菌門
- 重型β 地中海貧血患兒移植前后腸道菌群變化研究
分析，A組的主要菌門是厚壁菌門、擬桿菌門、變形菌門、放線菌門、梭菌門、疣狀菌門。而B 組的主要菌門是厚壁菌門、擬桿菌門、變形菌門、放線菌門、梭菌門、疣狀菌門、藍(lán)菌門。C組主要菌門是變形菌門、擬桿菌門、厚壁菌門、梭菌門、疣狀菌門。D組主要菌門為變形菌門、擬桿菌門、厚壁菌門、梭菌門。E組則由變形菌門、擬桿菌門、厚壁菌門、放線菌門、梭菌門等菌門組成。2.3 腸道菌群構(gòu)成變化5 組之間厚壁菌門、變形菌門、擬桿菌門、梭菌門、放線菌門、疣狀菌門、藍(lán)菌門的豐度差異均有統(tǒng)
臨床兒科雜志 2023年11期2023-11-22
- 雞糞堆肥中的細(xì)菌群落組成及多樣性分析
主要因素，且厚壁菌門(Firmicutes)和變形菌門(Proteobacteria)在氮素轉(zhuǎn)化和釋放過程中發(fā)揮重要作用。敖靜等[8]的研究進(jìn)一步表明，堆肥中菌群數(shù)量與堆體溫度、纖維素酶活性和過氧化氫酶(CAT)活性呈正相關(guān)，與脲酶和蛋白酶活性無顯著相關(guān)性。Chen等[9]研究表明，在豬糞便堆肥中厚壁菌門和變形菌門是占據(jù)主導(dǎo)地位的菌門且厚壁菌門中的乳桿菌屬(Lactobacillus)細(xì)菌能有效降解3-羥基-5-甲基異惡唑(3-MI)，從而有效緩解豬糞便中
西南農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào) 2023年1期2023-03-31
- 內(nèi)蒙古賽罕烏拉自然保護(hù)區(qū)馬鹿夏季腸道菌群多樣性
有更高豐度的變形菌門（Proteobacteria）［7］。馬鹿（Cervus elaphus）生活于范圍較大的針闊混交林、林緣或靠近水源的林地，是國家二級重點(diǎn)保護(hù)野生動(dòng)物［8］。對于馬鹿的生態(tài)研究涵蓋了食性、家域、種群遺傳結(jié)構(gòu)和行為習(xí)性等多方面內(nèi)容［9-12］。阿拉善馬鹿（C.e.alashanicus）冬季腸道菌群以厚壁菌門（Firmicutes）、擬桿菌門（Bacteroidetes）和變形菌門為優(yōu)勢菌門，顯示菌群群落組成與食性密切相關(guān)［13］。不同
野生動(dòng)物學(xué)報(bào) 2023年1期2023-02-22
- 甘薯根際土壤微生物群落結(jié)構(gòu)及多樣性分析
7個(gè)，分別為變形菌門(Proteobectria，18.83%～29.65%)、綠彎菌門(Chloroflexi，20.50%～25.85%)、放線菌門(Actinobacteria，15.52%～18.57%)、酸桿菌門(Acidobacteria，10.86%～21.59%)、芽單胞菌門(Gemmatimonadetes，5.22%～6.72%)、厚壁菌門(Firmicutes，3.23%～4.45%)和擬桿菌門(Bacteroidetes，1.69%
西南農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào) 2022年9期2022-12-05
- 基于宏基因組測序?qū)δ膛＿\(yùn)動(dòng)場土壤和糞便微生物群落結(jié)構(gòu)的分析
占比最高的是變形菌門（Proteobacteria，42.06%～44.01%）和放線菌門（Actinobacteria，18.42%～22.26%），其次依次是擬桿菌門（Bacteroidetes，6.63%～6.70%）、綠灣菌門（Chloroflexi，3.44%～4.26%）、浮霉菌門（Planctomycetes，3.40%～4.57%）、芽單胞菌門（Gemmatimonadetes，3.82%～4.17%）、酸桿菌門（Acidobacteria
養(yǎng)殖與飼料 2022年2期2022-12-05
- 水處理周期中微生物群落結(jié)構(gòu)的變化
bacteria菌門的Nitrosomonas菌屬、Nitrospirae菌門的Nitrospira菌屬)的富集。以上研究表明，養(yǎng)殖環(huán)境因子不僅會影響?zhàn)B殖對象的生理狀態(tài)，也會改變養(yǎng)殖環(huán)境中微生物群落結(jié)構(gòu)。碳源的添加方式是反應(yīng)器運(yùn)行效果的影響因素之一。Ciggin等[7]研究表明分次添加碳源的方式比連續(xù)添加更加能促進(jìn)微生物的生長。張萬友等[8]研究表明分次添加碳源的處理方式在處理序批式反應(yīng)器(sequencing batch reactor,SBR)中更加有
安徽農(nóng)業(yè)科學(xué) 2022年20期2022-11-11
- 特殊竹林土壤細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)及多樣性研究
細(xì)菌主要來自變形菌門(Proteobacteria)、放線菌門(Actinomycetes)、酸桿菌門(Acidobacteria)和綠彎菌門(Chloroflexi)[4-5]，其中綠彎菌門是竹林土壤的特有優(yōu)勢菌[6]。對毛竹林的研究顯示，竹林非根際土壤細(xì)菌數(shù)量低于其他林地植物[7-8]，以酸桿菌門和變形菌門為主[9]，主要包括嗜糖假單胞菌Zoogloea、Pelomonas、陶厄氏菌屬Thauera、根瘤菌屬Rhizobium等[10]；而雷竹林則以綠
科學(xué)技術(shù)與工程 2022年26期2022-11-01
- 礦井水對荒漠草原土壤微生物群落結(jié)構(gòu)及多樣性的影響
