張志云,邊葉雨,黃 航,韓瀟瀟,吳 蘭,吳麗萍
(南昌大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院/南昌大學(xué)鄱陽湖環(huán)境與資源利用教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,南昌 330031)
煙草花葉病毒(Tobacco mosaic virus,TMV)是單鏈RNA病毒,感染煙草、辣椒等經(jīng)濟(jì)作物[1],化學(xué)農(nóng)藥作為當(dāng)前控制病害發(fā)生的主要手段,對人體和環(huán)境都有很大的危害。目前,天然活性物質(zhì)因其無公害、無污染、無殘留等優(yōu)點(diǎn)[2],而成為抗TMV藥物研究熱點(diǎn),具有廣闊的應(yīng)用前景。
蛋白質(zhì)是抗病毒生物活性物質(zhì)之一。例如商陸[3]、多種食用菌(香菇、平菇、茶樹菇和毛頭鬼傘等)的抽提物[4]有鈍化TMV的作用;超敏蛋白[5]、粉紅單端孢菌體[6]中的蛋白激發(fā)子可使植物體內(nèi)苯丙氨酸解氨酶(PAL)、過氧化物酶(POD)和多酚氧化酶(PPO)等酶活性增強(qiáng);激發(fā)子Hrip1[7]、PevD1[8]、BDP-30[9]、GP-1[10]、PeaT1[11]都被證明可以誘導(dǎo)植物產(chǎn)生抗病性。由此可見,一些蛋白質(zhì)在植物防御機(jī)制中起著關(guān)鍵作用。但目前商品化的抗病毒蛋白制劑品種少,不能滿足農(nóng)業(yè)生產(chǎn)上多品種、大規(guī)模的需求,因此有必要尋找更多具有抗病毒活性的蛋白質(zhì)類制劑。
誘導(dǎo)子或激發(fā)子激活植物免疫系統(tǒng),提高植物防御力,植物組織結(jié)構(gòu)和細(xì)胞生理生化發(fā)生變化。由細(xì)胞壁、細(xì)胞間隙的產(chǎn)生木質(zhì)素和胼胝質(zhì)可以避免植物水分及營養(yǎng)的流失而抑制了病原的繁殖[12];同時也伴隨著活性氧(ROS)、離子通量改變、水楊酸(salicylic acid,SA)積累、植物防御酶、防御基因激活等改變[13]。POD參與木質(zhì)素的合成;PPO參與與酚類物質(zhì)的氧化過程;PAL與SA的生物合成有關(guān)[14]。在SA信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑中,NPR1編碼的氧化還原敏感蛋白調(diào)控病程相關(guān)蛋白(pathogenesis-related protein,PR)的表達(dá),β-1,3葡聚糖酶是PR家族的一員[15],最終激發(fā)系統(tǒng)獲得性抗性(systemic acquired,SAR),也是SAR重要調(diào)控因子[16]。
Y3蛋白分離于毛頭鬼傘Coprinuscomatus,分子量約為14.4 kD[16],濃度為2.0 μg/mL時,對TMV的抑制率為50%[18,19],其后獲得了Y3cDNA序列及轉(zhuǎn)基因煙草,轉(zhuǎn)基因煙草也表現(xiàn)出一定的抗病毒活性[20]。且Y3能與TMV外殼蛋白(CP)互作[21]。前期研究表明Y3具有抗病毒活性,但在植物體內(nèi)的抗病毒活性及其在植物系統(tǒng)抗性中的潛在作用卻鮮有報道。
為了明確 Y3蛋白是否可誘導(dǎo)煙草產(chǎn)生抗病性及可能的作用機(jī)制,本研究利用畢赤酵母表達(dá)重組蛋白Y3,通過測定植物防御酶(PAL,POD,PPO,β-1,3葡聚糖酶)活性、防御基因(PR1-a,PR1-b,NPR1,PAL)表達(dá)水平,以探討該蛋白處理后煙草對TMV的抗性,為后續(xù)Y3誘導(dǎo)煙草產(chǎn)生抗性的機(jī)制研究奠定基礎(chǔ)。
