基于基因組微衛(wèi)星的團(tuán)頭魴養(yǎng)殖群體遺傳多樣性分析和指紋圖譜構(gòu)建

張芹　王延暉　王冰柯　屈長義　劉英杰

摘要 利用基因組微衛(wèi)星檢測2個(gè)團(tuán)頭魴（Megalobrama amblycephala）養(yǎng)殖群體的遺傳多樣性，18個(gè)位點(diǎn)共檢測到126個(gè)等位基因，大小在135～362 bp。各位點(diǎn)觀測等位基因數(shù)（Na）在3～15個(gè)，平均為7個(gè)；有效等位基因數(shù)（N）在1.250～6.979，平均為3.603。各位點(diǎn)檢測到的香農(nóng)信息指數(shù)（I）在0.417～2.213，平均為1.384。觀測雜合度（H）在0.219～0.856，平均值為0.647；期望雜合度（H）在0.200～0.857，平均值為0.665。多態(tài)信息含量指數(shù)（PIC）在0.190～0.843，平均值為0.624。群體間的遺傳分化指數(shù)（F）為0.070，群體間的基因交流（N）為1.59，說明HH和YH 2個(gè)群體之間有一定程度基因流。2個(gè)位點(diǎn)檢測到的近交系數(shù)（F）>0，其他16個(gè)位點(diǎn)近交系數(shù)均<0。研究表明，HH和YH兩個(gè)人工養(yǎng)殖群體中均有較高的遺傳多樣性，群體間有一定程度的基因交流，指紋圖譜的構(gòu)建可以用來進(jìn)行團(tuán)頭魴種質(zhì)資源品種間的鑒定以及品種內(nèi)的親緣關(guān)系研究，尤其是可以區(qū)分沒有親緣關(guān)系數(shù)據(jù)背景的群體，可以指導(dǎo)沒有家系構(gòu)建能力的苗種繁育場進(jìn)行繁殖策略的升級(jí)。

關(guān)鍵詞團(tuán)頭魴；基因組；SSR；多態(tài)性

中圖分類號(hào)S917文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼A

文章編號(hào)0517-6611（2023）08-0099-06

doi：10.3969/j.issn.0517-6611.2023.08.023開放科學(xué)（資源服務(wù)）標(biāo)識(shí)碼（OSID）：

Genetic Diversity Analysis and Fingerprint Construction for Two Cultured Populations of Megalobrama amblycephala? on Genomic Microsatellites

ZHANG Qin，WANG Yan-hui，WANG Bing-ke et al（Henan Academy of Fishery Sciences，Zhengzhou，Henan 450044）

AbstractIn this study，the genetic diversity for two populations of Megalobrama amblycephala was detected using genomic SSR.The results showed that 126 alleles were detected in 18 microsatellite loci，ranging from 135 bp to 362 bp.The observed heterozygosity ranged from 3 to 15，with mean value of 7.The expected heterozygosity ranged from 1.250 to 6.979，with mean value of 3.603.The Shannon information index was between 0.417 and 2.213，with an average of 1.384.The observed heterozygosity was between 0.219 and 0.856，with an average of 0.647.The expected heterozygosity was between 0.200 and 0.857，with an average value of 0.665.The polymorphism information content ranged from 0.190 to 0.843，with mean value of 0.624.The genetic differentiation index between the populations was 0.07，and the gene flow was 1.59，indicating that there was a certain degree of gene flow between the two populations.The inbreeding coefficients at two loci were greater than zero，and at the other 16 loci were all less than zero.In summary，the genetic diversity among the two pupulaitons was mid-high，and there was a certain degree of gene exchange between the two populations，which showed that all the artificial selection breeding strategies for the two cultural populations could maintain population diversity.There was a large genetic difference between wild individuals and cultured populations，which could be used as an effective supplement for the genetic diversity of Megalobrama amblycephala in later breeding process.Using these tags，the fingerprint was constructed for two Megalobrama amblycephala group.These microsatellite loci can be used for identification and genetic relationship research of megalobrama amblycephala germplasm resources.Especially，these tags can be used to distinguish pupulations with no pedigree data background and then to guide strategies for breeding ground without family building capacity.

