王玉平,龔瑾,李沙沙,章正,楊倩之,單璐琛
(1.暨南大學 附屬第一醫(yī)院 藥學部,廣東 廣州 510630;2.暨南大學 附屬第一醫(yī)院 胃腸外科,廣東 廣州 510630;3.暨南大學 藥學院,廣東 廣州 510000)
非酒精性脂肪性肝?。╪onalcoholic fatty liver disease,NAFLD)是肝臟功能障礙的常見病因,目前已成為全球流行疾病,這種疾病可以發(fā)展為一種晚期形式,稱為非酒精性脂肪性肝炎(nonalcoholic steatohepatitis,NASH)[1]。在NAFLD譜系中,NASH發(fā)展為纖維化并進展為肝硬化的風險最高[2],影響約3%~5%的普通人群,NASH預計將成為肝硬化和終末期肝病的主要原因[3]。但目前NASH發(fā)病機制的分子基礎(chǔ)尚不清楚,也無有效的治療方法及藥物,因此,尋找治療NASH安全有效的方法和藥物至關(guān)重要。
川芎(CX)是植物川芎(Ligusticum Chuanxiong Hort.)的干燥根莖,一種非常常見的中藥,在中國被廣泛應用,始載于《神農(nóng)本草經(jīng)》,在《本草綱目》中記載其燥濕、止瀉痢、行氣開郁,主要用于治療風冷頭痛眩暈、脅痛腹疼、寒痹痙攣、經(jīng)閉、難產(chǎn)、產(chǎn)后瘀阻塊痛、癰疽瘡瘍等癥狀[4]。研究認為其主要成分阿魏酸、川芎嗪等,已被發(fā)現(xiàn)其具有抗炎、改善血脂、提高血液流動性、抑制血小板聚集和發(fā)揮抗氧化活性等作用[5]。雖然川芎被報道具有抗炎、改善血脂等作用,但其對NASH或NAFLD的作用鮮有報道。
探究中藥成分對于疾病的主要分子作用機制與信號通路,是目前探索中藥方劑藥理機制的綜合有效的方法。本研究以川芎為研究對象,通過網(wǎng)絡(luò)藥理學的方法,采用多成分、多靶點、多通路的思路挖掘川芎改善NASH的作用機制,為后續(xù)研究提供依據(jù)。另外,本研究通過擬建立NASH小鼠動物模型,給予模型鼠川芎提取物治療,觀察川芎對NASH的改善效果,為臨床藥物的開發(fā)和應用提供依據(jù)。
在中藥系統(tǒng)藥理學分析平臺(TCMSP,https://old.tcmsp-e.com/tcmsp.php)進行化合物成分和靶點的篩選,設(shè)置Herb name的檢索條件下以“川芎”為關(guān)鍵詞檢索其化學成分,口服生物利用度(OB)≥30%、類藥性(DL)≥0.18為篩選條件對川芎中的有效成分進行篩選。利用pubchem數(shù)據(jù)平臺(https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/),搜索SMILES結(jié)構(gòu)后錄入Swiss Target Prediction(http://www.swisstargetprediction.ch/),進行靶點預測獲得化合物作用靶點,通過Uniprot數(shù)據(jù)庫(http://www.uniprot.org/)得到上述靶點物種設(shè)定為人的基因名。
利用DisGenet數(shù)據(jù)庫(http://www.disgenet.org)以“NASH”,“Nonalcoholic steatohepatitis”,“Non-alcoholic steatohepatitis”為關(guān)鍵詞,搜索NASH的疾病靶點,將獲得的靶點導出備用。
將所獲得的川芎的潛在靶點與NASH疾病靶點導入Calculate and draw custom Venn diagrams平臺(http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/Venn/)繪制韋恩圖并獲得共有的靶點作為核心靶點,將核心靶點導入String數(shù)據(jù)庫(http://string-db.org/)獲得PPI蛋白互作相關(guān)信息,將上述信息導入Cytoscape 3.8.0軟件進行編輯及網(wǎng)絡(luò)分析,繪制PPI網(wǎng)絡(luò)圖及核心靶點相關(guān)性信息。
