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      1 株雞源奇異變形桿菌的分離鑒定及藥敏試驗

      2022-09-20 09:00:24熊菊萍肖瀅宇韓青松高小龍李增魁仝麗娜
      畜牧與飼料科學 2022年5期
      關鍵詞:登錄號瓊脂雛雞

      熊菊萍,肖瀅宇,張 誠,韓青松,高小龍,李增魁,文 英,仝麗娜

      (1.青海大學農(nóng)牧學院,青海 西寧 810016;2.溫州科技職業(yè)學院,浙江 溫州 325006)

      奇異變形桿菌(Proteus mirabilis)是腸桿菌科變形桿菌屬的一種兼性厭氧革蘭陰性桿菌。 該菌廣泛存在于土壤、污水、污泥和動物及人體體表、黏膜、消化道、糞便中,是一種常見的條件致病菌[1]。在一定條件下, 如人體免疫力下降時, 可引起腹瀉、尿道炎、腹膜炎、腦膜炎、菌血癥和敗血癥等疾病,其中以泌尿系統(tǒng)感染最常見[2-4]。 同時,奇異變形桿菌也是引發(fā)細菌性食物中毒的第四大病原菌[5]。 奇異變形桿菌不僅可以感染人,還可以感染牛、羊、豬、犬、兔、狐貍、竹鼠、食蟹猴、大熊貓等多種動物[6-10]。 近年來,因奇異變形桿菌感染引發(fā)的幼畜和家禽發(fā)病或死亡的情況在我國多省份均有報道,且該菌臨床分離率呈上升趨勢,威脅著人類健康和畜禽養(yǎng)殖業(yè)健康發(fā)展[10-13]。 并且,為了促進動物生長和減少細菌病發(fā)生, 部分養(yǎng)殖場對抗生素類藥物的不合理、不規(guī)范使用,甚至濫用,加劇了耐藥菌株的出現(xiàn)。 李欣楠等[14]從遼寧肉雞養(yǎng)殖場分離的67 株奇異桿菌, 對11 種抗生素耐藥性普遍較高,其中對黏桿菌素E、氟苯尼考和磺胺異噁唑等9 種藥物耐藥率可達80%。 徐睿等[15]從西昌地區(qū)雞場分離到2 株奇異變形桿菌, 該2 株菌對14 種抗生素耐藥率分別為78.6%和71.4%。 龐洪澤等[16]從秦皇島地區(qū)的雞場中分離到1 株多重耐藥奇異變形桿菌。 多重耐藥性的不斷出現(xiàn)增加了該病防治的難度。因此,調(diào)查了解奇異變形桿菌耐藥性狀況, 對指導青海省養(yǎng)雞場合理用藥具有重要意義。

      2019 年11 月, 青海省大通縣某肉雞場的部分雞發(fā)病,初期病雞精神沉郁、羽毛蓬亂,并排出黃綠色和水樣稀糞,后期有雞只死亡。為確定病雞死亡原因,該研究從發(fā)病雞場采集病料,分離到一株疑似菌,經(jīng)革蘭染色鏡檢、生化鑒定、16S rDNA和tuf 特異性基因PCR 擴增與測序后, 鑒定為奇異變形桿菌, 并對分離菌進行了致病性試驗和藥敏試驗, 旨在為禽類奇異變形桿菌病的防治提供參考。

      1 材料與方法

      1.1 病料來源

      青海省大通縣某肉雞場的部分雞發(fā)病, 臨床癥狀為羽毛蓬亂、精神沉郁并排出黃綠色稀糞。從上述病雞無菌采集肝臟、 脾臟和泄殖腔拭子等作為病料。

      1.2 主要試劑

      營養(yǎng)瓊脂培養(yǎng)基購自北京奧博星生物技術有限責任公司;MH 瓊脂培養(yǎng)基、營養(yǎng)肉湯培養(yǎng)基購自杭州微生物試劑有限公司;SS 瓊脂、 細菌微量生化鑒定管、 藥敏紙片均購自青島高科技工業(yè)園海博生物技術有限公司; 麥氏比濁管購自溫州市康泰生物科技有限公司; 革蘭染色劑購自北京索萊寶科技有限公司;DL 2 000 DNA Marker 購自天根生化科技有限公司;2×EasyTaq PCR SuperMix購自北京全式金生物技術有限公司; 膠回收試劑盒購自生工生物工程(上海)股份有限公司。

