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    耗散粒子動(dòng)力學(xué)中Lees-Edwards邊界條件的實(shí)施

    2012-12-03 03:49:58金亞斌張明焜
    關(guān)鍵詞:元胞鏡像邊界條件

    陳 碩,金亞斌,張明焜,尚 智

    (1.同濟(jì)大學(xué) 航空航天與力學(xué)學(xué)院,上海200092;2.高性能計(jì)算研究所,A*STAR,新加坡138632)

    Lees-Edwards邊界條件(簡(jiǎn)稱(chēng)LE)最初在分子動(dòng)力學(xué)中模擬簡(jiǎn)單剪切流動(dòng)[1],該邊界條件的特點(diǎn)是在不需要固體壁面拖動(dòng)的情況下在準(zhǔn)無(wú)限大流體系統(tǒng)中獲得定常的剪切率.

    基于粒子的數(shù)值模擬方法中,密集排列的粒子一般會(huì)對(duì)近壁面區(qū)域內(nèi)流體密度、溫度等參量有一定的影響,進(jìn)而影響到流動(dòng)的主體.LE 方法在邊界附近的區(qū)域內(nèi)則不會(huì)出現(xiàn)物理參數(shù)的數(shù)值反常波動(dòng).LE 邊界條件其原理也適合于基于粒子的其他模擬方法,最近Lorenz等[2],Wagner等[3]研究了LE邊界條件在格子-波爾茲曼方法(簡(jiǎn)稱(chēng)LB)中的實(shí)施,并模擬了懸浮液的剪切流動(dòng)等.

    將從微觀(guān)、介觀(guān)到宏觀(guān)不同層次及尺度的模擬聯(lián)系起來(lái)正成為計(jì)算機(jī)模擬領(lǐng)域最富挑戰(zhàn)性的重要課題.介觀(guān)模擬更是一項(xiàng)為實(shí)現(xiàn)“第一原理預(yù)計(jì)物質(zhì)宏觀(guān)性質(zhì)”奠定物理基礎(chǔ)的關(guān)鍵技術(shù)[4],而發(fā)展適宜的介觀(guān)尺度的流體模擬技術(shù)是近年來(lái)國(guó)際計(jì)算機(jī)模擬領(lǐng)域的熱點(diǎn)[5],其特征為在分子尺度上進(jìn)行粗?;幚恚春雎宰罴?xì)節(jié)的分子結(jié)構(gòu)),而在介觀(guān)尺度上捕捉流體的物理特性.

    耗散粒子動(dòng)力學(xué)(簡(jiǎn)稱(chēng)DPD)是一門(mén)新興的基于粒子的介觀(guān)尺度數(shù)值模擬技術(shù),于1992 年首次由Hoogerbrugge和Koelman提出[6].盡管DPD 不如LB計(jì)算省時(shí),但是DPD 比LB 靈活得多,尤其不會(huì)象LB那樣在很多情況下出現(xiàn)數(shù)值不穩(wěn)定性[7].另一方面,DPD 又可以理解為宏觀(guān)的微分流動(dòng)控制方程在小尺度上的隨機(jī)描述,從這個(gè)意義上說(shuō),DPD 方法是連接微觀(guān)分子動(dòng)力學(xué)方法和宏觀(guān)流體力學(xué)方法的一座橋梁.

    DPD 已經(jīng)成功地應(yīng)用于對(duì)復(fù)雜流體和復(fù)雜流動(dòng)過(guò)程的模擬[8-13],其中包括早期的DPD算法結(jié) 合LE邊界條件獲得簡(jiǎn)單剪切流動(dòng)[6,14].隨著DPD 中計(jì)算方法的改進(jìn),在DPD 中實(shí)施LE邊界條件,需要將LE條件與DPD 中所采用的velocity-Verlet算法以及元胞分割方法等結(jié)合起來(lái)考慮.本文結(jié)合上述算法詳細(xì)討論了LE條件在DPD 方法中的實(shí)施過(guò)程,并對(duì)在LE 邊界條件下所獲得的速度、密度、壓強(qiáng)、剪切應(yīng)力等參數(shù)的分布進(jìn)行了比較分析與討論.通過(guò)提高耗散力系數(shù)來(lái)模擬較高的Schmidt數(shù)流體,結(jié)果表明在高耗散率條件下,在耗散粒子動(dòng)力學(xué)中應(yīng)用Lees-Edwards邊界條件仍然有效.

