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      骨髓增生異常綜合征剪接體突變的研究進(jìn)展

      2017-11-14 03:45:56黃林娜劉鵬琴綜述代國(guó)知審校
      中國(guó)腫瘤臨床 2017年19期
      關(guān)鍵詞:剪接體突變率內(nèi)含子

      黃林娜 劉鵬琴 綜述 代國(guó)知 審校

      骨髓增生異常綜合征剪接體突變的研究進(jìn)展

      黃林娜 劉鵬琴 綜述 代國(guó)知 審校

      研究發(fā)現(xiàn)剪接體突變?cè)诠撬柙錾惓>C合征(myelodysplastic syndrome,MDS)疾病的發(fā)生發(fā)展中發(fā)揮重要作用,其突變基因包括SF3B1、U2AF1(U2AF35)、SRSF2、ZRSR2、PRPF40B、SF1、SF3A1和U2AF2等,突變基因(45%~85%)發(fā)生在mRNA剪接過(guò)程中的3'剪接位點(diǎn),主要表現(xiàn)為雜合性錯(cuò)義突變。了解RNA剪接對(duì)MDS的靶向治療及預(yù)后具有指導(dǎo)作用。本文就剪接體相關(guān)突變基因在MDS中的致病機(jī)制、靶向治療及臨床預(yù)后等進(jìn)行綜述。

      骨髓增生異常綜合征 剪接體 基因突變 靶向治療

      骨髓增生異常綜合征(myelodysplastic syndromes,MDS)是一組起源于造血干/祖細(xì)胞的高度異質(zhì)性的血液系統(tǒng)腫瘤,中國(guó)由于人口老齡化加劇,其發(fā)病率呈明顯上升趨勢(shì)。MDS呈現(xiàn)出高度的異質(zhì)性,致病機(jī)制至今尚未明確,總體預(yù)后較差。有研究發(fā)現(xiàn)獲得性體細(xì)胞突變與MDS疾病發(fā)展密切相關(guān)。除了獲得性體細(xì)胞突變外,RNA剪接機(jī)制、DNA甲基化、染色質(zhì)修飾等基因機(jī)制的失調(diào)在MDS致病機(jī)理中越來(lái)越受到重視。Papaemmanuil等[1]和Haferlach等[2]分別從738位及944位MDS及相關(guān)腫瘤患者中測(cè)得111和104個(gè)突變基因,78%以上的患者至少有1個(gè)致瘤性的基因突變。RNA剪接突變?cè)贛DS中是最常見(jiàn)的突變方式,常發(fā)生在疾病的早期,對(duì)疾病的臨床特征起著決定性作用,也影響隨后基因組的演化。部分剪接突變因子作為分子生物標(biāo)記已用于MDS疾病的診斷、分層及預(yù)后轉(zhuǎn)歸等評(píng)估[3]。近年來(lái),逐漸建立了MDS相關(guān)的靶向治療,如DNA甲基轉(zhuǎn)移酶抑制劑(如地西他濱)在高危MDS患者中運(yùn)用。雖然剪接調(diào)節(jié)體的靶向治療已經(jīng)進(jìn)行了臨床前實(shí)驗(yàn),但暫無(wú)確切可行的靶向藥物運(yùn)用到臨床。本文對(duì)剪接體相關(guān)突變基因在MDS中的致病機(jī)制、靶向治療及臨床預(yù)后等問(wèn)題進(jìn)行綜述。

      1 RNA剪接在MDS疾病發(fā)生、發(fā)展中的作用及機(jī)制

      剪接體是一個(gè)超大分子復(fù)合物,DNA轉(zhuǎn)錄完成后形成前-mRNA(pre-mRNA),通過(guò)剪接體切除內(nèi)含子,并將外顯子按照一定的順序進(jìn)行拼接,從而形成成熟的mRNA。剪接體主要有5種核小RNA(sn-RNA)即U1、U、U4、U5、U6組成。與特異蛋白質(zhì)發(fā)生相互作用形成的復(fù)合物被稱為核小核糖核蛋白顆粒(small nuclear ribonucleoprotein particle,snRNP),共同完成mRNA前體中內(nèi)含子的剪接。RNA剪接體的作用主要是識(shí)別內(nèi)含子和外顯子的交界部位以及催化內(nèi)含子的切除及與外顯子的拼接[4]。剪接體基因突變常是異基因突變,突變位于氨基酸殘基的位置并常伴其他基因的突變,誘導(dǎo)重要蛋白的丟失、異常功能的表達(dá)和細(xì)胞凋亡的啟動(dòng),最終導(dǎo)致包括MDS在內(nèi)的極高惡性事件發(fā)生[5]。有研究發(fā)現(xiàn)RNA剪接因子突變包括 SF3B1、U2AF1(U2AF35)、SRSF2、ZRSR2、PRPF40B、SF1、SF3A1和U2AF2,其中最常見(jiàn)的突變因子為SF3B1、SRSF2、U2AF1和ZRSR2[6]。