Key wordsMegalobrama amblycephala;Genome;SSR;Polymorphism

團(tuán)頭魴（Megalobrama amblycephala）為我國特有的淡水經(jīng)濟(jì)魚類，因其生長快、成活率高、易捕撈、肉質(zhì)好等優(yōu)點(diǎn)，在全國各地均有養(yǎng)殖。團(tuán)頭魴“華海1號(hào)”水產(chǎn)新品種經(jīng)第五屆全國水產(chǎn)原種和良種審定委員會(huì)審定通過，具有遺傳性狀穩(wěn)定、生長快、成活率高等優(yōu)良特征［1］。“伊河魴”在分類上屬于魴屬團(tuán)頭魴，是近年來開發(fā)黃河流域土著魚類品種時(shí)，選育出來的一個(gè)優(yōu)良新品系［2］。微衛(wèi)星標(biāo)記（microsatellite）由于重復(fù)性好，多態(tài)性高，廣泛應(yīng)用于水生動(dòng)物的種質(zhì)資源鑒定以及遺傳多樣性研究［3-4］，尤其是利用SSR的多態(tài)性對(duì)水生生物進(jìn)行親子鑒定的較多［5-7］。李寶玉等［8］利用微衛(wèi)星標(biāo)記對(duì)團(tuán)頭魴二倍體和三倍體群體進(jìn)行遺傳特性分析，Xiong等［9］利用微衛(wèi)星技術(shù)對(duì)團(tuán)頭魴群體不同家系的肌間刺數(shù)量進(jìn)行研究，而有關(guān)團(tuán)頭魴基因組微衛(wèi)星研究鮮見報(bào)道。筆者對(duì)團(tuán)頭魴基因組SSR序列進(jìn)行分析，篩選得到若干多態(tài)性微衛(wèi)星SSR標(biāo)記，筆者利用這些標(biāo)記，對(duì)2個(gè)團(tuán)頭魴養(yǎng)殖群體進(jìn)行遺傳多樣性研究和指紋圖譜的構(gòu)建，旨在為團(tuán)頭魴種質(zhì)資源品種間的鑒定以及品種內(nèi)的親緣關(guān)系研究提供科學(xué)依據(jù)。

1材料與方法

1.1材料在河南省嵩縣陸渾水庫伊河魴魚種廠采集團(tuán)頭魴伊河群體100尾，以下簡稱YH群體；從湖北省鄂州國家級(jí)團(tuán)頭魴原種場采集團(tuán)頭魴“華海1號(hào)”群體100尾，以下簡稱HH群體；在湖北省鄂州市梁子湖采集野生團(tuán)頭魴個(gè)體2尾，以下簡稱LZH個(gè)體。所有個(gè)體測量體長、體重，剪尾鰭用無水乙醇保存?zhèn)溆谩?/p>

1.2方法

1.2.1團(tuán)頭魴DNA的提取。團(tuán)頭魴DNA用磁珠法基因組DNA提取試劑盒（天根生化）提取，經(jīng) 1% 瓊脂糖凝膠電泳檢測，用超微量分光光度計(jì)（NanoDrop One spectrophotometer）檢測 DNA 濃度和純度，置于 -20 ℃低溫保存。

1.2.2PCR擴(kuò)增及SSR檢測。挑選出18對(duì)微衛(wèi)星引物［10］，使用 M13 通用接頭序列（TGTAAAACGACGGCC AGT）加到每對(duì)引物的 F 引物的 5′方向，并合成帶不同熒光基團(tuán)的 M13 接頭序列。

PCR 反應(yīng)體系（15 μL）：2×Taq PCR Master Mix 7.5 μL，Mix primer 2.0 μL，基因組DNA模板 1.0 μL（50～200ng），dd HO 4.5 μL。PCR擴(kuò)增條件：96 ℃ 預(yù)變性 3 min（96 ℃ 變性 30 s，59～60 ℃退火 30 s，72 ℃ 延伸1 min）共 30個(gè)循環(huán)，72 ℃ 終延伸 10 min，12 ℃保存。

