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      非綜合征型聾患兒SLC26A4基因突變分析*

      2013-12-23 04:44:14戴翔李雋胡晞江童靜向萍霞劉翎冷培
      聽力學及言語疾病雜志 2013年5期
      關鍵詞:外顯子單側耳聾

      戴翔 李雋 胡晞江 童靜 向萍霞 劉翎 冷培

      耳聾是一種嚴重影響人類生活質量的常見疾病,在世界范圍內,每1 000名新生兒中就有1名耳聾患兒,50%患兒的耳聾與遺傳因素有關[1]。在遺傳性聾中,綜合征型聾(syndromic hearing loss,SHL)占30%,非綜合征型聾(non-syndromic hearing loss,NSHL)占70%,在引起NSHL的常見致病基因中,SLC26A4基因突變是僅次于GJB2基因突變而引起常染色體隱性遺傳非綜合征型聾的致病因素[2],與前庭水管擴大(large vestibular aqueduct,LVA)密切相關。本研究擬對137例散發(fā)非綜合征性聾患者進行SLC26A4 基因突變檢測,探討其耳聾的可能病因及SLC26A4基因突變規(guī)律。

      1 資料與方法

      1.1 研究對象 研究對象為經武漢市婦女兒童醫(yī)療保健中心耳鼻咽喉科確診的137例非綜合征型聾患者(耳聾組),男73例,女64例,年齡6個月~13歲,平均3.8±3.1歲。其中,雙側聾119例,單側聾18例;LVA 患者22例,其中雙側LVA 20例,單側LVA 2例。1例患者(表1 中編號111103)除聽力損失外,曾有腎母細胞瘤病史及治療史,尿液pH 值5.0,較正常范圍低,其他系統(tǒng)未見明顯異常。其他患者均無其他系統(tǒng)異常,無家族遺傳病史,無傳染病史,無耳毒性藥物應用史。選取聽力正常且其他系統(tǒng)無明顯異常者126例作為正常對照組,男女各63例,年齡3~34歲,平均12.7±10.6歲。根據(jù)知情同意原則,對受檢者采集外周血樣本以枸櫞酸鈉抗凝備查,該項目的倫理論證由武漢市婦女兒童醫(yī)療保健中心倫理委員會認可。

      1.2 研究方法

      1.2.1 聽功能與影像學檢查 根據(jù)受檢者年齡及配合程度,對耳聾患者分別進行純音測聽及聽性腦干反應(ABR)檢查,聽力損失程度分級標準[3]:輕度為20~40dB HL、中度為41~70dB HL、重度為71~95dB HL、極重度為>95dB HL。對患者進行顳骨CT 檢查,從半規(guī)管總腳到前庭水管外口的1/2處直徑大于1.5mm 即診斷為LVA。

      1.2.2 基因組DNA 提取與PCR 反應 應用Ge-nomic DNA Purification Kit(Promega公司)從受檢者外周血樣本中提取基因組DNA,經紫外分光光度計定量及純度分析后,保存于-20 ℃?zhèn)溆谩?/p>

      擴增耳聾組和正常對照組所有對象的SLC26A4基因全部21個外顯子,外顯子1的引物及PCR 反應條件參見Coyle等的研究[4],其余外顯子的引物及反應條件參考文獻報道[5],引物由上海生工公司合成。PCR 反應體系(50μl):5xBuffer 10μl,dNTP 1μl,Mg2+5μl,Taq酶1.25U,均由Promega公司提供,引物1μl,DNA 200ng,加去離子水至50μl。PCR 反應在ABI公司9700型熱循環(huán)儀上完成,PCR產物經瓊脂糖凝膠電泳檢測分析。

      1.2.3 DNA 測序與數(shù)據(jù)分析 應用Cycle-Pure Kit純化試劑盒(OMEGA 公司)對PCR 產物進行純化。應用ABI公司3130型基因分析儀進行正反向直接測序,引物與PCR 引物相同。測序結果經Sequencing Analysis 5.2分析,并通過GeneTool與來自NCBI的SLC26A4基因標準序列進行比對,確定突變位點。

      2 結果

      137例耳聾患者中23例檢出SLC26A4基因突變,占16.79%(23/137);119 例雙側耳聾患者中SLC26A4突變患者約占19.33%(23/119);18例單側耳聾患者中未檢出SLC26A4基因致病突變。126例正常對照組中未檢出SLC26A4基因致病突變。

      耳聾組中20 例確診為雙側LVA,2 例為單側LVA;雙側LVA 患者中SLC26A4基因突變19例,約占95.0%(19/20)(表1);單側LVA 患者中未檢出SLC26A4基因致病突變。

