楊瑞先 劉萍 王祖華 阮寶碩 汪智達(dá)
(洛陽理工學(xué)院環(huán)境工程與化學(xué)學(xué)院,河南 洛陽 471023)
牡丹根腐病又稱爛根病,是牡丹種植中的重要土傳病害。調(diào)查發(fā)現(xiàn)該病在牡丹多個(gè)種植區(qū)發(fā)生嚴(yán)重,如在菏澤和洛陽主要觀賞區(qū),根腐病的發(fā)病率一般在20%左右,嚴(yán)重地塊可達(dá)到40%以上[1]。該病主要為害牡丹根部,植株感病后,支根和須根變黑腐爛,并逐漸向主根擴(kuò)展,造成地上部分長(zhǎng)勢(shì)衰弱,葉片失綠、發(fā)黃,發(fā)病嚴(yán)重時(shí)整株常因無法吸收水分和養(yǎng)分導(dǎo)致植株萎蔫直至枯死[2]。目前,研究認(rèn)為引起牡丹根腐病的病原菌主要為腐皮鐮刀菌(Fusarium solani),但尖孢鐮刀菌(F. oxysporum)和立枯絲核菌(Rhizoctonia solani)等在根腐病的發(fā)生和發(fā)展過程中,通常與腐皮鐮刀菌(F. solani)混合侵染,導(dǎo)致牡丹根腐病的發(fā)生機(jī)制較為復(fù)雜[3-4]。
目前,在生產(chǎn)過程中主要采用農(nóng)業(yè)措施和化學(xué)防治的方法控制牡丹根腐病的發(fā)生[5-6],雖取得了一定效果,但未從根本上解決根腐病的防治難題。牡丹根腐病防治過程中主要存在兩個(gè)困難:一是牡丹為多年生植物,若采用輪作和換土的方法,在實(shí)際生產(chǎn)中難以實(shí)施,且成本較大;二是化學(xué)防治的效果不理想,且易造成病原菌抗性增加和土壤中農(nóng)藥殘留,因此,急需探索根腐病防治的新途徑。生物防治作為一種安全有效的防治方法日益受到重視,尤其是利用選育的內(nèi)生拮抗菌株對(duì)植物病害進(jìn)行防治,可從根本上抑制病原菌生長(zhǎng)繁殖,改善土壤微生態(tài)環(huán)境,控制植物連作條件下土傳根腐病病害的發(fā)生,且能夠有效避免化學(xué)農(nóng)藥帶來的防治缺點(diǎn)。
近年來,研究者采用4種商用生防菌劑MC -1(枯草芽胞桿菌Bacillus subtilis制劑)、B130-1(巨大芽胞桿菌B. megaterium制劑)、BA31和 BXN(枯草芽胞桿菌B. subtilis制劑)進(jìn)行牡丹根腐病的防治,結(jié)果表明菌劑BA31和 BXN對(duì)牡丹根腐病的防治效果較好,其防效可達(dá)80%以上[7]。王雪山等[8]從牡丹根際土壤中分離獲得了7株對(duì)牡丹根腐病原菌具有平板拮抗作用的細(xì)菌菌株,其抑菌帶寬度在2-5 mm之間,為牡丹根腐病的生物防治提供了一些微生物資源。孟國慶等[9]從多年生牡丹發(fā)病植株根際土壤中獲得了兩株對(duì)牡丹根腐病原菌具有抑菌作用的菌株,經(jīng)鑒定均為芽孢桿菌屬(Bacillus)細(xì)菌。這些微生物在牡丹根腐病的生物防治中表現(xiàn)出了很好的應(yīng)用潛力。
為進(jìn)一步拓展牡丹根腐病的生防菌資源,本研究從健康牡丹根部組織中進(jìn)行內(nèi)生細(xì)菌的分離,通過前期篩選獲得了2株對(duì)牡丹根腐病菌具有拮抗作用的細(xì)菌,并將其鑒定為解淀粉芽胞桿菌(B.amyloliquefaciens)。本文在前期研究的基礎(chǔ)上,進(jìn)一步探討2個(gè)菌株抑菌活性物質(zhì)的組成,并解析在抑菌作用過程中發(fā)揮主要生防作用的次生代謝產(chǎn)物,以期為牡丹根腐病的生物防治提供新的微生物資源,并為將來2個(gè)菌株在牡丹根腐病防治中的實(shí)際應(yīng)用提供理論研究基礎(chǔ)。
1.1.1 供試病原菌:牡丹根腐病原菌(F. solani)由本課題組2019年4-5月間從洛陽牡丹國花園根腐病發(fā)病植株上分離、鑒定并保存的致病能力強(qiáng)的菌株。
1.1.2 供試內(nèi)生細(xì)菌:解淀粉芽胞桿菌(B. amyloliquefaciens)md8和md9由本課題組 2019年9-10月間分離自洛陽理工學(xué)院牡丹種植地健康牡丹根部組織。
