于海龍,儲(chǔ)國(guó)棟,詹梅
(江蘇省宿遷市公安局物證鑒定所,江蘇宿遷 223800)
蘇北地區(qū)漢族人群19個(gè)Y-STR基因座的遺傳多態(tài)性
于海龍,儲(chǔ)國(guó)棟,詹梅
(江蘇省宿遷市公安局物證鑒定所,江蘇宿遷 223800)
法醫(yī)遺傳學(xué);多態(tài)現(xiàn)象,遺傳;Y-STR;蘇北;漢族
Y染色體短串聯(lián)重復(fù)序列(Y-STR)作為常用的Y染色體特異遺傳標(biāo)記,在法醫(yī)學(xué)個(gè)體識(shí)別、親子鑒定、混合斑中男性成分檢測(cè)、追溯父系遷移歷史[1]等方面都具有獨(dú)特的應(yīng)用價(jià)值,是常染色體及mtDNA的重要補(bǔ)充。本研究調(diào)查了蘇北地區(qū)642名漢族無(wú)關(guān)男性個(gè)體的19個(gè)Y-STR基因座的遺傳多態(tài)性,以期為該群體的DNA檢驗(yàn)鑒定提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。
1.1 樣本
收集保存于FTA卡上的642名蘇北地區(qū)漢族無(wú)關(guān)男性個(gè)體血樣,分別用打孔器取直徑1.0mm血樣。
1.2 樣本擴(kuò)增和檢測(cè)
對(duì)19個(gè)Y-STR基因座(DYS391、DYS389Ⅰ、DYS390、DYS389Ⅱ、DYS438、DYS456、Y-GATA-H4、DYS388、DYS447、DYS19、DYS392、DYS393、DYS460、DYS439、DYS635、DYS448、DYS458、DYS437、DYS385a/b),采用GoldeneyeTMDNA 20Y試劑盒[基點(diǎn)認(rèn)知技術(shù)(北京)有限公司],按照操作說(shuō)明書進(jìn)行PCR擴(kuò)增,反應(yīng)總體系為10μL,PCR產(chǎn)物在3130XL型遺傳分析儀(美國(guó)AB公司)上進(jìn)行毛細(xì)管電泳,運(yùn)用GeneMapper ID v3.2軟件進(jìn)行自動(dòng)基因分型。
1.3 統(tǒng)計(jì)分析
應(yīng)用直接計(jì)數(shù)法計(jì)算19個(gè)Y-STR基因座的等位基因頻率與單倍型頻率?;蚨鄻有裕╣ene diversity,GD)按照公式GD=n(1-ΣPi2)/(n-1)計(jì)算,其中n為樣本數(shù),Pi為各等位基因或單倍型頻率[2]。
對(duì)蘇北地區(qū)642名漢族無(wú)關(guān)男性個(gè)體樣本進(jìn)行檢驗(yàn),得到各Y-STR基因座的等位基因分布情況(表1)。在642例樣本中觀察到619種單倍型,其中599種單倍型只觀測(cè)到1次,17種單倍型觀測(cè)到2次,3種單倍型觀測(cè)到3次(表1)。
19 個(gè)Y-STR基因座的GD值分布范圍是0.4117 (DYS438)~0.9762(DYS385a/b),大部分基因座GD值高于0.7(表2)。結(jié)果表明,19個(gè)Y-STR基因座在蘇北地區(qū)漢族人群中有較好的多態(tài)性,適合法醫(yī)學(xué)應(yīng)用。
表1 蘇北地區(qū)漢族人群19個(gè)Y-STR基因座等位基因頻率(n=642)
續(xù)表1
表2 蘇北地區(qū)漢族人群19個(gè)Y-STR基因座GD值(n=642)
[1]孟祥寧,薛雅麗,傅松濱.利用Y染色體進(jìn)行人類起源和進(jìn)化分析[J].國(guó)外醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)分冊(cè),2003,26(2):63-66.
[2]Roewer L,Arnemann J,Spurr NK,et al.Simple repeat sequences on the human Y chromosome are equally polymorphic as their autosomal counterparts[J].Hum Genet,1992,89(4):389-394.
DF795.2
B
10.3969/j.issn.1004-5619.2013.06.019
1004-5619(2013)06-0468-02
2013-06-03)
(本文編輯:李成濤)
于海龍(1976—),男,河北辛集人,主檢法醫(yī)師,主要從事法醫(yī)物證及DNA檢驗(yàn)與研究;E-mail:yhailongyx@gmail.com