堿基
- 例談基于PCR的基因定點(diǎn)突變技術(shù)
物的5端引入突變堿基，或者增加或減少一個(gè)或多個(gè)堿基，通過(guò)PCR大量擴(kuò)增突變DNA。兩種思路相比較而言，第二種能更為準(zhǔn)確地實(shí)現(xiàn)基因的定點(diǎn)突變，故下文主要討論第二種思路。3 基于PCR的基因定點(diǎn)突變技術(shù)3.1 重疊延伸PCR重疊延伸PCR需要設(shè)計(jì)兩對(duì)引物：上游引物a、突變引物b以及下游引物d、突變引物c。其中突變引物b和c加入了突變堿基，且具有重疊區(qū)域，如圖1所示，引物中突變堿基處用“·”表示。第一、二輪PCR時(shí)（即圖1中PCR1和PCR2）分別用引物a、b和
中學(xué)生物學(xué) 2023年2期2023-05-30
- 基于位置信息的DNA 序列特征提?。?/a>
更好地保留序列中堿基的信息，本文提出了一種基于堿基距離和相關(guān)性的特征提取方法。以H1N1、H5N1、COVID-19 等6 種病毒作為研究對(duì)象，將DNA序列轉(zhuǎn)化為特征向量，并用KNN 算法對(duì)冠狀和非冠狀病毒進(jìn)行分類(lèi)。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明該方法能提高分類(lèi)的準(zhǔn)確率。據(jù)估計(jì)地球上約有1000 萬(wàn)～1 億種生物，如此龐大的數(shù)據(jù)使得生物分類(lèi)面臨著巨大挑戰(zhàn)[1]，因此DNA 序列的分類(lèi)成為了人們的研究熱點(diǎn)，也是當(dāng)前生物信息學(xué)的主要研究任務(wù)之一。特征提取是DNA 序列分類(lèi)研究中
數(shù)字技術(shù)與應(yīng)用 2023年1期2023-02-19
- 堿基編輯技術(shù)的新進(jìn)展及在耳蝸中的應(yīng)用前景
均不能完美地將單堿基突變序列修復(fù)為野生型序列[2～5]。近年研究通過(guò)改進(jìn)CrispR/Cas9技術(shù)，即在Cas9酶的基礎(chǔ)上，融合1個(gè)堿基脫氨酶基團(tuán)并降低Cas9酶中剪切酶的活性，研發(fā)一種酶可以人為誘導(dǎo)單個(gè)突變基因復(fù)原而不切除DNA雙鏈，該項(xiàng)研究技術(shù)即為堿基編輯(base editing)[6]。腺苷酸堿基編輯酶(adenosine base-editing enzyme, ABE)和胞嘧啶堿基編輯酶(cytidine base-editing enzyme
聽(tīng)力學(xué)及言語(yǔ)疾病雜志 2022年4期2022-12-06
- 基于CRISPR/Cas系統(tǒng)的DNA堿基編輯研究進(jìn)展
diting1 堿基編輯系統(tǒng)簡(jiǎn)介點(diǎn)突變是自然界中最常見(jiàn)的基因突變類(lèi)型。根據(jù)人類(lèi)基因組變異數(shù)據(jù)庫(kù)ClinVar分析，超過(guò)半數(shù)的人類(lèi)遺傳疾病是由點(diǎn)突變引起［9］。在作物遺傳育種上，點(diǎn)突變也是許多重要農(nóng)藝性狀遺傳變異的基礎(chǔ)。將高效、精準(zhǔn)的核苷酸替換應(yīng)用于基因治療，可以從根本上治愈點(diǎn)突變引起的人類(lèi)遺傳疾病；應(yīng)用于作物育種，可以簡(jiǎn)化并加快育種進(jìn)程，可見(jiàn)開(kāi)發(fā)高效精準(zhǔn)的堿基替換工具十分重要。2016年，哈佛大學(xué)David R. Liu團(tuán)隊(duì)在原有CRISPR/Cas9基礎(chǔ)
生物技術(shù)通報(bào) 2022年6期2022-07-22
- 大豆非同義SNP相鄰堿基組分分析
00～2000個(gè)堿基就有一個(gè)SNP，在一些高頻的區(qū)域，甚至能達(dá)到每300個(gè)堿基一個(gè)SNP[1-2].由于SNP在基因組中的高密度，使其成為一種理想的分子標(biāo)記，并已被用于構(gòu)建人類(lèi)遺傳分析圖譜和人類(lèi)復(fù)雜疾病性狀的研究[3-5].SNP在植物中也廣泛存在，例如在水稻基因組中的發(fā)生率接近1/268[6].根據(jù)SNP在基因中的位置，可將其分為基因編碼區(qū)SNP(coding SNP，cSNP)、基因內(nèi)含子區(qū)SNP和基因調(diào)控區(qū)SNPs(regulatory SNPs，r
南陽(yáng)師范學(xué)院學(xué)報(bào) 2022年4期2022-07-12
- 參照多重PCR片段分析法進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光PCR法對(duì)ABCB1三等位基因測(cè)定結(jié)果讀取方法的確定
理，數(shù)據(jù)分析采用堿基峰位圖中對(duì)應(yīng)的研究峰位進(jìn)行對(duì)比分析。2 結(jié) 果2.1 實(shí)時(shí)熒光PCR法與多重PCR片段分析法讀取結(jié)果139例樣本中，包括120例等位基因及19例三等位基因。實(shí)時(shí)熒光PCR法與多重PCR片段分析法對(duì)120例等位基因樣本的讀取結(jié)果完全一致。兩種方法對(duì)19例三等位基因樣本的讀取結(jié)果見(jiàn)表1。表1 實(shí)時(shí)熒光PCR法與多重PCR片段分析法對(duì)三等位基因分析結(jié)果2.2 三等位基因讀取結(jié)果的確定采用實(shí)時(shí)熒光PCR法測(cè)定19例ABCB1三等位基因的結(jié)果，以
四川精神衛(wèi)生 2022年2期2022-05-09
- 紫芽六堡茶轉(zhuǎn)錄組SSR位點(diǎn)序列分析
NA，以1～6個(gè)堿基為核心序列，具有多態(tài)性高、重復(fù)性好、穩(wěn)定性高等特點(diǎn)，隨著現(xiàn)代分子技術(shù)的發(fā)展，SSR技術(shù)已廣泛應(yīng)用于植物分子輔助育種、種質(zhì)資源遺傳多樣性、繪制遺傳圖譜等方面的研究中。毛娟等利用30對(duì)茶樹(shù)核心SSR引物，對(duì)3個(gè)代表性的野生和栽培大理茶居群進(jìn)行遺傳分析。陳春林等從紫娟茶樹(shù)轉(zhuǎn)錄組 46 041 條單基因簇(unigene)中篩選出57 976個(gè)SSR位點(diǎn)，并對(duì)SSR序列的分布特征進(jìn)行了分析，篩選出44對(duì)高質(zhì)量引物。班秋艷等對(duì)陜西及臨近8個(gè)省份1
