• <tr id="yyy80"></tr>
  • <sup id="yyy80"></sup>
  • <tfoot id="yyy80"><noscript id="yyy80"></noscript></tfoot>
  • 99热精品在线国产_美女午夜性视频免费_国产精品国产高清国产av_av欧美777_自拍偷自拍亚洲精品老妇_亚洲熟女精品中文字幕_www日本黄色视频网_国产精品野战在线观看 ?

    藏東南地區(qū)毛殼屬真菌多樣性及系統(tǒng)發(fā)育分析

    2017-09-12 11:01:45岳海梅莊華潘朝暉鞏文峰
    關鍵詞:東南地區(qū)真菌菌株

    岳海梅,莊華,潘朝暉,鞏文峰

    (1.西藏農(nóng)牧學院植物科學學院,西藏林芝860000;2.西北農(nóng)林科技大學植物保護學院/旱區(qū)作物逆境生物學國家重點實驗室,陜西楊凌712100;3.西藏高原生態(tài)研究所,西藏林芝860000)

    藏東南地區(qū)毛殼屬真菌多樣性及系統(tǒng)發(fā)育分析

    岳海梅1*,莊華2,潘朝暉3,鞏文峰11

    (1.西藏農(nóng)牧學院植物科學學院,西藏林芝860000;2.西北農(nóng)林科技大學植物保護學院/旱區(qū)作物逆境生物學國家重點實驗室,陜西楊凌712100;3.西藏高原生態(tài)研究所,西藏林芝860000)

    為分析藏東南地區(qū)毛殼屬(Chaetomium Kunze)真菌多樣性及系統(tǒng)發(fā)育情況,從藏東南5個市、縣采集土壤、植物殘體和動物糞便等標本共355份,采用組織分離法和稀釋分離法得到36株毛殼菌,平均分離幾率為10.14%。將分離得到的菌株進行多樣性指數(shù)特征分析,并按形態(tài)特征初步分類;運用聚合酶鏈式反應對菌株的rDNA-ITS和β-tubulin基因序列進行擴增與序列測定;利用MEGA 5.0軟件構建rDNA-ITS和β-tubulin基因系統(tǒng)發(fā)育進化樹。結果顯示:林芝縣的毛殼屬真菌多樣性指數(shù)最高,為1.178 5,物種均勻度指數(shù)也最高,為0.605 6;昌都市的毛殼屬真菌豐富度指數(shù)最高,達到0.861 4。不同地區(qū)毛殼屬真菌的優(yōu)勢種也存在差異:工布江達縣的優(yōu)勢種為球毛殼(C. globosum);墨脫縣和昌都市的優(yōu)勢種為糞生毛殼(C.funicola);察隅縣的優(yōu)勢種為旋絲毛殼(C.bostrychodes);林芝縣的優(yōu)勢種為反卷毛殼(C.convolutum)。根據(jù)形態(tài)特征可將36株菌歸屬為8個種。分析擴增后的rDNA-ITS和β-tubulin基因序列發(fā)現(xiàn),β-tubulin基因的變異位點、單倍型總數(shù)、單倍型多樣度、核苷酸多樣性指數(shù)和核苷酸平均差異數(shù)與rDNA-ITS序列的這些參數(shù)存在顯著差異,體現(xiàn)出更大的堿基變異性。系統(tǒng)發(fā)育進化樹表明,供試的36個菌株被分為7個組,rDNA-ITS和β-tubulin這2個基因片段不僅可用來區(qū)分毛殼菌屬中形態(tài)差異較大的種,如印度毛殼(C.indicum)、大果毛殼(C.megalocarpum)、球毛殼(C.globosum)、糞生毛殼(C.funicola),還可區(qū)分形態(tài)特征非常相似的印度毛殼(C.indicum)和直立毛殼(C.erectum),同時也可以對一些形態(tài)上難以鑒定的種進行初步鑒定,但不能較好地區(qū)分反卷毛殼(C.convolutum)、旋絲毛殼(C.bostrychodes)和黑毛殼(C.nigricolor),需要結合更多的基因片段進行區(qū)分。綜上所述,本文對藏東南地區(qū)毛殼屬真菌多樣性與系統(tǒng)發(fā)育情況進行了研究,為豐富西藏毛殼屬真菌資源和開發(fā)毛殼菌代謝產(chǎn)物奠定了理論基礎。

    藏東南;毛殼菌;多樣性;系統(tǒng)發(fā)育分析

    SummaryChaetomium Kunze is mainly distributed in cellulose-containing substrates in the nature,including soil,plant residue,excrement of birds,omnivorous animals and rodents.Persistent organic compounds can be degraded by cellulase produced by Chaetomium Kunze,which also has antagonistic effects on certain microorganisms in the soil.However,littlehas been known about Chaetomium in Tibet.Therefore,a systematic research on resource distribution of Chaetomium in Tibet is necessary and urgent.

