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      豬傳染性胃腸炎病毒基因組結(jié)構(gòu)及主要基因功能研究進展

      2023-09-13 06:47:58成偉偉容維中陳伯祥趙子惠李元新
      現(xiàn)代畜牧獸醫(yī) 2023年8期
      關(guān)鍵詞:結(jié)構(gòu)域基因組位點

      王 佳,成偉偉,容維中,楊 明,陳伯祥,趙子惠,李元新

      ( 甘肅省畜牧獸醫(yī)研究所,甘肅 平?jīng)?744000 )

      豬傳染性胃腸炎(porcine transmissible gastroenteritis)是由豬傳染性胃腸炎病毒(transmissible gastroenteritis virus,TGEV)引起的一種急性、高度接觸性傳染病。1946年,Doyle等[1]確定豬傳染性胃腸炎的病原體為病毒;1956 年我國首次報道后,該病在我國多省份接連發(fā)生[2]。豬傳染性胃腸炎以嚴重腹瀉、嘔吐和脫水為臨床特征,不同日齡的豬均易感,兩周齡內(nèi)仔豬病死率高達100%[3]。豬傳染性胃腸炎多發(fā)于冬、春季,感染高峰期在1~2月,在新疫區(qū)暴發(fā)性流行,老疫區(qū)間歇性流行。TGEV 通過呼吸道和消化道傳播,發(fā)病豬和帶毒豬可通過呼氣、嘔吐物、糞便排出病毒,患病豬經(jīng)治療痊愈后仍會帶毒。病毒經(jīng)口鼻進入宿主體內(nèi),在豬的鼻黏膜和肺部繁殖,再通過消化道和血液循環(huán)至小腸黏膜上皮細胞[4]。TGEV臨床中常與豬流行性腹瀉病毒(PRCV)、豬輪狀病毒和豬δ 冠狀病毒混合感染,給養(yǎng)豬業(yè)造成巨大經(jīng)濟損失[5]。

      TGEV屬于冠狀RNA病毒,基因組結(jié)構(gòu)具有較高的突變性,雖已研究出了TGEV 各類疫苗,但該病的防控難度仍然較大。進行TGEV基因組解析有助于鑒別病毒、闡明病毒感染的作用機制,為新型疫苗和治療藥物的開發(fā)提供方向。本文闡述了近年來TGEV的病毒特點、基因結(jié)構(gòu)以及編碼得到的主要蛋白功能的研究進展,以期為后續(xù)TGEV防控及致病機制的相關(guān)研究提供參考。

      1 TGEV病原學

      TGEV 為尼多病毒目(Nidovirales)冠狀病毒科(Coronavirus)冠狀病毒屬(Coronavirus)α 亞群成員,是具有囊膜的單股正鏈RNA 病毒。病毒囊膜為雙層脂質(zhì)結(jié)構(gòu),外形類皇冠或太陽日冕形狀,為直徑約90~200 nm 的圓形或橢圓形,外膜上為柄狀結(jié)構(gòu)連接的纖突蛋白(S),形似花瓣,大而稀疏,長約12~25 nm,末端膨大部直徑約10 nm。S、膜蛋白(M)與包膜蛋白(E)鑲嵌于病毒囊膜;核衣殼蛋白(N)與病毒RNA 結(jié)合,共同構(gòu)成直徑約9~16 nm的螺旋狀核糖核蛋白(RNP),使病毒粒子獲得感染力[3-4]。磷鎢酸負染電鏡觀察,制樣過程中纖突極易斷裂后脫落,有時只能觀察到少數(shù)花瓣狀纖突或囊膜邊界視野中僅有一個電子透明中心。TGEV病毒結(jié)構(gòu)見圖1[2,6]。