江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2022年3期2022-03-03
- 瓦氏黃顙魚(yú)全基因組微衛(wèi)星的分布特征及其定位的初步研究
、分析，探索了各堿基重復(fù)類(lèi)型的豐度及其規(guī)律，并且對(duì)外顯子區(qū)含有微衛(wèi)星的基因進(jìn)行了GO注釋和KEGG富集，進(jìn)一步探究了微衛(wèi)星在瓦氏黃顙魚(yú)全基因組中的潛在功能，為今后黃顙魚(yú)屬群體的微衛(wèi)星篩選、遺傳多樣性分析等研究積累參考資料。1 材料與方法1.1 基因組序列基于本實(shí)驗(yàn)室前期瓦氏黃顙魚(yú)基因組測(cè)序和組裝，確定其基因組大小為663.53 Mb，Contig N50為14.02 Mb，scaffold N50為26.78 Mb，contig長(zhǎng)度錨定率為99.79%，定
南方水產(chǎn)科學(xué) 2022年1期2022-03-02
- 巨魾(Bagarius yarrelli)全基因組微衛(wèi)星分布特征分析
中統(tǒng)計(jì)出1～6個(gè)堿基重復(fù)的完整型微衛(wèi)星,使用EXCEL統(tǒng)計(jì)分析出各堿基類(lèi)型的數(shù)量和分布情況,分別列出其分布特征和占比情況. 搜索標(biāo)準(zhǔn)參考MISA默認(rèn)參數(shù)設(shè)置,即要求單堿基重復(fù)≥10次,二堿基重復(fù)≥6次,三、四、五、六堿基重復(fù)≥5次. 經(jīng)過(guò)前期的大量研究可知,以此標(biāo)準(zhǔn)搜索全基因組微衛(wèi)星得出的結(jié)果最優(yōu)[9]. 根據(jù)起始堿基順序的差異及堿基互補(bǔ)配對(duì)原則,對(duì)屬于同一類(lèi)別的微衛(wèi)星進(jìn)行同類(lèi)合并,如三堿基AAT,可以與之兼并的有ATA、TAA、TTA、TAT和ATT.2
- 花斑無(wú)須鯰(Ageneiosus marmoratus)全基因組微衛(wèi)星分布特征研究
)是指以1～6個(gè)堿基為基本單位重復(fù)串聯(lián)組成的DNA序列[1],在真核、原核生物以及病毒基因組中均廣泛分布[2-3]. 微衛(wèi)星具有共顯性遺傳、多態(tài)性信息豐富和易于檢測(cè)等特點(diǎn),在物種保護(hù)[4-5]、種質(zhì)資源評(píng)價(jià)[6]、種群遺傳多樣性研究[7-12]、親緣關(guān)系鑒定[13]及物種鑒定[14]等方面的應(yīng)用越來(lái)越廣泛.花斑無(wú)須鯰(Ageneiosusmarmoratus)隸屬于脊椎動(dòng)物亞門(mén)(Vertebrata)、輻鰭魚(yú)綱(Actinopterygii)、鲇形目(Si
- 美國(guó)紅楓轉(zhuǎn)錄組SSR序列分析
，是由1～6 個(gè)堿基為重復(fù)單位組成的串聯(lián)重復(fù)DNA 序列，具有多態(tài)性高、重復(fù)性好、標(biāo)記數(shù)量多等特點(diǎn)，是林木遺傳育種研究中的一種輔助育種方法[7-9]。隨著現(xiàn)代分子生物學(xué)技術(shù)的飛速發(fā)展，SSR 技術(shù)也被廣泛應(yīng)用于植物分子輔助育種、遺傳圖譜的繪制以及種質(zhì)資源遺傳多樣性等方面的研究。周宵等[10]基于木本油料植物光皮樹(shù)葉片轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)，篩選出12 538 個(gè)SSR 位點(diǎn)，并根據(jù)正交實(shí)驗(yàn)研究出SSR-PCR 反應(yīng)體系最佳組合。張振等[11]從紅松轉(zhuǎn)錄組中41 476
中南林業(yè)科技大學(xué)學(xué)報(bào) 2021年7期2021-07-30
- 文蛤轉(zhuǎn)錄組中微衛(wèi)星位點(diǎn)生物信息分析
微衛(wèi)星序列的重復(fù)堿基類(lèi)型分析文蛤SSR位點(diǎn)堿基重復(fù)數(shù)量統(tǒng)計(jì)見(jiàn)表2。單堿基重復(fù)序列在文蛤轉(zhuǎn)錄組中所占比例最高（33.89%），其次為三、四堿基重復(fù)序列占比（分別為25.45%、24.84%），二、五堿基重復(fù)序列占比再次之（分別為11.88%、3.79%），六堿基重復(fù)序列占比最低（0.15%）。每種重復(fù)堿基類(lèi)型的分布密度情況為：四堿基＞三堿基＞單堿基＞二堿基＞五堿基＞六堿基；SSR發(fā)生頻率大小依次為：?jiǎn)?span id="j5i0abt0b" class="hl">堿基＞三堿基＞四堿基＞二堿基＞五堿基＞六堿基。表1 文蛤轉(zhuǎn)
海洋漁業(yè) 2021年2期2021-05-12
- 基因“字母表”擴(kuò)充后的生命
都是用同樣的4個(gè)堿基“字母”來(lái)建造的：A、T、C和G。它們?cè)贒NA的雙螺旋“梯子”上，遵循互補(bǔ)配對(duì)的原則，即A與T配，C和G配。但事實(shí)上，還有其他一些有機(jī)分子也可以做DNA的堿基。不久前，一位美國(guó)生物學(xué)家已經(jīng)制造出2個(gè)人工的堿基。它們也能跟大自然中搭建DNA的酶愉快地合作。這樣，堿基“字母”一下子擴(kuò)充到了6個(gè)?，F(xiàn)在，他又進(jìn)一步把人造堿基整合到活的大腸桿菌的DNA上，培育出首批堿基“字母表”擴(kuò)充后的生命。我們知道，DNA上的堿基最終用途是指導(dǎo)合成各種氨基酸。
科學(xué)之謎 2021年2期2021-04-25
- 云斑白條天牛COI基因拼接方法及序列比較的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)
59KB，含不同堿基的圖譜。seq 格式文件較小，僅為1KB，含堿基序列。1.3 基因序列拼接和分析軟件利用DNAStar 軟件的SeqMan 程序拼接基因序列，利用MegAlign 程序比對(duì)序列。2 實(shí)驗(yàn)過(guò)程2.1 Seq 序列文件的拼接打開(kāi)DNAStar 的SeqMan 程序，輸入2 個(gè)seq 序列文件，將2 個(gè)序列進(jìn)行拼接，拼接后序列長(zhǎng)度716 bp。點(diǎn)擊菜單欄Contig 的Strategy View，打開(kāi)Strategy窗口（圖1），勾取Conf
現(xiàn)代園藝 2021年5期2021-03-13
- 三-(五氟苯基)咔咯錳配合物與DNA堿基的相互作用理論研究