    In this study,355 samples of soil,plant residue and animal manure were collected from five regions of southeastern Tibet,in which plant residue and animal manure were separated by tissue separation,and soil samples were separated by dilution separation method.SPSS 13.5 software was used to analyze the diversity index of Chaetomium spp.from different regions,and 36 strains were preliminarily classified according to Arx system.The nucleotide sequence polymorphisms of rDNA-ITS and β-tubulin gene were analyzed by DnaSP version 5.0.The rDNA-ITS and β-tubulin gene sequences were used to analyze the diversity of Chaetomium species in southeastern Tibet.

    The results showed that a total of 36 strains were successfully isolated from the 355 samples,and the average isolation rate was 10.14%.The diversity index data indicated that both the diversity index and species evenness index of Chaetomium spp. in Nyingchi was the highest,with the value of 1.178 5 and 0.605 6 respectively.But the richness index of Chaetomium was the highest in Chamdo,with the value of 0.861 4.Differences of dominant populations of Chaetomium were observed among the five regions:the dominant population in Gongbogyamda County,Medog County and Chamdo City,Zayü County,and Nyingchi County was C.globosum,C.funicola,C.bostrychodes,and C.convolutum,respectively.According to the morphological characteristics,the 36 strains were assigned to eight species.Moreover,rDNA-ITS sequences and β-tubulin gene were applied to conduct the diversity analysis,and the result showed that the variation sites,haplotype numbers,haplotype diversity,nucleotide diversity index and nucleotide difference of β-tubulin gene were significantly different from rDNA-ITS sequences,while βtubulin gene showed greater base variability.The phylogenetic tree of rDNA-ITS and β-tubulin genes indicated that the 36 isolates were divided into seven groups.The two gene fragments can not only distinguish the species of Chaetomium with different morphologies(such as C.indicum,C.megalocarpum,C.globosum and C.funicola),but also those with very similar morphological characteristics(such as C.indicum and C.erectum)and some species hard to distinguish.However,several species such as C. convolutum,C.bostrychodes and C.nigricolor can’t be distinguished by rDNA-ITS and β-tubulin genes,which still need combining more gene fragments to differentiate.

    In conclusion,the results confirm the rich resources of Chaetomium fungus in southeastern region of Tibet,providing data for abundant resources of Chaetomium in Tibet,and laying a foundation for the exploitation of the metabolites of Chaetomium.

    毛殼屬真菌(Chaetomium Kunze,以下簡稱毛殼菌)隸屬于子囊菌門(Ascomycota)核菌綱(Pyrenomycetes)糞殼目(Sordariales)毛殼菌科(Chaetomiaceae),主要分布在自然界各種含纖維素的基質上,包括雜食動物及鳥類和鼠類的糞便、土壤、植株殘體等,能夠產(chǎn)生大量的纖維素酶[1],同時還可以降解纖維素和木質素等大分子難降解有機物,具有拮抗土壤中某些微生物的作用。自從1817年KUNZE建立毛殼菌屬以來,人們對毛殼菌的認識不斷深入,分類標準也日趨一致。毛殼菌屬由1881年第1部專著中報道的10個種,逐漸發(fā)展穩(wěn)定到真菌字典第9版記載的81個種[2],2008年由KIRK確定為95個種。我國對毛殼菌的分類和研究始于1959年,陳慶濤[3]于1959—1965年發(fā)現(xiàn)了2個毛殼菌新種;隨后,戴芳瀾[4]在《中國真菌總匯》里記錄了該屬30個種(含異名);孫廣宇等[5]對我國部分地區(qū)的毛殼菌進行了分離和鑒定,報道了3個新種;譚悠久等[6]發(fā)現(xiàn)了我國1個新種;王雪薇[7]報道了我國毛殼菌31個種,其中包括2個新種,5個中國新記錄種;劉富江[8]從我國部分?。▍^(qū))采樣,發(fā)現(xiàn)毛殼菌14個種,其中包括1個新記錄種。目前,我國發(fā)現(xiàn)并記載的毛殼菌共計31種。