      圖1 TGEV病毒結(jié)構(gòu)Fig.1 Virus structure of TGEV

      TGEV 只存在一種血清型,與豬呼吸道冠狀病毒(PRCV)具有交叉保護性,與犬冠狀病毒(CCV)和貓傳染性腹膜炎病毒(FIPV)具有抗原相關(guān)性,與戊型肝炎病毒(HEV)、豬流行性腹瀉病毒(PEDV)無抗原相關(guān)性[3]。TGEV對溫度、紫外線敏感,耐冷不耐熱、對乙醚、SDS等有機試劑敏感,病毒粒子在膽汁中較穩(wěn)定。此外,病毒的毒力越強,對胰酶的敏感性越低。SH株和TO株在4 ℃的條件下會凝集部分動物的紅細胞,但不凝集鵝和小鼠的紅細胞[7]。TGEV感染豬睪丸細胞(ST)和豬腎細胞(PK-15)時會形成雙膜囊泡(DMVs),DMV是冠狀病毒復制的一種標志。實驗室培養(yǎng)常用ST 和PK-15 細胞系,其中TGEV 對ST 細胞系最為敏感,但在ST 細胞和PK-15細胞系上進行體外培養(yǎng)并不能完全模擬TGEV 在體內(nèi)宿主細胞中的完整過程。因此,李甜甜等[8]建立了豬腸道上皮細胞系(IPEC-J2)模型,尹靈丹等[9]建立了TGEV的腸小體感染模型,均比ST和PK-15細胞系更接近體內(nèi)環(huán)境。

      TGEV 感染宿主細胞的主要受體為豬氨基肽酶N(pAPN)。有研究在新生仔豬的小腸絨毛上皮細胞中發(fā)現(xiàn)一個約200 kDa 的蛋白質(zhì),此蛋白質(zhì)在3 周齡以上豬中不存在,推測該蛋白受體為TGEV 感染低齡仔豬的第二受體[10]。表皮生長因子受體(EGFR)作為輔助因子在感染早期與pAPN 協(xié)同作用[11]。輔助受體(Neu5Gc)決定TGEV的腸道趨向性,PRCV缺乏此受體,故不感染腸道器官[12]。

      2 TGEV基因組結(jié)構(gòu)及功能

      2.1 TGEV基因組結(jié)構(gòu)

      TGEV基因組長度約28.5 kbp,是最大的RNA病毒,雖為單股正鏈不分節(jié)段RNA 病毒,但具有類似分節(jié)段RNA病毒的高重組率特點[13]。TGEV 分子量約6×103kDa,全基因組共7 個分區(qū),其中ORF1 由ORF1a 和ORF1b 共同構(gòu)成,ORF3 由ORF3a 和ORF3b 共同構(gòu)成,基因組排列順序為:5'-UTR-ORF1a-ORF1b-S-ORF3a-ORF3b-E-M-NORF7-UTR-3',5'端有帽子結(jié)構(gòu),3'端有poly(A)尾,各個基因間結(jié)構(gòu)緊湊。5'端的ORF1長約20 kbp占據(jù)整個基因組的2/3,3'端的基因組約8.4 kbp 占整個基因組的1/3。不同基因之間被核心區(qū)為(CUAAAC)的轉(zhuǎn)錄調(diào)整序列(TRS)隔開,是轉(zhuǎn)錄亞基因組RNA的起始信號[14]。5'端前598 bp為病毒包裝信號,3'端后494 bp對病毒包裝非必需,但可提高包裝效率[11]。TGEV基因組結(jié)構(gòu)見圖2。

      圖2 TGEV基因組結(jié)構(gòu)Fig.2 Genome structure of TGEV

      不同毒株非編碼區(qū)的長度不同,5'端非編碼區(qū)(UTR)約200~400 bp,3'端UTR 約300~500 bp,5'-UTR 包含存在65~98 bp的前導序列。不同CoV 5'-UTR二級結(jié)構(gòu)存在較大差異,但均存在一個約15個核苷酸組成的“莖環(huán)結(jié)構(gòu)”。3'-UTR 尤其是Poly(A)附近高度保守的基因序列對TGEV 的RNA 轉(zhuǎn)錄具有非常重要的作用,兩端UTR 中的順勢調(diào)控區(qū)域?qū)Σ《巨D(zhuǎn)錄具有重要作用[2]。TGEV的繁殖階段在胞質(zhì)中進行,過程與其他冠狀病毒相似。TGEV 基因組RNA可直接作mRNA,或作模板擴增負鏈,再由負鏈作模板擴增新的正鏈RNA 和亞基因組RNA,而后經(jīng)過翻譯、組裝、釋放,完成整個復制周期。

