李佳慧 汶瑛 田茂 劉光琇 張威 章高森 薛林貴
摘要:沙漠土壤蘊藏豐富的放線菌資源,尤其是稀有放線菌類群,是挖掘新放線菌資源的理想生境。本研究開展庫姆塔格沙漠可培養(yǎng)放線菌抑菌活性篩選,以期為該地區(qū)放線菌資源開發(fā)和利用提供菌株資源。根據(jù)分離菌株的16S rRNA基因序列分析放線菌多樣性;從庫姆塔格沙漠4份土樣中分離純化到370株放線菌,分布于11個目12個科的22個屬,其中鏈霉菌屬和糖絲菌屬為優(yōu)勢菌屬,分別占分離放線菌菌株的63%和13.8%。對14株放線菌潛在新種(16S rRNA基因序列相似性低于98.65%)進(jìn)行高氏一號、ISP2、TSB培養(yǎng)基液體發(fā)酵,獲得提取濃縮物樣品進(jìn)行抑菌活性篩選,發(fā)現(xiàn)11株潛在新種的發(fā)酵產(chǎn)物有廣譜抗菌活性。本研究表明,庫姆塔格沙漠中含有豐富的放線菌資源,具有從中發(fā)現(xiàn)放線菌新菌種和抗生素的潛力。
關(guān)鍵詞:庫姆塔格沙漠;放線菌;16S rRNA基因測序;抑菌活性
中圖分類號:R978文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A
Assessment of the diversity and antibacterial potential of culturable actinomycetes in the Kumtag Desert
Li Jiahui1, Wen Ying2,3,4, Tian Mao2,3,4, Liu Guangxiu2,3, Zhang Wei2,3, Zhang Gaosen2,3, and Xue Lingui1
(1 College of Biological and Pharmaceutical Engineering, Lanzhou Jiaotong University, Lanzhou 730000; 2 Key Laboratory of Desert and Desertification, Northwest Institute of Eco-Environment and Resources, Chinese Academy of Sciences, Lanzhou 730000;?3 Key Laboratory of Extreme Environmental Microbial Resources and Engineering, Lanzhou 730000;?4 University of Chinese Academy of Sciences, Beijing 100049)
Abstract Desert soil contains abundant actinomycetes, especially many rare strains, thus, it is an ideal habitat for excavating new actinomycete resources. In this study, the screening for antibacterial and culturable actinomycetes isolated from Kumtag Desert soil was carried out to provide strains for developing and utilizing actinomycete resources in this area. Actinomycete diversity was analyzed based on the 16S rRNA gene sequence of isolated strains; From 4 soil samples, 370 actinomycete strains, distributed in 22 genera of 12 families and 11 orders were isolated. Amongst them, Streptomyces and Saccharothrix were the dominant genera, accounting for 63% and 13.8% of the isolated actinomycete strains, respectively. Fourteen potential new actinomycete strains (16S rRNA gene sequence similarity less than 98.65%) were fermented in Gauze's synthetic, ISP2 and TSB broth media, respectively. Their fermentation broth was extracted for bacteriostatic activity screening, showing that fermentation products of 11 potential new species had broad-spectrum antibacterial activity. This study indicated that the Kumtag Desert was rich in actinomycete resources, for which potential new species of actinomycetes and antibiotics could be discovered.