    研究表明,微生物的生態(tài)分布與土壤和植被等環(huán)境因子密切相關[9]。藏東南地區(qū)處于我國雅魯藏布江中下游,總體海拔高度差超過7 000 m[10],平均海拔3 100 m,地勢南低北高,印度洋暖流與北方寒流匯合,形成了特殊的熱帶、亞熱帶、溫帶和寒帶并存的特殊氣候。該地區(qū)地形復雜,氣候多樣,資源豐富,是研究植物區(qū)系和生物多樣性的理想?yún)^(qū)域。徐阿生等[11]和張惠等[12]分別對藏東南地區(qū)的大型真菌進行了調查,何建清等[9]對藏東南地區(qū)的放線菌進行了分離和鑒定。但是,目前對西藏毛殼菌的系統(tǒng)研究還較少,僅劉述春等[13]對來源于藏東南林芝地區(qū)的1株毛殼菌進行了生物活性篩選,發(fā)現(xiàn)了新聚酮類結構活性化合物;GUO等[14]從藏東南林芝地區(qū)的土壤中分離到3株毛殼菌并發(fā)現(xiàn)了1個新種。這些研究均表明,特殊生境是微生物新種和活性天然產(chǎn)物的重要來源。

    自20世紀60年代以后,分子生物學方法被廣泛應用于真菌分類和鑒定,其中保守的rDNA-ITS序列被推薦為真菌的通式性DNA條形碼[15],但由于內(nèi)部轉錄間隔區(qū)(internal transcribed spacer,ITS)序列提供的遺傳信息有限,一些功能基因如CO1,EF-a和β-tubulin等序列在一些真菌種類鑒定中成為更好的分子標記[16-18]。本文通過rDNA-ITS結合βtubulin基因序列對分離自藏東南地區(qū)的毛殼屬真菌菌株進行初步鑒定,分析其多樣性和系統(tǒng)發(fā)育情況,以期為豐富西藏毛殼屬真菌資源、開發(fā)毛殼菌代謝產(chǎn)物提供理論依據(jù)。

    1.1 材料

    1.1.1 標本來源

    從藏東南的昌都市、工布江達縣、墨脫縣、察隅縣、林芝縣等地共采集土壤、植物殘體和動物糞便等基質355份,用牛皮紙信封裝好帶回實驗室,風干1周后,進行毛殼菌的分離。各采樣區(qū)的基本情況見表1。

    1 材料與方法

    表1 藏東南不同采樣區(qū)基本情況Table 1Profile of different sampling areas in southeastern Tibet

    1.1.2 供試培養(yǎng)基

    馬丁培養(yǎng)基[19](分離培養(yǎng)基):蛋白胨5 g,葡萄糖10 g,KH2PO41 g,MgSO4·7H2O 0.5 g,瓊脂20 g,蒸餾水1 L。培養(yǎng)基配制好后,加入1%孟加拉紅溶液3.3 mL,分裝后用121℃高壓蒸汽滅菌30 min。

    玉米粉培養(yǎng)基(鑒定培養(yǎng)基):玉米粉30 g,瓊脂15 g,水1 L。將玉米粉在70℃蒸餾水中加熱約1 h,用紗布過濾固體殘渣后,將瓊脂粉加入濾液中,加熱溶化,最后用蒸餾水補足至1 L,分裝后用121℃高壓蒸汽滅菌30 min。

    1.1.3 主要設備和試劑

    試劑:十六烷基三甲基溴化銨(CTAB)、Tris飽和酚、氯仿、異戊醇、異丙醇、乙醇、超純水、冰醋酸、氯化鈉、二水乙二胺四乙酸二鈉、氫氧化鈉等,聚合酶鏈式反應(polymerase chain reaction,PCR)擴增用的試劑均購自大連TaKaRa寶生物工程有限公司。

    設備:Nikon體式解剖鏡(SMZ800-C-DS)、徠卡(Leica)系統(tǒng)顯微鏡(DM5000)、雙人單面水平凈化工作臺(SF-CJ-20)、電熱恒溫培養(yǎng)箱(DHP-9162)、PCR儀、天能凝膠電泳成像分析系統(tǒng)(Tanon-41000)、電子天平(JA10003N)、DY1002V電泳儀、MR22低溫高速離心機等。

    1.2 方法

    1.2.1 數(shù)據(jù)處理

    分離幾率=分離到的菌株數(shù)/分離的樣本總數(shù)× 100%。

    采用SPSS 13.5軟件進行毛殼菌的數(shù)量統(tǒng)計及數(shù)據(jù)分析。

    毛殼菌的多樣性特征指數(shù)即Shannon-Weiner多樣性指數(shù)(H)、Pielou均勻性指數(shù)(E)和豐富度指數(shù)(D)分別按以下公式計算。

    式中:pi為物種i占采樣區(qū)菌株總數(shù)的比例;S為各采樣區(qū)內(nèi)毛殼菌的物種數(shù)量;N為各采樣區(qū)內(nèi)分離到的菌株總數(shù)。

    1.2.2 菌株分離與純化[20]