    1 耗散粒子動(dòng)力學(xué)

    1.1 耗散粒子動(dòng)力學(xué)理論模型

    基于牛頓運(yùn)動(dòng)方程,DPD 系統(tǒng)中粒子的位置和速度隨時(shí)間的變化規(guī)律為

    式中:ri和vi為第i個(gè)粒子的位置和速度矢量;t為時(shí)間;fi為所有其他粒子(不包括粒子i本身)作用在粒子i上的力;Fe為粒子所受到的其他外力如高分子鏈的彈性力等.DPD 系統(tǒng)中單位質(zhì)量為單個(gè)粒子的質(zhì)量,因此作用在每個(gè)粒子上的力的大小等于粒子的加速度值.粒子之間的動(dòng)力相互作用由耗散力和隨機(jī)力組成.

    fi包括保守力FC,ij、耗散力FD,ij和隨機(jī)力FR,ij三部分,其中每一部分都表示粒子之間的兩兩相互作用.

    式中的求和符號(hào)對(duì)一定的截?cái)喟霃絩c內(nèi)所有的不包括粒子i的其他粒子進(jìn)行求和.如果粒子之間的距離rij>rc,則粒子之間的相互作用為零.

    保守力FC,ij為作用在2個(gè)粒子質(zhì)心連線(xiàn)方向上的粒子之間的排斥力,可表示為

    式中:aij為保守力系數(shù),表示粒子i與粒子j間最大的排斥力值;rij=ri-rj,rij=|rij|,r^ij=rij/|rij|.粒子j作用在粒子i上的耗散力(或者阻力)FD,ij可以表達(dá)為

    式中:γ為耗散系數(shù);wD為與粒子間距離rij有關(guān)的權(quán)函數(shù),當(dāng)rij≥rc時(shí),wD=0;vij為粒子之間相對(duì)速度,vij=vi-vj.隨機(jī)力FR,ij可表達(dá)為

    式中:σ為隨機(jī)力系數(shù);wR為與粒子之間距離rij有關(guān)的權(quán)函數(shù),稱(chēng)為隨機(jī)力權(quán)函數(shù),當(dāng)rij≥rc時(shí),wR=0;ξij為 隨 機(jī) 變 量,其 平 均 值 為 零 且 方 差 為Δt-1,Δt為時(shí)間步長(zhǎng).與保守力一樣,隨機(jī)力和耗散力也作用在粒子質(zhì)心的連線(xiàn)方向.

    Espa?ol等[15]研究表明,式(4)和(5)中的2 個(gè)權(quán)函數(shù)相互關(guān)聯(lián),兩者只能任取一個(gè),其相互關(guān)系為

    γ和σ也相互關(guān)聯(lián),兩者也只能任取一個(gè)

    式中:kB為Boltzmann常 數(shù),T為 溫 度,kBT為 系 統(tǒng)的Boltzmann溫度,與系統(tǒng)的漲落-耗散理論相類(lèi)似[16].將kBT作為能量的單位,則有

    Fan等[17]的研究表明,采用平方根的權(quán)函數(shù)有利于提高DPD 系統(tǒng)的Schmidt數(shù),因此本文中采用改進(jìn)的權(quán)函數(shù)表達(dá)式,即rc取單位長(zhǎng)度,即rc=1.

