羅昌國,王三紅,袁啟鳳,鄭 偉,宋 莎
(1.貴州省農(nóng)業(yè)科學(xué)院 果樹科學(xué)研究所,貴州 貴陽 550006; 2.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 園藝學(xué)院,江蘇 南京 210095)
1997年在擬南芥(Arabidopsisthaliana)上發(fā)現(xiàn)3個抗白粉病﹝Erysiphespp.(Golovinomycesspp.)﹞的位點(diǎn)RPW(RESISTANCE TO POWDERY MILDEW)6/7/8,其中RPW8.1(GenBank ID:AF273059)和RPW8.2(AF273059)基因是擬南芥Ms-0生態(tài)型2個緊密連鎖的白粉病抗性基因,于2001被成功克隆,并具有抗白粉病的功能。RPW8在不同生態(tài)型的擬南芥中存在被同源基因取代的現(xiàn)象,即便基因不被取代也可能在功能方面存在一定差異。在來自全球各地的不同生態(tài)型的擬南芥中,RPW8.1和RPW8.2基因主要存在于抗白粉病擬南芥Ms-0、Kas-1、Wa-1、Ei-5、Nw-0等5個生態(tài)型中;在感病擬南芥Col-0、Fr-3、Is-1、Nie-0、Sg-2等生態(tài)型中則缺乏RPW8.1和RPW8.2基因,取而代之的是HR4;而Bu-06、Is-0、K1-0生態(tài)型中具備RPW8.1和RPW8.2基因,但卻表現(xiàn)出感病的性狀。在擬南芥中,RPW8的同源基因還有HR1(Tair ID:At3g50450)、HR2(At3g50460)和HR3(At3g50470)。RPW8基因在不同種類植物中,甚至同種不同生態(tài)型中,其基因序列和功能都存在差異。筆者等主要對具有抗性功能的RPW8或其同源基因的研究成果進(jìn)行綜述,并對RPW8基因在種群關(guān)系、抗病育種上的應(yīng)用價值進(jìn)行展望,以期為白粉病抗性調(diào)控、抗性育種等方面的研究提供參考。
在擬南芥(Col-0生態(tài)型)基因組數(shù)據(jù)庫中(https://www.arabidopsis.org),HR4位于第3條染色體上。RPW8基因在親緣關(guān)系較近的不同生態(tài)型或近緣種中,基因位點(diǎn)相對固定,但可能由于重復(fù)片段插入、缺失、交換等事件發(fā)生,使得PRW8被同源基因取代或丟失,并在序列和功能方面存在較大差異。從圖1看出,Ms-0生態(tài)型擬南芥RPW8.1和RPW8.2基因位于HR3和SPK-2(SNF1-RELATED PROTEIN KINASE)之間,Col-0生態(tài)型的HR4也位于HR3和SPK-2之間。琴葉擬南芥(Arabidopsislyrata)則只有RPW8.2基因,位置在HR3和SPK-2之間。
注:At為擬南芥;Al為琴葉擬南芥。
Note: At,A.thaliana; Al,A.lyrata.
圖1擬南芥及其近緣種中RPW8基因的位點(diǎn)
Fig.1RPW8 locus ofA.thalianaandA.lyrata
RPW8基因在不同植物中的數(shù)量、基因長度、基因結(jié)構(gòu)等方面存在較大差異(圖2)。在43個不同的生態(tài)型擬南芥的基因序列比對中,RPW8.1基因長度為718個核苷酸,包含長度分別為281 bp和229 bp的2個外顯子和1個208 bp內(nèi)含子,編碼148個氨基酸;RPW8.2基因長度為653個核苷酸,包含長度分別為296 bp和229 bp的2個外顯子和1個183 bp內(nèi)含子;編碼174個氨基酸。擬南芥RPW8.1(核苷酸多樣性π=0.012)和RPW8.2(π=0.010)系列比同源基因HR3(π=0.002)和HR4(π=0.002)的變化大。琴葉擬南芥和擬南芥上RPW8.2同源基因的核苷酸和蛋白序列相似度只有81%和61%。油菜(Brassicanapus)的4個BnHRs也只有2個外顯子和1個內(nèi)含子,外顯子和內(nèi)含子核苷酸多樣性在0.001~0.015。華東葡萄(Vitispseudoreticulata)中克隆到的5個RPW8基因(GenBank ID:KU365990、KU365991、KU365992、KX389173和KX389175),編碼的蛋白長度在647~825個氨基酸,相似度為78%,每個基因包括5個外顯子和4個內(nèi)含子。
注:At為擬南芥;Bn為油菜;Vp為華東葡萄。
Note:At,A.thaliana;Bn,B.napus;VP,V.pseudoreticulata.