    樹枝、樹葉、動物糞便等基質采用組織分離法分離:將實驗材料切取成4~5 mm的小塊,用60%乙醇將組織小塊浸泡6~8 min,無菌水連續(xù)漂洗3次,將表面消毒過的組織小塊轉接至馬丁培養(yǎng)基上,每個培養(yǎng)皿放置4~5塊,28℃恒溫培養(yǎng),3~4 d后觀察是否有子囊果產(chǎn)生,并在Nikon體式解剖鏡下挑取單個子囊果接種于玉米粉培養(yǎng)基上,對菌株進行純化和觀察。

    采用稀釋分離法分離土壤樣品:稱取充分混勻的土樣約1.0 g置于250 mL無菌三角瓶中,加入60%乙醇2 mL使土樣完全淹沒,處理6~8 min,加入120 mL左右無菌水,使三角瓶中的乙醇濃度稀釋至1%左右,吸取0.8~1.0 mL稀釋液均勻涂布于馬丁培養(yǎng)基平板上,28℃恒溫培養(yǎng),3~4 d后觀察是否有子囊果產(chǎn)生,并在Nikon體式解剖鏡下挑取單個子囊果接種于玉米粉培養(yǎng)基上,對菌株進行純化和觀察。

    1.2.3 毛殼菌的初步歸類

    以VON ARX等[21]報道的系統(tǒng)為主要基礎和依據(jù)對毛殼菌進行初步歸類。將待鑒定的菌株接種于玉米粉培養(yǎng)基上,28℃黑暗培養(yǎng),記錄菌落特征、子囊果成熟時間。定期觀察,待子囊果成熟時,在Nikon體式解剖鏡下挑取單個子囊果,制作臨時玻片,用DM5000徠卡系統(tǒng)顯微鏡觀察子囊果、附屬絲和子囊的形態(tài),以及子囊孢子的顏色、形態(tài)、萌發(fā)孔等特征,將特征一致的菌株歸為一類。

    1.2.4 聚合酶鏈式反應和序列測定

    DNA的提取主要參考NAKADA等[22]的方法并加以改進。rDNA-ITS序列的PCR引物對序列[23]如下。ITS1-F:5'-CTTGGTCATTTAGAGGAAGTAA-3',ITS4:5'-TCCTCCGCTTATTGATATGC-3'。β-tubulin基因的PCR引物對序列[24]如下。Bt2a:5'-GGTAAC CAAATCGGTGCTGCTTTC-3',Bt2b:5'-ACCCTCAG TGTAGTGACCCTTGGC-3'。以上引物均由上海美吉生物科技有限公司合成。

    PCR反應體系(25 μL):10×PCR緩沖液2.5 μL,DNA模板10 ng,2.5 mmol/L dNTP 2.0 μL,10 μmol/L引物各0.5 μL,5 U/μL Taq酶0.2 μL。擴增ITS的PCR反應程序:95℃預變性3 min;95℃變性30 s,53℃退火40 s,72℃延伸30 s,35個循環(huán);最后72℃延伸10 min。擴增β-tubulin基因序列的PCR反應程序:95℃預變性5 min;94℃變性30 s,58℃退火30 s,72℃延伸1 min,40個循環(huán);最后72℃延伸10 min。PCR產(chǎn)物的純化和序列測定由上海美吉生物科技有限公司完成。

    1.2.5 序列分析及系統(tǒng)發(fā)育樹的構建

    將分離到的36個菌株的rDNA-ITS和β-tubulin基因序列測序結果在GenBank數(shù)據(jù)庫中申請接受號(表2),利用Blast進行同源序列查找,選擇15個相關種的序列(表2)。采用Clustal X 1.8軟件對所測定的核苷酸序列進行比對后,用Bioedit軟件將序列兩端切割平齊,保存為fastal格式,用SequenceMatrix進行菌株rDNA-ITS和β-tubulin基因序列拼接,并保存為nexus,擴展名為.nex。利用DnaSP v5.0軟件對序列進行DNA多態(tài)性分析,分別統(tǒng)計序列間每對堿基的平均差異、多態(tài)位點數(shù)目、單倍型數(shù)目基因型多樣性和核苷酸差異的平均值。用MEGA 5.0軟件中的鄰接法構建系統(tǒng)進化樹(選擇Sordaria macrospora為外部群)。

    表2 構建系統(tǒng)發(fā)育樹所用的菌株Table 2Strains used for constructing phylogenetic tree

    表2 (續(xù))Continuation of Table 2

    2 結果與分析

    2.1 分離結果及多樣性分析

    從表3中可看出:從采集自藏東南5個市、縣土壤、植物殘體、動物糞便的355份標本中分離到36株毛殼菌,分離幾率為10.14%。其中:工布江達縣的分離幾率最高,為33.33%;昌都市的標本分離幾率最低,僅為3.42%。林芝縣的毛殼屬真菌多樣性指數(shù)最高,為1.178 5,物種均勻度指數(shù)也最高,為0.605 6;工布江達縣的多樣性指數(shù)最低,僅為0.260 1;昌都市的毛殼屬真菌豐富度指數(shù)最高,達到0.861 4;察隅縣的豐富度指數(shù)最低,僅為0.430 7;藏東南各地區(qū)的物種數(shù)量存在較大差異,其中林芝縣物種數(shù)量最多。

