周建
(揚(yáng)州大學(xué)農(nóng)學(xué)院,江蘇 揚(yáng)州 225000)
隨著人們生活水平的不斷提高,越來越多的人開始關(guān)注稻米品質(zhì)。稻米品質(zhì)包括稻米外觀品質(zhì)、碾磨品質(zhì)、營養(yǎng)品質(zhì)、蒸煮食味品質(zhì)四個方面[1]。其中,蒸煮食味品質(zhì)最受消費(fèi)者關(guān)注。已有研究表明,稻米蛋白質(zhì)含量對蒸煮食味品質(zhì)有顯著的負(fù)向影響,稻米蛋白質(zhì)含量越高,營養(yǎng)品質(zhì)越高,但稻米適口性卻越差。目前增施氮肥的同時,稻米蛋白質(zhì)含量也顯著增加,蛋白質(zhì)的含量影響著稻米的蒸煮食味品質(zhì)[2]。然而,目前氮肥如何調(diào)控稻米蛋白質(zhì)的機(jī)制尚不清楚。氮素是促進(jìn)植物生長的重要營養(yǎng)元素,對保障農(nóng)作物高產(chǎn)極為關(guān)鍵。而植物生長的直觀體現(xiàn)為生物量的積累。植物吸收氮素后通過氮同化等一系列代謝過程,生成核酸、蛋白等大量功能元件以滿足光合作用及生長所需。[3-4]本研究利用實驗室已有的水稻近等基因系,對其不同氮肥處理,并選取花后14天胚乳做RNA-Seq,從組學(xué)水平對施肥調(diào)控稻米蛋白質(zhì)含量機(jī)制初探。
我們選擇CSSL SL402作為供體親本與背景親本Sasanishiki進(jìn)行雜交,構(gòu)建HH、HS、DH、DS近等基因系,選擇HH對其進(jìn)行低氮(LN 2.2 g/盆)、中氮(MN 4.4 g/盆)、高氮(HN 6.6 g/盆)氮肥處理,同時選取花后14天胚乳做RNA-Seq。
利用FOSSTECATOR全自動凱氏定氮儀進(jìn)行總蛋白測定。
利用BCA法測定米粉谷蛋白、醇溶蛋白、清蛋白、球蛋白含量。
水稻蛋白質(zhì)以谷蛋白、醇溶蛋白為主,清蛋白和球蛋白在稻米蛋白質(zhì)中所占比例很少。通過比較HH在LN、MN、HN處理條件下發(fā)現(xiàn),HH在MN條件下比LN上升11.22%,在HN條件下比MN上升3.26%??偟鞍缀繌腖N到MN極顯著增加,MN到HN增加不顯著。同時分析了HH的組分蛋白含量發(fā)現(xiàn),稻米總蛋白含量增加主要是由于谷蛋白和醇溶蛋白含量增加導(dǎo)致在統(tǒng)計學(xué)上達(dá)到顯著水平,然而清蛋白和球蛋白增加并不是很明顯。(見表1)。
表2.1 蛋白含量(mg/g)分析
通過對HH在低中,高低氮肥處理下同時上調(diào)下調(diào)的基因的GO進(jìn)行富集發(fā)現(xiàn),在BP中富集主要包括細(xì)胞過程(Cellular process)、代 謝 過 程(Metabolic processs)、生物調(diào)節(jié)(Biological regulation)、細(xì)胞成分的組織或生物發(fā)生(Cellular component organization or biogenesis)、發(fā)育過程(Development process)、多細(xì)胞生物過程(Multicellular organismal process)、生物過程的負(fù)調(diào)控(Negative regulation of biological process)、排 毒(Deltoxification)、免疫系統(tǒng)過程(Immune system process)、細(xì)胞增殖(Cell proliferation)、生長(Growth)、氮素利 用(Nitrogen utilization)等方面,在CC中顯著富集主要包括細(xì)胞(cell)、細(xì)胞部分(Cell part)、細(xì)胞器(Organelle)、膜部分(Membrane part)、含蛋白質(zhì)復(fù)合物(Protein-containing complex)、細(xì)胞外區(qū)域(Extracellular region)、細(xì)胞連接(Cell junction)、細(xì)胞外區(qū)域部分(Extracellular region part)、在MF中主要包括捆綁(Binding)、催化活性(Catalytic activity)、轉(zhuǎn)運(yùn)活動(transporter activity)、轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)活性(Transcription regulator activity)、分子功能調(diào)節(jié)劑(Molecular function regulator)、營養(yǎng)物儲存活動(Nutrient reservoir activity)。這些差異表達(dá)基因大多數(shù)富集在代謝,和貯藏物質(zhì)形成等相關(guān)富集上,尤其在氮素利用上,這些差異基因的富集可能導(dǎo)致稻米蛋白質(zhì)含量發(fā)生變化(圖1)。
圖1 HH在中低、高低氮肥處理下同時上調(diào)下調(diào)基因GO富集
通過RNA-Seq測序,我們檢測到大量醇溶蛋白前體和谷蛋白相關(guān)基因上調(diào)。同種材料只改變施氮量,其他外界條件不變的情況下,增施氮肥主要是通過上調(diào)醇溶蛋白前體和谷蛋白相關(guān)基因的表達(dá)量,從而使稻米蛋白質(zhì)含量增加。此外,內(nèi)質(zhì)網(wǎng)分子伴侶如BiP, PDI 等介導(dǎo)貯藏蛋白在種子成熟過程中特異大量合成并經(jīng)由內(nèi)質(zhì)網(wǎng)沉積在蛋白體PB內(nèi),對蛋白質(zhì)的形成至關(guān)重要。在我們實驗中發(fā)現(xiàn)Os02g0115900編碼OsBip1是一種內(nèi)質(zhì)網(wǎng)分子伴侶基因發(fā)生上調(diào)。蛋白質(zhì)二硫鍵異構(gòu)酶(PDI)作為一個分子伴侶,通過行使催化和協(xié)助在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中的折疊功能而參與氧化蛋白的折疊。已有研究表明略微增加BiP1的表達(dá)水平伴隨著鈣連蛋白和類蛋白質(zhì)二硫鍵異構(gòu)酶蛋白水平的增加,從而導(dǎo)致種子貯藏蛋白的增加,因此我們猜測這兩類相關(guān)基因的上調(diào),最終導(dǎo)致蛋白含量升高。
氮肥的大量施用保證產(chǎn)量,但是也會導(dǎo)致稻米蛋白質(zhì)含量增加,蛋白質(zhì)含量越高,稻米的適口性就越差。我們通過不同氮肥的處理發(fā)現(xiàn)稻米總蛋白質(zhì)含量是上升的,測定組分蛋白發(fā)現(xiàn)總蛋白的上升主要是谷蛋白和醇溶蛋白上升引起。此外,通過轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)表明,增施氮肥后谷蛋白和醇溶蛋白前體相關(guān)基因上調(diào),因此我們推測增施氮肥后,谷蛋白和醇溶蛋白相關(guān)前體基因上調(diào)最終導(dǎo)致稻米蛋白質(zhì)含量上升。