田小莉 楊 潔 楊 靜 閆少春 時(shí)靜華# 邵 國(guó)
(1 包頭醫(yī)學(xué)院中心實(shí)驗(yàn)室生物醫(yī)學(xué)研究中心, 神經(jīng)科學(xué)研究所, 包頭 014010; 2 內(nèi)蒙古自治區(qū)低氧轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室, 包頭 014010; 3 首都醫(yī)科大學(xué)宣武醫(yī)院低氧適應(yīng)轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)北京重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室, 北京 100053)
表觀遺傳如DNA甲基化在哺乳動(dòng)物生長(zhǎng)發(fā)育過程中起著重要的作用。DNA甲基轉(zhuǎn)移酶(DNMTs)是調(diào)控表觀遺傳DNA甲基化基因表達(dá)的關(guān)鍵酶,它催化甲基使其從S-腺苷-甲硫氨酸共價(jià)轉(zhuǎn)移到CpG島胞嘧啶殘基上[1]。哺乳動(dòng)物體中,有3類DNA甲基化轉(zhuǎn)移酶:DNMT1、DNMT3A和DNMT3B,在基因組甲基化過程中起著不同的作用。DNMT1是維持基因組中甲基化狀態(tài)所必需的。DNMT3A和DNMT3B負(fù)責(zé)在胚胎發(fā)育期間或有絲分裂后的神經(jīng)元中將非甲基化的DNA甲基化[2-3]。5-氮雜-2′-脫氧胞苷(5-Aza-CdR)是DNMTs抑制劑,是一種胞嘧啶類似物,其通過與酶的半胱氨酸殘基共價(jià)結(jié)合阻斷DNMTs功能[4]。很多癌細(xì)胞系的研究發(fā)現(xiàn)5-Aza-CdR的修飾可以作為一種有效的藥物來(lái)干擾癌癥發(fā)展[5-7]。Xiong等[8]報(bào)道,5-Aza-CdR 通過改變表觀遺傳狀態(tài)誘導(dǎo)人結(jié)直腸癌細(xì)胞的細(xì)胞周期停滯和細(xì)胞死亡。本研究主要是觀察5-Aza-CdR 對(duì)HT22細(xì)胞周期、凋亡及DNMTs表達(dá)水平的影響。
1.1 實(shí)驗(yàn)細(xì)胞
HT22細(xì)胞系是小鼠海馬神經(jīng)元細(xì)胞系,來(lái)自于HT4。本文所用細(xì)胞由中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院癌癥研究所和腫瘤分子生物學(xué)國(guó)家實(shí)驗(yàn)室提供。HT22細(xì)胞中加入含有胎牛血清(FBS)、青霉素和鏈霉素的DMEM高糖培養(yǎng)基(Sigma-Aldrich,USA),置于37℃、5% CO2潮濕的細(xì)胞培養(yǎng)箱中培養(yǎng)[9],待細(xì)胞長(zhǎng)至80%~90%且細(xì)胞狀態(tài)良好,傳代并開始實(shí)驗(yàn)。
1.2 5-Aza-CdR濃度篩選
為確定5-Aza-CdR的有效濃度,在HT22細(xì)胞中加入5、10、15、20mol/L和40μmol/L不同濃度的5-Aza-CdR,使用IncuCyte FLR在顯微鏡(4×)下對(duì)每孔細(xì)胞進(jìn)行實(shí)時(shí)成像,觀測(cè)細(xì)胞的增殖。預(yù)實(shí)驗(yàn)顯示,20μmol/L 濃度的5-Aza-CdR對(duì)細(xì)胞增殖抑制作用最大,5μmol/L濃度的5-Aza-CdR對(duì)細(xì)胞增殖抑制作用最小。因此,我們選擇將HT22細(xì)胞在5μmol/L(最低)和20μmol/L(最高)濃度的5-Aza-CdR中孵育24h。對(duì)照組細(xì)胞中加入PBS孵育24h。
1.3 IncuCyte成像分析
96孔細(xì)胞培養(yǎng)皿中,每孔加入100μl含有10% FBS的DMEM高葡萄糖培養(yǎng)基,每孔接種4×103個(gè)細(xì)胞。待細(xì)胞生長(zhǎng)24h后加入不同濃度的5-Aza-CdR,加藥后實(shí)時(shí)觀察細(xì)胞68h。使用IncuCyte Confluence 1.5版軟件(ESSEN Bioscience, Ann Arbor, MI, USA)分析數(shù)據(jù)。IncuCyte實(shí)驗(yàn)重復(fù)3次。
1.4 Real-time PCR分析
