李亞文,徐世元,張慶國(guó),李 樂(lè),賴(lài)露穎,鄭 艇,蘇嬌玲,楊耐梅,李元濤
(1.南方醫(yī)科大學(xué)珠江醫(yī)院麻醉科,廣州 510282;2.南方醫(yī)科大學(xué)附屬深圳婦幼保健院麻醉科,廣東深圳 518028)
長(zhǎng)期以來(lái),過(guò)表達(dá)microRNA質(zhì)粒可直接用于細(xì)胞系轉(zhuǎn)染表達(dá),是研究基因功能的重要方法。但用真核細(xì)胞構(gòu)建的表達(dá)載體在細(xì)胞轉(zhuǎn)染階段存在轉(zhuǎn)染率不高且周期長(zhǎng)等弊端,限制其廣泛應(yīng)用;而慢病毒載體是以人類(lèi)免疫缺陷型病毒(HIV)為基礎(chǔ)發(fā)展起來(lái)的基因治療載體,它既能感染分裂細(xì)胞又能感染非分裂細(xì)胞,安全性高并可以在體內(nèi)較長(zhǎng)期地表達(dá)。本實(shí)驗(yàn)所用慢病毒載體感染目的細(xì)胞后不再感染其他細(xì)胞,也不會(huì)利用宿主細(xì)胞產(chǎn)生新的病毒顆粒。
本研究通過(guò)構(gòu)建Grp78基因過(guò)表達(dá)慢病毒表達(dá)載體,為下一步感染SH-SY5Y細(xì)胞株,進(jìn)而研究Grp78在布比卡因神經(jīng)毒性所致細(xì)胞凋亡和細(xì)胞損傷中的作用奠定基礎(chǔ)。
1.1 材料 (1)主要試劑:瓊脂糖、PCR試劑盒、Taq polymerase,dNTP、限制性?xún)?nèi)切酶、質(zhì)粒抽提試劑盒。臺(tái)盼藍(lán)、胰酶、DMSO、DMEM、Lipofectamine 2000、細(xì)胞株:293T;菌株:大腸埃希菌菌株DH5α;病毒載體:GV 載體、pHelper 1.0載體、pHelper 2.0載體。(2)主要儀器:PCR儀、穩(wěn)壓DNA電泳儀、凝膠成像儀、培養(yǎng)箱、高速離心機(jī)、熒光顯微鏡、CO2培養(yǎng)箱。
1.2 方法
1.2.1 PCR擴(kuò)增目的基因 (1)載體信息:GV261;元件順序:Ubi-MCS-IRES-Cherry;克隆位點(diǎn):AgeI/NheI。(2)目的基因片段Grp78引物,上游:5′-CGG GTA CCG GTC GCC ACC ATG AAG CTC TCC CTG GTG G-3′;下 游:5′-AGT CGC TAG CCT ACA ACT CAT CTT TTT CTG CTG TAT C-3′。
1.2.2 制備感受態(tài)細(xì)胞及轉(zhuǎn)化 CaCl2法制備感受態(tài)細(xì)胞進(jìn)行轉(zhuǎn)化實(shí)驗(yàn)步驟如下:(1)各取每種感受態(tài)細(xì)胞懸液200μL轉(zhuǎn)移至無(wú)菌微量離心管中,每管加入連接液10μL,輕輕旋轉(zhuǎn)以混勻,然后置冰中放置30min。制備感受態(tài)細(xì)胞,使其具有攝取外源DNA的能力。(2)42℃熱休克90s。快速將管轉(zhuǎn)移到冰浴中冷卻細(xì)胞1~2min。每管加入800μL LB培養(yǎng)基。水浴加溫至37℃,然后放置搖床溫育45min以復(fù)蘇細(xì)菌。(4)將150μL轉(zhuǎn)化感受態(tài)細(xì)胞轉(zhuǎn)移到AMP(100μg/mL)抗性的LB瓊脂培養(yǎng)基上。把平板置于室溫直至液體被吸收。然后倒置平皿,置于37℃培養(yǎng)箱中培養(yǎng)16h。(5)克隆進(jìn)行后續(xù)PCR鑒定。
1.2.3 重組質(zhì)粒構(gòu)建 PCR產(chǎn)物連接入線性化表達(dá)載體反應(yīng)體系見(jiàn)表1,反應(yīng)條件 :25℃30min;42℃15min。
