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      pH對(duì)褐環(huán)粘蓋牛肝菌蛋白質(zhì)和核酸的影響

      2019-06-11 05:31:42蔣瑩程永樂曹代京陳有君李國光閆偉
      安徽農(nóng)業(yè)科學(xué) 2019年2期
      關(guān)鍵詞:核酸蛋白質(zhì)

      蔣瑩 程永樂 曹代京 陳有君 李國光 閆偉

      摘要為了探明環(huán)境pH對(duì)褐環(huán)粘蓋牛肝菌(Suillus luteus(L.:Fr.)Gray)生長代謝的影響機(jī)理,研究不同pH條件下液體培養(yǎng)褐環(huán)粘蓋牛肝菌菌絲中蛋白質(zhì)和核酸的含量變化,結(jié)果顯示:該菌在pH 3.0~6.0范圍內(nèi),隨著pH的增加,蛋白質(zhì)及核酸的含量逐漸增加,并在pH 6.0時(shí)達(dá)到最高值;在pH 6.0~8.0范圍內(nèi),蛋白質(zhì)及核酸的含量迅速降低。蛋白質(zhì)的含量和RNA、DNA的含量之間極顯著相關(guān),相關(guān)系數(shù)分別達(dá)0.923和0.977,DNA和RNA的含量之間也極顯著相關(guān),相關(guān)系數(shù)達(dá)0.927。該研究可為進(jìn)一步探索褐環(huán)粘蓋牛肝菌適應(yīng)與調(diào)節(jié)環(huán)境pH機(jī)理方面提供依據(jù)。

      關(guān)鍵詞褐環(huán)粘蓋牛肝菌;pH;蛋白質(zhì);核酸

      中圖分類號(hào)S646.3文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼A文章編號(hào)0517-6611(2019)02-0004-03

      doi:10.3969/j.issn.0517-6611.2019.02.002

      開放科學(xué)(資源服務(wù))標(biāo)識(shí)碼(OSID):

      褐環(huán)粘蓋牛肝菌(Suillus luteus(L.:Fr.)Gray)是分布于我國甘肅、內(nèi)蒙古[1]、陜西、黑龍江、西藏、遼寧以及廣東等地的外生菌根真菌,不同地區(qū)土壤的酸堿度不同導(dǎo)致菌絲體的生長狀況不盡相同[2-3],所以環(huán)境pH對(duì)該菌的影響引發(fā)大量學(xué)者的研究討論。張茹琴等[4]發(fā)現(xiàn)該菌的最適生長pH為5.3~6.7,且培養(yǎng)后培養(yǎng)基的pH降低。雷增普等[5]通過大田試驗(yàn)發(fā)現(xiàn),該菌具有抗堿能力(土壤pH 8.6)。姚慶智等[6]發(fā)現(xiàn)該菌在pH 6~7時(shí)生長最為旺盛。宋微等[7]研究發(fā)現(xiàn),該菌在pH 4.0~8.0的固體培養(yǎng)基上能生長,且最適pH為5.0,在pH小于5.0或者大于6.0時(shí),該菌的增長速度減緩,菌苔變薄。劉淑清等[8]通過試驗(yàn)發(fā)現(xiàn),含有檸檬酸-磷酸二氫鉀緩沖液且pH為4.5的培養(yǎng)基中該菌的生物量最高,當(dāng)pH大于4.5時(shí),菌絲的生物量隨著pH的增高而逐漸降低[8]。劉強(qiáng)等[9]研究發(fā)現(xiàn),在NaCl濃度為0.1 mol/L且pH為6.0時(shí),該菌長勢(shì)最好,隨著環(huán)境pH的增加,菌體受到的抑制作用也愈加明顯。劉楊[10]研究不同培養(yǎng)基、pH、碳氮源等因素對(duì)該菌的影響,發(fā)現(xiàn)該菌在Pach培養(yǎng)基上的最適生長pH為4.5。王明慧[11]發(fā)現(xiàn)該菌的蛋白含量隨著pH的升高而升高,在pH為5.0時(shí)增長速率最大,且在pH 7.0時(shí)蛋白含量達(dá)到最大值,達(dá)到峰值后蛋白質(zhì)含量迅速下降。劉萌[12]發(fā)現(xiàn)該菌在pH 5.0~6.0時(shí)分泌的有機(jī)酸最多,生長狀況最好。但是,環(huán)境pH對(duì)該菌核酸含量的影響還缺少研究。