1.2.3熒光毛細(xì)管電泳檢測。取3 μL熒光PCR產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳鑒定，檢測PCR條帶是否單一、片段大小是否與預(yù)期一致。條帶單一且大小相符的，對(duì)照DNA Marker的濃度進(jìn)行定量，將所有產(chǎn)物稀釋至相同的濃度范圍，取1 μL PCR稀釋產(chǎn)物加10 μL甲酰胺（含0.5μL內(nèi)標(biāo)）變性后上DNA測序儀ABI 3730xl進(jìn)行毛細(xì)管熒光電泳檢測。

1.2.4結(jié)果整理。將毛細(xì)管電泳檢測結(jié)果導(dǎo)入GeneMarkerV2.2.0 分析軟件中對(duì)原始數(shù)據(jù)進(jìn)行條帶分型，每對(duì)引物導(dǎo)出PDF峰圖文件，結(jié)果匯總統(tǒng)計(jì)后進(jìn)行分析。

各位點(diǎn)等位基因數(shù)（N）、有效等位基因數(shù)（N）、觀測雜合度（H）、期望雜合度（H）等遺傳多樣性參數(shù)使用GenAIex軟件計(jì)算，各位點(diǎn)的多態(tài)信息含量指數(shù)（PIC）由Cervus軟件計(jì)算，群體Hardy-Weinberg 平衡偏離用固定指數(shù)F衡量，使用GenAIex軟件進(jìn)行群體的哈代溫伯格平衡檢驗(yàn)。群體間的聚類分析運(yùn)用 Phylip 軟件對(duì)其進(jìn)行 UPGMA方法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)生樹。群體間遺傳分化系數(shù)（F）、地方群體內(nèi)近交系數(shù)（F）、基因差異分化系數(shù)（G）、分子方差、PCA分析由GenAIex軟件進(jìn)行運(yùn)算，熱點(diǎn)圖為R語言繪制。連鎖不平衡使用R包poppr的pair.ia方法進(jìn)行分析，圖用R語言繪制。

2結(jié)果與分析

2.1各位點(diǎn)遺傳多樣性參數(shù)由表1可知，采用的基因組微衛(wèi)星位點(diǎn)均為多態(tài)性位點(diǎn)，18個(gè)位點(diǎn)共檢測到126個(gè)等位基因，大小在135～362 bp。各位點(diǎn)觀測等位基因數(shù)目（N）在3～15個(gè)，平均數(shù)為7個(gè)；有效等位基因數(shù)（N）在1.250～6.979，平均值為3.603。各位點(diǎn)檢測到的香農(nóng)信息指數(shù)（I）在0.417～2.213，平均值為1.384。觀測雜合度（H）在0.219～0.856，平均值為0.647；期望雜合度（He）在0.200～0.857，平均值為0.665。多態(tài)信息含量指數(shù)（PIC）在0.190～0.843，平均值為0.624。各位點(diǎn)檢測到的遺傳分化指數(shù)（F）值0.010～0.174，平均值為0.070。在ZQTTF079和ZQTTF257兩個(gè)位點(diǎn)檢測到的近交系數(shù)（F）>0，其他位點(diǎn)近交系數(shù)均<0。基因流（N）為1.185～25.302，平均值為6.047。HH群體在ZQTTF079、ZQTTF124、ZQTTF149、ZQTTF157、ZQTTF209和ZQTTF262位點(diǎn)上顯著偏離哈代溫伯格平衡，YH群體在ZQTTF023、ZQTTF050、ZQTTF079、ZQTTF112、ZQTTF124、ZQTTF149、ZQTTF209、ZQTTF252位點(diǎn)上顯著偏離哈代溫伯格平衡，其中ZQTTF079、ZQTTF124、ZQTTF149、ZQTTF209 位點(diǎn)在2個(gè)群體中都顯著偏離哈代溫伯格平衡。

2.22個(gè)群體各位點(diǎn)的遺傳多樣性參數(shù)由表2可知，HH群體檢測到的觀測等位基因數(shù)目平均值為5.889，有效等位基因數(shù)平均值為2.827，香農(nóng)信息指數(shù)平均值為1.212，觀測雜合度平均值為0.624，期望雜合度平均值為0.612；YH群體檢測到的觀測等位基因數(shù)目平均值為5.222，有效等位基因數(shù)平均值為3.057，香農(nóng)信息指數(shù)平均值為1.202，觀測雜合度平均值為0.671，期望雜合度平均值為0.616。

