王志強(qiáng),倪亞莉,安錦霞,王同光,張風(fēng)霞
帕金森?。≒arkinson's disease)是一種常見的神經(jīng)系統(tǒng)變性疾病,其中遺傳性帕金森病的發(fā)生率為5%~10%[1]。目前已有20多個(gè)基因明確定位,其中帕金森病15型的致病基因是FBXO7(F-box only protein 7)基因,其基因突變呈常染色體隱性遺傳。引起單基因遺傳性帕金森病的臨床表現(xiàn)復(fù)雜多變。常染色體隱性遺傳性帕金森病多為青少年起病。一般父母雙方都是致病基因攜帶者,生育患兒的概率理論上達(dá)25%,但實(shí)際發(fā)生率可能更高。本文報(bào)告1例具有FBXO7基因突變并通過胚胎植入前單基因遺傳學(xué)檢測(Preimplantation Genetic Testing for Monogenic Disorders,PGT-M)技術(shù)助孕成功妊娠的病例。
1.1 研究對象夫婦雙方因生育2個(gè)男孩且2孩均于5個(gè)月時(shí)出現(xiàn)相似疾病癥狀,懷疑遺傳學(xué)相關(guān)疾病,于2018年9月19日帶大男就診于甘肅省婦幼保健院(我院)。就診時(shí)女方28歲,男方28歲,雙方均為初婚,女方既往孕4產(chǎn)2,2013年和2017年均于孕40~50 d藥物流產(chǎn)1次,終止妊娠原因不詳。分娩史如下:2012年足月順產(chǎn)一男孩(大男,先證者),在其5個(gè)月大時(shí)出現(xiàn)肌肉張力和肢體僵硬程度增加,無法獨(dú)立坐下?,F(xiàn)6歲不能獨(dú)立行走,不能正常說話,并且智力發(fā)育遲緩。該患兒2015年4月于外院被診斷為腦癱并進(jìn)行相關(guān)康復(fù)治療,但未取得令人滿意的結(jié)果。女方于2016年12月31日再次足月順產(chǎn)第2個(gè)男孩(小男),小男于5個(gè)月齡時(shí)出現(xiàn)了和哥哥同樣的癥狀,肌肉張力增強(qiáng),認(rèn)知能力下降,2017年6月7日于外院就診時(shí)對小男行全外顯子測序(whole exome sequencing,WES)未發(fā)現(xiàn)異常,最終于2017年6月20日因嚴(yán)重的肺部感染夭折。經(jīng)相關(guān)診治后初步推斷,小男與先證者大男相關(guān)癥狀與體征均可能與帕金森-錐體束綜合征(Parkinsonianpyramidal syndrome,PPS)發(fā)作有關(guān)。就診于我院時(shí)經(jīng)患者及家屬知情同意后,對夫婦雙方及二子前次行WES的剩余擴(kuò)增樣本再次行WES重新尋找遺傳病因,發(fā)現(xiàn)先證者大男和小男均為FBXO7基因的復(fù)合雜合突變攜帶者(NM_012179.3):c.402G>A和c.872-1G>A。c.402G>A遺傳自父親,而c.872-1G>A來自母親。對患者夫婦進(jìn)行充分遺傳咨詢和知情同意后,為患者制定了詳細(xì)的PGT-M助孕方案。該研究得到我院倫理委員會的批準(zhǔn)。
1.2 研究方法
1.2.1 家系預(yù)實(shí)驗(yàn)分析采集夫妻雙方及先證者肘正中靜脈血5 mL,對先證者FBXO7基因的突變位點(diǎn)c.402G>A和c.872-1G>A進(jìn)行Sanger測序驗(yàn)證。結(jié)果如圖1和圖2所示:FBXO7基因(OMIM:605648)存在錯(cuò)義突變,確定了先證者和弟弟均為FBXO7基因的復(fù)合雜合突變(NM_012179.3):c.402G>A和c.872-1G>A。c.402G>A遺傳自父親,而c.872-1G>A遺傳自母親。根據(jù)美國醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)和基因組學(xué)會(American College of Medical Genetics and Genomics,ACMG)指南介紹,c.402G>A為無義突變,可導(dǎo)致蛋白翻譯提前終止;c.872-1G>A為剪切突變,可導(dǎo)致蛋白剪切發(fā)生變化,均為致病突變,分別遺傳自父母雙方。同時(shí),對該家系的基因組DNA(genomic DNA,gDNA)樣本在FBXO7基因上下游2 Mb范圍內(nèi)進(jìn)行單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism,SNP)多重?cái)U(kuò)增,進(jìn)行家系SNP單體型分析,區(qū)分先證者致病攜帶的單體型為后續(xù)胚胎SNP連鎖分析奠定基礎(chǔ)。
