張一沙 吳穎 范興麗 蔣錦琴 孫愛(ài)華
[摘要] 目的 研究解脲脲原體喹諾酮類(lèi)藥物耐藥機(jī)制。 方法 用支原體培養(yǎng)、鑒定和藥敏試劑盒分離獲得77株解脲脲原體并檢測(cè)對(duì)3種喹諾酮類(lèi)藥物的耐藥性,同時(shí)PCR法擴(kuò)增臨床分離株的gyrA和parC基因喹諾酮耐藥決定區(qū)并進(jìn)行測(cè)序分析。 結(jié)果 對(duì)3種喹諾酮均敏感3株,74株至少對(duì)1種藥物呈現(xiàn)不同程度耐藥。gyrA和parC基因喹諾酮耐藥決定區(qū)測(cè)序發(fā)現(xiàn)上述敏感株和2株耐藥株不發(fā)生突變,其余72株耐藥株gyrA和parC發(fā)生D112E和/或S83L突變。 結(jié)論 解脲脲原體gyrA和parC基因喹諾酮耐藥決定區(qū)突變與耐藥密切相關(guān)。
[關(guān)鍵詞] 解脲脲原體;gyrA、parC基因;突變;序列分析;耐藥性
[中圖分類(lèi)號(hào)] R446.5[文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼] A[文章編號(hào)] 1673-9701(2012)16-0001-03
To study of resistance mechanisms of Ureaplasma urealyticum to quinolones
ZHANG Yisha1 WU Ying2 FAN Xingli3 JIANG Jinqin3 SUN Aihua3
1.Department of Urological Surgery, Taizhou Integrative Medicine Hospital in Zhejiang Province, Wenling 317523, China; 2.Department of Clinical Laboratory, Taizhou Integrative Medicine Hospital in Zhejiang Province, Wenling 317523, China; 3.Department of Basic Medicine, Zhejiang Medical College, Hangzhou 310053, China
[Abstract] Objective To study the resistance mechanisms of Ureaplasma urealyticum to quinolones. Methods Mycoplasma detection kits were used to culture and identify mycoplasma as well as drug sensitivity. PCR and DNA sequencing were conducted to analyze QRDR associated genes of gyrA and parC in 77 isolates. Results There were only 3 isolates susceptible to all quinolones, and 74 isolates showed varying degree resistance to at least one kind of quinolone. Sequencing analysis of gyrA and parC revealed that 3 susceptible isolates and 2 resistant isolates had no mutation, 72 resistant isolates had mutation of D112E and/or S83L in gyrA and parC. Conclusion Mutations in gyrA and parC genes play an important role in the development of quinolones resistance in Ureaplasma urealyticum.
[Key words] Ureaplasma urealyticum; GyrA and parC genes; Mutation; Sequence analysis; Drug resistance