    1.2 粒子間作用力的計(jì)算

    在DPD 中如何恰當(dāng)選取方法計(jì)算粒子間相互作用力將在很大程度上影響整個(gè)模擬所花費(fèi)的時(shí)間,元胞分割法(cell subdivision)[18]不 失為一種高效的方法.如圖1所示,計(jì)算區(qū)域被劃分為一系列的元胞區(qū)域,每個(gè)元胞的邊長(zhǎng)均大于rc.計(jì)算區(qū)域內(nèi)的各DPD 粒子處于不同的元胞區(qū)域內(nèi).顯然,粒子之間的相互作用僅僅發(fā)生在處于同一個(gè)元胞內(nèi)的粒子之間以及分別處于2個(gè)緊鄰的元胞內(nèi)的粒子之間;否則,粒子之間的相互距離必定大于rc,從而可以不考慮其相互作用.因此,在計(jì)算某個(gè)粒子與周?chē)W拥南嗷プ饔脮r(shí),可以只計(jì)算該粒子與其屬于同一個(gè)元胞內(nèi)的其他粒子之間的相互作用以及該粒子與緊鄰的周?chē)麅?nèi)的粒子的相互作用.這樣的方法,避免了所求解的粒子與計(jì)算區(qū)域內(nèi)的粒子之間全部求解相互作用力,可以大幅節(jié)約計(jì)算工作量.

    由于粒子間相互作用力的對(duì)稱(chēng)性,因此可以?xún)H考慮相鄰的元胞中的一半數(shù)目,對(duì)于二維問(wèn)題來(lái)說(shuō),是5個(gè)元胞(含中心元胞本身);對(duì)于三維問(wèn)題來(lái)說(shuō),是14個(gè)元胞(同樣也含中心元胞本身).對(duì)于周期性邊界條件,相鄰的鏡像元胞也必須計(jì)算在內(nèi).這些細(xì)節(jié),在與LE邊界條件的結(jié)合中必須仔細(xì)考慮.

    1.3 數(shù)值積分算法

    圖1 元胞分割法示意Fig.1 Schematic diagram of cell subdivision method

    目前DPD 中已采用改進(jìn)的velocity-Verlet算法[19]來(lái)更新每個(gè)粒子在新時(shí)刻(即t+Δt時(shí)刻)的位置、速度以及受力情況.如下所示:ri(t+Δt)=式中:為粒子i在t+Δt時(shí)刻的預(yù)估速度;λc為經(jīng)驗(yàn)系數(shù).如果粒子的受力情況與粒子間的相對(duì)速度無(wú)關(guān),則λc=0.5.Groot和Warren[19]發(fā)現(xiàn),DPD方法中λc的最優(yōu)值為0.65.當(dāng)采用該最優(yōu)值同時(shí)取ρ=3,σ=3時(shí),對(duì)平衡系統(tǒng)的模擬中計(jì)算的時(shí)間步長(zhǎng)可以增加到Δt=0.06而不失去對(duì)溫度的控制.

    2 LE邊界條件與DPD中算法的結(jié)合

    2.1 LE邊界條件

    LE 邊界條件可模擬周期性的簡(jiǎn)單剪切流動(dòng)[20].圖2為周期性系統(tǒng)中簡(jiǎn)單剪切流動(dòng)示意圖,圖中L為周期性區(qū)域在z方向的長(zhǎng)度,ux為x方向的流體剪切速度.假定所研究的區(qū)域內(nèi)僅有2個(gè)粒子.在粒子運(yùn)動(dòng)的過(guò)程中,受到處于本區(qū)域內(nèi)其他粒子及周期性鏡像區(qū)域內(nèi)粒子的作用.由于剪切率Dx=?ux/?z,鏡像區(qū)域各自角點(diǎn)的x方向速度u(r,t)與z成正比,即u(r,t)=iDxz,其中i為x方向單位矢量.

