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    12份櫻桃品種遺傳多樣性的ISSR分析

    2014-12-23 10:57:46陳新張慶霞徐麗賈建云王甲威劉慶
    山東農(nóng)業(yè)科學(xué) 2014年11期
    關(guān)鍵詞:遺傳多樣性櫻桃

    陳新+張慶霞+徐麗+賈建云+王甲威+劉慶忠

    摘 要:本試驗(yàn)采用ISSR技術(shù)對(duì)12份櫻桃種質(zhì)資源的遺傳多樣性進(jìn)行了研究。篩選出6條ISSR引物對(duì)供試材料進(jìn)行擴(kuò)增,共檢測(cè)到48個(gè)遺傳位點(diǎn),包含44個(gè)多態(tài)性位點(diǎn),多態(tài)性位點(diǎn)百分率為91.67%。材料間遺傳相似系數(shù)為0.29~0.98,平均為0.65。當(dāng)閾值為0.58時(shí),供試樣品可分為3個(gè)組,即組Ⅰ、組Ⅱ和組Ⅲ。遺傳相似性分析結(jié)果顯示材料間具有豐富的遺傳多樣性。

    關(guān)鍵詞:櫻桃;遺傳多樣性;ISSR

    中圖分類號(hào):S662.501 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)號(hào):A 文章編號(hào):1001-4942(2014)11-0012-03

    櫻桃為薔薇科(Rosacea)李屬(Prunus)櫻桃組植物,多分布在亞洲和歐洲[1],全世界櫻桃組植物約有120種以上,主要分布于北半球溫和地帶。中國(guó)栽培櫻桃已有3000多年的歷史。我國(guó)栽培的櫻桃可分為四大類,即中國(guó)櫻桃、甜櫻桃、酸櫻桃和毛櫻桃[2],其中以中國(guó)櫻桃和甜櫻桃為主要栽培對(duì)象。我國(guó)櫻桃種質(zhì)資源豐富,華北、華中及兩廣地區(qū)皆有分布,尤以浙江、山東、河南、江蘇、陜西、四川、安徽、河北分布最多,為充分挖掘櫻桃種質(zhì)資源提供了天然條件[3,4]。

    ISSR(Inter-simple sequence repeat) 是Zietkiewitcz等于1994年發(fā)展起來的微衛(wèi)星基礎(chǔ)上的分子標(biāo)記[5],是一種簡(jiǎn)單重復(fù)序列之間擴(kuò)增多態(tài)性分子標(biāo)記。其利用基因組中有關(guān)SSR序列信息,引物的開發(fā)較SSR引物簡(jiǎn)單,且可以在不同的物種間通用,不像SSR標(biāo)記一樣具有較強(qiáng)的種屬特異性。ISSR分子標(biāo)記不僅具有SSR標(biāo)記的穩(wěn)定性且揭示的多態(tài)性較RAPD高[6,7],是一種非常理想的分子標(biāo)記技術(shù),目前已廣泛用于植物品種鑒定、遺傳作圖、遺傳多樣性及分子生態(tài)學(xué)研究。本試驗(yàn)采用ISSR標(biāo)記技術(shù)對(duì)山東省部分主栽櫻桃品種和砧木資源進(jìn)行檢測(cè),并分析其遺傳背景差異,對(duì)櫻桃資源的科研、生產(chǎn)具有重要的實(shí)際應(yīng)用價(jià)值和科學(xué)價(jià)值。

    1 材料與方法

    1.1 試驗(yàn)材料

    試驗(yàn)所用材料均于2014年4月采自山東省果樹研究所櫻桃品種資源保存圃,所用12份材料均為目前生產(chǎn)上的主要栽培品種。隨機(jī)采取健康嫩葉迅速于液氮中冷凍,放于-80℃冰箱保存?zhèn)溆?。樣品編?hào)及品種見表1。

    1.2 模板DNA的制備

    采用改良CTAB法[8]提取葉片的基因組DNA,用0.8%的瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)其質(zhì)量。稀釋DNA至終濃度10 ng/μL,-20℃儲(chǔ)存?zhèn)溆谩?/p>