      1.3 試驗動物

      10 只2 周齡SPF 白來航雛雞購自濟南賽斯家禽科技有限公司。

      1.4 分離培養(yǎng)與染色鏡檢

      將采集的病料劃線接種普通營養(yǎng)瓊脂和SS瓊脂,置于37 ℃恒溫培養(yǎng)箱18~36 h,并觀察菌落形態(tài),挑取可疑菌落在營養(yǎng)瓊脂和SS 瓊脂平板上分區(qū)劃線,進行純化。純化后的可疑菌落進行革蘭染色鏡檢。 接種純化后的疑似菌落至營養(yǎng)肉湯,37 ℃振蕩培養(yǎng)18~24 h。

      1.5 生化鑒定

      將“1.4”項下營養(yǎng)肉湯中培養(yǎng)的細菌用無菌生理鹽水稀釋到0.5 麥氏濃度(約1×108CFU/mL)后, 按照生化鑒定管說明書接種于細菌微量生化鑒定管中,37 ℃培養(yǎng)24~48 h,參照《伯杰細菌鑒定手冊》(第八版)進行結(jié)果判定。

      1.6 細菌16S rDNA 和奇異變形桿菌tuf 基因擴增

      使用水煮法提取細菌基因組DNA。 在SS 瓊脂平板上挑取單個菌落接種于2 mL 營養(yǎng)肉湯培養(yǎng)基中,37 ℃、180 r/min 振蕩培養(yǎng)12 h,用微量移液器吸取400 μL 菌液于1.5 mL 離心管中,12 000 r/min 離心2 min,棄去上清液,用無菌水重懸,放入沸水中煮8 min 后,12 000 r/min 離心2 min,取上清液即為DNA 模板,于-20 ℃保存。

      設計16S rDNA 和奇異變形桿菌tuf 基因特異性引物,引物序列為16S rDNA-F:CAGGCCTAACACATGCAAGTC,16S rDNA -R:GGGCGGWGTGTACAAGGC, 產(chǎn) 物 大 小 為 1 400 bp;tuf -F:AAATTGTTGAATTAGCAGAAGCA,tuf -R:GCGATTGGGTGGATCAGTTC,產(chǎn)物大小為540 bp。以制備的細菌基因組DNA 為模板進行PCR 擴增,16S rDNA 和tuf 基因擴增反應體系均為:2×Taq Mix 25 μL、上下游引物各1 μL、模板2 μL,無酶滅菌水21 μL;陰性對照反應體系除模板改為無酶滅菌水外,其余組分同上。 16S rDNA 擴增反應條件為:94 ℃預變性5 min;94 ℃變性30 s,55 ℃退火30 s,72 ℃延伸1 min,35 個循環(huán);72 ℃延伸10 min。tuf 基因擴增反應條件為:57 ℃退火30 s,72 ℃延伸30 s, 其余反應條件同16S rDNA 擴增反應條件。 PCR 產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳檢測,切下目的片段,進行膠回收,將產(chǎn)物送生工生物工程(上海)股份有限公司測序,測序結(jié)果與GenBank 上公布的序列進行BLAST 比對。 用DNAStar 軟件進行序列同源性分析,用MEGA 軟件構建系統(tǒng)發(fā)育樹。

      1.7 雛雞致病性試驗

      將10 只2 周齡SPF 雛雞隨機分為試驗組和對照組。 試驗組腹腔注射1 mL 的菌液(1 個麥氏比濁度,約3×108CFU/mL),對照組腹腔注射無菌肉湯1 mL。接種后每隔12 h 觀察并記錄雛雞精神狀況和死亡情況,并對死亡雛雞進行解剖,無菌采集心臟、肝臟和脾臟,進行細菌分離鑒定。

