基于SNP 分子標(biāo)記的云上黑山羊3 個(gè)核心群遺傳多樣性分析

朱 蘭，王 鵬，歐陽依娜，江炎庭，蘭 蓉*

（1.云南省畜牧獸醫(yī)科學(xué)院，云南昆明 650224；2.云南省種羊繁育推廣中心，云南尋甸 650000）

云上黑山羊是在低緯高原氣候條件下，以努比山羊?yàn)楦副?、云嶺黑山羊?yàn)槟副荆捎矛F(xiàn)代動(dòng)物遺傳育種技術(shù)，歷經(jīng)22 年5 個(gè)世代選育出的黑山羊新品種，具有體質(zhì)結(jié)實(shí)、生長速度快、較高繁殖性能、肉質(zhì)鮮美等特性，是深受我國南方地區(qū)人民喜愛的山羊品種。研究云上黑山羊的不同核心育種群的遺傳多樣性，對(duì)于正確評(píng)價(jià)和掌握云上黑山羊核心育種群的遺傳結(jié)構(gòu)和變化規(guī)律，使育種群保持科學(xué)的動(dòng)態(tài)交流和調(diào)整、有效降低遺傳相似性、優(yōu)化品種遺傳結(jié)構(gòu)具有重要意義。

群體的遺傳多樣性分析對(duì)種質(zhì)資源的遺傳評(píng)價(jià)與利用、新品種（系）的培育具有重要意義，通過深層次挖掘并分析群體間親緣關(guān)系遠(yuǎn)近程度，可以更為科學(xué)地指導(dǎo)生產(chǎn)。隨著分子技術(shù)的發(fā)展，SNP（Single Nucleotide Polymorphisms）檢測分析被越來越多的使用于山羊遺傳多樣性、群體結(jié)構(gòu)分析、重要性狀關(guān)聯(lián)分析中，其中大多基于全基因組重測序和基因芯片技術(shù)開展，應(yīng)用MassARRAY SNP 質(zhì)譜陣列基因分析技術(shù)開展山羊群體遺傳多樣性的研究較少，在云上黑山羊研究中尚未有報(bào)道。MassARRAY SNP 質(zhì)譜陣列基因分析技術(shù)通過PCR 擴(kuò)增延伸跨越SNP 位點(diǎn)的DNA 序列，再使用飛行質(zhì)譜（Time of Flight，TOF）進(jìn)行分析，根據(jù)堿基的分子量差別對(duì)SNP 進(jìn)行分型，實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)靈活，分型結(jié)果準(zhǔn)確率可達(dá)98%，尤其在分析大量SNP 位點(diǎn)時(shí)極具價(jià)格優(yōu)勢(shì)，有較高的性價(jià)比。

SNP 即單核苷酸多態(tài)性，主要指在基因組水平上的單個(gè)核苷酸的變異，是繼RFLP、RAPD、AFLP、SSR 等第1 代和第2 代分子標(biāo)記技術(shù)之后發(fā)展起來的第3 代分子標(biāo)記技術(shù)，具有較高的遺傳穩(wěn)定性、豐富的多態(tài)性、檢測快速等特點(diǎn)，被廣泛應(yīng)用于關(guān)聯(lián)分析、親緣鑒定等動(dòng)物分子遺傳研究中。MassARRY 核酸質(zhì)譜分型系統(tǒng)基于基質(zhì)輔助激光解吸電離分型時(shí)間質(zhì)譜技術(shù)（MALDI-TOF），是世界上領(lǐng)先的基因分型工具。該技術(shù)完美融合了PCR 技術(shù)的高靈敏性、芯片技術(shù)的高通量和質(zhì)譜技術(shù)的高精確度，適用于前期經(jīng)過重測序或關(guān)聯(lián)分析等工作獲得少量SNP 位點(diǎn)的驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)，分型結(jié)果準(zhǔn)確性可達(dá)98%，檢出率可達(dá)95%，具有極高的準(zhǔn)確率和最佳性價(jià)比。

本研究選取25 個(gè)SNP 位點(diǎn)，應(yīng)用MassARRAY 基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時(shí)間（Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization-Time of Flight，MALDI-TOF）質(zhì)譜基因分型法對(duì)云上黑山羊3 個(gè)核心群的遺傳多樣性進(jìn)行分析，為云上黑山羊品種的推廣利用進(jìn)行實(shí)時(shí)監(jiān)控提供了分子理論基礎(chǔ)。