    1.3 ISSR反應(yīng)

    ISSR引物委托上海生工生物工程股份有限公司合成,篩選出6條用于PCR(表2)。PCR擴(kuò)增體系為20 μL,其中10 × buffer (含Mg2+) 2 μL,2.5 mmol/L dNTPs 1.6 μL,10 μmol/L Primer 1 μL,2.5 U/μL Taq聚合酶0.4 μL,10 ng/μL DNA模板1 μL 和無菌ddH2O 14 μL。PCR 反應(yīng)程序?yàn)?5℃ 5 min;95℃ 1 min,48℃ 1 min,72℃ 1 min,35 個(gè)循環(huán);72℃ 10 min,程序結(jié)束后進(jìn)入4℃保存。PCR擴(kuò)增產(chǎn)物用1.5%瓊脂糖凝膠電泳分離檢測(cè),于紫外燈下觀察,并拍照保存。

    1.4 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析

    將所獲得的電泳譜帶進(jìn)行數(shù)字化統(tǒng)計(jì),按照?qǐng)D譜中同一位置條帶的“有”、“無”進(jìn)行統(tǒng)計(jì),有帶標(biāo)記為“1”,無帶標(biāo)記為“0”,僅記錄重復(fù)性好、條帶清晰且片段為200~750 bp 范圍內(nèi)的擴(kuò)增帶。將DNA擴(kuò)增帶數(shù)據(jù)輸入到數(shù)據(jù)矩陣,通過NTSYSpc(version 2.11 a)采用非加權(quán)類平均法(UPGMA)進(jìn)行聚類分析建立聚類圖,并計(jì)算遺傳相似系數(shù)。

    2 結(jié)果與分析

    2.1 PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的多態(tài)性分析

    6條引物均能對(duì)12份櫻桃種質(zhì)基因組DNA擴(kuò)增出清晰穩(wěn)定的多態(tài)性條帶,圖1為引物ISSR36擴(kuò)增的帶型。本試驗(yàn)共檢測(cè)到48個(gè)遺傳位點(diǎn),其中包含44個(gè)多態(tài)性遺傳位點(diǎn),多態(tài)性位點(diǎn)比率為91.67%(表2)。同一樣品的不同引物擴(kuò)增條帶數(shù)量和多態(tài)性差異較大。

    2.2 遺傳相似性

    12份櫻桃種質(zhì)個(gè)體間的相似系數(shù)為0.29~0.98,平均值為0.65。其中1與4和2與3的遺傳相似系數(shù)最大,為0.98,說明其遺傳距離最近,即親緣關(guān)系最近,5與10 的遺傳相似系數(shù)最小,僅為0.29,說明二者遺傳相似性最低,親緣關(guān)系最遠(yuǎn)。

    2.3 聚類分析

    對(duì)供試12份種質(zhì)進(jìn)行聚類分析,結(jié)果表明,品種間遺傳背景有較大的差異,遺傳多樣性豐富。在相似系數(shù)0.58處,12個(gè)品種可聚類為3個(gè)組(圖2),其中,1、4、10、2、3、11和12聚為一個(gè)分支,為組Ⅰ;5和9聚為一個(gè)分支,為組Ⅱ;6、7和8聚為一個(gè)分支,為組Ⅲ。

    3 結(jié)論

    6條ISSR 引物均能有效擴(kuò)增出多態(tài)性條帶,說明ISSR標(biāo)記是櫻桃遺傳分析的有效工具。供試12個(gè)樣品間的相似系數(shù)分布在0.29~0.98之間,ISSR標(biāo)記能將供試樣品完全區(qū)分開。品種間具有豐富的遺傳多樣性,親緣關(guān)系復(fù)雜,遺傳背景存在很大差異。物種的地理分布特征也可能影響其遺傳多樣性水平,一般而言,廣泛分布比狹域分布的物種具有更高的遺傳多樣性[9],供試櫻桃品種間表現(xiàn)出較高遺傳多樣性,可能與它們地理分布相對(duì)較廣有關(guān)。參 考 文 獻(xiàn):

    [1] 俞德浚.中國(guó)植物志[M].北京:科學(xué)出版社, 1986: 46-87.

