1000拷貝/mL)乙型肝炎患者血清,PCR反向點(diǎn)雜交法檢測(cè)HBV基因型和耐藥變異位點(diǎn)。結(jié)果598例樣本中,B基因型35例(5.85%"/>
劉淑榮 黃顯嬌 趙文靜等
[摘要] 目的 研究長(zhǎng)春地區(qū)598例乙型肝炎患者乙型肝炎病毒(hepatitis B virus)基因分型及耐藥基因突變情況。方法 收集598例HBVDNA高于檢測(cè)下限(>1000拷貝/mL)乙型肝炎患者血清,PCR反向點(diǎn)雜交法檢測(cè)HBV基因型和耐藥變異位點(diǎn)。 結(jié)果 598例樣本中, B基因型35例(5.85%), C基因型525例(87.79%),BC混合基因型32例(5.35%),D基因型2例(0.33%),未分型4例(0.67%)。79例發(fā)生HBV耐藥變異,總體變異率為13.21% ,其中B基因型3例(3.80%),C基因型73例(92.41%),BC混合基因型2例(2.53%),未分型1例(1.27%); rtM204檢出率最高75.94%(60/79), rtM204變異位點(diǎn)耐藥突變模式有10種類型。 結(jié)論 長(zhǎng)春地區(qū)HBV感染患者基因型以C基因型為主,HBV基因耐藥以rtM204位點(diǎn)檢出率最高,變異模式復(fù)雜。
[關(guān)鍵詞]乙型肝炎;HBV基因分型;基因耐藥;PCR反向點(diǎn)雜交法
[中圖分類號(hào)] R446.61 [文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼] A [文章編號(hào)] 2095-0616(2015)15-12-03
[Abstract] Objective To investigate Hepatitis B virus genotype and drug-resistant mutation patterns in 598 patients with hepatitis B in Changchun region. Methods Serum of a total 598 patients with hepatitis B whose HBVDNA was higher than the lower limit of detection (more than 1000copies/mL) were collected. To detect HBV genotype and drug-resistance site mutation by PCR reverse dot blot hybridization method. Results Of the 598 serum samples, there were 35 samples(5.85%) of genotype B, 525 samples(87.79%) of genotype C, 32 samples(5.35%) of B and C mixed genotype, 2 samples(0.33%) of genotype D and 4 samples(0.67%) of undifferentiated type. Drug-resistant mutation were detected in 79 samples, accounting for 13.21%, which included 3 samples(3.80%) of genotype B, 73 samples(92.41%) of genotype C, 2 samples(2.53%) of B and C mixed genotype and 1 case(1.27%) of undifferentiated type. The most frequently detection rate of rtM204 mutation was 75.94%(60/79). There were 10 types of patterns in rtM204 site mutation. Conclusion The main HBV genotype is genotype C in patients infected by HBV in Changchun region, and the detection rate of rtM204 site mutation is the highest among all the drug-resistance site mutations detected in patients with hepatitis B, what's more the mutation patterns are complicated.
[Key words] Hepatitis B; HBV genotype; Drug-resistance mutation; PCR combined reverse dot blot method
乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)感染是全球性的公共衛(wèi)生問(wèn)題,我國(guó)約有9300萬(wàn)HBV感染者,其中慢性乙型肝炎(chronic hepatitis B,CHB)患者約2000萬(wàn)例,每年約有30萬(wàn)人死于HBV感染所指的肝衰竭、肝硬化和肝細(xì)胞癌[1-2]。根據(jù)HBV全基因核苷酸序列的異質(zhì)性將HBV分為A-H共8種基因型,HBV基因型具有明顯的地域差異,同時(shí)不同基因型與病情的嚴(yán)重程度、預(yù)后、抗病毒治療效果等方面都可能有一定的相關(guān)性[3-5]。核苷(酸)類似物[nucleos(t)ide analogue,NAs]起效迅速、服用方便、副作用小,是目前臨床治療慢性乙型肝炎(chronic hepatitis B,CHB)的重要藥物,隨著NAs的長(zhǎng)期使用HBV發(fā)生耐藥的危險(xiǎn)性也隨之增加,HBV耐藥變異是引起NAs 抗病毒治療失敗的最重要的原因[6-10]。本研究采用PCR反向點(diǎn)雜交法檢測(cè)長(zhǎng)春地區(qū)598例HBV感染患者的HBV基因型及常見的8個(gè)耐藥位點(diǎn)變異情況,了解本地區(qū)HBV基因型分布特征和HBV耐藥變異位點(diǎn)突變模式,為乙型肝炎患者抗病毒治療提供依據(jù)。
1 材料與方法
1.1 血清標(biāo)本
采集2013年1月~ 2014年1月吉林省肝膽病醫(yī)院門診和住院乙型肝炎患者,篩選出HBVDNA高于檢測(cè)下限(>1000拷貝/mL)患者598例,其中男448例,女150例,年齡15 ~ 76歲。病例診斷均符合2010版中國(guó)《慢性乙型肝炎防治指南》診斷標(biāo)準(zhǔn)[11],排除合并甲、丙、戊和庚型肝炎病毒感染,血清標(biāo)本-80℃保存?zhèn)錂z。
1.2 HBV感染血清學(xué)標(biāo)志物和HBVDNA測(cè)定
患者血清HBV感染標(biāo)志物HBsAg、HBsAb、HBeAg、HBeAb 、HBcAb采用羅氏試劑在羅氏7100電化學(xué)發(fā)光儀測(cè)定(Roche Diagnose,中國(guó)上海);HBVDNA采用中山達(dá)安基因有限公司試劑在美國(guó)ABI熒光定量PCR擴(kuò)增儀測(cè)定。
1.3 HBV基因分型和耐藥檢測(cè)
采用深圳亞能生物技術(shù)有限公司生產(chǎn)HBV分型和耐藥突變基因檢測(cè)試劑盒,可檢測(cè)HBV B\C\D基因型以及常見核苷(酸)類似物耐藥相關(guān)的8個(gè)耐藥位點(diǎn),包括:rt180、rt184、rt204、rt202、rt207、rt181、rt236、rt250。
1.4 HBV基因型和耐藥性檢測(cè)方法
嚴(yán)格按試劑盒說(shuō)明書進(jìn)行操作,主要操作流程如下:(1)離心柱提取方法提取血清HBVDNA;(2)DNA為模板進(jìn)行HBVDNA 的PCR擴(kuò)增;(3)恒溫雜交箱47℃雜交1.5h;(4)洗膜;(5)孵育;(6)顯色:將膜條浸泡與顯色液中避光顯色15min,觀察結(jié)果。
2 結(jié)果
2.1 患者基本臨床資料
598例乙型肝炎患者中,急性肝炎25例,慢性乙型肝炎313例,肝癌58例,肝硬化202例, 均為HBsAg陽(yáng)性,其中HBe Ag陽(yáng)性358例,HBe Ag陰性240例,HBVDNA定量檢測(cè)顯示Log10 HBVDNA(5.36±2.24)copies/mL。
2.2 HBV基因分型檢測(cè)結(jié)果
598例乙型肝炎患者HBV基因分型檢測(cè)結(jié)果:B基因型5.85%(35/598),C基因型87.79%(525/598),BC混合基因型HBV感染者占5.35%(32/528),D基因型0.33%(2/598),未分型4例占0.67%(4/598)。313例慢性乙型肝炎患者B基因型6.07%(19/313), C基因型89.45%(280/313),BC混合基因型3.51%(11/313),D基因型0.32%(1/313),未分型0.63%(2/313)。
2.3 HBV耐藥變異檢測(cè)結(jié)果
在598例患者中檢出79例發(fā)生HBV耐藥變異,總體變異率為13.21%(79/598),其中B基因型3例(3.80%,3/79),C基因型73例(92.41%,73/79),BC混合基因型2例(2.53%,2/79),未分型1例(1.27%,1/79)。檢出相關(guān)耐藥突變位點(diǎn)有rtL180M、rtT184A/L、rtM204I/V、rtS202G、rtM/V207I、rtA181V/T、rtN236T、rtM250V/L。8個(gè)HBV相關(guān)耐藥突變位點(diǎn)檢出率各不相同, rtM204檢出率最高75.94%(60/79),其余位點(diǎn)檢出率分別為rtL180(38/79),rtA181(18/79), rtN236(9/79), rtT184(3/79), rtS202(1/79), rtM250(1/79), rtM/V207(1/79)。