質(zhì)粒pPIC-9k,畢赤酵母PichiapastorisGS115,大腸桿菌EscherichiacoliDH5α,普通煙Nicotiana tabacumK326種子均保存于本實(shí)驗(yàn)室,TMV保存于普通煙K326葉片,毛頭鬼傘新鮮子實(shí)體購自福建農(nóng)林大學(xué)菌草研究所。
限制性內(nèi)切酶Not I、Bg1 Ⅱ、EcoR I、PrimerSTAR Max Premix購自TaKaRa公司;Gel Extraction Kit、Ultrapure RNA Kit、HiFiScript cDNA Synthesis Kit、DNA Purification Kit、pClone007 Versatile Simple Vertor Kit、PurePlasmid Maxi Kit均購自康為世紀(jì)有限公司;E.coli Ploly (A) Polymerase購于New England Biolabs,引物合成及測序由上海生工完成。無氨基氮源(YNB),生物素,遺傳霉素(G418)購自索萊寶生物。
培養(yǎng)基配方。LB培養(yǎng)基:胰蛋白胨10 g/L、酵母浸粉5 g/L、NaCl 10 g/L;YPD培養(yǎng)基:酵母提取物10 g/L、蛋白胨20 g/L、葡萄糖20 g/L、瓊脂20 g/L;MD培養(yǎng)基:YNB 13.4 g/L、葡萄糖20 g/L、生物素0.4 mg/L、瓊脂15 g/L;MM培養(yǎng)基:YNB 13.4 g/L、甲醇5 mL/L、生物素0.4 mg/L、瓊脂15 g/L。BMGY培養(yǎng)基:酵母提取物10 g/L、胰蛋白胨20 g/L、1.0%甘油、YNB 13.4 g/L、磷酸鉀緩沖液100 mL、生物素0.4 mg/L;BMMY培養(yǎng)基:酵母提取物10 g/L、胰蛋白胨20 g/L、1.0%甲醇、YNB 13.4 g/L、磷酸鉀緩沖液100 mL、生物素0.4 mg/L。
根據(jù)Y3cDNA (Accession:GQ859168)序列及pPIC-9K載體序列,設(shè)計特異性引物并加入酶切位點(diǎn)。Y3正向引物序列加入 EcoR I位點(diǎn)(用下劃線表示):5′-CCGGAATTC ATGCATCATCACCATCAC CATATGATCTCCACCAAGATTTTCACC-3′,反向引物序列加入 Not I位點(diǎn):5′-CCGGCGGCCGCTTAGAA GTCGGTGCTACAATCACCAT-3′。按照 Ultrapure RNA Kit說明書提取毛頭鬼傘總 RNA,用 HiFiScript cDNA Synthesis Kit逆轉(zhuǎn)錄合成 cDNA 的第一條鏈,反應(yīng)體系:6 μL RNA、2 μL Primer Mix、4 μL dNTP Mix、2 μL DTT、4 μL 5×RT Buffer、1 μL HiFi Script、1 μL RNase-Free Water,42 ℃ 40 min,85 ℃ 5 min。隨后擴(kuò)增Y3cDNA,PCR 反應(yīng)體系:Primer STAR Max Premix (2×) 12.5 μL,10 μmol/L上下游引物各1 μL,cDNA 1 μL,ddH2O 9.5 μL。PCR 反應(yīng)程序?yàn)?95 ℃ 3 min;95 ℃ 30 s,60 ℃ 30 s,72 ℃ 1 min,35個循環(huán);72 ℃ 10 min。