使用TRIzol試劑從HT22細(xì)胞中提取總RNA,根據(jù)反轉(zhuǎn)錄試劑盒(cDNA Synthesis Kit(Invitrogen Company, USA))說(shuō)明書將總RNA逆轉(zhuǎn)錄成cDNA,在ABI 7900PCR儀上進(jìn)行Real-time PCR,使用2△△CT方法,以β-actin做為內(nèi)參[10]。每個(gè)樣品做3個(gè)復(fù)孔,重復(fù)實(shí)驗(yàn)6次。表1是由Sangon生物技術(shù)公司(中國(guó)上海)合成的Real-time PCR引物。
1.5 免疫印跡檢測(cè)
使用(RIPA)細(xì)胞裂解液(碧云天,中國(guó)上海)提取蛋白,用BCA蛋白測(cè)定試劑盒(Pierce Biotechnology, Rockford, USA)測(cè)定蛋白濃度,然后用5%的SDS-PAGE濃縮膠和10% SDS-PAGE分離膠電泳分離等量的蛋白樣品,轉(zhuǎn)移至PVDF膜上,5%脫脂奶粉封閉1h,鼠源DNMT1、DNMT3A、DNMT3B多克隆抗體(Novus Biologicals, Littleton, CO, USA)、鼠源β-actin 單克隆抗體4℃孵育14h(Sigma, St.Louis, MO, USA),洗膜3次,孵育山羊抗鼠二抗(1∶1000),室溫2h。加ECL(碧云天,中國(guó)上海)發(fā)光液,放入蛋白凝膠圖像分析系統(tǒng)中掃描,使用Image J(Scion Corporation, Torrance, CA, USA)圖像分析系統(tǒng)來(lái)量化目的條帶的光密度。蛋白印跡數(shù)據(jù)以β-actin做內(nèi)參。
1.6 細(xì)胞周期檢測(cè)
HT22細(xì)胞棄掉培養(yǎng)基,PBS洗滌2次,胰蛋白酶消化20~30s后,將細(xì)胞收集于離心管中,1500r/min 4℃離心8min,預(yù)冷的PBS洗細(xì)胞2次,緩慢加入預(yù)冷的70%乙醇,4℃固定過夜[11]。棄掉固定液,PBS沖洗細(xì)胞,加入適量PI(碘化丙啶)染色,避光4℃反應(yīng)30min。流式細(xì)胞儀檢測(cè),對(duì)G1期、S期細(xì)胞進(jìn)行計(jì)數(shù)。
1.7 細(xì)胞凋亡檢測(cè)
如上方法收集細(xì)胞懸液,加入400μl 1×Binding Buffer懸浮細(xì)胞,按試劑盒說(shuō)明書加入Annexin V-FITC和碘化丙啶(PI)進(jìn)行染色,輕輕混勻,避光4℃反應(yīng)30min。流式細(xì)胞儀檢測(cè)。
1.8 DNMTs活性測(cè)定
收集的HT22細(xì)胞,1500r/min離心5min,棄去上清液。將收集的HT22細(xì)胞用EpiQuik核提取試劑盒(Epigentek, Brooklyn, NY, USA)提取核蛋白,用EpiQuik DNMT活性/抑制測(cè)定Ultra試劑盒(Epigentek Brooklyn, NY, USA)檢測(cè)總DNMTs,DNMT1和DNMT3A的活性,對(duì)樣品進(jìn)行DNA甲基轉(zhuǎn)移酶活性分析。
1.9 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理
2.1 5-Aza-CdR對(duì)HT22細(xì)胞形態(tài)的影響
不同濃度5-Aza-CdR對(duì)HT22細(xì)胞形態(tài)的影響如圖2所示。光學(xué)顯微鏡下觀察HT22細(xì)胞顯示,對(duì)照組(圖1A)中HT22細(xì)胞數(shù)量較多,細(xì)胞大且亮,折射率好,細(xì)胞膜邊界清晰。與對(duì)照組相比,5-Aza-CdR處理組中HT22細(xì)胞數(shù)量明顯減少,細(xì)胞膜邊界粗糙且附著顆粒,出現(xiàn)胞質(zhì)空泡化(圖1B、C)。
2.2 5-Aza-CdR對(duì)HT22細(xì)胞周期和細(xì)胞凋亡的影響
結(jié)果表明,加入不同濃度5-Aza-CdR的HT22細(xì)胞,HT22細(xì)胞在S期的數(shù)目顯著增加,但在G1期細(xì)胞數(shù)目減少(圖2A),表明細(xì)胞在S期阻滯。此外,5-Aza-CdR抑制早期凋亡,但促進(jìn)晚期凋亡(圖2B、C)。
圖1 光學(xué)顯微鏡下HT22細(xì)胞形態(tài),×40。A: 對(duì)照組;B: 5μmol/L 5-Aza-CdR加藥組;C: 20μmol/L 5-Aza-CdR加藥組;箭頭: 細(xì)胞質(zhì)空泡.
圖2 5-Aza-CdR對(duì)細(xì)胞周期和凋亡的影響。A: 細(xì)胞周期;a: S期;b: G1期。B: 流式細(xì)胞儀檢測(cè)結(jié)果圖;a: 對(duì)照組;b: 5μmol/L 5-Aza-CdR group; c: 20μmol/L 5-Aza-CdR group。C: 細(xì)胞凋亡;a: 早期凋亡;b: 晚期凋亡。*P<0.05.
