李慧芬,程文英,陶元平,楊 樂(lè),歐陽(yáng)柳,李小玲,汪珍光,曹晶珠
1. 海軍軍醫(yī)大學(xué)第三附屬醫(yī)院肝外三科,上海 200433 2. 中國(guó)人民解放軍92493部隊(duì)醫(yī)院內(nèi)三科,葫蘆島 125003 3. 海軍軍醫(yī)大學(xué)第一附屬醫(yī)院普外三科,上海 200433 4. 海軍軍醫(yī)大學(xué)第一附屬醫(yī)院內(nèi)分泌科,上海 200433
中國(guó)人群中胰腺癌發(fā)病率正逐年上升,2019年新發(fā)病例約占全世界總病例數(shù)的20%[1-2]。目前,手術(shù)切除和化療是胰腺癌的主要治療策略[3]。在過(guò)去的幾十年中,胰腺癌患者的總體生存時(shí)間未得到明顯改善,患者5年生存率仍低于5%[4-5]。因此,深入了解胰腺癌發(fā)生與進(jìn)展的詳細(xì)分子機(jī)制至關(guān)重要。
近年來(lái),越來(lái)越多的研究證明,長(zhǎng)鏈非編碼RNAs(lncRNAs)是細(xì)胞正常生理和病理過(guò)程中的重要調(diào)控因子[6]。多種lncRNAs已被證實(shí)在多種腫瘤組織中異常表達(dá),進(jìn)而促進(jìn)或抑制腫瘤細(xì)胞的增殖、侵襲和轉(zhuǎn)移能力[7-9]。本研究旨在檢測(cè)lncRNA DBH-AS1在胰腺癌中的表達(dá)情況,探討DBH-AS1在胰腺癌進(jìn)展中潛在的分子作用機(jī)制。
1.1 研究樣本 選擇2015年7月至2017年12月海軍軍醫(yī)大學(xué)第一附屬醫(yī)院普外三科收治的原發(fā)胰腺癌患者45例,收集患者經(jīng)手術(shù)切除的胰腺癌組織和對(duì)應(yīng)癌旁組織(距離腫瘤組織邊緣至少大于2 cm)。所有樣本離體后于液氮保存,以備后續(xù)實(shí)驗(yàn)。所有組織樣本均經(jīng)病理證實(shí)為胰腺癌。本研究經(jīng)海軍軍醫(yī)大學(xué)第一附屬醫(yī)院倫理委員會(huì)批準(zhǔn)(2017-148-06),所有患者均知情并簽署知情同意書(shū)。
1.2 主要材料及試劑 本研究所用細(xì)胞均購(gòu)自中科院上海細(xì)胞庫(kù)。LncRNA DBH-AS1干擾慢病毒和空白(陰性)對(duì)照均購(gòu)自上海吉瑪基因。CCK-8試劑盒購(gòu)自上海碧云天。Transwell小室購(gòu)自美國(guó)Corning公司。AKT1、p-mTOR、mTOR以及β-actin抗體均購(gòu)自英國(guó)Abcam公司。
1.3 細(xì)胞培養(yǎng)和病毒轉(zhuǎn)染 正常永生化人胰腺上皮細(xì)胞株(HPDE6C7)和4株人胰腺癌細(xì)胞株(CFPAC-1、Mia-capa2、L3.6pl和PANC1)均用添加10%胎牛血清和1%青霉素-鏈霉素的DMEM高糖培養(yǎng)基,在37℃、5%CO2的恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。依照病毒試劑轉(zhuǎn)染說(shuō)明,構(gòu)建敲低DBH-AS1的胰腺癌細(xì)胞株。
1.4 實(shí)時(shí)熒光定量PCR(qRT-PCR) TRIzol法提取組織和細(xì)胞的總RNA,用Nanodrop 2000測(cè)定RNA濃度并反轉(zhuǎn)錄為cDNA。采用ViiATM 7實(shí)時(shí)qRT-PCR系統(tǒng)(美國(guó)Applied Biosystems公司)進(jìn)行qRT-PCR,反應(yīng)體系為10 μL,包括2×SYBR Premix ExTaqTM試 劑5 μL、ROX校 正 染 料Ⅱ 0.2 μL、上游和下游引物各0.4 μL、cDNA模板 2 μL、雙蒸水2 μL。以GAPDH基因?yàn)閮?nèi)參基因,應(yīng)用2-ΔΔCT法計(jì)算DBH-AS1和AKT1基因相對(duì)表達(dá)量。引物序列見(jiàn)表1。