Key wordsKumtag desert;? Actinomycetes; 16S rRNA gene sequencing;? Antibiotic activity
近年來,隨著“超級細(xì)菌”的不斷出現(xiàn),耐藥菌對人類健康造成了極大威脅。據(jù)美國FDA新藥評價中心的數(shù)據(jù),近30多年來新批準(zhǔn)的抗生素數(shù)量逐年減少[1],尋求高效新型抗生素刻不容緩。據(jù)統(tǒng)計,臨床上60%以上的抗生素來自放線菌[2-3]。目前,從傳統(tǒng)棲息地分離到的放線菌產(chǎn)生的抗生素大多是重復(fù)分離,成本高且效率低。所以,越來越多的研究人員正在探索從極端環(huán)境或地球上未開發(fā)的棲息地分離出新的放線菌資源[4-9]。極端環(huán)境放線菌可長期在多重脅迫因子例如高溫、低溫、高酸、高堿或高鹽等的極端環(huán)境中生長,使它們產(chǎn)生了獨特的基因型和生理特性[10],具備產(chǎn)生新穎代謝產(chǎn)物的潛力[11]。
沙漠土壤蘊藏著豐富的稀有放線菌和放線菌新物種[12-15]。已從沙漠來源放線菌中分離得到多種具有新穎結(jié)構(gòu)和生物活性的次級代謝產(chǎn)物。例如,在新疆沙漠中發(fā)現(xiàn)了一株諾卡菌屬新種Nocardia XJ31,并從中分離得到了12個鐵載體和2個蒽酮類化合物,其中10個鐵載體被鑒定為新化合物,2個蒽酮類化合物表現(xiàn)出較好的抗結(jié)核活性[16];Liu等[17]從塔克拉瑪干沙漠分離到一株糖絲菌屬新種Saccharothrix 16Sb2-4,從中分離鑒定出了4種16元大環(huán)內(nèi)酯類抗生素,這些化合物都通過抑制pDualrep2系統(tǒng)中的蛋白質(zhì)合成而顯示出抗菌活性。此外,Boubetra等[18]在撒哈拉沙漠中獲得了一株糖絲菌屬Saccharothrix SA198,其產(chǎn)生的2個新骨架化合物A4和A5,具有顯著的抗細(xì)菌和真菌活性。因此,沙漠環(huán)境中的放線菌,具有巨大的潛在應(yīng)用價值。
庫姆塔格沙漠位于塔里木盆地東南的阿爾金山北麓,區(qū)域降水極為稀少,年均蒸發(fā)量2800~3000 mm;年平均溫度10 ℃左右,是中國第四大流動沙漠,也是我國極為干旱、自然環(huán)境極為嚴(yán)酷的沙漠[19]。
目前,對該地區(qū)的細(xì)菌研究主要集中在可培養(yǎng)細(xì)菌多樣性、抗輻射抗氧化的特征及環(huán)境對細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)的影響等[20-22],有關(guān)該地區(qū)放線菌多樣性及其抑菌活性菌株篩選鮮有報道。根據(jù)擴增子研究結(jié)果發(fā)現(xiàn)該地區(qū)細(xì)菌豐富度較高,放線菌門是主要的細(xì)菌門[20-21]。
另外,可培養(yǎng)研究也支持放線菌為該地區(qū)最主要優(yōu)勢菌門的結(jié)論,其中鏈霉菌屬(9.08×105 CFU/g)為優(yōu)勢菌屬,占分離出的放線菌門可培養(yǎng)細(xì)菌總數(shù)量的
92% [22];柏曉玉等[20]對該地區(qū)細(xì)菌進(jìn)行培養(yǎng)發(fā)現(xiàn),鏈霉菌占所有可培養(yǎng)放線菌的65.76%。以上結(jié)果表明,庫姆塔格沙漠地區(qū)蘊含著豐富的放線菌資源,是挖掘極端放線菌資源的理想生境。