    圖2 LE 邊界條件示意Fig.2 Schematic diagram of LE boundary condition

    在粒子運(yùn)動(dòng)過(guò)程中,如果粒子跑出了計(jì)算區(qū)域,該粒子將由其周期性鏡像粒子代替而重新進(jìn)入該計(jì)算區(qū)域.然而在剪切流動(dòng)條件下,粒子穿過(guò)z=0面或者z=L面時(shí),其對(duì)應(yīng)的周期性鏡像粒子并不會(huì)有同樣的流體速度以及同樣的x坐標(biāo).跑出計(jì)算區(qū)域的粒子以周期性鏡像的身份再進(jìn)入該區(qū)域時(shí)如果賦予特定的速度和x坐標(biāo)可產(chǎn)生剪切流動(dòng).整個(gè)流動(dòng)過(guò)程中其空間上是均勻的,不會(huì)感受到邊界的存在,這是LE邊界條件的優(yōu)點(diǎn).

    具體來(lái)說(shuō),在模擬區(qū)域中,令其角點(diǎn)O的流體速度為零.所模擬區(qū)域中DPD 粒子的速度由兩部分構(gòu)成,即DPD 粒子的熱速度ci和流體速度u(ri),即

    簡(jiǎn)單剪切中由于流體速度是只以z為自變量的函數(shù),這里只需要考慮在z方向上粒子穿越邊界的情況.零時(shí)刻ri的鏡像矢量r′i在ri+kL處,ri的鏡像矢量r″i在ri-kL處.t時(shí)間后,該粒子及鏡像的位置分別為其中,ci和zi(包括其鏡像)都是時(shí)間的函數(shù).由于粒子的熱速度及其所有鏡像粒子的熱速度都是相同的,因此,那么同理kL-iDxLt.如果ri(t)跑出了下邊界,將被其鏡像代替

    如果ri(t)跑出了上邊界,將被其鏡像r″i(t)代替

    2.2 DPD中的算法與LE邊界條件的結(jié)合

    如圖3所示,模擬區(qū)域顯示x,z方向,y方向垂直紙面向里,圖中的方格代表元胞.由于流動(dòng)存在剪切率Dx,所以粒子離開(kāi)下邊界而以鏡像粒子的身份從上邊界被引入時(shí)x方向的速度要加上DxLz,即速率變?yōu)閡x+DxLz.由于x方向速度的差異,一定時(shí)間后在上邊界被引入的x方向的位置也會(huì)相應(yīng)改變?chǔ),也就是圖形上部實(shí)線(xiàn)粒子與虛線(xiàn)粒子x方向距離差Δx=ntVxΔt-[ntVxΔt/Lx]Lx,其中nt為時(shí)間步數(shù),Δt為時(shí)間,[]為取整符號(hào),Lx為模擬區(qū)域x方向的總長(zhǎng)度.從計(jì)算區(qū)域下部跑出去的粒子將從上邊界處一個(gè)新的位置進(jìn)入計(jì)算區(qū)域,從而能夠保證能量守恒[1].相應(yīng)地在計(jì)算粒子間相互作用時(shí)其相鄰的粒子也需要更新,因此DPD 所采用的元胞分割法中的所有細(xì)節(jié)也必須與此相對(duì)應(yīng).

    圖3 DPD 方法中LE 邊界條件的實(shí)施Fig.3 Implementation of LE boundary condition in DPD

    粒子從計(jì)算區(qū)域底部離開(kāi)的算法如下:r′x=必須強(qiáng)調(diào)的是改進(jìn)的velocity-Verlet算法引入一個(gè)中間速度,對(duì)于粒子從計(jì)算