2.3群體遺傳結(jié)構(gòu)HH和YH 2個(gè)群體之間的F為0.07，說明二者間存在中等程度的分化。2個(gè)群體間的基因流（N）為1.59，說明二者間有一定程度基因交流。

團(tuán)頭魴群體的分子方差分析結(jié)果（表3）顯示，群體間的差異占差異來源的13.06%，個(gè)體間的差異較小，差異的主要來源在個(gè)體內(nèi)部，占總差異的83.26%。個(gè)體內(nèi)部的差異是指由雜合等位基因引起的遺傳差異，大小與個(gè)體雜合位點(diǎn)數(shù)相關(guān)，即個(gè)體的遺傳多樣性，由此可知2個(gè)養(yǎng)殖群體的個(gè)體內(nèi)部存在著豐富的遺傳多樣性。

根據(jù)遺傳距離繪制的群體間系統(tǒng)發(fā)生樹（圖1），YH群體和HH群體首先聚合在一起，然后再與LZH群體聚合在一起，說明YH群體和HH群體之間的遺傳距離更近，而2個(gè)養(yǎng)殖群體離LZH群體之間的遺傳距離更遠(yuǎn)。

PCA（Principal co-ordinates analysis）用來研究樣本群體組成的相似性或相異性（圖2），HH群體的個(gè)體幾乎集中分布在同一個(gè)區(qū)域，YH群體內(nèi)的個(gè)體也是集中分布在另一個(gè)區(qū)域，而LZH的個(gè)體離2個(gè)集中分布的區(qū)域均較遠(yuǎn)，單獨(dú)分布在一個(gè)區(qū)域。說明這3個(gè)群體之間存在一定程度的分化，個(gè)體之間有較明顯的遺傳差異。

在連鎖不平衡中，一般通過r值平方來表征連鎖不平衡程度，18個(gè)位點(diǎn)兩兩之間r值平方在0.02～0.34（圖3），說明位點(diǎn)之間存在一定程度的連鎖不平衡。

利用在線工具STRUCTURE HARVESTER 進(jìn)行群體結(jié)構(gòu)分析，參數(shù)設(shè)置如下：混合模型（admixture model）；Burn-in值為10 000，MC值為100 000；K值設(shè)置為3～10，每個(gè)K值重復(fù)20次。軟件對(duì)每個(gè)K值模擬的結(jié)果，都會(huì)對(duì)應(yīng)產(chǎn)生最大似然值（likelihood），最大似然值是取自然對(duì)數(shù)后輸出的數(shù)值（ln likelihood）。ln likelihood越大，說明K值越接近于真實(shí)情況。一般隨著K值升高，ln likelihood值也會(huì)不斷升高，但會(huì)慢慢進(jìn)入平臺(tái)期，選擇最優(yōu)K值的目標(biāo)是要找到拐點(diǎn)。該研究最佳K值為3（圖4），根據(jù)最佳K值估計(jì)群體數(shù)為3（圖5），說明試驗(yàn)所檢測的樣品最佳可劃分為3個(gè)群體。

2.4利用DNA 指紋圖譜鑒別2個(gè)團(tuán)頭魴群體 根據(jù)2個(gè)養(yǎng)殖群體在 18 個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)上的擴(kuò)增結(jié)果，按照表1中的編號(hào)順序，利用EXCEL 作圖軟件構(gòu)建這2個(gè)群體的 DNA 指紋模式圖（圖 6）。

從指紋圖譜庫中可以篩選出 6個(gè)特異的微衛(wèi)星 DNA 標(biāo)記（ZQTTF124、149、050、106、209和023）用以鑒別這 2 個(gè)群體，每個(gè)標(biāo)記至少在其中一個(gè)群體中可以擴(kuò)增出獨(dú)有的條帶，從而將這2個(gè)群體區(qū)分開。而將這6個(gè)標(biāo)記配合使用，則可以將群體中99%的個(gè)體區(qū)分開來，這 6 個(gè)特異微衛(wèi)星標(biāo)記產(chǎn)生的多態(tài)位點(diǎn)可作為團(tuán)頭魴育種過程中種質(zhì)鑒定的依據(jù)。

