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    轉(zhuǎn)錄因子NRF3結(jié)構(gòu)、功能及其表達(dá)調(diào)控的研究進展*

    2021-09-01 08:30:54吳宇財錢金欽何宇輝李學(xué)松鞏艷青
    中國病理生理雜志 2021年8期
    關(guān)鍵詞:泛素結(jié)構(gòu)域調(diào)控

    吳宇財, 錢金欽, 何宇輝, 李學(xué)松, 鞏艷青

    [北京大學(xué)第一醫(yī)院泌尿外科,北京大學(xué)泌尿外科研究所,國家泌尿男生殖系腫瘤研究中心,泌尿生殖系疾?。校┓肿釉\治北京市重點實驗室,北京100034]

    “ 帽 領(lǐng) ”(Cap'n'collar,CNC)家 族 包 括 果 蠅CNC1,線蟲Skn-1,脊椎動物核因子E2樣蛋白1(nu?clear factor E2-like protein 1,NFE2L1)/核因子E2相關(guān)因子1(nuclear factor E2-related factor 1,NRF1)、NFE2L2/NRF2和NFE2L3/NRF3,以及相似性較低的BACH1和BACH2蛋白[1]。在信號傳遞過程中,CNC因子與小Maf家族蛋白形成異源二聚體,以進一步識別并結(jié)合多種反應(yīng)元件如NFE2、Maf識別元件(Maf recognition element,MARE)、抗氧化反應(yīng)元件(antioxidant response element,ARE)、應(yīng)激反應(yīng)元件(stress response element,STRE)和親電子反應(yīng)元件(electrophile response element,EpRE),進而調(diào)控靶基因的表達(dá)[2]。其中研究最為廣泛的是NRF2,其在細(xì)胞氧化應(yīng)激、合成代謝以及腫瘤預(yù)防與治療等方面發(fā)揮重要作用[3-4]。NRF3作為NRF2的同源基因,其蛋白的功能和調(diào)控目前還未得到深入的闡明;明確NRF3表達(dá)的調(diào)控因子及其調(diào)控的靶基因,尋找調(diào)控其轉(zhuǎn)錄因子活性的通路分子,對于全面了解它的功能和調(diào)節(jié)機制至關(guān)重要。

    1 NRF3蛋白結(jié)構(gòu)和表達(dá)

    脊椎動物NRF轉(zhuǎn)錄因子家族由3個密切相關(guān)的因子NRF1、NRF2和NRF3組成,三者的結(jié)構(gòu)見圖1。它們在C端區(qū)域都具有CNC結(jié)構(gòu)域和堿性亮氨酸拉鏈(basic leucine zipper,bZIP)結(jié)構(gòu)域,中間含有1~2個調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄激活的酸性區(qū)域(AD1、AD2或AD2L);NRF1和NRF3的N末端結(jié)構(gòu)域(N-terminal domain,NTD)帶有跨膜區(qū)域,可以將蛋白錨定到內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜上,此外兩者還都包含一個富含Asn/Ser/Thr(NST)的可發(fā)生N-糖基化的結(jié)構(gòu)域[5]。不同物種之間的生物信息學(xué)分析表明,NRF3結(jié)構(gòu)中的NTD、CNC和bZIP等重要結(jié)構(gòu)域在進化上具有高度保守性。人類NRF3基因位于染色體7p14~15,編碼的蛋白質(zhì)分子量為73 kD,包含7個結(jié)構(gòu)域,即NTD、PEST、TAD、Neh6L、CNC、bZIP和Neh3L,其中NTD區(qū)可進一步細(xì)分為N末端同源盒1(N-terminal homology box 1,NHB1)和NHB2,兩者對NRF3的翻譯后修飾起重要作用[1,6]。NRF3通過NHB1信號序列靶向輸送到內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中進行糖基化修飾,NHB2可能參與控制NRF3活性以及其在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)內(nèi)的翻譯后加工過程[7]。分子生物學(xué)研究表明,NRF3有A、B、C三種形式:B形式主要存在于細(xì)胞質(zhì)中,可被靶向運輸?shù)絻?nèi)質(zhì)網(wǎng)并進行N-糖基化修飾而轉(zhuǎn)化為A形式;而C形式主要存在于細(xì)胞核中,與sMaf蛋白形成異二聚體,通過與特異性DNA結(jié)合位點結(jié)合而激活靶基因的轉(zhuǎn)錄[1]。Nouhi等[8]的研究表明,C形式可能是NRF3的截短形式,因其N端缺乏NHB1結(jié)構(gòu)域。