圖2RPW8基因的結(jié)構(gòu)
Fig.2 Structure ofRPW8 genes
位于RPW8.2蛋白第64位、第116位和第161位的蘇氨酸(Thr-64)、天冬氨酸(Asp-116)和蘇氨酸(Thr-161)對白粉病的抗性至關(guān)重要,尤其位于卷曲結(jié)構(gòu)域的Thr-64是蛋白磷酸化的關(guān)鍵位點(diǎn),在過敏性抗病反應(yīng)中起決定性作用。N端1~22位氨基酸為跨膜結(jié)構(gòu)域TMD(Trans-membrane domain),TMD的5~14位序列(VAAGGALGLA)在蛋白穩(wěn)定和錨定白粉菌吸器外膜EHM(Extrahaustorial membrane)中起比較關(guān)鍵的作用。C端的111位亮氨酸也是錨定EHM的關(guān)健位點(diǎn),缺少此位點(diǎn)及之后的序列也對蛋白錨定有影響。RPW8.2N端30個氨基酸對其與14-3-3λ(G-BOX FACTOR 14 LAMBDA或稱14-3-3 lambda)蛋白互作沒有影響,而C端的38個氨基酸則影響很大。通過酵母雙雜試驗發(fā)現(xiàn),RPW8.2蛋白能與14-3-3 λ(At5g10450)蛋白互作,RPW8.1蛋白與14-3-3λ互作的能力很弱。
多數(shù)R抗病基因(Resistance Genes)編碼的蛋白通常具有1個核苷酸結(jié)合位點(diǎn)(Nucleotide-binding site ,NBS)和1個羧基端的亮氨酸重復(fù)系列(Leucine-rich repeats,LRRs),因此亦將此類基因稱為NBS-LRR基因(文中用該名稱)或NBS基因。根據(jù)此特征可將NBS-LRR類R蛋白分為兩大類:一類是氨基含有1個TIR(Toll/interleukin receptor)域的TIR-NBS-LRR蛋白,或又稱TIR-NBS-LRR,簡寫為TNLs蛋白;另一類是無TIR結(jié)構(gòu)域的none TIR-NBS-LRR蛋白,簡稱nTNLs蛋白。在nTNLs中,又將氨基端含有卷曲螺旋結(jié)合位點(diǎn)(Coiled-coiled motif)的蛋白歸類為CC-NBS-LRR蛋白,簡寫為CNLs蛋白[9-10]。亦有學(xué)者將此類R基因編碼的蛋白稱為NB-LRR蛋白(Nucleotide binding-leucine rich repeat)[11-13]。 NBS結(jié)構(gòu)域通常包括P-loop(GxGKT)、Kinase2(LxxLDDV)、Kinase3或稱RNBS-B (GxxxxxT(T/S)R)、GLPL(GLPL)等保守結(jié)構(gòu),LRR結(jié)構(gòu)域序列通常為xxLxLxx結(jié)構(gòu)[14]。RPW8屬于nTNLs,N端含1個跨膜結(jié)構(gòu)域TMD(N-terminal transmembrane domain)和1~2個卷曲螺旋結(jié)構(gòu)域(Coiled-coil),還具有R基因常有NBS和LRR結(jié)構(gòu)域[15-17],因此,有學(xué)者將RPW8歸為一類特殊類型R基因,即RPW8-NBS-LRR,簡寫為RNL,或者將其歸在X-NBS-LRR類型中[17-20]。
在藻類植物中,灰色藻門(Glaucophyta) 和紅藻門(Rhodophyta)還沒有出現(xiàn)TNLs和CNLs基因,綠藻門(Chlorophyta)和輪藻門(Charophyta)才開始有NBS-LRR基因的出現(xiàn);苔蘚植物如地錢(Marchantiapolymorpha) 、泥炭蘚(Sphagnumfallax)和開花植物中,NBS-LRR基因較豐富,但是單子植物中沒有TNLs類型基因[21]。RPW8雖屬于NBS-LRR基因,但在藻類植物中沒有出現(xiàn),直到苔蘚植物(Bryophyta)才出現(xiàn)。其他的開花植物則存在數(shù)量不等的RPW8基因[22]。在草莓、蘋果、梨、桃和梅基因組中,預(yù)測的RPW8基因分別有24個、20個、22個、11個和13個[23]。截型苜蓿(Medicagotruncatula)、木豆(Cajanuscajan)、菜豆(Phaseolusvulgaris)和大豆(Glycinemax)中,RPW8基因分別有8個、4個、5個和9個。RPW8與ADR1(activated disease resistance gene)和NRG1(N-required gene 1)有較高的同源性,在基因的進(jìn)化和形成過程中可能存在比較緊密的關(guān)系。RPW8基因可能從ADR1或NRG1進(jìn)化而來,蕨類植物(Pteridophyta),如石松門(Lycopodiophyta)以及單子葉植物中在進(jìn)化過程中只保留ADR1和NRG1類似基因或數(shù)量極少的RPW8同源基因[24-25]。
