基于莖干含水率的紫薇病蟲害等級早期診斷方法

高 超 趙 玥 趙燕東

(1.北京林業(yè)大學(xué)工學(xué)院, 北京 100083； 2.城鄉(xiāng)生態(tài)環(huán)境北京實(shí)驗室， 北京 100083;3.林業(yè)裝備與自動化國家林業(yè)局重點(diǎn)實(shí)驗室， 北京 100083)

0 引言

森林植被中病蟲害的大面積傳播蔓延，將破壞森林生態(tài)平衡。因此，及時對植物病蟲害進(jìn)行診斷具有重大意義，這也成為廣大學(xué)者的研究熱點(diǎn)。

目前，植物病蟲害診斷方法主要分為兩類，即基于植物外部表觀特征的診斷方法和基于植物內(nèi)部生理特征的診斷方法[1-3]。植物一般在感染病蟲害后，其莖、花、葉、果實(shí)等部位會殘留病斑或蟲斑，結(jié)合機(jī)器視覺和相關(guān)圖像處理方法即可完成植物病蟲害的診斷。BOISSARD等[4]融合圖像掃描、采樣優(yōu)化、視覺認(rèn)知等技術(shù)，設(shè)計了溫室玫瑰葉粉虱早期診斷系統(tǒng)，該系統(tǒng)能夠準(zhǔn)確地識別并統(tǒng)計粉虱，且效率是人工識別計數(shù)的5倍。PYDIPATI等[5]在實(shí)驗室采用模擬相機(jī)獲取正常柑橘葉片和3種染病葉片的圖像，并以顏色指數(shù)為特征構(gòu)建了基于神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的柑橘病害分類系統(tǒng)，該系統(tǒng)的平均識別準(zhǔn)確率達(dá)到95%。EBRAHIMI等[6]在溫室中采用數(shù)字相機(jī)獲取草莓冠層圖像，并以圖像區(qū)域指數(shù)和顏色指數(shù)為特征構(gòu)建了基于支持向量機(jī)的草莓寄生蟲分類系統(tǒng)，該系統(tǒng)的平均相對誤差小于2.25%。MOHANTY等[7]借助植物葉片圖像的開源數(shù)據(jù)庫，訓(xùn)練了卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)，該網(wǎng)絡(luò)對14種作物和26種病蟲害的識別準(zhǔn)確率達(dá)到99.35%。盡管隨著圖像特征提取和分類識別算法的優(yōu)化和創(chuàng)新，基于植物外部表觀特征的病蟲害識別率逐步上升，但是此時病蟲害已經(jīng)嚴(yán)重危害植物健康，達(dá)不到提前預(yù)警、防治的目標(biāo)。

當(dāng)植物受到病蟲害侵襲時，植物各種組織的新陳代謝活動不穩(wěn)定，進(jìn)一步影響植物的生理生化參數(shù)，而植物的外部表觀癥狀與其內(nèi)部生理變化在時間上存在滯后性，因此通過測量植物的生理生化指標(biāo)可以實(shí)現(xiàn)對病蟲害的提前預(yù)警[8]。MOSHOU等[9]運(yùn)用高光譜反射成像和多光譜熒光成像技術(shù)對染病前后冬小麥的葉綠素含量進(jìn)行監(jiān)測，并通過敏感波段提取和數(shù)據(jù)融合算法實(shí)現(xiàn)了對小麥條銹病的診斷識別，識別準(zhǔn)確率達(dá)到94.5%。ELLIS等[10]以蘋果樹為試驗對象，發(fā)現(xiàn)感染白粉病的蘋果樹葉片的光合速率和呼吸速率都顯著下降，這種抑制作用在幼葉中表現(xiàn)得更為強(qiáng)烈。MOALEMIYAN等[11]以芒果樹為試驗對象，通過判別分析揮發(fā)性有機(jī)物含量對莖腐病和炭疽病進(jìn)行診斷，該方法的識別率在33%～88%之間。與此同時，一些學(xué)者采用酶聯(lián)免疫吸附試驗法和聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)法在分子水分上實(shí)現(xiàn)了對植物病蟲害的精確診斷[12-14]。盡管通過監(jiān)測植物的生理生化參數(shù)可以實(shí)現(xiàn)對病蟲害的早期診斷，但是現(xiàn)階段對植物生理生化指標(biāo)難以實(shí)現(xiàn)野外快速、無損、連續(xù)地測量，因此限制了其在農(nóng)林業(yè)生產(chǎn)中的大規(guī)模應(yīng)用。