    Figure 1.Schematic structures of NRF1,NRF2 and NRF3.These proteins share Cap'n'collar(CNC)and a basic leucine zipper(bZIP)domains in their C-terminus region.They contain one or two acidic domains(AD1,AD2 or AD2L)that regulate the transcriptional activation.The N-terminal domain(NTD)of NRF1 and NRF3 has a transmembrane region that can an?chor proteins to the endoplasmic reticulum membrane.In addition,both of them contain an Asn/Ser/Thr-rich(NST)do?main,which isa target for N-glycosylation.圖1 NRF1、NRF2和NRF3的結(jié)構(gòu)示意圖

    NRF3在組織和細(xì)胞中的表達(dá)水平已有研究。人類NRF3轉(zhuǎn)錄本從妊娠第12周至足月期間存在于胎盤絨毛中,特別是在滋養(yǎng)層細(xì)胞中高度表達(dá),但在成纖維細(xì)胞中不表達(dá)。與組織中一致,NRF3轉(zhuǎn)錄本和蛋白在來源于人胎盤滋養(yǎng)層腫瘤的BeWo和JAR細(xì)胞系中高表達(dá)。細(xì)胞因子TNF-α能促進胎盤細(xì)胞中NRF3的mRNA和蛋白表達(dá),提示NRF3可能參與TNF-α介導(dǎo)的信號通路[9]。NRF3在人其他組織中的表達(dá)程度不同,如在心臟、腦、肺、腎臟、胰腺、結(jié)腸、胸腺和脾臟有表達(dá),而在睪丸、前列腺、骨骼肌和卵巢內(nèi)幾乎不表達(dá)。

    2 NRF3的表達(dá)調(diào)節(jié)機制

    2.1 NRF3的翻譯后修飾 在生理條件下NRF3表達(dá)受到嚴(yán)格的調(diào)控,其在細(xì)胞內(nèi)主要是通過泛素-蛋白酶體途徑降解,以維持穩(wěn)定的水平,此過程可能涉及多個信號分子參與[8]。Kannan等[10]的研究首次提出含F(xiàn)框/WD重復(fù)域蛋白7(F-box/WD repeat-con?taining protein 7,F(xiàn)BW7)和糖原合成酶激酶3(glyco?gen synthase kinase 3,GSK3)共同介導(dǎo)NRF3的降解。FBW7基因編碼的蛋白屬于F-box蛋白家族的一員,為SCF型泛素連接酶識別目標(biāo)蛋白的關(guān)鍵組分,可介導(dǎo)包括癌蛋白在內(nèi)的許多重要蛋白質(zhì)的泛素化,如cyclin E、c-Myc、Mcl-1、mTOR等,進而經(jīng)26S蛋白酶體降解[10]。GSK3是一種絲氨酸蛋白激酶,可通過磷酸化FBW7的結(jié)合位點而增加FBW7與其底物之間的親和力。此外,有學(xué)者提出NRF3在細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞核中通過不同的途徑降解[11]。生理條件下NRF3在胞質(zhì)內(nèi)是通過羥甲基戊二酰輔酶A還原酶降解蛋白1(3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase degra?dation protein 1,HRD1;定位于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜上的泛素連接酶,介導(dǎo)內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中底物的跨膜轉(zhuǎn)位[12])和含纈酪肽蛋白(valosin-containing protein,VCP;也稱為p97,是一種高度保守的ATP酶,通過水解ATP將多肽從膜上分離出來)進行降解,在細(xì)胞核中則通過含β-轉(zhuǎn)導(dǎo)蛋白重復(fù)域蛋白(β-transducin repeat-containing pro?tein,β-TrCP;F-box蛋白家族的成員,是SCF泛素連接酶E3的關(guān)鍵組分[13])促進其泛素化降解[11]。

