周 翠
(東阿縣林業(yè)局,山東 東阿 252200)
粘帚霉(Gliocladiumsp.),屬半知菌門,絲孢綱,叢梗孢目,叢梗孢科,粘帚霉屬,是一種分布廣泛的土壤習(xí)居菌和重寄生菌,具有生長(zhǎng)速度快、產(chǎn)孢量大、寄主范圍廣、寄生能力強(qiáng)、拮抗機(jī)制多樣等優(yōu)點(diǎn),被認(rèn)為是目前已發(fā)現(xiàn)的拮抗微生物中極具潛力的生防因子之一[1-2]。粉紅粘帚霉(G.roseum,無(wú)性階段拉丁文名稱為Clonostachys rosea)是得到廣泛的研究和應(yīng)用的粘帚霉之一,絲狀真菌,在生長(zhǎng)周期內(nèi)可以產(chǎn)生3種繁殖體,包括菌絲體、分生孢子和厚垣孢子[3-5]。粉紅粘帚霉的生存環(huán)境十分廣泛,熱帶雨林,溫帶,靠近北極地區(qū)以及世界上的沙漠地帶均有粉紅粘帚霉分布。據(jù)報(bào)道,耕地、草地、荒野、淡水、海灘以及鹽堿地都可能分離到粉紅粘帚酶[6]。
供試菌株:粉紅粘帚霉分離自于山東省濰坊市臨朐縣蘋果枝干部輪紋病病斑,分離純化后保存。
1.2.1 粉紅粘帚霉的菌落特征
在活化培養(yǎng)3~5d的粉紅粘帚霉菌落邊緣用5mm的無(wú)菌打孔器打取菌餅,轉(zhuǎn)接到已制備好的9cm直徑的PDA平板中央,重復(fù)3組實(shí)驗(yàn),將接種好的PDA平板放置在28℃培養(yǎng)箱中培養(yǎng),定時(shí)觀察和記錄粉紅粘帚霉菌落顏色、邊緣整齊程度、質(zhì)地、氣生菌絲梳密和發(fā)達(dá)程度、菌株產(chǎn)生色素的情況等變化。
1.2.2 粉紅粘帚霉的形態(tài)特征
當(dāng)純化培養(yǎng)的粉紅粘帚霉菌落顏色開(kāi)始變?yōu)榉奂t色時(shí),用無(wú)菌解剖針挑取菌落邊緣菌絲置于載玻片上制成臨時(shí)裝片,在顯微鏡下觀察粉紅粘帚霉產(chǎn)孢結(jié)構(gòu),菌絲形態(tài)以及孢子形態(tài)特征。
1.2.3 粉紅粘帚霉分子生物學(xué)鑒定
1.2.3 .1 液體培養(yǎng)與菌絲的獲得
搖菌:在經(jīng)過(guò)純化的粉紅粘帚霉菌落邊緣用打孔器打取五個(gè)菌餅,將菌餅接種到PD(液體馬鈴薯)培養(yǎng)基中,28℃,200rpm恒溫?fù)u床上培養(yǎng)2d。
菌絲抽提:將培養(yǎng)好的菌絲用真空泵及布式漏斗抽提,除去培養(yǎng)液,獲得干燥的粉紅粘帚霉菌絲,然后用烘箱65℃烘干,-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>
1.2.3 .2 DNA的提取
采用CTAB法提取粉紅粘帚霉DNA。
1.2.3 .3 PCR擴(kuò)增
設(shè)置 25 μL 反應(yīng)體系為 10×PCR buffer2.5μL,dNTP 1μL,ITS1 引 物 2μL,ITS4 引物 2μL,Taq 酶0.5 μL,Mg2+1μL,DNA 模板 2μL,ddH2O 14μL;其PCR擴(kuò)增條件:94℃預(yù)變性 3min,94℃變性 1 min,55℃退火1 min,72℃延伸 2min,重復(fù)步驟上述 30次,72℃延伸10 min。將獲得PCR產(chǎn)物在1%的瓊脂糖凝膠中取5 μL電泳,觀察目標(biāo)片段的大小。
1.2.3 .4 CR產(chǎn)物的純化回收和測(cè)序
擴(kuò)增后的目標(biāo)片段按試劑盒說(shuō)明進(jìn)行純化回收,將回收的PCR產(chǎn)物送華大基因公司測(cè)序。
1.2.3 .5 分子鑒定與系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)的構(gòu)建