3討論

3.1群體遺傳多樣性分析該研究觀測等位基因數(shù)和有效等位基因數(shù)差別較大，則等位基因在2個(gè)群體中分布不均勻。團(tuán)頭魴養(yǎng)殖群體檢測到的平均等位基因數(shù)目高于團(tuán)頭魴二倍體和三倍體群體［8］、鱖魚［11］、魴鲌雜交及回交F2群體［12］、三角魴×翹嘴鲌、團(tuán)頭魴×翹嘴鲌2種雜交后代［13］、團(tuán)頭魴耐低氧新品系雌核發(fā)育群體［14］和海蜇群體［15］；觀測等位基因數(shù)和有效等位基因數(shù)低于大口黑鱸［16］和刺參群體［17］，高于花鱸群體［18］。等位基因情況反映出團(tuán)頭魴2個(gè)養(yǎng)殖群體與其他水產(chǎn)養(yǎng)殖品種相比處于較高水平，一方面說明2個(gè)養(yǎng)殖群體保持了較高的遺傳多樣性，另一方面說明選擇得到的基因組微衛(wèi)星位點(diǎn)具有較高的遺傳多樣性，能夠反映出團(tuán)頭魴群體的遺傳背景。

該研究團(tuán)頭魴養(yǎng)殖群體檢測到的觀測雜合度和期望雜合度均低于團(tuán)頭魴群體［9］和鱖魚群體［11］，高于三角魴×翹嘴鲌、團(tuán)頭魴×翹嘴鲌2種雜交后代［13］、海蜇群體［15］和花鱸群體［18］。觀測雜合度高于刺參群體［17］，低于團(tuán)頭魴耐低氧新品系雌核發(fā)育群體［14］；期望雜合度低于刺參群體［17］，高于大口黑鱸群體［16］和團(tuán)頭魴耐低氧新品系雌核發(fā)育群體［14］。觀測雜合度和期望雜合度與魴鲌雜交及回交F2群體［12］相比處于中等水平。綜合來看，該研究團(tuán)頭魴養(yǎng)殖群體的觀測雜合度和期望雜合度與其他水產(chǎn)養(yǎng)殖品種相比處于中等水平。

通過固定指數(shù)可以衡量種群中基因型的實(shí)際頻率是否偏離Hardy-Weinberg平衡［19］，刺參［17］和團(tuán)頭魴耐低氧新品系［14］中大量位點(diǎn)表現(xiàn)為雜合子過剩。HH群體在6個(gè)位點(diǎn)上顯著偏離哈代溫伯格平衡，YH群體在8個(gè)位點(diǎn)上顯著偏離哈代溫伯格平衡，說明人工選擇育種過程給養(yǎng)殖群體造成了一定的選擇壓力。其中，4個(gè)位點(diǎn)在2個(gè)群體中都顯著偏離哈代溫伯格平衡，可見這4個(gè)位點(diǎn)在不同的選育策略中都承受了較大的選擇壓力，可在今后的選育過程中予以特別關(guān)注，以期進(jìn)一步了解與位點(diǎn)相關(guān)的性狀以及選育過程對(duì)其帶來的影響。

該研究中微衛(wèi)星位點(diǎn)檢測到的多態(tài)信息含量指數(shù)（PIC）在0.190～0.843，平均值為0.624，高于鱖魚群體［11］、三角魴×翹嘴鲌、團(tuán)頭魴×翹嘴鲌2種雜交后代［12］、團(tuán)頭魴耐低氧新品系［14］和花鱸群體［18］，低于團(tuán)頭魴群體［9］和刺參群體［17］，與魴鲌雜交及回交群體［12］接近。2個(gè)團(tuán)頭魴養(yǎng)殖群體的多態(tài)性較高，與等位基因衡量的結(jié)果一致。18個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)中有16個(gè)位點(diǎn)的PIC值均大于0.5，其中大于0.7的位點(diǎn)有5個(gè)，說明試驗(yàn)中采用的微衛(wèi)星位點(diǎn)是高度多態(tài)的［20］，能夠?yàn)槿后w遺傳信息監(jiān)測提供豐富、高質(zhì)量的數(shù)據(jù)。