    2.2 NRF3的核轉(zhuǎn)位 研究表明,NRF2對于機體抵抗氧化應(yīng)激具有重要作用,生理情況下細(xì)胞質(zhì)中的NRF2不斷被Cul3-Keap1泛素連接酶復(fù)合體泛素化,并經(jīng)蛋白酶體途徑迅速降解,氧化應(yīng)激會抑制NRF2在胞質(zhì)中的降解,促使未降解的NRF2轉(zhuǎn)位進入細(xì)胞核結(jié)合ARE而調(diào)控靶基因的表達(dá)[14-15]。當(dāng)抑制NRF3胞質(zhì)降解關(guān)鍵基因HRD1和VCP的表達(dá)時,NRF3在細(xì)胞質(zhì)積聚,但細(xì)胞核內(nèi)NRF3的含量卻未見增加,顯示NRF3入核與其細(xì)胞質(zhì)內(nèi)泛素化降解無關(guān),其核轉(zhuǎn)位機制不同于NRF2[11]。有研究表明,天冬氨酰蛋白酶DDI2(DNA-damage inducible 1 homolog 2)的N末端含有泛素樣(ubiquitin-like,UBL)結(jié)構(gòu)域,能以較弱的親和力結(jié)合泛素,已知人體內(nèi)DDI2的UBL結(jié)構(gòu)域參與NRF1核轉(zhuǎn)位前的加工,DDI2的表達(dá)下調(diào)抑制了NRF1的核轉(zhuǎn)位,并伴有胞質(zhì)內(nèi)NRF1的增加[5,16-17]。Chowdhury等[11]證實NRF3進入細(xì)胞核內(nèi)的過程與此相似,DDI2識別多聚泛素化的NRF3并對其N末端NHB2結(jié)構(gòu)域中的AWLVH基序進行切割,從而促進NRF3的核轉(zhuǎn)位;而對于NRF3哪些位點的泛素化介導(dǎo)了DDI2的識別切割,目前未有報道。

    2.3 NRF3調(diào)控的靶基因 鑒定NRF3調(diào)控的靶基因有助于深入了解其在生物體內(nèi)所發(fā)揮的功能。在氧化應(yīng)激環(huán)境下,NRF2進入細(xì)胞核內(nèi)與ARE相互作用,啟動下游編碼抗氧化蛋白和II相解毒酶的基因表達(dá),發(fā)揮細(xì)胞保護功能[18]。盡管NRF3的生物學(xué)特征在很多方面與NRF2類似,但研究發(fā)現(xiàn)其調(diào)控作用與NRF2相反:體外細(xì)胞實驗的結(jié)果表明,在氧化劑叔丁基對苯二酚(tert-butylhydroquinone,t-BHQ)的誘導(dǎo)下,NRF3負(fù)性調(diào)控其下游基因NQO1的表達(dá),使細(xì)胞難以抵抗氧化應(yīng)激損傷[19]。此外,NRF3還可通過結(jié)合Prdx6啟動子區(qū)域內(nèi)的ARE,進而實現(xiàn)對Prdx6基因的負(fù)性調(diào)控[20]。有學(xué)者初步分析了NRF1、NRF2和NRF3所調(diào)控基因的異同,發(fā)現(xiàn)了31個共同調(diào)控的基因,其中27個基因的調(diào)控機制相似;同時也發(fā)現(xiàn)了22個僅由NRF3調(diào)控的基因[21]。葡萄糖轉(zhuǎn)運蛋白1(glucose transporter 1,GLUT1;由SLC2A1基因編碼)受NRF3的正向調(diào)控,這可能與癌細(xì)胞的代謝重編程過程相關(guān)[22]。盡管有報道稱UHMK1(U2AF homology motif kinase 1)是NRF3的靶基因[11],但是UHMK1上不含有功能的ARE位點,故其可能是被NRF3間接調(diào)節(jié)[23]。