1.1.3 供試培養(yǎng)基:內(nèi)生細(xì)菌純化采用 TSA 培養(yǎng)基(胰蛋白胨3 g,植物蛋白胨1 g,氯化鈉1 g,瓊脂15 g,定容至1 L,pH7.2);根腐病原菌的純化及平板抑菌作用采用PDA培養(yǎng)基(馬鈴薯200 g,葡萄糖20 g,瓊脂15-20 g,蒸餾水1 L,自然pH);拮抗菌株脂肽類物質(zhì)的提取采用Landy 培養(yǎng)基[10]。
1.2.1 拮抗牡丹根腐病原菌內(nèi)生細(xì)菌菌株的鑒定 根據(jù)菌落形態(tài)特征和16S rDNA基因序列鑒定具有拮抗作用的內(nèi)生細(xì)菌菌株md8和md9,具體方法參考文獻(xiàn)[11]。
1.2.2 菌株md8和md9脂肽類化合物合成基因PCR 檢測(cè)分析 以菌株md8和md9的基因組DNA為模板,通過PCR 擴(kuò)增Fengycin 合成基因fenA,Surfactin 合成基因srfAA,Iturin 合成基因ituD,分別參考Koumoutsi和Hsieh文獻(xiàn)合成基因引物[12-13],引物序列詳見表1,引物由上海生工生物工程股份有限公司合成。PCR反應(yīng)體系為25 μL,擴(kuò)增程序?yàn)?5℃預(yù)變性5 min;94℃變性1 min、55℃退火1min、72℃延伸1 min,共35個(gè)循環(huán);72℃延伸10 min。1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)菌株md8和md9 基因組中相關(guān)脂肽類化合物合成基因的擴(kuò)增情況。PCR產(chǎn)物切膠回收后,連接到載體pMD18-T 上,轉(zhuǎn)化至大腸桿菌DH5α感受態(tài)細(xì)胞,挑取陽性克隆測(cè)序。測(cè)序由上海生工生物工程股份有限公司完成,DNA測(cè)序后的產(chǎn)物序列利用NCBI 數(shù)據(jù)庫的Blast 程序進(jìn)行同源檢索,與GenBank 數(shù)據(jù)進(jìn)行比對(duì)分析。
表1 脂肽類物質(zhì)合成基因片段引物序列Table 1 Primer sequence for lipopeptide biosynthesis genes fragments
1.2.3 菌株md8和md9脂肽類物質(zhì)的提取、凝膠層析分離及抑菌活性測(cè)定
1.2.3.1 脂肽類物質(zhì)的提取及凝膠層析分離 采用酸沉淀和甲醇抽提法提取菌株md8和md9的脂肽類粗提物,具體方法參考文獻(xiàn)[10]。將菌株md8和md9產(chǎn)生的脂肽類粗提物配制成合適濃度,利用Sephadex LH-20凝膠柱(1.6 cm×80 cm)進(jìn)行分離純化,上樣體積2 mL,洗脫溶劑為甲醇,流速為1 mL/min,紫外檢測(cè)波長(zhǎng)為220 nm,每5 min收集1管,合并相關(guān)主要洗脫峰,用真空冷凍干燥機(jī)進(jìn)行減壓蒸干,磷酸緩沖液(0.2 mol/L,pH=7.0)溶解備用。
1.2.3.2 脂肽類物質(zhì)及凝膠層析分離組分抑菌活性測(cè)定 采用牛津杯對(duì)峙培養(yǎng)法測(cè)定菌株md8和md9脂肽類粗提物及凝膠層析分離組分對(duì)牡丹根腐病原菌的抑菌活性。具體方法為:取直徑5 mm根腐病原菌接種于PDA 培養(yǎng)基平板中央,將牛津杯插至距培養(yǎng)皿邊緣1.5 cm處,將150 μL過濾除菌的脂肽類粗提物及凝膠層析分離組分分別加入牛津杯中,每個(gè)處理重復(fù)3 次,對(duì)照只接種病原菌,28℃培養(yǎng)箱培養(yǎng)5 d后,測(cè)量抑菌帶的寬度。
1.2.4 菌株md8和md9脂肽類物質(zhì)合成基因熒光定量PCR分析