      2.2 TGEV結(jié)構(gòu)基因

      2.2.1 S基因

      S 基因長度約4.35 kbp,編碼得到1 447~1 449 個氨基酸殘基的前體蛋白。蛋白質(zhì)糖基化對病毒抗原性具有重要作用,TGEV S 蛋白約含51 個N-糖基化修飾位點,糖基化前分子量128~160 kDa,糖基化后增加約30 kDa。蛋白質(zhì)磷酸化介導蛋白質(zhì)活性,增強蛋白質(zhì)相互作用的能力。TGEV S 蛋白約含139 個磷酸蛋白[15]。S 蛋白是Ⅰ型跨膜糖蛋白,為一種同源三聚體。每個單體分為S1 和S2 兩個區(qū)域,S1 具有S1-CTD 和S2-NTD 兩個獨立的功能亞域,CTD 是受體結(jié)合關(guān)鍵區(qū)域;S2 存在HR1 和HR2 兩個重要的保守重復氨基酸序列[15]?;ò隊頢1直接參與病毒、靶細胞的識別,誘導產(chǎn)生中和抗體,決定病毒的種屬嗜性和感染特性。連接病毒囊膜與S1 部分的柄狀S2 區(qū)域,固定S蛋白于囊膜上,參與病毒囊膜和宿主細胞膜融合的過程。

      S蛋白氨基端在外,羧基端在內(nèi),具有膜外區(qū)、跨膜區(qū)、膜內(nèi)區(qū)等3 個區(qū)域,N 端aa1~aa16 分泌信號肽。膜外區(qū)主要為冠狀凸起部分,其上含有氨基肽酶N(APN)識別位點,aa522~aa744區(qū)域與pAPN發(fā)生黏附介導感染,pAPN上的aa36~aa223、aa349~aa591、aa592~aa963 可與抗pAPN 抗體結(jié)合,不同程度地阻斷TGEV 感染。研究表明,敲除pAPN 的仔豬對TGEV 具有抵抗力,并且敲除該位點后不會引起宿主細胞生理功能改變。N 端存在一處血凝活性區(qū),故與其他冠狀病毒(CoV)相比,TGEV雖無血凝素蛋白(HE),但仍具有血凝活性,PRCV缺失該血凝活性區(qū),故利用檢測血凝活性可區(qū)分PRCV和TGEV。

      S 蛋白從氨基端到羧基端存在為C、B、D、A 等4 個抗原位點。A 位點在aa538~aa591 內(nèi),是分布在病毒粒子表面的不連續(xù)抗原位點。aa537~aa547處有一條可部分代表A 位點的多肽,可用于病毒的區(qū)分。A 位點存在Aa、Ab、Ac等3個亞位點,核心分別位于538、591和543殘基處。B位點位于aa97~aa144,具有復雜的空間結(jié)構(gòu)。C 位點位于aa49~aa52,是一段連續(xù)的線狀結(jié)構(gòu),對溫度和pH值進行調(diào)節(jié)可影響C 位點的親和性。PRCV 缺少C 位點,通過此位點可區(qū)分PRCV 和TGEV。D 位點位于aa382~aa385,高度保守,可能在病毒繁殖中起到一定作用。S 蛋白存在抗原位點、抗原亞位點和抗原決定簇等3種抗原層次。目前已知S蛋白的抗原決定簇共11個,與產(chǎn)生中和抗體相關(guān)的有5個,A、D位點誘導產(chǎn)生中和抗體。