慢性前列腺炎是男性最常見(jiàn)的泌尿生殖道疾病之一,解脲脲原體(Ureaplasma urealyticum,Uu)是引起非細(xì)菌性慢性前列腺炎的主要病原體[1]。喹諾酮類(lèi)藥物是一類(lèi)人工合成的具有高效廣譜抗菌作用的藥物。隨著喹諾酮類(lèi)藥物的大量和廣泛的應(yīng)用,解脲脲原體臨床分離株對(duì)該類(lèi)藥物的敏感性逐漸下降并出現(xiàn)耐藥[2-5]。
國(guó)內(nèi)外對(duì)解脲脲原體對(duì)喹諾酮類(lèi)藥物的耐藥機(jī)制研究不多,喹諾酮類(lèi)藥物的作用靶酶為Ⅱ型拓?fù)洚悩?gòu)酶(包括DNA螺旋酶和拓?fù)洚悩?gòu)酶Ⅳ),喹諾酮類(lèi)藥物耐藥是由于編碼靶酶的基因突變導(dǎo)致靶酶的氨基酸序列改變,gyrA和parC基因分別編碼DNA螺旋酶和拓?fù)洚悩?gòu)酶Ⅳ,GyrA和ParC氨基酸發(fā)生替換突變抑制細(xì)菌DNA螺旋酶和拓?fù)洚悩?gòu)酶Ⅳ的活性導(dǎo)致耐藥[6]。本研究從慢性前列腺炎患者前列腺液中分離了77株解脲脲原體并檢測(cè)其對(duì)3種喹諾酮類(lèi)藥物的耐藥性,PCR擴(kuò)增所有菌株gyrA和parC基因包括喹諾酮耐藥決定區(qū)(quinolone resistance determining regions,QRDR)在內(nèi)的核苷酸序列并直接測(cè)序,以探討本地區(qū)分離自非細(xì)菌性慢性前列腺炎解脲脲原體gyrA和parC基因的QRDR突變與喹諾酮類(lèi)藥物耐藥的相關(guān)性。
1 材料與方法
1.1 前列腺液的采集
采集2008年6月~2011年10月本院泌尿外科門(mén)診擬診斷為慢性前列腺炎患者的前列腺液。用生理鹽水清潔龜頭和尿道口后用碘伏消毒,直腸指診按摩前列腺,獲取前列腺液,用無(wú)菌拭子洗脫于無(wú)菌的EP管中,用于培養(yǎng)或PCR研究。血清3型解脲脲原體標(biāo)準(zhǔn)株ATCC700970來(lái)自浙江大學(xué)病原生物系。
1.2 支原體分離與鑒定及藥敏試驗(yàn)
支原體鑒定及藥敏試驗(yàn)一體化試劑盒由珠海黑馬生物工程有限公司生產(chǎn),取無(wú)菌拭子洗脫液,按試劑盒說(shuō)明書(shū)操作,與生長(zhǎng)對(duì)照孔比較,培養(yǎng)24 h后Uu孔由黃色變?yōu)槌壬蚣t色且未見(jiàn)渾濁為陽(yáng)性,表示有Uu生長(zhǎng),不變色表示陰性。篩選獲得77株解脲脲原體菌株,-70℃保存。
1.3 藥敏試驗(yàn)結(jié)果判斷
支原體鑒定藥物環(huán)丙沙星、氧氟沙星和司帕沙星3種藥物高、低兩個(gè)濃度各設(shè)1孔,均不變色表示敏感,都變紅色表示高度耐藥,低濃度孔變紅色、高濃度孔不變色表示低度耐藥。
1.4 DNA模板的制備
取上述細(xì)菌株培養(yǎng)物500 μL,6 000 r/min離心10 min,沉淀中加入25 μL細(xì)菌裂解液,充分混勻后沸水浴10 min,10 000 r/min離心10 min,取2 μL上清作為PCR的DNA模板。
1.5 引物設(shè)計(jì)
參考GenBank登錄血清3型解脲脲原體gyrA和parC基因參考序列(GenBank:AF222894.1)及QRDR位置設(shè)計(jì)上、下游引物。gyrA基因上游引物序列:5-GCT GCT TTC GAA AAC GGA ATG-3,下游引物序列:5''-TGA TGG TAA AAC ACT TGG AAC-3。parC基因上游引物序列:5-GAC GAA TTT TAT ACG CAA TG-3,下游引物序列:5''-TTT CAC TAT CAT CAA AGT TTG-3。委托上海Invitrogen公司測(cè)序合成引物。
1.6 PCR擴(kuò)增及擴(kuò)增產(chǎn)物檢測(cè)
