xué)教研室,內(nèi)蒙古包頭 014060)
目的探討包頭地區(qū)漢族人群前列腺干細(xì)胞抗原(PSCA)基因單核苷酸多態(tài)性(SNP)位點(diǎn)rs2294008 C>T與非賁門(mén)胃癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的相關(guān)性。方法收集288例胃癌患者(胃癌組)和281例健康者(健康對(duì)照組)血標(biāo)本,采用TaqMan進(jìn)行了基因分型;并用非條件性Logistic回歸分析PSCA基因位點(diǎn)rs2294008多態(tài)性與非賁門(mén)胃癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)聯(lián)性。結(jié)果rs2294008的等位基因和基因型分布頻率在胃癌患者和健康對(duì)照者中的差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。結(jié)論P(yáng)SCA基因位點(diǎn)rs2294008多態(tài)性可能在包頭地區(qū)漢族人群非賁門(mén)胃癌的發(fā)病中不起主要作用。
胃癌;前列腺干細(xì)胞抗原;單核苷酸多態(tài)性
雖然隨著醫(yī)療條件和生活水平的提高,胃癌患者的預(yù)后和生活質(zhì)量有所改善,但迄今為止,胃癌在全球發(fā)病率仍居常見(jiàn)惡性腫瘤的第4位,病死率仍居第2位[1]。而我國(guó)胃癌的年病死率為16/10萬(wàn),男性病死率為20.9/10萬(wàn),女性為10.2/10萬(wàn)(中國(guó)人口化標(biāo)準(zhǔn)),分別占惡性腫瘤死亡原因的26.1%和18.7%,為各類(lèi)腫瘤之首[2]。其中胃癌的分布有明顯的區(qū)域聚集現(xiàn)象[3],西部地區(qū)的胃癌病死率較高[4]。目前,由于胃癌起病隱匿,早期多無(wú)癥狀或僅有非特異性消化道癥狀,得不到重視或因檢驗(yàn)方法靈敏度差而耽誤疾病確診治療,進(jìn)而影響患者的生存質(zhì)量和生存時(shí)間。所以早確診、早治療是改善胃癌患者預(yù)后、降低患者病死率的首要途徑。因此,尋找一些可用于胃癌篩查的生物學(xué)標(biāo)記是非常必要的。
2008年,日本進(jìn)行基因組計(jì)劃,發(fā)現(xiàn)前列腺干細(xì)胞抗原(PSCA)基因單核苷酸多態(tài)性(SNP)rs2294008 T>C與彌漫性胃癌密切相關(guān)[5]。隨后,我國(guó)關(guān)于漢族人群PSCA基因位點(diǎn)rs2294008多態(tài)性與胃癌的關(guān)系有多項(xiàng)研究報(bào)道,結(jié)果并不一致。在本研究中,筆者在包頭地區(qū)漢族人群中檢測(cè)了PSCA基因位點(diǎn)rs2294008多態(tài)性與非賁門(mén)胃癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)系,旨在為胃癌的早期診斷和預(yù)防提供一定的實(shí)驗(yàn)依據(jù)。
1.1一般資料病例為2008年9月至2010年6月包頭腫瘤醫(yī)院經(jīng)組織病理學(xué)診斷為非賁門(mén)胃癌的患者,要求患者為漢族,發(fā)病時(shí)已在包頭市居住5年以上,排除繼發(fā)病例和復(fù)發(fā)病例,采集血樣2 mL。同期在包頭醫(yī)學(xué)院第一附屬醫(yī)院的健康體檢者中隨機(jī)選取同性別、同年齡組(±5歲)的漢族健康居民作為健康對(duì)照組,要求對(duì)照者無(wú)癌癥家族史和慢性胃病史,且在包頭市居住5年以上。健康對(duì)照組標(biāo)本同樣采集血樣2 mL。所有參加本研究的胃癌組患者和健康對(duì)照者均無(wú)親緣關(guān)系,都要求提供知情同意書(shū),并且本研究已獲得包頭醫(yī)學(xué)院倫理委員會(huì)批準(zhǔn)。在整個(gè)研究中,共收集胃癌患者288例,健康對(duì)照組281例。
1.2rs2294008基因分型采用酚/氯仿抽提核酸的方法提取外周血白細(xì)胞中的DNA[6]。用TaqMan探針?lè)ㄔ谒袠?biāo)本中對(duì)rs2294008進(jìn)行基因分型,基因分型由北京諾賽基因組有限公司完成。
1.3統(tǒng)計(jì)學(xué)處理采用SPSS17.0統(tǒng)計(jì)軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)分析, 用χ2檢驗(yàn)檢測(cè)rs2294008基因型分布在健康對(duì)照組中是否符合Hardy-weinberg平衡定律;并用χ2檢驗(yàn)檢測(cè)rs2294008的等位基因和基因型分布在胃癌組和健康對(duì)照組的差異是否有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。用非條件性Logistic回歸分析來(lái)評(píng)估SNP rs2294008的等位基因、基因型與非賁門(mén)胃癌的關(guān)系,以?xún)?yōu)勢(shì)比(OR)和95%可信區(qū)間(CI)表示。OR值調(diào)整了性別和年齡因素的影響。以P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