      2.2.2 M基因

      M 基因長度約789 bp,編碼得到的蛋白質(zhì)前體約含262 個氨基酸殘基,切除aa1~aa16 的信號肽、轉(zhuǎn)膜、糖基化后得到成熟的M蛋白,攜帶一條富含甘露糖天冬氨肽連接的側(cè)鏈[4]。M蛋白分子量約29~31 kDa,形成于宿主細胞質(zhì)中粗面內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜上,可在病毒囊膜中多次跨膜,包埋在病毒囊膜中,含量最多,維持了病毒包膜形狀。TGEV 的M蛋白1/3的C端暴露于病毒的囊膜之外,2/3的C端存在于病毒內(nèi)部,是一種不同于其他冠狀病毒的空間構(gòu)象。膜外的C端可作為保護性抗原刺激機體產(chǎn)生抗體中和病毒,介導被感染細胞發(fā)生補體溶解反應(yīng)。N 端6~22 氨基酸殘基區(qū)具有誘導機體干擾素產(chǎn)生的抗原決定簇,可在體外誘導干擾素-α(INF-α)。此外,M蛋白還可以通過誘導干擾素調(diào)節(jié)因子3(IRF-3)的磷酸化和核轉(zhuǎn)移激活I(lǐng)FN-β 信號通路,誘導干擾素-β(INF-β)的產(chǎn)生[16]。TGEV 的M 蛋白可同Nsp3 結(jié)合調(diào)節(jié)病毒早期復制。Ji 等[17]闡明了TGEV 內(nèi)化侵入細胞的一種新機制——通過網(wǎng)格蛋白(clathrin)介導的內(nèi)吞作用,幫助TGEV M 蛋白與HSC70 互相作用,影響病毒TGEV內(nèi)化過程。

      2.2.3 E基因

      E 基因長度約246 bp,編碼后得到的蛋白質(zhì)前體含82個氨基酸,成熟的E蛋白僅含78個氨基酸。E蛋白(sM蛋白、包膜蛋白E)是一種小分子跨膜蛋白,分子量約7.9 kDa。E蛋白由一個疏水結(jié)構(gòu)域和一個α螺旋結(jié)構(gòu)域組成,參與病毒組裝、出芽和包膜形成過程[12]。E蛋白可調(diào)控病毒粒子的裝配和釋放,引起內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激,提高白細胞介素18(IL-18)的表達[18]。雖然E蛋白缺失不影響病毒RNA合成,但對于TGEV 的復制、病毒粒子在細胞內(nèi)的運輸和成熟是必需的。研究發(fā)現(xiàn),TGEV M 蛋白和E蛋白共表達是病毒樣顆粒組裝和釋放的必要條件,而且M蛋白與E蛋白形成的病毒樣顆粒(VLPs)能夠誘導INF-α產(chǎn)生,可抵御TGEV的感染[19]。

      2.2.4 N基因

      N基因長約1 149 bp,編碼得到的蛋白質(zhì)前體約382個氨基酸殘基。成熟的N 蛋白分子質(zhì)量約45 kDa,與病毒RNA結(jié)合形成核衣殼,使病毒獲得感染力[20]。N蛋白是一種序列保守的磷酸化酸性蛋白,可誘導機體產(chǎn)生細胞免疫應(yīng)答,含有A、B、C等3個高度保守的抗原位點[20]。N蛋白可延長細胞周期的合成期,能夠引起內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激和白細胞介素-8(IL-8)上調(diào)[18]。研究發(fā)現(xiàn),N蛋白定位于核仁這一過程對核糖體優(yōu)先翻譯病毒亞基因組RNA和調(diào)節(jié)細胞分裂周期具有重要作用[21]。TGEV抗N蛋白血清中和全活病毒時90%以上的亞基因組mRNA合成被抑制[14]。

