于佳琦,夏亞男,喬曉宏,靳志敏,李鵬亮,王 茹,王 洋,雙 全,
(1.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)食品科學(xué)與工程學(xué)院,內(nèi)蒙古呼和浩特 010018;2.阿巴嘎旗照富經(jīng)貿(mào)有限責(zé)任公司,內(nèi)蒙古錫林郭勒 011400;3.內(nèi)蒙古自治區(qū)食品檢驗(yàn)檢測(cè)中心,內(nèi)蒙古呼和浩特 010018;4.呼和浩特市食品檢驗(yàn)所,內(nèi)蒙古呼和浩特 010018)
錫林郭勒牧區(qū)是蒙古族文化的主要發(fā)源地之一,馬匹和酸馬奶是其民族文化的重要組成部分[1]。2019年錫林郭勒地區(qū)的馬匹數(shù)量超過15萬。母馬的產(chǎn)奶期約73 d,屬于季節(jié)性生產(chǎn)[2],不同季節(jié)馬奶的售價(jià)在30~40元/公斤不等。傳統(tǒng)的酸馬奶是往馬奶中添加天然發(fā)酵劑后,在乳酸菌和酵母菌的作用下產(chǎn)酸產(chǎn)氣的輕度酒精飲料。高品質(zhì)的酸馬奶均勻不分層,具有發(fā)酵的香氣以及二氧化碳的刺激感[1]。發(fā)酵風(fēng)味和保存在很大程度上取決于天然發(fā)酵劑中的微生物群,因此,優(yōu)質(zhì)的天然發(fā)酵劑是維系酸馬奶產(chǎn)品品質(zhì)的關(guān)鍵。為了開發(fā)工業(yè)應(yīng)用的新產(chǎn)品并保護(hù)傳統(tǒng)酸馬奶中的微生物多樣性,對(duì)酸馬奶天然發(fā)酵劑的自有風(fēng)味、微生物組成及功能進(jìn)行詳細(xì)的研究是十分有意義的。
Illumina Miseq測(cè)序是一種高通量、高精度、省時(shí)省力的第二代測(cè)序技術(shù)[3-4],這一技術(shù)可以檢測(cè)到很多非培養(yǎng)、低豐度的微生物[5-6],并且彌補(bǔ)了傳統(tǒng)的基于分離培養(yǎng)和生理生化鑒定建立系統(tǒng)發(fā)育樹的局限,已廣泛應(yīng)用于對(duì)發(fā)酵食品微生態(tài)的研究。近年來,較多研究應(yīng)用分子生物學(xué)技術(shù)探究酸馬奶的微生物群落結(jié)構(gòu),發(fā)現(xiàn)不同地區(qū)以及不同的牧民制作的酸馬奶細(xì)菌群落大多由乳桿菌屬、乳球菌屬、鏈球菌屬、醋酸桿菌屬、腸球菌以及部分低豐度細(xì)菌屬組成[7-8]。由于傳統(tǒng)的酸馬奶天然發(fā)酵劑都是將釀成的酸馬奶取出部分保留而得,因此發(fā)現(xiàn)其細(xì)菌群落組成與發(fā)酵酸馬奶的組成相似[9]。而對(duì)酸馬奶及引子中真菌多樣性的探究比較少,本文是首次使用Illumina MiSeq第二代高通量測(cè)序技術(shù)專門調(diào)查酸馬奶天然發(fā)酵劑中完整的微生物群落多樣性并預(yù)測(cè)其中的功能信息。
本研究采用氣相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用(GC-MS)及Illumina Miseq第二代測(cè)序技術(shù)分析錫林郭勒牧區(qū)酸馬奶天然發(fā)酵劑的主要風(fēng)味物質(zhì)及核心微生物群落結(jié)構(gòu),全面揭示酸馬奶天然發(fā)酵劑的風(fēng)味組成與微生物多樣性,并結(jié)合功能預(yù)測(cè)分析風(fēng)味相關(guān)功能基因,以期為工業(yè)化生產(chǎn)酸馬奶的風(fēng)味調(diào)控、品質(zhì)優(yōu)化和安全保障提供理論依據(jù)。
酸馬奶天然發(fā)酵劑樣本 于2019年6月采自內(nèi)蒙古自治區(qū)錫林郭勒盟阿巴嘎旗的3個(gè)平行樣品(命名為YZ_1,YZ_2,YZ_3),在測(cè)定總酸度和pH后分裝于采樣管,封口并于干冰中轉(zhuǎn)移至實(shí)驗(yàn)室,冷凍保存用于后續(xù)試驗(yàn);3-辛醇(純度≥98%) 上海麥克林生化科技有限公司;E.Z.N.A.?soil DNA kit美國Omega Bio-tek;瓊脂糖 西班牙biowest;FastPfu Polymerase 中國TransGen;AxyPrep DNA Gel Extraction Kit 美國Axygen。