(Ⅲ)與DNA的堿基以及堿基對(duì)的軸向配位性質(zhì)進(jìn)行理論計(jì)算，為實(shí)驗(yàn)研究提供新的理論依據(jù).1 計(jì)算方法DNA的雙鏈結(jié)構(gòu)非常復(fù)雜，因此本文將DNA雙鏈結(jié)構(gòu)分解，選取DNA的4個(gè)堿基片段：腺嘌呤(Adenine，A)、鳥(niǎo)嘌呤(Guanine，G)、胞嘧啶(Cytosine，C)、胸腺嘧啶(Thymine，T)，對(duì)(TPFC)Mn(Ⅲ)與4種堿基以及A=T、C≡G堿基對(duì)的軸向配位性質(zhì)進(jìn)行理論研究，均以1∶1的數(shù)量比進(jìn)行配位. 實(shí)驗(yàn)研究發(fā)現(xiàn)，金屬咔咯與DNA的主要結(jié)合
- 應(yīng)用思維進(jìn)階構(gòu)建模型 例談培養(yǎng)學(xué)生創(chuàng)造性思維
A 分子中T 占堿基總數(shù)的20%，用芥子氣使DNA 分子中所有鳥(niǎo)嘌呤成為mG 后進(jìn)行復(fù)制一次，其中一個(gè)DNA 分子T 占堿基總數(shù)的30%，則另一個(gè)DNA 分子中T 占堿基總數(shù)的比例是 （ ）A.15% B.20% C.30% D.40%【答案】D2.設(shè)起點(diǎn) 讓思維在已知區(qū)點(diǎn)燃教師應(yīng)依據(jù)最近發(fā)展區(qū)理論，按照從簡(jiǎn)單到復(fù)雜的科學(xué)分析方法及思維，在學(xué)生已知區(qū)中找到與新問(wèn)題相類(lèi)似的問(wèn)題，并比較二者的異同。學(xué)生對(duì)DNA 組成、結(jié)構(gòu)和復(fù)制有一定的認(rèn)識(shí)和掌握，并具有對(duì)DN
教學(xué)考試(高考生物) 2020年6期2020-11-23
- CRISPR/Cas9技術(shù)介導(dǎo)豬基因組單堿基編輯效率的研究
or，ABE）單堿基修飾技術(shù)對(duì)豬基因組靶基因位點(diǎn)進(jìn)行編輯效率的分析研究。設(shè)計(jì)、合成并構(gòu)建4個(gè)豬基因組靶基因位點(diǎn)gRNA表達(dá)載體，分別與CBE或ABE共轉(zhuǎn)染PK15細(xì)胞，繼續(xù)培養(yǎng)48 h，結(jié)合二代測(cè)序技術(shù)測(cè)定單堿基替換效率和indels發(fā)生率。結(jié)果表明，單堿基編輯系統(tǒng)BE3和ABE7.10對(duì)豬基因組靶位點(diǎn)堿基修飾的活性編輯窗口主要分別為5個(gè)核苷酸和4個(gè)核苷酸;兩套單堿基編輯系統(tǒng)主要對(duì)編輯窗口內(nèi)的目標(biāo)堿基進(jìn)行單堿基轉(zhuǎn)換而非indel;兩套單堿基編輯系統(tǒng)對(duì)豬基因
湖北農(nóng)業(yè)科學(xué) 2020年18期2020-11-23
- 常規(guī)CRISPR/Cas9系統(tǒng)也能進(jìn)行堿基替換（2020.9.23 中國(guó)科學(xué)雜志社）
。除了基因敲除，堿基替換（例如單氨基酸突變相關(guān)疾病或性狀）是基因編輯領(lǐng)域中另一重要的應(yīng)用領(lǐng)域。但是，長(zhǎng)期以來(lái)學(xué)界普遍認(rèn)為，僅僅依靠Cas9的DNA切割功能及細(xì)胞自發(fā)的NHEJ修復(fù)無(wú)法進(jìn)行堿基替換。要實(shí)現(xiàn)堿基替換，目前有以下幾種技術(shù)路線。1）將含有突變的DNA模板整合在Cas9的切口處，2）單堿基編輯器，例如CBE（C到T的堿基替換）、ABE（A到G的堿基替換）等將脫氨酶與Cas9融合來(lái)實(shí)現(xiàn)堿基編輯，以及3）PE（prime?editing）工具，利用RNA
三農(nóng)資訊半月報(bào) 2020年18期2020-10-14
- 創(chuàng)建新型糖基化酶堿基編輯器
建出新型糖基化酶堿基編輯器（GBE），開(kāi)發(fā)了可實(shí)現(xiàn)嘧啶和嘌呤間顛換的單堿基基因編輯系統(tǒng)?；谠撓到y(tǒng)，國(guó)際上首次在微生物中實(shí)現(xiàn)任意堿基編輯，在哺乳動(dòng)物細(xì)胞中實(shí)現(xiàn)C-G堿基特異性顛換。相關(guān)成果日前發(fā)表于《自然—生物技術(shù)》，并已申請(qǐng)PCT專利。傳統(tǒng)的胞嘧啶堿基編輯器在脫氨酶的作用下，將DNA單鏈上的C轉(zhuǎn)變?yōu)槟蜞奏ぃ?jīng)過(guò)多次DNA復(fù)制才轉(zhuǎn)化為T(mén)。新型GBE獨(dú)辟蹊徑，利用細(xì)胞自身DNA修復(fù)系統(tǒng)直接修復(fù)該“非常規(guī)堿基”，生成特定堿基，實(shí)現(xiàn)堿基編輯。實(shí)驗(yàn)結(jié)果證明，GBE
科學(xué)導(dǎo)報(bào) 2020年54期2020-09-09
- DNA，RNA堿基和稀有堿基的太赫茲光譜檢測(cè)
的基本遺傳單位。堿基是核酸分子(包括DNA和RNA)的重要組成部分，此外，核酸中還有一些含量較少的稀有堿基，大部分是堿基的甲基衍生物。堿基是核酸信息存儲(chǔ)和傳遞的基礎(chǔ)，是生物遺傳、 進(jìn)化和變異的根本原因，所以研究核酸分子堿基對(duì)研究生物活性和生物行為具有重要意義[1-5]。因此，研究核酸分子堿基的光譜特征對(duì)于表征核酸分子結(jié)構(gòu)的改變和核酸分子與小分子的相互作用提供參考價(jià)值。太赫茲(THz)輻射介于微波和紅外之間，頻率范圍大概在0.1～10 THz。雖然有些太赫茲
光譜學(xué)與光譜分析 2020年8期2020-08-08
- 構(gòu)建大豆單堿基替換基因編輯技術(shù)體系（2020.4.23 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院）
現(xiàn)了大豆基因的單堿基替換，并獲得了表型穩(wěn)定的純合突變系。該研究是大豆單堿基替換研究工作的首例報(bào)道，為精準(zhǔn)修飾和利用單核苷酸多態(tài)性（SNP）改良大豆農(nóng)藝性狀提供了新技術(shù)、新方法。相關(guān)研究成果在線發(fā)表在《植物生物技術(shù)雜志（Plant Biotechnology Journal）》上。據(jù)侯文勝研究員介紹，作為一種簡(jiǎn)單有效的基因組編輯工具，CRISPR已在多種重要作物中實(shí)現(xiàn)了基因定點(diǎn)敲除、等位基因單堿基替換和外源DNA片段定點(diǎn)整合，但在大豆中的成功實(shí)踐還很少見(jiàn)。該