    表3 不同地區(qū)的毛殼屬真菌物種多樣性指數(shù)特征Table 3Characteristics of species diversity index of Chaetomium from different regions

    2.2 形態(tài)特征初步歸類

    從表4可以看出,從藏東南各地區(qū)分離到的36個菌株可歸屬為8個種,分別為球毛殼(C. globosum),糞生毛殼(C.funicola),旋絲毛殼(C. bostrychodes),反卷毛殼(C.convolutum),印度毛殼(C.indicum),近緣毛殼(C.subaffine),黑毛殼(C. nigricolor)和大果毛殼(C.megalocarpum)。其中近緣毛殼、黑毛殼和大果毛殼僅分離到1株,為少見種。不同地區(qū)毛殼屬真菌的優(yōu)勢種存在差異:工布江達縣的優(yōu)勢種為球毛殼(C. globosum);墨脫縣和昌都市的優(yōu)勢種為糞生毛殼(C.funicola);察隅縣的優(yōu)勢種為旋絲毛殼(C. bostrychodes);林芝縣的優(yōu)勢種為反卷毛殼(C. convolutum)。

    表4 不同地區(qū)毛殼屬真菌形態(tài)特征歸類結果Table 4Classification results of morphological characteristics of Chaetomium from different regions

    2.3 序列分析及系統(tǒng)發(fā)育樹的構建

    2.3.1 堿基變異分析

    對36株毛殼菌的rDNA-ITS和β-tubulin基因序列進行擴增,結果(表5)顯示:rDNA-ITS擴增后兩端切割平齊獲得的長度為528 bp,β-tubulin基因擴增后兩端切割平齊獲得的長度為379 bp,拼接序列總長度為907 bp;36株毛殼菌共有223個變異位點,18種單倍型,單倍型多樣度為0.890,核苷酸多樣性指數(shù)為0.099 05,核苷酸平均差異數(shù)為89.835;βtubulin基因的變異位點、單倍型多樣度、單倍型總數(shù)、核苷酸多樣性指數(shù)和核苷酸平均差異數(shù)與rDNA-ITS的差異顯著,體現(xiàn)出更大的堿基變異性。

    表52 個基因在36株毛殼屬真菌中的核苷酸多樣性Table 5Nucleotide diversity of two genes in 36 strains of Chaetomium

    2.3.2 系統(tǒng)發(fā)育分析

    利用MEGA 5.0軟件構建rDNA-ITS和β-tubulin基因系統(tǒng)發(fā)育進化樹,對所測定的序列及GenBank數(shù)據(jù)庫中的相關序列進行系統(tǒng)發(fā)育進化分析,構建藏東南地區(qū)毛殼菌的系統(tǒng)發(fā)育樹。結果(圖1)顯示,供試的36個菌株被分為7個組,各分支的支持強度均達77%以上。其中:10個菌株與糞生毛殼(C.funicola)聚類在一個分支上,包括形態(tài)上不能準確歸類的菌株39-6-1;3個菌株與印度毛殼(C. indicum)聚類在一個分支上;2個形態(tài)不定的菌株LZT0021、LZZ0045與C.erectum聚類在一個分支上;菌株LZZ0012與C.subaffine聚類在一個分支上;92-35與大果毛殼(C.megalocarpum)聚類在一起;6個菌株與球毛殼(C.globosum)聚類在一個分支上,包括形態(tài)上不能準確歸類的菌株39-16-1;此外,形態(tài)上不能準確歸類的菌株92-18-2、形態(tài)上鑒定為反卷毛殼(C.convolutum)的4個菌株、形態(tài)上鑒定為旋絲毛殼(C.bostrychodes)的7個菌株、形態(tài)上歸類為黑毛殼(C.nigricolor)的1個菌株,共計13個菌株聚在一起,彼此分不開。