    [2] 于亞軍,代漢萍,李寶江,等. 世界櫻桃育種進(jìn)展[J]. 果樹學(xué)報(bào),2003,20(2):135-139.

    [3] 胡正剛.中國(guó)櫻桃的分布及生產(chǎn)現(xiàn)狀[J].落葉果樹, 1996(3):29-30.

    [4] Li M M,Cai Y L,Qian Z Q, et al. Genetic diversity and differentiation in Chinese sour cherry Prunus pseudocerasus Lindl., and its implications for conservation[J]. Genetic Resources and Crop Evolution, 2009, 56(4): 455-464.

    [5] Zietkiewicz E, Rafalski A, Labuda D. Genome fingerprinting by simple sequence repeat (SSR)-anchored polymerase chain reaction amplification[J]. Genomics, 1994, 20: 176-183.

    [6] Sanchez de la Hoz M P,Davila J A,Loarce Y,et al. Simple sequence repeat primers used in polymerase chain reaction amplifications to study genetic diversity in barley [J]. Genome, 1996, 39(1): 112-117.

    [7] Ratnaparkhe M B,Santra D K,Tullu A,et al. Inheritance of inter-simple-sequence-repeat polymorphisms and linkage with a fusarium wilt resistance gene in chickpea [J].Theor. Appl. Genet., 1998, 96(3/4): 348-353.

    [8] 陳新.榛子花芽轉(zhuǎn)錄組文庫(kù)的Solexa 測(cè)序及冷調(diào)節(jié)基因的表達(dá)譜分析[D].北京:中國(guó)林業(yè)科學(xué)研究院,2011.

    [9] Nybom H, Bartish I V. Effects of life history traits and sampling strategies on genetic diversity estimates obtained with RAPD markers in plants [J]. Perspectives in Plant Ecology, Evolution and Systematics, 2000, 3(2):93-114.

    摘 要:本試驗(yàn)采用ISSR技術(shù)對(duì)12份櫻桃種質(zhì)資源的遺傳多樣性進(jìn)行了研究。篩選出6條ISSR引物對(duì)供試材料進(jìn)行擴(kuò)增,共檢測(cè)到48個(gè)遺傳位點(diǎn),包含44個(gè)多態(tài)性位點(diǎn),多態(tài)性位點(diǎn)百分率為91.67%。材料間遺傳相似系數(shù)為0.29~0.98,平均為0.65。當(dāng)閾值為0.58時(shí),供試樣品可分為3個(gè)組,即組Ⅰ、組Ⅱ和組Ⅲ。遺傳相似性分析結(jié)果顯示材料間具有豐富的遺傳多樣性。

    關(guān)鍵詞:櫻桃;遺傳多樣性;ISSR

    中圖分類號(hào):S662.501 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)號(hào):A 文章編號(hào):1001-4942(2014)11-0012-03

    櫻桃為薔薇科(Rosacea)李屬(Prunus)櫻桃組植物,多分布在亞洲和歐洲[1],全世界櫻桃組植物約有120種以上,主要分布于北半球溫和地帶。中國(guó)栽培櫻桃已有3000多年的歷史。我國(guó)栽培的櫻桃可分為四大類,即中國(guó)櫻桃、甜櫻桃、酸櫻桃和毛櫻桃[2],其中以中國(guó)櫻桃和甜櫻桃為主要栽培對(duì)象。我國(guó)櫻桃種質(zhì)資源豐富,華北、華中及兩廣地區(qū)皆有分布,尤以浙江、山東、河南、江蘇、陜西、四川、安徽、河北分布最多,為充分挖掘櫻桃種質(zhì)資源提供了天然條件[3,4]。