圖1 FBXO7基因家系圖譜
圖2 FBXO7基因家系一代驗(yàn)證結(jié)果
1.2.2 卵細(xì)胞質(zhì)內(nèi)單精子注射(intracytoplasmic sperm injection,ICSI)及PGT-M治療為患者制定控制性卵巢刺激方案,采用卵泡期短效長方案,最終獲卵15枚,ICSI后正常受精9枚,于第5天獲得可活檢囊胚5枚,對擴(kuò)張期囊胚滋養(yǎng)外胚層細(xì)胞進(jìn)行活檢。并將活檢樣本參照基因測序通用樣本處理(XK-028,Yikon Genomics)試劑盒說明(ChromSwiftTM)進(jìn)行單細(xì)胞全基因組擴(kuò)增(whole genome amplification,WGA)。
取20 ng WGA產(chǎn)物應(yīng)用轉(zhuǎn)座酶試劑盒(KT100801924,Yikon Genomics)進(jìn)行片段化建庫,文庫大小為200~500 bp,Illumina Nextseq 550平臺測序0.04×深度,分析胚胎染色體非整倍性。取120 ng WGA產(chǎn)物為模板,利用FBXO7基因上下游的SNP引物行多重?cái)U(kuò)增,后續(xù)利用基因測序文庫(XK-038,Yikon Genomics)試劑盒進(jìn)行文庫構(gòu)建,文庫大小約為250 bp,測序深度為100×。染色體拷貝數(shù)變異(copy number variations,CNV)分析時(shí)將原始讀長(reads)去掉重復(fù),以1 Mb大小的單元(bin)比對到基因組上,在整個(gè)基因組范圍進(jìn)行計(jì)數(shù)。利用循環(huán)二元分割算法(circular binary segmentation,CBS)對≥4 Mb的胚胎CNV進(jìn)行報(bào)告,并應(yīng)用R語言程序?qū)?4條染色體的每個(gè)單元的CNV進(jìn)行可視化畫圖[2]。SNP位點(diǎn)分析時(shí)將高通量測序數(shù)據(jù)比對到人類參考基因組(hg19),進(jìn)一步分析家系及檢測樣本全基因組SNP位點(diǎn),在致病基因上下游1~2 Mb內(nèi)挑選SNP位點(diǎn)。最終,根據(jù)胚胎突變基因的SNP位點(diǎn)連鎖分析結(jié)果、基因點(diǎn)突變位點(diǎn)驗(yàn)證結(jié)果以及胚胎的染色體整倍性結(jié)果綜合考慮,出具檢測報(bào)告。
2.1 家系預(yù)實(shí)驗(yàn)基因分析家系預(yù)實(shí)驗(yàn)基因分析結(jié)果示:父母雙方均為FBXO7基因相應(yīng)位點(diǎn)的突變攜帶者,先證者攜帶分別遺傳自父母的FBXO7基因突變位點(diǎn),為復(fù)合雜合突變。見圖3、圖4。
圖3 父母及先證者SNP連鎖分析
圖4 父母及先證者基因分析結(jié)果
2.2 活檢樣本檢測結(jié)果及移植結(jié)果5枚囊胚行滋養(yǎng)層細(xì)胞活檢后均成功擴(kuò)增,基因突變位點(diǎn)及SNP檢測結(jié)果見表1和圖5。5枚囊胚中有2枚(P2018052_1和P2018052_4)僅攜帶父源突變且染色體為正常二倍體,2枚胚胎染色體存在異常,1枚胚胎患病。遺傳咨詢后對患者行凍融胚胎移植,經(jīng)內(nèi)膜準(zhǔn)備后將編號為P2018052_1(形態(tài)學(xué)評分為5BB)的活檢后囊胚移植到母體,獲得成功妊娠。妊娠期經(jīng)過胎兒頸項(xiàng)透明層厚度(nuchal translucency,NT)、系統(tǒng)B超和羊水穿刺三聯(lián)篩查驗(yàn)證胎兒與前期胚胎PGT-M遺傳學(xué)檢測結(jié)果完全一致,未發(fā)現(xiàn)其他異常。該患者于2020年4月3日成功分娩一名僅攜帶父源突變、無發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的健康男嬰,出生體質(zhì)量3 360 g。
圖5 5枚囊胚SNP檢測結(jié)果
表1 5枚囊胚活檢樣本CNV檢測結(jié)果