利用Cytoscape軟件對川芎、有效成分、核心靶點、NASH的關(guān)聯(lián)關(guān)系進行可視化,繪制關(guān)聯(lián)網(wǎng)絡(luò)。
將核心靶點錄入到Metascape分析系統(tǒng)中(https://metascape.org/gp/index.Html#/main/step1),將篩選條件設(shè)置為“H.sapiens”,分別GO富集分析和KEGG通路分析,并將獲得信息導入微生信網(wǎng)(http://www.bioinformatics.com.cn/)進行GO富集分析柱狀圖和KEGG通路分析氣泡圖的繪制。
在PPI網(wǎng)絡(luò)中選取度值排列前5的蛋白靶點與川芎有效成分度值排列前5的化合物進行分子對接驗證。利用PDB數(shù)據(jù)庫(https://www.rcsb.org/)下載PPI蛋白互作網(wǎng)絡(luò)核心蛋白的結(jié)構(gòu),并Pymol去除其配體和水分子;利用PubChem數(shù)據(jù)庫(http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/)下載川芎核心化合物的sdf文件,用OpenBabel軟件將其轉(zhuǎn)化為mol2格式,得到的配體(化合物)及受體(蛋白結(jié)構(gòu))運用autodock軟件進行分子對接,最后用Pymol軟件將對接結(jié)果絕對值最大的4種組合進行可視化。配體和受體結(jié)合的構(gòu)象越穩(wěn)定能量越低,產(chǎn)生作用可能性越大。當結(jié)合能絕對值大于4.25 kcal/moL時,表示分子與靶點具有一定的結(jié)合能力,當結(jié)合能絕對值大于5.0 kcal/moL時,表示結(jié)合能力較強。
C57雄性小鼠,SPF級,(20±2)g,購自浙江維通利華實驗動物有限公司,許可證號SCXK(浙)2019-0001。高脂飼料(D12108C)購自美國Research Diets有限公司,其中含40%脂肪和1.25%膽固醇。TC、TG生化分析試劑盒購自南京建成科技有限公司。ALT、AST檢測試劑盒和HE染色試劑盒購自北京索萊寶科技有限公司。高速低溫離心機購自Sigma公司。
1.8.1 川芎提取物制備
川芎飲片購自廣東和祥制藥有限公司,原產(chǎn)地為四川,為道地藥材,符合中國藥典2015年版一部的相關(guān)規(guī)定。飲片采用10倍量水煎煮提取2次,每次2 h,水煎濃縮;然后醇沉,第1次醇沉體積分數(shù)為60%,4℃冷藏24 h,濃縮;第2次醇沉體積分數(shù)為80%,4℃冷藏48 h,濃縮得到樣品,再進行大孔樹脂分離得到樣品。根據(jù)川芎提取率計算,稀釋成川芎組分質(zhì)量濃度為1 mg/mL;川芎提取物(chuanxiong total extracts,CTE)給藥組50 mg·kg-1·d-1灌胃。
1.8.2 動物造模及取材
試驗前小鼠經(jīng)過1周的適應性喂養(yǎng),期間小鼠飼喂普通日糧,自由采食飲水。1周后隨機將小鼠隨機分為以下3組:正常對照組(Ctrl)、NASH模型組(NASH)、川芎提取物給藥組(CTE),10只/組,5只/籠飼養(yǎng),每天更換水瓶,每2 d更換1次墊料。Ctrl組小鼠給予普通飼料,NASH組及CTE組小鼠給予高脂飼料,同時CTE組采用灌胃的方式進行給藥,每天給藥2次。Ctrl組與NASH 組小鼠給予對應體積的生理鹽水。實驗持續(xù)10周,每周稱量并記錄小鼠體質(zhì)量。實驗結(jié)束后,小鼠禁食12 h,第2天取材。麻醉小鼠后心臟取血,于4℃,3 500 r/min的條件下離心15 min,測定各組小鼠血清中谷丙轉(zhuǎn)氨酶(ALT)、谷草轉(zhuǎn)氨酶(AST)含量。同時適量稱取小鼠肝臟組織,用組織勻漿機制備肝臟組織勻漿,按照試劑盒說明書操作,檢測小鼠肝臟組織中的TG、TC含量。部分小鼠肝臟組織約0.5 cm3固定于10%的甲醛液中,之后組織脫水,行HE染色。本研究通過暨南大學實驗動物倫理委員會審批(20210603-01)。