    ISSR(Inter-simple sequence repeat) 是Zietkiewitcz等于1994年發(fā)展起來的微衛(wèi)星基礎(chǔ)上的分子標(biāo)記[5],是一種簡(jiǎn)單重復(fù)序列之間擴(kuò)增多態(tài)性分子標(biāo)記。其利用基因組中有關(guān)SSR序列信息,引物的開發(fā)較SSR引物簡(jiǎn)單,且可以在不同的物種間通用,不像SSR標(biāo)記一樣具有較強(qiáng)的種屬特異性。ISSR分子標(biāo)記不僅具有SSR標(biāo)記的穩(wěn)定性且揭示的多態(tài)性較RAPD高[6,7],是一種非常理想的分子標(biāo)記技術(shù),目前已廣泛用于植物品種鑒定、遺傳作圖、遺傳多樣性及分子生態(tài)學(xué)研究。本試驗(yàn)采用ISSR標(biāo)記技術(shù)對(duì)山東省部分主栽櫻桃品種和砧木資源進(jìn)行檢測(cè),并分析其遺傳背景差異,對(duì)櫻桃資源的科研、生產(chǎn)具有重要的實(shí)際應(yīng)用價(jià)值和科學(xué)價(jià)值。

    1 材料與方法

    1.1 試驗(yàn)材料

    試驗(yàn)所用材料均于2014年4月采自山東省果樹研究所櫻桃品種資源保存圃,所用12份材料均為目前生產(chǎn)上的主要栽培品種。隨機(jī)采取健康嫩葉迅速于液氮中冷凍,放于-80℃冰箱保存?zhèn)溆?。樣品編?hào)及品種見表1。

    1.2 模板DNA的制備

    采用改良CTAB法[8]提取葉片的基因組DNA,用0.8%的瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)其質(zhì)量。稀釋DNA至終濃度10 ng/μL,-20℃儲(chǔ)存?zhèn)溆谩?/p>

    1.3 ISSR反應(yīng)

    ISSR引物委托上海生工生物工程股份有限公司合成,篩選出6條用于PCR(表2)。PCR擴(kuò)增體系為20 μL,其中10 × buffer (含Mg2+) 2 μL,2.5 mmol/L dNTPs 1.6 μL,10 μmol/L Primer 1 μL,2.5 U/μL Taq聚合酶0.4 μL,10 ng/μL DNA模板1 μL 和無菌ddH2O 14 μL。PCR 反應(yīng)程序?yàn)?5℃ 5 min;95℃ 1 min,48℃ 1 min,72℃ 1 min,35 個(gè)循環(huán);72℃ 10 min,程序結(jié)束后進(jìn)入4℃保存。PCR擴(kuò)增產(chǎn)物用1.5%瓊脂糖凝膠電泳分離檢測(cè),于紫外燈下觀察,并拍照保存。

    1.4 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析

    將所獲得的電泳譜帶進(jìn)行數(shù)字化統(tǒng)計(jì),按照?qǐng)D譜中同一位置條帶的“有”、“無”進(jìn)行統(tǒng)計(jì),有帶標(biāo)記為“1”,無帶標(biāo)記為“0”,僅記錄重復(fù)性好、條帶清晰且片段為200~750 bp 范圍內(nèi)的擴(kuò)增帶。將DNA擴(kuò)增帶數(shù)據(jù)輸入到數(shù)據(jù)矩陣,通過NTSYSpc(version 2.11 a)采用非加權(quán)類平均法(UPGMA)進(jìn)行聚類分析建立聚類圖,并計(jì)算遺傳相似系數(shù)。

    2 結(jié)果與分析

    2.1 PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的多態(tài)性分析

    6條引物均能對(duì)12份櫻桃種質(zhì)基因組DNA擴(kuò)增出清晰穩(wěn)定的多態(tài)性條帶,圖1為引物ISSR36擴(kuò)增的帶型。本試驗(yàn)共檢測(cè)到48個(gè)遺傳位點(diǎn),其中包含44個(gè)多態(tài)性遺傳位點(diǎn),多態(tài)性位點(diǎn)比率為91.67%(表2)。同一樣品的不同引物擴(kuò)增條帶數(shù)量和多態(tài)性差異較大。