    近來在干細(xì)胞分化研究領(lǐng)域發(fā)現(xiàn),NRF3可通過直接結(jié)合到平滑肌細(xì)胞特異性基因啟動子區(qū)域內(nèi)的CArG盒,來調(diào)節(jié)平滑肌細(xì)胞特異性基因SMαA(smooth muscleα-actin)和SM22α(smooth muscle pro?tein 22α)的表達(dá)[24]。體外實驗研究表明,NRF3還可以直接與Pla2g7(phospholipase A2group VII)基因啟動子結(jié)合,激活Pla2g7基因表達(dá),進而促進干細(xì)胞向平滑肌細(xì)胞分化[25]。

    此外,有學(xué)者認(rèn)為NRF3可以負(fù)調(diào)控NRF2的表達(dá),NRF2啟動子的近端區(qū)域有一個近似于ARE的功能序列,NRF3通過結(jié)合此序列來調(diào)控NRF2基因的表達(dá)[26-27]。目前對于NRF3調(diào)控的靶基因尚不十分明確,這也是NRF3的功能復(fù)雜、多樣,且不同于NRF2的原因之一。

    3 NRF3的生物學(xué)功能

    3.1 NRF3在腫瘤發(fā)生發(fā)展中的作用 人類癌癥基因組計劃已經(jīng)將NRF3歸入127個顯著突變基因譜中,認(rèn)為NRF3其能顯著誘導(dǎo)癌癥的發(fā)生[28]?;蛐酒瑪?shù)據(jù)分析發(fā)現(xiàn)NRF3在霍奇金淋巴瘤和套細(xì)胞淋巴瘤等多種淋巴腫瘤中高表達(dá)[29-30]。除血液系統(tǒng)惡性腫瘤外,NRF3在結(jié)直腸癌、乳腺癌、甲狀腺癌、肝癌和睪丸癌等腫瘤組織中均有報道出現(xiàn)高表達(dá)[31-36]。NRF3的表達(dá)量可能與某些腫瘤的預(yù)后相關(guān)。Wang等[37]的一項回顧性研究表明,與癌旁組織相比,胰腺癌組織中NRF3的mRNA和蛋白表達(dá)量均顯著增加,NRF3表達(dá)量高的患者更易發(fā)生淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移,且腫瘤TNM分期更高,預(yù)后更差;多變量分析表明NRF3和腫瘤病理分級可作為胰腺癌患者總體生存率的獨立預(yù)測因子。近來有研究顯示NRF2可通過結(jié)合ARE誘導(dǎo)多種抗氧化蛋白和II相解毒酶的合成,從而增強尿路上皮癌細(xì)胞對順鉑的耐藥性[38]。ARE也是NRF3的結(jié)合位點,關(guān)于NRF3是否在腫瘤患者發(fā)生化療耐藥過程中起作用目前則尚未有相關(guān)報道。

    NRF3在不同腫瘤發(fā)生中的作用有所差別。例如,NRF3表達(dá)與肝癌的腫瘤分級和病理T分期呈顯著正相關(guān),敲減NRF3可以抑制肝癌細(xì)胞的侵襲和轉(zhuǎn)移[36]。然而Chevillard等[39]的動物實驗通過管飼法讓小鼠暴露在化學(xué)致癌物苯并芘下,與野生型小鼠相比,NRF3缺失型小鼠對苯并芘更加敏感,30周后死亡率顯著增加(死亡率分別是6%和32%),組織病理學(xué)分析顯示NRF3缺失型小鼠更易患T淋巴母細(xì)胞性淋巴瘤(67%),這個結(jié)果表明NRF3能抑制某些血液系統(tǒng)惡性腫瘤的發(fā)生。Sun等[33]觀察到NRF3的表達(dá)在乳腺癌中被顯著抑制,并與腫瘤的轉(zhuǎn)移與分期呈現(xiàn)負(fù)相關(guān);過表達(dá)NRF3能顯著抑制腫瘤惡性增殖能力并延緩上皮-間充質(zhì)轉(zhuǎn)化過程。Zhou等[40]發(fā)現(xiàn)NRF3在結(jié)直腸癌中處于低表達(dá)狀態(tài),且NRF3的低表達(dá)與更差的預(yù)后顯著相關(guān);過表達(dá)NRF3后結(jié)直腸癌細(xì)胞的增殖、轉(zhuǎn)移和侵襲能力均顯著降低。因此,NRF3對腫瘤發(fā)生(促進或抑制)的作用可能與腫瘤的類型及腫瘤所處的微環(huán)境有關(guān)。