      1.1 SF3B1

      SF3B1即剪接因子3B復(fù)合物的第一亞單位,定位于染色體2號(hào)染色體長(zhǎng)臂(2q33.1)上,含有25個(gè)外顯子,蛋白質(zhì)分子量155 kDa。SF3B1的突變集中在第12~16外顯子中,即翻譯后的4、5、6結(jié)構(gòu)域內(nèi),主要突變類(lèi)型為K700E(700位上的賴氨酸被谷氨酸所代替)占55%[7]。SF3B1突變率在MDS中約占28.1%,而在 MDS-RS(MDS with ring sideroblasts,MDS-RS)中SF3B1突變率高達(dá)97.7%[8],Cazzola等[9]發(fā)現(xiàn)大量的異常剪接事件與SF3B1突變密切相關(guān),常由3'剪接位點(diǎn)的錯(cuò)誤識(shí)別引起,50%的3'剪接位點(diǎn)改變導(dǎo)致一個(gè)框移突變。SF3B1突變可對(duì)其下游基因造成影響,特別是亞鐵血紅素合成的相關(guān)基因,并降低細(xì)胞周期分化以及DNA修復(fù)等相關(guān)基因的表達(dá)。MDS-RS型中環(huán)形鐵粒幼細(xì)胞的特點(diǎn)是過(guò)多的鐵沉積在線粒體內(nèi),且骨髓環(huán)形鐵粒幼細(xì)胞百分率的增高常伴隨ABCB7表達(dá)水平的下調(diào)[12]。Mupo等[10]通過(guò)研究發(fā)現(xiàn),SF3B1突變的MDS環(huán)形鐵粒幼紅細(xì)胞的形成是由于血紅素合成過(guò)程中關(guān)鍵基因的異常剪接引起,同時(shí)伴多個(gè)蛋白水平的下調(diào),其中包括線粒體鐵運(yùn)輸?shù)鞍譇BCB7。綜合多項(xiàng)研究可以發(fā)現(xiàn)SF3B1突變導(dǎo)致鐵轉(zhuǎn)運(yùn)體ABCB7下調(diào),隨后鐵沉積在紅細(xì)胞線粒體內(nèi)從而形成MDS的獨(dú)特表型MDS-RS[11]。

      預(yù)后方面,Malcovati等[8]認(rèn)為MDS-RS伴SF3B1突變常表現(xiàn)出較好的生存率和急性髓細(xì)胞白血病(acute myeloid leukemia,AML)轉(zhuǎn)化的低風(fēng)險(xiǎn)性,突變預(yù)示著有利的臨床結(jié)果,將它們納入分層系統(tǒng)可以改善MDS的風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估。Thol等[13]研究卻認(rèn)為SF3B1不是一個(gè)獨(dú)立的預(yù)后因素,其預(yù)后良好可能與MDSRS這一型分化良好的特點(diǎn)相關(guān)。但在世界衛(wèi)生組織(WHO)2016年骨髓腫瘤分類(lèi)(修訂版)中提出SF3B1突變常出現(xiàn)在MDS-RS的早期事件中,體現(xiàn)一種獨(dú)特的基因表達(dá)譜,并與良好預(yù)后相關(guān)[3]。