的門分別為：放線菌門（Actinobacteria）、變形菌門（Proteobacteria）、綠彎菌門（Chloroflexi）、酸桿菌門（Acidobacteria）、厚壁菌門（Firmicutes）、芽單胞菌門（Gemmatimonadota）、擬桿菌門（Bacteroidota）、粘球菌門（Myxococcota）、脫硫細(xì)菌門（Desulfobacterota）和Methylomirabilota。各細(xì)菌相對含量分析表明，放線菌門（33.94%）、
干旱區(qū)研究 2022年5期2022-10-26
- 不同種植地膽木根際的細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)和多樣性
根際土壤的優(yōu)勢細(xì)菌門為 Rokubacteria 、WPS-2、芽單胞菌門（Gemmatimonadetes)、浮霉菌門（Planctomycetes)、厚壁菌門（Firmicutes)、疣微菌門（Verrucomicrobia)、綠彎菌門（Chloroflexi)、放線菌門（Actinobacteria)、變形菌門（Proteobacteria)、酸桿菌門（Acidobacteria）等10個(gè)細(xì)菌門。DM4、DM14第一優(yōu)勢菌門為變形菌門，其相對豐度分別
熱帶生物學(xué)報(bào) 2022年5期2022-09-23
- 青海湖高寒濕地土壤細(xì)菌群落對氮添加的響應(yīng)
土壤理化性質(zhì)和細(xì)菌門水平多樣性之間的相關(guān)性進(jìn)行分析。數(shù)據(jù)以平均值±標(biāo)準(zhǔn)偏差的形式列出。2 結(jié)果與分析2.1 不同氮添加土壤基本理化性質(zhì)由表1可知，土壤pH值在7.3—7.57之間，研究區(qū)濕地土壤環(huán)境呈弱堿性，N10添加后，雖pH值提高，但各處理間差異不顯著（P>0.05），氮沉降對土壤pH沒有顯著影響。不同處理間土壤水分存在差異，隨施氮量的增加土壤水分逐漸增加，且表層土壤水分顯著高于深層土壤水分（P表1 不同氮添加處理對土壤理化性質(zhì)的影響Table 1 E
生態(tài)環(huán)境學(xué)報(bào) 2022年6期2022-08-10
- 海水魚循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)中細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)研究進(jìn)展
勢菌通常包含變形菌門、擬桿菌門、變形菌門下的γ-變形菌綱和α-變形菌綱。養(yǎng)殖對象不同，RAS中的細(xì)菌組成也有一定差異。例如，大菱鲆和半滑舌鰨RAS生物濾池中優(yōu)勢菌分別為變形菌門和黃桿菌門，從中也分離鑒定出了亞硝化單胞菌屬及黃桿菌屬等[12]。斑石鯛（）RAS生物濾池內(nèi)優(yōu)勢菌為變形菌門、綠彎菌門、擬桿菌門[26]。褐點(diǎn)石斑魚（）和豹紋鰓棘鱸（）RAS生物濾池內(nèi)優(yōu)勢菌為變形菌門下的γ-變形菌綱和α-變形菌綱[13]。紅鰭東方鲀（）RAS生物濾池優(yōu)勢菌為放線菌門
天津農(nóng)學(xué)院學(xué)報(bào) 2022年2期2022-08-05
- 土壤微生態(tài)對二氯喹啉酸污染及Enterobacter ludwigii EM1 修復(fù)的響應(yīng)
度最高的門為變形菌門（Proteobacteria），其次為擬桿菌門（Bacteroidetes）、芽單胞菌門（Gemmatimonadetes）、酸桿菌門（Acidobacteria）、厚壁菌門（Firmicutes）。QNC 處理與CK 相比，芽單胞菌門的豐度增長5.3 個(gè)百分點(diǎn)，厚壁菌門的豐度降低5.6 個(gè)百分點(diǎn)，疣微菌門（Verrucomicrobia）和浮霉菌門（Planctomycetes）作為新優(yōu)勢菌門出現(xiàn)，原優(yōu)勢菌門單糖菌門（Sacchar
河南農(nóng)業(yè)科學(xué) 2022年4期2022-07-06
- 千峽湖三種肉食性魚類腸道微生物群落結(jié)構(gòu)分析
%）的門類有變形菌門（Proteobacteria）、梭桿菌門（Fusobacteria）、厚壁菌門（Firmicutes）、螺旋菌門（Spirochaetes）、擬桿菌門（Bacteroidetes）、藍(lán)細(xì)菌門（Cyanobacteria）和浮霉菌門（Planctomycetes）。翹嘴鲌腸道菌群分為16 個(gè)菌門，以變形菌門（35.88%）、梭桿菌門（31.80%）、厚壁菌門（27.62%）和擬桿菌門（4.18%）為主，前三優(yōu)勢菌門占比高達(dá)95.30%。
水產(chǎn)學(xué)雜志 2022年3期2022-07-01
- 不同強(qiáng)化處理措施對銅污染土壤微生物多樣性的影響
較大的門類為酸桿菌門 (Acidobacteria，21.80% ～25.86%)、變 形 菌 門(Proteobacteria，19.21% ～23.74%)、放 線 菌 門(Actinobacteria，12.11% ～17.53%)、綠 彎 菌 門(Chloroflexi，9.69%～12.53%)和厚壁菌門(Firmicutes，5.38%～11.50%)。T0和T1處理土壤微生物群落組成較為相似，聚為一類；CK位于較遠(yuǎn)的聚類分支上，說明空白對照與
中國農(nóng)學(xué)通報(bào) 2022年14期2022-06-01
- 不同梯度氮磷鉀施用量對云南植煙土壤細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)與多樣性的影響
