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    SSR分子標(biāo)記技術(shù)在甘藍(lán)型油菜雜交種陜油16純度鑒定中的應(yīng)用

    2016-01-17 09:19:31徐愛(ài)遐
    種子 2016年6期
    關(guān)鍵詞:標(biāo)記技術(shù)雜交種親本

    盧 虹, 徐愛(ài)遐

    (西北農(nóng)林科技大學(xué)農(nóng)學(xué)院旱區(qū)作物逆境生物學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室, 陜西 楊凌712100)

    油菜屬于十字花科蕓薹屬,是世界四大油料作物(大豆、油菜、花生、向日葵)之一。中國(guó)是重要的油菜生產(chǎn)國(guó),2013—2014年度中國(guó)的油菜籽產(chǎn)量占世界總產(chǎn)量的20.6%。2012—2013年度中國(guó)油料播種面積為1 402.3萬(wàn)hm2,油菜籽播種面積為753.1萬(wàn)hm2,占油料播種面積的53.7%。2012—2013年度較往年油菜播種面積、總產(chǎn)增加,但是單產(chǎn)降低[1],雜種優(yōu)勢(shì)的利用是一種有效的提高油菜產(chǎn)量的重要途徑。

    隨著油菜雜種優(yōu)勢(shì)的利用,市場(chǎng)上的雜交油菜推廣面積占油菜生產(chǎn)總面積的60%[2]。雜種利用的主要途徑有:細(xì)胞質(zhì)雄性不育(CMS)、細(xì)胞核雄性不育(GMS)、化學(xué)誘導(dǎo)雄性不育(CHA)和自交不親和性(SI)等[3],但目前應(yīng)用于生產(chǎn)的細(xì)胞質(zhì)雄性不育主要是高溫不育型,在低溫條件下容易產(chǎn)生微粉,造成自交結(jié)實(shí)從而影響雜交種的純度[4]。因此,對(duì)雜交種的純度研究顯得尤為重要。

    目前,農(nóng)作物雜交種純度的鑒定方法主要有三大類:形態(tài)學(xué)鑒定、生化標(biāo)記鑒定和DNA水平鑒定。形態(tài)學(xué)鑒定周期長(zhǎng),易受環(huán)境影響,相似形態(tài)特征的鑒定困難,鑒定者的經(jīng)驗(yàn)制約設(shè)鑒定的準(zhǔn)確性,而且花費(fèi)高;生化標(biāo)記鑒定不穩(wěn)定受環(huán)境影響較大,具有嚴(yán)格的組織和時(shí)間表達(dá)特異性[5-6]。DNA水平鑒定有DNA分子標(biāo)記技術(shù)和基因組DNA的光譜分析(Fourier transform infrared spectroscopy)[7],DNA 分子標(biāo) 記技術(shù)可以有效的避免上述問(wèn)題,具有簡(jiǎn)便、快速、準(zhǔn)確的特點(diǎn)。DNA分子標(biāo)記技術(shù)主要包括RAPD、SRAP、SSR、ISSR、EST-SSR、INDEL、AFLP 等[8-12]。其中,SSR分子標(biāo)記技術(shù)廣泛應(yīng)用于油菜[13]、大豆[14]、向日葵[15]、棉花[16]、水稻[17-8]、玉米[19]等的雜交種純度鑒定。

    本試驗(yàn)利用SSR標(biāo)記技術(shù)對(duì)甘藍(lán)型油菜陜油16雜交種純度進(jìn)行研究,以期找到可以鑒定陜油16雜交種純度的SSR標(biāo)記。

    1 材料與方法

    1.1 試驗(yàn)材料

    甘藍(lán)型油菜雜交種陜油16及其雙親9A(♀)和530C(♂)均由西北農(nóng)林科技大學(xué)油菜中心品種資源課題組提供。陜油16大田制種種子樣本由楊凌金諾公司和楊凌高科公司提供。

    1.2 試驗(yàn)方法

    1.2.1 引物設(shè)計(jì)與合成

    80對(duì)引物來(lái)源于白菜型油菜基因組已公布信息,下載網(wǎng)址 http://brassicadb.org/brad/geneticMarker.php?chr=ALL。所有引物均有上海生工生物技術(shù)服務(wù)有限公司合成。

    1.2.2 DNA的提取與檢測(cè)

    雜交種陜油16及其親本各取100粒,大田制種種子各取400粒,分別均勻放入鋪有2層吸水紙的培養(yǎng)皿中,早晚各澆水1次,室溫下發(fā)芽5~7d。取幼芽上半部分放入研缽中,隨機(jī)選取實(shí)驗(yàn)材料父本、F1、母本標(biāo)準(zhǔn)樣品10個(gè)單株的幼嫩子葉分別混合磨樣,提取DNA用于標(biāo)記篩選。陜油16大田制種材料分別取188株并編號(hào),進(jìn)行單株DNA提取,用于純度鑒定?;蚪MDNA提取采用CTAB法進(jìn)行[20]。

    1.2.3 雜交種及其親本的SSR分析

    1)PCR擴(kuò)增。PCR循環(huán)參數(shù)94℃預(yù)變性3 min,94℃變性1min,60℃退火30s,72℃延伸45s,此后每個(gè)循環(huán)退火溫度降低0.5℃,共計(jì)9個(gè)循環(huán);94℃變性1min,55℃退火30s,72℃延伸45s,29個(gè)循環(huán);72℃延伸10min,4℃保存。