表1 qRT-PCR引物序列
1.5 細(xì)胞增殖 將細(xì)胞接種于96孔板,加入CCK-8溶液采用酶標(biāo)儀分別在0 h、24 h、48 h和72 h測(cè)定450 nm波長(zhǎng)的光密度值。
1.6 克隆形成 將各組處理細(xì)胞消化計(jì)數(shù)并分別接種在6孔板中,于37℃、5%CO2的恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng)10 d,出現(xiàn)肉眼可見(jiàn)的克隆時(shí),終止培養(yǎng),棄去上清,PBS清洗后用4%多聚甲醛固定,隨后結(jié)晶紫染色,采用Image J軟件進(jìn)行克隆計(jì)數(shù)。
1.7 侵襲和遷移 將細(xì)胞密度調(diào)整至1.5×104個(gè)/mL,取100 μL細(xì)胞懸液加入鋪有稀釋的基質(zhì)膠的transwell小室的上室,將加有10%FBS的DMEM培養(yǎng)基加入下室,孵育24 h,底部細(xì)胞用4%多聚甲醛固定,0.1%結(jié)晶紫染色后,顯微鏡下隨機(jī)選擇5個(gè)視野計(jì)數(shù)。細(xì)胞遷移實(shí)驗(yàn)在上室中不添加基質(zhì)膠,其余同前。
1.8 Western印跡 用RIPA緩沖液進(jìn)行細(xì)胞和組織裂解提取蛋白質(zhì),提取過(guò)程保持低溫,用碧云天BCA蛋白濃度測(cè)定試劑盒檢測(cè)蛋白濃度,用5×loading buffer和PBS調(diào)整蛋白濃度并加熱變性。用10% SDS-PAGE凝膠電泳分離,然后將分離的蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)移到PVDF膜上。室溫下用5%脫脂奶粉封閉2 h,洗膜,在4℃條件下一抗孵育過(guò)夜(AKT1、p-mTOR、mTOR以 及Actin),洗 膜 后室溫下二抗孵育2 h,洗滌,顯影。
1.9 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理 采用GraphPad Prism 6.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析及作圖。符合正態(tài)分布的計(jì)量資料均以±s表示,所有實(shí)驗(yàn)均至少完成3次以上生物學(xué)重復(fù)實(shí)驗(yàn)。2組組間比較采用獨(dú)立樣本t檢驗(yàn),多組間比較采用方差分析。計(jì)數(shù)資料以n(%)表示,組間比較采用χ2檢驗(yàn)。采用Kaplan-Meier生存曲線比較DBH-AS1表達(dá)量與胰腺癌患者預(yù)后的關(guān)系。采用Pearson相關(guān)分析檢測(cè)兩變量之間的相關(guān)性。檢驗(yàn)水準(zhǔn)(α)為0.05。
2.1 DBH-AS1在胰腺癌組織中的表達(dá)情況 在線數(shù)據(jù)庫(kù)GEPIA(Gene Expression Profiling Interactive Analysis,http://gepia.cancer-pku.cn/)結(jié)果顯示(圖1A),lncRNA DBH-AS1在胰腺癌腫瘤組織的表達(dá)明顯低于癌旁組織,差異倍數(shù)>2(P<0.05)。應(yīng)用qRT-PCR檢測(cè)lncRNA DBH-AS1在45例胰腺癌患者腫瘤組織和對(duì)應(yīng)癌旁組織中的表達(dá)情況,結(jié)果(圖1B)顯示:DBH-AS1在胰腺癌組織中的表達(dá)水平低于對(duì)應(yīng)的癌旁組織(0.0372±0.0032vs0.0792±0.0070),差異倍數(shù)>2(P<0.01)。結(jié)果(圖1C)顯示:與正常胰腺細(xì)胞系(HPDE6C7)相比,DBH-AS1在胰腺癌細(xì)胞系(Mia-capa2、CFPAC-1、L3.6pl和PANC1)中的表達(dá)水平也下調(diào),差異倍數(shù)>2(P<0.001)。