1%)依次為變形菌門(Proteobacteria)，酸桿菌門(Acidobacteria)，放線菌門(Actinobacteria)，擬桿菌門(Bacteroidetes)，芽單胞菌門(Gemmatimonadetes)，綠彎菌門(Chloroflexi)，厚壁菌門(Firmicutes)。圖1 不同氮、磷、鉀梯度下細(xì)菌門水平相對豐度在氮梯度(N0、N1、N2、N3)處理中，變形菌門相對豐度分別為37.50%、39.51%、39.98%和40.05%，酸
西南農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào) 2022年4期2022-05-28
- 中華穿山甲腹瀉治療前后糞便微生物群落組成的差異
糞便細(xì)菌群落優(yōu)勢菌門(占比1%以上)依次為厚壁菌門(Firmicutes，65.59%)、變形菌門(Proteobacteria，15.67%)、梭桿菌門(Fusobacteria，8.32%)、擬桿菌門(Bacteroidetes，6.87%)和酸桿菌門(Acidobacteria，2.16%)；治療后為厚壁菌門(63.58%)、變形菌門(21.73%)、梭桿菌門(10.76%)和擬桿菌門(2.77%)(圖3A)。在屬水平上，治療前的優(yōu)勢菌屬(豐度排序前
野生動(dòng)物學(xué)報(bào) 2022年2期2022-05-16
- 基于自主核酸提取方法分析單油井采出液微生物＊
采出液總菌群主要菌門依次是變形菌門(Proteobacteria)、厚壁菌門(Firmicutes)、放線菌門(Actinobacteria)、桿狀菌門(Bacteroidetes)等，其中優(yōu)勢門為變形菌門。主要菌屬依次是蛭弧菌屬(Bdellovibrio)、水小桿菌屬(Aquabacterium)、不運(yùn)桿菌屬(Acinetobacter)等，優(yōu)勢屬為蛭弧菌屬。原油核酸法對Q2YG138140采出液檢出的門和屬水平菌群分類情況見表2。注：*目前未知微生物。
油氣田環(huán)境保護(hù) 2022年2期2022-05-09
- 甘藍(lán)、菜豆和玉米不同輪作組合對淡褐土細(xì)菌群落和作物產(chǎn)量的影響
e 科屬種（厚壁菌門芽孢桿菌綱乳桿菌目乳桿菌科乳桿菌屬棒狀乳桿菌種）和OTU1893 Firmicutes 門Bacilli綱Bacillales 目Paenibacillaceae 科屬uncultured_bacterium 種（厚壁菌門芽孢桿菌綱芽孢桿菌目類芽孢桿菌科類芽孢桿菌屬下未定名種）；BMC處理特有OTU數(shù)為1，是OTU2307 Proteobacteria門Gammaproteobacteria 綱Betaproteobacteriales
- 甲酸和木醋液對苜蓿青貯細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)的影響
表1）可知，厚壁菌門(Firmicates)豐度表現(xiàn)為B組＞A組＞C組，組間差異均顯著；變形菌門(Proteobacteria)豐度表現(xiàn)為A組>B組>C組，組間差異均顯著；藍(lán)細(xì)菌門(Cyanobacteria)豐度均表現(xiàn)為C組顯著高于A、B組；放線菌門(Actinobacteria)、酸桿菌門(Acidobacteria)、擬桿菌門(Bacteroidetes)、綠彎菌門(Chloroflexi)、梭桿菌門(Fusobacteria)和浮霉菌門(Planc
中國農(nóng)學(xué)通報(bào) 2022年2期2022-03-07
- 胡麻連作對土壤細(xì)菌群落的影響
T3土壤具有的細(xì)菌門數(shù)分別為33、32個(gè)和35個(gè)，其中有31個(gè)細(xì)菌門三者所共有，T1和T2土壤內(nèi)的WWE3菌門在T3土壤內(nèi)未檢測到，T2土壤內(nèi)未檢測到T1和T3土壤內(nèi)的Peregrinibacteria菌門，衣原體門(Chlamydiae)、梭桿菌門(Fusobacteria)和BJ-169菌門只有在T3土壤內(nèi)檢測到(圖2A)。對土壤細(xì)菌優(yōu)勢菌門(豐度占比>0.01)分析表明，3種土壤內(nèi)的優(yōu)勢菌門均為相同的12個(gè)菌門，但不同土壤內(nèi)各優(yōu)勢細(xì)菌門的相對豐度存在
干旱地區(qū)農(nóng)業(yè)研究 2022年1期2022-01-28
- 羊瘤胃優(yōu)勢菌組成的Meta分析
生物（如瘤胃厚壁菌門和擬桿菌門）發(fā)揮了主導(dǎo)作用。因此，瘤胃細(xì)菌群落研究可為提高肉羊養(yǎng)殖飼料轉(zhuǎn)化效率和養(yǎng)殖效益提供重要保障。高通量測序技術(shù)具有低成本高精度分析的特點(diǎn)，利用該技術(shù)已對羊瘤胃菌群進(jìn)行了廣泛研究，但瘤胃微生物結(jié)構(gòu)容易受到動(dòng)物品種、年齡、日糧和健康狀況等多方面的影響，不同研究所報(bào)道瘤胃內(nèi)優(yōu)勢微生物的種類和豐度的差異，制約了人們對羊瘤胃菌群結(jié)構(gòu)規(guī)律性的認(rèn)識。Meta分析也稱薈萃分析，可以對前人研究進(jìn)行系統(tǒng)分析和量化綜述，增加統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)效能，對效應(yīng)指標(biāo)的結(jié)
中國畜牧雜志 2022年1期2022-01-20
- 高寒濕地土壤微生物多樣性對氮沉降濃度差異的響應(yīng)
1%的物種有變形菌門(Proteobacteria)、綠彎菌門(Chloroflexi)、酸桿菌門(Acidobacteria)、放線菌門(Actinobacteria)、芽單胞菌門(Gemmatimonadetes)、擬桿菌門(Bacteroidetes)、己科河菌門(Rokubacteria)、Patescibacteria、硝化螺旋菌門(Nitrospirae)、厚壁菌門(Firmicutes)、疣微菌門(Verrucomicrobia)、浮霉菌門(