本研究對庫姆塔格沙漠放線菌進(jìn)行分離培養(yǎng)、純化和活性測定,通過16S rRNA基因測序?qū)ε囵B(yǎng)獲得的菌株進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育分析,并測定菌株的抑菌活性,以期為該地區(qū)放線菌資源開發(fā)和利用提供菌株資源。
1 材料與方法
1.1 材料
1.1.1 土樣采集
2020年8月,采集庫姆塔格沙漠區(qū)土壤樣品4份,在對應(yīng)地區(qū)進(jìn)行編號(表1),每一樣點采集200~300 g/袋,用無菌采樣袋將所采集的樣品暫時4 ℃
低溫保存,然后在-20 ℃下進(jìn)行保存,進(jìn)行后續(xù)的可培養(yǎng)試驗。
1.1.2 培養(yǎng)基
(1)分離培養(yǎng)基 選用12種不同的培養(yǎng)基進(jìn)行培養(yǎng), 配方參考德國菌種保藏中心(https://www.dsmz.de)的部分培養(yǎng)基。M1(高氏一號培養(yǎng)基G);M2(淀粉酪蛋白瓊脂培養(yǎng)基SCA);M3(胰酪大豆胨瓊脂培養(yǎng)基TSA);M4(0.1×TSA);M5(R2A);M6(PYGV);M7(甘油-天門冬酰胺培養(yǎng)基ISP5);M8(MM);M9(ISP3);M10(胰蛋白胨大豆肉湯培養(yǎng)基TSB);M11(0.1×TSB);M12(腐殖酸維生素瓊脂培養(yǎng)基HVA)。
(2)純化培養(yǎng)基 ISP4培養(yǎng)基配方參考德國菌種保藏中心(https://www.dsmz.de)。
(3)種子液培養(yǎng)基 0.1×TSA—胰蛋白胨1.7 g,
大豆蛋白胨0.3 g,NaCl 0.5 g,葡萄糖0.25 g,K2HPO4 0.05 g,H2O 1000 mL;R2A—R2A (BD,Difco) 3.2 g,H2O 1000 mL。
(4)發(fā)酵培養(yǎng)基 高氏一號、TSB和ISP2液體培養(yǎng)基配方參考德國菌種保藏中心,均不加瓊脂。
(5)檢定菌培養(yǎng)基 LB—胰蛋白胨10 g,酵母提取物5 g,NaCl 5 g,H2O 1000 mL,瓊脂18 g。
1.1.3 主要儀器和試劑
生物安全柜(蘇州智凈凈化有限公司);PCR擴增儀(吉泰生物有限公司);電泳儀(山東博晟生物技術(shù)有限公司);立式壓力蒸汽滅菌鍋(上海云泰儀器儀表有限公司);旋轉(zhuǎn)蒸發(fā)儀(吉泰生物有限公司);電熱恒溫培養(yǎng)箱和恒溫振蕩培養(yǎng)箱(上海一恒科學(xué)儀器有限公司)。
Ex Taq DNA聚合酶,南京諾唯贊生物科技股份有限公司;Agarose,蘭杰柯生物科技有限公司;其他試劑均為國產(chǎn)分析純。
1.1.4 指示菌株
革蘭陽性菌株:金黃色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)、表皮葡萄球菌(Staphylococcus epidermidis)、蠟樣芽胞桿菌(Bacillus cereus)、蘇云金芽胞桿菌(Bacillus thuringiensis)、藤黃微球菌(Micrococcus luteus)、巴氏葡萄球菌(Staphylococcus pasteuri)。
革蘭陰性菌株:大腸埃希菌(Escherichia coli)、肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneunoniae)、銅綠假單胞菌(Pseudomonas aeruginosa),以上供試菌由甘肅省極端環(huán)境微生物資源與工程重點實驗室提供。
1.2 方法
1.2.1 土壤樣品的處理
在生物安全柜中,取5 g土壤樣品置于50 mL裝有5~10個玻璃珠且滅過菌的錐形瓶中,再將20 mL已滅菌生理鹽水加入每個錐形瓶中,以200 r/min的速度在30℃恒溫?fù)u床上振蕩40 min;振蕩后取出靜置