將測(cè)定的菌株ITS序列提交到NCBI上,并用BLAST進(jìn)行同源性序列比對(duì),確定菌株的分類地位。在所測(cè)定的相關(guān)基因序列的基礎(chǔ)上,再?gòu)腉en-Bank上搜集與測(cè)序菌株相關(guān)的序列,并首先對(duì)測(cè)定序列用Clustalx1.83進(jìn)行序列對(duì)齊,刪除缺失位點(diǎn)、殘缺位點(diǎn)、非編碼序列位點(diǎn),然后利用MEGA 5.0軟件進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育分析,以自展法(bootstrap)進(jìn)行檢測(cè),共循環(huán)1,000次,用鄰接法構(gòu)建菌株序列的鄰接樹(shù)。
在PDA培養(yǎng)基上,菌絲初為白色,邊緣整齊,菌絲匍匐,較疏松,氣生菌絲不發(fā)達(dá),后菌絲變?yōu)榉奂t色,菌落表面有少許水溢出,菌落底有橙紅色色素產(chǎn)生(見(jiàn)圖 1)。
圖1 粉紅粘帚霉菌落形態(tài)Fig.1 Colonial morphology of Clonostachys
分生孢子梗掃帚狀分枝。分生孢子橢圓形,粘連在一起聚集成團(tuán)狀,菌絲無(wú)色,有隔膜,并且具有與其功能相適應(yīng)的菌環(huán)(見(jiàn)圖2)。
圖2 粉紅粘帚霉的形態(tài)特征Fig.2 Structure characterastics of Clonostachys rosea A粉紅粘帚霉的產(chǎn)孢結(jié)構(gòu)B分生孢子C菌絲D菌環(huán)結(jié)構(gòu)
通過(guò)對(duì)菌株的rDNA ITS進(jìn)行PCR擴(kuò)增,其電泳結(jié)果見(jiàn)圖3。對(duì)PCR擴(kuò)增后的基因序列進(jìn)行凝膠電泳,用2Kb Maker進(jìn)行對(duì)照,我們發(fā)現(xiàn)所得序列大小約為600bp。
圖3 部分菌株ITS序列電泳圖Fig.3 The electrophorogram of ITS
通過(guò)構(gòu)建菌株的系統(tǒng)發(fā)育分析樹(shù)我們可以發(fā)現(xiàn),本次試驗(yàn)所用的菌株編號(hào)為JF817331.1,它的分類地位為半知菌門,絲孢綱,叢梗孢目,叢梗孢科,粘帚霉屬,粉紅粘帚霉。與已知編號(hào)為KP670432.1的粉紅粘帚霉菌株具有最近的親緣關(guān)系。在一定程度上我們可以通過(guò)系統(tǒng)發(fā)育分析樹(shù)得 到供試菌株的分類地位并參照親緣關(guān)系較近的已知菌株的特性推測(cè)供試菌株的形態(tài)特征等生物學(xué)特性。
圖4 粉紅粘帚霉菌株分子鑒定及系統(tǒng)發(fā)育分析樹(shù)Fig.4Phylogenetic tree of Clonostachys rosea strain
菌落形態(tài)顯示,粉紅粘帚霉菌絲初為白色,邊緣整齊,菌絲匍匐,較疏松,氣生菌絲不發(fā)達(dá),后變?yōu)榉奂t色,菌落表面有少許水溢出,菌落底部有橙紅色色素產(chǎn)生,通過(guò)對(duì)粉紅粘帚霉的培養(yǎng)觀察可以看到粉紅粘帚霉可以產(chǎn)生大量分生孢子。ITS序列測(cè)定表明,該菌株與genbank中提交的粉紅粘帚霉(Clonostachys rosea)菌株同源性達(dá)到100%,上述研究明確了該菌株為半知菌門,絲孢綱,叢梗孢目,叢梗孢科,粘帚霉屬,粉紅粘帚霉。
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