圖1 DBH-AS1在胰腺癌腫瘤組織和胰腺癌細(xì)胞系中表達(dá)下調(diào)A:GEPIA數(shù)據(jù)庫(kù)中胰腺癌組織和正常胰腺組織中DBH-AS1的表達(dá)水平;B:qRT-PCR分析胰腺癌腫瘤組織和胰腺癌旁組織中DBH-AS1的表達(dá)水平(n=451);C:qRT-PCR分析正常胰腺細(xì)胞系(HPDE6C7)和胰腺癌細(xì)胞(CFPAC-1、Mia-capa2、L3.6pl和PANC1)中DBH-AS1的表達(dá)水平。每組3個(gè)重復(fù)孔,*P<0.05,***P<0.001。
2.2 DBH-AS1在胰腺癌腫瘤組織中的表達(dá)水平與患者惡性臨床特征的相關(guān)性 根據(jù)lncRNA DBH-AS1在胰腺癌患者腫瘤組織中的中位表達(dá)量(0.0380),將45例患者分為DBH-AS1低表達(dá)組 (n=23)和DBH-AS1高表達(dá)組(n=22)。結(jié)果(表2)顯示,DBH-AS1在胰腺癌組織中的低表達(dá)與腫瘤分化(P=0.038)、TNM分期(P=0.029)和淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移(P=0.006)相關(guān)。
表2 lncRNA DBH-AS1表達(dá)水平與胰腺癌患者臨床特征的關(guān)系n(%)
2.3 DBH-AS1在胰腺癌患者腫瘤組織中表達(dá)水平與患者預(yù)后的相關(guān)性 以DBH-AS1在胰腺癌組織中表達(dá)水平的中位數(shù)為分界線,將176例胰腺癌患者分為DBH-AS1高表達(dá)組(n=88)和DBH-AS1低表達(dá)組(n=88)。結(jié)果(圖2)顯示,與胰腺癌腫瘤組織DBH-AS1高表達(dá)組患者相比,DBH-AS1低表達(dá)組患者的無(wú)瘤生存率(P=0.013)和總體生存率(P=0.009)較低,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
圖2 數(shù)據(jù)庫(kù)中DBH-AS1在胰腺癌腫瘤組織中表達(dá)下調(diào)與患者預(yù)后較差相關(guān)
2.4 敲低DBH-AS1對(duì)胰腺癌細(xì)胞增殖能力和克隆形成能力的影響 構(gòu)建敲低DBH-AS1慢病毒,轉(zhuǎn)染至DBH-AS1表達(dá)相對(duì)較高的2株胰腺癌細(xì)胞系(Mia-capa2和PANC1)中。結(jié)果(圖3A)顯示,轉(zhuǎn)染敲低DBH-AS1慢病毒后,Mia-capa2細(xì)胞中DBH-AS1的表達(dá)水平比對(duì)照組下降約6倍 (P<0.001),PANC1細(xì) 胞 中DBH-AS1的 表 達(dá)水平較對(duì)照組下降約8倍(P<0.001)。CCK-8檢測(cè)結(jié)果(圖3B、3C)顯示,與對(duì)照組相比,轉(zhuǎn)染敲低DBH-AS1慢病毒后,Mia-capa2和PANC1細(xì)胞的增殖能力分別在48 h和72 h后提高(P< 0.05)。細(xì)胞克隆形成實(shí)驗(yàn)結(jié)果(圖3D~3E)顯示,干擾DBH-AS1表達(dá)后Mia-capa2和PANC1細(xì)胞的克隆形成能力較對(duì)照組顯著增強(qiáng)(Mia-capa2:207±11.55vs86.0±2.309,P<0.001;PANC1:228.7±14.53vs84.0±2.887,P<0.001)。
圖3 敲低DBH-AS1表達(dá)可增強(qiáng)胰腺癌細(xì)胞增殖和克隆形成能力A:qRT-PCR檢測(cè)慢病毒轉(zhuǎn)染前后DBH-AS1的表達(dá)水平;B,C:CCK-8法檢測(cè)轉(zhuǎn)染si-NC或si-DBH-AS1后PANC1 (B)和Mia-capa2 (C)細(xì)胞增殖情況;D:集落形成法檢測(cè)轉(zhuǎn)染si-NC或si-DBH-AS1對(duì)Mia-capa2和PANC1細(xì)胞克隆形成能力的影響。每組3個(gè)重復(fù)孔,*P<0.05,***P<0.001。