生物學(xué)雜志 2021年6期2021-12-20
- 灌喂鼠李糖乳桿菌對妊娠后期小鼠糞便菌群多樣性影響
妊娠小鼠糞便中的菌門分別為厚壁菌門、擬桿菌門、變形菌門、放線菌門、unidentified_Bacteria、軟壁菌門、脫鐵桿菌門、藍(lán)細(xì)菌、酸桿菌門，其中厚壁菌門、擬桿菌門、變形菌門的豐度之和在90%以上。小鼠糞便中厚壁菌門，試驗(yàn)組比對照組提高了20.12%(P表3 門水平物種的豐度變化Table 3 Abundance of phylum level species (%)2.3 灌喂鼠李糖乳桿菌對妊娠小鼠糞便中科水平物種豐度的影響研究表明，在科水平上t
新疆農(nóng)業(yè)科學(xué) 2021年10期2021-11-17
- 造紙法再造煙葉廢水中微生物多樣性分析
要類群，包括變形菌門(Proteobacteria)占總數(shù)的48.7%，放線菌門(Actinobacteria)占總數(shù)的11.5%，硝化螺旋菌門(Nitrospira)占總數(shù)的5.1%，擬桿菌門(Bacteriodetes)占總數(shù)的5.1%，綠彎菌門(Chlorobacteria)占到總數(shù)的5.1%，未培養(yǎng)菌(Uncultured bacterium)占總數(shù)的15.4 %和其他種類占總數(shù)的9.0 %。圖4 污泥樣品細(xì)菌系統(tǒng)發(fā)育樹圖5 污泥樣品細(xì)菌群落組成(
工業(yè)微生物 2021年5期2021-11-02
- 基于Illumina高通量測序的天津北大港濕地沉積物細(xì)菌群落特征和多樣性分析
沉積物層中，變形菌門（Proteobacteria）、綠彎菌門（Chloroflexi）和酸桿菌門（Acidobacteria）是細(xì)菌中的優(yōu)勢類群，其相對豐度分別為44.73%、16.84%和10.25%；其他已知類群的相對豐度分別為浮霉菌門（Planctomycetes）4.73%、芽單胞菌門（Gemmatimonadetes）2.61%、擬桿菌門（Bacteroidetes）2.32%、硝化螺旋菌門（Nitrospirae）2.10%、綠菌門（Chlo
- 稻蟹共作對水稻土性質(zhì)的影響
處理下細(xì)菌的優(yōu)勢菌門(豐度>5%)均為變形菌門(Proteobacteria)、綠彎菌門(Chloroflexi)、放線菌門(Actinobacteria)、擬桿菌門(Bacteroidetes)、酸桿菌門(Acidobacteria)(圖1(a))。稻蟹共作后,變形菌門、酸桿菌門相對豐度分別下降了46.72%和18.55%,導(dǎo)致固氮微生物種群相對豐度有所降低[13],從而影響土壤脲酶活性[14]。綠彎菌門、放線菌門、擬桿菌門相對豐度分別增加63.26%,
- 黃河三角洲濱海濕地微生物多樣性及其驅(qū)動(dòng)因子
致,主要包括變形菌門(Proteobacteria)、厚壁菌門(Firmicutes)、擬桿菌門(Bacteroidetes)、放線菌門(Actinobacteria)、藍(lán)藻菌門(Cyanobacteri)、疣微菌門(Verrucomicrobia)、綠彎菌門(Chloroflexi)、浮霉菌門(Planctomycetes)、酸桿菌門(Acidobacteria)、軟壁菌門(Tenericutes),其中,細(xì)菌分布以厚壁菌門、變形菌門、擬桿菌門和放線菌門
生態(tài)學(xué)報(bào) 2021年15期2021-09-01
- 短時(shí)高溫好氧固態(tài)發(fā)酵對豬糞細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)的影響
最高的分別是變形菌門59.48 %、擬桿菌門23.97 % 和厚壁菌門13.79 %，發(fā)酵后變形菌門和擬桿菌門分別減少至0.66 % 和1.00 %，而厚壁菌門增加至99.01 %，是發(fā)酵豬糞的優(yōu)勢菌群。本研究表明發(fā)酵后豬糞細(xì)菌群落多樣性下降，抗生素抗性基因潛在攜帶者相對豐度降低，耐高溫的有機(jī)質(zhì)降解菌成為優(yōu)勢菌屬，該研究對豬糞的資源化處理具有理論指導(dǎo)意義。豬糞；高通量測序；細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)集約化養(yǎng)殖導(dǎo)致畜禽糞便大量堆積，嚴(yán)重污染環(huán)境[1]。豬糞中含有大量的病原
山東畜牧獸醫(yī) 2021年5期2021-06-07
- 動(dòng)物糞便堆肥廠不同工作區(qū)空氣中細(xì)菌和條件致病菌污染特征研究
堆肥過程中，厚壁菌門(Firmicutes)、變形菌門(Proteobacteria)、擬桿菌門(Bacteroidetes)和放線菌門(Actinobacteria)是堆肥糞便中常見的優(yōu)勢菌門。其中，厚壁菌門、變形菌門、擬桿菌門的相對豐度要普遍高于放線菌門[10-11]。對空氣中細(xì)菌菌屬水平的研究結(jié)果表明，芽孢桿菌屬(Bacillus)、高溫放線菌屬(Thermoactinomyces)、溫雙岐菌屬(Thermobifida)和糖單孢菌屬(Sacchar
- HRT對A/O-BF處理低碳氮比農(nóng)村生活污水脫氮的影響