    2.2 遺傳相似性

    12份櫻桃種質(zhì)個(gè)體間的相似系數(shù)為0.29~0.98,平均值為0.65。其中1與4和2與3的遺傳相似系數(shù)最大,為0.98,說明其遺傳距離最近,即親緣關(guān)系最近,5與10 的遺傳相似系數(shù)最小,僅為0.29,說明二者遺傳相似性最低,親緣關(guān)系最遠(yuǎn)。

    2.3 聚類分析

    對(duì)供試12份種質(zhì)進(jìn)行聚類分析,結(jié)果表明,品種間遺傳背景有較大的差異,遺傳多樣性豐富。在相似系數(shù)0.58處,12個(gè)品種可聚類為3個(gè)組(圖2),其中,1、4、10、2、3、11和12聚為一個(gè)分支,為組Ⅰ;5和9聚為一個(gè)分支,為組Ⅱ;6、7和8聚為一個(gè)分支,為組Ⅲ。

    3 結(jié)論

    6條ISSR 引物均能有效擴(kuò)增出多態(tài)性條帶,說明ISSR標(biāo)記是櫻桃遺傳分析的有效工具。供試12個(gè)樣品間的相似系數(shù)分布在0.29~0.98之間,ISSR標(biāo)記能將供試樣品完全區(qū)分開。品種間具有豐富的遺傳多樣性,親緣關(guān)系復(fù)雜,遺傳背景存在很大差異。物種的地理分布特征也可能影響其遺傳多樣性水平,一般而言,廣泛分布比狹域分布的物種具有更高的遺傳多樣性[9],供試櫻桃品種間表現(xiàn)出較高遺傳多樣性,可能與它們地理分布相對(duì)較廣有關(guān)。參 考 文 獻(xiàn):

    [1] 俞德浚.中國(guó)植物志[M].北京:科學(xué)出版社, 1986: 46-87.

    [2] 于亞軍,代漢萍,李寶江,等. 世界櫻桃育種進(jìn)展[J]. 果樹學(xué)報(bào),2003,20(2):135-139.

    [3] 胡正剛.中國(guó)櫻桃的分布及生產(chǎn)現(xiàn)狀[J].落葉果樹, 1996(3):29-30.

    [4] Li M M,Cai Y L,Qian Z Q, et al. Genetic diversity and differentiation in Chinese sour cherry Prunus pseudocerasus Lindl., and its implications for conservation[J]. Genetic Resources and Crop Evolution, 2009, 56(4): 455-464.

    [5] Zietkiewicz E, Rafalski A, Labuda D. Genome fingerprinting by simple sequence repeat (SSR)-anchored polymerase chain reaction amplification[J]. Genomics, 1994, 20: 176-183.

    [6] Sanchez de la Hoz M P,Davila J A,Loarce Y,et al. Simple sequence repeat primers used in polymerase chain reaction amplifications to study genetic diversity in barley [J]. Genome, 1996, 39(1): 112-117.

    [7] Ratnaparkhe M B,Santra D K,Tullu A,et al. Inheritance of inter-simple-sequence-repeat polymorphisms and linkage with a fusarium wilt resistance gene in chickpea [J].Theor. Appl. Genet., 1998, 96(3/4): 348-353.

    [8] 陳新.榛子花芽轉(zhuǎn)錄組文庫(kù)的Solexa 測(cè)序及冷調(diào)節(jié)基因的表達(dá)譜分析[D].北京:中國(guó)林業(yè)科學(xué)研究院,2011.

    [9] Nybom H, Bartish I V. Effects of life history traits and sampling strategies on genetic diversity estimates obtained with RAPD markers in plants [J]. Perspectives in Plant Ecology, Evolution and Systematics, 2000, 3(2):93-114.