1.2.4.1 菌體收集 采用平板對(duì)峙法準(zhǔn)備用于熒光定量PCR分析的細(xì)菌樣品。具體方法為:在平板一側(cè)劃線接種拮抗細(xì)菌菌株,另一側(cè)接種直徑5 mm根腐病原菌菌餅,28℃倒置培養(yǎng)。分別收集對(duì)峙培養(yǎng)2 d、3 d、4 d、5 d、6 d和7 d的細(xì)菌菌體5 mg,以平板僅接種拮抗菌株的細(xì)菌菌體為對(duì)照,所有收集菌體均置于1.5 mL離心管中-80℃冷凍備用。每 10個(gè)平板作為1個(gè)生物學(xué)重復(fù),每個(gè)樣品設(shè)置3次重復(fù)。共采集 14 組樣品,分別包括菌株md8和md9 與根腐病原菌對(duì)峙培養(yǎng)后2 d、3 d、4 d、5 d、6 d和7 d的細(xì)菌樣品12組,以及在PDA平板上僅接種細(xì)菌菌株md8和md9,培養(yǎng)2 d后收集的菌體樣品2組。
1.2.4.2 菌體RNA的提取、質(zhì)量檢測(cè)及逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng) 按照OMEGA E.Z.N.A?Bacterial RNA Kit(Omega Bio-Tek公司)試劑盒說明書的使用方法提取細(xì)菌樣品RNA,利用NanoDrop 2000分光光度計(jì)在260/280 nm處測(cè)定各樣品RNA的濃度和純度。按照PrimeScriptTMRT reagent Kit with gDNA Eraser Kit(TaKaRa公司)試劑盒說明書的使用方法將細(xì)菌樣品RNA反轉(zhuǎn)錄為cDNA。
1.2.4.3 熒光定量PCR檢測(cè) 根據(jù)DNA 測(cè)序獲得的拮抗菌株脂肽類物質(zhì)合成基因序列,設(shè)計(jì)熒光定量PCR引物,序列詳見表2,由上海生工生物工程股份有限公司合成。以細(xì)菌rpsJ基因(編碼細(xì)菌核糖體蛋白)作為內(nèi)參基因[14],利用ABI7500實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀(Applied Biosystems公司,USA)對(duì)樣品進(jìn)行定量檢測(cè)。熒光定量PCR的反應(yīng)體系為:2×SYRBR Green Buffer 10 μL;引物(10 μmol /L)0.5 μL;cDNA模板 2μL;ddH2O 6.4 μL,總體積為20 μL。PCR的反應(yīng)程序?yàn)椋?5℃ 預(yù)變性30 s,95℃ 變性5 s,60℃ 退火30 s,循環(huán)40 次。實(shí)時(shí)熒光定量結(jié)果Cq值采用 2-△△Ct方法進(jìn)行相對(duì)定量[15]。
表2 脂肽類物質(zhì)合成基因熒光定量PCR引物序列Table 2 Primer sequences for lipopeptide biosynthesis genes in RT-qPCR
1.2.5 基質(zhì)輔助激光解吸飛行時(shí)間質(zhì)譜鑒定抑菌物質(zhì) 利用基質(zhì)輔助激光解吸附飛行時(shí)間質(zhì)譜(MALDI-TOF-MS)分析菌株md8和md9凝膠層析分離組分中具有抑菌活性的物質(zhì)成分結(jié)構(gòu)。MALDITOF-MS 具體方法參照文獻(xiàn)[16],使用337 nm 氮激光源解吸附和電離,采用α-氰-4-羥肉桂酸(α-cyano-4-hydroxycinnamic acid)為基質(zhì),將具有抑菌作用的分離組份置于儀器離子源進(jìn)行測(cè)定,質(zhì)量掃描范圍為100 - 2 000 Da。
1.2.6 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與分析 試驗(yàn)數(shù)據(jù)采用SPSS 19 和Excel 2010 軟件進(jìn)行分析。