3 min,在900 ?L生理鹽水中加入上清液100 ?L,混合均勻后標(biāo)記為原液的10-1,再進(jìn)行10倍梯度稀釋至原液的10-5。在不同稀釋濃度的土壤懸液中吸取
200 ?L,在上述12種分離培養(yǎng)基中進(jìn)行涂布,37 ℃下培養(yǎng)7~14 d,培養(yǎng)1周后對平板進(jìn)行計數(shù)和不同形態(tài)、顏色菌落的挑取、分離和純化。
1.2.2 菌株的分離純化
觀察菌落形態(tài),在同一分離平板內(nèi)根據(jù)菌落形態(tài)特征去重后,挑取單菌落,編號,然后采用分區(qū)劃線的方法接種在ISP4固體培養(yǎng)基上進(jìn)行菌株純化。
1.2.3 菌株的保藏
向凍存管(Corning,USA)中加入1.5 mL的25%的甘油水溶液,然后挑取已純化的放線菌,混合均勻后保存至-80 ℃冰箱中。
1.2.4 基于16S rRNA基因序列的放線菌多樣性分析
(1) 放線菌菌株基因組DNA提取? ? 放線菌基因組DNA的提取按照試劑盒Solarbio?LIFE SCIENCES(北京)步驟進(jìn)行。
(2) 16S rRNA基因序列的PCR擴增? ? 以提取的放線菌總DNA為模板,根據(jù)(表2)中的條件和(表3)中的程序來進(jìn)行擴增。
PCR擴增產(chǎn)物在1%瓊脂糖凝膠中進(jìn)行電泳檢測,PCR擴增產(chǎn)物送至西安擎科生物技術(shù)有限公司進(jìn)行16S rRNA基因測序。
(3)序列比對及系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建? ? 將菌株的16S rRNA基因序列在EzBioCloud數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對(www.ezbiocloud.net);使用MEGA 11.0軟件,采用鄰接法進(jìn)行聚類分析,構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。系統(tǒng)進(jìn)化矩陣采用Kimura two parameter模型進(jìn)行評估,并重復(fù)取樣1000次進(jìn)行自展值分析,以評估進(jìn)化樹拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性。
1.2.5 放線菌抑菌活性檢測
(1) 首先,在固體培養(yǎng)基上挑取適量生長良好的菌株,并將其轉(zhuǎn)移到含有100 mL適合其生長的液體培養(yǎng)基的500 mL錐形瓶中。然后,放入搖床中,在180 r/min、30 ℃的條件下震蕩培養(yǎng)2 d。接下來,加入高氏一號發(fā)酵培養(yǎng)基或TSB或ISP2,繼續(xù)培養(yǎng)7 d。
完成發(fā)酵后,用8000 r/min的離心條件去除菌體,留下上清液,再用等量的乙酸乙酯萃取上清液。最后,使用旋轉(zhuǎn)蒸發(fā)儀將提取物濃縮,再用2 mL甲醇溶解即可得到乙酸乙酯粗提物。
(2) 將實驗室保存的指示菌接種到LB固體培養(yǎng)基中進(jìn)行活化,接著,挑取活化好的指示菌加入到含有20 mL LB液體培養(yǎng)基的50 mL離心管中,在37 ℃、
180 r/min的搖床上震蕩培養(yǎng)24~48 h,直至菌液生長繁殖。同時,配制LB固體培養(yǎng)基,并將其溫度降至約55 ℃左右。隨后,將0.1%的指示菌懸液加入到LB固體培養(yǎng)基中,并傾注于方形平板備用。