    目前NRF3在腫瘤發(fā)生過程中的確切機制尚未完全闡明,此過程可能涉及多種信號通路參與。UHMK1是一種絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶,在有絲分裂原的激活下其表達(dá)上調(diào)并使細(xì)胞周期蛋白依賴性激酶抑制劑p27Kip1磷酸化,磷酸化的p27Kip1從核內(nèi)遷移到細(xì)胞質(zhì)中,使細(xì)胞周期正常進行,UHMK1活性異常增高能促進腫瘤的發(fā)展[41]。Chowdhury等[11]通過敲減NRF3后觀察到UHMK1的mRNA和蛋白表達(dá)降低,證實了NRF3通過誘導(dǎo)UHMK1的表達(dá)來促進結(jié)腸癌細(xì)胞增殖。此外,NRF3可降低下游抗氧化基因的表達(dá),使細(xì)胞代謝過程產(chǎn)生的活性氧增加,繼而改變和破壞細(xì)胞內(nèi)生物大分子結(jié)構(gòu),從而促進腫瘤發(fā)生[42]。NRF3還可以通過調(diào)節(jié)細(xì)胞內(nèi)血管內(nèi)皮生長因子A(vascular endothelial growth factor A,VEGFA;腫瘤血管生成的關(guān)鍵因子)的水平來促進腫瘤進展[37]。Aono等[22]則提出了β-catenin/T細(xì)胞因子(T-cell factor,TCF)-NRF3軸促進腫瘤生成,其中APC(adenomatous polyposis coli)基因缺失是重要的第一步,其缺失導(dǎo)致β-catenin及TCF4介導(dǎo)的相關(guān)基因的激活及表達(dá),如NRF3,進而上調(diào)GLUT1基因表達(dá)水平和促進腫瘤細(xì)胞增殖。Sun等[33]探究了NRF3抗乳腺癌的潛在機制,結(jié)果表明NRF3通過抑制AKT的磷酸化繼而影響ID3(inhibitor of DNA binding 3,HLH protein)的表達(dá),從而發(fā)揮抗癌作用。Zhou等[40]在結(jié)直腸癌中觀察到NRF3的缺失促進表皮生長因子受體(epidermal growth factor receptor,EGFR)和p38的磷酸化激活及表達(dá)增加,同時促進EGFR和p38下游分子(AKT、ATF2、CHOP等)的表達(dá),進而增強細(xì)胞的增殖能力,促進結(jié)直腸癌發(fā)生發(fā)展。Waku等[43]觀察到腫瘤對NRF3的依賴性,并提出了NRF3-蛋白酶體成熟蛋白(proteasome maturation protein,POMP)-20S蛋白酶體軸介導(dǎo)的非泛素依賴蛋白質(zhì)降解;NRF3通過誘導(dǎo)POMP分子伴侶的表達(dá),激活非泛素依賴的20S蛋白酶體裝配,降解腫瘤抑制因子p53和Rb,從而促進腫瘤的生長及惡性進展。

    3.2 NRF3抑制炎癥的發(fā)生 已有研究表明NRF3可能與炎癥發(fā)生有關(guān)。Kitaya等[44]在研究人子宮微血管內(nèi)皮細(xì)胞內(nèi)干擾素γ(interferon-γ,IFN-γ)調(diào)節(jié)的靶基因時發(fā)現(xiàn)IFN-γ處理能上調(diào)NRF3基因的表達(dá),發(fā)揮抗炎作用;動物實驗研究也表明NRF3能抑制炎癥的發(fā)生。有研究用酚類抗氧化劑丁羥甲苯處理野生型和NRF3缺陷型小鼠,可引起小鼠廣泛肺泡損傷和血管周圍炎癥細(xì)胞浸潤,主要表現(xiàn)為呼吸困難和體重下降;與野生型小鼠相比,NRF3缺陷型小鼠體重下降更加顯著,且處理后的野生型小鼠肺組織中NRF3的表達(dá)量降低[45]。Braun等[46]研究了NRF2敲除小鼠的創(chuàng)傷修復(fù)過程,發(fā)現(xiàn)在創(chuàng)傷修復(fù)早期,參與創(chuàng)面愈合的各種關(guān)鍵分子的表達(dá)明顯減少,修復(fù)后期炎癥持續(xù)時間延長,然而NRF2敲除小鼠并沒有表現(xiàn)出明顯的組織學(xué)異常;與野生型小鼠相比,NRF2敲除小鼠在受傷前及傷后1 d的皮膚中NRF3的mRNA表達(dá)上調(diào),其可能是NRF2無表達(dá)的代償機制,且NRF2和NRF3均可在角質(zhì)細(xì)胞生長因子(ke?ratinocyte growth factor,KGF)的作用下表達(dá)上調(diào)。