根據(jù)Gel Extraction Kit說明書將PCR產(chǎn)物膠回收,隨后用DNA Purification Kit將膠回收產(chǎn)物進(jìn)行純化,根據(jù)大腸桿菌Ploly (A) Polymerase說明書加A尾,與pUC-T載體連接后形成載體pUC-T-Y3轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α感受態(tài)細(xì)胞,用氨芐青霉素(ampicillin,Amp,50 mg/mL)進(jìn)行篩選,菌液經(jīng)PCR鑒定后送上海生工測序。
根據(jù)PurePlasmid Maxi Kit說明書提取質(zhì)粒pUC-T-Y3,用EcoR I和Not I將pUC-T-Y3質(zhì)粒進(jìn)行酶切,獲得攜帶酶切位點(diǎn)的基因Y3后,用T4 DNA連接酶將Y3cDNA與相同酶切處理的pPIC-9k載體連接后轉(zhuǎn)入大腸桿菌DH5α感受態(tài)細(xì)胞中,對生長在LB固體培養(yǎng)基(含氨芐青霉素100 mg/mL,卡那霉素Kana 50 mg/mL)上的菌落進(jìn)行雙酶切鑒定和測序,用以驗(yàn)證重組質(zhì)粒pPIC-9k-Y3構(gòu)建是否成功。
用Bg1 Ⅱ線性化處理重組質(zhì)粒pPIC-9k-Y3后將其電轉(zhuǎn)化入酵母GS115感受態(tài)細(xì)胞中(1.5 KV,25 μF,200 Ω),同時電轉(zhuǎn)同樣酶切處理的空載體pPIC-9k為陰性對照。細(xì)胞培養(yǎng)1 h (28 ℃、150 r/min) 后,涂布于 MD固體培養(yǎng)基上,28 ℃ 培養(yǎng) 2~3 d,挑取單菌落接種到 MM、MD 以及含遺傳霉素 G418(Geneticin)濃度為1、2、3和4 mg/mL的 YPD平板上,篩選甲醇利用高拷貝型轉(zhuǎn)化子。在 4 mg/mL G418-YPD平板上生長良好的菌株為高拷貝型。挑取高拷貝型單菌落接種到含的300 μL YPD液體培養(yǎng)基(氨芐青霉素100 mg/mL,卡那霉素50 mg/mL)的1.5 mL離心管中,28 ℃、150 r/min振蕩培養(yǎng)1 h,13000 r/min離心3 min,收集菌體,用0.01 mol/L PBS和蒸餾水洗滌菌體,13000 r/min離心3 min后重懸于0.02 mol/L NaOH,沸水浴5 min,液氮速凍30 s,反復(fù)煮凍3次,最后一次用沸水煮5 min以裂解酵母。以裂解的菌體為PCR反應(yīng)的模板,進(jìn)行PCR鑒定以篩選陽性轉(zhuǎn)化子。
挑取上述陽性轉(zhuǎn)化子于5 mL YPD培養(yǎng)基中,28 ℃、250 r/min搖床培養(yǎng)12~14 h取1 mL接種于50 mL BMGY液體培養(yǎng)基中,28 ℃、250 r/min條件下培養(yǎng)16~18 h,至OD600為2.0~6.0;4000 r/min離心10 min收集菌體,重懸于10 mL的BMMY液體培養(yǎng)基,轉(zhuǎn)至300 mL BMMY液體培養(yǎng)基中28 ℃、250 r/min搖床培養(yǎng) 5~7 d,每隔 24 h添加 1%甲醇[22]。培養(yǎng) 7 d后收集菌液,取 10 μL上清進(jìn)行SDS-PAGE。抗His標(biāo)簽兔多克隆抗體為一抗,山羊抗兔IgG (H+L)為二抗,進(jìn)行Western-blot分析檢測蛋白的表達(dá)情況。