(3) 待上述方形平板的培養(yǎng)基凝固后,用5~6 mm的打孔器在方形平板上間隔1 cm打出小孔,吸取
20 μL乙酸乙酯粗提物注入小孔中,每個平板上留出一個孔加入20 μL濃度為? 2 mg/mL的卡那霉素作為陽性對照,37 ℃培養(yǎng)24~48 h后觀察并記錄抑菌圈的有無和大小。
2 結(jié)果與分析
2.1 庫姆塔格沙漠可培養(yǎng)放線菌數(shù)量特征
培養(yǎng)初期(2周后),對庫姆塔格沙漠的兩個樣地(HLES和HLBS)放線菌進(jìn)行了分離,計數(shù)不同培養(yǎng)基中分離到的菌落總數(shù)及放線菌數(shù)目(圖1)所示。M8中分離到的細(xì)菌菌落數(shù)目最多,達(dá)1.12×104 CFU/g,M7分離到的菌落數(shù)最少(0.58×103 CFU/g)。從分離到的放線菌數(shù)來看,M1中分離到的放線菌數(shù)量最多(1.88×103 CFU/g),M12的最少(0.2×103 CFU/g)。綜合菌落數(shù)目,M8、M1、M4 3種培養(yǎng)基的分離效果較好;而在M5培養(yǎng)基的平板上觀察發(fā)現(xiàn),菌落的種類相較于其他培養(yǎng)基較高。因此,選擇這4種培養(yǎng)基來分離培養(yǎng)SSD和HMX兩個樣地的土壤放線菌。
2.2 庫姆塔格沙漠可培養(yǎng)放線菌的多樣性分析
從庫姆塔格沙漠地區(qū)的土壤樣品中分離純化獲得的純培養(yǎng)物根據(jù)菌落形態(tài)、顏色、大小等特征進(jìn)行初步重排,選擇420株菌進(jìn)行16S rRNA基因擴增和序列比對,結(jié)果表明,其中370株為放線菌,根據(jù)最新文獻(xiàn)的修訂[23],可以分為79個不同放線菌分類單元。它們隸屬于11個目12個科的22個屬,分離結(jié)果如(表4)所示,分別為:鏈霉菌屬(Streptomyces)、糖絲菌屬(Saccharothrix)、倫茨菌屬(Lentzea)、假諾卡菌屬(Pseudonocardia)、放線動孢菌屬(Actinokineospora)、擬孢囊菌屬(Kibdelosporangium)、擬無枝菌酸菌屬(Amycolatopsis)、小單孢菌屬(Micromonospora)、原小單孢菌屬(Promicromonospora)、壤球菌屬(Agrococcus)、節(jié)桿菌屬(Arthrobacter)、戈登菌屬(Gordonia)、擬諾卡菌屬(Nocardiopsis)、貧養(yǎng)桿菌屬(Modestobacter)、芽生球菌屬(Blastococcus)、動球菌屬(Kineococcus)、浮霉?fàn)罹鷮伲≒lanctomonas)、微桿菌屬(Microbacterium)、考克菌屬(Kocuria)、污物假節(jié)桿菌屬(Pseudarthrobacter)、Auraticoccus、類諾卡菌屬(Nocardioides)。其中,鏈霉菌屬為庫姆塔格沙漠地區(qū)的優(yōu)勢菌屬,共分離到233株,占分離到的放線菌菌株數(shù)量的63%,其次是糖絲菌屬、倫茨菌屬和節(jié)桿菌屬,分別占13.8%、4.3%和3.8%。此外,其余菌屬都不超過10株。部分代表菌株及其同源菌株基于16S rRNA基因序列構(gòu)建的Neighbour-joining系統(tǒng)進(jìn)化樹見(圖2)。
2.3 可培養(yǎng)放線菌潛在新種分析