經(jīng)前期篩選,菌株md8和md9對(duì)牡丹根腐病原菌具有顯著的抑菌作用。利用形態(tài)學(xué)特征和分子生物學(xué)方法進(jìn)行菌株鑒定。形態(tài)結(jié)果表明菌株md8和md9的菌落均為白色,圓形,干燥,邊緣不規(guī)則,環(huán)狀凸起,革蘭氏染色均為陽性,菌體均為桿狀(圖1)。菌株md8和md9的16S rDNA PCR擴(kuò)增產(chǎn)物長(zhǎng)度分別為1 446 bp和1 438 bp,其在 GenBank中的登錄號(hào)分別為MT233097和MT233098,利用NCBI中的BLAST軟件進(jìn)行比對(duì)分析,結(jié)果表明菌株md8和md9與解淀粉芽胞桿菌(B. amyloliquefaciens)序列相似度高達(dá)99%,選取與其序列相似性較高的模式菌株,通過MEGA 7.0軟件中的鄰近法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(圖2),系統(tǒng)發(fā)育樹結(jié)果表明,菌株md8和md9與解淀粉芽胞桿菌(B. amyloliquefaciens)聚在同一分支。結(jié)合形態(tài)學(xué)特征和16S rRNA基因分子生物學(xué)鑒定,將菌株md8和md9鑒定為解淀粉芽胞桿菌(B. amyloliquefaciens)。
圖1 拮抗菌株md8和md9菌落和菌體形態(tài)特征(10×100)Fig.1 Colonies and morphological characteristics of antagonistic strain md8 and md9(10×100)
圖2 基于16S rDNA序列構(gòu)建的拮抗細(xì)菌md8和md9的系統(tǒng)發(fā)育樹Fig.2 Phylogenetic tree of antagonistic strain md8 and md9 based on 16 S rDNA sequences
利用3對(duì)引物對(duì)拮抗菌株md8和md9脂肽類物質(zhì)合成基因進(jìn)行PCR擴(kuò)增,結(jié)果表明拮抗菌株md8和md9均能夠擴(kuò)增獲得ituD、fenA和srfkAA基因片段,其片段大小分別約為1 300 bp、1 500 bp和1 500 bp(圖3)。將擴(kuò)增獲得的特異條帶回收純化,克隆測(cè)序,分別獲得菌株md8和md9的3個(gè)脂肽類物質(zhì)合成基因片段序列。Blastn 比對(duì)結(jié)果表明,菌株md8的合成基因組中ituD基因片段(1 312bp)與B. amyloliquefaciensUMAF6639(CP006058)序列同源性達(dá)到99%,fenA基因片段(1 559 bp)與B.amyloliquefaciensB15(CP014783)同源性達(dá)到99%,srfAA基因片段(1 632 bp)與B. amyloliquefaciensMBE1283(CP013727)同源性達(dá)到98%;菌株md9的合成基因組中ituD基因片段(1 328 bp)與B. amyloliquefacienssubsp.plantarumCAUB946(HE617159)序列同源性達(dá)到99%,fenA基因片段(1 555 bp) 與B. amyloliquefaciensY2(CP003332)同源性達(dá)到99%,srfAA基因片段(1 640 bp)與B.amyloliquefaciensLFB112(CP006952)同源性達(dá)到99%。利用 Blastx 將獲得的基因片段序列與 NCBI 數(shù)據(jù)庫中非冗余蛋白質(zhì)序列進(jìn)行比對(duì),結(jié)果發(fā)現(xiàn),菌株md8和md9的fenA、srfAA、ituD基因片段序列分別與解淀粉芽孢桿菌(B. amyloliquefaciens)非核糖體物質(zhì)芬薺素合成酶蛋白序列、表面活性素合成酶蛋白序列、伊枯草菌素類桿菌霉素D合成酶蛋白序列相似性達(dá)到99%,說明利用特異引物所擴(kuò)增獲得的基因片段為相應(yīng)的非核糖體物質(zhì)類脂肽類物質(zhì)合成基因序列,表明菌株 md8和md9具有合成脂肽類抑菌物質(zhì)的能力。
