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      基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)對(duì)生姜藥用活性成分的發(fā)現(xiàn)和作用機(jī)制分析

      2021-08-03 03:16:34雷丹洪滔伍慶華羅小泉陳來(lái)劉志勇江西中醫(yī)藥大學(xué)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物科技中心南昌0004江西中醫(yī)藥大學(xué)臨床醫(yī)學(xué)院南昌0004江西中醫(yī)藥大學(xué)中醫(yī)學(xué)院南昌0004江西省中藥藥理學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室南昌0004
      關(guān)鍵詞:作用點(diǎn)生姜靶點(diǎn)

      ★ 雷丹 洪滔 伍慶華 羅小泉,4 陳來(lái),4 劉志勇,4(.江西中醫(yī)藥大學(xué)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物科技中心 南昌 0004;.江西中醫(yī)藥大學(xué)臨床醫(yī)學(xué)院 南昌 0004;.江西中醫(yī)藥大學(xué)中醫(yī)學(xué)院 南昌 0004;4.江西省中藥藥理學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 南昌 0004)

      生姜(Zingiberofficinale Roscoe)屬于姜科多年生草本植物姜的新鮮根狀莖部分,是人們喜歡用的調(diào)味品或菜肴,具有溫中止嘔、溫肺止咳、發(fā)散風(fēng)寒等功效[1],現(xiàn)在被列為藥食兩用的中藥材?;瘜W(xué)成分分析顯示生姜中有多達(dá)100余種化學(xué)成分,分屬揮發(fā)油、姜辣素、二苯基庚烷三大類(lèi)[2]。國(guó)內(nèi)外研究表明,生姜的主要藥理作用有止吐、抗腫瘤、抗氧化、免疫調(diào)節(jié)、抗炎等[3-5]。近年來(lái),網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析技術(shù)的出現(xiàn),應(yīng)用文本挖掘等方法建立生物信息關(guān)系網(wǎng)絡(luò),解析網(wǎng)絡(luò)拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)并進(jìn)行中藥作用的多靶點(diǎn)預(yù)測(cè),為新藥研發(fā)提供新思路[6-9]。在綜合中藥系統(tǒng)藥理學(xué)解析平臺(tái)(TCMSP)和batman數(shù)據(jù)庫(kù)的基礎(chǔ)上,應(yīng)用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的分析技術(shù)對(duì)生姜的主要功能物質(zhì)進(jìn)行細(xì)分,并結(jié)合功能成分分析作用靶點(diǎn)、有關(guān)生物信號(hào)路徑和疾病信息,研究了生姜的主要活性成分的功能及其發(fā)揮藥理作用的機(jī)制,為生姜的深入開(kāi)發(fā)和多層次應(yīng)用提供了科學(xué)依據(jù)。

      1 資料獲得與方法

      1.1 數(shù)據(jù)庫(kù)與處理軟件[10-16]數(shù)據(jù)庫(kù)(中藥系統(tǒng)藥理學(xué)分析與TCMSP)(https://tcmspw.com/tcmsp.php);BATMAN-TCM線(xiàn)上解析數(shù)據(jù)庫(kù)(http://bionet.ncpsb.org/batman-tcm/);UniProt蛋白質(zhì)通用數(shù)據(jù)庫(kù)(http:// www.uniprot. org/uploadlists/);CTD數(shù) 據(jù)庫(kù)(http://ctdbase.org/);蛋白質(zhì)互作平臺(tái)STRING V 10.5(https://string-db.org/);生物學(xué)信息注釋數(shù) 據(jù) 庫(kù)DAVID V 6.8(https://david.ncifcrf.gov/);cytoscape 3.7.2作圖軟件。