根據(jù)放線菌的16S rRNA基因序列相似性低于98.65%可以被認(rèn)為是不同物種的原則[9]。對分離到的可培養(yǎng)放線菌進(jìn)行了潛在新穎性分析,結(jié)果顯示,共有14株放線菌的16S rRNA基因序列與其最近緣的典型菌株序列相似性均低于98.65%,其中,鏈霉菌屬7株,倫茨菌屬、貧養(yǎng)桿菌屬、污物假節(jié)桿菌屬、類諾卡菌屬、節(jié)桿菌屬、動球菌屬和糖絲菌屬各1株,其相似性處于95.79%~98.64%之間。14株潛在放線菌新種中,6株是從HMX樣地分離得到,4株是從SSD樣地分離得到,4株是從HLES樣地中分離得到,1株是從HLBS樣地中分離得到,具體見表5。
2.4 抑菌活性篩選結(jié)果
對14株潛在放線菌新種分別進(jìn)行了不同發(fā)酵培養(yǎng)基的搖瓶發(fā)酵,菌株發(fā)酵液乙酸乙酯萃取濃縮物對9種指示菌的抑菌活性統(tǒng)計結(jié)果顯示(表6),不論是哪種發(fā)酵培養(yǎng)基,所有的檢測菌株都至少對一種指示菌具有抑菌活性。部分菌株抑菌活性檢測結(jié)果見(圖3)。
其中,高氏一號培養(yǎng)基發(fā)酵時,SSD54、HMX87、HMX112、HMX145、HLES74、HLES54的發(fā)酵液乙酸乙酯萃取物對6種及以上指示菌有抑制作用,具有廣譜抗菌活性,包括3株鏈霉菌和3株稀有放線菌(假諾卡菌屬、節(jié)桿菌屬和倫茨菌屬)。HMX145、HMX169、HLES74的發(fā)酵液乙酸乙酯萃取物均對3種指示菌表現(xiàn)出強抑菌活性(抑菌圈直徑>20.00 mm);而僅有HMX87對大腸埃希菌有良好的抑制作用,抑菌圈直徑達(dá)17.00 mm。
ISP2培養(yǎng)基發(fā)酵時,SSD35、HMX87、HMX169、SSD95、HLES74、HLES153發(fā)酵液乙酸乙酯萃取物對6種及以上指示菌有抑制作用,同樣具有廣譜抗菌活性。但是,ISP2培養(yǎng)基發(fā)酵時,所有菌株的發(fā)酵液乙酸乙酯萃取物抑菌活性良好(抑菌圈直徑<20.00 mm)。
TSB培養(yǎng)基發(fā)酵時,SSD35、HMX112、HMX169、HMX40、HLES54發(fā)酵液乙酸乙酯萃取物對6種及以上指示菌有抑制作用,具有廣譜抗菌活性。同樣,TSB培養(yǎng)基發(fā)酵時,只有HMX112對巴氏葡萄球菌和蘇云金芽胞桿菌表現(xiàn)出顯著的抑菌活性(抑菌圈直徑>25.00 mm),并且其抑菌圈直徑均大于陽性對照組;其他菌株的發(fā)酵液乙酸乙酯萃取物抑菌活性均良好(抑菌圈直徑<20.00 mm)。
3 結(jié)論與討論
來自庫姆塔格沙漠區(qū)4份土壤樣品中,分離到可培養(yǎng)的放線菌370株,分布于11個目12個科的22個屬,除分離到鏈霉菌屬外,還包括糖絲菌屬、倫茨菌屬、污物假節(jié)桿菌屬、擬孢囊菌屬、貧養(yǎng)桿菌屬、芽生球菌屬、浮霉?fàn)罹鷮?、類諾卡菌屬等21個稀有放線菌屬,其中包括14株潛在放線菌新種。已有研究表明,從塔克拉瑪干沙漠中分離到的放線菌分屬于16科24屬,鏈霉菌屬和擬諾卡菌屬為優(yōu)勢菌屬,還分離到類諾卡菌屬、庫克菌屬、糖單胞菌屬、迪茨菌屬等稀有放線菌[11]。另外,在西藏仲巴五彩沙漠中,優(yōu)勢菌仍然是鏈霉菌屬,還有諾卡菌屬、倫茨菌屬、考克菌屬、糖絲菌屬和動球菌屬等放線菌[9]。本研究從庫姆塔格沙漠分離的放線菌中,鏈霉菌屬也為優(yōu)勢菌屬,這可能與其能夠產(chǎn)生抗干燥和耐熱的孢子有關(guān),孢子可以在干燥環(huán)境中長期存在[24]。而與文獻(xiàn)不同的是本研究還分離到了擬孢囊菌屬、貧養(yǎng)桿菌屬、芽生球菌屬、浮霉?fàn)罹鷮?、污物假?jié)桿菌屬等一些稀有放線菌屬。