      1.2 SRSF2

      SRSF2即富含絲氨酸(S)和精氨酸(R)蛋白的剪接因子2,屬于SR蛋白家族中的一員,蛋白質(zhì)分子量為35 kDa。除了剪接作用,SRSF2還參與了DNA穩(wěn)定性的調(diào)節(jié)。SRSF2主要的突變位點(diǎn)位于RNA結(jié)構(gòu)域、RS結(jié)構(gòu)域之間的位置第95位氨基酸上,主要突變類(lèi)型為P95L/R/H[14]。SRSF2是造血細(xì)胞存活的必備基因,它的缺乏會(huì)導(dǎo)致細(xì)胞的凋亡和生長(zhǎng)停滯,在SRSF2雜合型血細(xì)胞中雖然沒(méi)有明顯異常表型,但是在生長(zhǎng)停滯和凋亡的細(xì)胞中可發(fā)現(xiàn)P95H和Δ8aa突變[15]。Kim等[16]通過(guò)研究發(fā)現(xiàn)SRSF2 P95H突變?cè)贛DS疾病的發(fā)展中發(fā)揮了重要的作用,SRSF2 P95H突變可以影響SRSF2RNA識(shí)別特征序列,增加對(duì)CCNG的親和力而減低GGNG的親和力。與SRSF2 P95H突變相關(guān)的下游靶向基因還包括表觀調(diào)節(jié)因子EZH2,SRSF2突變導(dǎo)致EZH2轉(zhuǎn)錄時(shí)產(chǎn)生不成熟終止密碼子,引起無(wú)義介導(dǎo)的mRNA降解和基因下調(diào)。Skrdlant等[17]研究發(fā)現(xiàn)SRSF2P95-R/L/H突變不會(huì)影響蛋白質(zhì)的細(xì)胞定位,因而不會(huì)導(dǎo)致激酶2或P53磷酸化,但會(huì)增加細(xì)胞的早期凋亡并影響細(xì)胞分裂周期蛋白25同源蛋白C(cell division cyclin 25 homolog C,Cdc25C)的可變剪接,導(dǎo)致短型CDC25C-C5的增加,而CDC25C-C5的增多與細(xì)胞的DNA受損密切相關(guān)。

      在非RS型的MDS中SRSF2突變率約占11.6%,但在MDS-RS中約占5.5%[6]。在另一項(xiàng)研究中,193例MDS中SRSF2突變率為12.4%,其中80%為錯(cuò)義突變和框移突變,95%的突變?cè)诎被酨95的位置[13]。Thol等[13]認(rèn)為MDS伴SRSF2突變的患者常表現(xiàn)出極短的生存率和加速AML的進(jìn)程。Zhang等[18]研究發(fā)現(xiàn),AML伴SRSF2突變的病例約18.9%來(lái)源于骨髓增殖性疾病,分析發(fā)現(xiàn)SRSF2突變與差的總體生存率相關(guān)。

      1.3 U2AF1

      U2AF1即U2小核RNA輔助因子1,定位于21號(hào)染色體長(zhǎng)臂(21q22.3)上,蛋白質(zhì)分子量為35 kDa。U2AF1突變點(diǎn)相當(dāng)特別的,涉及到兩個(gè)高度保守的氨基酸位置(S34或Q157),其C端是鋅指結(jié)構(gòu),側(cè)翼是U2AF的同源基序,常見(jiàn)的突變類(lèi)型S34F/Y、Q157R/P等[6]。U2AF1突變常導(dǎo)致3'剪接位點(diǎn)的特異序列改變,3'剪接位點(diǎn)S34和Q157的改變會(huì)導(dǎo)致相關(guān)的臨床疾病。伴U2AF1突變的MDS中常出現(xiàn)盒式外顯子剪接異常,與野生型相比U2AF1 S34F突變蛋白在3'剪接位點(diǎn)-3的位置對(duì)胞嘧啶的識(shí)別要高于胸腺嘧啶,而U2AF1 Q157突變?cè)?1位置與鳥(niǎo)嘌呤取代腺苷酸相關(guān)[19]。Park等[20]研究發(fā)現(xiàn)U2AF1突變?cè)谑怯捎谵D(zhuǎn)錄過(guò)程中增加了末端裂隙和多腺苷酸化位點(diǎn),導(dǎo)致3'編碼區(qū)的增加,從而導(dǎo)致mRNA的無(wú)效轉(zhuǎn)錄和人自噬相關(guān)蛋白7(autophagy-related protein 7,ATG7)水平的降低,從而降低自噬,同時(shí)促進(jìn)轉(zhuǎn)錄,常伴隨線粒體功能紊亂并增加活性氧的產(chǎn)生,導(dǎo)致基因組的不穩(wěn)定性并提高自發(fā)性突變的頻率。