      1.2 主要活性成分的收集和靶點(diǎn)獲取本研究通 過(guò) 檢 索TCMSP(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,中藥系統(tǒng)藥理數(shù)據(jù)庫(kù)和分析平臺(tái))相關(guān)信息,對(duì)獲得的生姜所有活性成分?jǐn)?shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行了篩分選擇,其中篩分條件為:經(jīng)口服藥的生物利用度(oral bioavailability,OB)≥30 %、藥物相似的類(lèi)藥性(drug-likeness,DL)≥0.18[10];其中OB一般認(rèn)為是評(píng)價(jià)藥物是否發(fā)揮藥效的一個(gè)參考指標(biāo)[17],DL代表發(fā)現(xiàn)成分與已知西藥的相似度,對(duì)確定中藥成分是否在機(jī)體產(chǎn)生作用具有重要參考意義[18]。采用 TCMSP 靶點(diǎn)預(yù)測(cè)模型對(duì)相關(guān)活性功能成分作用靶點(diǎn)加以預(yù)測(cè),通過(guò)UniProt數(shù)據(jù)庫(kù)獲取有關(guān)作用點(diǎn)的DNA片段(基因)名稱(chēng)。利用相關(guān)軟件建立生姜“活性功能成分-作用點(diǎn)”的關(guān)系圖,用互聯(lián)的拓?fù)鋵W(xué)技術(shù)分析關(guān)系圖,并探討其主要功能活性物質(zhì)成分與作用點(diǎn)之間的關(guān)聯(lián)。

      1.3 作用靶點(diǎn)-相關(guān)疾病網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建將生姜主要功能物質(zhì)作用點(diǎn)的關(guān)聯(lián)基因?qū)氲紺TD數(shù)據(jù)線(xiàn)上解析平臺(tái)(tp://ctdbase.org/)數(shù)據(jù)庫(kù),得到與作用點(diǎn)有關(guān)的疾病信息,解析生姜在疾病治療中的作用,同時(shí)結(jié)合已發(fā)表的文獻(xiàn)研究生姜治療的主要疾病,選擇分析軟件Cytoscape 3.7.2(該軟件具有網(wǎng)絡(luò)拓?fù)鋵傩裕┸浖⑸饔命c(diǎn)-疾病信息的關(guān)聯(lián)。在該關(guān)系結(jié)構(gòu)中,代表靶作用的蛋白以節(jié)點(diǎn)表示,代表作用點(diǎn)的相互作用則以“邊”來(lái)表示。采用網(wǎng)絡(luò)分析功能,分析網(wǎng)絡(luò)的拓?fù)鋵傩?,?jì)算其“介數(shù)中心性(Betweennesscentrali-ty)”和“節(jié)點(diǎn)度值分布(Node de-greedistribution)” 參數(shù)[19-20](節(jié)點(diǎn)度值反映了一個(gè)靶作用蛋白與其他靶作用蛋白的連接的多少,而介數(shù)則是經(jīng)過(guò)這一靶蛋白的路徑占最短路徑總數(shù)的比,度值和介數(shù)是量化指標(biāo),用以評(píng)價(jià)一個(gè)靶蛋白(節(jié)點(diǎn))在網(wǎng)絡(luò)中的重要性,具有高的度值和介數(shù)值節(jié)點(diǎn)可以成為后續(xù)新藥的發(fā)現(xiàn)和靶點(diǎn)預(yù)測(cè)提供線(xiàn)索),故此最后利用該屬性分析來(lái)尋找生姜發(fā)揮藥效作用的主要功能成分。

      1.4 相關(guān)靶蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)的建構(gòu)為研究生姜主要活性功能成分有關(guān)靶作用蛋白之間的聯(lián)系,在STRING平臺(tái)上建立其相互作用靶蛋白之間的PPI網(wǎng)絡(luò)。在運(yùn)行前需要進(jìn)行有關(guān)設(shè)置,首先需要將物種設(shè)為人類(lèi)(Homo sapiens),其次要將最低相互作用閥值設(shè)為中等置信度(Medium confidence),一般為0.4,其余參數(shù)的設(shè)置保持默認(rèn)就可以了,然后通過(guò)軟件對(duì)PPI網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行拓?fù)鋵傩赃M(jìn)行研究,繼而篩選并討論P(yáng)PI網(wǎng)絡(luò)中的關(guān)鍵靶作用蛋白。