1 材料與方法

1.1 材料

1.1.1 樣品采集 選用云上黑山羊核心育種群3 個(gè)不同育種群的668 只山羊作為實(shí)驗(yàn)材料，每只羊采用EDTA-K2抗凝真空采血管采集靜脈血液3～5 mL，-20℃保存，樣本品種名、樣品數(shù)量及采集地點(diǎn)如表1 所示。

表1 樣本信息表

1.1.2 主要實(shí)驗(yàn)試劑 基因組DNA 提取純化試劑盒（Blood DNA Kit）購自O(shè)mega Bio-Tek 公司，真空采血管購自三力醫(yī)學(xué)科技發(fā)展有限公司，RNA 酶購自北京天根生物公司產(chǎn)品，無水乙醇、異丙醇，均為國產(chǎn)分析純。

1.2 方法

1.2.1 DNA 提取和檢測 按照Omega DNA 試劑盒操作程序從血液樣品中提取DNA，獲得的DNA 溶液用1%瓊脂糖凝膠進(jìn)行電泳檢測，初步檢測DNA 提取效果，合格的產(chǎn)物再用NANO 核酸蛋白分析儀進(jìn)一步檢測吸光度和濃度。篩選260/280 值在1.7～2.0 之間、濃度大于50 ng/μL 的樣品，存儲(chǔ)于-20℃冰箱備用。

1.2.2 引物設(shè)計(jì) 根據(jù)歐洲生物信息學(xué)研究所（EMBLEB）發(fā)布的SNP 位點(diǎn)序列數(shù)據(jù)庫，使用Assay design 3.1引物設(shè)計(jì)軟件進(jìn)行PCR 反應(yīng)和單堿基延伸引物設(shè)計(jì)，交由蘇州泓迅生物科技有限公司進(jìn)行引物合成，25 個(gè)位點(diǎn)的引物信息見表2。

表2 25 個(gè)SNP 位點(diǎn)質(zhì)譜檢測引物信息表

1.1.3 SNP 分型 將符合質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)的DNA 溶液交由北京康普森農(nóng)業(yè)科技有限公司，采用MassARRAY 時(shí)間飛行質(zhì)譜列陣技術(shù)完成SNP 位點(diǎn)的基因型檢測和分析。

PCR 擴(kuò)增：在點(diǎn)樣孔中加入1 μL 基因組DNA，4 μL PCR 反應(yīng)混合液。反應(yīng)條件為：94℃2 min；94℃20 s，56℃30s，72℃60s，45 個(gè)循環(huán)；72℃3min。

蝦堿性磷酸酶（SAP）反應(yīng)：在點(diǎn)樣孔中加入2 μL SAP 反應(yīng)混合液。SAP 反應(yīng)混合液的組成為1.53 μL ddHO，0.17 μL SAP buffer（10×），0.3 μL SAP 酶。反應(yīng)參數(shù)設(shè)定：37℃40 min，85℃5 min。反應(yīng)完成，溫度降至室溫后4℃保存。

單堿基延伸反應(yīng)：在點(diǎn)樣孔中加入2 μL 單堿基延伸反應(yīng)混合液。反應(yīng)體系總體積9 μL，其組成為：0.755 μL ddHO，0.804 μL Extend primer mix，0.2 μL iPLEX buffer plus，0.2 μL iPLEX terminator，0.041 μL iPLEX 酶。反應(yīng)參數(shù)設(shè)定：①94℃預(yù)變性30 s；②94℃變性5 s 后，以52℃退火5 s 加上80℃延伸5 s 為一組循環(huán)5 次；③步驟②重復(fù)40 個(gè)循環(huán)；④72℃延伸3 min。⑤全部完成后4℃保存。樹脂脫鹽純化：將9 μL 反應(yīng)產(chǎn)物用水稀釋為27 μL，讓樹脂與反應(yīng)物充分接觸脫鹽，再經(jīng)過低速旋轉(zhuǎn)和離心獲得純化后的反應(yīng)產(chǎn)物。

質(zhì)譜分析：純化后的延伸產(chǎn)物移至SpectroCHIP（Sequence）芯片上，使用MALDI-TOF 質(zhì)譜分析，每個(gè)分型實(shí)驗(yàn)至少重復(fù)2 次，檢測結(jié)果使用TYPER 4.0（Sequenom）軟件分型并輸出結(jié)果。