采用SPSS 26.0統(tǒng)計學軟件進行實驗數(shù)據(jù)統(tǒng)計處理。計量資料采用mean±SD表示,3組間比較用One-Way ANOVA方差分析和Student's t檢驗進行兩兩比較,P<0.05為差異有統(tǒng)計學意義。
本研究通過對樣本數(shù)量以及后續(xù)數(shù)據(jù)的研究價值考慮,選擇OB≥30%且DL≥0.18作為篩選川芎化學成分的條件。通過TCMSP數(shù)據(jù)庫檢索得到川芎化學成分189個,其中符合篩選條件的化學成分7個(有效成分5個,川芎醌、川芎哚未預測到相關(guān)靶點),具體信息見表1。通過Swiss Target Prediction數(shù)據(jù)庫搜索上述化合物的關(guān)聯(lián)靶點共計307個,采用UNIPROT數(shù)據(jù)庫將靶點名標準化。
表1 川芎主要活性成分信息Table 1 The main active components information of Chuanxiong
通過DisGenet數(shù)據(jù)庫以“NASH”,“Nonalcoholic steatohepatitis”,“Non-alcoholic steatohepatitis”為關(guān)鍵詞,檢索非酒精性脂肪肝炎相關(guān)靶點434個。
繪制川芎改善NASH核心靶點韋恩圖,并獲得靶點44個(圖1)。將核心靶點輸入String數(shù)據(jù)庫中,以medium confidence(0.400)為篩選條件,最終獲得核心靶點39個,獲得川芎改善NASH蛋白互作(PPI)網(wǎng)絡(luò)圖(圖2)。將PPI數(shù)據(jù)導入Cytoscape軟件,并按照度值排序獲得核心靶點數(shù)據(jù)(表2)。
圖1 核心靶點韋恩圖Figure 1 Venn diagram of the core target
圖2 蛋白互作網(wǎng)絡(luò)Figure 2 Protein Interaction(PPI)Network
表2 川芎改善NASH核心靶點信息Table 2 The core target information of Chuanxiong
分別將“藥物-成分”、“成分-靶點”、“靶點-疾病”的關(guān)聯(lián)數(shù)據(jù)導入Cytoscape軟件,通過網(wǎng)絡(luò)將其連接起來,并剔除不相關(guān)的靶點,將川芎改善NASH“藥物-成分-靶點-疾病”網(wǎng)絡(luò)關(guān)系進行可視化(圖3)。
圖3 川芎改善NASH網(wǎng)絡(luò)Figure 3 The network of Chuanxiong improving NASH
川芎治療NASH的GO富集結(jié)果見圖4。富集的生物過程包括炎癥反應的調(diào)節(jié)、蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)運的調(diào)控、細胞對脂質(zhì)的反應、蛋白激酶活性的調(diào)節(jié)、激素水平的調(diào)節(jié)、對營養(yǎng)水平的反應、類固醇代謝過程、脂質(zhì)定位的調(diào)節(jié)等,涉及炎癥反應、蛋白質(zhì)與脂質(zhì)代謝等生物過程;細胞組成主要涉及細胞膜、囊泡、受體、轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)復合物、轉(zhuǎn)移酶等;分子功能主要包括了核受體激活、蛋白酶激活、脂肪酸綁定、脂質(zhì)轉(zhuǎn)運活性等。
圖4 川芎改善NASH GO富集分析柱狀圖Figure 4 GO enrichment analysis histogram
川芎治療NASH的KEGG通路分析結(jié)果見圖5,按基因在通路中的比例排序,具體通路信息見表3。川芎治療NASH與眾多通路有關(guān),可能通過調(diào)節(jié)PPAR 信號通路、AMPK 信號通路、cAMP信號通路、Wnt信號通路等發(fā)揮作用。