      1.5 生物過(guò)程和通路分析基于上述結(jié)果,通過(guò)生物學(xué)信息注釋數(shù)據(jù)庫(kù)DAVID 6.8,篩選出最多富集的生物學(xué)注釋。對(duì)生姜主要活性功能成分的靶基因采用KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行路徑和基因本體GO的相關(guān)生物過(guò)程富集,以分析生姜主要活性功能成分作用點(diǎn)的主要代謝路徑及GO生物過(guò)程(結(jié)果中如P<0.05則判為具有關(guān)聯(lián)性)。

      2 結(jié)果

      2.1 生姜化學(xué)成分篩選通過(guò)TCMSP數(shù)據(jù)庫(kù)篩選潛在的活性化合物,共獲得生姜的化學(xué)成分共265個(gè),對(duì)其在體內(nèi)的吸收、分布、代謝、排泄(ADME)過(guò)程中的性質(zhì)進(jìn)行評(píng)價(jià),最終以O(shè)B≥30%和DL≥0.18作為化合物篩分選擇的條件,結(jié)合CNKI文獻(xiàn)報(bào)道,共獲得10個(gè)活性功能成分,如豆甾醇、β-谷甾醇、6-姜酚、6-姜烯酚等。把靶點(diǎn)名稱(chēng)輸入U(xiǎn)niProt數(shù)據(jù)庫(kù),獲得其相應(yīng)人源靶點(diǎn)的基因名稱(chēng)。其中二氫辣椒堿(Dihydrocapsaicin)、8-姜酚(8-gingerol)未在TCMSP平臺(tái)上查到相關(guān)作用靶點(diǎn)信息,因此共獲得生姜的主要活性功能成分8個(gè),如表1所示。

      表1 生姜主要活性成分基本信息

      2.2 “活性功能成分-作用靶點(diǎn)”網(wǎng)絡(luò)圖分析將篩分出的8個(gè)活性功能成分和其相互作用的靶點(diǎn)通過(guò)軟件構(gòu)建成網(wǎng)絡(luò)圖,如圖1所示。圖1包含82個(gè)節(jié)點(diǎn)(8個(gè)活性功能成分和74個(gè)相關(guān)作用靶點(diǎn))和119條線(xiàn),功能活性成分以圓圖標(biāo)表示,相關(guān)作用靶點(diǎn)以三角形表示,活性功能成分與相關(guān)靶點(diǎn)之間的關(guān)系則以線(xiàn)條來(lái)表示。目前普遍認(rèn)為度值和節(jié)點(diǎn)與活性功能成分的重要性呈正相關(guān)性的關(guān)系,值越大,相應(yīng)的節(jié)點(diǎn)在活性成分靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)圖中越重要[21]。圖1中,MOL000358(β-谷甾醇)的度值為38,表明這個(gè)活性功能成分的靶點(diǎn)共有38個(gè),最大。MOL000449(豆甾醇)度值為31,MOL002467(6-姜酚)的度值為26,靶點(diǎn)較多的成分提示其在生姜的藥理作用中就可能起到關(guān)鍵作用。生姜在越來(lái)越多的研究中顯示具有抗炎、抗腫瘤等廣泛生理活性[22-23];β-谷甾醇、豆甾醇對(duì)人肝癌細(xì)胞活性具有明顯的增殖抑制作用生姜揮發(fā)油研究進(jìn)展,6-姜酚對(duì)人乳腺癌細(xì)胞遷移有明顯的抑制作用;生姜主要活性成分中MOL001771(B-谷甾醇)的度值為2,最低,可見(jiàn),不同活性功能成分的作用靶點(diǎn)數(shù)量是不一樣,作用靶點(diǎn)的差異體現(xiàn)了其發(fā)揮藥理作用的強(qiáng)度不一樣。相關(guān)靶點(diǎn)ADRA1B、SCN5A、ADRB2、CHRM1的度值均為4,說(shuō)明這些可能是生姜發(fā)揮整體藥效的關(guān)鍵靶點(diǎn),作用靶點(diǎn)與多個(gè)有效成分具有相互作用關(guān)系,表明生姜發(fā)揮其藥理作用是多靶點(diǎn)協(xié)同作用的結(jié)果。