1.1.4 統(tǒng)計(jì)分析 利用GenAlex 6.5計(jì)算觀測等位基因數(shù)（Na）、有效等位基因數(shù)（Ne）、觀測雜合度（Ho）、期望雜合度（He）、Shannon 指數(shù)（I）、近交系數(shù)（）、遺傳變異系數(shù)（）、基因流（Nm）、Nei 氏遺傳距離及群體一致度等遺傳多樣性相關(guān)參數(shù)；利用CERVUS 3.0 軟件計(jì)算多態(tài)信息含量（PIC）；利用MEGA 4構(gòu)建UPGMA 系統(tǒng)聚類圖；利用Structure V2.3.3分析群體結(jié)構(gòu)；利用Plink v1.07進(jìn)行MDS 分析，R 軟件（V2.13.1）繪制主成分圖。

2 結(jié)果與分析

2.1 SNP 位點(diǎn)分析 運(yùn)用MassARRAY 核酸質(zhì)譜分型系統(tǒng)進(jìn)行分析，本實(shí)驗(yàn)共獲得668 個(gè)樣本在25 個(gè)SNP 位點(diǎn)上的16 700 個(gè)基因型數(shù)據(jù)，檢出率在64.67%～100%之間，平均檢出率93.04%。分型數(shù)據(jù)用于后續(xù)分析。

2.2 群體遺傳多樣性分析

2.2.1 SNP 位點(diǎn)遺傳多樣性分析 由表3 所知，彌勒和尋甸2 個(gè)群體所有位點(diǎn)上的Na 值均為2，只有團(tuán)結(jié)鄉(xiāng)群體在S13、S27、S28、S30 4 個(gè)位點(diǎn)上Na 值為1，所有位點(diǎn)平均Na 值在1.667～2.000 之間，其中，S13、S27、S28、S30 4 個(gè)位點(diǎn)上的Na 值為1.667，其余位點(diǎn)均為2.000；25 個(gè)位點(diǎn)在3 個(gè)山羊群體的Ne 值最高和最低都在團(tuán)結(jié)鄉(xiāng)群體中，其中團(tuán)結(jié)鄉(xiāng)群體的S6 最高，S13 最低，所有位點(diǎn)平均Ne 值范圍在1.036～1.919 之間，最高的是S5 位點(diǎn)，最低的是S30 位點(diǎn)。

表3 3 個(gè)山羊群體在25 個(gè)SNP 位點(diǎn)上的基因數(shù)

25 個(gè)SNP 位點(diǎn)的雜合度和多態(tài)性分析如表4 所示，25 個(gè)位點(diǎn)平均Ho 為0.035～0.535 之間，最高為S6 位點(diǎn)，最低為S30 位點(diǎn)；平均He 為0.033～0.478，最高為S5位點(diǎn)，最低為S30 位點(diǎn)；平均I 為0.074～0.671，最高為S5 位點(diǎn)，最低為S30 位點(diǎn)；平均PIC 值在0.047～0.375之間，最高為S11 位點(diǎn)，最低為S30 位點(diǎn)。

表4 3 個(gè)山羊群體在25 個(gè)SNP 位點(diǎn)上的遺傳雜合度及多態(tài)性

2.2.2 群體間遺傳多樣性分析 運(yùn)用GeNaLEX6 軟件計(jì)算群體3 個(gè)核心群的遺傳多樣性數(shù)據(jù)如表5 所示，3 個(gè)群體的PIC 值在0.210～0.227 之間，均小于0.5；Shannon 指數(shù)在0.372～0.432 之間，均小于1；Ho 在0.210～0.240 之間；He 在0.260～0.276 之間；值在0.099～0.188 之間。

表5 3 個(gè)山羊群體多態(tài)性分析

2.3 群體間親緣關(guān)系分析

2.3.1 PCA 主成分分析 將668 個(gè)樣本的25 個(gè)SNP 位點(diǎn)進(jìn)行PCA 主成分分析，以主成分1 和2 作為坐標(biāo)，應(yīng)用R 軟件（V2.13.1）繪制群體結(jié)構(gòu)散點(diǎn)圖，以紅、綠、藍(lán) 3 種顏色分別標(biāo)注HM、HX、HY 3 個(gè)群體的不同個(gè)體。從分析結(jié)果（圖1）可以看出，云上黑山羊3 個(gè)群體的親緣關(guān)系緊密，大量重疊，沒有明顯形成獨(dú)立亞群。