3.2群體遺傳結(jié)構(gòu)分析遺傳分化指數(shù)（F）是反映群體間遺傳差異的重要參數(shù)［21］，各位點(diǎn)檢測到的遺傳分化指數(shù)（F）值0.010～0.174，平均為0.070；在檢測的18個(gè)位點(diǎn)中，9個(gè)位點(diǎn)屬于輕度分化位點(diǎn)（0＜F≤0.05），7個(gè)位點(diǎn)屬于中度分化位點(diǎn)（0.05＜F≤0.15），2個(gè)位點(diǎn)屬于高度分化位點(diǎn)（0.15＜F≤0.25）。群體間的F為0.070，說明2個(gè)群體屬于中度分化群體［22］，群體間遺傳變異不顯著。HH和YH 2個(gè)群體間的基因流（N）為1.59，說明2個(gè)養(yǎng)殖群體之間有一定程度基因交流。

基因差異分化系數(shù)（Gst）可以不必考慮地方群體形成歷史、遷移方式、群體中等位基因數(shù)和基因型頻率，只需將整個(gè)群體中雜合體頻率分解為地方群體間變異和地方群體內(nèi)變異［23］。各位點(diǎn)檢測到的Gst范圍在0.007～0.172，群體間有一定的遺傳分化。

地方群體內(nèi)近交系數(shù)（F）對(duì)地方群體內(nèi)的繁育系統(tǒng)具有指示意義，在ZQTTF079和ZQTTF257 2個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)檢測到的近交系數(shù)F>0，其他16個(gè)位點(diǎn)近交系數(shù)F<0，2個(gè)群體近交現(xiàn)象很少，2個(gè)群體在18個(gè)位點(diǎn)的F值的范圍在-0.184～0.166，接近于0，說明群體比較接近于隨機(jī)交配群體。各位點(diǎn)檢測到的近交系數(shù)說明2個(gè)養(yǎng)殖群體在選育種過程中參與繁殖的親本較多，群體保持較好的遺傳多樣性。

基因流（N）均大于1，就能有效抑制由遺傳漂變而引起的遺傳分化［24］。群體間基因流為1.59，群體間存在一定程度基因流，18個(gè)位點(diǎn)檢測到的基因流（N）大于1，其中8個(gè)位點(diǎn)基因流大于5。推測原因可能是伊河魴群體選育時(shí)間較短，河南地區(qū)養(yǎng)殖的團(tuán)頭魴苗種較多來源于湖北地區(qū)，養(yǎng)殖群體逃逸及放流的個(gè)體給伊河流域的團(tuán)頭魴種群帶來了一定程度的基因交流。

群體最佳K值即為最佳群體分層情況［25-26］，張智等［27］對(duì)西昌華吸鰍進(jìn)行種群結(jié)構(gòu)分析，計(jì)算得出K=2是比較理想的種群亞型類群數(shù)目，遺傳分化分析結(jié)果相一致。高玉坤等［28］對(duì)馬鈴薯品種（系）的群體遺傳結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析， 65 個(gè)品種（系）劃分為3個(gè)群體。該研究最佳K值為3，樣品可劃分為3個(gè)群體，與實(shí)際團(tuán)頭魴采樣群體情況一致，與群體間聚類結(jié)果也一致。