培養(yǎng)基接種木霉菌(Trichodermaatroviride)試驗中,Col-0生態(tài)型擬南芥的HR4在接種后96 h,表達(dá)比對照提高4倍; Ms-0生態(tài)型擬南芥的RPW8.1在接種后96 h,表達(dá)比對照提高155倍,RPW8.2則不明顯[26]。通過PRW8.1-YFP(yellow fluorescent protein)和PRW8.2-YFP融合基因在洋蔥表皮細(xì)胞和擬南芥葉片表皮細(xì)胞表達(dá)后,兩者的亞細(xì)胞定位主要在膜系統(tǒng)上,包括細(xì)胞質(zhì)膜、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)和高爾基體。亞細(xì)胞定位過程中觀察到RPW8在細(xì)胞中有流動現(xiàn)象,這一現(xiàn)象在進(jìn)一步研究后被證實(shí)是RPW8蛋白利用胞內(nèi)小泡運(yùn)輸(Vesicle trafficking)并通過微絲細(xì)胞骨架(Actin cytoskeleton)在細(xì)胞內(nèi)轉(zhuǎn)運(yùn)。通過轉(zhuǎn)基因植物中穩(wěn)定表達(dá)PRW8.1-YFP和PRW8.2-YFP發(fā)現(xiàn),PRW8.1主要在葉肉細(xì)胞中表達(dá),很少在表皮細(xì)胞中表達(dá),PRW8.2則在葉肉細(xì)胞和表皮細(xì)胞中均有表達(dá)[27]。
目前,RPW8抗病方面的研究以白粉病居多。將Ms-0的RPW8.1和RPW8.2基因中任何1個或2個同時轉(zhuǎn)化到Col-0中,轉(zhuǎn)基因植株都表現(xiàn)出提高白粉病抗性。異位表達(dá)(Ectopic expression)擬南芥RPW8.1基因,使得PTI﹝PAMP(Pathogen-associated molecular pattern )-triggered immunity﹞通路誘導(dǎo)的抗性相關(guān)的基因PRRs(Pattern recognition receptors)、FLS2(Flagellin Sensing2)、CERK1(Chitin elicitor receptor kinase1 )、BAK1(BRI1-ASSOCIATED RECEPTOR KINASE1)、BIK1(BOTRYTIS-INDUCED KINASE1)、PBL1﹝AvrPphB susceptible1 (PBS1)-like﹞、MPK3、MPK6和PBL2上調(diào)表達(dá),以及PR1(Pathogenesis-related)、PR2和WRKY29上調(diào)表達(dá),同時誘導(dǎo)H2O2產(chǎn)生,出現(xiàn)HR(Hypersensitive response)過敏性反應(yīng)類似的細(xì)胞壞死癥狀。轉(zhuǎn)PRW8基因的煙草可提高白粉病的抗性,其對抗性調(diào)控依賴于SA(Salic acid)通路和EDS1(ENHANCED DISEASE SUSCEPTIBILITY1)通路,并伴隨著類似的HR反應(yīng);但同樣轉(zhuǎn)PRW8基因在蕃茄(Lycopersicon esculentum)上未表現(xiàn)出抗白粉病(Oidiumlycopersici)[28]。過量表達(dá)HR1、HR2和HR3基因也有提高白粉病抗性的作用,HR4則更易感白粉??;HR1、HR2和HR3敲除后,HR2和HR3敲除株系更易感白粉病[29]。感白粉病生態(tài)型和抗白粉病生態(tài)型的抗病雜交后代只對白粉菌分生孢子有抑制作用,而在病原菌其他的生活周期抗性不明顯[30]。當(dāng)環(huán)境發(fā)生變化時,不同白粉病抗性的擬南芥植株也會發(fā)生一定變化[31]。