      通過對(duì)多種絲狀真菌的研究發(fā)現(xiàn),生物響應(yīng)外界環(huán)境酸堿性的改變是通過自身基因表達(dá)的改變來實(shí)現(xiàn)的[13]。嗜水氣單胞菌在中性或偏酸性(pH 7.0和pH 5.0)環(huán)境中,4種毒性基因可以表達(dá),而在堿性環(huán)境中僅僅只有1種基因可以表達(dá)[14]。賈海鋒等[15]通過不同pH處理草莓果實(shí)葉片的試驗(yàn),發(fā)現(xiàn)隨著pH的增加基因表達(dá)量呈顯著上升趨勢(shì),并在pH 6時(shí)獲得最大值。沈靜等[16]發(fā)現(xiàn)低pH嚴(yán)重影響水稻根系細(xì)胞中細(xì)胞膜質(zhì)子泵基因的表達(dá),在pH 5.5時(shí)該基因的表達(dá)量最高。有研究表明,細(xì)胞膜質(zhì)子泵的最高活性范圍為pH 6.0~6.5[17-18],pH通過影響其活性進(jìn)而影響其表達(dá)量。以上說明環(huán)境pH會(huì)對(duì)生物體的基因產(chǎn)生影響。雖然部分研究學(xué)者針對(duì)pH與褐環(huán)粘蓋牛肝菌之間的關(guān)系做了大量研究,但從蛋白質(zhì)及核酸含量方面研究該菌與環(huán)境pH之間關(guān)系的報(bào)道目前還不是很多。筆者研究了該菌在不同pH培養(yǎng)下蛋白質(zhì)和核酸的含量變化,以期為深入了解褐環(huán)粘蓋牛肝菌生理學(xué)及其改變環(huán)境pH的調(diào)控機(jī)制提供依據(jù)。

      1材料與方法

      1.1試驗(yàn)處理

      將在Pach培養(yǎng)基中培養(yǎng)7 d的褐環(huán)粘蓋牛肝菌Sp9菌株(由內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)菌根技術(shù)研究室提供)轉(zhuǎn)接到不同pH(滅菌后pH為3.0、4.0、4.5、5.0、5.5、6.0、7.0和8.0)的液體培養(yǎng)基中,每瓶接入11塊,150 mL三角瓶裝液量為50 mL,置于25 ℃恒溫培養(yǎng)箱中靜置培養(yǎng),并每天更換其培養(yǎng)基,5 d后濾出菌絲,備用。

      1.2試驗(yàn)方法

      1.2.1蛋白質(zhì)的測(cè)定。

      取0.01 g菌絲用液氮冷卻后于冰浴中進(jìn)行研磨,加入1 mL研磨緩沖液后裝入離心管中于-4 ℃、6 000 r/min條件下離心5 min。取上清液,再次置于離心管中,并于-4 ℃、10 000 r/min條件下離心10 min,獲得上清液。用考馬斯亮藍(lán)法測(cè)定蛋白質(zhì)含量(以牛血清蛋白溶液為標(biāo)準(zhǔn)液,用考馬斯亮藍(lán)法做標(biāo)準(zhǔn)曲線:y=85.816x-1.098 6,其中x為吸光度,y為蛋白質(zhì)含量,線性相關(guān)系數(shù)r為0.999,根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)曲線計(jì)算出8個(gè)樣品中相應(yīng)蛋白質(zhì)的含量)。

      1.2.2RNA含量的測(cè)定。取0.01 g菌絲用液氮冷卻后在冰浴中充分研磨至粉末,按照RNAprep Pure 多糖多酚植物總RNA提取試劑盒(天根公司)所提供的方法提取該菌的總RNA,并溶于ddH2O中,取1 μL RNA ddH2O溶液于Biodrop中檢測(cè)RNA含量。

      1.2.3DNA含量的測(cè)定。取0.01 g菌絲用液氮冷卻后于冰浴中充分研磨至粉末,按照植物基因組DNA提取試劑盒(天根公司)所給的方法提取該菌的總DNA,并溶于ddH2O。取1 μL DNA ddH2O溶液于Biodrop中進(jìn)行DNA含量檢測(cè)。