微生物主要由變形菌門(Proteobacteria)(占比為49.36%)、綠彎菌門(Chloroflexi)(占比為15.37%)、放線菌門(Actinobacteria)(占比為10.37%)和厚壁菌門(Firmicutes)(占比為6.28%)組成；HRT為8 h時(shí)，變形菌門(占比為42.23%)、綠彎菌門(占比為19.68%)、放線菌門(占比為11.60%)和擬桿菌門(Bacteroidetes)(占比為6.45%)是優(yōu)勢菌門；HRT為9 h時(shí)，變
環(huán)境科學(xué)研究 2021年4期2021-04-25
- 純種柯樂豬與巴×柯雜交豬腸道菌群結(jié)構(gòu)的研究
十二指腸中的主要菌門為無壁菌門(Tenericutes)(34.11%)、厚壁菌門(Firmicutes)(26.78%)、變形菌門(Proteobacteria)(28.16%)、擬桿菌門(Bacteroidetes)(5.02%)；純種柯樂豬十二指腸中的主要菌門為厚壁菌門(49.04%)、無壁菌門(40.53%)、變形菌門(9.32%)。由表2可知，巴×柯雜交豬十二指腸中擬桿菌門的相對豐度顯著高于純種柯樂豬(P2.4.2 空腸菌群結(jié)構(gòu)分析由圖5可知，巴
動(dòng)物營養(yǎng)學(xué)報(bào) 2021年3期2021-04-13
- 池塘養(yǎng)殖紅螯螯蝦個(gè)體大小與腸道細(xì)菌的關(guān)系分析
魚腸道黏膜中厚壁菌門比例較少。Semova等[19]研究結(jié)果顯示，大個(gè)體草魚的腸道黏膜微生物中擁有比小個(gè)體草魚更高比例的厚壁菌門，可能與厚壁菌門細(xì)菌能促進(jìn)腸上皮細(xì)胞吸收有關(guān)。【本研究切入點(diǎn)】目前，有關(guān)紅螯螯蝦的腸道微生物對其個(gè)體生長影響的研究鮮見報(bào)道?！緮M解決的關(guān)鍵問題】利用高通量測序技術(shù)對池塘養(yǎng)殖紅螯螯蝦的腸道16S rDNA基因V3～V4區(qū)進(jìn)行測序分析，探究紅螯螯蝦個(gè)體大小與腸道細(xì)菌組成及其多樣性和功能的關(guān)系，為紅螯螯蝦益生菌篩選及健康養(yǎng)殖提供參考依據(jù)
西南農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào) 2021年12期2021-02-12
- 不同生長階段大口黑鱸腸道微生物多樣性研究
組優(yōu)勢菌群為厚壁菌門(Firmicutes，40.78%)，B～F組的優(yōu)勢菌群為變形菌門(Proteobacteria)，G～I(xiàn)組的優(yōu)勢菌群為梭桿菌門(Fusobacteria)。隨著養(yǎng)殖時(shí)間的推移，變形菌門在A～D組呈現(xiàn)出增加趨勢，隨后上下波動(dòng)；梭桿菌門在A～D組呈現(xiàn)降低的趨勢，在E～H組升高，隨后降低；厚壁菌門在A～E組呈現(xiàn)降低的趨勢，隨后波動(dòng)(表2)。各生長階段大口黑鱸腸道微生物在屬水平上相對豐度大于2%的有17屬。其中A組的優(yōu)勢種群為消化鏈球菌科(
西南農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào) 2021年12期2021-02-12
- 宏基因組測序分析野生林麝瘤胃、小腸和大腸微生物組成和抗生素抗性基因
的核心菌群(擬桿菌門和厚壁菌門細(xì)菌)豐度變化不大，而非核心菌群的種類和豐度變化明顯[6-8]，這些微生物在免疫反應(yīng)和營養(yǎng)消化方面發(fā)揮著重要作用[9]。目前林麝消化道微生物研究樣本以糞便為主，常用的方法是16S rRNA高通量測序，這種方法的缺點(diǎn)是測序深度有限，而宏基因組測序不僅能獲得全面的微生物類群信息，還能提供基因功能層面的預(yù)測，近年來被廣泛用于微生物群落研究[10]。糞便采樣具有集合了貫穿胃腸道分散微生物群落的優(yōu)勢，但其與大腸微生物相似度較高，不能完全
動(dòng)物營養(yǎng)學(xué)報(bào) 2021年1期2021-02-07
- 妊娠后期與泌乳期母豬腸道微生物多樣性研究
期母豬腸道中擬桿菌門相對豐度升高，變形菌門的相對豐度下降，且提高了泌乳期母豬及仔豬的抗氧化水平及仔豬的生長性能。Li等[7]研究了母豬飼糧中纖維成分對妊娠母豬及其仔豬的影響，發(fā)現(xiàn)飼糧中不可溶解纖維與可溶解纖維的比例下降，母豬妊娠后期腸道中軟壁菌門的相對豐度增加，變形菌門的相對豐度減少，母豬及其仔豬抗氧化水平和抗炎能力提高。母豬的腸道微生物是如何影響仔豬生長發(fā)育的尚不清楚，李浩等[8]推測這可能是由于妊娠期和泌乳期母體腸道微生物通過胎盤、產(chǎn)道和乳汁進(jìn)入子代腸
動(dòng)物營養(yǎng)學(xué)報(bào) 2021年1期2021-02-07
- 益氣養(yǎng)陰方對胃腸道腫瘤化療后患者腸道菌群及免疫功能的影響*
型/性別n 厚壁菌門擬桿菌門變形菌門放線菌門胃癌45 54.30±30.13 18.81±24.06 24.27±29.30 2.23±2.56結(jié)直腸癌46 58.91±25.51 17.66±21.44 16.81±22.70 5.29±10.29 t值，P值-0.777 6，0.438 9 0.238 4，0.812 2 1.325 6，0.188 7-1.935 2，0.058 5女性29 51.44±31.32 20.81±25.71 23.60±
中醫(yī)學(xué)報(bào) 2021年1期2021-01-21
- 煙蒜輪作對煙株根際土壤細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)的影響
在門水平上，變形菌門(Proteobacteria)、放線菌門(Actinobacteria)、綠彎菌門(Chloroflexi)、厚壁菌門(Firmicutes)、酸桿菌門(Acidobacteria)、Saccharibacteria、擬桿菌門(Bacteroidetes)、芽單胞菌門(Gemmatimonadetes)、浮霉菌門(Planctomycetes)、藍(lán)藻菌門(Cyanobacteria)10個(gè)菌門的相對豐度超過1 %，占總菌數(shù)的97 %以