三農(nóng)資訊半月報(bào) 2020年8期2020-05-13
- 基于納米孔測(cè)序技術(shù)的PNA/λDNA測(cè)序精確度研究
萬(wàn)條DNA分子的堿基進(jìn)行測(cè)序，它促進(jìn)了人類(lèi)對(duì)物種轉(zhuǎn)錄組測(cè)序以及基因組深度測(cè)序方法的發(fā)展，但是其試劑價(jià)格昂貴，使得第二代基因測(cè)序的成本高達(dá)幾十萬(wàn)美元。近年來(lái)，基于單分子納米孔技術(shù)的第三代測(cè)序方法應(yīng)運(yùn)而生，其主要是通過(guò)分辨4種堿基結(jié)構(gòu)的細(xì)微差異而導(dǎo)致不同堿基在通過(guò)納米孔時(shí)產(chǎn)生不同的離子阻塞電流來(lái)進(jìn)行測(cè)序，測(cè)序過(guò)程不需要試劑，且測(cè)序速度比一、二代測(cè)序方法快，有望進(jìn)一步降低測(cè)序成本，從而改進(jìn)人類(lèi)由基因缺陷引起疾病的治療方法[2-5]。為了證明基于單分子納米孔的第三
機(jī)械設(shè)計(jì)與制造工程 2020年1期2020-02-07
- 科學(xué)家構(gòu)建大豆單堿基替換基因編輯技術(shù)體系
現(xiàn)了大豆基因的單堿基替換，并獲得了表型穩(wěn)定的純合突變系。該研究是大豆單堿基替換研究工作的首例報(bào)道，為精準(zhǔn)修飾和利用單核苷酸多態(tài)性（SNP）改良大豆農(nóng)藝性狀提供了新技術(shù)、新方法。相關(guān)研究成果在線發(fā)表在《植物生物技術(shù)雜志（Plant Biotechnology Journal）》上。據(jù)侯文勝研究員介紹，作為一種簡(jiǎn)單有效的基因組編輯工具，CRISPR 已在多種重要作物中實(shí)現(xiàn)了基因定點(diǎn)敲除、等位基因單堿基替換和外源DNA 片段定點(diǎn)整合，而在大豆中的成功實(shí)踐還很少見(jiàn)
中國(guó)食品學(xué)報(bào) 2020年5期2020-01-19
- 中國(guó)科學(xué)家創(chuàng)建出新型糖基化酶堿基編輯器
組編輯前沿技術(shù)，堿基編輯(base editing, BE)無(wú)需產(chǎn)生DNA 雙鏈斷裂，也無(wú)需供體DNA 的參與，可實(shí)現(xiàn)靶位點(diǎn)的精準(zhǔn)點(diǎn)突變，已成為基因編輯的重要研究方向。 現(xiàn)有堿基編輯器只能實(shí)現(xiàn)嘧啶間（胞嘧啶堿基編輯器）和嘌呤間（腺嘌呤堿基編輯器）的堿基轉(zhuǎn)換，尚沒(méi)有堿基編輯器實(shí)現(xiàn)嘧啶與嘌呤間的特異性堿基顛換。 開(kāi)發(fā)新型堿基編輯技術(shù)實(shí)現(xiàn)堿基顛換甚至任意堿基變換，在合成生物體系構(gòu)建、遺傳疾病的基因治療、生物性狀修飾等領(lǐng)域具有重要意義。中科院天津工業(yè)生物所張學(xué)禮研
食品與生物技術(shù)學(xué)報(bào) 2020年8期2020-01-06
- 基于454 GS FLX高通量測(cè)序的南疆沙蜥微衛(wèi)星特征分析及其候選引物設(shè)計(jì)
星標(biāo)記多態(tài)性，三堿基和四堿基重復(fù)微衛(wèi)星的不易產(chǎn)生由于滑鏈錯(cuò)配形成影子帶(O’reilly & Wright，1995)等優(yōu)越性(O’connell & Wright，1997)，因此，選取部分三、四堿基重復(fù)的微衛(wèi)星進(jìn)行引物設(shè)計(jì)篩選，得到可用于微衛(wèi)星分析的部分候選引物，以期為利用微衛(wèi)星標(biāo)記研究南疆沙蜥種群遺傳結(jié)構(gòu)奠定基礎(chǔ)。1 材料和方法1.1 樣品收集、基因組DNA提取及Roche 454 GS FLX高通量測(cè)序用于基因組測(cè)序的南疆沙蜥標(biāo)本(標(biāo)本號(hào)：WGXG
四川動(dòng)物 2019年5期2019-09-23
- 制造前所未有的生命
，中間通過(guò)一對(duì)對(duì)堿基相連。如果把DNA看成一架雙螺旋狀的梯子，兩條長(zhǎng)鏈就相當(dāng)于兩邊的扶欄，而堿基對(duì)相當(dāng)于中間踏腳的橫木。每條“橫木”都由兩個(gè)堿基組成，每邊各出一個(gè)，堿基之間則通過(guò)氫鍵（一種分子間作用力）相連。堿基有4種類(lèi)型，它們只能以特定的方式配對(duì)：腺嘌呤（A）配胸腺嘧啶（T），鳥(niǎo)嘌呤（G）配胞嘧啶（C）。堿基的序列就編碼著我們基因中的信息。這些堿基的大小還不一樣，嘌呤要比嘧啶大，所以每對(duì)堿基事實(shí)上是以大對(duì)小，或小對(duì)大的方式配對(duì)的。這一切構(gòu)成了我們對(duì)DNA
風(fēng)流一代·經(jīng)典文摘 2019年8期2019-08-16
- 生命“字母表”迎來(lái)新成員
的DNA包含4個(gè)堿基，現(xiàn)在，美國(guó)科學(xué)家將生命“字母表”的數(shù)量增加了一倍，首次合成出包含8個(gè)堿基的DNA。應(yīng)用分子進(jìn)化基金會(huì)創(chuàng)始人史蒂文·本納領(lǐng)導(dǎo)的團(tuán)隊(duì)，通過(guò)調(diào)整普通堿基——鳥(niǎo)嘌呤、胞嘧啶、腺嘌呤和胸腺嘧啶（G、C、A、T，其中A與T配對(duì)、C與G配對(duì)）的分子結(jié)構(gòu)，創(chuàng)建出兩對(duì)新堿基：S和B、P和Z。新堿基的形狀與天然堿基類(lèi)似，但結(jié)合方式不同。隨后，他們將合成堿基與天然堿基結(jié)合，得到了由8個(gè)堿基組成的DNA。實(shí)驗(yàn)表明，合成DNA似乎能像天然DNA一樣存儲(chǔ)和轉(zhuǎn)錄信
學(xué)苑創(chuàng)造·B版 2019年5期2019-06-14
- 生命“字母表”迎來(lái)4名新成員
的DNA包含4種堿基，現(xiàn)在，美國(guó)科學(xué)家通過(guò)調(diào)整普通堿基——鳥(niǎo)嘌呤、胞嘧啶、腺嘌呤和胸腺嘧啶（G、C、A、T，其中A與T配對(duì)、C與G配對(duì)）的分子結(jié)構(gòu)，創(chuàng)建出兩對(duì)新堿基：S和B、P和Z。隨后，研究人員將合成堿基與天然堿基結(jié)合，得到了由8個(gè)堿基組成的DNA。實(shí)驗(yàn)表明，合成序列與天然DNA擁有相同屬性：它們采用相同的方式可靠地配對(duì);無(wú)論合成堿基的順序如何，雙螺旋結(jié)構(gòu)都保持穩(wěn)定;DNA可忠實(shí)地轉(zhuǎn)錄成RNA。這一成果首次系統(tǒng)性證明了合成堿基與天然堿基可彼此識(shí)別并結(jié)合，