      圖1 活性成分-靶點(diǎn)圖

      2.3 “成份靶點(diǎn)-疾病”網(wǎng)絡(luò)圖分析通過(guò)CTD在線(xiàn)分析平臺(tái)分析成份與靶點(diǎn)有關(guān)的疾病, ACHE、BCL2L1、GBRA2、GBRA3、GBRA5、LACTBL1暫 時(shí)沒(méi)有找到相關(guān)的疾病信息,刪除這部分作用點(diǎn),共獲得65個(gè)與疾病相關(guān)的點(diǎn)。通過(guò)軟件構(gòu)建“成份作用靶點(diǎn) - 疾病”網(wǎng)絡(luò)圖,包含65個(gè)靶作用點(diǎn)和34種相關(guān)疾病,共99個(gè)節(jié)點(diǎn)和2 271條線(xiàn)。圖中“V”代表相關(guān)疾病,相關(guān)靶點(diǎn)以方形圖代表, “線(xiàn)”代表活性功能成分與疾病靶點(diǎn)的關(guān)系,如圖2所示。34種有關(guān)疾病包括腫瘤、心血管疾病、神經(jīng)系統(tǒng)疾病、免疫系統(tǒng)疾病等?!俺煞葑饔冒悬c(diǎn)-疾病”網(wǎng)絡(luò)圖中度值較大的疾病包括腫瘤、心血管疾病、神經(jīng)系統(tǒng)疾病、血管疾病等,表明生姜的主要活性成分可能有利于治療腫瘤、神經(jīng)系統(tǒng)疾病、心血管疾病等都有作用。其度值較大的靶作用點(diǎn)有PTGS2等,與其相關(guān)的疾病分別有41、40、40、39個(gè),表明這些靶作用點(diǎn)在生姜治療的疾病中可以發(fā)揮比較大的作用,也體現(xiàn)了生姜治療疾病的多成分、多靶點(diǎn)的協(xié)同作用的特性。

      圖2 靶點(diǎn)-疾病圖

      2.4 靶作用蛋白PPI網(wǎng)絡(luò)分析生姜靶蛋白PPI聯(lián)系圖顯示有63個(gè)交匯節(jié)點(diǎn)(6個(gè)靶蛋白未參與蛋白的相互作用分析)、反應(yīng)作用連線(xiàn)300條。經(jīng)計(jì)算,PPI 聯(lián)系圖中度值平均為10.526,介數(shù)平均為0.025。進(jìn)一步把度值、介數(shù)都排序在前1/3的作用蛋白(排名前19的作用蛋白)建立交集,區(qū)分出度值高、介數(shù)大的作用蛋白共有9個(gè),提示這些作用靶蛋白是生姜發(fā)揮治療作用的PPI關(guān)系網(wǎng)絡(luò)中的關(guān)鍵靶作用點(diǎn),在該關(guān)系圖中發(fā)揮了關(guān)鍵作用。關(guān)鍵作用點(diǎn)及拓?fù)鋮?shù)見(jiàn)表2。

      表2 生姜靶蛋白PPI關(guān)系圖中的關(guān)鍵作用點(diǎn)及其拓?fù)鋮?shù)