    表1 PCR反應(yīng)體系

    2)電泳檢測(cè)。樣品從PCR中取出來(lái)后加入等體積的Loading buffer,放入水浴中變性5min,然后放入冰水混合物中冷卻;然后在6%變性聚丙烯酰胺凝膠上電泳(U=2 000VI=200AP=85W)45min左右;電泳完成后,用10%醋酸固定20min后,蒸餾水漂洗2遍,每次10min;然后用硝酸銀染色、碳酸鈉顯影,再用10%醋酸固定,經(jīng)漂洗后自然風(fēng)干,拍照保存。

    1.3 種子純度的鑒定

    1.3.1 SSR分子標(biāo)記鑒定

    用80對(duì)SSR引物在構(gòu)建的陜油16及其雙親的基因池中進(jìn)行篩選,用篩選到的具有差異的SSR引物鑒定陜油16大田制種材料的純度。雜交種純度(%)=具有雙親特征條帶的樣本數(shù)/檢測(cè)的樣本總數(shù)×100%。

    1.3.2 田間植株鑒定

    陜油16種植于西北農(nóng)林科技大學(xué)油菜實(shí)驗(yàn)基地,每個(gè)品種設(shè)2個(gè)小區(qū),進(jìn)行常規(guī)田間管理,不間苗,在盛花期統(tǒng)計(jì)總株數(shù)以及不育株數(shù)。

    鑒定方法為:當(dāng)天開(kāi)的花中,如果有花朵的花藥高于柱頭、正常散粉且發(fā)育正常則記為可育株,花朵較小、花藥等于或低于柱頭且雄蕊退化不能散粉的單株記為不育株,其中未開(kāi)花的單株不計(jì)數(shù)。

    2 結(jié)果與分析

    2.1 特征型引物的篩選

    用80對(duì)SSR引物在陜油16雜交種及其親本中進(jìn)行篩選和群體驗(yàn)證后,確定有3對(duì)引物SSR 313、SSR 354、SSR 359在陜油16雜交種及其親本中存在多態(tài)性,擴(kuò)增帶型清晰,容易分辨,且在陜油16及其雙親中表現(xiàn)共顯性,見(jiàn)圖1,引物序列見(jiàn)表2。

    2.2 SSR標(biāo)記用于陜油16雜交種種子純度鑒定

    試驗(yàn)中共檢測(cè)了188個(gè)陜油16雜交種單株(如圖2~圖4箭頭所示),與P1條帶相同的記為母本(不育系),與P2條帶相同的記為父本(恢復(fù)系),與F1條帶相同的記為雜交種;圖2,圖3,圖4分別是SSR 313、SSR 354、SSR 359用于陜油16大田制種種子純度鑒定圖(部分)。

    表2 SSR引物序列

    圖1 SSR引物對(duì)陜油16及其親本的擴(kuò)增結(jié)果

    圖2 SSR 313對(duì)陜油16部分單株及其親本的擴(kuò)增結(jié)果

    圖3 SSR 354對(duì)陜油16部分單株及其親本的擴(kuò)增結(jié)果

    圖4 SSR 359對(duì)陜油16部分單株及其親本的擴(kuò)增結(jié)果

    統(tǒng)計(jì)2品種雜交種種子中不育系(母本)比率、恢復(fù)系(父本)比率和雜交種純度鑒定結(jié)果見(jiàn)表3。從表3可以看出,SSR標(biāo)記鑒定結(jié)果中不育株比率均大于恢復(fù)系比率。

    表3 陜油16雜交種種子純度鑒定結(jié)果

    2.3 田間植株鑒定

    于油菜盛花期(4月1日)在田間對(duì)陜油16鑒定圃材料進(jìn)行全區(qū)逐株觀察鑒定,鑒別育性。田間種植鑒定結(jié)果顯示,陜油16品種的平均純度為85.61%,結(jié)果見(jiàn)表4。

    對(duì)陜油16的SSR鑒定結(jié)果與田間鑒定結(jié)果進(jìn)行了比較分析,結(jié)果顯示,田間鑒定的平均純度高于SSR鑒定結(jié)果3.71%。

    表4 陜油16的田間鑒定結(jié)果

    3 討 論

    首先,本研究篩選的SSR引物在陜油16的F1代雜交種擴(kuò)增結(jié)果均具有親本的兩條帶,說(shuō)明SSR標(biāo)記有穩(wěn)定的共顯性,可以用來(lái)鑒定甘藍(lán)型油菜的雜交種純度。

    其次,本研究發(fā)現(xiàn),分子標(biāo)記鑒定結(jié)果中,不育株率較父本株率高,說(shuō)明母本因微粉導(dǎo)致的自交是雜交種種子純度降低的重要原因。因此,在制種過(guò)程中要特別注意母本的育性,可采用化學(xué)殺雄的方法盡量避免由于微粉造成的雜交種純度降低。

    此外,本研究中SSR標(biāo)記純度鑒定結(jié)果均低于田間鑒定結(jié)果,與王同華等[21]的研究結(jié)果一致,出現(xiàn)這種現(xiàn)象的可能原因是田間鑒定主要通過(guò)形態(tài)學(xué)特征進(jìn)行判斷,由于材料間親緣關(guān)系較近,很難做出準(zhǔn)確的鑒定,而SSR分子標(biāo)記技術(shù)可以準(zhǔn)確識(shí)別非雜交單株,如由于母本因微粉導(dǎo)致的自交、花粉污染、機(jī)械混雜等原因造成的混雜,因此,SSR標(biāo)記技術(shù)得到的純度鑒定結(jié)果比種植鑒定的結(jié)果更為可靠、準(zhǔn)確。

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