1.5.1 Y3誘導(dǎo)煙草防御相關(guān)酶活性測定 普通煙K326播種于營養(yǎng)土中,在溫室(25 ℃~30 ℃)中光照16 h,黑暗8 h培養(yǎng),至8~9葉期時進(jìn)行試驗(yàn)。對照組(H2O+TMV):噴灑清水;實(shí)驗(yàn)組(EP+TMV):噴灑濃度為300 μg/mL空質(zhì)粒(pPIC-9k)菌株誘導(dǎo)上清1 mL于煙草葉片;實(shí)驗(yàn)組(EY3+TMV):噴灑1 mL 300 μg/mL Y3蛋白誘導(dǎo)上清。處理葉片為每株煙草的下位兩片煙葉,在24 h后在處理煙葉上摩擦接種TMV[23],1 g帶TMV的普通煙K326病葉于10 mL 0.01 moL/L PBS (pH=7.2) 緩沖液中研磨,四層紗布過濾。各處理5株,重復(fù)3次。分別在試驗(yàn)處理后1、3、5、7、9 d[24],采集處理葉上位葉,液氮速凍后于-80 ℃冷凍保存。
采用BCA (bicinchoninic acid)法測定總蛋白;分別用PPO、PAL、POD試劑盒根據(jù)說明書測定各時期酶活性變化(BCA,酶活試劑盒均購于南京建成生物工程研究所);PAL在OD290以每毫克蛋白每分鐘變化0.1為一個酶活力單位,PPO在OD420每毫克蛋白變化0.01為一個酶活力單位,POD以每毫克蛋白催化1 μg底物為一個酶活力單位。β-1,3葡聚糖酶活性測定采用趙凱等[25]的方法。每處理3次重復(fù)。
1.5.2 煙草病情調(diào)查 1.5.1相同處理后第 20 d進(jìn)行煙草花葉病調(diào)查,并參照煙草病害分級標(biāo)準(zhǔn)(GB/T23222)對其病情進(jìn)行分級[26]。
1.5.3 Y3誘導(dǎo)煙草抗病相關(guān)基因分析 按Ultrapure RNA Kit說明書提取煙草總RNA,用HiFiScript cDNA Synthesis Kit逆轉(zhuǎn)錄合成cDNA第一條鏈,以β-actin為內(nèi)參基因,分別以PR1a、PR1b、NPR1、PAL抗病相關(guān)基因特異引物進(jìn)行PCR。PCR反應(yīng)體系:cDNA 2 μL,10 μmol/L上下游引物各0.4 μL,SYBR Premix ExTaq10 μL,用ddH2O補(bǔ)足至20 μL;PCR反應(yīng)程序:95 ℃ 3 min ;95 ℃ 30 s,60 ℃ 30 s,72 ℃ 1 min,40個循環(huán)。每處理3重復(fù)。
表1 qRT-PCR引物Table 1 The primers in qRT-PCR
利用SPSS25.0單因素ANOVA檢驗(yàn)方差分析,顯著性分析使用最小顯著性差異LSD和沃勒-鄧肯(W)法,用Origin軟件作圖。熒光定量數(shù)據(jù)根據(jù)Ct值計算出相對表達(dá)量,計算公式如下:目的基因相對表達(dá)量=2-△△Ct,△△Ct=[(Ct目的基因-Ct內(nèi)參基因)處理組-(Ct目的基因-Ct內(nèi)參基因)對照組]。
經(jīng)1.0%瓊脂糖凝膠電泳,PCR擴(kuò)增獲得Y3cDNA約400 bp (圖1A);重組質(zhì)粒pUC-T-Y3的菌液PCR約400 bp (圖1B)。測序結(jié)果與NCBI上已提交的Y3蛋白序列(Accession:AEE87275)進(jìn)行BLAST比對,同源性為96%,表明Y3cDNA已成功插入pUC-T載體中,pUC-T-Y3與pPIC-9K質(zhì)粒分別經(jīng)EcoRⅠ、NotⅠ雙酶切,獲得2個片段分別為400和9300 bp,其中400 bp為Y3cDNA,9300 bp與pPIC9K質(zhì)粒大小一致(圖2),表明成功構(gòu)建重組質(zhì)粒 pPIC-9k-Y3。
圖1 Y3基因擴(kuò)增與鑒定Fig.1 Amplification and identification of Y3 gene