      MDS中U2AF1的突變率為7.3%(14/193),常伴隨ASXL1及DNMT3A突變[13]。在非RS型的MDS中U2AF1 的突變率為 12%[6]。Wu等[21]在研究 305位MDS患者中發(fā)現(xiàn)U2AF1突變率為8.6%,且U2AF1突變常伴隨+8或20q-等染色體改變。在預(yù)后方面,伴U2AF1突變的患者意味著更短的生存率和極易向AML轉(zhuǎn)化的高風(fēng)險(xiǎn)性[21]。Thol等[13]也通過(guò)研究發(fā)現(xiàn)U2AF1突變的患者預(yù)后總體生存率與未突變患者無(wú)明顯區(qū)別,但易向白血病轉(zhuǎn)化。

      1.4 ZRSR2

      ZRSR2即鋅指結(jié)構(gòu)(CCCH型),RNA結(jié)合基序和富含絲氨酸/精氨酸的2基因位于Xp22.1上,所編碼的蛋白與U2AF異二聚體相關(guān),是識(shí)別前體mRNA剪接體功能性3'剪接位點(diǎn)所必需的,在MDS中ZRSR2的突變發(fā)生在整個(gè)轉(zhuǎn)錄的過(guò)程,與SF3B1、SRSF2和U2AF1等突變的熱點(diǎn)形成對(duì)比。位于X染色體的剪接體ZRSR2的突變與MDS疾病的發(fā)生發(fā)展相關(guān),其致病機(jī)理至今尚未完全明確。Madan等[22]研究發(fā)現(xiàn)ZRSR2突變與U12型內(nèi)含子的錯(cuò)誤剪接相關(guān),ZRSR2的敲除會(huì)導(dǎo)致MDS骨髓的U12型內(nèi)含子的剪接功能和RNA序列受損,ZRSR2活性的缺失會(huì)增加剪接的錯(cuò)誤率,如12型內(nèi)含子的保留,在體外實(shí)驗(yàn)中ZRSR2缺乏的細(xì)胞表現(xiàn)出增殖潛力的減低及紅系分化的異常。在MDS中U12型內(nèi)含子對(duì)剪接體的調(diào)節(jié)是ZRSR2突變的特征。ZRSR2基因的剪接位點(diǎn)突變和框移突變常發(fā)生于男性患者。

      ZRSR2的突變率在血液系統(tǒng)惡性腫瘤中較低,在MDS和CMML患者中不超過(guò)8%[6]。ZRSR2突變的類(lèi)型包括移碼突變,無(wú)義突變和錯(cuò)義突變,該突變?cè)贛DS中約占3%~11%,伴隨中性粒細(xì)胞的減少[6]。在預(yù)后方面,Damm等[23]發(fā)現(xiàn)ZRSR2突變?cè)贛DS中更集中于IPSS的中危1型和2型,骨髓原始細(xì)胞比例較高,在不合并TET2突變的情況下具有更短的生存率和更高的AML轉(zhuǎn)化率。而Thol等[13]的研究則指出ZRSR2突變與IPSS分型無(wú)關(guān),且對(duì)預(yù)后無(wú)明顯影響。

      2 RNA剪接突變的靶向治療

      MDS傳統(tǒng)的治療藥物局限在去甲基化治療劑如阿扎胞苷和地西他濱,免疫調(diào)解劑來(lái)那度胺和造血生長(zhǎng)因子。行異基因造血干細(xì)胞移植的患者不到5%,主要原因是患者年齡較大而無(wú)法耐受移植后的不良反應(yīng),因此生存率也不到5%。MDS和相關(guān)的髓系腫瘤中,剪接體正成為一種新的靶向治療目標(biāo)。在美國(guó)關(guān)于剪接調(diào)解體的臨床試驗(yàn)于2016年開(kāi)始實(shí)行[24]。