圖3 菌株md8和md9脂肽類物質(zhì)合成基因片段PCR擴(kuò)增電泳結(jié)果Fig. 3 Electrophoresis of PCR amplified lipopeptide biosynthesis gene fragments of strain md8 and md9
平板對(duì)峙實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,不同培養(yǎng)時(shí)間菌株md8和md9對(duì)牡丹根腐病原菌的抑菌作用有所變化,對(duì)峙培養(yǎng)后的5-7 d抑菌作用相對(duì)穩(wěn)定(圖4)。利用RNA提取試劑盒提取處理樣品和對(duì)照樣品的RNA,結(jié)果顯示所有樣品RNA提取質(zhì)量較好,OD260/280均在 1.9-2.1 之間,能夠有效滿足后續(xù)試驗(yàn)要求。利用反轉(zhuǎn)錄試劑盒將所有細(xì)菌樣品RNA反轉(zhuǎn)錄為cDNA,同時(shí)利用引物進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量 PCR。結(jié)果表明菌株md8和md9的ituD、fenA和srfAA合成基因在與牡丹根腐病原菌的對(duì)峙培養(yǎng)過程中其相對(duì)表達(dá)量發(fā)生了不同程度的變化(圖5和6)。與對(duì)照表達(dá)量相比,菌株md8芬薺素(fenA)和伊枯草菌素(ituD)合成基因在對(duì)峙培養(yǎng)6 d時(shí)相對(duì)表達(dá)量達(dá)到高峰,分別是對(duì)照的3.8倍和6.1倍,表面活性素合成基因(srfAA)的表達(dá)量在整個(gè)對(duì)峙培養(yǎng)過程中相對(duì)穩(wěn)定,僅為對(duì)照的2-3倍。菌株md9fenA和ituD合成基因表達(dá)量在對(duì)峙培養(yǎng)5 d時(shí)達(dá)到高峰,分別是對(duì)照的4.6倍和7.8倍,srfAA的表達(dá)量在整個(gè)對(duì)峙培養(yǎng)過程中相對(duì)穩(wěn)定,也僅為對(duì)照的2-3倍。熒光定量PCR結(jié)果表明,菌株md8和md9ituD合成基因在與根腐病原菌的對(duì)峙培養(yǎng)過程中被誘導(dǎo)表達(dá),其表達(dá)量顯著高于對(duì)照基因的表達(dá)量,推測(cè)菌株md8和md9合成的伊枯草菌素類物質(zhì)可能在牡丹根腐病原菌平板抑制過程中發(fā)揮主要抑菌作用,同時(shí)fenA合成基因也被誘導(dǎo)表達(dá),表明芬薺素類物質(zhì)對(duì)牡丹根腐病原菌也具有一定的抑制作用。
圖4 菌株md8和md9對(duì)牡丹根腐原菌的平板抑制作用(平板對(duì)峙培養(yǎng)6 d)Fig.4 Inhibitory effect of strain md8 and md9 inhibiting F. solani on the plate(plate confrontation cultured 6 d)
圖5 菌株md8脂肽類物質(zhì)合成基因在抑制牡丹根腐病原菌時(shí)的相對(duì)表達(dá)量Fig.5 Relative expressions of the lipopeptide biosynthesis genes of strain md8 inhibiting F. solani on the plate
菌株md8和md9脂肽類粗提物對(duì)牡丹根腐病原菌具有明顯的平板抑制作用,其抑菌帶寬度均可達(dá)到10 mm(圖7-A)。兩個(gè)菌株的脂肽類粗提物利用Sephadex LH-20凝膠層析柱層析分離,結(jié)合時(shí)間和220 nm處的吸光度收集分離組分,菌株md8共收集到10個(gè)分離組分,分別命名為A1-A10,菌株md9共收集12個(gè)分離組分,分別命名為B1-B12。牛津杯對(duì)峙培養(yǎng)法測(cè)定不同收集組分的抑菌活性,結(jié)果表明,菌株md8 層析分離組分A4和A5對(duì)牡丹根腐病原菌具有明顯的抑菌作用,其抑菌帶寬度分別為5.2 mm和3.1 mm(圖7-B),菌株md9 的3個(gè)分離組分B2、B3和B4對(duì)牡丹根腐病原菌具有不同程度的抑菌作用,其抑菌帶寬度分別為1.3 mm、6.2 mm和5.4 mm(圖7-C),其中組份B3對(duì)牡丹根腐病原菌的抑菌效果最為顯著,推測(cè)其為菌株md9抑制根腐病原菌的主要活性物質(zhì)。