      表1 23例SLC26A4基因突變患者的耳聾程度、CT 顯示LVA 和基因檢測結果

      本研究共發(fā)現(xiàn)11種SLC26A4基因突變,包括4種國際上尚未報道的突變:E29K(c.85G>A)、R79X(c.235C>T)、C282G(c.844T>G)和V285I(c.853G>A)(圖1);7種已報道突變:IVS7-2A>G、G197R、K440X、S532R、IVS15+5G>A、D669V 和H723R。IVS7-2A>G 突變患者在所有SLC26A4基因突變患者中約占82.61%(19/23),在雙側LVA 患者中占89.47%(17/19);H723R 突變在所有SLC26A4基因突變患者中約占13.04%(3/23),在雙側LVA 患者中占15.79%(3/19);其他突變均只有一例患者。多個物種的Pendrin蛋白在進行同源性比對后,發(fā)現(xiàn)4種新發(fā)現(xiàn)的突變均位于保守區(qū)。

      3 討論

      SLC26A4基因定位于7q31,屬于離子轉運體家族,介導I-/Cl-的轉運[6]。小鼠動物模型研究結果顯示,SLC26A4基因最早在胚胎期11 天表達于內耳的內淋巴囊,對聽力表型的發(fā)育至關重要[7]。人類SLC26A4基因突變及其表達異常與聽力損失和內耳結構異常密切相關。SLC26A4基因突變是僅次于GJB2突變而引起常染色體隱性遺傳非綜合征型聾的致病因素,與LVA 和Pendred綜合征密切相關。本研究耳聾組中SLC26A4突變檢出率為16.79%(23/137),在雙側耳聾患者中約占19.33%(23/119),與很多報道結果相近[2,7];Wang 等[8]研究發(fā)現(xiàn)中國的大前庭水管患者中SLC26A4基因突變檢出率為97.9%,本研究中雙側LVA 患者中SLC26A4基因突變檢出率為95%(19/20),說明SLC26A4基因突變是中國人NSHL 的常見病因,同時也是引起國人LVA 的主要病因。

      SLC26A4基因突變類型繁多,分布于各個外顯子或其側翼序列,可以表現(xiàn)為一致的純合突變,也可以為任意兩種突變的組合,呈復合雜合型突變。迄今為止,在SLC26A4 基因發(fā)現(xiàn)突變位點超過200個(http://www.hgmd.cf.ac.uk/ac/gene.php?gene=SLC26A4),并且具有明顯的種族差異,歐洲人以L236P和T416P最為常見[9],而中國人、日本人和蒙古人最常見的突變類型分別為IVS7-2A>G、H723R 和L676Q[10]。本組病例檢測出的突變類型中,IVS7-2A>G 和H723R 是國人LVA 患者中最常見的突變類型,分別占89.47%(17/19)和15.79%(3/19)。IVS7-2A>G 位于外顯子8剪切位點的位置,即內含子7的3’末端,其突變使前體mRNA 不能正常剪接,從而導致Pendrin的翻譯發(fā)生移框或提前終止,影響Pendrin 的結構和功能[11],這在IVS7-2A>G 突變轉基因小鼠的研究中也得到證實[12]。H723R 突變使該位置正常的組氨酸變成精氨酸,影響Pendrin 的表達而致?。?3]。由于IVS7-2A>G 和H723R 在國人LVA 患者中的高突變率,因此,將這兩個位點的檢查作為新生兒耳聾基因篩查的必查項目,已經成為國內學者研究的共識[5,14]。

      SLC26A4基因突變的臨床表型差異很大,有時同一種突變型在歐美人群中常表現(xiàn)為LVA 合并甲狀腺腫的SHL,而在東亞人中卻常表現(xiàn)為僅合并LVA 的NSHL,少見甲狀腺異常。即使在同一種人群中,SLC26A4基因突變所引起的聽力損失程度、前庭水管擴大程度和甲狀腺異常的情況也存在差異。目前,無論是在Pendred綜合征,還是在非綜合征型LVA 中,都沒有發(fā)現(xiàn)其臨床表型與SLC26A4基因型之間的直接關系。耳聾、LVA 和甲狀腺異常的表型與SLC26A4基因突變的個數(shù)有關[15],本研究中編號110206和120805的患者檢出單等位基因IVS7-2A>G 雜合突變,CT 結果正常,則進一步證實單等位基因突變不足以引起LVA。有些LVA病例在SLC26A4基因外顯子編碼區(qū)及側翼序列中只檢出一個致病突變,很可能在其內含子或調控區(qū)還存在第二個不易被檢測到的致病突變;而那些沒有檢測出SLC26A4基因突變的LVA 患者的發(fā)病原因可能就更加復雜了,如:SLC26A4基因表觀遺傳改變、SLC26A4基因以外其他致病基因、病原體感染等非遺傳因素[15]。本研究中,僅有一例雙側LVA 患者未檢出SLC26A4基因突變,其病因可能為上述因素中的一種,也可能為多種因素共同作用所至;2例患者(編號為110301和110801)檢出單個SLC26A4基因突變,由于沒有CT 結果而無法證實是否為LVA,且檢出突變是否為致病突變仍未確定,因此,這2例患者的耳聾病因是否與SLC26A4基因突變有關還有待進一步研究。另外,2 例單側LVA 患者均未檢出SLC26A4基因突變,目前,尚無研究證明單側LVA 與SLC26A4 基因突變有關。本研究中的19 例雙側LVA 均檢出雙等位基因SLC26A4突變,其聽力損失程度為中度到極重度,均未見甲狀腺異常;1例患者(編號120503)基因型為IVS7-2A>G/G197R 復合雜合突變,聽力損失為中度,其CT 顯示的LVA 不象典型的LVA 那樣前庭水管外口大而中段小,反而是外口小于中段。