圖5 川芎改善NASH KEGG通路分析氣泡圖Figure 5 KEGG signaling pathway analysis bubble plot
表3 川芎改善NASH KEGG通路分析Table 3 KEGG signaling pathway analysis
在PPI網(wǎng)絡(luò)中選取度值排列前5的蛋白靶點EGFR、ESR1、PPARG、MAPK14、PPARA與川芎有效成分度值排列前 5 的化合物谷甾醇(sitosterol)、楊梅酮(Myricanone)、亞油酸乙酯(Mandenol)、川芎萘呋內(nèi)酯(wallichilide)、阿魏酸(FA)進行分子對接驗證,其 中 PPARG 和Myricanone、PPARA 和 Myricanone、PPARA 和Sitosterol、PPARA和wallichilide的分子對接結(jié)果結(jié)合能絕對值最高,分別對其進行可視化,具體結(jié)構(gòu)如圖6、表4所示。
表4 川芎改善NASH KEGG分子對接信息Table 4 KEGG Molecular Docking Information
圖6 川芎改善NASH分子對接圖Figure 6 Molecular docking map
2.7.1 一般情況及體質(zhì)量變化
實驗期間3組小鼠飲食及排便基本正常,正常組小鼠反應迅速,動作靈敏,皮毛整潔有光澤;NASH模型組小鼠活動較少,皮毛油膩;CTE給藥組一般情況有所緩解,CTE組體質(zhì)量較NASH組明顯下降,但與對照組無顯著差異(圖7)。
圖7 各組體質(zhì)量曲線圖Figure 7 Body mass graph of each group
2.7.2 血清酶學及肝臟脂質(zhì)水平比較
與正常對照組比較,NASH模型組肝臟組織TC、TG水平,血清ALT、AST均明顯升高,有顯著差異(P<0.05)。與CTE組比較,NASH模型組血清ALT、AST,肝臟組織TG水平均明顯下降(P<0.05),但肝臟組織TC水平差異無統(tǒng)計學意義(圖8)。
圖8 各組小鼠血清酶學及肝臟脂質(zhì)水平比較Figure 8 Comparison of serum enzymology and liver lipid levels of mice in each group
2.7.3 小鼠肝病理變化
由圖9可見正常對照組肝小葉結(jié)構(gòu)完整,肝細胞核形態(tài)、大小均一,未見明顯異常。NASH模型組肝細胞明顯腫脹,水樣變性,可見散在或灶性肝細胞氣球樣變,形成脂肪樣空泡,CTE給藥組小鼠肝小葉脂肪變程度較模型組明顯改善。
圖9 各組小鼠肝臟HE染色(×200)Figure 9 HE staining of mouse liver in each group(×200)
NASH是一種以炎性浸潤和脂肪變性為主要特征的慢性肝病,其與肥胖、血脂異常、胰島素抵抗等諸多代謝性致病因素密切相關(guān),又被稱為代謝性肝炎[6]。目前藥物對NAFLD 患者并存的NASH特別是肝纖維都無肯定的治療效果[7]。本研究根據(jù)文獻報道[8],制備川芎提取物,并建造動物模型,結(jié)果表明體質(zhì)量曲線及血液生化指標顯示造模成功,川芎提取物治療組較NASH模型組血清ALT、AST及肝臟組織TG均有明顯改善作用(P<0.05),并明顯減輕小鼠肝小葉脂肪變程度,顯示該模型效果明顯,成功率較高。