2.5 遷移和侵襲 Transwell實(shí)驗(yàn)結(jié)果(圖4A)顯 示,干 擾DBH-AS1表 達(dá) 后,Mia-capa2和PANC1細(xì)胞的遷移能力較對(duì)照組增強(qiáng)(Miacapa2:222.7±2.603vs131.3±3.528,P<0.001;PANC1:113.7±0.882vs88.3±0.333,P<0.001)。侵襲實(shí)驗(yàn)結(jié)果(圖4B)顯示,Mia-capa2和PANC1細(xì)胞的侵襲能力較對(duì)照組顯著增強(qiáng)(Mia-capa2:241.7±2.333vs111.3±1.202,P<0.01;PANC1: 73.3±1.333vs60.0±1.732,P<0.001)。
圖4 敲低DBH-AS1表達(dá)可增強(qiáng)胰腺癌細(xì)胞遷移(A)和侵襲能力(B)Original magnification:×100; 每組3個(gè)重復(fù)孔,**P<0.01,***P<0.001。
2.6 DBH-AS1調(diào) 控AKT1/mTOR信 號(hào) 通 路 在 線 數(shù) 據(jù) 庫(kù)GEPIA結(jié)果(圖5A)顯 示,lncRNA DBH-AS1在胰腺癌腫瘤組織中的表達(dá)水平與AKT1 mRNA的表達(dá)水平負(fù)相關(guān)(r=-0.18,P= 0.016)。qRT-PCR結(jié)果(圖5B)顯 示,干 擾DBH-AS1表 達(dá) 后,Mia-capa2細(xì) 胞 和PANC1細(xì)胞的AKT1 mRNA表達(dá)水平較對(duì)照組顯著提高(Mia-capa2:4.057±0.180vs1.000±0.505,P<0.001;PANC1:5.425±0.896vs1.000±0.706,P<0.001)。Western印跡結(jié)果(圖5C、5D)表明,干擾DBH-AS1表達(dá)后Mia-capa2和PANC1細(xì)胞的AKT1蛋白(Mia-capa2:2.541±0.182vs1.000±0.121,P<0.001;PANC1:2.392±0.252vs1.000±0.243,P<0.001)和p-mTOR/mTOR蛋白(Mia-capa2:2.023±0.102vs1.000±0.289;PANC1:2.171±0.153vs1.000±0.228,P<0.001)表達(dá)水平較對(duì)照組顯著提高。
圖5 LncRNA DBH-AS1通過(guò)調(diào)控AKT1表達(dá)抑制mTOR信號(hào)通路A:利用在線數(shù)據(jù)庫(kù)GEPIA數(shù)據(jù)分析lncRNA DBH-AS1在胰腺癌腫瘤組織中的表達(dá)水平與AKT1 mRNA的表達(dá)水平的相關(guān)性;B:qRT-PCR檢測(cè)轉(zhuǎn)染si-NC或si-DBH-AS1后Mia-capa2和PANC1細(xì)胞中AKT1 mRNA的表達(dá)水平;C,D:Western 印跡檢測(cè)轉(zhuǎn)染si-NC或si-DBH-AS1后,Mia-capa2和PANC1細(xì)胞AKT1/mTOR通路分子的蛋白表達(dá)水平。***P<0.001。
目前,已有大量lncRNAs被證實(shí)參與胰腺癌的發(fā)生與進(jìn)展。例如,胰腺導(dǎo)管腺癌中l(wèi)ncRNA PANDAR表達(dá)異常上調(diào),并且與胰腺癌腫瘤血管侵犯密切相關(guān)[10]。另有研究[11]發(fā)現(xiàn),lncRNA LOXL1-AS1在胰腺癌腫瘤組織和胰腺癌細(xì)胞系中表達(dá)上調(diào),且LOXL1-AS1通過(guò)吸附miR-28-5p上調(diào)SEMA7A表達(dá),促進(jìn)胰腺癌進(jìn)展。