Fig 1 Light microscopic examination of morphology of HT22 cells,×40. A: Control group; B: 5μmol/L 5-Aza-CdR group ; C: 20μmol/L 5-Aza-CdR group. Arrows depicted vacuolization.
Fig 2 Effects of 5-Aza-CdR on cell cycle progression. A: Cell cycle; a: S phase; b: G1 phase. B: Flow cytometric analysis results; a: Control group; b: 5μmol/L 5-Aza-CdR group; c: 20μmol/L 5-Aza-CdR group. C: Apoptosis; a: Early apoptosis; b: Late apoptosis.*P<0.05.
2.3 5-Aza-CdR對(duì)DNMT1、DNMT3A、DNMT3B mRNA和蛋白表達(dá)的影響
Real-time PCR結(jié)果顯示,與對(duì)照組相比,DNMT1和DNMT3A mRNA表達(dá)水平顯著降低,但DNMT3B mRNA表達(dá)水平?jīng)]有明顯變化(圖3A)。DNMT1和3A蛋白表達(dá)水平顯著降低,與mRNA表達(dá)水平相一致(圖3B),表明5-Aza-CdR對(duì)DNMT1和DNMT3A 的mRNA和蛋白表達(dá)起抑制作用。
2.4 DNMTs活性檢測(cè)
結(jié)果顯示,在2種5-Aza-CdR濃度下,DNMT1和DNMT3B活性顯著降低(圖4),然而,總DNMTs活性未發(fā)生明顯變化。
圖3 5-Aza-CdR對(duì)DNMT1、DNMT3A和DNMT3B mRNA(A)和蛋白(B)表達(dá)水平的影響
圖4 5-Aza-CdR調(diào)節(jié)DNMTs活性的檢測(cè)結(jié)果
癌癥是嚴(yán)重威脅人類健康和生命且發(fā)病率僅次于心血管疾病的重大疾病,受到人們廣泛關(guān)注。研究顯示,癌癥的發(fā)生發(fā)展與基因組異常甲基化有關(guān),如在肺癌發(fā)生發(fā)展過程中出現(xiàn)整個(gè)基因組低甲基化,使原癌基因活躍、基因組易變等,致使原癌基因過度表達(dá)及染色體穩(wěn)定性降低,從而導(dǎo)致肺癌發(fā)生;某些基因啟動(dòng)子區(qū)CpG島發(fā)生高甲基化[12-13],使抑癌基因、凋亡基因、細(xì)胞周期調(diào)節(jié)基因等轉(zhuǎn)錄受到抑制,表達(dá)減少或沉默,相應(yīng)的功能減弱或喪失,從而引起癌癥發(fā)生。
DNA甲基化是一種調(diào)控基因表達(dá)的機(jī)制,且甲基化和去甲基化有一定的可逆性。5-Aza-CdR作為一種甲基轉(zhuǎn)移酶抑制劑,曾被報(bào)道其影響細(xì)胞增殖、周期及凋亡,如Chen等[14]報(bào)道了5-Aza-CdR處理人食管鱗狀細(xì)胞癌(ESCC)TE-1細(xì)胞系,顯示KLF4因子上調(diào)誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡和細(xì)胞周期停滯在S期;Fang等[15]指出,2μmol/L的5-Aza-CdR處理Daudi細(xì)胞系24h后,細(xì)胞在S期被阻滯;本研究用5μmol/L或20μmol/L 5-Aza-CdR處理HT22細(xì)胞24h后,顯示HT22細(xì)胞在S期阻滯,說(shuō)明5-Aza-CdR可以阻滯細(xì)胞周期,使細(xì)胞不再繼續(xù)分裂增殖。Christman[16]提出,5-Aza-CdR并入DNA骨架,導(dǎo)致DNMTs喪失活性;Pan等[17]報(bào)道了在胰腺癌細(xì)胞系(PANC-1)中,5-Aza-CdR 聯(lián)合大黃素通過減少DNMT1和DNMT3A的表達(dá),來(lái)增強(qiáng)抑癌基因p16、RASSF1A和ppENK 5-Aza-CdR 的去甲基化;Zhang等[18]報(bào)道,10μmol/L的 5-AzaCdR對(duì)NG108-15膠質(zhì)母細(xì)胞瘤和神經(jīng)母細(xì)胞瘤雜交細(xì)胞系產(chǎn)生完全細(xì)胞增殖停滯且降低DNMT1、DNMT3A和DNMT3B的表達(dá);本研究結(jié)果表明5-Aza-CdR處理降低DNMT1和DNMT3A的表達(dá)以及DNMT1和DNMT3B活性,說(shuō)明5-Aza-CdR可以有效降低DNMTs的表達(dá)及活性。
5-Aza-CdR可抑制細(xì)胞中DNA甲基轉(zhuǎn)移酶活性及其表達(dá),影響細(xì)胞周期及凋亡,可以為癌癥治療提供一種有效途徑,且隨著研究的不斷深入,DNA甲基化與癌癥之間關(guān)系的研究將為癌癥早期診斷、評(píng)估癌癥風(fēng)險(xiǎn)、制定治療方案以及預(yù)后判斷等方面提供新的啟示。