      SLC26A4基因突變型與臨床表型的多樣性,說明該疾病的發(fā)病機制復雜,還有待深入研究。另外,值得一提的是,SLC26A4基因在腎臟中也有表達,然而在由SLC26A4基因突變導致耳聾的患者中卻很少見腎功能明顯異常,提示在腎臟中,依賴Pendrin的離子轉運受到其他機制的保護[16]。本研究中1例LVA 患者(編號111103)曾患有腎母細胞瘤,經手術治療后病情穩(wěn)定,其尿液pH 值5.0,較正常范圍低,是否與SLC26A4 基因突變有關還需進一步研究。

      新突變的發(fā)現(xiàn)對完善國人SLC26A4基因突變圖譜具有重要意義。本研究新發(fā)現(xiàn)的基因突變中,R79X 屬無意突變,導致Pendrin 蛋白合成提前終止,是明確的致病突變;E29K 屬錯義突變,并且和R79X 在同一個明確LVA 表型的患者中形成復合雜合突變,屬致病突變的可能性極大;C282G 和V285I均屬錯義突變,且均位于保守區(qū),同時在126例正常對照組中未檢出,可能屬致病突變,然而攜帶這兩種突變的患者均屬于單等位基因突變,且是否為LVA 無法確定,其致病性有待進一步研究。今后的工作將圍繞新突變展開功能研究,為闡明SLC26A4基因突變的致病機制提供依據(jù),并為完善耳聾分子診斷奠定基礎。

      1 劉學忠,歐陽小梅,Denise Y,等.中國人群遺傳性耳聾研究進展[J].中華耳科學雜志,2006,4:81.

      2 Smith RJ.Clinical application of genetic testing for deafness[J].Am J Med Genet A,2004,130(A):8.

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      4 Coyle B,Reardon W,Herbrick JA,et al.Molecular analysis of the PDS gene in Pendred syndrome[J].Hum Mol Genet,1998,7:1 105.

      5 袁永一,王國建,戴樸,等.大前庭水管相關SLC26A4基因熱點突變區(qū)域篩查方案探討[J].中華耳科學雜志,2010,8:292.

      6 Scott DA,Wang R,Kreman TM,et al.The Pendred syndrome gene encodes a chloride-iodide transport protein[J].Nat Genet,1999,21:440.

      7 Wangemann P.The role of Pendrin in the development of the murine inner ear[J].Cell Physiol Biochem,2011,28:527.

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      10 Wu CC,Yeh TH,Chen PJ,et al.Prevalent SLC26A4mutations in patients with enlarged vestibular aqueduct and/or mondini dysplasia:a unique spectrum of mutations in Taiwan,including a frequent founder mutation[J].Laryngoscope,2005,115:1 060.

      11 Park HJ,Shaukat S,Liu XZ,et al.Origins and frequencies of SLC26A4(PDS)mutations in east and south Asians:global implications for the epidemiology of deafness[J].J Med Genet,2003,40:242.

      12 Lu YC,Wu CC,Shen WS,et al.Establishment of a knock-in mouse model with the SLC26A4c.919-2A>G mutation and characterization of its pathology[J].PloS One,2011,6:e22 150.

      13 Yang JJ,Tsai CC,Hsu HM,et al.Hearing loss associated with enlarged vestibular aqueduct and Mondini dysplasia is caused by splice-site mutation in the PDS gene[J].Hear Res,2005,199:22.

      14 李雋,歷建強,王秋菊,等.678例新生兒聽力和聾病易感基因聯(lián)合篩查結果分析[J].聽力學及言語疾病雜志,2010,18:419.

      15 Ito T,Choi BY,King KA,et al.SLC26A4genotypes and phenotypes associated with enlargement of the vestibular aqueduct[J].Cell Physiol Biochem,2011,28:545.

      16 Lang F,Vallon V,Knipper M.Functional significance of channels and transporters expressed in the inner ear and kidney[J].Am J Physiol Cell Physiol,2007,293:1 187.

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