FG2-ELK便攜式pH計(jì) Mettler Toledo;NEVAP-45氮吹儀 美國Organomation;Thermo Trace 1300-ISQ氣相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用儀 美國Thermo;DB-Wax(30 m×0.250 mm×0.25 μm)色譜柱 美國Agilent;日立CF16RN冷凍離心機(jī) 日本Hitachi;DYY-6C電泳儀 北京市六一儀器廠;GeneAmp?9700型PCR儀 美國ABI;5424R高速臺(tái)式冷凍離心機(jī) 美國Eppendorf;Miseq PE300測(cè)序儀 美國Illumina。
1.2.1 酸馬奶天然發(fā)酵劑pH及總酸度測(cè)定 在采樣現(xiàn)場(chǎng)通過便攜式pH計(jì)測(cè)定pH,滴定酸度參照GB 5009.237-2016《食品pH值的測(cè)定》中酚酞指示劑法測(cè)定。
1.2.2 風(fēng)味物質(zhì)測(cè)定方法
1.2.2.1 樣品前處理 參照蘇海榮[10]的方法并稍作改進(jìn),取天然發(fā)酵劑樣品10 g,加入200 μL質(zhì)量濃度為310 mg/L的3-辛醇內(nèi)標(biāo)物,加入氯化鈉至過飽和(有利于香氣物質(zhì)的萃?。?。取溶液于50 mL離心管中,4 ℃下分別用10和5 mL的乙醚以5500 r/min離心5 min萃取2次,合并上層有機(jī)相。氮吹濃縮至約0.2 mL,再以乙醚復(fù)融定容至2.0 mL,無水Na2SO4干燥,0.22 μm有機(jī)相膜過濾,供GC/MS上機(jī)分析。樣品重復(fù)測(cè)定3次。
1.2.2.2 GC-MS檢測(cè)條件 色譜條件:參照洪家麗等[11]方法并稍作改進(jìn),進(jìn)樣口溫度250 ℃;進(jìn)樣不分流,程序升溫為40 ℃保持5 min,以3 ℃/min升溫至200 ℃,保持5 min,再以2 ℃/min升溫至230 ℃,保持10 min。載氣為氦氣,流速1.0 mL/min。質(zhì)譜條件:離子化方式:EI;電子能量70 eV;離子源溫度230 ℃;質(zhì)量掃描范圍40~500 m/z 。
1.2.2.3 定性定量分析 利用Xcalibur工作站NIST譜庫自動(dòng)檢索各組分質(zhì)譜數(shù)據(jù),并結(jié)合保留指數(shù)進(jìn)行定性分析。采用半定量的方法計(jì)算各風(fēng)味化合物的相對(duì)含量,根據(jù)內(nèi)標(biāo)物質(zhì)(3-辛醇)與各組分峰面積比值計(jì)算[12]。
1.2.3 樣品總DNA提取 使用 E.Z.N.A.?soil DNA kit試劑盒進(jìn)行微生物群落總DNA抽提。提取成功后用1%的瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)DNA的提取質(zhì)量,并使用NanoDrop2000測(cè)定DNA濃度和純度。
1.2.4 PCR擴(kuò)增及MiSeq高通量測(cè)序 細(xì)菌16S rRNA基因V3~V4可變區(qū):上游引物:338F(5’-ACTCCT ACGGGAGGCAGCAG-3’),下游引物806R(5’-GG ACTACHVGGGTWTCTAAT-3’)。擴(kuò)增程序:95 ℃預(yù)變性3 min,27個(gè)循環(huán)(95 ℃變性30 s,55 ℃退火30 s,72 ℃延伸30 s),然后72 ℃穩(wěn)定延伸10 min,最后在4 ℃進(jìn)行保存。