3.3團(tuán)頭魴指紋圖譜數(shù)據(jù)庫的應(yīng)用熒光標(biāo)記SSR可以區(qū)分親緣關(guān)系遠(yuǎn)的品種，也能將親緣關(guān)系很近的個(gè)體區(qū)分開［29］。筆者利用 18 個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記，繪制了 2 個(gè)團(tuán)頭魴養(yǎng)殖群體的微衛(wèi)星 DNA 指紋圖譜，篩選到 6 個(gè)能特異性鑒別這2個(gè)養(yǎng)殖群體的微衛(wèi)星標(biāo)記，將這6個(gè)標(biāo)記配合使用，可以有效區(qū)分群體內(nèi)的個(gè)體。該研究采集的樣品沒有遺傳背景數(shù)據(jù)，篩選出的標(biāo)記可以對(duì)這些個(gè)體進(jìn)行準(zhǔn)確區(qū)分，利用這些特異性譜帶可以鑒定未知樣本，是群體種質(zhì)純度鑒定的有效手段，可以用來指導(dǎo)親本遺傳背景不清晰或者沒有家系構(gòu)建能力的良種繁育場進(jìn)行繁殖策略的升級(jí)。

4結(jié)論

HH和YH 2個(gè)人工養(yǎng)殖群體中的個(gè)體都有較高的遺傳多樣性，表明所采取的人工選擇育種策略都能夠保持群體的多樣性。YH群體保持較大的親本選育群體是檢測到低水平近交的主要原因。由于長江禁漁，僅采集到很少量的野生個(gè)體，野生個(gè)體與養(yǎng)殖群體存在較大的遺傳差異，可以作為后期育種過程中遺傳多樣性的有效補(bǔ)充。利用熒光標(biāo)記SSR構(gòu)建DNA指紋圖譜，可以精確區(qū)分同一群體內(nèi)的不同個(gè)體，在團(tuán)頭魴土著品種進(jìn)行搶救性選育過程中，可以建立有效的繁育體系，并對(duì)子代進(jìn)行精準(zhǔn)鑒定。

參考文獻(xiàn)

［1］ 王衛(wèi)民，高澤霞，劉紅，等.團(tuán)頭魴“華海1號(hào)”［J］.中國水產(chǎn)，2018（5）：65-70.

［2］ 張芹，孔令軍，屈長義，等.伊河團(tuán)頭魴2 種同工酶組織特異性分析［J］.中國漁業(yè)質(zhì)量與標(biāo)準(zhǔn)，2020，10（5）：37-43.

［3］? NAPORA-RUTKOWSKI ，RAKUS K，NOWAK Z，et al.Genetic diversity of common carp （Cyprinus carpio L.） strains breed in Poland based on microsatellite，AFLP，and mtDNA genotype data［J］.Aquaculture，2017，473：433-442.

［4］ DAS MAHAPATRA K，SAHOOL，SAHA J N，et al.Establishment of base population for selective breeding of catla （Catla catla） depending on phenotypic and microsatellite marker information［J］.Journal of genetics，2018，97（5）：1327-1337.

［5］ LIU Y，CHEN Y Y，GONG Q，et al.Paternity assignment in the polyploid Acipenser dabryanus based on a novel microsatellite marker system［J］.PLoS One，2017，12（9）：1-15.

［6］ XU X J，WANG G Z，ZENG C S，et al.Parentage determination of the mud crab Scylla paramamosain using microsatellite markers［J］.Aquaculture research，2018，49（1）：217-221.

［7］ WANG P P，ZHAO C，CHEN S Q，et al.Parentage identification of Odontobutis potamophlia based on microsatellite DNA markers［J］.Journal of genetics，2018，97（2）：563-568.

［8］ 李寶玉，鄭國棟，崔文濤，等.團(tuán)頭魴三倍體的微衛(wèi)星遺傳特征及生長性能分析［J］.水產(chǎn)科學(xué)，2022，41（2）：173-182.

［9］ XIONG X M，ROBINSON N A，ZHOU J J，et al.Genetic parameter estimates for intermuscular bone in blunt snout bream （Megalobrama amblycephala） based on a microsatellite-based pedigree ［J］.Aquaculture，2019，502：371-377.

［10］ 張芹，王延暉，王冰柯，等.團(tuán)頭魴基因組微衛(wèi)星特征及SSR位點(diǎn)開發(fā)［J］.江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué)，2022，50（3）：79-85.

［11］ 周夢(mèng)晨，徐東坡，方弟安，等.6個(gè)不同群體鱖基于SSR的遺傳多樣性初步研究［J］.中國農(nóng)學(xué)通報(bào)，2020，36（26）：147-152.