圖2 重組質(zhì)粒pPIC-9k-Y3雙酶切Fig.2 Double digestion of recombinant plasmid pPIC-9k-Y3
取誘導(dǎo)5、6、7 d的空質(zhì)粒pPIC9K和重組蛋白菌液進(jìn)行SDS-PAGE電泳(圖3A)。泳道1~3在約16 kD處均有單一條帶,且第6 d時效果較好。取甲醇誘導(dǎo)第6 d培養(yǎng)液上清,經(jīng)SDS-PAGE后進(jìn)行Western-blot檢測,在16 kD處有單一條帶(圖3B)表明Y3重組蛋白已經(jīng)成功表達(dá)。
圖3 重組蛋白表達(dá)產(chǎn)物SDS-PAGE及Western-blot分析Fig.3 SDS-PAGE and Western-blot analysis of recombinant protein expression product
2.3.1 Y3誘導(dǎo)煙草抗性相關(guān)酶活性 重組蛋白Y3對煙草抗病相關(guān)酶的影響表明,β-1,3葡聚糖酶活性逐漸下降,在1~5 d內(nèi)Y3處理組始終顯著低于清水處理組(P<0.05);對PPO、PAL有升高作用,但差異不顯著(P>0.05)。噴施重組蛋白Y3 1 d后接種TMV,PPO和PAL活性分別在24 h、3 d達(dá)到最大,隨后保持相對穩(wěn)定;POD酶活性在1 d內(nèi)達(dá)到最大(圖4)。
圖4 Y3誘導(dǎo)煙草抗性相關(guān)酶活性結(jié)果Fig.4 Activity changes of resistance-related enzyme in tobacco treated with Y3
2.3.2 Y3提高煙草抗性相關(guān)基因轉(zhuǎn)錄水平 對5個基因進(jìn)行PCR擴(kuò)增,經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳檢測,條帶單一且與預(yù)期相符(圖5),符合qRT-PCR擴(kuò)增標(biāo)準(zhǔn)。
圖5 瓊脂糖凝膠電泳檢測引物特異性Fig.5 Gel-lectrophoresis of primers
蛋白Y3誘導(dǎo)煙草葉片抗性相關(guān)基因表達(dá)qRT-PCR結(jié)果顯示,NPR1表達(dá)量總體下降,但高于對照組的表達(dá)量。PAL基因在第3 d時驟增,PAL基因與SA的合成相關(guān),表明SA合成。PR1-a在Y3處理1 d后誘導(dǎo)表達(dá),但表達(dá)量與對照組相差不大。對照組中PR1-b表達(dá)量逐漸降低,而噴施蛋白Y3后第1 d時,表達(dá)量達(dá)到最高,同時含空質(zhì)粒 pPIC-9k酵母菌也會誘導(dǎo)PR1-a、PR1-b基因的表達(dá)量升高。Y3處理后與對照相比,PAL和NPR1表達(dá)量差異顯著(P<0.05),PR1-b除第3 d外,表達(dá)量始終顯著高于清水處理組(P<0.05),而PR1-a差異不顯著(P>0.05)。Y3對PR1-a的誘導(dǎo)升高作用不明顯,但能顯著誘導(dǎo)NPR1、PAL、PR1-b表達(dá)量升高(圖6)。
圖6 Y3誘導(dǎo)煙草抗性相關(guān)基因qRT-PCR結(jié)果Fig.6 The result of resistance-releated genes induced Y3 in tobacco
2.3.3 重組蛋白Y3對 TMV的防治效果 重組蛋白Y3噴施煙草葉片1 d后,摩擦接種TMV。各處理組在第20 d時進(jìn)行病情調(diào)查(圖7),清水處理組花葉癥狀明顯,EP處理組還出現(xiàn)葉片黃化,Y3蛋白處理組癥狀明顯減輕,表明Y3可以作為防治TMV的候選肽。