    3.3 NRF3促進干細(xì)胞分化 近年來的研究還發(fā)現(xiàn)NRF3在胚胎干細(xì)胞向平滑肌細(xì)胞分化過程中起重要作用[24]。在平滑肌細(xì)胞分化過程中NRF3的mRNA和蛋白表達(dá)上調(diào),到分化第4天時達(dá)到高峰,在干細(xì)胞分化過程中NRF3易位到細(xì)胞核內(nèi),通過募集SRF/心肌素復(fù)合物,或直接結(jié)合平滑肌特異性基因的啟動子區(qū)域,啟動α-SMA和SM22α基因的表達(dá)[24]。此外,NRF3通過增加NADPH氧化酶4(NADPH oxidase 4,NOX4)、下調(diào)抗氧化酶的表達(dá),使超氧化物的產(chǎn)生增加,促進平滑肌分化[24]。因此,NRF3是干細(xì)胞分化的重要調(diào)節(jié)器。Xiao等[25]在探索Pla2g7與干細(xì)胞分化的關(guān)系時,發(fā)現(xiàn)NRF3是Pla2g7的上游調(diào)控基因,NRF3被內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激激活后,通過轉(zhuǎn)錄激活調(diào)節(jié)Pla2g7基因表達(dá),使Pla2g7表達(dá)上調(diào),產(chǎn)生超氧化物,進而介導(dǎo)血清應(yīng)答因子(serum response factor,SRF)與平滑肌特異性基因啟動子的結(jié)合,促進平滑肌特異性基因表達(dá)。目前,NRF3在干細(xì)胞分化中的調(diào)控機制尚未完全明確,現(xiàn)有的研究大多來自體外實驗,需要后續(xù)更多的體內(nèi)研究進行驗證。

    4 結(jié)語與展望

    NRF3是一種受嚴(yán)格調(diào)控和轉(zhuǎn)錄翻譯后修飾的轉(zhuǎn)錄因子。糖基化修飾是其重要的修飾方式,但NRF3蛋白是否存在其他轉(zhuǎn)錄后修飾對其功能的調(diào)節(jié),如磷酸化、類泛素化和棕櫚?;揎椀壬写芯俊RF3作為干性標(biāo)志基因在干細(xì)胞分化早期上調(diào),但是其具體作用尚未明確。雖然有研究報道了NRF3可能調(diào)控的靶基因,如Prdx6、Nqo1、α-SMA、SM22α、NOX4等,但仍缺乏它們體內(nèi)相關(guān)性的足夠證據(jù)?;虮磉_(dá)譜芯片研究顯示NRF3轉(zhuǎn)錄本在人類多種癌癥中表達(dá)上調(diào),但僅反映了其mRNA表達(dá)水平;對這些組織中誘導(dǎo)表達(dá)的轉(zhuǎn)錄本是編碼有功能還是突變的轉(zhuǎn)錄因子,以及亞細(xì)胞內(nèi)調(diào)控和在腫瘤發(fā)生中的具體作用機制尚未十分明確;NRF3及其相關(guān)通路將可能成為癌癥患者治療的新的潛在靶點。作為一直被忽視的CNC家族轉(zhuǎn)錄因子,NRF3的研究正逐步進入公眾視野,因此明確NRF3表達(dá)的調(diào)控因子及其調(diào)控的靶基因,以及調(diào)控其轉(zhuǎn)錄因子活性的相關(guān)通路和機制,對于全面了解其在人類生理活動或疾病中的功能和調(diào)節(jié)具有重要研究意義。

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