    3 討論

    本文從藏東南地區(qū)采集動物糞便、土壤和植物殘體標本共355份,從中分離到毛殼菌36株,平均分離幾率僅為10.14%,說明毛殼菌在土壤中的分離幾率較低。這與國內(nèi)很多學者的研究結果一致:王雪薇[7]從1 738份基質中僅分離到136株毛殼菌,分離幾率為7.82%;劉富江[8]從1 098份標本中僅分離獲得63株毛殼菌,分離幾率僅為5.74%。林芝縣的毛殼菌多樣性指數(shù)和均勻度指數(shù)均為最高,這與該地區(qū)植被豐富有很大關系。綜合分析藏東南各地區(qū)的物種類群,旋絲毛殼為察隅縣的優(yōu)勢種,球毛殼為工布江達縣的優(yōu)勢種,糞生毛殼為昌都市和墨脫縣的優(yōu)勢種,反卷毛殼為林芝縣的優(yōu)勢種,反映出不同生態(tài)區(qū)的植被和土壤狀況影響了微生物的生態(tài)分布與優(yōu)勢種的類型。

    圖1 基于rDNA-ITS和β-tubulin基因序列構建的系統(tǒng)發(fā)育樹Fig.1Phylogenetic tree constructed based on rDNA-ITS and β-tubulin sequences

    從堿基變異結果來看,β-tubulin基因的堿基變異位點、單倍型總數(shù)、單倍型多樣度、核苷酸多樣性指數(shù)和核苷酸平均差異數(shù)等較rDNA-ITS存在顯著差異。β-tubulin基因既有保守的外顯子又有6個可變的內(nèi)含子,可作為真菌物種鑒定的標志片段[25]。SAMSON等[26]對青霉屬的180株代表性菌株進行序列分析,證實了β-tubulin基因是較理想的物種標記片段;VARGA等[27]和GEISER等[28]的研究均表明βtubulin基因適合作為曲霉屬的DNA條形碼;但是TANG等[29]在對糞殼菌綱(Sordariomycetes)進行系統(tǒng)發(fā)育研究時發(fā)現(xiàn),β-tubulin對該類群真菌的分辨率較低,需要結合其他基因片段才能提高物種的分辨率。本研究結合rDNA-ITS和β-tubulin基因序列進行聯(lián)合分析,提高了物種鑒定的準確性。

    從系統(tǒng)發(fā)育樹上可以看出,結合rDNA-ITS和β-tubulin基因不僅可以用來區(qū)分毛殼菌屬中形態(tài)差異較大的種,如印度毛殼、大果毛殼、球毛殼、糞生毛殼,還可以區(qū)分形態(tài)特征非常相似的印度毛殼和直立毛殼(C.erectum),同時對一些形態(tài)上難以鑒定的種也可以進行初步鑒定,但還不能很好地區(qū)分反卷毛殼、旋絲毛殼和黑毛殼,需要結合更多的基因片段進行區(qū)分。

    目前,國內(nèi)外對西藏毛殼菌的研究僅為零星報道,缺乏較系統(tǒng)的研究。本文選擇西藏植被較為豐富的藏東南地區(qū)為標本采集地,提高了菌株的分離幾率。藏東南復雜而獨特的生態(tài)環(huán)境和較原始的土壤生態(tài)環(huán)境決定了其毛殼菌的獨特之處。本研究分離到的直立毛殼(C.erectum)在國內(nèi)尚無報道,大果毛殼也是比較少見的種[30]。由此可見,藏東南地區(qū)是西藏的重要菌種資源庫,本研究為豐富西藏毛殼菌資源庫和開發(fā)毛殼菌代謝產(chǎn)物奠定了基礎。

    [1]劉守安,李多川,俄世瑾,等.嗜熱毛殼菌纖維素酶(CBHⅡ) cDNA的克隆及在畢赤酵母中的表達.生物工程學報,2005,21 (6):892-899. LIU S A,LI D C,E S J,et al.Cloning and expressing of cellulase gene(cbh2)from thermophilic fungi Chaetomium thermophilum CT2.Chinese Journal of Biotechnology,2005,21(6):892-899.(in Chinese with English abstract)

    [2]KIRK P M,CANNON P F,DAVID J C,et al.Ainsworth&Bisby’s Dictionary of the Fungi.9thed.Wallingford,UK:CAB International Publishing,2001:610-614.

    [3]陳慶濤.毛殼菌和殼針孢菌的新種.微生物學報,1973,13(2): 124-128. CHEN Q T.Some new species of Chaetomium and Septoria.Acta Microbiologica Sinica,1973,13(2):124-128.(in Chinese with English abstract)

    [4]戴芳瀾.中國真菌總匯.北京:科學技術出版社,1979:157-165. DAI F L.Sylloge Fungorum Sinicorum.Beijing:Science and Technology Press,1979:157-165.(in Chinese)

    [5]孫廣宇,譚悠久,張榮.中國毛殼菌科研究I.毛殼菌屬的種.菌物學報,2004,23(3):333-337. SUN G Y,TAN Y J,ZHANG R.The family Chaetomiaceae from China I.Species of the genus Chaetomium.Mycosystema,2004,23 (3):333-337.(in Chinese with English abstract)