真菌ITS區(qū)PCR擴(kuò)增:上游引物:ITS1F(5'-CTTGGTCATTTAGAGGAAGTAA-3'),下游引物:ITS2R(5'-GCTGCGTTCTTCATCGATGC-3')。擴(kuò)增程序:95 ℃預(yù)變性3 min,27個(gè)循環(huán)(95 ℃變性30 s,55 ℃退火30 s,72 ℃延伸45 s),然后72 ℃穩(wěn)定延伸10 min,最后在10 ℃進(jìn)行保存。
PCR反應(yīng)體系為:5×TransStart FastPfu緩沖液4 μL,2.5 mmol/L dNTPs 2 μL,上游引物(5 μmol/L)0.8 μL,下 游 引 物(5 μmol/L)0.8 μL, TransStart FastPfu DNA聚合酶0.4 μL,模板DNA 10 ng,補(bǔ)足至20 μL。每個(gè)樣本3個(gè)重復(fù),將3個(gè)重復(fù)的PCR產(chǎn)物混合,之后使用2%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)產(chǎn)物[13]。使用AxyPrep DNA Gel Extraction Kit純化PCR產(chǎn)物后用 Quantus? Fluorometer進(jìn)行檢測(cè)定量,按照每個(gè)樣本的測(cè)序量要求,進(jìn)行相應(yīng)比例的混合。寄于上海美吉生物醫(yī)藥科技有限公司通過Illumina Miseq PE300平臺(tái)進(jìn)行高通量測(cè)序。
使用Trimmomatic軟件原始測(cè)序序列進(jìn)行質(zhì)控,使用FLASH軟件進(jìn)行拼接,質(zhì)控過濾測(cè)序質(zhì)量低、錯(cuò)配率高和不能進(jìn)行拼接的序列,得到優(yōu)質(zhì)序列進(jìn)行分析處理。利用上海美吉公司提供的Sanger生物云信息平臺(tái)對(duì)測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行細(xì)菌多樣性分析及微生物功能預(yù)測(cè)。
采用液液萃取與氣質(zhì)聯(lián)用法(LLE-GC/MS)測(cè)定鮮馬奶天然發(fā)酵劑中風(fēng)味化合物,總離子流圖見圖1。
由圖1可以看出,風(fēng)味化合物分離效果較好,物質(zhì)種類豐富。在天然發(fā)酵劑中共檢測(cè)到43種風(fēng)味物質(zhì),包括18種酸類、15種酯類、6種醇類、3種芳香族化合物和1種酮,見表1。酸類物質(zhì)是主要風(fēng)味物質(zhì),檢測(cè)到的種類及含量(891.69±2.69 μg/g)均最高,其中乙酸、L-乳酸、棕櫚酸、月桂酸、癸酸和肉豆蔻酸含量均高于80 μg/g,為酸馬奶天然發(fā)酵劑主要酸類物質(zhì)。酸類物質(zhì)的產(chǎn)生主要是通過乳酸菌發(fā)酵底物中的可發(fā)酵糖。酸馬奶天然發(fā)酵劑中L-乳酸是含量最高的酸類物質(zhì),賦予酸馬奶乳的清香以及爽口的風(fēng)味[14]。乙酸具有醋酸味,口感刺激,酸而不澀。辛酸和癸酸能賦予乳制品更好的奶香品質(zhì),其含量越高,對(duì)奶香味的貢獻(xiàn)越大[15]??梢娝犷愇镔|(zhì)為天然發(fā)酵劑的刺激口感及奶香味做出了較大貢獻(xiàn)。
酸馬奶天然發(fā)酵劑中,酯類物質(zhì)種類和總含量(477.04±9.45 μg/g)僅次于酸類物質(zhì)。其中辛酸乙酯、9,12,15-十八碳三烯酸乙酯、乳酸乙酯、月桂酸乙酯、癸酸乙酯和E-11-十六碳烯酸乙酯含量高于40 μg/g,是主要的酯類物質(zhì)。大多數(shù)酯類物質(zhì)都具有水果和花香味,有研究發(fā)現(xiàn)酯類的形成高度依賴于酵母菌的存在,不同的酵母菌株可以提供形成不同的香氣,酯含量的變化也取決于其特定的真菌微生物群落[16]。
圖1 酸馬奶天然發(fā)酵劑風(fēng)味物質(zhì)總離子流圖Fig.1 Total ion current diagram of koumiss natural starter flavor substances
表1 酸馬奶天然發(fā)酵劑中風(fēng)味物質(zhì)Table 1 Flavor substances in koumiss natural starter