西南農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào) 2020年9期2020-12-10
- 剛竹屬3個(gè)竹種根際土壤微生物群落結(jié)構(gòu)
2。3個(gè)竹種優(yōu)勢菌門為變形菌門(Proteobacteria)、綠彎菌門(Chloroflexi)、放線菌門(Actinobacteria)、酸稈菌門(cidobacteria)，在毛竹根際土壤中占比分別為25.5%、20.2%、23%、20.7%，在雷竹根際土壤中占比分別為34.3%、6.8%、21.4%、28.1%，在黃稈烏哺雞竹根際土壤中占比為28.7%、12.6%、11.9%、32.9%。圖2 3個(gè)竹種根際細(xì)菌在門(左)、綱(中)、目(右)水平上的
世界竹藤通訊 2020年5期2020-11-11
- 不同包裝方式對貨架期冷鮮雞微生物菌相變化的影響
個(gè)門，分別為變形菌門(Proteobacteria)、厚壁菌門(Firmicutes)、藍(lán)細(xì)菌門(Cyanobacteria)、放線菌門(Actinobacteria)、擬桿菌門(Bacteroidetes)、酸桿菌門(Acidobacteria)、疣微菌門(Verrucomicrobia)、棲熱菌門(Deinococcus-Thermus)、芽單胞菌門(Gemmatimonadetes)和綠彎菌門(Chloroflexi)。PK1組變形菌門和厚壁菌門相對
浙江農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào) 2020年7期2020-07-28
- 人工基質(zhì)上附著生物膜的微生物群落結(jié)構(gòu)分析
勢物種，其中變形菌門(Proteobacteria)、浮霉菌門(Planctomycetes)、擬桿菌門(Bacteroidetes)和藍(lán)藻細(xì)菌(Cyanobacteria)在各位點(diǎn)中所占比例最為明顯，為樣品中的優(yōu)勢門，其中變形菌門具有最高的相對豐度，在A區(qū)的變形菌門的相對豐度達(dá)到39.3%左右，B區(qū)變形菌門相對豐度較A處低，大致在30.5%。在纖維基質(zhì)上，不同試驗(yàn)位點(diǎn)存在顯著差異。在深層和淺層的纖維基質(zhì)上附著的變形菌門(Proteobacteria)在2
浙江農(nóng)業(yè)科學(xué) 2020年6期2020-06-23
- 野生樹鼩與人工飼養(yǎng)樹鼩消化道不同部位微生物組成的比較研究
和盲腸主要由變形菌門(Proteobacteria)、厚壁菌門(Firmicutes)和擬桿菌門(Bacteroidetes)組成；而人工繁育樹鼩直腸、結(jié)腸主要由變形菌門(Proteobacteria)、螺旋體門(Spirochaetes)和梭桿菌門(Fusobacteria)組成，盲腸主要由變形菌門(Proteobacteria)、螺旋體門(Spirochaetes)和擬桿菌門(Bacteroidetes)組成。野生樹鼩回腸中主要由厚壁菌門(Firmic
中國比較醫(yī)學(xué)雜志 2020年4期2020-05-26
- 不同施肥模式對茶園土壤細(xì)菌多樣性的影響
個(gè)類群，其中變形菌門（Proteobacteria）、酸桿菌門（Acidobacteria）、放線菌門（Actinobacteria）、綠彎菌門（Chloroflexi）、厚壁菌門（Firmicutes）、奇古菌門（Thaumarchaeota）、擬桿菌門（Bacteroidetes）為優(yōu)勢類群，相對豐度占87.08%～96.76%。不同施肥處理間變形菌門、酸桿菌門、放線菌門、綠彎菌門的相對豐度差異顯著。不同施肥處理的ACE指數(shù)、Chao1指數(shù)、Shann
湖北農(nóng)業(yè)科學(xué) 2019年22期2019-12-23
- 饑餓與重?cái)z食對河蟹腸道菌群結(jié)構(gòu)的影響
得到河蟹腸道優(yōu)勢菌門分別為軟壁菌門(Tenericutes)、擬桿菌門(Bacteroidtes)、厚壁菌門(Firmicutes)和變形菌門(Proteobacteria)。后續(xù)較為深入的研究包含了針對白班病毒(WSSV)與正常河蟹腸道微生物的異同[15,16]、河蟹腸道微生物、鰓微生物與水體微生物共有菌群探究[17]以及“蟹稻共生”兩種模式下河蟹腸道微生物的異同[18]。但針對正常、饑餓以及重?cái)z食這3種狀態(tài)下腸道菌群結(jié)構(gòu)的異同比較卻未見研究。本文通過研
水生生物學(xué)報(bào) 2019年4期2019-07-20
- 聲帶良性增生性疾病患者聲帶表面分泌物菌群研究*
群可以劃分到7個(gè)菌門中，在兩組中按相對豐度由多到少的順序排列一致,依次為：變形菌門(proteobacteria)、厚壁菌門(firmicutes)、擬桿菌門(bacteroidetes)、梭桿菌門(fusobacteria)、放線菌門(actinobacteria)、SR1和TM7(圖 1)。實(shí)驗(yàn)組和對照組7大細(xì)菌門總比例分別高達(dá)99.05 % 和99.12 %(表 1)。實(shí)驗(yàn)組中變形菌門、厚壁菌門均較對照組明顯增高(分別為P圖1 兩組菌群組成對比(菌門
聽力學(xué)及言語疾病雜志 2019年3期2019-05-24
- 黃羽肉雞飼料效率與糞便微生物多樣性及豐度的相關(guān)性研究