      2.3 TGEV非結(jié)構(gòu)基因

      2.3.1 ORF1(Nsp1~Nsp16)

      ORF1 位于基因組5'端,編碼病毒復制與轉(zhuǎn)錄相關(guān)的酶,由ORF1a和ORF1b構(gòu)成。ORF1全長約20 kbp,ORF1a約12 051 bp,ORF1b 約8 094 bp,ORF1a 的變異性明顯高于ORF1b。ORF1b 有43 個堿基重疊于上游ORF1a 中,重疊部分為核糖體移碼信號區(qū)。ORF1a編碼多聚蛋白pp1a,ORF1a 和ORF1b 共同編碼多聚蛋白pp1ab,經(jīng)Nsp3 和Nsp5 切割后形成16 個非結(jié)構(gòu)蛋白Nsp1~Nsp16。非結(jié)構(gòu)蛋白誘導細胞產(chǎn)生DMVs,以此組裝形成病毒的轉(zhuǎn)錄復合體(RTC),在RTC幫助下以不連續(xù)轉(zhuǎn)錄的方式合成一套具有5'端帽子結(jié)構(gòu)和3'端Poly(A)尾嵌套的亞基因組RNA[22]。在ORF1 的上游117 位堿基處有一個小ORF(AUGAAAUCA),通過同源蛋白的結(jié)構(gòu)和功能推斷,該ORF 可能對ORF1 的翻譯起到調(diào)控作用。Nsp3、Nsp4 和Nsp6 可促進DMVs 的形成;Nsp7、Nsp8、Nsp9、Nsp12 和Nsp13 相互作用形成RTC,促進RNA 序列反應(yīng),共同參與RTCs 的形成[23]。非結(jié)構(gòu)蛋白在不同冠狀病毒中相對保守,在病毒的生命周期中起到重要作用[22]。

      α 屬病毒Nsp1 不與40s 核糖體結(jié)合,也不促進宿主細胞mRNA 降解,但可在一定程度上抑制宿主蛋白質(zhì)翻譯,并且這種抑制具有宿主特異性[24]。TGEV Nsp1 可抑制哺乳動物細胞和海拉細胞無細胞提取物的蛋白質(zhì)翻譯,但不影響兔網(wǎng)織紅細胞裂解物的翻譯[25]。TGEV Nsp1 的aa85~aa102 區(qū)域磷酸化后,激活核因子κB(NF-κB),誘導Ⅲ型IFN產(chǎn)生[26]。Nsp1蛋白存在于α屬和β屬CoV中,但兩個屬抑制宿主基因的表達機制不同,比較Nsp1 表面靜電、形成和氨基酸序列,推測同源異途進化是導致表達機制不同的原因。因此,兩屬病毒的Nsp1 氨基酸序列差異大也可作為區(qū)分冠狀病毒屬的特異性標記[2,12]。

      Nsp2分子量較大,序列不保守,不是CoV復制的必需成分,但缺少Nsp2會導致病毒合成量降低[2]。Nsp2可誘導前炎性因子表達,aa1~aa120 區(qū)域可激活核因子NF-κB 信號通路[12]。Nsp3 約含1 922 個氨基酸,平均分子量200 kDa,是CoV 編碼的最大的多結(jié)構(gòu)域非結(jié)構(gòu)蛋白。所有CoV Nsp3中均具有泛素樣結(jié)構(gòu)域1、泛素樣結(jié)構(gòu)域2、宏結(jié)構(gòu)域、富含Glu 的酸性域、木瓜蛋白酶樣蛋白酶2、NSP3胞外域、未知功能域Y1和CoV-Y結(jié)構(gòu)域等8種結(jié)構(gòu)域[24]。Nsp3 具有木瓜蛋白酶樣蛋白酶活性(PLpro),包括PL1pro和PL2pro等兩個水解活性位點,水解多聚蛋白獲得Nsp1~Nsp4[27]。Nsp3 宏結(jié)構(gòu)域在病毒復制和免疫逃避中起到作用[12]。α屬冠狀病毒Nsp3主要結(jié)構(gòu)域[22]見圖3。