圖7 菌株md8和md9脂肽類粗提物和凝膠層析分離組分對(duì)牡丹根腐病原菌的平板抑制作用Fig.7 Inhibition effect of lipopeptide extract and separation components via gel chromatography of strain md8 and md9 inhibiting F. solani
為進(jìn)一步明晰菌株md8和md9對(duì)根腐病原菌具有抑菌作用的凝膠層析分離組分的物質(zhì)種類,利用 MALDI-TOF-MS分析具有抑菌活性的凝膠層析分離組分。菌株md8凝膠層析組分A4和A5 MALDITOF-MS分析結(jié)果表明(圖8),其中組分A4質(zhì)子化峰值m/z=1 031和1 045,其中1 031和1 045差一個(gè)亞甲基(-CH2),推測(cè)這種化合物為脂肪酸鏈相差一個(gè)亞甲基(-CH2)的同系物,與C14-C15的Bacillomycins D[M+H]+加 合 峰 相 對(duì) 應(yīng),同時(shí)在組分A4中含有m/z=1 081的離子峰,與C16 Bacillomycins D的[M+Na]+加合峰相吻合,由已知文獻(xiàn)確定,菌株md8的組分A4主要為C14 Bacillomycins D[17]。組份A5的質(zhì)譜顯示在m/z=1 058、1 072和1 086處出現(xiàn)3個(gè)離子峰,其中1 058和1 072差一個(gè)亞甲基(-CH2),1 072和10 86之間差一個(gè)亞甲基(-CH2),表明它們?yōu)橥滴?,與屬于C15-C17 的Iturin B[M+H]+加合峰相對(duì)應(yīng),同時(shí)在組分A5中含有m/z=1 096的離子峰,其響應(yīng)量相對(duì)較弱,與C15 Iturin B[M+K]+加合峰相吻合,由已知文獻(xiàn)確定,菌株md8的組分A5主要為C15 Iturin B[17]。菌株md9對(duì)根腐病原菌具有抑制作用的3個(gè)組分B2、B3和B4經(jīng) MALDI-TOF-MS分析(圖9),組分B2的質(zhì)譜顯示在m/z=1 519和1 533處出現(xiàn)離子峰,對(duì)應(yīng)于C20-C21 Fengycin A[M+H]+加合峰,由已知文獻(xiàn)確定,組分B2的主要物質(zhì)為Fengycin A[18];組分B3的質(zhì)譜顯示在m/z=1 072和1 086出現(xiàn)二個(gè)離子峰,對(duì)應(yīng)于C15 Iturin B的質(zhì)核比,同時(shí)在B3組分中含有m/z=1 083的離子峰,其響應(yīng)量也相對(duì)較強(qiáng),與C15 Bacillomycins D的[M+K]+加合峰相吻合,表明B3組分中可能含有C15 Iturin B和C15 Bacillomycins D兩種物質(zhì);組分B4的質(zhì)譜顯示在m/z=1 058和1 086處出現(xiàn)2個(gè)離子峰,推測(cè)菌株md9組分B4的主要物質(zhì)種類為C15 Iturin B。
圖8 菌株md8凝膠層析分離組分A4(A)和A5(B)的MALDI-TOF-MS分析Fig.8 MALDI-TOF-MS analysis of separation component A4(A)and A5(B)produced by the strain md8
圖9 菌株md9凝膠層析組分B2(A)、B3(B)和B4(C)的MALDI-TOF-MS分析Fig.9 MALDI-TOF-MS analysis of separation component B2(A),B3(B)and B4(C)produced by the strain md9