醇類物質(zhì)是酸馬奶天然發(fā)酵劑中不可或缺的風(fēng)味物質(zhì),但其風(fēng)味閾值較高,因此對(duì)發(fā)酵乳的風(fēng)味貢獻(xiàn)度較小[17]。本試驗(yàn)中共檢測(cè)到6種醇類物質(zhì),其中2,3-丁二醇、十二硫醇、異戊醇、苯乙醇和異丁醇5種醇類物質(zhì)含量較高。據(jù)報(bào)道,異戊醇具有水果香和雜醇味,苯乙醇具有典型的清甜的玫瑰花香[18],可見不同的醇類物質(zhì)為酸馬奶復(fù)雜的風(fēng)味及口感做出了一定貢獻(xiàn)。此外還檢測(cè)到苯乙烯、1,3-二叔丁基苯、2,6-二叔丁基對(duì)甲酚3種芳香族類和3-羥基-2-丁酮。3-羥基-2-丁酮又稱乙偶姻,是發(fā)酵乳產(chǎn)品中普遍存在的一種對(duì)風(fēng)味有重要貢獻(xiàn)的酮類物質(zhì),它能夠賦予發(fā)酵乳奶香氣[19],對(duì)酸乳奶香味的增加起到?jīng)Q定性作用。
傳統(tǒng)的酸馬奶天然發(fā)酵劑大多是發(fā)酵后的酸馬奶留存下來的一部分,乳酸菌和酵母菌發(fā)酵產(chǎn)生的各種酶通過一系列生化過程將原料乳分解為醇、醛、酯和氨基酸等,從而形成了獨(dú)特的風(fēng)味[20],可見發(fā)酵乳的風(fēng)味品質(zhì)與其微生物群落密切相關(guān),因此綜合分析酸馬奶天然發(fā)酵劑的風(fēng)味組成及微生物多樣性至關(guān)重要。
2.2.1 細(xì)菌和真菌序列的豐度和多樣性 通過Illumina Miseq高通量測(cè)序從3個(gè)酸馬奶天然發(fā)酵劑樣本中共獲得180069條細(xì)菌和187397條真菌高質(zhì)量的優(yōu)化序列,樣本的平均讀數(shù)分別為60023(SD=7028)和62466(SD=8359)。采用RDP classifier貝葉斯算法對(duì)97%相似水平下的OTU進(jìn)行劃分,按最小樣本序列數(shù)進(jìn)行抽平,結(jié)果表明,所有樣本細(xì)菌序列歸屬于5個(gè)門,7個(gè)綱,17個(gè)目,22個(gè)科,33個(gè)屬,49個(gè)種,52個(gè)OTU。所有樣本真菌序列歸屬于4個(gè)門,11個(gè)綱,18個(gè)目,32個(gè)科,43個(gè)屬,59個(gè)種,98個(gè)OTU。
表2是關(guān)于樣本信息及Alpha多樣性指數(shù)表,Alpha多樣性是評(píng)價(jià)微生物群落豐富性和多樣性的指標(biāo)。Chao1和Ace指數(shù)用來估算測(cè)序樣本中所含OTU個(gè)數(shù),反映群落豐富度[21]。本試驗(yàn)中樣本真菌的平均Chao1指數(shù)(83.99±23.62)和Ace指數(shù)(94.51±30.44)均明顯高于細(xì)菌的Chao1指數(shù)(49.89±8.56)和Ace指數(shù)(52.75±6.59)。Simpson和Shannon指數(shù)表征群落多樣性,當(dāng)Simpson指數(shù)值越小,Shannon值越大時(shí),說明群落多樣性越高[22]。結(jié)果顯示細(xì)菌群落多樣性(Simpson指數(shù)0.52±0.06;Shannon指數(shù)1.20±0.12)高于真菌群落多樣性(Simpson指數(shù)0.84±0.05;Shannon指數(shù)0.50±0.13)。以上α多樣性指數(shù)表明該批次酸馬奶發(fā)酵劑雖然真菌物種豐富度高于細(xì)菌,但細(xì)菌的微生物群落多樣性更高。
將抽平后的細(xì)菌和真菌序列作稀釋性曲線,見圖2,稀釋性曲線趨于平緩,且隨著測(cè)序量的增大,實(shí)際觀測(cè)到的物種數(shù)不斷減小,表明測(cè)序量的合理性,但真菌稀釋性曲線中第三組樣本的實(shí)際觀測(cè)到的物種低于其余兩組,說明該組樣本的重復(fù)性略差,可能與樣品本身以及測(cè)序環(huán)境有關(guān)。細(xì)菌和真菌的Shannon-Wiener曲線趨于平坦,測(cè)序趨于飽和,結(jié)合表中樣本的Coverage值均大于99.9%,表明該測(cè)序結(jié)果能充分解釋鮮馬奶發(fā)酵劑樣品的微生物群落信息,僅有很少一部分的微生物群落未被覆蓋到。
