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對比人類基因探秘材料基因——人類基因組計劃對材料基因組計劃的啟發(fā)
李楠楠,沈一筍,臧亮,閆宗楷,向勇*
(寧波國際材料基因工程研究院,浙江 寧波315000)
“材料基因組計劃”中的基因一詞引用了“人類基因組計劃”(Human Genome Project,HGP)中基因的概念。在人類基因組中,基因是具有遺傳效應的DNA或RNA片段,支持著生命的基本構(gòu)造和性能,是決定生命健康的內(nèi)在因素。DNA由腺嘌呤、鳥嘌呤、胞嘧啶和胸腺嘧啶4種堿基通過兩兩配對形成雙螺旋結(jié)構(gòu),堿基對不同的組成序列決定了基因中所攜帶的不同的遺傳信息,從而決定生命體的不同機能。因此人類基因組計劃的核心是利用第一代基因測序技術(shù),檢測人體約2.5萬個基因中30億個堿基對組成的核苷酸序列,明確所有基因的結(jié)構(gòu)和功能。從而探尋堿基對組成-堿基對序列-人類生命現(xiàn)象的內(nèi)在規(guī)律,為疾病的預防和診治提供科學依據(jù),更好地認識和保護生命體。
人類基因組計劃最早也是由美國能源部于1985年提出草案,于1990年10月正式啟動。該計劃由美國、德國、日本、英國、法國和中國6個國家的多個科學研究機構(gòu)共同參與實施,融合了分子生物學、化學、物理學、機器人技術(shù)和計算科學等多個學科的知識,打破了研究學者獨自探索并解決科學問題的傳統(tǒng)格局,開啟了協(xié)同創(chuàng)新科學探索的新途徑。歷經(jīng)多年的努力,于2003年以99.99%的精度提前兩年完成人類基因組測序工作。人類基因組計劃一反“假說推動研究”的傳統(tǒng)規(guī)則,搜集人類基因數(shù)據(jù),成功建立起一個全球共享的人類基因組數(shù)據(jù)庫,通過共享數(shù)據(jù)促進生命科學的快速發(fā)展,揭秘生命起源奧秘。
人類基因組計劃的成功實施為材料基因組計劃提供了寶貴的經(jīng)驗:①人類基因組計劃所使用的基因測序工具是第一代基因測序技術(shù),效率低,此后發(fā)展出的高通量測序技術(shù)可加快基因測序效率,并大大降低成本;②六國科學家通過多學科、多領(lǐng)域及多部門的積極合作,實現(xiàn)協(xié)同創(chuàng)新;③人類基因組計劃中的數(shù)據(jù)分析效率低下,為獲得每條染色體的連續(xù)序列,第一個人類基因組序列是將零碎產(chǎn)生的上千個單獨序列片段(每個約100~300個堿基)通過計算拼接而成,這嚴重阻礙了人類基因組計劃的推進。
借鑒人類基因組計劃,認為材料基因組計劃的發(fā)展應當從以下幾個方面做出努力:①開發(fā)高通量制備及表征技術(shù),利用高通量的實驗手段,加速材料研發(fā)進程;②整合全球力量,覆蓋適用于不同材料類型的實驗裝備和數(shù)據(jù)平臺,建立材料科學協(xié)同創(chuàng)新網(wǎng)絡,實現(xiàn)“云研發(fā)、云集成、云創(chuàng)新”的先進理念;③構(gòu)建材料基因大數(shù)據(jù)庫,并形成計算仿真、定制實驗,提高實驗靶向性,從而促進新材料研發(fā)與應用的進程。
此外,我們還應當充分認識到材料基因組與人類基因組的區(qū)別,人與人之間基因相似度為99.9%,基因的結(jié)構(gòu)是明確的雙螺旋結(jié)構(gòu),只是基因序列上存在堿基對的排列差異,從而導致人與人之間的不同。而材料的微觀結(jié)構(gòu)更加多樣化,不但成分組成可以不同,微觀形貌等結(jié)構(gòu)也可能千差萬別,其組成-結(jié)構(gòu)-性能之間的關(guān)系更加復雜。為此應當將先進的材料研發(fā)技術(shù)與更多元的高通量制備和表征裝備相結(jié)合,打破傳統(tǒng)研發(fā)模式,為材料基因組計劃的實施提供強大的技術(shù)支持與裝備保障。
在中國材料基因組計劃大力發(fā)展的趨勢下,寧波國際材料基因工程研究院于2015年8月成立。研究院匯聚國際材料基因芯片技術(shù)發(fā)明人與多名國家材料基因組計劃重大咨詢項目專家組成員,完美結(jié)合材料基因芯片技術(shù)與高通量制備和表征裝備,通過技術(shù)、機制、模式的創(chuàng)新,為中國材料基因組計劃的實施不懈努力。
(通訊作者:向勇,男,1977年生,教授,寧波國際材料基因工程研究院院長,Email: jinl@mgi.org.cn)