    3 結(jié)果及討論

    3.1 LE邊界條件下DPD簡(jiǎn)單剪切流動(dòng)模擬

    首先,利用上述DPD 與LE相結(jié)合的方法,模擬了大小為-15.000≤x<15.000,-5.000≤y<5.000,-11.125≤z<11.125區(qū)域內(nèi)的簡(jiǎn)單剪切流動(dòng).總共采用了27 600個(gè)DPD 粒子,由此對(duì)應(yīng)的流體密度為4.13.在開(kāi)始的2 000時(shí)間步長(zhǎng)內(nèi),令流體粒子自由運(yùn)動(dòng),不施加LE 邊界條件,直到達(dá)到平衡態(tài).從2 000時(shí)間步開(kāi)始,對(duì)系統(tǒng)施加LE 邊界條件.時(shí)間步長(zhǎng)設(shè)置為0.02.在z方向設(shè)置40 個(gè)統(tǒng)計(jì)格子,所有的局部參數(shù)將由對(duì)各個(gè)格子內(nèi)的數(shù)據(jù)樣本進(jìn)行10 000時(shí)間步長(zhǎng)的平均而獲得.經(jīng)過(guò)45 050步的計(jì)算模擬結(jié)果如圖4所示.

    圖4 所示為2 種剪切率條件下的簡(jiǎn)單剪切流動(dòng),剪切率分別為0.2和0.4.所得簡(jiǎn)單剪切流動(dòng)速度的線(xiàn)性化程度很好,更為重要的是,在邊界區(qū)域,也即在z=11.125和z=-11.125附近區(qū)域,模擬的速度沒(méi)有反常波動(dòng),即感受不到邊界的存在,說(shuō)明模擬結(jié)果與預(yù)想的一致.而其各自的斜率剛好等于剪切率,從而驗(yàn)證了在DPD 中實(shí)施LE 邊界條件的正確性.相應(yīng)地,還統(tǒng)計(jì)了系統(tǒng)內(nèi)密度和溫度分布.圖5所示在剪切率為0.2時(shí)的密度和溫度分布,顯示在邊界附近兩者均無(wú)反常,整個(gè)系統(tǒng)的密度保持在4.1附近,而溫度也控制在1.0附近.

    在粒子方法中,如果采用固體壁面模型,在實(shí)施無(wú)滑移和不可穿透固體壁面條件的同時(shí),很可能會(huì)引入壁面效應(yīng),對(duì)近壁面區(qū)域流體參量產(chǎn)生一定的影響.Fan等[17]提出的壁面模型即采用了“凍住”的粒子代表壁面,在壁面附近的流體區(qū)域設(shè)置一薄層,在這一薄層內(nèi)流體流動(dòng)保持無(wú)滑移條件,并令薄層內(nèi)的粒子速度方向隨機(jī)分布,速度的大小與給定的壁面溫度相對(duì)應(yīng),但各個(gè)粒子速度的矢量平均值為零(與靜止的壁面相對(duì)應(yīng)).進(jìn)一步,令在該薄層內(nèi)的粒子以一定速度離開(kāi)壁面,從而保證粒子不穿透壁面.其離開(kāi)速度式中:vR為隨機(jī)速度矢量;n為壁面單位法向矢量(指向流體),詳見(jiàn)文獻(xiàn)[17].

    圖6為DPD 方法中采用Fan等[17]提出的壁面模型模擬剪切率為0.2時(shí)系統(tǒng)的有關(guān)物理量分布與LE邊界條件所得結(jié)果的對(duì)比,圖6a顯示在壁面附近固體壁面模型產(chǎn)生了一定的密度波動(dòng).DPD 中壓力和剪切應(yīng)力的計(jì)算可參閱文獻(xiàn)[10].由圖6b~6d可見(jiàn),對(duì)LE邊界條件來(lái)說(shuō),本文模擬得到的DPD 系統(tǒng)的溫度、壓力和剪切應(yīng)力在邊界附近過(guò)渡平穩(wěn),而采用固體壁面模型所得結(jié)果則有較大的波動(dòng).