      2.5 代謝通路 KEGG分析生姜主要功能功能成分中67個(gè)作用基因中有59個(gè)富集在KEGG代謝通路中,牽涉74條KEGG代謝通路,其中P≤0.05 的信號(hào)通路有65條,將相關(guān)性排序前十的生物功能如表3所示?;驍?shù)目較多的主要代謝通路有:癌癥信號(hào)通路、尿液配體-受體相互作用、乙型肝炎、Ca2+信號(hào)通路、癌中的蛋白聚糖代謝、3K-Akt信號(hào)通路、酒精性脂肪肝?。∟AFLD)、MP信號(hào)通路、視光、直腸癌、嗎啡成癮、可卡因成癮、甲狀腺激素信號(hào)通路、心肌細(xì)胞中的神經(jīng)信號(hào)、PK信號(hào)通路,另有P>0.05的茶堿和其他因子調(diào)節(jié)的鈣重吸收、ll樣受體信號(hào)通路、子宮癌、卵母細(xì)胞跨內(nèi)皮遷移、D樣受體信號(hào)通路、Tural殺傷細(xì)胞介導(dǎo)的細(xì)胞毒性、花生四烯酸代謝等信號(hào)通路,但這些通路在其他文獻(xiàn)中報(bào)道也與生姜治療疾病的過(guò)程有關(guān)。由此可見(jiàn),生姜具有通過(guò)調(diào)節(jié)多條代謝通路的能力進(jìn)而發(fā)揮治療疾病的作用。

      表3 生姜主要活性功能成分代謝通路與相關(guān)靶基因

      2.6 GO生物過(guò)程分析將上述得到的74個(gè)靶點(diǎn)輸入到DAVID數(shù)據(jù)庫(kù)中,通過(guò)生物學(xué)功能富集以分析其生物學(xué)過(guò)程。共得到212條生物過(guò)程,其中有顯著差異的生物過(guò)程共有159條,將排序前十的相關(guān)性生物功能列入表4所示。GO分析生姜相關(guān)靶點(diǎn)的生物學(xué)功能分布發(fā)現(xiàn),主要影響的生物過(guò)程有與藥物反應(yīng)、AC激活腎上腺素能受體信號(hào)通路、神經(jīng)元凋亡過(guò)程的正調(diào)控、與雌二醇反應(yīng)、突觸傳遞(膽堿能)、平滑肌收縮的正調(diào)控、AC抑制G蛋白偶聯(lián)乙酰膽堿受體信號(hào)通路、磷脂酶C激活G蛋白偶聯(lián)的乙酰膽堿受體信號(hào)通路、與脂多糖反應(yīng)、磷脂酶C激活G蛋白偶聯(lián)受體信號(hào)通路等。

      表4 生姜主要活性成分GO生物過(guò)程與靶基因

      3 討論

      網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)能在一定程度上反映生物大分子與化學(xué)成分之間的相互作用,通過(guò)網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法篩選出中藥更有效的活性成分,能夠?yàn)楦嗅槍?duì)性的中藥研究提供基礎(chǔ)[25]。生姜是一種姜科藥食兩用的中藥,具有具有解表散寒、溫中止嘔、化痰止咳等功效,臨床常用于治療治風(fēng)濕痛、腰腿痛,胃、十二指腸潰瘍,瘧疾,急性細(xì)菌性痢疾,急性睪丸炎等,還具有止吐、抗腫瘤、抗氧、抗菌、抗過(guò)敏、調(diào)節(jié)免疫系統(tǒng)的作用[1]。為進(jìn)一步闡述中藥生姜的藥理作用及其作用機(jī)制,借助TCSMP分析平臺(tái),以ADME的參數(shù)OB、DL為閾值,篩選出生姜中具有較好OB、DL的優(yōu)效化合物,并構(gòu)建了化合物-靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò),探索生姜的優(yōu)效化合物與靶點(diǎn)之間的關(guān)系,并對(duì)靶點(diǎn)進(jìn)行了基因水平的功能注釋。為生姜的優(yōu)效化合物所對(duì)應(yīng)的多靶點(diǎn)、多途徑的藥理作用機(jī)制提供了研究基礎(chǔ)。