牡丹根腐病是嚴(yán)重影響牡丹栽培管理的一種土傳病害,其發(fā)病機(jī)制復(fù)雜,病原菌難以清除,目前尚無有效的防治方法。本研究對(duì)內(nèi)生解淀粉芽胞桿菌(B. amyloliquefaciens)md8和md9抑制牡丹根腐病原菌的活性物質(zhì)成分進(jìn)行了分析,結(jié)果表明菌株md8和md9合成的伊枯草菌素類物質(zhì)為抑制牡丹根腐病原菌菌絲生長(zhǎng)的主要活性物質(zhì)。目前研究表明,解淀粉芽胞桿菌(B. amyloliquefaciens)產(chǎn)生的脂肽類化合物是其發(fā)揮生防作用的主要抗菌物質(zhì),主要包含表面活性素(surfactins)、伊枯草素(iturins)和芬薺素(fengycins)三大類群[19-20]。其中伊枯草菌素(iturins)分子量約為1 000 Da,家族成員包括Iturins A、B、C、D,桿菌霉素Bacillomycins D、F、L等,Bacillomycin D 是Iturin家族的一類抗菌脂肽,它與Iturin 結(jié)構(gòu)相似,其氨基酸組成不同[21]。芬薺素(fengycins)分子量約為1 500 Da,家族成員主要包括Fengycins A和B,伊枯草菌素和芬薺素均具有強(qiáng)烈抑制真菌生長(zhǎng)的能力,尤其對(duì)絲狀真菌抑制作用更加明顯[22]。桑建偉等[16]研究發(fā)現(xiàn)內(nèi)生解淀粉芽胞桿菌(B. amyloliquefaciens)BEB17對(duì)香蕉枯萎病菌(F. oxysporumf.sp.cubense)起主要抑制作用的物質(zhì)為芬薺素和伊枯草菌素;向亞萍等[23]研究發(fā)現(xiàn)桿菌霉素和芬薺素在菌株B1619 抑制番茄枯萎病菌(F. oxysporumf.sp.lycopersici)中起到相當(dāng)重要的作用;楊洋[24]研究發(fā)現(xiàn)解淀粉芽胞桿菌(B.amyloliquefaciens)FZB42產(chǎn)出的桿菌霉素D和芬薺素是抑制禾谷鐮孢菌(F. graminearum)生長(zhǎng)的主要活性物質(zhì),尤其是桿菌霉素D的抑菌效果最為顯著。牡丹根腐病原菌屬于鐮刀菌屬(Fusarium)真菌,與香蕉枯萎病菌、番茄枯萎病菌和禾谷鐮孢菌為同屬病原菌,本研究表明菌株md8和md9抑制根腐病原菌生長(zhǎng)的主要抑菌活性物質(zhì)為Iturin B、Bacillomycin D和Fengycins A,其中Iturin B和Bacillomycin D抑菌作用較為顯著,F(xiàn)engycins A抑菌作用相對(duì)較弱,表明伊枯草菌素類物質(zhì)在牡丹根腐病原菌生長(zhǎng)過程中發(fā)揮主要的抑制作用,這與前人的研究結(jié)果是一致的。后期可進(jìn)行菌株發(fā)酵條件的優(yōu)化,進(jìn)一步純化獲取 Iturin B和Bacillomycin D物質(zhì),以為牡丹根腐病原菌的防治提供良好的生防菌劑。
圖6 菌株md9脂肽類物質(zhì)合成基因在抑制牡丹根腐病原菌時(shí)的相對(duì)表達(dá)量Fig.6 Relative expressions of the lipopeptide biosynthesis genes of strain md9 inhibiting F. solani on the plate