科學(xué)24小時(shí) 2019年5期2019-06-11
- 生命“字母表”迎來(lái)4名新成員
的DNA包含4個(gè)堿基，現(xiàn)在，美國(guó)科學(xué)家將生命“字母表”的數(shù)量增加了一倍，首次合成出包含8個(gè)堿基的DNA。實(shí)驗(yàn)表明，合成DNA似乎能像天然DNA一樣存儲(chǔ)和轉(zhuǎn)錄信息。應(yīng)用分子進(jìn)化基金會(huì)創(chuàng)始人史蒂文·本納領(lǐng)導(dǎo)的團(tuán)隊(duì)，通過(guò)調(diào)整普通堿基——鳥(niǎo)嘌呤、胞嘧啶、腺嘌呤和胸腺嘧啶（G、C、A、T，其中A與T配對(duì)、C與G配對(duì)）的分子結(jié)構(gòu)，創(chuàng)建出兩對(duì)新堿基：S和B、P和Z。新堿基的形狀與天然堿基類(lèi)似，但結(jié)合方式不同。隨后，他們將合成堿基與天然堿基結(jié)合，得到了由8個(gè)堿基組成的DN
發(fā)明與創(chuàng)新 2019年9期2019-03-26
- 重要食藥同源植物余甘子轉(zhuǎn)錄組微衛(wèi)星特征分析
并對(duì)其分布特征、堿基組成和變異規(guī)律進(jìn)行分析，以期為下一步大量EST-SSR標(biāo)記的開(kāi)發(fā)提供遺傳學(xué)資料，進(jìn)而為余甘子遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)的研究奠定基礎(chǔ)，亦為余甘子野生資源的保護(hù)和合理開(kāi)發(fā)利用提供參考依據(jù)。1 材料與方法1.1 試驗(yàn)材料本研究以云南省賓川縣(25°45′59″N,100°26′29″E)野生余甘子為研究對(duì)象，于2017年6月采集余甘子植株的幼嫩葉片，立即置于液氮中，帶回實(shí)驗(yàn)室于-80℃冰箱中保存?zhèn)溆谩?.2 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及拼接組裝余甘子總RNA的提
植物研究 2019年2期2019-03-19
- 制造前所未有的生命
，中間通過(guò)一對(duì)對(duì)堿基相連。如果把DNA看成一架雙螺旋狀的梯子，兩條長(zhǎng)鏈就相當(dāng)于兩邊的扶欄，而堿基對(duì)相當(dāng)于中間踏腳的橫木。每條“橫木”都由兩個(gè)堿基組成，每邊各出一個(gè)，堿基之間則通過(guò)氫鍵（一種分子間作用力）相連。堿基有4種類(lèi)型，它們只能以特定的方式配對(duì)：腺嘌呤（A）配胸腺嘧啶（T），鳥(niǎo)嘌呤（G）配胞嘧啶（C）。堿基的序列就編碼著我們基因中的信息。這些堿基的大小還不一樣，嘌呤要比嘧啶大，所以每對(duì)堿基事實(shí)上是以大對(duì)小，或小對(duì)大的方式配對(duì)的。這一切構(gòu)成了我們對(duì)DNA
科學(xué)之謎 2019年1期2019-03-19
- 巧用兩種堿基數(shù)目之和例析雙鏈DNA的共性和特異性
各種生物DNA的堿基組成，發(fā)現(xiàn)A與T的比值以及G與C的比值總是接近于1.0。沃森（J. D. Watson）和克里克（F. Crick）以此為根據(jù)構(gòu)建了DNA的雙螺旋模型。堿基配對(duì)的氫鍵和上下堿基對(duì)之間形成的堿基堆積力是構(gòu)成DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)的內(nèi)部原因，即腺嘌呤（A）與胸腺嘧啶（T）配對(duì)，鳥(niǎo)嘌呤（G）與胞嘧啶（C）配對(duì)，數(shù)量上A=T,G=C。這種配對(duì)方式主要有兩個(gè)根據(jù)：氫鍵的形成與空間的排列。DNA的雙鏈脫氧核糖核苷酸對(duì)應(yīng)部位的堿基之間的距離是1.08 nm
教學(xué)考試(高考生物) 2018年5期2018-12-08
- 遺傳密碼的擴(kuò)展
，而組成基因組的堿基只有4種： ATGC(RNA中U替代了T)，即4種堿基的不同排列組合形成了不同的基因和基因組。遺傳密碼共有64個(gè)密碼子，其中還包括終止密碼子和簡(jiǎn)并密碼子，所以，實(shí)際編碼20種氨基酸的密碼子不到64種。在漫長(zhǎng)的生物進(jìn)化過(guò)程中，這4種堿基的排列組合有變化，但沒(méi)有更多堿基的參與，自然界的生物均是如此，概莫能外。僅憑4種堿基、64個(gè)密碼子、20種氨基酸就能形成地球上那么多形形色色的生命，如果再增加一個(gè)堿基對(duì)，則可以有6×6×6=216個(gè)密碼子，
生物學(xué)教學(xué) 2018年6期2018-11-30
- 串聯(lián)重復(fù)序列在克萊門(mén)柚基因組中的特征研究
)被定義為，每兆堿基對(duì)含有的串聯(lián)重復(fù)序列的堿基對(duì)數(shù)(bp/Mbp)，表示串聯(lián)重復(fù)序列長(zhǎng)度在總檢測(cè)序列長(zhǎng)度中所占的比例。依據(jù)圖1，分別計(jì)算、分析克萊門(mén)柚基因組UI1000、UI500、UI200、5′UTR、CDS、Intron、3′UTR、DI200、DI500、DI1000區(qū)域中的串聯(lián)重復(fù)序列特征。1.2 串聯(lián)重復(fù)序列的檢測(cè)和分析為了對(duì)健全和不完善的串聯(lián)重復(fù)序列的檢測(cè)，利用串聯(lián)重復(fù)序列的搜索工具(Phobos version 3.3.12)?？紤]所需處理
西南農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào) 2018年8期2018-09-11
- 串聯(lián)重復(fù)序列在高粱基因組中的特征及分布
，并表現(xiàn)出種屬、堿基組成等的特異性[3]。在同一物種基因組中，串聯(lián)重復(fù)序列在編碼區(qū)和非編碼區(qū)都有分布，并且在非編碼區(qū)大量存在[4]。隨著計(jì)算技術(shù)的進(jìn)步及高通量數(shù)據(jù)分析的出現(xiàn)，重復(fù)序列研究已不僅僅局限于微衛(wèi)星等短重復(fù)序列(通常指1～10 bp)，中等重復(fù)序列(>10 bp)也已經(jīng)被廣泛研究，并且研究顯示，這些重復(fù)序列在植物及綠藻的基因轉(zhuǎn)錄及翻譯調(diào)控中扮演著重要的作用[5]。本研究利用Phytozome數(shù)據(jù)庫(kù)，下載高粱全基因組及基因組注解數(shù)據(jù)，然后使用Phob