RPW8對白粉病的抗性可能同時受到基因本身、遺傳背景和環(huán)境的影響。RPW8除了具有抗白粉病的功能外,可能還具有其他抗性作用,水稻中異源表達(dá)擬南芥RPW8.1基因表現(xiàn)出抗稻瘟病(Pyriculariaoryzae)和白葉枯病(Xanthomonasoryzaepv.oryzae)[32]。華東葡萄(Vitispseudoreticulata)VpRPW8基因受霜霉病誘導(dǎo)表達(dá),轉(zhuǎn)VpRPW8基因煙草(Nicotianabenthamiana)表現(xiàn)出抗疫霉病(Phytophthoracapsici)。轉(zhuǎn)PRW8基因擬南芥對霜霉病(Hyaloperonosporaparasitica)和花葉病毒(Cauliflowermosaicvirus)的抗性有提高作用;對假單胞菌(Pseudomonassyringaepv.maculicolaES4326)的抗性沒有影響,而更感鏈格孢菌(Alternariaspp.)和 灰霉菌(Botrytisspp.)[27]。
SA、EDS1和NPR1都是植物抗病過程中的重要信號通路[33-37]。RPW8.1和RPW8.2對白粉病的抗性常需要SA和EDS1、PAD4、EDS5、NPR1的參與,并伴隨HR出現(xiàn)[15]。1998年篩選到edr1(Enhanced disease resistance 1)抗白粉病突變體,其沒有提高PR1和PR5的表達(dá)[38]。EDR1通過抑制RPW8.1和RPW8.2的轉(zhuǎn)錄,進(jìn)而抑制HR細(xì)胞死亡和白粉病抗性[15]。EDR1負(fù)調(diào)控RPW8的抗性亦需要EDS1和SA的參與[15],EDR1也聯(lián)系SA與ET(ethylene)[39]、ABA(abscisic acid)[40]信號通路之間的橋梁。EDR2突變體能增強(qiáng)白粉病的抗性,突變體中RPN1a蛋白起關(guān)鍵作用,RPN1a是蛋白降解系統(tǒng)中26S蛋白的一個亞基,也是edr1和pmr4白粉病性抗性調(diào)控所必需的,RPN1a基因突變使植株更易感白粉病[41]。XCT(X-CHROMOSOME ASSOCIATED PROTEIN5(XAP5) CIRCADIAN TIMEKEEPER)基因(At2g21150)正調(diào)控RPW8.1的抗性[42],而XCT是ET信號通路中重要的調(diào)控因子[43]。14-3-3λ(GF14 lambda)正調(diào)控RPW8的抗性,14-3-3λ是真核生物普遍存在的調(diào)節(jié)蛋白,通過識別特異的磷酸化序列與靶蛋白互作,也是蛋白間相互作用的重要橋梁蛋白。14-3-3λ蛋白能夠與APX3 (Ascorbate peroxidase) 和AKR2互作,并可能參與植物氧化代謝過程。14-3-3λ還與BZR1轉(zhuǎn)錄因子互作,參與油菜素內(nèi)脂信號通路BRs(Brassinosteroid signaling)。在酵母和植物體還能觀察到RPW8.2蛋白能與PAPP2C(Phytochrome-associated protein phosphatase type 2C,At1g22280)互作,RNAi干涉PAPP2C后,出現(xiàn)RPW8過表達(dá)的表現(xiàn),即葉片出現(xiàn)敏性細(xì)胞死亡并提高白粉病抗性[44]。PP2C是通過調(diào)控CDK(Cyclin-dependent protein kinases)去磷酸化來調(diào)節(jié)細(xì)胞周期和細(xì)胞凋亡,PP2C還可通過去磷酸化作用調(diào)控MAPK(Mitogen-activated protein kinase)信號通路,進(jìn)而可能關(guān)聯(lián)病菌入侵寄主時細(xì)胞壁完整性過程[45-46]。與PRW8介導(dǎo)密切相關(guān)的基因ERH(Enhancing RPW8-mediated HR-like cell death)突變體erh表現(xiàn)為SA的積累和RPW8表達(dá)量的上升,ERH與酵母IPCS(Inositolphosphorylceramide synthase)同源,并編碼植物IPCS。IPCS是調(diào)控細(xì)胞PCD(Programmed cell death)的重要基因,在植物防疫反應(yīng)中扮演著重要角色[47]。