有研究表明，擬桿菌門、厚壁菌門及變形菌門之間的互作關(guān)系可幫助宿主消化難以分解的多糖類物質(zhì)[4]，從而提高機(jī)體對于糖類物質(zhì)的消化和吸收。Turnbaugh等[5]指出，腸道微生物通過將難以消化的多糖發(fā)酵為單糖及短鏈脂肪酸從而調(diào)控脂肪沉積。Fetissov[6]指出，腸道微生物與宿主的饑餓和飽腹感有關(guān)，腸道微生物調(diào)節(jié)宿主攝食從而維持機(jī)體正常生長、發(fā)育的營養(yǎng)代謝。目前，國內(nèi)外畜牧領(lǐng)域關(guān)于腸道微生物與宿主飼料效率的關(guān)系在豬[7]、牛[8]、雞[9]等農(nóng)業(yè)動(dòng)物中均有
中國畜牧雜志 2019年4期2019-04-20
- 造紙廢水UMIC反應(yīng)器中微生物的縱向分布特性
上。主要包括擬桿菌門(Bacteroidetes)、綠彎菌門(Chloroflexi)、厚壁菌門(Firmicutes)、螺旋菌門(Spirochaetae)、變形菌門(Proteobacteria)、放線菌門(Actinobacteria)、互養(yǎng)菌門(Synergistetes)等。7種類群的相對豐度比例約占70%～80%。就平均而言，在7個(gè)樣品中，擬桿菌門和綠彎菌門在顆粒污泥中占有最大的豐度比例，兩者相加相對豐度比例均占50%以上。其中，Bacteri
中國沼氣 2019年1期2019-04-13
- 醬醅與豆醬微生物關(guān)系研究
樣品醬醅與豆醬真菌門水平分布來看,共檢測出兩個(gè)已知真菌門,其醬醅中,子囊菌門(Ascomycota,77.55%),接合菌門(Zygomycota,22.31%)為醬醅中的優(yōu)勢菌門;后期發(fā)酵過程中,豆醬前三階段子囊菌門和接合菌門依然為豆醬中的優(yōu)勢菌門,占比在77.55%～82.6%、22.31%～17.4%之間。從S樣品醬醅與豆醬細(xì)菌門水平分布來看,共檢測出3個(gè)已知細(xì)菌門,其中醬醅厚壁菌門(Firmicutes)占90.01%,為醬醅的優(yōu)勢菌門,變形菌門(
食品工業(yè)科技 2019年7期2019-04-12
- 昆蟲體內(nèi)微生物多樣性的影響因素研究進(jìn)展
物。1.1 優(yōu)勢菌門當(dāng)前研究表明，昆蟲體內(nèi)微生物的優(yōu)勢菌門以變形菌門或/和厚壁菌門為主。 例如，鞘翅目的天牛Saperda vestita Say(Schloss et al.，2006)，鱗翅目的茶尺蠖Ectropis obliqua Prout (靳亮等，2013)和稻縱卷葉螟Cnaphalocrocis medinalis (Guenée)(劉小改等，2016)，雙翅目的地中海實(shí)蠅Ceratitis capitata Wiedemann(Behar
生物安全學(xué)報(bào) 2019年3期2019-02-15
- 妊娠期糖尿病腸道菌群變化及臨床價(jià)值分析
菌，各組均以厚壁菌門、擬桿菌菌門、變形菌門和放線菌門為主，3組腸道菌群種各優(yōu)勢菌門屬比例比較，差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P2.2 血糖相關(guān)指標(biāo)與腸道菌群優(yōu)勢菌門屬的關(guān)系經(jīng)Spearman相關(guān)分析，F(xiàn)BG、FINS和IR與厚壁菌門和放線菌門均呈明顯正相關(guān)(P2.3 各組妊娠不良結(jié)局情況比較與正常妊娠組比較，糖尿病妊娠組妊娠不良結(jié)局總發(fā)生率明顯升高，差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P表1 3組腸道菌群優(yōu)勢菌群比例比較*P表2 血糖相關(guān)指標(biāo)與腸道菌群優(yōu)勢菌門屬的關(guān)系表3 3組妊娠不良
川北醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào) 2019年6期2019-02-10
- 應(yīng)用高通量測序法檢測南疆傳統(tǒng)酸奶中微生物多樣性
共檢測到15 個(gè)菌門，厚壁菌門是絕對優(yōu)勢菌門，占據(jù)94.6%～99.92%，其次是變形菌門占據(jù)0.028%～9.38%。1號樣品（AM1）相對含量由大到小為99.38%厚壁菌門、0.175 8%變形菌門，其他門豐度小于0.1%。3號樣品在MRS及Lee氏培養(yǎng)基上（AM3、AL3）厚壁菌門相對含量均為 99.86%，YGC培養(yǎng)基上（AY3）占優(yōu)勢的為厚壁菌門90.49%，其次為變形菌門9.38%，其他門相對含量小于0.02%。4號樣品MRS及Lee氏培養(yǎng)基上
食品科學(xué) 2018年20期2018-10-31
- 鏈脲佐菌素誘導(dǎo)糖尿病大鼠模型腸道菌群變化
到少依次為：厚壁菌門(Firmicutes)、擬桿菌門(Bacteroidetes)、變形菌門(Proteobacteria)、藍(lán)藻菌門(Cyanobacteria)、軟壁菌門(Tenericutes)、疣微菌門(Verrucomicrobia)、TM7、放線菌門(Actinobacter)。迷蹤菌門(Elusimicrobia)、綠彎桿菌門(Chloroflexi)僅在個(gè)別動(dòng)物體內(nèi)檢出。造模4周時(shí)，模型組厚壁菌門、擬桿菌門豐度與對照組比較差異無顯著性。厚
- 生物炭對設(shè)施黃瓜根際土壤菌群結(jié)構(gòu)及植株生長的影響