      2結(jié)果與分析

      2.1pH對(duì)褐環(huán)粘蓋牛肝菌蛋白質(zhì)含量的影響

      不同環(huán)境pH培養(yǎng)5 d后菌絲體的蛋白含量如圖1所示。由圖1可知,當(dāng)pH小于6時(shí),蛋白質(zhì)含量隨著pH的升高而逐漸上升,在pH為3.0~4.5時(shí),蛋白質(zhì)的含量上升緩慢,每增加1個(gè)單位的pH,蛋白質(zhì)平均增加215.79 ng;在pH 4.5~5.0范圍內(nèi),單位pH的蛋白質(zhì)增長量極其微小,僅增加43.07 ng;在pH為5.0~6.0時(shí),蛋白質(zhì)含量迅速增長,單位pH的蛋白質(zhì)增長量高達(dá)714.35 ng,且在pH 6.0時(shí)蛋白質(zhì)的含量達(dá)到最高值;達(dá)到峰值后,隨著pH的增加,蛋白質(zhì)含量逐漸降低,在pH為6.0~8.0時(shí),蛋白質(zhì)含量顯著下降,單位pH的蛋白質(zhì)減少量達(dá)到330.59 ng。就整體趨勢(shì)而言,蛋白質(zhì)含量受環(huán)境pH的影響較大,在pH 6.0的條件下,蛋白質(zhì)含量最高,推測(cè)pH 6.0為該菌的最適生長pH。

      2.2pH對(duì)褐環(huán)粘蓋牛肝菌RNA含量的影響

      不同環(huán)境pH培養(yǎng)5 d后菌絲體的RNA含量如圖2所示。由圖2可知,當(dāng)pH小于6時(shí),RNA含量隨著pH的升高而升高,在pH為3.0~4.5時(shí),RNA含量增長緩慢,環(huán)境pH每增加1個(gè)單位,RNA含量增加77.30 ng;在pH為4.5~6.0時(shí),RNA含量顯著增加,平均環(huán)境pH每增加1個(gè)單位,RNA含量的增長量可達(dá)283.79 ng,并在pH 6.0時(shí)達(dá)到峰值,為639.60 ng/mg。此后,隨著pH的增加,RNA含量開始下降,在pH為6.0~7.0時(shí),RNA含量逐漸減少,單位減少量為150.38 ng;在pH為7.0~8.0時(shí),RNA含量迅速下降,單位pH的RNA減少量達(dá)到313.16 ng,說明在堿性環(huán)境下不利于RNA的合成。就整體趨勢(shì)而言,環(huán)境pH對(duì)RNA含量影響較大,RNA含量在pH 6.0時(shí)獲得最大值,因此推測(cè)該菌的最適生長pH為6.0。

      2.3pH對(duì)褐環(huán)粘蓋牛肝菌DNA含量的影響

      不同環(huán)境pH培養(yǎng)5 d后菌絲體的DNA含量如圖3所示。由圖3可知,當(dāng)pH小于6.0時(shí),DNA含量隨著pH的升高而逐漸上升,在pH為3.0~4.0時(shí),DNA含量增長緩慢,單位pH的DNA增加量為62.44 ng;在pH 4.0~4.5時(shí)DNA含量幾乎不變;在pH 4.5~6.0時(shí),DNA含量顯著增加,單位pH的DNA增加量可達(dá)90.23 ng,并在pH 6.0時(shí)DNA含量達(dá)到最大值;在pH 6.0~8.0時(shí),DNA含量快速下降,單位pH的DNA減少量可達(dá)59.21 ng。就整體變化趨勢(shì)而言,DNA含量受環(huán)境pH影響較大,DNA含量在pH 6.0時(shí)最高,因此推測(cè)該菌的最適生長pH為6.0。

      3結(jié)論與討論

      3.1褐環(huán)粘蓋牛肝菌蛋白質(zhì)含量與RNA含量的相關(guān)性

      由圖4可以看出,蛋白質(zhì)含量隨RNA含量的增加而增加,相關(guān)分析表明二者之間具有極顯著的相關(guān)關(guān)系(相關(guān)系數(shù)r=0.923,P<0.01)。菌絲中蛋白質(zhì)含量與RNA含量的線性回歸方程為y=1.5722x+1 832.1。