      生姜的成分復(fù)雜,通過(guò)篩選得出的分子靶標(biāo)可能是生姜發(fā)揮藥理機(jī)制的關(guān)鍵物質(zhì)基礎(chǔ)。研究證實(shí),生姜的主要活性成分6-姜酚和6-姜烯酚可以通過(guò)不同的機(jī)制觸發(fā)胃癌腫瘤細(xì)胞的凋亡[26]。β-谷甾醇(beta-sitosterol)是植物甾醇類(lèi)成分之一,存在于某些植物藥中,具有降血脂、抗癌、抗炎癥等作用,目前β-谷甾醇已應(yīng)用到醫(yī)藥行業(yè)中[27]。且β-谷甾醇、豆甾醇(Stigmasterol)還被研究表明具有抑制人肝癌細(xì)胞SMMC-7721的增殖和誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡的抗腫瘤作用[28]。姜酮(zingerone)是生姜及其制品中清除自由基的一種有效成分[29]。10-姜酚(10-gingerol)能劑量依賴(lài)性的抑制肝癌HepG2細(xì)胞的增殖,抑制Src及其下游的STAT3的激活[30]。說(shuō)明生姜的優(yōu)效成分篩選方法的可行性,且生姜可通過(guò)這些優(yōu)效成分從而治療如癌癥、炎癥、心血管等疾病及發(fā)揮抗氧化作用。

      化合物-靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)中的靶點(diǎn)共有65個(gè)與疾病有關(guān),進(jìn)一步將生姜的靶點(diǎn)進(jìn)行PPI分析得到9個(gè)關(guān)鍵靶點(diǎn),包括TP53、CASP3、JUN、MMP9、RELA、PPARG、HSP90AA1、ACHE、MAOA等。提示生姜可能通過(guò)優(yōu)效化合物與篩選出的關(guān)鍵靶點(diǎn)相互作用從而對(duì)疾病起到治療作用。TP53,也稱(chēng)p53,通過(guò)調(diào)節(jié)凋亡、細(xì)胞生長(zhǎng),影響腫瘤血管的生成等過(guò)程發(fā)揮抗癌的作用,并在基因組穩(wěn)定性中起作用[31]。CASP3(Caspase 3)是一種蛋白質(zhì)編碼基因,CASP3被發(fā)現(xiàn)對(duì)于正常的大腦發(fā)育是必需的,并且在細(xì)胞凋亡中也起著典型的作用,它負(fù)責(zé)染色質(zhì)的濃縮和DNA片段化[32]。JUN是一種蛋白質(zhì)編碼基因,相關(guān)疾病有百日咳和肉瘤,途徑包括ATM途徑以及理化特性與毒性相關(guān)途徑,其編碼的蛋白c-jun,水平的周期性變化在腺上皮細(xì)胞的增殖和凋亡中具有重要意義[33]。MMP9(Matrix Metallopeptidase 9)為MMP家 族的一員,MMP家族是一類(lèi)金屬蛋白酶是鈣依賴(lài)性鋅含內(nèi)肽酶,其在正常的生理過(guò)程中參與細(xì)胞外基質(zhì)的分解,例如胚胎發(fā)育、繁殖、血管生成、骨骼發(fā)育、傷口愈合、細(xì)胞遷移、學(xué)習(xí)和記憶、以及病理過(guò)程如關(guān)節(jié)炎、腦出血和轉(zhuǎn)移[34-35]。RELA,也稱(chēng)為p65,是一種與REL相關(guān)的蛋白,參與NF-κB異二聚體的形成,核易位和激活,已經(jīng)研究證明RELA可調(diào)節(jié)免疫應(yīng)答,并且RELA的活化與多種類(lèi)型的癌癥正相關(guān)[36]。PPARG(Peroxisome proliferator-activated receptor gamma)是一種蛋白質(zhì)編碼基因,與其相關(guān)的疾病包括脂肪營(yíng)養(yǎng)不良、家族性疾病、頸動(dòng)脈內(nèi)膜—中層厚度。HSP90AA1(Heat Shock Protein 90 Alpha Family Class A Member 1)基因在大多數(shù)腫瘤中沒(méi)有改變,目前發(fā)現(xiàn)膀胱癌的改變次數(shù)最多,其次是胰腺癌,在許多腫瘤中,HSP90AA1基因是純合缺失的,這表明這些腫瘤可能具有降低的惡性程度[37-38]。ACHE(Acetylcholinesterase),也稱(chēng)酰水解酶,是體內(nèi)的主要膽堿酯酶。它是一種酶的是催化的擊穿乙酰膽堿和其他一些的膽堿該函數(shù)酯作為神經(jīng)遞質(zhì),主要存在于神經(jīng)肌肉接頭和膽堿能型化學(xué)突觸中,其活性可終止突觸傳遞,是神經(jīng)毒劑和殺蟲(chóng)劑等有機(jī)磷化合物抑制的主要靶點(diǎn)。MAO-A是正常大腦功能的關(guān)鍵調(diào)節(jié)劑。它可通過(guò)氧化脫氨作用降解胺類(lèi)神經(jīng)遞質(zhì),例如多巴胺,去甲腎上腺素和5-羥色胺,能夠以應(yīng)對(duì)諸如缺血和炎癥等應(yīng)激反應(yīng)[39]。說(shuō)明生姜可能是調(diào)控這些核心基因或者網(wǎng)絡(luò)中的其他基因從而調(diào)控如癌癥、炎癥、心血管疾病、行為和神經(jīng)疾病等。