    [6]譚悠久,張榮,張軍林,等.中國毛殼菌科(Chaetomiaceae)分類研究.西北農(nóng)林科技大學學報(自然科學版),2005,33(增刊):267. TAN Y J,ZHANG R,ZHANG J L,et al.Classification of the family Chaetomiaceae from China.Journal of Northwest A&F University(Natural Science Edition),2005,33(Suppl.):267.(in Chinese)

    [7]王雪薇.中國毛殼屬Chaetomium Kunze及其形態(tài)相似類群的系統(tǒng)分類研究.北京:中國科學院大學,2005:51-147. WANG X W.Systematic studies on Chaetomium Kunze and its morphologically similar taxa from China.Beijing:University of Chinese Academy of Sciences,2005:51-147.(in Chinese with English abstract)

    [8]劉富江.中國部分省(區(qū))毛殼屬真菌的分類研究.烏魯木齊:新疆農(nóng)業(yè)大學,2009:20-67. LIU F J.Taxonomic study on the Chaetomium Kunze from some provinces(regions)in China.Urumqi:Xinjiang Agricultural University,2009:20-67.(in Chinese with English abstract)

    [9]何建清,吳云鋒,張格杰.藏東南地區(qū)土壤放線菌的生態(tài)分布及活性研究.微生物學報,2006,46(5):773-777. HE J Q,WU Y F,ZHANG G J.Activity and ecological distribution of actinomycetes from soil in the southeastern of Tibet.Acta Microbiologica Sinica,2006,46(5):773-777.(in Chinese with English abstract)

    [10]游金娥,馮建孟.藏東南地區(qū)種子植物的區(qū)系組成和物種多樣性.生態(tài)環(huán)境學報,2013,22(2):207-212. YOU J E,FENG J M.Plant biodiversity and flora composition in southeast Tibet.Ecology and Environmental Sciences,2013,22(2): 207-212.(in Chinese with English abstract)

    [11]徐阿生,羅建.中國盤菌屬Peziza一新記錄種.菌物學報,2007, 26(1):148-149. XU A S,LUO J.A new record species of Peziza in China.Mycosystema,2007,26(1):148-149.(in Chinese with English abstract)

    [12]張惠,范宇光,圖力古爾.采自西藏的盔孢菌屬2個中國新記錄種.東北林業(yè)大學學報,2012,40(5):134-136. ZHANG H,FAN Y G,TOLGOR B.Two new records of the genus Galerina collected from Tibet,China.Journal of Northeast Forestry University,2012,40(5):134-136.(in Chinese with English abstract)

    [13]劉述春,孫炳達,旺姆,等.一株毛殼霉屬真菌中新結構活性聚酮類化合物研究.菌物學報,2010,29(5):726-731. LIU S C,SUN B D,WANGMU,et al.Chaetomones A-E:New bioactive polyketides from Chaetomium sp.Mycosystema,2010,29 (5):726-731.(in Chinese with English abstract)

    [14]GUO Y Z,ZHU M Q,SUN G Y.The family Chaetomiaceae from China.4.Two newly recorded species of Chaetomium.Mycotaxon, 2011,116:247-251.

    [15]SCHOCH C L,SEIFERT K A,HUHNDORF S,et al.Nuclear ribosomal internal transcribed spacer(ITS)region as a universal DNA barcode marker for fungi.Proceedings of the National Academy of Sciences of the USA,2012,109(16):6241-6246.

    [16]BUEE M,REICH M,MURAT C,et a1.454 pyrosequencing analyses of forest soils reveal an unexpectedly high fungal diversity.New Phytologist,2009,184(2):449-456.

    [17]GREIF M D,STCHIGEL A M,MILLER A N,et al.A reevaluation of genus Chaetomidium based on molecular and morphological characters.Mycologia,2009,101(4):554-564.

    [18]ASGARI B,ZARE R.The genus Chaetomium in Iran,a phylogenetic study including six new species.Mycologia,2011, 103(4):863-882.

    [19]MALLOCHD.Moulds:TheirIsolation,Cultivationand Identification.Canada:University of Toronto Press,1981:1-59.

    [20]譚悠久.毛殼菌科(Chaetomiace)分類及分子系統(tǒng)發(fā)育研究.陜西,楊凌:西北農(nóng)林科技大學,2005:24-33. TAN Y J.Classification,identification and molecular phylogenetics of the family Chaetomiaceae.Yangling,Shaanxi:Northwest A&F University,2005:24-33.(in Chinese with English abstract)

    [21]VON ARX J A,GUARRO J,FIGUERAS M J.The Ascomycete genus Chaetomium.Nova Hedwigia,Beiheft,1986,84:1-162.