      通過對(duì)圖1和圖2進(jìn)行對(duì)比發(fā)現(xiàn),在pH 3.0~6.0的培養(yǎng)條件下,蛋白質(zhì)與RNA的含量都隨著pH的升高而逐漸上升,其中在pH 3.0~4.5時(shí),RNA含量的增加速率明顯高于蛋白質(zhì)含量的增長速率,單位菌絲體中平均1 ng RNA可以翻譯為14.859 ng蛋白質(zhì);在pH 4.5~6.0時(shí),蛋白質(zhì)含量增長率高于RNA含量增長率,單位菌絲體中平均1 ng RNA可以翻譯為6.441 ng蛋白質(zhì),雖然翻譯率下降,但由于轉(zhuǎn)錄率較高,獲得的RNA含量較高,所以依然獲得較高的蛋白質(zhì)含量,并在pH 6.0的培養(yǎng)條件下蛋白質(zhì)含量達(dá)到峰值,說明在該pH范圍內(nèi)更利于蛋白質(zhì)的合成;在pH 6.0~8.0的培養(yǎng)條件下,二者的含量都明顯下降,單位菌絲體中平均1 ng RNA可以翻譯為7.732 ng蛋白質(zhì),雖然翻譯率有所提高,但由于該范圍的環(huán)境pH培養(yǎng)條件下RNA的合成量逐漸降低,因此翻譯獲得的蛋白質(zhì)含量依然呈下降趨勢(shì),尤其在pH 7.0~8.0時(shí),RNA含量的下降速率比蛋白質(zhì)的下降速率更大。

      3.2褐環(huán)粘蓋牛肝菌蛋白質(zhì)含量與DNA含量的相關(guān)性

      由圖5可以看出,蛋白質(zhì)含量隨DNA含量的增加而增加,相關(guān)分析表明二者之間具有極顯著的相關(guān)關(guān)系(相關(guān)系數(shù)r=0.977,P<0.01)。菌絲中蛋白質(zhì)含量和DNA含量的線性回歸方程為y=5.452 4x+1 466.9。

      通過對(duì)圖1和圖3進(jìn)行對(duì)比發(fā)現(xiàn),在pH 3.0~6.0的培養(yǎng)條件下,蛋白質(zhì)和DNA的含量都隨著pH的增加而增加,其中在pH 3.0~4.5時(shí),DNA的增長率接近蛋白質(zhì)增長率的7倍,說明在該pH范圍內(nèi),更有利于DNA的合成,單位基因的表達(dá)量不大,導(dǎo)致蛋白質(zhì)含量的增加速率緩慢,但是在pH 4.5~6.0 的培養(yǎng)條件下,蛋白質(zhì)的增長率迅速增加,即基因的表達(dá)量顯著增加,說明在該pH范圍內(nèi)更有利于基因的表達(dá)。在pH 6.0~8.0的培養(yǎng)條件下,二者含量均顯著下降,其中,在pH 6.0~7.0時(shí),DNA含量的減少率明顯高于蛋白質(zhì)含量的減少率,說明在該環(huán)境pH下更不利于DNA的生成;在pH 7.0~8.0時(shí),二者含量均繼續(xù)下降接近于最低值,說明在堿性條件下不利于該菌基因的表達(dá)。

      3.3褐環(huán)粘蓋牛肝菌RNA含量與DNA含量的相關(guān)性

      由圖6可知,RNA含量隨DNA含量的增加而增加,相關(guān)分析表明二者之間具有極顯著的相關(guān)關(guān)系(相關(guān)系數(shù)r=0.927,P<0.01)。菌絲中RNA含量與DNA含量線性回歸方程為y=3.037 1x-161.93。

      通過對(duì)圖2和圖3進(jìn)行綜合分析,可以發(fā)現(xiàn),在pH 3.0~4.5的培養(yǎng)條件下,單位菌絲體中平均1 ng DNA可以轉(zhuǎn)錄為1.443 ng RNA;在pH 4.5~6.0的培養(yǎng)條件下,單位菌絲體中平均1 ng DNA可以轉(zhuǎn)錄為2.254 ng RNA,轉(zhuǎn)錄率有所提高,并在pH 6.0的培養(yǎng)條件下獲得最高RNA含量;在pH 6.0~8.0的培養(yǎng)條件下,單位菌絲體中平均1 ng DNA可以轉(zhuǎn)錄為1.956 ng RNA,轉(zhuǎn)錄率有所下降,說明該范圍的環(huán)境pH下,不利于RNA的合成。

      綜上所述,在pH 3.0~6.0的培養(yǎng)條件下,褐環(huán)粘蓋牛肝菌菌絲體中蛋白質(zhì)和核酸的含量都隨著pH的增加而逐漸增加,并在pH 6.0時(shí)獲得峰值,此后隨著pH的增加其含量均顯著降低。該結(jié)果與孫琳[19]、蔡楠楠[20]在pH 6.0獲得最大生物量的結(jié)果相吻合,因此,可以認(rèn)為弱酸性環(huán)境下更有利于褐環(huán)粘蓋牛肝菌的生長,并且該菌的最適生長pH為6.0。

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