河南農(nóng)業(yè)科學(xué) 2018年7期2018-08-20
- 枸杞轉(zhuǎn)錄組SSR分布特征分析及其與基因組SSR分布特征的比較
NA為模板，用6堿基隨機(jī)引物合成第1鏈cDNA，然后加入緩沖液、dNTPs、DNA polymeraseⅠ、RNase H合成第2鏈cDNA，再用AMPure XP beads純化雙鏈cDNA。將處理后的cDNA先進(jìn)行末端修復(fù)、加A尾并連接測(cè)序接頭，再用AMPure XP beads進(jìn)行選擇。最后進(jìn)行PCR擴(kuò)增，并用AMPure XP beads純化產(chǎn)物，得到最終的文庫(kù)。把不同文庫(kù)按照有效濃度及目標(biāo)下機(jī)數(shù)據(jù)量的需求pooling后進(jìn)行Illumina Hi
江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2018年14期2018-08-08
- 基于CRISPR/Cas9系統(tǒng)的單堿基基因編輯技術(shù)及其在醫(yī)藥研究中的應(yīng)用
NA能與靶序列的堿基互補(bǔ)配對(duì)，Cas9蛋白作為核酸酶能切割雙鏈DNA，靶序列3′端的前間區(qū)序列鄰近基序（protospacer adja?cent motif，PAM）為Cas9的DNA識(shí)別位點(diǎn)，sgRNA與Cas9蛋白形成復(fù)合物后，通過(guò)sgRNA與靶序列的配對(duì)和Cas9蛋白對(duì)PAM的識(shí)別，該RNA-蛋白復(fù)合物精準(zhǔn)地靶向特異的DNA位點(diǎn)，激活Cas9的核酸酶活性，切割靶DNA，產(chǎn)生雙鏈斷裂（double strand breaks，DSB）［12-13］。
中國(guó)藥理學(xué)與毒理學(xué)雜志 2018年7期2018-01-21
- 單堿基編輯工具及在基因治療中的應(yīng)用及前景
on-Crick堿基配對(duì)來(lái)定位和切割一段目標(biāo)核酸序列（前間隔序列）。前間隔序列附近必須有Cas蛋白依賴的短核酸序列——PAM[1]。目標(biāo)核酸序列切割后通過(guò)非同源末端連接（NHEJ）或同源重組修復(fù)（HDR）可恢復(fù)DNA的完整性。CRISPR系統(tǒng)的出現(xiàn)及其在真核生物基因組編輯領(lǐng)域的應(yīng)用[2]引發(fā)了生命科學(xué)的巨大進(jìn)步，但研究大多基于非同源末端連接修復(fù)技術(shù)[3]。盡管在細(xì)胞系中，通過(guò)抑制NHEJ、優(yōu)化DNA模板等方法，利用HDR的基因編輯技術(shù)取得了巨大的進(jìn)步，但是
中華耳科學(xué)雜志 2018年2期2018-01-17
- 新型堿基編輯器橫空出世
們開(kāi)發(fā)出的腺嘌呤堿基編輯器（ABE），能將A-T堿基對(duì)轉(zhuǎn)換為G-C堿基對(duì)。腺嘌呤（A）、鳥(niǎo)嘌呤（G）、胞嘧啶（C）和胸腺嘧啶（T）是構(gòu)成DNA的基本單元。這些堿基按照A-T，C-G這樣配對(duì)形式，搭建起DNA的雙螺旋結(jié)構(gòu)。而在RNA中，胸腺嘧啶（T）由尿嘧啶（U）替代。2016年，同樣發(fā)表在《自然》雜志，David Liu及同事首次報(bào)告了他們的“堿基編輯器”，通過(guò)在Cas9蛋白上安裝大鼠胞苷脫氨酶APOBEC1，Cas9的“剪刀”功能會(huì)消失，不再切割DNA雙
醫(yī)藥前沿 2018年3期2018-01-16
- 虎皮鸚鵡全基因組中微衛(wèi)星分布規(guī)律研究
，查找到l～6個(gè)堿基重復(fù)類(lèi)型的微衛(wèi)星序列共90 346個(gè)，約占整個(gè)基因組總長(zhǎng)度的序列(1.1 Gb)的0.41%，分布頻率為82.9/Mb。不同類(lèi)型微衛(wèi)星中，單堿基重復(fù)類(lèi)型數(shù)目最多，為50 349個(gè)，占總數(shù)的55.7%；其次是二、四、三、五、六堿基重復(fù)單元序列，分別占到總數(shù)的16.3%，13.7%，10.8%，2.9%，0.5%。單堿基微衛(wèi)星中A重復(fù)類(lèi)型數(shù)量最多，二堿基中AT最多，三堿基中AAT，四堿基中AAAC最多，五堿基中AAAGA最多，六堿基中AAC
野生動(dòng)物學(xué)報(bào) 2017年3期2017-11-17
- 滇東南瀕危植物長(zhǎng)梗杜鵑轉(zhuǎn)錄組微衛(wèi)星特征分析
現(xiàn)1個(gè)SSR。二堿基和三堿基重復(fù)為長(zhǎng)梗杜鵑SSR主要重復(fù)單元類(lèi)型，分別占SSR總數(shù)的69.25%和15.07%，187種重復(fù)基元中，所占比例最高的是(AG/CT)n(62.01%)，其次是(A/T)n(12.34%)、(AC/GT)n(4.52%)和(AAG/CTT)n(4.23%)。在SSR和CDS的交集基因中，共發(fā)現(xiàn)15 908個(gè)SSR位點(diǎn)，其中2 792個(gè)位于編碼區(qū)，出現(xiàn)頻率為0.076 SSR/kb，而非編碼區(qū)為0.344 SSR/kb，在基因編碼
林業(yè)科學(xué)研究 2017年4期2017-08-07
- “穩(wěn)定”的半合成有機(jī)體
人員通過(guò)優(yōu)化人工堿基等途徑，制造出“穩(wěn)定”的半合成有機(jī)體，對(duì)未來(lái)的生物醫(yī)療開(kāi)發(fā)具有重要意義，也朝著創(chuàng)造新生命形式邁出重要一步。自然界所有生命的遺傳物質(zhì)由4個(gè)堿基構(gòu)成，分別是腺嘌呤（A）、胸腺嘧啶（T）、胞嘧啶（C）和鳥(niǎo)嘌呤（G），其中A與T，C與G分別配對(duì)。此前科學(xué)家制造出兩個(gè)相配對(duì)的人工堿基X與Y，并將這個(gè)新的堿基對(duì)成功插入大腸桿菌的DNA中，制造出第一個(gè)半合成有機(jī)體。但它生長(zhǎng)緩慢，而且人工堿基X與Y無(wú)法永久性傳遞下去，會(huì)隨著細(xì)胞的分裂很快消失。新的研究
百科知識(shí) 2017年11期2017-06-13
- 生物高考DNA計(jì)算問(wèn)題匯總