有學(xué)者證實(shí)，在病蟲害侵染植物的早期階段，植物體內(nèi)水分含量有顯著變化，因此可以作為檢測病蟲害的早期指標(biāo)[15-17]。隨著莖干含水率檢測技術(shù)的發(fā)展，現(xiàn)階段國內(nèi)已研發(fā)出適用于野外快速、無損、連續(xù)測量的莖干含水率傳感器，這使得通過監(jiān)測植物莖干含水率變化實(shí)現(xiàn)病蟲害的早期診斷成為可行[18-20]。本文以紫薇為研究對象，通過長期監(jiān)測紫薇萌芽期莖干含水率變化，分析不同染病程度紫薇的莖干含水率差異，并以莖干含水率為特征，結(jié)合相關(guān)機(jī)器學(xué)習(xí)算法實(shí)現(xiàn)對紫薇病蟲害等級的早期診斷。

1 試驗材料與方法

1.1 試驗地點(diǎn)概況

試驗地點(diǎn)位于北京市海淀區(qū)東升鎮(zhèn)八家村的三頃園苗圃，其地理位置為116°20′43.6236″ E，40°0′41.9184″N,海拔高度為50 m左右，地勢平坦，占地約31 200 m2，苗圃內(nèi)培育有紫薇、核桃楸、海棠等多種小型喬木。土壤質(zhì)地為粘壤土，土壤pH值在7～8之間。四季分明，春秋短促，年均氣溫為12.6℃，年均降水量為620 mm，年均日照時數(shù)為2 569 h，屬溫帶季風(fēng)氣候。

1.2 試驗樣本制備

依據(jù)歷史的栽培經(jīng)驗，苗圃內(nèi)的紫薇每年6月都會被紫薇絨蚧所侵蝕，而其分泌物又極易引發(fā)煤污病，在葉面上形成黑色小霉斑，在影響葉片光合作用的同時也降低了紫薇的觀賞價值[21]。并且紫薇絨蚧通常在枝干的裂縫內(nèi)越冬孵化，難以從表觀上識別，因此試驗中選取樹勢相近的紫薇作為研究對象，分析不同染病程度紫薇的莖干含水率差異。為了獲取不同染病程度的紫薇樣本，將苗圃內(nèi)紫薇分為3等份并施加不同等級的病蟲害防治措施。對第1等份紫薇在冬春兩季均施加病蟲害防治措施，包括修剪枝條、噴灑石硫合劑等；對第2等份紫薇只在春季發(fā)芽前施加病蟲害防治措施；對第3等份紫薇則不施加任何病蟲害防治措施。由于采取了不同等級的防治措施，紫薇在7月長出葉片后呈現(xiàn)出不同的健康狀態(tài)，具體的表觀特征如圖1所示。圖1a為第1等份紫薇葉片的典型特征，即幾乎沒有黑斑，可將其標(biāo)記為健康紫薇；圖1b為第2等份紫薇葉片的典型特征，即黑斑面積小于1/3葉面積，可將其標(biāo)記為輕微病蟲害紫薇; 圖1c為第3等份紫薇葉片的典型特征，即黑斑面積大于1/3葉面積，可將其標(biāo)記為嚴(yán)重病蟲害紫薇。表1展示了不同健康等級紫薇在各生長周期中的樹勢，從表中可以看出，在落葉休眠期，不同健康等級紫薇在樹勢上無顯著差異，而在復(fù)蘇萌芽期、開花期、結(jié)果期，不同健康等級紫薇在樹勢上有顯著差異，從好到壞依次為：健康紫薇、輕微病蟲害紫薇、嚴(yán)重病蟲害紫薇，因此表明復(fù)蘇萌芽期是實(shí)現(xiàn)對紫薇病蟲害等級早期診斷的最佳時間周期。

1.3 試驗數(shù)據(jù)采集

在完成了3種不同健康等級紫薇樣本的制備之后，從每種健康等級紫薇中選取24株作為試驗對象。采用BD-IV型植物莖干含水率傳感器(北京林業(yè)大學(xué)，0～60%，±1%)測量紫薇莖干體積含水率，傳感器的安裝位置緊鄰于主干第一分叉處，采用自主設(shè)計的基于AVR128的多通道數(shù)字采集器連接各路莖干含水率傳感器，試驗中的一個監(jiān)測站如圖2所示。采集器每10 min自動采集并存儲一個數(shù)據(jù)包，1 d總計采集144個數(shù)據(jù)包，即對于每株紫薇，采集器每天可以記錄144個莖干含水率。在紫薇整個萌芽過程中，對所有試驗對象均采取相同的栽培管理模式，保證其水分、養(yǎng)分供給等外部環(huán)境相近，并記錄紫薇莖干含水率的變化過程。