70%的天然抗生素都是由放線菌產(chǎn)生的[25-27]。沙漠環(huán)境中的放線菌尤其是一些新物種已成為了新穎多樣的次級代謝產(chǎn)物和新型抗生素的重要來源,例如,Abdelkader等[28]從分離自阿塔卡馬沙漠土壤的鏈霉菌Streptomyces asenjonii KNN42.f中分離到3個具有廣譜抗菌活性的新β-二酮類化合物;Bao等[29]從1株來自西藏仲巴五彩沙漠土壤的鏈霉菌XZH99T中分離到了7個angucycline類抗生素,其中3個為新化合物。活性檢測表明,這些化合物對人腫瘤細(xì)胞具有顯著的細(xì)胞毒性;從塔克拉瑪干沙漠中分離出一株鏈霉菌8P21H-1,其表現(xiàn)出強大的抗菌活性和對蛋白質(zhì)生物合成的抑制活性,通過分離得到乙?;揖G蛋白和脫硫灰綠蛋白[30];此外,1株從阿根廷阿塔卡瑪沙漠分離出的鏈霉菌新種Steptomyces leeuwenhoeki C34T,能夠產(chǎn)生罕見的二十二元大環(huán)內(nèi)酯類抗生素Chaxalactins A~C和新型安莎類抗生素chaxamycins A~D,這些新型抗生素具有良好的熱穩(wěn)定性和溶解性,并且表現(xiàn)出抗菌和抗腫瘤活性[31-32]。從沙漠放線菌中分離到具有良好的抗菌、抗腫瘤活性的物質(zhì),對生物醫(yī)藥領(lǐng)域具有積極影響。
本研究通過對14株潛在放線菌新種進(jìn)行液體發(fā)酵及抑菌活性檢測發(fā)現(xiàn),它們至少對1種檢定菌有抑菌活性,且對革蘭陽性菌的抑制效果強于革蘭陰性菌;其中,抑制蘇云金芽胞桿菌的效果最為突出,抑菌活性最強的是利用TSB發(fā)酵的HMX112菌株,對巴氏葡萄球菌有顯著的抑制效果,抑菌圈直徑達(dá)30.30 mm,而陽性對照卡那霉素(2 mg/mL)抑制巴氏葡萄球菌的抑菌圈為21.30 mm,表明HMX112的抑菌活性極強;14株潛在放線菌新種中有11株對6種及以上指示菌有抑制作用,具有廣譜的抑菌活性,其次級代謝產(chǎn)物值得下一步研究。此外,菌株HLES74、HMX112、HMX145、HMX169對革蘭陽性菌(Staphylococcus aureus、Staphylococcus pasteuri、Bacillus thuringiensis、Staphylococcus epidermidis)較強的抑制效果,抑菌圈直徑均大于20.00 mm,其中包括鏈霉菌、節(jié)桿菌、動球菌。本研究獲得的菌株為篩選相應(yīng)活性物質(zhì)或挖掘新的生物活性物質(zhì)提供了豐富的菌種資源,后續(xù)有待通過基因組信息分析、質(zhì)譜分子網(wǎng)絡(luò)技術(shù)[33]分析菌株次級代謝產(chǎn)物的產(chǎn)生能力,以進(jìn)行進(jìn)一步的次級代謝產(chǎn)物化學(xué)研究。
綜上所述,庫姆塔格沙漠環(huán)境中放線菌資源豐富并且一些潛在放線菌新種的抑菌活性較好,具有產(chǎn)生活性次級代謝產(chǎn)物的潛力。本研究為庫姆塔格沙漠放線菌挖掘提供了經(jīng)驗,并獲得了一批具有潛在應(yīng)用價值的抑菌活性菌株,是后續(xù)挖掘沙漠放線菌高活性天然產(chǎn)物的基礎(chǔ)。
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基金項目:第三次新疆綜合科學(xué)考察項目(No. 2022xjkk1200);國家自然科學(xué)基金(No. U22A20451);中國科學(xué)院“西部之光”計劃(No. xbzg-zdsys-202105);甘肅省科技計劃項目(No. 23JRRA574)。
作者簡介:李佳慧,女,生于1997年,碩士,研究方向:極端環(huán)境微生物學(xué)、微生物工程、應(yīng)用微生物學(xué),E-mail: 2051005547@qq.com
*通信作者,E-mail: xuelg@mail.lzjtu.cn