2.2.2 細(xì)菌群落組成多形性分析 將每個(gè)OTU代表序列與Silva數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對(duì),結(jié)果見圖3,所有細(xì)菌序列歸屬于5個(gè)細(xì)菌門,包括厚壁菌門(Firmicutes)、變形菌門(Proteobacteria)、放線菌門(Actinobacteria)、擬桿菌門(Bacteroidetes)和Patescibacteria。天然發(fā)酵劑的優(yōu)勢(shì)細(xì)菌門為厚壁菌門,平均相對(duì)豐度87.78%,其次為變形菌門,平均相對(duì)豐度12.00%,兩個(gè)細(xì)菌門總計(jì)占整個(gè)酸馬奶引子樣本的99.78%,而其余未提及到的細(xì)菌門相對(duì)豐度較低,均在1%以下。在屬水平上共鑒定出了33個(gè)細(xì)菌屬。平均相對(duì)豐度大于1%的屬共有五個(gè),包括乳桿菌屬(Lactobacillus)、乳球菌屬(Lactococcus)、醋酸桿菌屬(Acetobacter)、勞特菌屬(Raoultella)和鏈球菌屬(Streptococcus),總計(jì)占細(xì)菌群落的97.41%。酸馬奶天然發(fā)酵劑的群落組成中,乳桿菌屬為優(yōu)勢(shì)菌屬,相對(duì)豐度最高(72.26%),其次為乳球菌屬(11.92%),這與前人的研究結(jié)果一致[23]。
乳酸桿菌、乳球菌以及鏈球菌被定義為天然發(fā)酵乳中的核心微生物群,它們的代謝終產(chǎn)物和酶對(duì)發(fā)酵乳的質(zhì)地風(fēng)味有重要的影響[24],并可以通過產(chǎn)生有機(jī)酸和抗生素等物質(zhì)抑制腐敗菌和病原微生物的生長[25]。趙飛燕等[26]研究發(fā)現(xiàn)鮮馬奶中存在腸球菌屬、腸桿菌屬以及芽孢桿菌和氣單胞菌等有害微生物,可能會(huì)導(dǎo)致產(chǎn)品的質(zhì)地,顏色和風(fēng)味變差,也可能對(duì)消費(fèi)者的健康狀況有所影響,產(chǎn)生嚴(yán)重的疾病。本實(shí)驗(yàn)在采樣時(shí)測(cè)得酸馬奶天然發(fā)酵劑pH為3.69±0.03,滴定酸度為169.90±17.36 °T。天然發(fā)酵劑的低pH環(huán)境、乳酸菌的競(jìng)爭性保護(hù)作用和特有微生物產(chǎn)生的抑菌物質(zhì)等可以抑制有害微生物生長,提升產(chǎn)品的品質(zhì)。
傳統(tǒng)乳制品酸馬奶在世界各地已有長時(shí)間的消費(fèi)歷史,經(jīng)過長期的自然選擇作用,優(yōu)質(zhì)的乳酸菌菌種已經(jīng)流傳下來[27]。生產(chǎn)酸馬奶所添加的天然發(fā)酵劑,更是獲得優(yōu)質(zhì)乳酸菌的良好來源。
表2 樣本細(xì)菌和真菌信息及Alpha多樣性指數(shù)Table 2 Sample bacterial and fungal information and Alpha diversity index
圖2 樣本的稀釋性曲線和Shannon-Wiener曲線Fig.2 Sample dilution curve and Shannon-Wiener curve
圖3 酸馬奶天然發(fā)酵劑基于門水平(a)和屬水平(b)細(xì)菌相對(duì)豐度柱狀圖Fig.3 Histogram of relative abundance of bacteria in koumiss natural starter based on phylum level (a) and genus level (b)