圖1 不同健康等級的紫薇Fig.1 Lagerstroemia indica with different health levels

紫薇樹勢生長周期落葉休眠期復(fù)蘇萌芽期開花期結(jié)果期11月—次年3月3—7月7—9月9—11月健康葉片舒展且沒有黑斑花量大且花期長果量大且果實(shí)飽滿輕微病蟲害外觀上無顯著差異葉片輕微扭曲且有少量黑斑花量偏少且花期偏短果量偏少且果實(shí)輕微干癟嚴(yán)重病蟲害葉片嚴(yán)重扭曲且有大量黑斑花量少且花期短果量少且果實(shí)嚴(yán)重干癟

圖2 莖干含水率監(jiān)測站Fig.2 Monitoring station of stem water content1.數(shù)字采集器 2.莖干含水率傳感器

2 結(jié)果與分析

2.1 莖干含水率特征提取

2.1.1基于關(guān)鍵參數(shù)的特征提取

通過莖干含水率監(jiān)測站的連續(xù)監(jiān)測，得到紫薇莖干含水率的時間序列數(shù)據(jù)?；跁r間序列的莖干含水率采樣數(shù)據(jù)具有一定的冗余性，直接用于建模不僅會增加模型的復(fù)雜度，而且會降低模型的泛化能力，因此有必要對原始莖干含水率數(shù)據(jù)進(jìn)行特征提取[22-23]。圖3展示了3種不同健康等級紫薇的莖干含水率在復(fù)蘇萌芽期的變化規(guī)律(由于采集器的故障，2017年6月21—26日期間數(shù)據(jù)缺失)。由圖3可以看出，健康和輕微病蟲害紫薇的莖干含水率在萌芽期呈現(xiàn)出先下降后上升的趨勢，嚴(yán)重病蟲害紫薇的莖干含水率則是一直在下降。依據(jù)萌芽期莖干含水率的變化規(guī)律可以對紫薇健康狀態(tài)進(jìn)行初步評估，但是需要等待到紫薇長出新葉，而此時新葉表面已有病斑，不能達(dá)到對病蟲害提前預(yù)警的目的。

圖3 2017年復(fù)蘇萌芽期不同健康等級紫薇的莖干含水率變化曲線Fig.3 Stem water content changing curves of Lagerstroemia indica with different health levels in bud stage

紫薇莖干含水率呈現(xiàn)出單波峰單波谷的周期性變化規(guī)律，周期為1 d，因此以天為單位對莖干含水率時間序列進(jìn)行特征提取具有可行性,并選取日最小含水率、日最大含水率、日平均含水率、日極差含水率4個關(guān)鍵參數(shù)作為莖干含水率特征。以萌芽期第I階段數(shù)據(jù)為基礎(chǔ)，圖4展示了2017年6月1日不同健康等級紫薇莖干含水率4種關(guān)鍵參數(shù)的均值和方差。由圖4可以看出，不同健康等級紫薇莖干含水率的日最小含水率、日最大含水率、日平均含水率差異較大，與健康狀態(tài)正相關(guān)，日極差含水率差異較小，與健康狀態(tài)負(fù)相關(guān)。這種現(xiàn)象符合植物的病蟲害生理特性，因為健康植物的莖干儲水能力和調(diào)節(jié)能力均高于感染病蟲害的植物，所以健康植物的莖干含水率會處在一個較高的水平且波動較小。為了進(jìn)一步驗證4種關(guān)鍵參數(shù)在不同健康等級紫薇中差異性，表2展示了關(guān)鍵參數(shù)的方差分析結(jié)果。從表2可以看出，4種關(guān)鍵參數(shù)的顯著水平P值均小于0.01，表明健康等級對關(guān)鍵參數(shù)的影響均為極顯著。由于健康等級分為3個水平，還需要分析每2個健康等級間對關(guān)鍵參數(shù)的影響，表3展示了健康等級間的兩兩比較結(jié)果。由表3可以看出，只有健康等級1、2對極差含水率的影響為不顯著，其余兩兩比較的結(jié)果均為極顯著。綜合以上的分析結(jié)果，表明4種關(guān)鍵參數(shù)可以作為莖干含水率的特征向量用以診斷紫薇的病蟲害等級。