的基本骨架；含氮堿基排列在內(nèi)側(cè)，兩條單鏈上相對(duì)的堿基以氫鍵連接，堿基的配對(duì)是有規(guī)律的，即A一定與T配對(duì)（形成兩個(gè)氫鍵），G一定與C配對(duì)（形成三個(gè)氫鍵）。例1：下圖為某同學(xué)在學(xué)習(xí)DNA結(jié)構(gòu)后，畫(huà)的含有兩個(gè)堿基對(duì)的DNA片斷（其中○表示磷酸）。下列幾位同學(xué)對(duì)此圖的評(píng)價(jià)，正確的是（）A甲說(shuō)：該圖沒(méi)有什么物質(zhì)和結(jié)構(gòu)上的錯(cuò)誤B乙說(shuō)：該圖有一處錯(cuò)誤，就是U應(yīng)改為T(mén)C兩說(shuō)：三處錯(cuò)誤，其中核糖應(yīng)為脫氧核糖D丁說(shuō)：如圖說(shuō)畫(huà)的是RNA雙鏈，則正確解析：選C。圖中有三處錯(cuò)誤，一
課程教育研究·新教師教學(xué) 2016年29期2017-04-10
- 基因中堿基數(shù)目的正確計(jì)算方法
，則該基因所含的堿基數(shù)是多少？學(xué)生作出的答案有18888個(gè)堿基、18894個(gè)堿基、18900個(gè)堿基、18906個(gè)堿基和18912個(gè)堿基等5種類(lèi)型，為什么會(huì)出現(xiàn)這么多的答案呢？解答此類(lèi)習(xí)題，首先要具備有關(guān)蛋白質(zhì)和基因結(jié)構(gòu)的5個(gè)知識(shí)要點(diǎn)：① 一條多肽鏈上氨基酸的數(shù)目等于肽鍵數(shù)+1；② 密碼子是三聯(lián)體；③ 基因的結(jié)構(gòu)為DNA，是雙鏈的；④基因末端有終止密碼；⑤ 基因的前端有起始密碼，在真核生物起始密碼負(fù)責(zé)的在N端第一個(gè)甲硫氨酸、原核生物起始密碼負(fù)責(zé)的N端第一個(gè)甲
生物學(xué)教學(xué) 2017年12期2017-02-18
- 作物基因組單堿基編輯方法研究取得重要進(jìn)展
，借鑒哺乳動(dòng)物單堿基編輯方法，利用Cas9變體(nCas9-D10A)融合大鼠胞嘧啶脫氨酶(rAPOBEC1)和尿嘧啶糖基化酶抑制劑(UGI)，構(gòu)成了高效的植物單堿基編輯系統(tǒng)nCas9-PBE，成功地在三大重要農(nóng)作物(小麥、水稻和玉米)基因組中實(shí)現(xiàn)高效、精確的單堿基定點(diǎn)突變。單核苷酸點(diǎn)突變是作物許多重要農(nóng)藝性狀發(fā)生變異的遺傳基礎(chǔ)。單堿基的變異會(huì)導(dǎo)致氨基酸替換或蛋白質(zhì)翻譯終止,使基因功能發(fā)生改變，從而有可能產(chǎn)生優(yōu)良的等位基因與優(yōu)異性狀。傳統(tǒng)誘變及單堿基突變篩
生物學(xué)教學(xué) 2017年8期2017-02-18
- 遺傳發(fā)育所在作物基因組單堿基編輯方法研究中取得進(jìn)展
異的遺傳基礎(chǔ)。單堿基的變異會(huì)導(dǎo)致氨基酸替換或蛋白質(zhì)翻譯終止，使基因功能發(fā)生改變，從而有可能產(chǎn)生優(yōu)良的等位基因與優(yōu)異性狀。傳統(tǒng)誘變及單堿基突變篩選技術(shù)（如TILLING）需要進(jìn)行基因組規(guī)模的篩選，耗時(shí)、耗力且鑒定到的點(diǎn)突變數(shù)目和種類(lèi)有限?；蚪M編輯技術(shù)，特別是基于CRISPR/Cas9系統(tǒng)的基因組編輯技術(shù)，可以在基因組靶向位點(diǎn)處產(chǎn)生DNA雙鏈斷裂（DSB），以人為提供的外源供體DNA為模板，通過(guò)同源重組（HR）介導(dǎo)的DNA修復(fù)途徑來(lái)實(shí)現(xiàn)對(duì)目標(biāo)基因的單堿基突變
蔬菜 2017年3期2017-02-02
- 一步獲取基因定點(diǎn)修飾技術(shù)測(cè)序樣品雙峰中突變序列方法的建立
步明確具體的模板堿基改變是否有意義(移碼或提前終止)，可通過(guò)擴(kuò)增獲取測(cè)序套峰樣品的目標(biāo)基因片段PCR產(chǎn)物，將其克隆到質(zhì)粒(如T載體)，篩選陽(yáng)性單克隆測(cè)序或?qū)CR產(chǎn)物進(jìn)行PAGE膠純化(片段大小差別大，至少瓊脂糖充分電泳后能夠?qū)崿F(xiàn)切膠純化)后再進(jìn)行測(cè)序?？寺y(cè)序存在操作繁瑣、工作量大、周期長(zhǎng)以及費(fèi)用高等問(wèn)題；而切膠純化在實(shí)際操作時(shí)又存在很多困難，其原因在于基因剪輯技術(shù)得到的新基因型在序列缺失/增加堿基數(shù)量與野生型相差不大，因此切膠純化僅針對(duì)一部分大片段剪輯
安徽農(nóng)業(yè)科學(xué) 2016年34期2017-01-10
- 新納米技術(shù)用于檢測(cè)腫瘤生物標(biāo)志物
或是幾百個(gè)單元的堿基鏈或堿基序列組成。人們發(fā)現(xiàn)這些堿基都具有精確排序，即使是很短一段，也與它們的功能密切相關(guān)，因此可以將其作為細(xì)胞和組織內(nèi)部發(fā)生病變時(shí)的直接標(biāo)志物。例如，一個(gè)被稱為mRNA（微小核糖核酸）的核酸家族只有大約20個(gè)堿基的長(zhǎng)度，但卻可以作為包括癌癥在內(nèi)多種疾病的信號(hào)。（《科學(xué)日?qǐng)?bào)》）
大眾健康 2016年3期2016-05-31
- 改進(jìn)CRISPR/Cas9法：成功逆轉(zhuǎn)單個(gè)堿基變異
法：成功逆轉(zhuǎn)單個(gè)堿基變異美國(guó)哈佛大學(xué)科學(xué)家報(bào)告了用于定位和修改DNA單個(gè)堿基，而且不在基因組中引入隨機(jī)插入和缺失基因組的一種改進(jìn)方法。這種新的“堿基編輯”法使用一種修飾過(guò)的CRISPR/Cas9蛋白質(zhì)，使它和另外兩種蛋白質(zhì)一同工作，比現(xiàn)在修正單堿基變異的方法更高效。該方法已經(jīng)被用于培養(yǎng)細(xì)胞，成功逆轉(zhuǎn)了和疾病有關(guān)的單個(gè)堿基變異，包括晚發(fā)性阿爾茨海默癥與乳腺癌。另外兩個(gè)分別為德國(guó)科學(xué)家、中國(guó)科學(xué)家發(fā)表的研究，則提供了關(guān)于Cpf1酶機(jī)制和結(jié)構(gòu)的新信息。（摘自：《
甘肅醫(yī)藥 2016年5期2016-03-09
- 棗轉(zhuǎn)錄組序列的微衛(wèi)星特征分析