［12］ 崔文濤，鄭國棟，蘇曉磊，等.魴鲌雜交及回交F2群體的微衛(wèi)星遺傳結(jié)構(gòu)及其生長性能分析［J］.中國水產(chǎn)科學(xué)，2020，27（6）：613-623.

［13］ 蘇曉磊，鄭國棟，蔣霞云，等.三角魴×翹嘴鲌、團(tuán)頭魴×翹嘴鲌兩種雜交后代微衛(wèi)星遺傳結(jié)構(gòu)分析［J］.水生生物學(xué)報(bào)，2019，43（2）：264-271.

［14］ 徐湛寧，李福貴，鄭國棟，等.團(tuán)頭魴耐低氧新品系雌核發(fā)育群體遺傳結(jié)構(gòu)的微衛(wèi)星分析［J］.水產(chǎn)學(xué)報(bào)，2017，41（3）：330-338.

［15］ 狄明玉，周遵春，李云峰，等.海蜇４個(gè)自然群體遺傳多樣性的微衛(wèi)星標(biāo)記分析［J］.水產(chǎn)科學(xué)，2018，37（6）：762-768.

［16］ 蘇勝彥，張林兵，李海洋，等.基于微衛(wèi)星標(biāo)記的大口黑鱸（Micropterus salmoides）原種和養(yǎng)殖群體遺傳多樣性和結(jié)構(gòu)分析［J］.浙江大學(xué)學(xué)報(bào)（農(nóng)業(yè)與生命科學(xué)版），2020，46（6）：687-698.

［17］ 廖梅杰，王錦錦，李彬，等.基于SSR 標(biāo)記的刺參不同地理群體的遺傳結(jié)構(gòu)分析及指紋圖譜構(gòu)建［J］.漁業(yè)科學(xué)進(jìn)展，2021，42（1）：165-176.

［18］ 黃皓，范嗣剛，王鵬飛，等.基于微衛(wèi)星標(biāo)記對(duì)6 個(gè)花鱸群體的遺傳多樣性分析［J］.南方水產(chǎn)科學(xué)，2022，18（1）：99-106.

［19］ BOTSTEIN D，WHITE R L，SKOLNICK M，et al.Construction of a genetic linkage map in man using restriction fragment length polymorphisms ［J］.American journal of human genetics，1980，32（3）：314-331.

［20］ PURVIS I W，F(xiàn)RANKLIN I R.Major genes and QTL influencing wool production and quality：A review ［J］.Genetics selection evolution，2005，37 （S1）：S97-S107.

［21］ BALLOUX F，LUGON-MOULIN N.The estimation of population differentiation with microsatellite markers［J］.Molecular ecology，2002，11（2）：155-165.

［22］ NEI M.Genetic distance between populations ［J］.The American naturalist，1972，106（949）：283-292.

［23］ NEI M.Analysis of gene diversity in subdivided populations ［J］.Proceedings of the national academy of sciences of the United States of American，1973，70（12）：3321-3323.

［24］ WRIGH T S.Evolution in Mendelian populations［J］.Genetics，1931，16（2）：97-159.

［25］ PRITCHARD J K，STEPHENS M，DONNELLY P.Inference of population structure using multilocus genotype data［J］.Genetics，2000，155（2）：945-959.

［26］ 劉清文，宋躍，李甲明，等.利用核心簡單重復(fù)序列（SSR）標(biāo)記分析西洋梨品種資源遺傳多樣性［J］.農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào)，2015，23（5）：579-587.

［27］ 張智，俞丹，劉飛，等.西昌華吸鰍的微衛(wèi)星引物篩選及赤水河四個(gè)地理種群的遺傳多樣性分析［J］.水生生物學(xué)報(bào)，2019，43（6）：1224-1230.

［28］ 高玉坤，崔江慧，項(xiàng)曉冬，等.65個(gè)馬鈴薯品種（系）指紋圖譜構(gòu)建和遺傳多樣性分析［J］.農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào)，2020，28（8）：1363-1378.

［29］ 陶乃奇，張斌，劉信凱，等.利用熒光標(biāo)記SSR鑒別21個(gè)茶花新品種［J］.植物學(xué)報(bào)，2019，54（1）：37-45.