圖4 萌芽期不同健康等級紫薇莖干含水率的關(guān)鍵參數(shù)Fig.4 Stem water content key parameters of Lagerstroemia indica with different health levels in bud stage

關(guān)鍵參數(shù)來源平方和自由度均方FP組間0.95320.476421.562<0.001日最小含水率組內(nèi)0.078690.001總計1.03171組間0.77820.389368.243<0.001日最大含水率組內(nèi)0.073690.001總計0.85171組間0.84220.421534.468<0.001日平均含水率組內(nèi)0.054690.001總計0.89671組間0.00920.00410.350<0.001日極差含水率組內(nèi)0.02969<0.001總計0.03871

2.1.2基于主成分的特征提取

莖干含水率采樣數(shù)據(jù)可以被視作時間序列上的高維向量，采用主成分分析可以將高維向量映射成低維向量，在達(dá)到特征提取目的的同時，還能保證各特征之間相互獨(dú)立[24-26]。同樣以復(fù)蘇萌芽期數(shù)據(jù)為基礎(chǔ)，圖5展示了整個復(fù)蘇萌芽期不同健康等級紫薇莖干含水率的主成分貢獻(xiàn)率。在圖3中，不同健康等級紫薇在階段Ⅰ和階段Ⅱ中呈現(xiàn)出不同的變化規(guī)律，但在圖5中，不同健康等級紫薇莖干含水率的前4個主成分累計貢獻(xiàn)率均超過99.5%，表明基于主成分的特征提取適用于整個復(fù)蘇萌芽期。為了能達(dá)到對病蟲害等級提前診斷的目的，應(yīng)該以階段Ⅰ的數(shù)據(jù)為基礎(chǔ)進(jìn)行分析，因為紫薇此時并沒有長出新葉，并且2017年6月1日這天所對應(yīng)的主成分累計貢獻(xiàn)率最低，如果使用該天數(shù)據(jù)進(jìn)行主成分特征提取能夠?qū)崿F(xiàn)對病蟲害的早期診斷，那么對萌芽期內(nèi)其它日期數(shù)據(jù)進(jìn)行同樣處理也能實(shí)現(xiàn)該目的。表4展示了2017年6月1日不同健康等級紫薇莖干含水率時間序列的主成分分析結(jié)果，從表中可以看出，莖干含水率時間序列前4個主成分的累計貢獻(xiàn)率達(dá)到99.7%，可以完好地表征原始序列所包含的信息，因此可以選取前4個主成分作為莖干含水率的特征向量用以診斷紫薇的病蟲害等級，這樣也統(tǒng)一了關(guān)鍵參數(shù)特征和主成分特征的維度。

表3 健康等級間的兩兩比較Tab.3 Pairwise comparisons among health levels

注：等級1表示健康，等級2表示輕微病蟲害，等級3表示嚴(yán)重病蟲害。

圖5 2017年復(fù)蘇萌芽期不同健康等級紫薇莖干含水率的主成分貢獻(xiàn)率Fig.5 Principal component contribution rate of stem water content of Lagerstroemia indica with different health levels in bud stage

主成分特征值累計特征值貢獻(xiàn)率/%累計貢獻(xiàn)率/%第1主成分8721289872128998.4898.48第2主成分6809187893800.7799.25第3主成分2637388157530.3099.55第4主成分1329788290500.1599.70

2.2 病蟲害等級診斷模型構(gòu)建

試驗中模型的輸入為帶有健康等級標(biāo)簽的紫薇莖干含水率特征，模型的核心為分類器，模型的輸出為對應(yīng)紫薇的健康等級。紫薇莖干含水率特征有3種，分別為時序特征、關(guān)鍵參數(shù)特征、主成分特征，其中時序特征為144維，關(guān)鍵參數(shù)和主成分特征均為4維，分類器有4種，分別為RBF神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)、BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)、支持向量機(jī)(Support vector machine，SVM)、K均值聚類。因此依據(jù)莖干含水率特征和分類器的不同組合方式可以構(gòu)建12種紫薇病蟲害等級診斷模型，由前3種分類器構(gòu)建的模型稱為有監(jiān)督模型，由K均值聚類構(gòu)建的模型稱為無監(jiān)督模型，兩類模型的工作流程圖如圖6所示。在圖6中，樣本預(yù)處理包括標(biāo)簽化、歸一化、亂序化，分類器需要設(shè)置網(wǎng)絡(luò)層次、網(wǎng)絡(luò)初始參數(shù)、激活函數(shù)、核函數(shù)、迭代停止條件等參數(shù)，聚類需要設(shè)置距離函數(shù)，模型評價指標(biāo)為分類準(zhǔn)確率。由于試驗樣本數(shù)量較小，因此試驗中對有監(jiān)督模型采取了3折交叉驗證，以期得到更加穩(wěn)定可靠的模型。

