(江蘇農(nóng)牧科技職業(yè)學(xué)院,江蘇泰州 225300)
豬繁殖障礙與呼吸道綜合征,簡稱為PRRS,也可以稱之為藍(lán)耳病,發(fā)病后,往往會出現(xiàn)發(fā)熱、食欲減退、遲產(chǎn)、死產(chǎn)以及木乃伊胎等,如果是仔豬患病的話,往往會伴有明顯的呼吸道癥狀,從而導(dǎo)致死亡。如果能夠快速做出診斷,進(jìn)而采取恰當(dāng)措施進(jìn)行治療的話,往往會取得理想的效果。由此可見,關(guān)于“RTPCR檢測豬繁殖障礙與呼吸道綜合征病毒方法的建立與應(yīng)用”的研究與分析顯得尤為重要。
對于這種疾病,最為關(guān)鍵的就是要能夠快速做出診斷,這也是能否有效防治這種疾病的關(guān)鍵所在。PCR技術(shù)的原理在于通過對體內(nèi)DNA的復(fù)制過程,實現(xiàn)基因的體外擴(kuò)增,而檢測迅速、特異性強(qiáng)、敏感性好、操作簡單、產(chǎn)量理想等都是最為顯著的特點,相對于傳統(tǒng)的方法,這種檢測方法更加迅速、直觀。
所需要用到的材料主要就是酶類及其制劑以及相關(guān)的儀器設(shè)備等。
方法主要包括引物的設(shè)計、病毒核酸的提取以及合成、反應(yīng)條件范圍的確定和產(chǎn)物的確定等。
第一就是引物的設(shè)計,主要是要考慮到PCR的實際要求,設(shè)計檢測PRRSV引物,并將其進(jìn)行定名,分貝是上游引物和下游引物。
第二步就是提取病毒核酸,主要包括血液樣品的提取、組織樣品RNA的提取以及公豬精液樣品RNA的提取。
第三步就是PRRSV病毒cDNA的合成,具體來說就是首先要完成試劑的配制,操作是在PCR管中完成的;緊接著就是在70℃的條件下,在PCR儀器中進(jìn)行保溫處理,處理的時間大約是10min,之后就要迅速進(jìn)行急冷處理,時間大約兩分鐘;第三個步驟就是講上述已經(jīng)制成的液體混合均勻后,進(jìn)行離心處理,主要目的就是為了讓混合液能夠在管底聚集;第四個步驟就是配制反應(yīng)液,同樣是需要在PCR管中完成的。在配制的實際過程中,需要注意的是,配制一定要在冰盒上進(jìn)行,而且需要佩戴一次性手套,以免造成酶污染。
第四步就是建立PRRSV的RT-PCR方法,在這個步驟中,PCR的擴(kuò)增程序可以簡單概括為:在94℃的條件下預(yù)變性,時間為五分鐘;在94℃的條件下,變性,時間為30s;在59℃的條件下進(jìn)行退火操作,時間為30s;在72℃的條件下進(jìn)行延伸處理,時間是30s;之后就是33個循環(huán);在72℃的條件下進(jìn)行延伸處理,時間是5min。等到循環(huán)完成了之后,將PCR的產(chǎn)物5提取出來,用濃度是1.5%的瓊脂糖凝膠進(jìn)行電泳處理,對擴(kuò)增的結(jié)果進(jìn)行觀察。
第五步就是反應(yīng)條件范圍的群定,主要是引物的濃度確定、dNTPs濃度的確定、RTaq酶濃度的確定以及被檢測樣品質(zhì)量對RT-PCR檢測的影響以RT-PCR退火溫度的確定以及模板量的確定等。
第六步就是對RT-PCR的產(chǎn)物進(jìn)行鑒定,鑒定的過程主要主要是分為以下幾個步驟,分別是PCR產(chǎn)物的電泳與回收純化處理;PCR產(chǎn)物的連接以及轉(zhuǎn)化、搖菌、質(zhì)粒的提取和酶切的鑒定,等到上述工作完成之后,進(jìn)行測序處理。
這個實驗設(shè)計的主要目的就是為了設(shè)計出PRRSV檢測引物,然后分別在兩端進(jìn)行限制性酶切位點的添加。
第一,關(guān)于引物的濃度,對于PRRSV來說,RT-PCR反應(yīng)最為適宜的引物添加量應(yīng)該是0.5μl。
第二,就是要確定dNTPs的濃度,對于PRRSV來說,RT-PCR反應(yīng)最為適宜的dNTPs添加量是1μl。
第三,就是要確定R Taq酶濃度,對于PRRSV來說,RT-PCR反應(yīng)最為適宜的R Taq添加量是0.5μl。
第四,關(guān)于被檢測樣片質(zhì)量對RT-PCR檢測的影響,通過這個實驗,對陳舊的被檢測樣品和新鮮的被檢測樣品在RT-PCR檢測中的差異進(jìn)行分析,得到如下結(jié)論,相對于新鮮的被檢測樣品而言,從陳舊的被檢測樣品中提出獲得的RNA更容易降解,而且電泳的效果也比較差。這就是說,無論是在進(jìn)行RT-PCR檢測方法建立的實驗中,還是在實際的應(yīng)用過程中,都要確保被檢測樣品的新鮮,從而保證檢測結(jié)果的準(zhǔn)確率。
第五,確定單相RT-PCR的退火溫度,我們以PRRSV為例子進(jìn)行說明,分別在53℃、55℃和59℃的退火溫度下進(jìn)行試驗,結(jié)果表明,59℃的退火溫度條件下,PCR產(chǎn)物的特異性更加理想。
通過目的片段與PMD-18T的連接、轉(zhuǎn)化、涂板和挑菌四管,提取質(zhì)粒,結(jié)果發(fā)現(xiàn),四個質(zhì)粒都有酶切目的片段370bp,可以任選一管送去測序,對于測序的結(jié)果進(jìn)行比對之后完全符合。
豬繁殖障礙與呼吸道綜合征不僅僅會對免疫系統(tǒng)造成侵害,而且所導(dǎo)致的感染也是持續(xù)性的,再加上預(yù)防起來比較困難,因此這種疾病逐漸成為制約養(yǎng)豬業(yè)發(fā)展的重要因素。雖然目前關(guān)于這種疾病已經(jīng)研究出了多種檢測和診斷的技術(shù),但是相對于間接免疫熒光、原位雜交以及免疫組化等,RT-PCR檢測技術(shù)更加省時,操作更加簡單,結(jié)果更加準(zhǔn)確,因此也就更加值得推廣。
[1] 涂宜強(qiáng),楊增歧,徐輝.RT—PCR檢測豬繁殖障礙與呼吸道綜合征病毒方法的建立與應(yīng)用[J]. 中國畜牧獸醫(yī),2005,32(6):52-53.