1.2.4 Lentivirus病毒包裝 消化293T細(xì)胞,調(diào)整其密度為每20mL有1.2×107個(gè)細(xì)胞,接種細(xì)胞于培養(yǎng)皿中,放置37℃,5%CO2培養(yǎng)箱中培養(yǎng)24h,待細(xì)胞密度達(dá)70%~80%時(shí)可用于細(xì)胞轉(zhuǎn)染。細(xì)胞狀態(tài)對(duì)于病毒包裝至關(guān)重要,需要保證良好的細(xì)胞狀態(tài)和較少的傳代次數(shù)。轉(zhuǎn)染前2h將含胎牛血清培養(yǎng)基更換為無(wú)血清培養(yǎng)基。向一離心管中加入制備的各DNA溶液(pGC-LV 載 體20μg、pHelper 1.0 載體15μg、pHelper 2.0載體10μg)與相應(yīng)體積培養(yǎng)基混合均勻,調(diào)整總體積為2.5mL,室溫下溫育5min。將Lipofectamine 2000試劑輕柔搖勻,取100μL Lipofectamine 2000試劑在另一管中與2.4mL Opti-MEM培養(yǎng)基混合,室溫下溫育5min。把稀釋后的DNA與稀釋后的Lipofectamine 2000進(jìn)行混合,輕顛混勻,避免振蕩,且須5min內(nèi)混合?;旌虾笫覝叵聹赜?0min,然后將混合液轉(zhuǎn)移至293T細(xì)胞培養(yǎng)液中,混合均勻,放置37℃、5%CO2培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。培養(yǎng)8h后倒去培養(yǎng)基,每瓶細(xì)胞加入20mL磷酸鹽緩沖液(PBS),以洗滌殘余混合液,移去混合液。每瓶細(xì)胞中加入含10% 胎牛血清培養(yǎng)基25mL,放置37℃,5%CO2培養(yǎng)箱內(nèi)繼續(xù)培養(yǎng)2d。
表1 PCR反應(yīng)體系
1.2.5 Lentivirus滴度測(cè)定
1.2.5.1 樣品制備 293T細(xì)胞傳代,24孔中每個(gè)孔加入1×105個(gè)細(xì)胞,體積為500μL;次日準(zhǔn)備10個(gè)無(wú)菌Ep管,每管中加90μL培養(yǎng)基;取待測(cè)病毒原液10μL加入到第一個(gè)管中,混合均勻,取混合均勻的第一管液10μL加入到第二個(gè)管中繼續(xù)相同的操作直到最后一管;選取所需細(xì)胞孔,吸去90μL培養(yǎng)基。加稀釋好的病毒溶液,放置于37℃,5%CO2培養(yǎng)箱培養(yǎng);1d后,加入新鮮培養(yǎng)基500μL。小心操作;4d后抽提RNA。
1.2.5.2 總RNA抽提 去細(xì)胞上清液,每孔加入1mL Trizol,吹打,室溫靜置5min,轉(zhuǎn)移至另一新1.5mL Ep管中。每管加200μL氯仿,用力震蕩15s,室溫下靜置15min。4℃下12000r/min離心15min。從每管中吸取上清液至另一新1.5 mL Ep管中。加入等體積-20℃預(yù)冷的異丙醇,混勻后-20℃沉淀10min。4℃下12000r/min離心10min,移去上清液。加入1mL 4℃預(yù)冷的75%乙醇,洗滌沉淀及離心管壁。4℃下10000r/min離心5min,移棄上清液。4℃下10000 r/min再次離心5min,吸去殘液,室溫下干燥,不需完全干燥。加20μL無(wú)RNA酶(RNase)水至完全溶解,紫外分析測(cè)定所抽提RNA濃度。
1.2.5.3 RNA逆轉(zhuǎn)錄獲cDNA 將1μL Oligo dT(0.5μg/μL)和2.0μg總RNA加入PCR小管,補(bǔ)焦碳酸二乙酯(DEPC)水至9μL?;旌暇鶆?、離心,70℃溫浴10min。緊接著插入到0℃冰水浴中。按下表比例,根據(jù)反應(yīng)管數(shù)算出所需試劑量。將M-MLV酶等在冰上混勻得到逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)液。在每個(gè)反應(yīng)管中加11μL逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)液,混合均勻后離心。其中,11μL逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)液含5×逆轉(zhuǎn)錄緩沖液4μL、10mmol/L dNTPs 2μL、RNA 抑制劑 0.5μL、M-MLV-RTase 1μL、DEPC水3.5μL。在42℃進(jìn)行1h完成逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng),后用70℃處理10min使逆轉(zhuǎn)錄酶失活。逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)產(chǎn)物cDNA可用于PCR,也可-80℃長(zhǎng)期保存。