圖1 云上黑山羊群體結(jié)構(gòu)分析圖

2.3.2 系統(tǒng)進(jìn)化樹分析 應(yīng)用MEGA4 軟件分析668 個(gè)樣本的基因型數(shù)據(jù)結(jié)果，采用鄰接法構(gòu)建出分支NJ 進(jìn)化樹，如圖2 所示，3 個(gè)群體的個(gè)體交叉混雜在一起，沒有明顯聚集成簇。

圖2 668 個(gè)樣本的NJ 聚類圖

2.3.3 Structrue 分析 通過Structure 2.3.4 軟件對(duì)668 個(gè)山羊個(gè)體進(jìn)行群體遺傳結(jié)構(gòu)分析，根據(jù)下列公式分析：

K 值對(duì)應(yīng)的Δ K 的曲線圖如圖3 所示，當(dāng)K 值為4 時(shí)，Δ K 達(dá)到最大。Structrure 軟件群體分析結(jié)果如圖4 所示。

圖3 Δ K 計(jì)算結(jié)果

圖4 在K=4 假設(shè)下云上黑山羊3 個(gè)群體的遺傳結(jié)構(gòu)圖

2.3.4 群體間的遺傳分化 由表6 可知，尋甸群體與彌勒群體之間的變異系數(shù)最小，尋甸群體與團(tuán)結(jié)鄉(xiāng)群體之間的變異系數(shù)最大，但均小于0.05；彌勒群體與尋甸群體之間的Nm 最大，尋甸群體與團(tuán)結(jié)鄉(xiāng)群體之間的Nm最小，數(shù)值都遠(yuǎn)大于1。

表6 3 個(gè)山羊群體的Fst 和Hm

由表7 可知，3 個(gè)群體之間的遺傳一致度均超過97%，其中彌勒群體與尋甸群體的一致度最高，遺傳距離最小；尋甸群體與團(tuán)結(jié)鄉(xiāng)群體之間的一致度最低，遺傳距離最大。

表7 3 個(gè)山羊群體的Nei’遺傳距離和群體一致度

2.3.5 群聚類分析 應(yīng)用MEGA 7 軟件構(gòu)建3 個(gè)群體的UPMGAE 系統(tǒng)聚類圖如圖5 所示，結(jié)果表明，彌勒群體與尋甸群體聚為一支，再與團(tuán)結(jié)鄉(xiāng)群體聚為一支。

圖5 3 個(gè)山羊群體UPMAGE 聚類圖

3 討 論

本研究首次通過MassARRAY 時(shí)間飛行質(zhì)譜技術(shù)研究云上黑山羊遺傳多樣性，SNP 位點(diǎn)平均檢出率高達(dá)93.04%，取得了較好的檢測效果。通過位點(diǎn)的多態(tài)性分析，計(jì)算群體中的基因頻率、Na、Ne、He、Ho、PIC、、Nm 等信息，研究群體的遺傳組成和遺傳規(guī)律，獲得云上黑山羊核心群的遺傳多樣性分析結(jié)果與實(shí)際生產(chǎn)情況相符，說明MassARRAY 時(shí)間飛行質(zhì)譜技術(shù)非常適合山羊遺傳多樣性和群體結(jié)構(gòu)分析。

3.1 SNP 位點(diǎn)遺傳多樣性分析 本研究中，25 個(gè)SNP位點(diǎn)中有21 個(gè)SNP 位點(diǎn)在3 個(gè)群體中檢測到2 個(gè)等位基因，有4 個(gè)SNP 位點(diǎn)在團(tuán)結(jié)鄉(xiāng)群體中只檢測到1 個(gè)等位基因，所有有效等位基因數(shù)都小于實(shí)際觀測基因值，提示這些等位基因在群體中的分布不平衡。根據(jù)Bostein 等人關(guān)于PIC 值的評(píng)價(jià)標(biāo)準(zhǔn)，本研究有10個(gè)位點(diǎn)PIC 值在0.25～0.5 之間，屬于中度多態(tài)位點(diǎn)；其余15 個(gè)位點(diǎn)的PIC 值小于0.25，屬于低度多態(tài)位點(diǎn)，表明本研究選取的25 個(gè)SNP 位點(diǎn)有一定遺傳多態(tài)性。SNP 通常表現(xiàn)為純合子和雜合子2 種狀態(tài)，而微衛(wèi)星可以表現(xiàn)大于二態(tài)性的多態(tài)性，所以在以往的研究中，云南山羊群體的微衛(wèi)星PIC 值均大于0.5，具有更高的遺傳多態(tài)性。但SNP 在基因組上的密度比微衛(wèi)星更高，遺傳穩(wěn)定性更強(qiáng)，某些突變可能直接影響蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)或表達(dá)水平，結(jié)果可供進(jìn)一步研究分析。