解淀粉芽胞桿菌產(chǎn)生的抗菌脂肽化合物結(jié)構(gòu)相對(duì)復(fù)雜,通過PCR擴(kuò)增技術(shù)可對(duì)抗菌物質(zhì)的編碼調(diào)控基因進(jìn)行檢測(cè),從而初步判斷菌株產(chǎn)生抗菌物質(zhì)的能力和種類[25-26]。本研究PCR檢測(cè)結(jié)果表明菌株md8和md9含有3種脂肽類物質(zhì)的合成基因,MALDI-TOF-MS分析結(jié)果表明兩個(gè)菌株的抑菌活性物質(zhì)中確實(shí)含有脂肽類物質(zhì),表明PCR檢測(cè)技術(shù)可以快速識(shí)別、篩選抗菌脂肽的產(chǎn)生菌,同時(shí)也可初步判斷菌株產(chǎn)生脂肽類物質(zhì)的種類,也再次證實(shí)基因檢測(cè)方法在抗菌脂肽產(chǎn)生菌鑒定方面具有較強(qiáng)的可行性。本研究中同時(shí)獲得了菌株md8和md9對(duì)根腐病原菌具有顯著抑制作用的物質(zhì)Iturin B,但由于前期未設(shè)計(jì)檢測(cè)Iturin B的編碼調(diào)控基因,因此建議在利用基因檢測(cè)技術(shù)進(jìn)行抗菌脂肽產(chǎn)生菌的篩選時(shí),應(yīng)盡可能全面的對(duì)脂肽類類物質(zhì)的編碼調(diào)控基因進(jìn)行檢測(cè),以更準(zhǔn)確的判斷菌株產(chǎn)生抗菌物質(zhì)的種類,同時(shí)也可判斷菌株是否能夠產(chǎn)生新穎的抗菌物質(zhì)。
Li等[27]研 究 了B.amyloliquefaciensSQR9四個(gè)脂肽類合成物質(zhì)編碼基因(fenA、bmyD、srfAA、dhbA)與6種土傳病原真菌平板對(duì)峙培養(yǎng)時(shí)相對(duì)表達(dá)量的變化,結(jié)果表明在與腐皮鐮刀菌(F. solani)和尖孢鐮刀菌(F. oxysporum)對(duì)峙培養(yǎng)時(shí),fenA、bmyD和srfAA基因均表現(xiàn)上調(diào)表達(dá)的趨勢(shì)。Sajitha等[28-29]研 究 了 菌 株B. subtilisB1與Lasiodiplodia theobromae平板對(duì)峙培養(yǎng)時(shí)fenB和srfAA脂肽類物質(zhì)合成編碼基因表達(dá)量的變化,表明fenB基因在對(duì)峙培養(yǎng)4 d時(shí)其表達(dá)量顯著增加,srfAA基因在細(xì)菌與病原真菌共培養(yǎng)的整個(gè)過程中表現(xiàn)出一個(gè)相對(duì)穩(wěn)定的表達(dá)量。這些研究結(jié)果均表明生防細(xì)菌在與病原真菌共培養(yǎng)條件下,能夠激活一些抗菌物質(zhì)合成基因的表達(dá),產(chǎn)生一些抗菌物質(zhì),從而為細(xì)菌獲得有效的生存條件。本研究中菌株md8和md9在與腐皮鐮刀菌(F. solani)共培養(yǎng)條件下,其ituD和fenA基因均表現(xiàn)上調(diào)表達(dá),同時(shí)srfAA基因的表達(dá)量在共培養(yǎng)前期也顯著增加,表明srfAA基因編碼的表面活性素物質(zhì)在菌株md8和md9抑制牡丹根腐病原菌的過程中具有協(xié)同增效作用,結(jié)合MALDI-TOFMS分析結(jié)果,再次驗(yàn)證了ituD基因編碼合成的物質(zhì)Bacillomycin D為菌株發(fā)揮抑菌作用的主要物質(zhì)種類。但其抑菌活性物質(zhì)如Iturin B、Bacillomycin D和Fengycins A對(duì)牡丹根腐病原菌的抑菌作用機(jī)制需進(jìn)一步研究,同時(shí)為何表面活性素物質(zhì)編碼基因srfAA在細(xì)菌與真菌共培養(yǎng)的前期表達(dá)量相對(duì)較高,以及菌株md8和md9抑菌活性物質(zhì)成分Iturin B物質(zhì)編碼基因ituB是否也能夠被高效誘導(dǎo)表達(dá)均需做進(jìn)一步的驗(yàn)證試驗(yàn)。
菌株md8和md9伊枯草菌素(iturin)的合成基因ituD在與牡丹根腐病原菌對(duì)峙培養(yǎng)過程中相對(duì)表達(dá)量顯著增加。MALDI-TOF-MS分析表明2個(gè)菌株中具有抑菌作用的組分主要為伊枯草菌素類物質(zhì)Iturin B和Bacillomycins D,結(jié)合實(shí)時(shí)熒光定量PCR結(jié)果,推測(cè)菌株md8和md9在拮抗根腐病原菌過程中發(fā)揮主要生防作用的物質(zhì)為伊枯草菌素(iturin)。