    摘 要:本試驗(yàn)采用ISSR技術(shù)對(duì)12份櫻桃種質(zhì)資源的遺傳多樣性進(jìn)行了研究。篩選出6條ISSR引物對(duì)供試材料進(jìn)行擴(kuò)增,共檢測(cè)到48個(gè)遺傳位點(diǎn),包含44個(gè)多態(tài)性位點(diǎn),多態(tài)性位點(diǎn)百分率為91.67%。材料間遺傳相似系數(shù)為0.29~0.98,平均為0.65。當(dāng)閾值為0.58時(shí),供試樣品可分為3個(gè)組,即組Ⅰ、組Ⅱ和組Ⅲ。遺傳相似性分析結(jié)果顯示材料間具有豐富的遺傳多樣性。

    關(guān)鍵詞:櫻桃;遺傳多樣性;ISSR

    中圖分類號(hào):S662.501 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)號(hào):A 文章編號(hào):1001-4942(2014)11-0012-03

    櫻桃為薔薇科(Rosacea)李屬(Prunus)櫻桃組植物,多分布在亞洲和歐洲[1],全世界櫻桃組植物約有120種以上,主要分布于北半球溫和地帶。中國(guó)栽培櫻桃已有3000多年的歷史。我國(guó)栽培的櫻桃可分為四大類,即中國(guó)櫻桃、甜櫻桃、酸櫻桃和毛櫻桃[2],其中以中國(guó)櫻桃和甜櫻桃為主要栽培對(duì)象。我國(guó)櫻桃種質(zhì)資源豐富,華北、華中及兩廣地區(qū)皆有分布,尤以浙江、山東、河南、江蘇、陜西、四川、安徽、河北分布最多,為充分挖掘櫻桃種質(zhì)資源提供了天然條件[3,4]。

    ISSR(Inter-simple sequence repeat) 是Zietkiewitcz等于1994年發(fā)展起來的微衛(wèi)星基礎(chǔ)上的分子標(biāo)記[5],是一種簡(jiǎn)單重復(fù)序列之間擴(kuò)增多態(tài)性分子標(biāo)記。其利用基因組中有關(guān)SSR序列信息,引物的開發(fā)較SSR引物簡(jiǎn)單,且可以在不同的物種間通用,不像SSR標(biāo)記一樣具有較強(qiáng)的種屬特異性。ISSR分子標(biāo)記不僅具有SSR標(biāo)記的穩(wěn)定性且揭示的多態(tài)性較RAPD高[6,7],是一種非常理想的分子標(biāo)記技術(shù),目前已廣泛用于植物品種鑒定、遺傳作圖、遺傳多樣性及分子生態(tài)學(xué)研究。本試驗(yàn)采用ISSR標(biāo)記技術(shù)對(duì)山東省部分主栽櫻桃品種和砧木資源進(jìn)行檢測(cè),并分析其遺傳背景差異,對(duì)櫻桃資源的科研、生產(chǎn)具有重要的實(shí)際應(yīng)用價(jià)值和科學(xué)價(jià)值。

    1 材料與方法

    1.1 試驗(yàn)材料

    試驗(yàn)所用材料均于2014年4月采自山東省果樹研究所櫻桃品種資源保存圃,所用12份材料均為目前生產(chǎn)上的主要栽培品種。隨機(jī)采取健康嫩葉迅速于液氮中冷凍,放于-80℃冰箱保存?zhèn)溆?。樣品編?hào)及品種見表1。

    1.2 模板DNA的制備

    采用改良CTAB法[8]提取葉片的基因組DNA,用0.8%的瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)其質(zhì)量。稀釋DNA至終濃度10 ng/μL,-20℃儲(chǔ)存?zhèn)溆谩?/p>

    1.3 ISSR反應(yīng)

    ISSR引物委托上海生工生物工程股份有限公司合成,篩選出6條用于PCR(表2)。PCR擴(kuò)增體系為20 μL,其中10 × buffer (含Mg2+) 2 μL,2.5 mmol/L dNTPs 1.6 μL,10 μmol/L Primer 1 μL,2.5 U/μL Taq聚合酶0.4 μL,10 ng/μL DNA模板1 μL 和無菌ddH2O 14 μL。PCR 反應(yīng)程序?yàn)?5℃ 5 min;95℃ 1 min,48℃ 1 min,72℃ 1 min,35 個(gè)循環(huán);72℃ 10 min,程序結(jié)束后進(jìn)入4℃保存。PCR擴(kuò)增產(chǎn)物用1.5%瓊脂糖凝膠電泳分離檢測(cè),于紫外燈下觀察,并拍照保存。