此外,最新研究[12]表明,lncRNA XLOC通過(guò)與c-Myc結(jié)合并增強(qiáng)其蛋白穩(wěn)定性,從而促進(jìn)胰腺癌的發(fā)生和谷氨酸代謝。LncRNA DBH-AS1從染色體9q34轉(zhuǎn)錄而來(lái),既往研究發(fā)現(xiàn)DBH-AS1在多種惡性腫瘤組織中表達(dá)上調(diào)并發(fā)揮重要的癌基因作用,例如肝癌[13]、非小細(xì)胞肺癌[14]、骨肉瘤[15]及彌 漫 大B細(xì)胞淋巴瘤[16]等。但是,lncRNA DBH-AS1在胰腺癌發(fā)病中的作用機(jī)制仍然尚未完全清楚。
本研究結(jié)合在線數(shù)據(jù)庫(kù)GEPIA以及qRT-PCR結(jié)果發(fā)現(xiàn),lncRNA DBH-AS1在胰腺癌腫瘤組織中表達(dá)下調(diào),同時(shí)qRT-PCR結(jié)果也表明DBH-AS1在胰腺癌細(xì)胞系中均表達(dá)下調(diào)。利用隊(duì)列樣本發(fā)現(xiàn),lncRNA DBH-AS1在胰腺癌中的低表達(dá)與腫瘤分化程度、TNM分期和淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移相關(guān),而生存分析結(jié)果提示胰腺癌腫瘤組織中DBH-AS1低表達(dá)的患者預(yù)后較差。通過(guò)慢病毒轉(zhuǎn)染,進(jìn)一步研究敲低DBH-AS1對(duì)胰腺癌細(xì)胞功能的影響,結(jié)果顯示,敲低DBH-AS1可顯著促進(jìn)胰腺癌細(xì)胞的增殖、克隆形成和遷移侵襲能力。上述結(jié)果提示,lncRNA DBH-AS1在胰腺癌中具有抑癌作用。
為了進(jìn)一步探究相關(guān)機(jī)制,首先利用在線GEPIA數(shù)據(jù)庫(kù)分析,發(fā)現(xiàn)DBH-AS1與AKT1在胰腺癌腫瘤組織中的表達(dá)負(fù)相關(guān),提示在胰腺癌中DBH-AS1可能下調(diào)AKT1表達(dá);進(jìn)一步通過(guò)qRTPCR和Western印跡實(shí)驗(yàn),驗(yàn)證了敲低DBH-AS1的表達(dá)可上調(diào)AKT1 mRNA和蛋白水平,同時(shí),敲低DBH-AS1表達(dá)可上調(diào)mTOR蛋白表達(dá)。以上結(jié)果提示,lncRNA DBH-AS1在胰腺癌中可抑制AKT1/mTOR信號(hào)通路。
本研究存在一定的局限性:(1)DBH-AS1的表達(dá)與胰腺癌患者的預(yù)后以及病理特征之間的關(guān)系需要進(jìn)一步擴(kuò)大樣本量研究,以進(jìn)一步證實(shí)DBH-AS1在胰腺癌中作為預(yù)后標(biāo)志物的潛力;(2)本研究?jī)H探究了敲低DBH-AS1對(duì)胰腺癌細(xì)胞惡性表型的影響,而缺乏對(duì)過(guò)表達(dá)DBH-AS1后胰腺癌細(xì)胞惡性表型變化的研究;(3)需要進(jìn)一步通過(guò)補(bǔ)充體內(nèi)試驗(yàn),驗(yàn)證DBH-AS1對(duì)胰腺癌細(xì)胞增殖和轉(zhuǎn)移能力的影響;(4)DBH-AS1調(diào)控AKT1表達(dá)的作用機(jī)制有待進(jìn)一步研究,其是否通過(guò)作為內(nèi)源競(jìng)爭(zhēng)RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)來(lái)調(diào)控AKT1有待進(jìn)一步驗(yàn)證。
綜上所述,本研究發(fā)現(xiàn)DBH-AS1在胰腺癌組織中表達(dá)下調(diào)與患者不良預(yù)后相關(guān),敲低DBH-AS1可顯著促進(jìn)胰腺癌細(xì)胞增殖、克隆形成和遷移侵襲能力。機(jī)制研究結(jié)果提示,DBH-AS1/AKT1/mTOR軸可能是胰腺癌進(jìn)展的關(guān)鍵信號(hào)通路。
利益沖突:所有作者聲明不存在利益沖突。