白粉菌在入侵過程中形成吸器體(Haustorium)、吸器外質(zhì)膜(Extrahaustorial membrane,EHM)和吸器外間質(zhì)(Extrahaustorial matrix,EHMx)[48],將白粉菌吸器從葉片組織中分離出來,可觀測到PRW8.2蛋白匯集到吸器外質(zhì)膜上[49],PRW8同源蛋白也有類似現(xiàn)象[29]。RPW8.2被白粉菌誘導(dǎo)表達(dá)后還激發(fā)過氧化氫在吸器復(fù)合體(Encasement of Haustorial Complex,EHC)內(nèi)高濃度富集,同時激發(fā)富含胼胝質(zhì)(Callose)的吸器復(fù)合體形成,并將高濃度的過氧化氫限制在吸器復(fù)合體內(nèi),從而達(dá)到抗病的效果而不傷害寄主細(xì)胞;在植株抗白粉病過程中,胼胝質(zhì)沉積現(xiàn)象在其他抗病基因型中也起到十分關(guān)鍵的作用[50-51]。胼胝質(zhì)沉積往往也需要SA的誘導(dǎo)和參與[52]。當(dāng)EHC不足以阻止白粉菌的入侵時,RPW8.2表達(dá)量便不斷增加直至受侵染細(xì)胞死亡,從而消滅入侵的白粉菌[53]。RPW8.2-YFP不但可以錨定在白粉菌吸器外質(zhì)膜上,也可以錨定霜霉菌吸器表面。但是,失去抗性功能的RPW8突變體即便可以錨定到吸器外質(zhì)膜上,或者失去錨定功能的RPW8突變體均不能產(chǎn)生抗病性[54]。
RPW8的上調(diào)表達(dá)常伴隨著活性氧產(chǎn)生,過量的活性氧產(chǎn)生不僅對病原菌具有殺傷作用,同時也對寄主本身形成傷害,除EHC對寄主細(xì)胞保護(hù)外,黃嘌呤脫氫酶XDH1(XANTHINE DEHYDROGENASE1)對寄主保護(hù)也有重要作用。XDH1通過調(diào)控ROS過程,影響RPW8介導(dǎo)的白粉病抗性,黃嘌呤脫氫酶是植物幾種鉬酶之一,XDH即可在嘌呤代謝過程中催化黃嘌呤(xanthine)和次黃嘌呤(of xanthine)生成尿酸,還可轉(zhuǎn)化為黃嘌呤氧化酶還原酶(Xanthine oxidoreductase,XOR)促進(jìn)ROS的產(chǎn)生。在白粉病侵染過程中,一方面XDH促進(jìn)ROS破壞吸器的形成,另一方面作為看家酶類存在,代謝產(chǎn)生尿酸來保護(hù)寄主細(xì)胞免受活性氧的傷害。XDH1基因啟動子包括3個WRKY結(jié)合元件W-box(TTGACC/T),預(yù)示其可能受WRKY的調(diào)控[55-56]。
白粉病是最為常見的一種植物病害,白粉菌種類有600余種,每個種又存在或多或少的生理小種,其為害的植物寄主近萬種。在進(jìn)化過程中,很多白粉菌(或生理小種)與相應(yīng)的植物種類(或生態(tài)型)形成專一性的寄生關(guān)系,RPW8在這一進(jìn)化過程中也發(fā)生了復(fù)雜遺傳變異的事件,這些事件是否與白粉病直接相關(guān)還有待深入研究。白粉病抗性調(diào)控基因除RPW8外,目前已報道在植物白粉病抗性調(diào)控中起重要作用的還有WRKY、PMR(powdery mildew resistant)、MLO(mildew locus O)和MLA(mildew locus A)等基因。RPW8在不同植物或生態(tài)型中的基因數(shù)量、結(jié)構(gòu)、功能等方面有著豐富的變化,為白粉病抗性研究帶來了一定的難度,同時也帶來了機(jī)遇:當(dāng)RPW8發(fā)揮抗病作用并占主導(dǎo)地位時,如何通過調(diào)控網(wǎng)絡(luò)與其他抗病基因協(xié)同調(diào)控;當(dāng)RPW8失去抗病功能時,其在生命體中又扮演怎樣的角色,其他抗病基因如何彌補(bǔ)RPW8的抗病功能,使植株產(chǎn)生抗病性,這些都值得去探索。RPW8基因在同一類群內(nèi)豐富的核苷酸多樣性和不同類群間高頻次的基因片段的插入、交換、缺失等事件的發(fā)生,使其成為種群關(guān)系甚至不同植物種類進(jìn)化關(guān)系的研究提供了一個較好的切入點(diǎn)。隨著對RPW8基因研究的不斷深入,預(yù)期其可為不同種類植物白粉病的抗性機(jī)制、白粉病抗性育種等方面的研究和應(yīng)用提供重要的參考價值。