圖7 煙草感染TMV后癥狀Fig.7 The symptom of tobacco after infect with TMV
化學(xué)農(nóng)藥的長期使用嚴(yán)重地破壞生態(tài)環(huán)境,而植物源農(nóng)藥與環(huán)境相容性好,易降解,且植物病原不易對其產(chǎn)生抗性[27],為研制抗病毒制劑開辟了新的方向。植物抗病毒蛋白一般與靶蛋白結(jié)合[28],觸發(fā)植物免疫反應(yīng)。PevD1通過與Nbnrp1蛋白互作,引起煙草體內(nèi)PPO、PAL等酶活性增強(qiáng),植物產(chǎn)生抗病性[29];PeaT1可上調(diào)PR-1a和PR-1b的轉(zhuǎn)錄,同時識別位于煙草質(zhì)膜上的DREPP蛋白[11];苦瓜素α-MMC可激活煙草的抗氧化系統(tǒng),并使POD酶活性增強(qiáng)[23]。通過RT-PCR克隆了Y3cDNA,并構(gòu)建重組表達(dá)載體pPIC-9k-Y3,在畢赤酵母GS115中以28 ℃、250 r/min、1.0%甲醇誘導(dǎo)6 d表達(dá)量最佳。Y3重組蛋白誘導(dǎo)抗性試驗(yàn)結(jié)果表明 PPO、PAL的酶活性升高,其中 PAL是水楊酸合成的關(guān)鍵酶[30]。另外,PR1b、NPR1基因的表達(dá)量在1 d內(nèi)顯著上調(diào)。在植物抗病毒過程中,SA積累誘導(dǎo)SAR的發(fā)生,同時細(xì)胞內(nèi)外氧化還原狀態(tài)改變,NPR1蛋白磷酸化并與TGA轉(zhuǎn)錄因子的互作促進(jìn)PR基因轉(zhuǎn)錄[31],因此NPR1基因在SAR中起關(guān)鍵作用。有研究表明,煙草感染TMV后,SA積累和病程相關(guān)蛋白(PRs)表達(dá)[32],表明Y3蛋白可能通過SA介導(dǎo)的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑激發(fā)SAR,提高煙草的抗病毒活性。激發(fā)子PevD1對PAL的影響在第6 d達(dá)到峰值,PPO和POD在第5 d達(dá)到峰值[8];Hrip1處理煙草3 d后PR1基因顯著表達(dá)[7],而Y3處理1 d后PR1b基因表達(dá),表明Y3可以更有效地激活煙草的防御系統(tǒng)。GP-1處理煙草后TMV CP積累減少,且破壞TMV粒子結(jié)構(gòu),表明GP-1可與TMV直接互作,同時也可誘導(dǎo)植物產(chǎn)生抗病性[10]。前期研究表明Y3蛋白與TMV衣殼蛋白結(jié)合,阻止了TMV的復(fù)制[21]。由此可見,Y3可通過直接與TMV作用和激活SAR兩個方面提高煙草的抗病性。
本研究噴施重組蛋白Y3后煙草花葉病癥狀明顯減輕,表明Y3可以誘導(dǎo)寄主產(chǎn)生抗病性。吳麗萍等[17]的研究表明Y3濃度為12.5 μg/mL時對TMV的侵染率達(dá)83.0%,另外有學(xué)者將Y3 cDNA轉(zhuǎn)化入煙草NC89,感病后癥狀出現(xiàn)時間晚且較輕[20]。本研究為Y3在煙草抗TMV的功能進(jìn)一步奠定基礎(chǔ)。
蛋白Y3在煙草抗TMV的過程中,可誘導(dǎo)防御相關(guān)酶活性和抗性相關(guān)基因轉(zhuǎn)錄水平發(fā)生變化。然而,是否還有其他信號分子參與了Y3誘導(dǎo)煙草產(chǎn)生系統(tǒng)性抗性,以及Y3的純化條件還需要進(jìn)一步的研究。本研究為探討Y3在植物對TMV感染的系統(tǒng)抗性反應(yīng)中的作用提供了依據(jù)。