    1.4 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析

    將所獲得的電泳譜帶進(jìn)行數(shù)字化統(tǒng)計(jì),按照?qǐng)D譜中同一位置條帶的“有”、“無”進(jìn)行統(tǒng)計(jì),有帶標(biāo)記為“1”,無帶標(biāo)記為“0”,僅記錄重復(fù)性好、條帶清晰且片段為200~750 bp 范圍內(nèi)的擴(kuò)增帶。將DNA擴(kuò)增帶數(shù)據(jù)輸入到數(shù)據(jù)矩陣,通過NTSYSpc(version 2.11 a)采用非加權(quán)類平均法(UPGMA)進(jìn)行聚類分析建立聚類圖,并計(jì)算遺傳相似系數(shù)。

    2 結(jié)果與分析

    2.1 PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的多態(tài)性分析

    6條引物均能對(duì)12份櫻桃種質(zhì)基因組DNA擴(kuò)增出清晰穩(wěn)定的多態(tài)性條帶,圖1為引物ISSR36擴(kuò)增的帶型。本試驗(yàn)共檢測(cè)到48個(gè)遺傳位點(diǎn),其中包含44個(gè)多態(tài)性遺傳位點(diǎn),多態(tài)性位點(diǎn)比率為91.67%(表2)。同一樣品的不同引物擴(kuò)增條帶數(shù)量和多態(tài)性差異較大。

    2.2 遺傳相似性

    12份櫻桃種質(zhì)個(gè)體間的相似系數(shù)為0.29~0.98,平均值為0.65。其中1與4和2與3的遺傳相似系數(shù)最大,為0.98,說明其遺傳距離最近,即親緣關(guān)系最近,5與10 的遺傳相似系數(shù)最小,僅為0.29,說明二者遺傳相似性最低,親緣關(guān)系最遠(yuǎn)。

    2.3 聚類分析

    對(duì)供試12份種質(zhì)進(jìn)行聚類分析,結(jié)果表明,品種間遺傳背景有較大的差異,遺傳多樣性豐富。在相似系數(shù)0.58處,12個(gè)品種可聚類為3個(gè)組(圖2),其中,1、4、10、2、3、11和12聚為一個(gè)分支,為組Ⅰ;5和9聚為一個(gè)分支,為組Ⅱ;6、7和8聚為一個(gè)分支,為組Ⅲ。

    3 結(jié)論

    6條ISSR 引物均能有效擴(kuò)增出多態(tài)性條帶,說明ISSR標(biāo)記是櫻桃遺傳分析的有效工具。供試12個(gè)樣品間的相似系數(shù)分布在0.29~0.98之間,ISSR標(biāo)記能將供試樣品完全區(qū)分開。品種間具有豐富的遺傳多樣性,親緣關(guān)系復(fù)雜,遺傳背景存在很大差異。物種的地理分布特征也可能影響其遺傳多樣性水平,一般而言,廣泛分布比狹域分布的物種具有更高的遺傳多樣性[9],供試櫻桃品種間表現(xiàn)出較高遺傳多樣性,可能與它們地理分布相對(duì)較廣有關(guān)。參 考 文 獻(xiàn):

    [1] 俞德浚.中國(guó)植物志[M].北京:科學(xué)出版社, 1986: 46-87.

    [2] 于亞軍,代漢萍,李寶江,等. 世界櫻桃育種進(jìn)展[J]. 果樹學(xué)報(bào),2003,20(2):135-139.

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    [4] Li M M,Cai Y L,Qian Z Q, et al. Genetic diversity and differentiation in Chinese sour cherry Prunus pseudocerasus Lindl., and its implications for conservation[J]. Genetic Resources and Crop Evolution, 2009, 56(4): 455-464.

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