1.2.5.4 實(shí)時(shí)定量PCR檢測(cè) 實(shí)時(shí)定量PCR在Takara的TP800PCR儀上完成。配置反應(yīng)體系:每管加入SYBR premix ex Taq 10μL、上游引物(5μmol/L)1.0μL、下游引物(5μmol/L)1.0μL、cDNA 1.0μL、ddH2O 7.5μL。設(shè)定程序?yàn)閮刹椒▽?shí)時(shí)定量PCR。預(yù)變性95℃5s;變性95℃5s,退火60℃30s,延伸60℃30s,40個(gè)循環(huán)。每次在延伸階段讀取吸光值,用于制作熔解曲線。PCR結(jié)束后,在95℃變性1 min。然后冷卻至55℃,使DNA雙鏈充分聚合。從55℃開(kāi)始到95℃,每一步增加0.5℃,保持30s,同時(shí)讀取吸光值。兩個(gè)循環(huán)后將調(diào)定點(diǎn)升高0.5℃。
2.1 重組質(zhì)粒構(gòu)建結(jié)果 陽(yáng)性轉(zhuǎn)化子PCR產(chǎn)物大?。?10 bp,見(jiàn)圖1。
圖1 PCR鑒定轉(zhuǎn)化結(jié)果電泳圖
2.2 病毒的收獲及濃縮 收集轉(zhuǎn)染后2d的293T細(xì)胞上清液。4℃、4000×g離心10min,以除去細(xì)胞碎片。用0.45 μm過(guò)濾器過(guò)濾上清液到40mL超速離心管中。把病毒粗提液樣品加入過(guò)濾杯中。將過(guò)濾杯插到濾過(guò)液收集管中,再4000×g離心至所需病毒濃縮體積,時(shí)間15min。離心結(jié)束后取出離心裝置,將過(guò)濾杯和濾過(guò)液收集杯分開(kāi)。將過(guò)濾杯倒扣在樣品收集杯上,離心力不超過(guò)1000×g,時(shí)間2min。過(guò)高轉(zhuǎn)速會(huì)使樣品損失。把過(guò)濾杯從樣品收集杯上移開(kāi)。樣品收集杯中即為病毒濃縮液。將病毒濃縮液移出,進(jìn)行分裝;取其中一支進(jìn)行滴度測(cè)定,其余置-80℃長(zhǎng)期保存。
2.3 實(shí)時(shí)定量PCR法測(cè)定綠色熒光蛋白標(biāo)記的慢病毒滴度
圖2 實(shí)時(shí)定量PCR曲線圖
2.3.1 引物信息 綠色熒光蛋白(GFP)引物:被擴(kuò)增的片段位于211~496bp之間,其上游引物序列為5′-TGC TTC AGC CGC TAC CC-3′,熔點(diǎn)Tm為57.4℃,GC百分含量為64.7%。下游引物序列為5′-AGT TCA CCT TGA TGC CGT TC-3′,熔點(diǎn)Tm為57.3℃,GC百分含量為50.0%。β-actin被擴(kuò)增的片段位置位于932~1233bp之間,其上游引物序列為5′-GTG GAC ATC CGC AAA GAC-3′,熔點(diǎn) Tm 為52.6℃,GC百分含量為55.6%。下游引物序列為5′-AAA GGG TGT AAC GCA ACT A-3′,熔點(diǎn)Tm為51.0℃,GC百分含量為42.1%。
2.3.2 實(shí)時(shí)定量PCR結(jié)果 在該次病毒滴度檢測(cè)中,1.00E-03μL組樣品與對(duì)照組樣品的Ct值差異大于3以上,故認(rèn)定病毒顆粒存在于1.00E-03μL組樣品中。見(jiàn)圖2。
2.4 β-actin、GFP熔解曲線 見(jiàn)圖3。
圖3 β-actin、GFP熔解曲線
通過(guò)慢病毒載體的構(gòu)建、包裝,得到穩(wěn)定表達(dá)的質(zhì)粒;該質(zhì)粒能有效應(yīng)用于研究Grp78基因過(guò)表達(dá)來(lái)減少細(xì)胞內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激反應(yīng)[1]。該質(zhì)粒較采用真核細(xì)胞轉(zhuǎn)染得到的質(zhì)粒感染細(xì)胞的成功率高[2-3]。觀察 GFP表達(dá)情況[4-5],在加入 1E-5μL病毒原液的孔中觀察到3個(gè)細(xì)胞存活,說(shuō)明該孔中至少有3病毒顆粒感染細(xì)胞,且認(rèn)為該病毒的滴度等于帶有熒光的細(xì)胞數(shù)除以病毒原液量。在加入1E-6μL病毒原液的孔中觀察到2個(gè)帶有熒光的細(xì)胞,說(shuō)明該孔中至少有2個(gè)病毒顆粒感染細(xì)胞,且認(rèn)為該病毒的滴度等于帶有熒光的細(xì)胞數(shù)除以病毒原液量,即2/(1E-6)=2E+6,單位為 TU/μL,也就等于2E+9 TU/mL。
