二代測序技術在Lynch綜合征中的應用新進展

李康平 張書喬

【摘 要】Lynch綜合征是一類表現(xiàn)為DNA錯配修復基因突變的遺傳性非息肉病性結直腸癌，DNA錯配修復基因突變是Lynch綜合征遺傳學的基礎。本文通過回顧近年來相關文獻，對二代測序技術應用在結直腸癌特別是Lynch綜合征中的基因診斷展開綜述。

【關鍵詞】Lynch綜合征;MMR基因;二代測序技術

【中圖分類號】R969.4【文獻標識碼】A【文章編號】1672-3783（2020）08-24--02

Lynch綜合征（Lynchsyndrome，LS）與DNA錯配修復基因（Mismatchrepair，MMR）突變密切相關。近幾年隨著MMR和微衛(wèi)星不穩(wěn)定檢測的出現(xiàn)，使LS患者診斷有了較為準確的方法。但僅依靠上述檢測與臨床診斷標準很難完全囊括全部LS患者。確診的患者中有一部分無MMR基因突變。二代測序技術（next-generationsequencing，NGS）的出現(xiàn)，使得LS等遺傳異質(zhì)性疾病的診斷更加容易。NGS不僅增加了測序量，且提高了突變檢出的靈敏度。在癌癥與遺傳病性相關疾病的早期篩查及確診領域都發(fā)揮了重要的作用，是如今臨床診療領域最有應用前景的技術之一。隨著NGS技術的不斷發(fā)展完善，一定會改變?nèi)祟悓τ谀[瘤發(fā)生與轉(zhuǎn)變進程的了解，也注定成為未來腫瘤診療跟預后的基礎。

一 MMR基因突變

有學者[1]對數(shù)位LS患者樣本進行測序后發(fā)現(xiàn)的大約400種MMR基因突變，50%是MSH2基因突變。MSH2基因中有一種定位于第7號外顯子的異常胚系突變，它能使該基因下游提前停止編碼。另外，對疑似有MSH2基因突變的LS患者在運用體外擴增特異DNA片斷率搜尋MSH2基因中潛在的重組突變庫，由此檢測該基因的轉(zhuǎn)位點，具有重要意義[2]。蔣帆[3]等人通過對Insight數(shù)據(jù)庫分析后得出進行臨床檢測和診斷時，需著重檢測MSH6、PMS2、MLH3這三個基因位點和外顯子，例如MSH6的5號外顯子和MLH3中的突變位點c.691A>C，c.2896T>C和c.2825C>T。因為這三個基因各自均有高頻的突變位點與外顯子。對于很多攜帶MSH6基因的LS患者都曾患過不止一次LS相關腫瘤，平均發(fā)病年齡較普通的LS患者來說也要滯后。

二 其他相關基因突變

有研究顯示BRAFV600E基因突變與散發(fā)性微衛(wèi)星不穩(wěn)定的結直腸癌相關，珠珠[4]利用NGS技術在107例LS患者中檢測到了3例MLH1基因表達缺失的患者存在BRAFV600E突變。Tan等人[5]在174例LS患者樣本中進行NGS發(fā)現(xiàn)共發(fā)現(xiàn)了4個新發(fā)突變位點。有6例具有強癌癥風險的個體在不存在MMR基因突變的情況下具有復發(fā)的新型KIT：c.2836C>T無義突變和ERCC4：c.2169C>a無義突變，這很可能具有臨床意義。AXIN2基因能夠控制β-連環(huán)蛋白表達。而85%的散發(fā)和遺傳性結直腸癌是由APC基因和β-連環(huán)蛋白基因突變引起的Wnt通路異常激活導致的，且在LS樣本中發(fā)現(xiàn)Wnt通路的β-連環(huán)蛋白、E-cad、TCF-4、PTEN的表達異常[6]。研究人員證實了結直腸癌中AXIN2基因表達顯著升高。而Rohlin等人[7]利用NGS找到了AXIN2基因突變與結直腸癌發(fā)生相關證據(jù)。報告的105例結直腸癌患者中發(fā)現(xiàn)了11個移碼突變。綜上AXIN2基因突變與結直腸癌發(fā)生相關。

三 小結：

如今隨著NGS技術的逐漸普及，測序所花時間及成本也相較以前大幅降低。該技術漸漸展現(xiàn)了其在基因診斷層面確診LS的優(yōu)勢，但受限于測序與分析數(shù)據(jù)本身所花費的時間還比較長，基因樣本庫也不夠完善，想要完全取代MMR基因檢測還有一段路要走，盡管有種種限制NGS技術依然揭示了Lynch綜合征潛在致病基因的一系列新突變位點，為研究人員呈現(xiàn)了一連串候選易感基因及位點，在完善了其基因數(shù)據(jù)庫信息的同時，也為今后研發(fā)定制具有針對性的高通量LS診斷檢測基因芯片提供了理論依據(jù)。依托于NGS技術的種種優(yōu)點，臨床上運用NGS檢測LS相關腫瘤致病基因及突變位點的新時代已到來。

參考文獻

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蔣帆. 中國人遺傳性非息肉性結直腸癌（HNPCC）大片段異常檢測與基因數(shù)據(jù)分析 [碩士]： 復旦大學; 2014.

珠珠. 云南省Lynch綜合征候選基因標志物研究 [博士]： 昆明醫(yī)科大學; 2014.

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