2.2.3 真菌群落組成多樣性分析 真菌也是酸馬奶天然發(fā)酵劑中非常重要的一類微生物區(qū)系。通過ITS序列,結(jié)果見圖4,絕對(duì)的優(yōu)勢(shì)真菌被鑒定為子囊菌門(Ascomycota),相對(duì)豐度為99.32%。3個(gè)樣本共鑒定出43個(gè)真菌屬,數(shù)量明顯高于細(xì)菌屬,然而樣本平均相對(duì)豐度大于1 %的屬有2個(gè),包括德克酵母屬(Dekkera)和克魯維酵母屬(Kluyveromyces),表明酸馬奶天然發(fā)酵劑中有很多低豐度存在的真菌微生物。德克酵母屬為優(yōu)勢(shì)真菌屬,相對(duì)豐度占94.09%。
酵母菌對(duì)酸馬奶的風(fēng)味、質(zhì)地和營養(yǎng)價(jià)值有著重要的促進(jìn)作用。酵母菌產(chǎn)生的酶分解形成脂肪酸,并進(jìn)一步發(fā)生酯化反應(yīng)得到具有芳香味的酯類[28],可以與乳酸菌共同分解蛋白質(zhì)產(chǎn)生大量的氨基酸[29]等。據(jù)調(diào)查,克魯維酵母、哈薩克斯坦酵母、假絲酵母屬等是酸馬奶中經(jīng)常被分離得到的酵母菌[30-32]。本試驗(yàn)中天然發(fā)酵劑的優(yōu)勢(shì)酵母菌種類與其他學(xué)者研究存在一定差異,分析原因可能與特定地區(qū)的氣候、草場(chǎng)等環(huán)境因素,和不同牧民傳統(tǒng)的制作方法以及所接種的發(fā)酵劑差異有關(guān)。而實(shí)際上,德克酵母屬在酸馬奶的真菌組成中也較常見,一些學(xué)者在新疆、青海、內(nèi)蒙古、哈薩克斯坦、吉爾吉斯斯坦等地的酸馬奶中分離得到了德克酵母屬[33-35],只是沒有作為優(yōu)勢(shì)酵母菌被發(fā)現(xiàn)。研究發(fā)現(xiàn)德克酵母可以產(chǎn)生醋酸氣味[36],釀酒酵母、德克酵母與克魯維酵母等在乳制品發(fā)酵過程中對(duì)水解蛋白質(zhì)和脂肪、乳酸代謝、產(chǎn)生酒精和特殊風(fēng)味有突出貢獻(xiàn)[37-38]。如此看來,天然發(fā)酵劑中德克酵母和克魯維酵母的存在可以為發(fā)酵酸馬奶形成典型風(fēng)味起到積極促進(jìn)作用。
圖4 酸馬奶天然發(fā)酵劑基于門水平(a)和屬水平(b)真菌相對(duì)豐度柱狀圖Fig.4 Histogram of relative abundance of fungal in koumiss natural starter based on phylum level (a) and genus level (b)
采用PICRUSt軟件對(duì)天然發(fā)酵劑中的細(xì)菌群落微生物進(jìn)行功能預(yù)測(cè)。結(jié)果見表3,通過與KEGG數(shù)據(jù)庫(Kyoto encyclopedia of genes and genomes)對(duì)比,共注釋到6類一級(jí)代謝通路,代謝作用(Metabolism)、遺傳信息處理(Genetic Information Processing)和環(huán)境信息處理(Environmental Information Processing)是主要代謝通路,平均占比分別為67.97%、14.04%和8.36%。在二級(jí)代謝通路中共注釋到42個(gè)子功能組成,其中屬于上述3類一級(jí)通路且相對(duì)豐度>0.1%的子功能見表3。參與新陳代謝的菌群主要富集在碳水化合物代謝(Carbohydrate metabolism,16.24 %)、氨基酸代謝(Amino acid metabolism,8.20%)等。遺傳代謝類通路中主要富集在翻譯(Translation,5.94%)、復(fù)制和修復(fù)(Replication and repair,5.44%)以及折疊分類和降解(Folding, sorting and degradation,2.30%)。環(huán)境信息處理類通路中膜轉(zhuǎn)運(yùn)(Membrane transport)和信號(hào)傳導(dǎo)(Signal transduction)為主要的子功能。