      1.8 藥敏試驗

      采用K-B 紙片擴散法進行藥敏試驗。 挑取平板純化的菌落, 接種至5 mL 營養(yǎng)肉湯培養(yǎng)基中,37 ℃、180 r/min 振蕩培養(yǎng)12 h。 用生理鹽水將菌液稀釋至0.5 麥氏濃度(約1×108CFU/mL)。 用無菌棉簽蘸取稀釋好的菌液均勻涂抹在MH 瓊脂平板上,并貼上藥敏紙片,放入37 ℃恒溫培養(yǎng)箱培養(yǎng)24 h 后測量抑菌圈直徑并記錄。 根據(jù)美國臨床和實驗室標準協(xié)會 (Clinical and Laboratory Standards Institute,CLSI) 推薦的紙片擴散法標準進行結(jié)果判定。

      2 結(jié)果與分析

      2.1 細菌的形態(tài)特征和鏡檢結(jié)果

      分離菌在SS 瓊脂培養(yǎng)基上為半透明、中央黑色或整個菌落都呈黑色的圓形扁平菌落 (見圖1A)。 革蘭染色鏡檢可發(fā)現(xiàn)長短不一、兩端鈍圓的革蘭陰性桿菌,單個或成簇分布(見圖1B)。

      圖1 分離菌株菌落形態(tài)和革蘭染色鏡檢結(jié)果

      2.2 生化試驗

      分離菌生化鑒定結(jié)果如表1 所示, 苯丙氨酸酶、明膠、鳥氨酸脫羧酶、尿素酶、木糖、脂酶和水楊苷試驗呈陽性;西蒙枸櫞酸鹽、色氨酸肉湯、麥芽糖、 甘露醇和七葉苷水解試驗反應呈陰性,與《伯杰細菌鑒定手冊》中奇異變形桿菌的生化特征相對應。

      表1 生化鑒定結(jié)果

      2.3 細菌16S rDNA 和tuf 基因擴增

      以水煮法制備的DNA 為模板, 用16S rDNA引物通過PCR 成功擴增出1 400 bp 左右的目的條帶,瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果見圖2。 切膠回收該目的條帶,回收產(chǎn)物送生工生物工程(上海)股份有限公司測序。 測序結(jié)果與GenBank 上公布的序列進行BLAST 比對,顯示與奇異變形桿菌同源性高達99.9%。 同時,用奇異變形桿菌特異性tuf 基因特異性引物通過PCR 成功擴增出540 bp 左右的目的條帶,瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果見圖3。 將分離株命名為DT1。

      圖2 16S rDNA PCR 擴增結(jié)果

      圖3 tuf 基因PCR 擴增結(jié)果

      2.4 16S rDNA 基因系統(tǒng)進化分析

      由圖4 可知,青海大通分離株DT1 與23 個參考株16S rDNA 序列進行比對, 同源性為96.7%~99.9%。 DT1 與孟加拉國水體分離株(GenBank 登錄號:MH010137)、 尼日利亞雞分離株(GenBank登錄號:LC385636)、印度魚分離株(GenBank 登錄號:KU378106)、 中國河南狐貍分離株(GenBank登錄號:EU3643833) 和中國山東人分離株(Gen-Bank 登錄號:GQ259884)同源性最高,達99.9%;與中國河南雞分離株 (GenBank 登錄號:KJ156620)同源性最低,為96.7%。

      圖4 16S rDNA 序列同源性比對

      對DT1 株與GenBank 中收錄的23 株奇異變形桿菌16S rDNA 序列繪制系統(tǒng)進化樹。由圖5 可知,24 株奇異變形桿菌在進化上分為兩大支,奇異變形桿菌來源廣泛,宿主多,DT1 株與中國河南狐貍分離株(GenBank 登錄號:EU3643833)和中國山東人分離株(GenBank 登錄號:GQ259884)屬于同一分支,遺傳關系最為密切。

      圖5 16S rDNA 系統(tǒng)進化樹

      2.5 雛雞致病性試驗

      試驗組接種菌液8 h 后雛雞開始發(fā)病, 主要表現(xiàn)為精神沉郁、排黃色稀糞;12 h 后,雛雞相繼死亡,至48 h 全部死亡。 并且從死亡雛雞的心臟、肝臟和脾臟中再次分離到該病原菌, 而對照組雛雞全部存活,表明該株奇異變形桿菌具有致病性。