      在人類(lèi)腫瘤剪接體突變的研究中發(fā)現(xiàn)自然界的細(xì)菌發(fā)酵產(chǎn)物具有抗腫瘤特性。光親和性標(biāo)記技術(shù)通過(guò)與3′剪接位點(diǎn)緊密連接證實(shí)了這些產(chǎn)物的功能,細(xì)菌發(fā)酵產(chǎn)物通過(guò)改變前-mRNA的剪接,形成不穩(wěn)定U2 snRNP/pre-mRNA復(fù)合物,從而阻止剪接體組裝[25]。近年來(lái),人工合成類(lèi)似藥物得到了快速發(fā)展,而人工合成類(lèi)似藥對(duì)改變pre-mRNA的剪接具有不同的作用機(jī)制,如吲哚類(lèi)化合物抑制外顯子剪接增強(qiáng)子,小分子激酶抑制劑通過(guò)阻止產(chǎn)物的磷酸化而調(diào)節(jié)其富-SR蛋白轉(zhuǎn)錄后的修飾,調(diào)節(jié)蛋白/蛋白和蛋白/RNA相互作用能識(shí)別正確的剪接位點(diǎn)等,使用反義寡核苷酸能糾正致瘤性mRNA的錯(cuò)誤剪接[26]。合成類(lèi)似物的生成必須確保其具有較強(qiáng)活性、穩(wěn)定性和溶解性,目前用于剪接體靶向治療的藥物主要有:spliceostatin A、sudemycins、E7107及最新藥物H3B-8800[27]。更適合稱上述合成藥物為剪接“調(diào)節(jié)體”而不是抑制體,因?yàn)樗鼈兏淖兗艚拥姆绞綐O其復(fù)雜,而不僅是簡(jiǎn)單的下游調(diào)節(jié)。

      2.1 spliceostatin A

      FR901464是由假單孢菌產(chǎn)生的具有高效抗腫瘤活性的天然產(chǎn)物。2004年Motoyoshi等[28]研究首次報(bào)道了FR901464甲基化的衍生物,并命名為spliceostatin A,它具有與FR901464有相似的抗腫瘤活性。FR901464和spliceostatin A在體外實(shí)驗(yàn)中通過(guò)與SF3b的連接而促進(jìn)pre-mRNA聚集[28]。spliceostatin A在繼U2 snRNP組裝之后通過(guò)干擾剪接體從而抑制pre-mRNA剪接,其剪接體組裝的抑制需要ATP調(diào)節(jié),從而保證pre-mRNA剪接序列和U1和U2 snRNAs的完整性。同時(shí)也證明此合成物具有抗腫瘤作用[25]。

      2.2 sudemycin

      sudemycin合成物類(lèi)似于RNA剪接調(diào)節(jié)體FR901464和它的衍生物spliceostatin A。Fan等[26]研發(fā)的一種新的人工合成藥物sudemycins,它具有與FR901464有相似的藥效基團(tuán),對(duì)人類(lèi)腫瘤細(xì)胞具有細(xì)胞毒性;同時(shí)sudemycins是強(qiáng)有力的調(diào)節(jié)體,能選擇性剪接人類(lèi)腫瘤細(xì)胞的內(nèi)源性基因,其作為腫瘤治療藥物已經(jīng)經(jīng)歷了臨床前評(píng)估[29]。使用sudemycins治療,U2AF1突變的小鼠比野生型更敏感。實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)sudemycins具有抗腫瘤性并直接作用于SF3B突變因子,把人類(lèi)的白血病細(xì)胞灌入免疫缺陷的小鼠中,低劑量的sudemycins就可以引起外周血和脾臟中的白血病細(xì)胞凋亡[30]。Shirai等[31]在體外實(shí)驗(yàn)中發(fā)現(xiàn)U2AF1(S34F)突變的細(xì)胞對(duì)剪接調(diào)節(jié)體藥物sudemycin敏感,U2AF1(S34F)突變小鼠使用sudemycin治療會(huì)導(dǎo)致U2AF1突變的衰減并誘導(dǎo)造血祖細(xì)胞的爆發(fā)。監(jiān)管分析整個(gè)轉(zhuǎn)錄組序列發(fā)現(xiàn)在sudemycin影響的RNA剪接集中在U2AF1(S34F)和U2AF1(WT)突變的骨髓細(xì)胞中。