得轉(zhuǎn)錄組序列的單堿基至五堿基微衛(wèi)星中，以單堿基微衛(wèi)星最多（6 314個(gè)，50.02%），并以A/T（6 217個(gè)，98.46%）為主要重復(fù)單元；二堿基微衛(wèi)星（3 335個(gè)，26.42%）次之，其中以AG/CT（2 532個(gè)，75.92%）類(lèi)型最多；再次是三堿基微衛(wèi)星（2 871個(gè)，22.74%）；最后是四堿基和五堿基微衛(wèi)星，二者僅占所有微衛(wèi)星信息的0.82%。單堿基微衛(wèi)星所占比例最多，為棗最優(yōu)勢(shì)微衛(wèi)星，而且其重復(fù)單元次數(shù)的變化明顯高于其他重復(fù)類(lèi)型，表明單堿
中南林業(yè)科技大學(xué)學(xué)報(bào) 2015年6期2015-12-20
- 獨(dú)辟蹊徑 化難為易
A雙鏈或單鏈某些堿基所占比率，求其他堿基占對(duì)應(yīng)鏈的比率問(wèn)題，是困擾歷屆學(xué)生的難點(diǎn)之一。利用數(shù)學(xué)推導(dǎo)，巧妙避開(kāi)公式的易學(xué)易用的堿基比率的計(jì)算方法，可輕松幫助學(xué)生突破難點(diǎn)。[關(guān)鍵詞]堿基比率計(jì)算 1DNA 12DNA堿基比率計(jì)算中，有一類(lèi)已知DNA雙鏈或單鏈某些堿基所占比率，求其他堿基占對(duì)應(yīng)鏈的比率問(wèn)題，它是困擾歷屆學(xué)生的難點(diǎn)之一。傳統(tǒng)方法是利用堿基互補(bǔ)配對(duì)原則推論出的多個(gè)公式進(jìn)行計(jì)算。但在教學(xué)過(guò)程中發(fā)現(xiàn)，大部分學(xué)生用起來(lái)并不能得心應(yīng)手，難以理清頭緒。原因是學(xué)
中學(xué)教學(xué)參考·理科版 2015年6期2015-05-30
- 基因語(yǔ)言多了兩個(gè)字母
、T、C、G四種堿基。幾十億年來(lái)，似乎還沒(méi)有什么生物對(duì)這套語(yǔ)言提出“異議”，但人類(lèi)顯然有自己的想法——2014年5月，科學(xué)家真的造出了新“字母”，更奇妙的是，它們還與原來(lái)的“語(yǔ)言”部分兼容，能在活細(xì)胞中復(fù)制。只靠四種堿基就能創(chuàng)造出如此斑斕的生物世界，新堿基將帶給我們無(wú)窮的想象空間。怎樣的“字母”才算新早在20世紀(jì)60年代，已經(jīng)有科學(xué)家在思考：生命能否用其他“字母”書(shū)寫(xiě)？如果能夠創(chuàng)造出新的基因“字母”，能否創(chuàng)造新的生命形式？但直到1989年，人類(lèi)才獲得實(shí)質(zhì)性
中學(xué)科技 2015年1期2015-04-28
- 紫外光譜法研究久效磷與堿基的相互作用
核苷酸庫(kù)的構(gòu)建，堿基是寡核苷酸的重要組成，從微觀入手研究堿基和久效磷的作用，將為核酸適體庫(kù)的構(gòu)建及適體的篩選奠定基礎(chǔ)。紫外可見(jiàn)吸收光譜是研究小分子與堿基和DNA相互作用的一種最簡(jiǎn)便、最常用的技術(shù)，小分子與堿基的相互作用會(huì)引起特征吸收峰的紅移或藍(lán)移現(xiàn)象及增色和減色現(xiàn)象，因此通過(guò)吸收峰的變化可以判斷堿基和小分子的作用程度［4－5］。童裳倫等［6］通過(guò)紫外可見(jiàn)吸收光譜法研究發(fā)現(xiàn)百草枯分子通過(guò)嵌插方式結(jié)合到小牛胸腺DNA的雙螺旋結(jié)構(gòu)上。何盈盈等［7］研究發(fā)現(xiàn)蒽與D
安徽科技學(xué)院學(xué)報(bào) 2014年5期2014-12-02
- 基于堿基間隔距離模型的多瘤病毒系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系分析
12007）基于堿基間隔距離模型的多瘤病毒系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系分析周立前1，李瑞1，溫在義2（1.湖南工業(yè)大學(xué)計(jì)算機(jī)與通信學(xué)院，湖南株洲412007；2.湖南工業(yè)大學(xué)理學(xué)院，湖南株洲412007）DNA序列的堿基間隔距離分析方法可以對(duì)完全基因組序列進(jìn)行較好地分析，但是對(duì)短基因序列分析的效果不佳。因此，在堿基間隔距離的基礎(chǔ)上，提出了一種改進(jìn)的DNA序列堿基間隔距離模型，并結(jié)合歐式距離，構(gòu)建了70種多瘤病毒基因組的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)。通過(guò)將所得系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)與已有文獻(xiàn)中
湖南工業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào) 2014年3期2014-05-04
- DNA序列堿基組合的頻率矩陣及其應(yīng)用
爾科夫鏈，分別以堿基A，T，C和G在序列中出現(xiàn)的次數(shù)作為基準(zhǔn)來(lái)構(gòu)造轉(zhuǎn)移矩陣，進(jìn)而刻畫(huà)11個(gè)物種的β-globin基因第一個(gè)外顯子編碼序列的差別.本文以序列的長(zhǎng)度作為基準(zhǔn)，基于堿基組合在DNA序列中出現(xiàn)的頻率，構(gòu)造了DNA序列的頻率矩陣.1 堿基組合的頻率矩陣1.1 頻率矩陣的定義給定長(zhǎng)為n的生物序列l(wèi)＝l1l2l3…ln，li∈S，S＝｛A，T，C，G｝為堿基集合.記 AA在序列中出現(xiàn)的次數(shù)為nAA，則定義PAA＝nAA／n.同理，可分別定義PAT，PAC
- 堿基互補(bǔ)配對(duì)原則的推論及例析
裴亞玲堿基互補(bǔ)配對(duì)原則是指DNA分子形成堿基對(duì)時(shí)，A一定與T配對(duì)，G一定與C配對(duì)的一一對(duì)應(yīng)關(guān)系。根據(jù)堿基互補(bǔ)配對(duì)原則，可推出如下規(guī)律.規(guī)律一．一個(gè)雙鏈DNA分子中，A=T，G=C，且嘌呤堿基總數(shù)等于嘧啶堿基總數(shù)，各占全部堿基數(shù)的50%，即A+G=T+C=50%。由此可知，在雙鏈DNA分子中：a．A+G=T+C=A+C=T+Gb．(A+G)/(T+C)=1【例1】 假設(shè)在一個(gè)DNA分子的片段中，含有鳥(niǎo)嘌呤240個(gè)，占全部堿基數(shù)的24%，在此DNA片段中，胸腺
中學(xué)理科·綜合版 2008年9期2008-10-15