      2.6 藥敏試驗

      根據(jù)CLSI 藥敏試驗判定標準, 如表2 所示,分離菌對哌拉西林、頭孢吡肟、頭孢噻肟、頭孢西丁、氨曲南、阿米卡星、卡那霉素、氧氟沙星、美羅培南等藥物高度敏感,對環(huán)丙沙星、奧格門汀中度敏感,對氨芐西林、阿莫西林、頭孢唑啉、萬古霉素、慶大霉素、鏈霉素、阿奇霉素、四環(huán)素、多西環(huán)素、萘啶酸、氯霉素、克林霉素、呋喃妥因、利福平、多黏菌素B、氟苯尼考產(chǎn)生了耐藥性。

      表2 藥敏試驗結(jié)果

      3 討論

      近年來,奇異變形桿菌感染家禽的情況時有報道,并且種雞感染后可垂直傳播給后代,造成雛雞發(fā)病死亡,對養(yǎng)禽業(yè)有較大危害[16]。為查明青海省大通縣某雞場肉雞發(fā)病死亡原因,該研究無菌采集病死雞病料,進行細菌的分離培養(yǎng)鑒定。 目前,細菌分類鑒定方法主要有兩種: 一種是基于形態(tài)學和生化反應的鑒定法,另一種是核酸分類法[17-18]。基于形態(tài)學和生理生化的鑒定法需要對細菌進行純培養(yǎng),然后進行形態(tài)學觀察,再將純培養(yǎng)物接種生化反應管來加以鑒定,鑒定過程往往費時費力。16S rDNA 大小適中(1.5 kb),其內(nèi)部既含有同類菌之間高度保守的序列, 又含有不同種類菌高度變異的差異序列, 是目前核酸法鑒定細菌種屬的理想靶標,已廣泛應用于細菌分類鑒定上,且操作相對簡便快速[19]。該研究為快速、準確鑒定分離菌類別,在細菌純培養(yǎng)后,挑取平板上的可疑菌落進行了16S rDNA 擴增和測序, 通過與GenBank 中公布的序列比對后, 發(fā)現(xiàn)與奇異變形桿菌同源性最高,為99.9%。 隨后,又對分離的疑似菌同步進行了革蘭染色鏡檢和生化試驗, 進一步確認分離的疑似菌為奇異變形桿菌, 為疾病快速診斷奠定了基礎。

      為鑒定該分離菌是否具有致病性, 選擇2 周齡SPF 雛雞進行了攻毒試驗, 結(jié)果表明該奇異變形桿菌具有致病性,雛雞致死率可達100%,并且從病死雞臟器中分離到該菌, 表明發(fā)病雞場病原為該株奇異變形桿菌。細菌病由于血清型多、致病機制復雜、毒力因子眾多,往往缺乏有效的疫苗,抗生素仍是目前防治細菌病的最有效手段。然而,由于抗生素不規(guī)范、不合理使用,使包括奇異變形桿菌在內(nèi)越來越多的細菌產(chǎn)生了多重耐藥性,給細菌病防治帶來一定的困難[19]。 為評價該研究分離的該株奇異變形桿菌耐藥性,選取9 大類27 種藥物進行藥敏試驗,結(jié)果顯示分離菌對青霉素類、β-內(nèi)酰胺類、糖肽類、氨基糖苷類、大環(huán)內(nèi)酯類、四環(huán)素類的少部分藥物產(chǎn)生了耐藥性, 而對喹諾酮類中的絕大多部分藥物產(chǎn)生了耐藥性,對頭孢類、單酰胺菌素類中的一些藥物高度敏感, 表現(xiàn)為多重耐藥,與先前報道的結(jié)果基本一致[20]。 因此,發(fā)生細菌性疾病時,迅速分離致病菌,進行藥物敏感試驗,選擇敏感藥物對控制疫病至關重要。

      4 結(jié)論

      從發(fā)病雞場分離到一株奇異變形桿菌, 該菌對雞具有較強的致病性,且表現(xiàn)為多重耐藥。

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