進(jìn)一步分析對(duì)60例rtM204位點(diǎn)變異情況,rtM204位點(diǎn)有10種突變模式,2種rtM204單一位點(diǎn)變異和8種與其他耐藥位點(diǎn)聯(lián)合突變模式,結(jié)果見表1。
3 討論
在中國(guó)主要以B基因型和C基因型為主,其中北方以C基因型為主,南方以B基因型為主[12]。本研究采用PCR反向點(diǎn)雜交法檢測(cè)長(zhǎng)春地區(qū)598乙型肝炎患者HBV基因型,檢測(cè)出B基因型5.85%(35/598), C基因型87.79%(525/598),基因BC混合型5.35 %(32/528),0.33%(2/598),未分型4例占0.67%(4/598),其中313例慢性乙型肝炎患者B基因型6.07%(19/313), C基因型89.45%(280/313),BC混合基因型3.51%(11/313),D基因型0.32%(1/313),未分型0.63%(2/313),研究結(jié)果表明長(zhǎng)春地區(qū)HBV感染者以C基因型為主,B基因型和BC混合型較少,此研究結(jié)果符合我國(guó)北方HBV基因型地理分布特點(diǎn)。
目前治療CHB的核苷(酸)類藥物主要有拉米夫定(LAM),阿德福韋酯(ADV),恩替卡韋(ETV)和替比夫定(LdT),在應(yīng)用NAs長(zhǎng)期抗病毒治療過(guò)程中,耐藥是非常重要的問(wèn)題,一旦發(fā)生耐藥,不僅影響抗病毒治療效果,增加后續(xù)治療的難度,甚至可導(dǎo)致疾病進(jìn)展,增加發(fā)生肝功能失代償?shù)娘L(fēng)險(xiǎn)。在抗病毒治療過(guò)程中檢測(cè)HBV耐藥位點(diǎn)檢測(cè),確定HBD耐藥基因突變模式,合理選擇抗病毒藥物及確定治療方案。本研究主要對(duì)臨床常用的四種核苷(酸)類藥物相關(guān)的8種耐藥基因進(jìn)行檢測(cè)。在598例乙型肝炎患者中檢出79例有HBV耐藥變異,總體變異率為13.21%(79/598),79例耐藥變異中8個(gè)位點(diǎn)上的耐藥變異檢出率各不相同, rtM204檢出率最高75.94%(60/79),rtM204I/V位點(diǎn)變異主要與LAM和LDT耐藥相關(guān),rtM204檢出率高可能有二方面的原因,一是LAM和LDT 為低耐藥基因屏障藥物,另一方面可能與LAM在我國(guó)上市最早、使用時(shí)間最長(zhǎng),應(yīng)用患者較多有關(guān)[13-14]。
本研究對(duì)60例發(fā)生rtM204位點(diǎn)變異進(jìn)行了分析,結(jié)果顯示rtM204位點(diǎn)有10種突變模式,2種rtM204單一位點(diǎn)變異和8種與其它耐藥位點(diǎn)聯(lián)合突變模式。rtM204I/V耐藥通路與LAM和LdT耐藥及ETV耐藥進(jìn)化相關(guān)[15],僅需出現(xiàn)rtM204原發(fā)耐藥位點(diǎn)突變位點(diǎn)即可導(dǎo)致LAM和LDT耐藥,同時(shí)rtM204I/V位點(diǎn)變異可以促進(jìn)發(fā)生ETN耐藥,在現(xiàn)有的可供選擇的抗病毒藥物中,一旦發(fā)生rtM204I/V變異,后續(xù)抗病毒治療的難度明顯增加。Tenney等[16]的研究表明rtM204V與rtL180M聯(lián)合變異病毒株更易發(fā)生與ETV耐藥相關(guān)rt184、rt202和rt250位點(diǎn)突變, 在臨床治療中對(duì)已發(fā)生rtM204V與rtL180M聯(lián)合突變的療效不佳CHB患者加用或換用ETV抗病毒治療時(shí),必須密切注意患者的病情變化。
綜上所述,本研究通過(guò)檢測(cè)了598例HBV感染患者的HBV基因型及常見的8個(gè)耐藥位點(diǎn)變異情況,長(zhǎng)春地區(qū)HBV感染患者以C基因型為主,B型和BC混合型較少,同時(shí)觀察到乙型肝炎患者HBV基因耐藥的變異類型和變異模式日趨復(fù)雜,在長(zhǎng)期抗病毒治療過(guò)程中,進(jìn)行HBV基因耐藥檢測(cè),對(duì)于正確選擇抗病毒藥物及合理選擇治療方案具有重要的參考價(jià)值。
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(收稿日期:2015-03-12)