      GO與KEGG分析提示生姜的生物功能主要富集在藥物反應(yīng)、AC激活腎上腺素能受體信號(hào)通路、神經(jīng)元凋亡過(guò)程的正調(diào)控、與雌二醇反應(yīng)、突觸傳遞(膽堿能)、平滑肌收縮的正調(diào)控的過(guò)程。通路主要富集于癌癥信號(hào)通路、尿液配體-受體相互作用、乙型肝炎、Ca2+信號(hào)通路、癌中的蛋白聚糖代謝、3K-Akt信號(hào)通路、酒精性脂肪肝病(NAFLD)、PK信號(hào)通路等相關(guān)通路。其中,癌癥信號(hào)通路不僅在KEGG為顯著性較高的通路,p53和RELA、HSP90AA1等癌癥相關(guān)蛋白在PPI網(wǎng)絡(luò)中也處于中心地位,且PPI網(wǎng)絡(luò)中中心靶點(diǎn)CASP3和MMP9是細(xì)胞凋亡和遷移通路的主要蛋白,說(shuō)明生姜可能是通過(guò)調(diào)控這些靶點(diǎn),從而促腫瘤細(xì)胞凋亡或抑制腫瘤細(xì)胞的遷移等,而起到抗腫瘤的作用。

      4 結(jié)論

      本研究通過(guò)網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的技術(shù)與方法,描繪了生姜多種功能成分-多作用靶點(diǎn)的網(wǎng)絡(luò)關(guān)系,再次印證了中藥起效是通過(guò)“多成分、多靶點(diǎn)”作用的特點(diǎn)。同時(shí)這個(gè)方法可以繼續(xù)用于虛擬篩選生姜有效物質(zhì)并發(fā)現(xiàn)其作用靶點(diǎn),進(jìn)一步闡明生姜活性功能成分、作用靶點(diǎn)、影響通路之間相互作用關(guān)系,對(duì)于發(fā)現(xiàn)生姜及其活性功能成分可以通過(guò)多個(gè)作用靶點(diǎn)、多條代謝通路發(fā)揮藥理藥效作用,為進(jìn)一步研究生姜藥理藥效機(jī)制提供理論依據(jù)。但我們這次的研究也有不足之處,目前工作僅是基于數(shù)據(jù)庫(kù)的分析,通過(guò)數(shù)據(jù)搜集獲取的資料對(duì)藥物的功效進(jìn)行預(yù)測(cè),后續(xù)要更深入了解生姜的藥效物質(zhì)還需要設(shè)計(jì)一些試驗(yàn)加以驗(yàn)證;此次分析的方法,也只是通過(guò)OB和DL的篩分為條件,與生姜的實(shí)際吸收情況有一定的差距,也存在著一定的限制,因?yàn)樗幬锏奈绽貌粌H僅局限于口服,而且口服生物利用度低的成分也需要重視起來(lái),恰恰是這些成分可能存在更廣泛的治療作用,但本研究為生姜藥用價(jià)值的進(jìn)一步合理開(kāi)發(fā)提供了一個(gè)思路。

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