對黃瓜根際土壤細(xì)菌門、綱、科、屬分類水平的豐度比較從表3可以看出，細(xì)菌在門分類水平上占優(yōu)勢的為 Proteobacteria（變形菌門）、Acidobacteria（酸桿菌門）、Actinobacteria（放線菌門）、Chloroflexi（綠彎菌門）、Firmicutes（厚壁菌門）、Gemmatimonadetes（芽單胞菌門）、Bacteroidetes（擬桿菌門），與對照相比，優(yōu)勢門所占比例有明顯增多的有變形菌門、放線菌門、厚壁菌門和擬桿菌門，而
中國瓜菜 2018年3期2018-04-19
- 種植菠菜和生菜對土壤可培養(yǎng)細(xì)菌多樣性的影響
分屬3個(gè)門（放線菌門、厚壁菌門、變形菌門）、21屬、16科。其中，放線菌門是菠菜土樣中第一位的優(yōu)勢種群，包含81株菌株，占該土樣所有分離獲得純培養(yǎng)的64.3%，且獲得菌株最多的是鏈霉菌屬、節(jié)桿菌屬；厚壁菌門是種植菠菜土樣中發(fā)現(xiàn)的第二大優(yōu)勢類群，包含34株菌株，占所有獲得純培養(yǎng)的27.0%，獲得菌株最多的是芽孢桿菌屬；變形菌門共包含11株菌株，占所有獲得純培養(yǎng)的8.7%，獲得菌株最多的是-Proteobacter，其屬于優(yōu)勢種群。1.2 種植生菜對土壤可培養(yǎng)
吉林農(nóng)業(yè) 2018年23期2018-01-17
- 一只半野生病死川金絲猴腸道微生物多樣性分析
個(gè)門類，包括厚壁菌門(Firmicutes)、疣微菌門(Verrucomicrobia)、變形菌門(Proteobacteria)、梭桿菌門(Fusobacteria)、放線菌門(Actinobacteria)、擬桿菌門(Bacteroidetes)、互養(yǎng)菌門(Synergistetes)及其他。其中占有優(yōu)勢的是厚壁菌門、疣微菌門和變形菌門。十二指腸中厚壁菌門占比可高達(dá)69%，其他門類細(xì)菌豐度很低。從十二指腸到最后的直腸，厚壁菌門所占比例逐漸降低，疣微菌門
野生動(dòng)物學(xué)報(bào) 2017年2期2017-09-19
- 基于MiSeq分析川中黑山羊瘤胃細(xì)菌的多樣性及群落結(jié)構(gòu)
高相對豐度為擬桿菌門的(占總序列數(shù)的40.87%)，其次為厚壁菌門的(27.19%)，樣品F最高相對豐度為擬桿菌門的(47.12%)，其次為變形菌門的(19.99%)，再次為厚壁菌門的(18.05%)，樣品A厚壁菌門的相對豐度極顯著高于樣品F的(＜0.01)；4)在屬水平上，樣品A與樣品F的最高相對豐度均為普雷沃氏菌屬的(樣品A的為25.54%，樣品F的為27.67%)，樣品A中月形單胞菌屬、丁酸弧菌屬、瘤胃球菌屬、琥珀酸弧菌屬、琥珀酸菌屬等的相對豐度顯著
湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)（自然科學(xué)版） 2017年3期2017-07-01
- 3～6月齡伊犁馬腸道微生物群落多樣性的研究
優(yōu)勢菌分別為厚壁菌門(Firmicutes)、擬桿菌門(Bacteroidetes)、變形菌門(Proteobacteria)、疣微菌門(Verrucomicrobia)、螺旋體菌門(Spirochaetes)、梭桿菌門(Fusobacteria)、無壁菌門(Tenericutes)、放線菌門(Actinobacteria)、TM7、廣古菌門(Euryarchaeota)，其中以厚壁菌門、擬桿菌門、變形菌門及疣微菌門的豐度較高；在科水平上，馬駒糞便中10大
動(dòng)物營養(yǎng)學(xué)報(bào) 2017年5期2017-05-12
- 西南地區(qū)夏塊菌子實(shí)體內(nèi)的細(xì)菌多樣性分析*
，其中，γ-變形菌門所占比例最大，為67%，假單胞菌屬的Pseudomonas fuscovaginae為優(yōu)勢類群；厚壁菌門（Firmicutes）所占比例其次，為第二大群，以葡萄球菌屬的Staphylococcus simiae、Staphylococcus warneri為優(yōu)勢類群。此外還分離得到擬桿菌門（Bacteroidetes）細(xì)菌22株，占9%；α-變形菌門細(xì)菌14株，占6%；β-變形菌門6株，占3%。夏塊菌；子實(shí)體；細(xì)菌；優(yōu)勢類群塊菌（tru
中國食用菌 2016年4期2016-11-30
- 云南4處酸性熱泉中的變形菌門細(xì)菌多樣性
酸性熱泉中的變形菌門細(xì)菌多樣性宋兆齊，王 莉，劉秀花，梁 峰(商丘師范學(xué)院生命科學(xué)學(xué)院，河南省高校生物質(zhì)降解與氣化工程技術(shù)研究中心，河南 商丘 476000)選擇云南騰沖和龍陵地區(qū)的4處酸性熱泉(pH：2.3～6.0，溫度：47～96 ℃)，通過Barcoded pyrosequencing技術(shù)及統(tǒng)計(jì)學(xué)分析，詳細(xì)闡述了這些樣點(diǎn)中變形菌門的物種和遺傳多樣性。本研究共獲得了2 489條變形菌門16S rRNA基因序列，可劃分為234個(gè)可操作分類單元(OTUs)
- 微生物群落結(jié)構(gòu)與偶氮染料之間對應(yīng)關(guān)系的研究
nKa38(變形菌門) 是甲基橙脫色過程的優(yōu)勢菌，占可分離培養(yǎng)細(xì)菌的50%;對于甲基紅、金橙I、茜黃素R鈉鹽而言，Bacilluscereusstrain1FFF (厚壁菌門)是其優(yōu)勢菌，所占比例分別為30.4%、60%、38.63%，其次是KlebsiellavariicolastrainRVEV3 (變形菌門) 和ExiguobacteriumaestuariistrainYS-6 (厚壁菌門);橙黃G、肼黃、混合染料的優(yōu)勢菌為Klebsiellava
陜西科技大學(xué)學(xué)報(bào) 2015年3期2015-05-04