加入不同病毒量的細(xì)胞樣品,通過(guò)提取總RNA后反轉(zhuǎn)錄為cDNA,然后進(jìn)行定量PCR檢測(cè),通過(guò)對(duì)照組與實(shí)驗(yàn)組的Ct值差異來(lái)判斷滴度值。通常情況下認(rèn)為Ct值差異2以上存在顯著差異[6]。反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)所獲得20μL cDNA中只取1μL用于實(shí)時(shí)定量PCR檢測(cè),該結(jié)果僅表示1/20樣品的情況,所以在滴度計(jì)算時(shí)乘以系數(shù)20。
退火溫度偏低,可引起非特異性擴(kuò)增。適當(dāng)提高退火溫度可降低非特異性擴(kuò)增。故通過(guò)測(cè)量升高溫度后熒光的變化可以幫助降低非特異產(chǎn)物的影響。非特異性條帶的出現(xiàn),原因諸多,引物與靶序列不完全互補(bǔ)、或引物聚合形成二聚體、退火溫度過(guò)低、PCR循環(huán)次數(shù)過(guò)多等。針對(duì)解決措施有降低引物量、減少循環(huán)次數(shù)、適當(dāng)提高退火溫度或采用二溫度點(diǎn)法(93℃變性,65℃左右退火與延伸)。熔解曲線中,由于SYBR GreenⅠ與所有雙鏈DNA相結(jié)合,引物二聚體、單鏈二級(jí)結(jié)構(gòu)以及錯(cuò)誤的擴(kuò)增產(chǎn)物引起的假陽(yáng)性會(huì)影響定量精確性。故由熔解曲線來(lái)分析產(chǎn)物的均一性更有助于準(zhǔn)確分析SYBR Green實(shí)時(shí)定量 PCR 結(jié)果[7-13]。
設(shè)立適當(dāng)?shù)年?yáng)性對(duì)照和陰性對(duì)照,陽(yáng)性對(duì)照以能出現(xiàn)擴(kuò)增條帶的最低量標(biāo)準(zhǔn)病原體核酸為宜,注意交叉污染可能。每次反應(yīng)都應(yīng)有一管不加模板的試劑對(duì)照及相應(yīng)不含有被擴(kuò)增核酸的樣品作陰性對(duì)照。PCR結(jié)束后,根據(jù)發(fā)生過(guò)程中熒光值變化繪出每個(gè)樣品的熔解曲線。熔解曲線是擴(kuò)增反應(yīng)的質(zhì)控途徑,圖中沒(méi)有出現(xiàn)雜峰,也未出現(xiàn)主峰的異常增寬,表明實(shí)驗(yàn)中未出現(xiàn)污染、引物二聚體和非特異性擴(kuò)增。不同的擴(kuò)增產(chǎn)物因?yàn)槠溟L(zhǎng)度和GC含量不同而在不一樣的溫度下解鏈,當(dāng)產(chǎn)物解鏈時(shí),SYBR GreenⅠ的熒光值將降低并被儀器所監(jiān)測(cè)。繪制熔解曲線時(shí),需實(shí)時(shí)定量PCR儀連續(xù)監(jiān)測(cè)每個(gè)樣品在從雙鏈完全配對(duì)到完全解鏈的升溫過(guò)程中熒光值的變化,由此繪制出熒光強(qiáng)度隨溫度變化的負(fù)一次倒數(shù)圖。熒光強(qiáng)度變化的拐點(diǎn)(熔點(diǎn),Tm)即為熔解峰值。Grp78過(guò)表達(dá)病毒載體的構(gòu)建和包裝成功,為今后研究Grp78基因在布比卡因所致神經(jīng)細(xì)胞損傷中的作用奠定基礎(chǔ),進(jìn)而為布比卡因神經(jīng)毒性的防治打開(kāi)一扇科學(xué)之門(mén)。
[1]李亞文,徐世元,張慶國(guó),等.高糖環(huán)境誘導(dǎo)SH-SY5Y細(xì)胞ROS爆發(fā)-內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激增強(qiáng)布比卡因神經(jīng)毒性[D].廣州:南方醫(yī)科大學(xué),2013.
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