      2.3 E7107

      E7107是自然真菌產(chǎn)物pladienolide B的半合成氨基甲酸酯衍生物,通過(guò)抑制剪接體組裝調(diào)節(jié)蛋白表達(dá),在臨床前實(shí)驗(yàn)中表現(xiàn)出獨(dú)特而廣譜的抗腫瘤作用。有實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)E7107通過(guò)阻止U2 snRNP與pre-mRNA的連接而阻斷剪接體的組裝[32]。在SRSF2 P95H突變的白血病小鼠中,使用E7107治療可以降低疾病的負(fù)荷,提高存活率和改善血細(xì)胞計(jì)數(shù)[33]。E7107用于實(shí)體腫瘤的臨床試驗(yàn)發(fā)現(xiàn),E7107通過(guò)pre-mRNA剪接的調(diào)解并增加內(nèi)含子保留能有效的抑制腫瘤生長(zhǎng)和外周血單核細(xì)胞數(shù),可以有效地靶向剪接過(guò)程中的薄弱點(diǎn),然而仍有5%患者出現(xiàn)視力喪失等不良反應(yīng),高劑量藥物甚至可以引起胃腸道不良反應(yīng),進(jìn)而導(dǎo)致試驗(yàn)終止[34]。

      2.4 H3B-8800

      在MDS患者人體試驗(yàn)中,H3B-8800是可以口服的小分子SF3B1調(diào)節(jié)體。剪接調(diào)節(jié)體作為新型的治療方式具有巨大潛力,但也存在許多問(wèn)題,如剪接調(diào)節(jié)體與SF3B結(jié)合的生化結(jié)構(gòu)不清楚,關(guān)于其不良反應(yīng)、準(zhǔn)確作用方式以及靶向治療方法等均需要在臨床前和臨床試驗(yàn)中解決。基于上述事實(shí),因剪接體突變的白血病表現(xiàn)出對(duì)靶向剪接調(diào)節(jié)體獨(dú)特的敏感性,亟需對(duì)剪接調(diào)節(jié)體的藥理作用做更深入的研究。

      3 總結(jié)和展望

      綜上所述,剪接體在MDS發(fā)生發(fā)展中的作用值得關(guān)注,但其致病機(jī)制尚未完全明確,如ZRSR2等因子是如何識(shí)別加工過(guò)程中的動(dòng)態(tài)變化并準(zhǔn)確選擇剪接位點(diǎn)等。其次,RNA剪接調(diào)節(jié)體藥物的發(fā)現(xiàn),為血液學(xué)腫瘤提供了新的治療方式。進(jìn)一步闡明靶向藥物的作用機(jī)制有利于理解和控制疾病的進(jìn)程,而個(gè)性化的基因表達(dá)和全基因組的研究將促進(jìn)個(gè)性化治療模式的發(fā)展。

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      Research progress on spliceosome mutations in myelodysplastic syndromes

      Linna HUANG,Pengqin LIU,Guozhi DAI

      Department of Clinical Laboratory,Chenzhou First People's Hospital Affiliated to University of South China,Chenzhou 423000,China

      Guozhi DAI;E-mail:daigz008@126.com

      Spliceosomal dysfunction plays a major role in pathogenesis of myelodysplastic syndrome(MDS).Splicing factor somatic mutations,including SF3B1,U2AF1(U2AF35),SRSF2,ZRSR2,PRPF40B,SF1,SF3A1,and U2AF2,comprise a common(45%-85%)class of mutated genes in MDS.These genes exist in a mutually exclusive manner at the 3?splice site of mRNA processing and are predominantly heterozygous and missense.RNA splicing might have therapeutic and prognosis values in MDS.This review mainly describes the pathogenesis of common splicing factor gene mutations in MDS and discusses possible therapeutic implications,clinical analysis,and prognosis.

      myelodysplastic syndromes,spliceosome,mutations,targeted therapy

      10.3969/j.issn.1000-8179.2017.19.144

      南華大學(xué)附屬郴州第一人民醫(yī)院檢驗(yàn)科(湖南省郴州市423000)

      代國(guó)知 daigz008@126.com

      (2017-02-09收稿)

      (2017-05-11修回)

      (編輯:孫喜佳 校對(duì):鄭莉)

      黃林娜 專業(yè)方向?yàn)榕R床檢驗(yàn)診斷學(xué)。E-mail:43985296@qq.com

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