氧化應激所導致的脂質(zhì)氧化和氧化過程中的系列產(chǎn)物,也是引起NASH肝損傷的主要機制之一[9]。本研究GO富集分析結(jié)果發(fā)現(xiàn)川芎改善NASH炎癥反應與脂質(zhì)代謝、核受體和蛋白酶激活、脂肪酸綁定、脂質(zhì)轉(zhuǎn)運活性等相關(guān)。據(jù)報道,NASH的病理生理學很復雜,主要特征是脂肪變性以及肝細胞損傷和炎癥反應,常與2型糖尿病和胰島素抵抗相關(guān),也可能存在于許多其他內(nèi)分泌疾病中,例如多囊卵巢綜合征、甲狀腺功能低下,男性性腺功能低下、生長激素缺乏或糖皮質(zhì)激素過多[10];來自NASH患者的肝細胞檢查結(jié)果發(fā)現(xiàn)具有異常的脂質(zhì)成分,脂質(zhì)的積累會導致細胞器功能障礙,細胞損傷和死亡以及慢性炎癥,推斷NASH發(fā)病機理和潛在治療靶標的脂質(zhì)種類和代謝途徑,包括參與脂肪酸和甘油三酸酯合成的酶,生物活性鞘脂和多不飽和衍生的類花生酸,以及親脂性脂質(zhì)介體[11]。本研究的KEGG通路富集結(jié)果顯示,川芎治療NASH與眾多通路有關(guān),可能通過調(diào)節(jié)PPAR 信號通路、AMPK 信號通路、cAMP信號通路、Wnt信號通路等發(fā)揮作用。氧化物酶體增殖物激活受體(PPARs)是在脂質(zhì)代謝和炎癥中起調(diào)節(jié)作用的核受體,這使得PPARs被認為是一種潛在的治療NASH的作用靶點[10,12],一些靶點PPARs激動劑已經(jīng)被證實對NASH具有治療作用[13-15]。研究發(fā)現(xiàn)NASH相關(guān)的肝細胞凋亡被AMPK細胞能量狀態(tài)的主要傳感器所抑制,NASH小鼠AMPK活性降低,而肝臟特異性AMPK敲除(LAKO)小鼠研究表明,AMPK的缺失會加大飲食誘導的NASH病理,包括肝臟損傷、纖維化和細胞死亡(特別是凋亡)的增加[16];AMPK還被認為可以調(diào)控脂肪組織炎癥和NASH中的巨噬細胞極化,巨噬細胞中AMPK激活和脂肪酸氧化的增加可能為NASH治療提供新的途徑[17];肝臟特異性AMPK敲除能夠加重小鼠NASH模型中的肝損傷,AMPK磷酸化促凋亡caspase-6蛋白以抑制其活化,從而控制肝細胞凋亡。AMPK活性的抑制緩解了這種抑制作用,使caspase-6在人和小鼠NASH中被激活。AMPK激活或caspase-6抑制,即使在NASH發(fā)作后,也能改善肝損傷和纖維化,預示著AMPK可能是NASH治療的靶點[18]。Wnt信號通路的失調(diào)與NASH的發(fā)生密切相關(guān),針對Wnt信號通路的調(diào)節(jié)被作為對抗NASH的潛在手段[19-21]。
分子對接結(jié)果表明,川芎改善NASH的過程中,由川芎中多個有效成分和核心靶點共同作用發(fā)揮治療其中Myricanone、Sitosterol、wallichilide是起主要作用的成分,目前文獻報道的川芎提取方法,得到的川芎提取物其中主要的部分活性成分[8,22-23]。PPARA和PPARG可能是川芎作用最緊密的靶點,PPARA和PPARG共屬于PPAR信號通路,均是脂肪代謝和炎癥反應中發(fā)揮重要作用的靶點,此結(jié)果為川芎改善NASH后續(xù)研究提供了理論依據(jù)。雖然本研究發(fā)現(xiàn)的NASH有關(guān)的可能靶點及機制已有文獻先后報道,而更深的分子機制及完整通路需進一步驗證和證實。
綜上所述,本研究通過網(wǎng)絡(luò)藥理學的方法發(fā)現(xiàn)川芎可能主要通過谷甾醇、楊梅酮、亞油酸乙酯、川芎萘呋內(nèi)酯和阿魏酸5種化合物作用于EGFR、PPARG、PPARA、ESR1、MAPK14等39個核心靶點,調(diào)節(jié)PPAR、AMPK等信號通路發(fā)揮對NASH的治療作用,并通過動物模型進行驗證,為川芎改善NASH后續(xù)研究提供了理論依據(jù)及初步驗證。雖然網(wǎng)絡(luò)藥理學研究手段日趨成熟,數(shù)據(jù)庫信息逐漸完善,但仍需進一步的分子機制研究進行驗證,為川芎改善NASH提供現(xiàn)實參考。本研究表明,川芎可以改善高脂飲食所致的小鼠非酒精性脂肪性肝炎,具有一定臨床應用可能,值得進一步研究。
作者貢獻聲明
王玉平:文章構(gòu)思、統(tǒng)計分析數(shù)據(jù),撰寫論文;龔瑾:分析數(shù)據(jù),修改論文建議;李沙沙:部分作圖分析;章正:部分作圖分析;楊倩之:部分作圖分析;單璐琛:提出研究思路和框架,修改論文。
利益沖突聲明
本研究未受到企業(yè)、公司等第三方資助,不存在潛在利益沖突。