    [22]NAKADA M,TANAKA C,TSUNEWAKI K.RFLP analysis for species separation in the genera Bipolaris and Curvularia. Mycoscience,1994,35(3):271-278.

    [23]WHITE T J,BRUNS T,LEE S,et al.Amplification and direct sequencing of fungal ribosomal RNA genes for phylogenetics// INNIS M A,GELFAND D H,SNINSKY J J,et al.PCR Protocols: A Guide to Methods and Applications.New York,USA:Academic Press,Inc.,1990:315-322.

    [24]GLASS N L,DONALDSON G C.Development of primer sets designed for use with the PCR to amplify conserved genes from filamentous ascomycetes.Applied and Environmental Microbiology, 1995,61(4):1323-1330.

    [25]BISCHOFF J F,REHNER S A,HUMBER R A.Metarhizium frigidum sp.nov.:A cryptic species of M.anisopliae and a member of the M.flavoviride complex.Mycologia,2006,98(5): 737-745.

    [26]SAMSON R A,SEIFERT K A,KUIJPERS A F A,et al.Phylogenetic analysis of Penicillium subgenus Penicillium using partial β-tubulin sequences.Studies in Mycology,2004,49:175-200.

    [27]VARGA J,FRISVAD J C,KOCSUBE S,et al.New and revisited species in Aspergillus section Nigri.Studies in Myology,2011,69: 1-17.

    [28]GEISER D M,KLICH M A,FRISVAD J C,et al.The current status of species recognition and identification in Aspergillus. Studies in Mycology,2007,59:1-10.

    [29]TANG A M C,JEEWON R,HYDE K D,et al.Phylogenetic utility of protein(RPB2,β-tubulin)and ribosomal(LSU,SSU)gene sequences in the systematics of Sordariomycetes(Ascomycota,fungi). Antonie Van Leeuwenhoek,2007,91(4):327-349.

    [30]郭云忠.毛殼科Chaetomiaceae真菌多基因系統(tǒng)演化及分類鑒定研究.陜西,楊凌:西北農(nóng)林科技大學,2012:87-89. GUO Y Z.The multigene phylogeny and classification of Chaetomiaceae.Yangling,Shaanxi:Northwest A&F University, 2012:87-89.(in Chinese with English abstract)

    Diversity and phylogenetic analysis of Chaetomium fungus from southeastern Tibet.Journal of

    Zhejiang University(Agric.&Life Sci.),2017,43(4):431-440

    YUE Haimei1*,ZHUANG Hua2,PAN Zhaohui3,GONG Wenfeng1(1.Department of Plant Science,Tibet Agricultural and Animal Husbandry College,Linzhi 860000,Xizang,China;2.College of Plant Protection,Northwest A&F University/State Key Laboratory of Crop Stress Biology for Arid Areas,Yangling 712100,Shaanxi,China;3.Tibet Plateau Institute of Ecology,Linzhi 860000,Xizang,China)

    southeastern Tibet;Chaetomium;diversity;phylogenetic analysis

    Q 949.32

    A

    10.3785/j.issn.1008-9209.2016.12.221

    國家自然科學基金(31360006);旱區(qū)作物逆境生物學國家重點實驗室開放基金課題(CSBAA2016006)。

    *通信作者(Corresponding author):岳海梅(http://orcid.org/0000-0001-9282-2295),E-mail:yuehm1980@163.com

    2016-12-22;接受日期(Accepted):2017-05-09

    猜你喜歡
    東南地區(qū)真菌菌株
    菌株ZYRH-19的篩選鑒定及其合成韋蘭膠的特性研究
    灰樹花工廠化瓶栽菌株篩選試驗
    食用菌(2023年6期)2023-11-28 06:03:32
    第18屆中國東南地區(qū)數(shù)學奧林匹克(高一)
    菌株出馬讓畜禽污染物變廢為寶
    第16屆中國東南地區(qū)數(shù)學奧林匹克
    高等大型真菌與人類
    科學(2020年2期)2020-08-24 07:56:56
    第17屆中國東南地區(qū)數(shù)學奧林匹克
    第15屆中國東南地區(qū)數(shù)學奧林匹克
    真菌造房子
    艾滋病合并侵襲性真菌感染的診治
    微山县| 武城县| 内丘县| 云龙县| 伊吾县| 昆明市| 黄石市| 金昌市| 淳化县| 建阳市| 靖安县| 肃北| 贡山| 石河子市| 彭水| 浑源县| 广丰县| 临朐县| 安福县| 托里县| 稻城县| 黄冈市| 兴国县| 咸阳市| 南安市| 宜兰县| 南召县| 澄迈县| 沁水县| 措美县| 竹北市| 隆子县| 东海县| 宁南县| 石屏县| 金乡县| 利川市| 郯城县| 朝阳市| 淮北市| 广饶县|