圖6 模型工作流程圖Fig.6 Flow charts of model operation

2.3 病蟲害等級診斷模型性能分析

試驗中分別測試了3種不同莖干含水率特征在4種分類器下的模型性能，試驗結(jié)果如表5所示。從模型的輸入來看，以莖干含水率的時序特征為輸入變量時，4種模型的平均識別率均不小于93%，性能最優(yōu)；以莖干含水率關(guān)鍵參數(shù)和主成分特征為輸入變量時，相同模型的平均識別率相近，但是RBF模型的平均識別率低于70%，性能最差，表明RBF模型嚴(yán)重依賴于輸入特征，魯棒性較差。從模型的分類器來看，基于BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)、SVM的有監(jiān)督模型平均識別率均在94%以上，基于K均值聚類的無監(jiān)督模型平均識別率低于93%，表明有監(jiān)督模型的性能優(yōu)于無監(jiān)督模型。在有監(jiān)督模型中，BP和SVM模型性能相近，且對輸入特征均具有較強(qiáng)的魯棒性，但SVM是一個二分類器，文中的紫薇病蟲害等級診斷是一個三分類問題，因此SVM模型至少需要訓(xùn)練3個分類器才能解決紫薇病蟲害等級診斷問題[27]，而BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)本身就能解決多分類問題，所以相較于SVM，BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)能夠降低模型的復(fù)雜度。對于有監(jiān)督模型，需要對輸入特征添加健康等級標(biāo)簽，但是有些時候難以獲取標(biāo)簽，此時就需要建立無監(jiān)督模型。盡管K均值模型的性能不如BP和SVM模型，但是其平均識別率也不小于86%，能夠滿足一般的林業(yè)生產(chǎn)應(yīng)用。

因此，在綜合考慮到模型復(fù)雜度(包括輸入特征維度和分類器數(shù)量)和準(zhǔn)確識別率情況下，對于有監(jiān)督模型來說，以主成分特征為輸入的BP模型的性能最優(yōu)，平均識別率達(dá)到98%，對于無監(jiān)督模型來說，以主成分特征為輸入的K均值模型最優(yōu)，平均識別率達(dá)到92%。

3 結(jié)論

(1)提出了一種基于莖干含水率的紫薇病蟲害等級早期診斷方法，并針對不同健康等級紫薇的莖干含水率在復(fù)蘇萌芽期的變化規(guī)律，選取日最小含水率、日最大含水率、日平均含水率、日極差含水率4個關(guān)鍵參數(shù)作為莖干含水率特征，其中日最小含水率、日最大含水率、日平均含水率與紫薇健康狀態(tài)正相關(guān)，而日極差含水率與紫薇健康狀態(tài)負(fù)相關(guān)。

表5 病蟲害等級診斷模型的性能分析Tab.5 Performance analysis of health diagnosis models

注：Ⅰ表示時序特征，Ⅱ表示關(guān)鍵參數(shù)特征，Ⅲ表示主成分特征。

(2)基于主成分分析，對不同健康等級紫薇的莖干含水率進(jìn)行特征提取，莖干含水率時間序列前4個主成分的累計貢獻(xiàn)率均達(dá)到99.7%，可以完好地表征原始序列所包含的信息。

(3)基于3種不同莖干含水率特征和4種分類器，構(gòu)建了12種紫薇病蟲害等級診斷模型。在綜合考慮模型復(fù)雜度和識別準(zhǔn)確率情況下，對于有監(jiān)督模型，以主成分特征為輸入的BP模型性能最優(yōu)，平均識別率達(dá)到98%；對于無監(jiān)督模型，以主成分特征為輸入的K均值模型最優(yōu)，平均識別率達(dá)到92%。