在健康對(duì)照組中,PSCA基因rs2294008在健康對(duì)照組中的基因型分布符合Hardy-weinberg平衡定律。胃癌組中C、T的等位基因頻率分別為70.18%、29.82%,健康對(duì)照組中C、T的等位基因頻率分別為74.55%、25.45%,兩組對(duì)比差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。胃癌組中CC、CT、TT的基因型頻率分別為46.43%、47.50%、6.07%,健康對(duì)照組中CC、CT、TT的基因型頻率分別為55.23%、38.63%、6.14%,兩組對(duì)比差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。SNP rs2294008與包頭地區(qū)漢族人群非賁門(mén)胃癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)沒(méi)有相關(guān)性。結(jié)果見(jiàn)表1、2。
表1 SNP rs2294008等位基因與胃癌的關(guān)聯(lián)分析
注:a由于有缺失的數(shù)據(jù),因此列入之和不及標(biāo)本總和;b調(diào)整了性別和年齡因素。
表2 SNP rs2294008基因型與非賁門(mén)胃癌的關(guān)聯(lián)分析
注:a由于有缺失的數(shù)據(jù),因此列入之和不及標(biāo)本等位基因總和;b調(diào)整了性別和年齡因素。
胃癌包括賁門(mén)癌和非賁門(mén)癌,兩者在流行病學(xué)特征、病因以及分子生物學(xué)特征等方面的差異都較大,而賁門(mén)癌在這些方面更接近于食管癌。為保證臨床標(biāo)本的均質(zhì)性,本研究將病例限定為非賁門(mén)胃癌患者。
PSCA為一種細(xì)胞表面蛋白,基因位于染色體8q24.2,編碼由123個(gè)氨基酸組成的細(xì)胞表面抗原,參與各種細(xì)胞功能,如細(xì)胞與細(xì)胞間黏附、傳導(dǎo)等[7]。PSCA在前列腺癌、膀胱癌等腫瘤中高表達(dá)[8],但在食管癌和胃癌中卻低表達(dá)[9]。但Sakamoto等[10]研究提示PSCA可能在胃癌細(xì)胞增殖中有腫瘤抑制功能。因此PSCA在胃癌中低表達(dá)可能對(duì)個(gè)體增加了發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)。
rs2294008位點(diǎn)位于PSCA基因第1外顯子區(qū),目前關(guān)于其確切的對(duì)胃癌發(fā)病機(jī)制還不清楚。2008年,日本一研究小組采用全基因組掃描發(fā)現(xiàn)PSCA基因位點(diǎn)rs2294008等位基因T基因頻率(61.7%)較高,可增高胃癌的易感性[5]。這與Wu等[11]對(duì)中國(guó)漢族人群的PSCA基因rs2294008 T等位基因頻率(28.4%)較低研究不一致。在對(duì)中國(guó)人群的研究中,趙久達(dá)等[12]在2012年選取青海地區(qū)藏族人群中的非賁門(mén)胃癌患者,中國(guó)藏族人群中T等位基因頻率(26.25%)較低,為次要等位基因。本研究包頭地區(qū)漢族人群中T等位基因頻率(29.82%)也較低,為次要等位基因,與文獻(xiàn)[11-12]的結(jié)果一致,該現(xiàn)象提示不同種族、地區(qū)的遺傳易感差異背景甚大。本研究結(jié)果顯示,PSCA基因rs2294008 的基因型和等位基因頻率在胃癌組和健康對(duì)照組中的分布差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,與包頭地區(qū)漢族人群非賁門(mén)胃癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)沒(méi)有相關(guān)性。結(jié)果的差異可能與樣本量的大小和遺傳亞結(jié)構(gòu)、環(huán)境因素有關(guān),關(guān)于他們之間的確切關(guān)系還需進(jìn)一步研究。
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10.3969/j.issn.1673-4130.2016.16.039
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1673-4130(2016)16-2302-03
2016-02-22
2016-06-03)