在酸馬奶天然發(fā)酵劑中,碳水化合物代謝及氨基酸代謝作用最為突出。具體地,碳水化合物代謝主要包括三羧酸循環(huán)、糖酵解和磷酸戊糖途徑等,可產(chǎn)生大量的乙酸、檸檬酸等風(fēng)味中間代謝產(chǎn)物[39]。氨基酸可以在酶的作用下產(chǎn)生風(fēng)味成分[40],由此推測(cè)天然發(fā)酵劑中的主要風(fēng)味物質(zhì)來源于碳水化合物代謝和氨基酸代謝途徑。除此之外還有很多的有益功能信息,如核苷酸代謝(Nucleotide metabolism)、輔助因子和維生素代謝(Metabolism of cofactors and vitamins)、聚糖生物合成和代謝(Glycan biosynthesis and metabolism)、萜類化合物和聚酮類化合物的代謝(Metabolism of terpenoids and polyketides)等。
表3 KEGG數(shù)據(jù)庫主要代謝通路豐度值Table 3 Abundance of main metabolic pathways in KEGG database
經(jīng)KEGG數(shù)據(jù)庫分析發(fā)現(xiàn)在酸馬奶天然發(fā)酵劑細(xì)菌群落中預(yù)測(cè)到1623種酶,真菌群落中預(yù)測(cè)到847種,細(xì)菌群落和真菌群落中共有568種酶相同,表4是細(xì)菌真菌中豐度平均值排前50的酶類。從表4中可以看出,除與細(xì)菌、真菌生長相關(guān)的酶外,與代謝相關(guān)的酶中參與碳水化合物代謝和氨基酸代謝的酶廣泛存在。三羧酸循環(huán)中關(guān)鍵酶琥珀酸脫氫酶(Succinate dehydrogenase)、蘋果酸脫氫酶(Malate dehydrogenase)、丙酮酸脫羧酶(Pyruvate decarboxylase)等均有發(fā)現(xiàn),β-半乳糖苷酶(Betagalactosidase)和α-半乳糖苷酶(Alpha-galactosidase)屬于乳桿菌目的酶,可催化生成低聚半乳糖及半乳糖寡糖,有益于人體的健康[40]。同時(shí),乙醇脫氫酶(Alcohol dehydrogenase)、醛脫氫酶(Aldehyde dehydrogenase)、蛋白酪氨酸磷酸酯酶(Protein-tyrosinephosphatase)、組氨酸激酶(Histidine kinase)等氨基酸代謝相關(guān)酶均存在,表明酸馬奶發(fā)酵劑中風(fēng)味物質(zhì)的很可能主要來源于糖代謝及氨基酸代謝,而乙酰輔酶A羧化酶(Acetyl-CoA carboxylase)、甘油激酶(Glycerol kinase)、醋酸激酶(Acetate kinase)等脂肪酶的存在說明還有一部分風(fēng)味物質(zhì)可能源自脂類代謝。
本研究對(duì)錫林郭勒牧區(qū)酸馬奶天然發(fā)酵劑中的風(fēng)味物質(zhì)和微生物多樣性進(jìn)行了測(cè)定和分析。天然發(fā)酵劑中共檢測(cè)到43種風(fēng)味物質(zhì),其中L-乳酸、棕櫚酸、月桂酸、乙酸、癸酸和肉豆蔻酸是主要酸類物質(zhì),辛酸乙酯、9,12,15-十八碳三烯酸乙酯、乳酸乙酯、月桂酸乙酯、癸酸乙酯和E-11-十六碳烯酸乙酯是主要的酯類物質(zhì),2,3-丁二醇、十二硫醇、異戊醇、苯乙醇和異丁醇5種醇相對(duì)含量較高,還有少量芳香族類和酮類化合物。微生物多樣性分析表明,細(xì)菌群落主要包括乳桿菌屬、醋酸菌屬、乳球菌屬和鏈球菌屬等,其中乳桿菌屬為優(yōu)勢(shì)細(xì)菌屬,相對(duì)豐度為72.26%。真菌群落主要包括德克酵母屬和克魯維酵母屬,其中德克酵母為優(yōu)勢(shì)真菌屬,相對(duì)豐度94.09%。酸馬奶天然發(fā)酵劑中真菌的豐富度更高,然而細(xì)菌微生物更多樣,表明多數(shù)的真菌微生物以低豐度存在。經(jīng)基因功能預(yù)測(cè),發(fā)酵劑碳水化合物代謝及氨基酸代謝功能突出,且存在大量代謝通路中的酶基因,為酸馬奶發(fā)酵過程風(fēng)味物質(zhì)的形成奠定了遺傳基礎(chǔ)。