      圖3 α屬冠狀病毒Nsp3主要結(jié)構(gòu)域Fig.3 Primary domain of α-coronavirus Nsp3

      Nsp4是一個跨膜蛋白,包含TM1、TM2、TM3、TM4等4個預測的跨膜區(qū)域[24]。Nsp4是一種糖基化蛋白,對病毒DMVs 的形成很重要,糖基化程度與CoV 適應(yīng)性相關(guān)[2]。Nsp5也稱3-胰凝乳蛋白酶樣蛋白酶(3CLpro),水解多聚蛋白獲得Nsp5~Nsp16,是研發(fā)抗冠狀病毒藥物的重要靶點。研究發(fā)現(xiàn),Nsp5 具有多種形態(tài),只有二聚體形態(tài)才具有3CLpro活性[2]。

      Nsp6是一個跨膜蛋白,是病毒的轉(zhuǎn)錄復合體的跨膜組成部分,包含6 個跨膜區(qū)和1 個保守的疏水結(jié)構(gòu)域。Nsp6可誘導小直徑自噬體的產(chǎn)生,限制了其運送病毒的能力,利于病毒感染[12]。Nsp7 定位于細胞質(zhì),對細胞周期、細胞周期蛋白A 的表達均無影響,具有使小腸上皮細胞(IEC)降低分泌IL-8 的能力[28]。晶體角度發(fā)現(xiàn),Nsp7 能夠與Nsp8 形成復合體[12]。Nsp8 具有RNA 聚合酶活性,但與Nsp12 相比則弱得多。有研究認為,Nsp8 是Nsp12 的潛在RNA 引物酶,可指導RNA 合成。此外,Nsp8 是復制轉(zhuǎn)錄復合物(RTC)相關(guān)蛋白[2]。Nsp9有核酸結(jié)合能力,與Nsp8形成二聚體,對病毒復制起到重要作用[29]。

      Nsp10是一個轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)蛋白,具有核酸結(jié)合能力,可與Nsp14、Nsp16、UTR 結(jié)合,是RNA 合成的關(guān)鍵調(diào)控因子。Nsp10和Nsp14作用,增加NSP14的外切核糖核酸酶活性,避免病毒復制期間的錯配;與Nsp16 1∶1結(jié)合,增強Nsp16的2'-O-甲基轉(zhuǎn)移酶活性,用于加帽。有研究推測,Nsp10可在病毒復制期間調(diào)節(jié)Nsp14外顯子活性[30-31]。Nsp11僅13個氨基酸,相關(guān)報道很少。Nsp12分子量約102 kDa,氨基酸序列保守,具有RdRp 活性。Nsp12 單獨作用僅具有較弱的RNA 聚合酶活性,但與Nsp7 或Nsp8 結(jié)合后,該活將明顯提高[22]。Nsp12 與Nsp13 協(xié)同可提高病毒復制效率,與Nsp14作用則可參與病毒復制保真過程[12]。

      Nsp13具有核酸解旋酶活性,依靠pH值和金屬離子濃度發(fā)揮活性。氨基端aa1~aa77 區(qū)域為鋅指結(jié)構(gòu)域,其中14 個高度保守的半胱氨酸殘基對Nsp13 的核酸解旋酶活性具有影響;aa279 到羧基端尾部為解旋酶結(jié)構(gòu)域[29]。Nsp14 分子量約為60 kDa,具有外切核酸酶活性和N7-甲基轉(zhuǎn)移酶活性[23]。外切核酸酶活性避免了病毒復制過程中的錯配,保證病毒復制的保真性,為TGEV 遠大于其他RNA 病毒的基因組長度提供了條件。Nsp14 與Nsp10 作用,其外切核酸酶活性顯著增加。N7-甲基轉(zhuǎn)移酶對病毒進行Cap 0 型加帽有利于病毒mRNA 的核轉(zhuǎn)運、翻譯和穩(wěn)定性。兩種酶活性功能域在結(jié)構(gòu)上交錯,但在功能表達上相互影響。Nsp14 外顯子對Nsp12 聚合酶起上位基因作用,參與病毒復制中的矯正過程。