3.2 群體分析 從3 個(gè)群體的平均等位基因數(shù)的計(jì)算結(jié)果看，彌勒群體和尋甸群體相同，而與團(tuán)結(jié)鄉(xiāng)群體有差異。3 個(gè)群體的平均觀測等位基因數(shù)均小于等位基因數(shù)，差異最大的是尋甸群體，表明3 個(gè)山羊群體均受到了人工選育，遺傳變異較小。雜合度是隨機(jī)抽取2 個(gè)樣本的等位基因不相同的可能性，He 主要是根據(jù)種群中的優(yōu)勢(shì)等位基因的分布頻率來推算，群體遺傳多樣性越豐富，群體一致度越低，He 的值越高；反之，群體遺傳多樣性豐富度越低，群體的遺傳一致度越高，則He 越低。群體處于遺傳平衡狀態(tài)時(shí)，群體的Ho 越接近He。本研究中的3 個(gè)群體中，尋甸群體的遺傳豐富度最低，彌勒群體的遺傳豐富度最高。3 個(gè)群體的Ho 都高于He，說明都存在雜合體缺失的情況，其中差異最大的是團(tuán)結(jié)鄉(xiāng)群體，受品種改良的影響較大；最小的是尋甸群體，群體結(jié)構(gòu)較為穩(wěn)定。Shannon 信息指數(shù)是反映群體遺傳多態(tài)度的指標(biāo)，用來估算群體多樣性的高低，I 值越大，表示群體的變異越大；I 值越小，表示群體的同質(zhì)性更高。本研究顯示3 個(gè)群體的I 值都小于1，說明云上黑山羊核心育種群有較高的遺傳一致度，具有較為穩(wěn)定的品種遺傳特征。根據(jù)PIC 的衡量標(biāo)準(zhǔn)，本研究3 個(gè)群體的遺傳多樣性較低（PIC＜0.25），說明這3 個(gè)云上黑山羊核心群體的整體遺傳多樣性較低，其中尋甸群體最低，其次為團(tuán)結(jié)鄉(xiāng)群體，彌勒群體最高。

本次研究的3 個(gè)核心群體遺傳結(jié)構(gòu)分析結(jié)果與蘭蓉研究的云南黑山羊新品種10 個(gè)群體相比，遺傳多樣性相對(duì)較低。這是在新品種培育過程中為提高品種一致度而造成的必然結(jié)果。

3.3 群體間的遺傳分化代表不同群體之間的遺傳分化水平，根據(jù)Wright 的研究，的數(shù)值是0～1，越小，2 個(gè)群體之間的分化程度越高，當(dāng)＜0.05 時(shí)，群間幾乎不存在分化；在0.05～0.15 間為中度分化；在0.15～0.25 間為高度分化。主要反映了群體內(nèi)的近交程度，當(dāng)出現(xiàn)正值時(shí)，表明群體內(nèi)存在近交；反之則存在遠(yuǎn)交。Nm 反應(yīng)了不同群體之間的基因交流情況，當(dāng)Nm＜1 時(shí)，基因交流較少，群體更趨于分化；Nm＞1時(shí)，基因交流較多，群體之間的基因流動(dòng)使得發(fā)生的遺傳漂變能夠抑制遺傳分化，群體趨于均質(zhì)化。本次研究的3 個(gè)群體值均小于0.05，群體間幾乎無分化，基因交流較多，其中彌勒群體與尋甸群體之間的分化最小，基因交流最大（16.636）；尋甸群體與團(tuán)結(jié)鄉(xiāng)群體之間的分化最大（0.30），基因交流最?。?.018）；近交系數(shù)均為正值，說明3 個(gè)群體都存在不同程度的近交。