PCR總體積為100 μL,內(nèi)含2.5 mol/L各dNTP、250 nmol/L各引物、2.5 U Ex-Taq DNA聚合酶(TaKaRa)、5 μL DNA提取物為模板、1×PCR緩沖液(pH8.3)。PCR參數(shù):94℃ 4 min;94℃ 30 s,58℃ 30 s,72℃ 30 s,35個(gè)循環(huán);72℃ 5 min。采用1 μg/mL溴乙錠預(yù)染色的2.0%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)擴(kuò)增產(chǎn)物,擴(kuò)增產(chǎn)物包括gyrA和parC基因QRDR的區(qū)域預(yù)期大小分別為333 bp和324 bp。
1.7 核苷酸序列測(cè)定及分析
采用BioColor公司的3S柱離心式瓊脂糖DNA小量快速純化試劑盒提純,委托Invitrogen公司測(cè)定PCR純化產(chǎn)物gyrA和parC基因片段的核苷酸序列。參照已報(bào)道的血清3型解脲脲原體標(biāo)準(zhǔn)株ATCC700970 gyrA和parC基因核苷酸序列及推測(cè)的氨基酸序列進(jìn)行比較,以確定上述菌株gyrA和parC基因QRDR的突變情況。
1.8 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理
實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)采用χ2檢驗(yàn),對(duì)檢測(cè)結(jié)果進(jìn)行比較,P < 0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
2 結(jié)果
2.1 藥敏結(jié)果
77株解脲脲原體對(duì)3種喹諾酮類(lèi)藥物的藥敏試驗(yàn)結(jié)果見(jiàn)表1。除3株對(duì)3種喹諾酮類(lèi)藥物均敏感外,其余74株至少對(duì)1種藥物呈現(xiàn)不同程度的耐藥,其中對(duì)藥物只呈現(xiàn)低度耐藥的有26株,至少對(duì)1種藥物高度耐藥的有48株。
2.2 PCR擴(kuò)增結(jié)果
利用自行設(shè)計(jì)的引物擴(kuò)增77株解脲脲原體的gyrA和parC基因目的片段,2.0%瓊脂糖凝膠電泳顯示所有77株解脲脲原體PCR產(chǎn)物在294 bp和237 bp位置有g(shù)yrA和parC基因擴(kuò)增的目的片段。同樣條件下血清3型解脲脲原體標(biāo)準(zhǔn)株ATCC700970 PCR擴(kuò)增結(jié)果為陽(yáng)性,見(jiàn)圖1。
2.3 PCR測(cè)序結(jié)果
77株菌株gyrA和parC基因目的片段PCR測(cè)序結(jié)果與血清3型標(biāo)準(zhǔn)株ATCC700970對(duì)應(yīng)序列比較見(jiàn)表1,對(duì)3種喹諾酮類(lèi)藥物均敏感菌株gyrA和parC基因測(cè)定序列與標(biāo)準(zhǔn)菌株對(duì)應(yīng)序列完全相同,gyrA基因c336a(D112E)和parC基因c248t(S83L)均不發(fā)生突變;74株至少對(duì)1種藥物發(fā)生耐藥的菌株中,只有2株上述基因?qū)?yīng)位置不發(fā)生突變,其余72株都存在gyrA基因c336a(D112E)和/或parC基因c248t(S83L)突變,兩者比較差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=45.0,P < 0.05)。74株至少對(duì)1種藥物發(fā)生耐藥的菌株中,26株至少對(duì)1種藥物呈現(xiàn)低度耐藥,其中1株gyrA和parC基因測(cè)定序列與標(biāo)準(zhǔn)菌株對(duì)應(yīng)序列完全相同,gyrA基因c336a(D112E)和parC基因c248t(S83L)均不發(fā)生突變,20株只發(fā)生gyrA基因c336a(D112E)或parC基因c248t(S83L)單位點(diǎn)突變,只有5株gyrA和parC基因上述位點(diǎn)突變同時(shí)突變;48株至少對(duì)1種藥物呈現(xiàn)高度耐藥,其中除1株gyrA和parC基因上述位點(diǎn)均不發(fā)生突變外,發(fā)生gyrA基因c336a(D112E)或parC基因c248t(S83L)單位點(diǎn)突變的只有13株,34株gyrA和parC基因上述位點(diǎn)突變同時(shí)發(fā)生,不同耐藥程度的解脲脲原體gyrA基因c336a(D112E)和parC基因c248t(S83L)雙突變發(fā)生率差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=18.6,P < 0.05)。