    3.2 應(yīng)用LE邊界條件模擬較高施密特?cái)?shù)流體的剪切流動(dòng)

    Schmidt數(shù)Sc是動(dòng)量擴(kuò)散與流體自擴(kuò)散的比值,本文中采用改進(jìn)的權(quán)函數(shù)表達(dá)式(式(9)),Sc數(shù)可表示為[12]:Sc=0.5+(2πγρr4c)2(1999kBT),式中:γ為耗散系數(shù),ρ為密度.傳統(tǒng)的DPD 系統(tǒng)所描述的流體Sc數(shù)偏低,提高耗散系數(shù)是提高流體的Schmidt數(shù)的一種有效途徑,從而使所模擬的流體更接近實(shí)際流體[12].本文中模擬了σ=14.14,即γ=100情況下,時(shí)間步長(zhǎng)為0.02、計(jì)算區(qū)域?yàn)?0.00×10.00×22.25時(shí)系統(tǒng)的速度分布.如圖7所示,在較高施密特?cái)?shù)條件下,剪切率為0.2時(shí),系統(tǒng)內(nèi)的速度分布仍然是線(xiàn)性的,流動(dòng)沒(méi)有邊界效應(yīng),說(shuō)明速度梯度在整個(gè)空間區(qū)域中是均勻的.

    圖7 γ=100時(shí)溫度及速度分布Fig.7 Temperature and velocity profile whenγ =100

    文獻(xiàn)[21]中顯示,當(dāng)γ=100時(shí),所模擬的剪切流動(dòng)在整個(gè)系統(tǒng)中不是均勻分布,如圖8所示,其線(xiàn)性速度分布出現(xiàn)了轉(zhuǎn)折.文獻(xiàn)[21]認(rèn)為在高的耗散率條件下,LE 邊界條件會(huì)帶來(lái)嚴(yán)重的誤差,文獻(xiàn)[21]將此誤差歸結(jié)為DPD 中耗散力的作用,并需要進(jìn)行修正才能獲得線(xiàn)性的速度分布.不過(guò)筆者認(rèn)為,LE邊界條件模擬了一個(gè)準(zhǔn)無(wú)限大區(qū)域內(nèi)的剪切流動(dòng),其算法固有的特點(diǎn)是感受不到邊界的存在.因此,DPD 中耗散力的影響在整個(gè)區(qū)域內(nèi)應(yīng)當(dāng)均勻的,而速度分布也應(yīng)一直保持線(xiàn)性.圖7 的結(jié)果也支持這個(gè)觀(guān)點(diǎn).因此本文作者認(rèn)為,高耗散率條件下,在耗散粒子動(dòng)力學(xué)中應(yīng)用Lees-Edwards邊界條件仍然有效.

    圖8 文獻(xiàn)[21]中γ=100時(shí)速度分布Fig.8 Velocity profile in Ref.[21]whenγ=100

    Groot和Warren[19]指出隨著σ的增加,可能會(huì)引起系統(tǒng)溫度的不穩(wěn)定,因此有必要檢驗(yàn)σ=14.14也即γ=100情況下系統(tǒng)的溫度,模擬結(jié)果如圖7,此時(shí)系統(tǒng)溫度依然能夠很好地控制在0.9~1.0之間.

    4 結(jié)論

    詳細(xì)討論了DPD 方法中實(shí)施LE邊界條件的過(guò)程,涉及DPD 方法中改進(jìn)的velocity-Verlet算法、元胞分割法等與LE 邊界條件的結(jié)合,并將DPD 方法中現(xiàn)有的一種固體壁面模型與LE 條件所模擬的結(jié)果進(jìn)行了比較.LE條件模擬所得到的速度、密度、溫度、壓強(qiáng)以及應(yīng)力分布等均為線(xiàn)性分布,說(shuō)明流體系統(tǒng)中各參量是均勻的,感受不到計(jì)算邊界的存在,符合預(yù)期.在模擬高耗散率流體的剪切流動(dòng)時(shí),所得到的速度分布仍然為線(xiàn)性分布,表明LE 邊界條件在高耗散率流體的模擬中仍然適用,得出了與文獻(xiàn)[21]不同的觀(guān)點(diǎn).LE 條件在DPD 方法中的實(shí)施可為復(fù)雜流體的剪切流動(dòng)研究提供便利.

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