3.4 聚類分析 遺傳距離是通過計(jì)算不同群體在同一基因座位上的等位基因頻率來估計(jì)群體間的遺傳差異大小的指標(biāo)，通常用遺傳系統(tǒng)樹加以表達(dá)。本次研究的3個(gè)群體之間遺傳距離都非常小，彌勒群體和尋甸群體之間的遺傳距離最小，遺傳一致度最高達(dá)99.1%；尋甸群體和團(tuán)結(jié)鄉(xiāng)群體遺傳距離最遠(yuǎn)（0.024），遺傳一致度97.7%，3 個(gè)群體的遺傳一致度非常高，品種遺傳特征穩(wěn)定。聚類分析將彌勒群體與尋甸群體作為一個(gè)亞分支，與團(tuán)結(jié)鄉(xiāng)群體分開，表明相對(duì)團(tuán)結(jié)鄉(xiāng)群體，彌勒群體與尋甸群體在遺傳上更為接近。

3.5 進(jìn)化分析 PCA 多因素分析、Structure 群體結(jié)構(gòu)分析、聚類圖是3 個(gè)分析群體進(jìn)化關(guān)系的方法，經(jīng)常被應(yīng)用在群體遺傳關(guān)系多樣性研究中。PCA 分析顯示，彌勒、尋甸、團(tuán)結(jié)鄉(xiāng)3 個(gè)核心群相互重疊聚集在一起，揭示3個(gè)群體的個(gè)體在遺傳分化上較為接近，HM 和HX 群體的個(gè)體之間在育種上有極其相近的遺傳背景。通過進(jìn)化樹分析群體中個(gè)體間的遺傳分類關(guān)系，發(fā)現(xiàn)3 個(gè)群體的668 只山羊個(gè)體并沒有明顯的分類，交叉混雜在一起，不同群來源的個(gè)體并未聚集成簇。用Structure 軟件進(jìn)一步分析群體結(jié)構(gòu)，參照Evanno 等的實(shí)驗(yàn)步驟，考察個(gè)體在群體中的雜交和混血情況。根據(jù)K 值最大似然值計(jì)算結(jié)果，大致分為4 個(gè)遺傳來源。從遺傳構(gòu)成來看，3 個(gè)山羊群體之間基因交流頻繁，遺傳背景相近，說明核心育種場的基因交流頻繁，群體相對(duì)均衡，這與PCA 分析、進(jìn)化樹分析結(jié)果高度一致。

綜上所述，云上黑山羊核心群體整體遺傳多樣性較低，遺傳一致度較高，群體遺傳構(gòu)成較為均衡，遺傳分化度較小，遺傳距離很近，近交系數(shù)非常高，說明云上黑山羊核心育種群經(jīng)過多年培育選育，品種的均一性強(qiáng)，群體差異多來自于品種內(nèi)部，在今后的生產(chǎn)中，需要注意保持品種的遺傳多樣性，以減少近交帶來的危害。另一方面，在3 個(gè)群體中，彌勒群體和尋甸群體有更為一致的遺傳特征，而與團(tuán)結(jié)鄉(xiāng)群體有較多分化，同時(shí)團(tuán)結(jié)鄉(xiāng)群體的遺傳多樣性最低，雜合體缺失程度最高，在今后的生產(chǎn)中需要防止該群體品種生產(chǎn)性能退化。

4 結(jié) 論

本研究首次使用MassARRAY SNP 質(zhì)譜陣列基因分析技術(shù)對(duì)云上黑山羊3 個(gè)核心群的遺傳結(jié)構(gòu)進(jìn)行了系統(tǒng)分析，發(fā)現(xiàn)云上黑山羊核心群在基因組水平上具有良好的品種一致度和較好的群體穩(wěn)定性，今后仍需利用分子標(biāo)記對(duì)群體遺傳結(jié)構(gòu)進(jìn)行定期監(jiān)控，保持云上黑山羊不同核心群的品種遺傳均衡，以防近交衰退和品種一致度降低的現(xiàn)象出現(xiàn)，減少近交導(dǎo)致的有害基因積累效應(yīng)。本研究為云上黑山羊種質(zhì)資源評(píng)價(jià)利用和差異化品系培育提供了分子理論基礎(chǔ)，在品種應(yīng)用推廣中具有指導(dǎo)意義。