3 討論
支原體沒(méi)有固定的細(xì)胞壁,部分針對(duì)細(xì)菌細(xì)胞壁合成的抗生素如β-內(nèi)酰胺類(lèi)、萬(wàn)古霉素等完全不敏感,目前治療支原體感染主要有四環(huán)素類(lèi)、大環(huán)內(nèi)酯類(lèi)和喹諾酮類(lèi),其中喹諾酮類(lèi)藥物是一類(lèi)人工合成的廣譜抗生素,具有對(duì)解脲脲原體抗菌活性強(qiáng)且能口服、與其他藥物交叉耐藥少、毒副作用少等特點(diǎn)而廣泛應(yīng)用。
喹諾酮類(lèi)藥物的作用靶酶是Ⅱ型拓?fù)洚悩?gòu)酶(包括DNA螺旋酶和拓?fù)洚悩?gòu)酶Ⅳ),在支原體繁殖傳代中DNA的復(fù)制過(guò)程,通過(guò)抑制細(xì)菌DNA螺旋酶和拓?fù)洚悩?gòu)酶Ⅳ的活性達(dá)到抗菌目的[5,6]。gyrA和parC基因分別編碼DNA螺旋酶和拓?fù)洚悩?gòu)酶Ⅳ,基因上的一段與喹諾酮類(lèi)耐藥相關(guān)的核苷酸序列被稱(chēng)為喹諾酮耐藥決定區(qū),其中g(shù)yrA基因5末端第202~531位堿基(即編碼GyrA第68~177位氨基酸殘基的堿基)和parC基因5末端第152~456位堿基(即編碼GyrA第51~152位氨基酸殘基的堿基)組成各自的QRDR區(qū),QRDR區(qū)堿基突變導(dǎo)致編碼的氨基酸突變抑制細(xì)菌DNA螺旋酶或拓?fù)洚悩?gòu)酶Ⅳ的活性導(dǎo)致耐藥[6]。其中最主要的是與gyrA和parC基因編碼蛋白GyrA和ParC空間結(jié)構(gòu)密切相關(guān)的D112和S83氨基酸突變[3-5,6]。本研究發(fā)現(xiàn)對(duì)3種喹諾酮類(lèi)藥物都敏感的3株菌株GyrA和ParC氨基酸編碼與解脲脲原體血清3型標(biāo)準(zhǔn)株序列完全相同,gyrA基因c336a(D112E)和parC基因c248t(S83L)測(cè)定區(qū)域均不發(fā)生突變,74株至少對(duì)1種藥物發(fā)生耐藥的菌株中,只有2株上述基因?qū)?yīng)位置不發(fā)生突變,兩者比較有顯著性差異,提示gyrA基因c336a(D112E)和/或parC基因c248t(S83L)突變是否發(fā)生與喹諾酮類(lèi)藥物敏感性密切相關(guān)。74株至少對(duì)1種藥物發(fā)生耐藥的菌株中,48株至少對(duì)1種藥物呈現(xiàn)高度耐藥,其中34株gyrA基因c336a(D112E)和parC基因c248t(S83L)突變同時(shí)發(fā)生,而26株至少對(duì)1種藥物呈現(xiàn)低度耐藥,其中只有5株gyrA基因c336a(D112E)和parC基因c248t(S83L)突變同時(shí)發(fā)生,統(tǒng)計(jì)結(jié)果表明對(duì)喹諾酮類(lèi)藥物不同耐藥程度的解脲脲原體gyrA基因c336a(D112E)和parC基因c248t(S83L)雙突變發(fā)生率差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,提示雙突變與喹諾酮類(lèi)耐藥程度密切相關(guān)。另我們?cè)谘芯恐邪l(fā)現(xiàn)有2株耐藥株gyrA基因存在c302u(A101V)突變,其中1株不伴有g(shù)yrA基因c336a(D112E)或parC基因c248t(S83L)突變。另有2株高度耐藥株parC基因編碼蛋白ParC存在125位T125A突變,為國(guó)內(nèi)首次報(bào)道。
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(收稿日期:2012-03-22)