      Nsp15 彌漫分布在整個細胞質(zhì)中,不形成斑點[32]。Nsp15 具有尿苷特異性內(nèi)切核糖核酸酶活性,優(yōu)先切割3'尿嘧啶核苷酸,產(chǎn)生2'-3'環(huán)磷酸酯端。Nsp16 具有2'-O-甲基轉(zhuǎn)移酶活性,與Nsp10 相互作用可增強活性。2'-O-甲基轉(zhuǎn)移酶對自身RNA 進行加帽,將Cap 0 甲基化為Cap 1,甲基化修飾會穩(wěn)定基因組RNA 的化學性質(zhì)并且偽裝RNA以進行免疫逃避[12]。

      2.3.2 ORF3

      ORF3 由ORF3a 和ORF3b 組成,ORF3a 編碼蛋白質(zhì)含71 個氨基酸,ORF3b 編碼蛋白質(zhì)含有254 個氨基酸,ORF3b 序列較保守,編碼蛋白質(zhì)分子量約27.7 kDa,糖基化后形成分子量約31 kDa 的整合膜蛋白。與TGEV 進行對比,TGEV變異株SP以及PRCV均在ORF3處有缺失,提示ORF3在病毒復制中非必需,但可能與病毒毒力相關(guān)[14]。

      2.3.3 ORF7

      ORF7 為α 屬冠狀病毒特有,編碼蛋白質(zhì)約含78 個氨基酸,為分子量約9.1 kDa的疏水蛋白,氨基端aa1~aa30區(qū)域為信號肽序列。ORF7蛋白表達定位于宿主細胞內(nèi)的內(nèi)質(zhì)網(wǎng),在體外合成時與微粒體、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)、高爾基體等相關(guān)。ORF7 蛋白不直接參與病毒復制過程,但具有調(diào)控病毒復制的能力,ORF7 過表達會導致宿主細胞病變效應(yīng)(CPE)程度降低,降低TGEV 的復制水平,而缺少ORF7 蛋白的TGEV毒力會增強[33]。

      3 展望

      豬傳染性胃腸炎暫無特效藥物,臨床中以免疫接種為主要防治手段,但由于TGEV 高突變率的特點,傳統(tǒng)疫苗的保護能力愈顯不足,基因工程疫苗和抗病毒藥物的開發(fā)為現(xiàn)在的主要研究方向。

      TGEV 既具有冠狀病毒的一部分共同特征,也有基于本屬的特點,病毒結(jié)構(gòu)蛋白、非結(jié)構(gòu)蛋白和附屬蛋白的結(jié)構(gòu)功能對病毒繁殖研究具有重大意義。結(jié)構(gòu)蛋白尤其是S蛋白與N蛋白是TGEV研究最多的結(jié)構(gòu)部分,參與宿主細胞的識別、誘導產(chǎn)生中和抗體和病毒繁殖過程等,對分子診斷、疫苗研發(fā)和抗病毒藥物開發(fā)等具有重大意義。非結(jié)構(gòu)蛋白參與轉(zhuǎn)錄翻譯,在指導蛋白質(zhì)合成以及附屬基因的表達中起到重要作用;非編碼區(qū)調(diào)控病毒轉(zhuǎn)錄翻譯,在病毒復制過程中可能起到重要作用,但目前這方面研究主要集中于冠狀病毒β 屬,而α 屬的非結(jié)構(gòu)蛋白與非編碼區(qū)的研究相對較少。非結(jié)構(gòu)蛋白為抗病毒藥物的研發(fā)提供了多個重要靶點,是今后研究的重要方向。

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      有趣的植物基因組
      世界科學(2014年8期)2014-02-28 14:58:31
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