帕金森病是一種神經(jīng)退行性疾病[1],其特征為靜止性震顫、肌肉痙攣、運(yùn)動遲緩和體位不穩(wěn)等,嚴(yán)重者亦有記憶障礙和癡呆[3]。家族性帕金森病在所有帕金森病患者中僅占10%[4],其可通過常染色體顯性遺傳、常染色體隱性遺傳或罕見的X連鎖遺傳[5],其中FBXO7基因突變?yōu)槌H旧w隱性遺傳方式。常染色體隱性遺傳早發(fā)性帕金森?。╝utosomal recessive early-onset Parkinsonism,AREP)是一種早發(fā)性、發(fā)病年齡一般≤40歲的帕金森病,除有帕金森病的特征性臨床表現(xiàn)外,還有其自身特點(diǎn),如癥狀常于睡眠休息后減輕、晨輕暮重、早期對小劑量多巴胺反應(yīng)敏感和肌張力障礙等[6]。研究發(fā)現(xiàn),編碼FBXO7蛋白的FBXO7基因突變可引起罕見的常染色體隱性遺傳性神經(jīng)退行性疾病——帕金森病15型[7],該病又稱為PPS或蒼白球-錐體束?。╬allido-pyramidal disease,PPD)?;加羞@種疾病的患者主要表現(xiàn)為錐體束疾病伴發(fā)的帕金森病的早期發(fā)作,并常表現(xiàn)出精神運(yùn)動遲緩、腱反射亢進(jìn)、舞蹈癥和其他非典型癥狀[8]。帕金森病15型屬于青少年起病的帕金森病,多在幼年和成人早期發(fā)病,該病進(jìn)展迅速,可有皮質(zhì)脊髓體征,部分家庭早發(fā)性帕金森病伴有運(yùn)動遲緩。目前國際上已有20例早發(fā)性帕金森病家族中FBXO7基因突變的病例報(bào)道,部分突變類型已被鑒定[8-9]。Wei等[9]報(bào)道了中國首例由FBXO7基因復(fù)合雜合突變引起的少年型帕金森病。
本家系中先證者和其弟均為FBXO7基因的復(fù)合雜合突變(NM_012179.3):c.402G>A和c.872-1G>A。無義突變c.402G>A遺傳自父親,而剪切突變c.872-1G>A遺傳自母親。通過在千人基因組計(jì)劃、人類外顯子數(shù)據(jù)庫(ExAC)和SNP數(shù)據(jù)庫(dbSNP)中檢索,并且在突變數(shù)據(jù)庫ClinVar、OMIM(Online Mendelian Inheritance in Man)和HGMD(Human Gene Mutation Database)中檢索,均沒有發(fā)現(xiàn)本家系中檢出的2個(gè)基因突變的記錄。c.402G>A突變使色氨酸密碼子(UGG)轉(zhuǎn)換為終止密碼子(UGA),使蛋白質(zhì)翻譯提前終止(p.Trp134*),并導(dǎo)致FBXO7功能喪失。c.872-1G>A突變是剪切位點(diǎn)突變,位于IVS5-1位置,導(dǎo)致6號外顯子剪切發(fā)生變化并產(chǎn)生異常蛋白。根據(jù)ACMG遺傳變異分類標(biāo)準(zhǔn)和指南,將新的無義突變c.402G>A加權(quán)為非常強(qiáng)致病性證據(jù)(PVS1),中等致病性證據(jù)(PM2和PM4),并提供致病性支持(PP);剪切突變c.872-1G>A的權(quán)重為PVS1、PM2、PM3和PP。根據(jù)致病標(biāo)準(zhǔn),將這兩個(gè)變異歸類為致病性。
目前已經(jīng)發(fā)現(xiàn)的單基因遺傳病有7 000多種,大部分單基因遺傳病具有致死性、致殘性或致畸性,且多數(shù)至今尚無有效治療手段,對患者家庭及社會造成嚴(yán)重負(fù)擔(dān)。PGT-M技術(shù)現(xiàn)已廣泛應(yīng)用于胚胎植入前的單基因病檢測,在妊娠之前即對胚胎進(jìn)行遺傳學(xué)診斷,避免遺傳學(xué)高風(fēng)險(xiǎn)的胚胎種植,從而實(shí)現(xiàn)優(yōu)生優(yōu)育[10]。本例帕金森病遺傳方式為常染色體隱性遺傳,夫妻雙方分別攜帶致病雜合變異基因,后代有25%的概率患病,50%的概率為致病變異攜帶者,25%的概率為正常人。經(jīng)用PGT-M技術(shù),通過多次退火環(huán)狀循環(huán)擴(kuò)增技術(shù)(multiple annealing and looping-based amplification cycles,MALBAC)進(jìn)行單基因擴(kuò)增及高通量測序,對囊胚進(jìn)行篩查,選擇不同時(shí)攜帶母源以及父源致病位點(diǎn)的非致病性胚胎進(jìn)行移植獲得活產(chǎn),成功阻斷了帕金森病在該家系的垂直傳遞。
PGD-M技術(shù)已經(jīng)成為解決單基因遺傳病的一級預(yù)防手段之一。在生殖臨床和生殖遺傳的常規(guī)臨床工作中,必須將臨床表現(xiàn)和遺傳學(xué)檢查結(jié)合起來,提高對遺傳性疾病的辨別力和洞察力,才能在實(shí)際的臨床工作中及時(shí)發(fā)現(xiàn)遺傳學(xué)風(fēng)險(xiǎn),從而通過相應(yīng)的治療手段提前進(jìn)行干預(yù),切實(shí)通過技術(shù)手段達(dá)到預(yù)防出生缺陷、提高人口素質(zhì)的目的。