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      TNF-α基因-308位點(diǎn)多態(tài)性與新疆維吾爾族、哈薩克族人群中支氣管哮喘的關(guān)系

      2015-02-18 12:23:14李忠凱
      關(guān)鍵詞:哈薩克族維吾爾族等位基因

      朱 佳,李忠凱,凌 敏

      (新疆維吾爾自治區(qū)人民醫(yī)院呼吸二科,新疆烏魯木齊 830000)

      支氣管哮喘(bronchial asthma,BA)是一種由多種炎性細(xì)胞因子參與的慢性非特異性炎癥疾病。目前,公認(rèn)的觀點(diǎn)是該病的發(fā)生、發(fā)展可能與遺傳因素,環(huán)境因素及其相互作用有關(guān),且具有家族聚集傾向和種族地域差異性[1-2]。

      TNF-α基因是多功能細(xì)胞因子,其多態(tài)性與TNF-α的功能相關(guān),且可能會影響其轉(zhuǎn)錄水平[3],進(jìn)而影響疾病的發(fā)展和預(yù)后。TNF-α基因序列分析顯示,其上游調(diào)控區(qū)的-308位點(diǎn)存在堿基G-A的轉(zhuǎn)換[4]。關(guān)于TNF-α基因多態(tài)性與BA相關(guān)性的研究結(jié)論并不相同。崔麗英[5]和楊劍等[6]在新疆維吾爾族和漢族人群中研究發(fā)現(xiàn)TNF-α基因多態(tài)性與支氣管哮喘無相關(guān)性。而李瑩[7]和高金明等[8]在青島地區(qū)漢族人群及中國北方人群研究發(fā)現(xiàn)二者存在相關(guān)性,這與WINCHESTER[9]及崔天盆等[10]在愛爾蘭人群中兒童及澳大利亞兒童中的研究一致。提示TNF-α基因多態(tài)性與BA易感性在不同人群中的作用機(jī)制有可能不同,有必要進(jìn)一步研究不同人群與BA的易感性。

      新疆地區(qū)各民族居住相對集中和固定,在許多地域還保留著世代完整的遺傳隔離群,遺傳學(xué)資源十分豐富,是研究少數(shù)民族基因多態(tài)性的理想?yún)^(qū)域。目前,關(guān)于TNF-α基因-308位點(diǎn)的多態(tài)性與新疆哈薩克族、維吾爾族人群支氣管哮喘易感性的研究尚未見報道。本研究以新疆哈薩克族、維吾爾族人群為研究對象,分析支氣管哮喘組與對照組TNF-α基因-308位點(diǎn)的基因型分布特征,以探討TNF-α基因多態(tài)性與新疆維吾爾族、哈薩克族人群BA易感性的關(guān)系。

      1 對象與方法

      1.1 研究對象 在新疆維吾爾自治區(qū)人民醫(yī)院呼吸科門診或住院治療的新疆維吾爾族及哈薩克族BA患者中各收集60例,均符合《支氣管哮喘的診斷標(biāo)準(zhǔn)診治指南》標(biāo)準(zhǔn)[11],其中維吾爾族BA組:男性32例,女性28例,平均年齡(54.3±15.1)歲;哈薩克族BA組:男性29例,女性31例,平均年齡(54.5±12.2)歲;同時選取本院健康體檢者維吾爾族60例和哈薩克族60例為對照組,4組之間年齡、性別比較均無統(tǒng)計學(xué)差異(P>0.05),具有可比性;排除標(biāo)準(zhǔn):有嚴(yán)重的心、腦、肝、腎等疾病;高血壓、糖尿病、免疫系統(tǒng)疾病等與HLA相關(guān)疾病及有家族史者;近1個月內(nèi)使用糖皮質(zhì)激素及免疫抑制劑者;哮喘持續(xù)狀態(tài)危重患者或資料收集不全者。

      4組對象均為無民族間遺傳干擾、無血緣關(guān)系的連續(xù)兩代及以上長期居住于新疆的維吾爾族、哈薩克族人群,所有受試者均簽署書面的志愿書,該研究由本單位的倫理委員會批準(zhǔn)。

      1.2 研究方法 ①標(biāo)本采集:在清晨空腹時采集研究對象的靜脈血2mL,EDTA抗凝,上下顛倒混勻,-20℃低溫保存。②基因組DNA提?。豪萌蚪MDNA快速提取試劑盒(離心柱型),按照廠家提供的說明書提取全血基因組DNA。提取的DNA置于-20℃保存?zhèn)溆?。③引物合成:參照SAKAO等[3]設(shè) 計 的 引 物,上 游 引 物:5′-AGGCAATAG-GTTTTGAGGGCCAT-3′,下游引物:5′-GAGCGTCTGCTGGCTGGGTG-3′。④PCR擴(kuò)增:PCR反應(yīng)體系(35μL):10mmol/L dNTP混合物2μL,10×Tap Buffer 3.5μL,2UTapDNA聚合酶,10μmol/L上下游引物各1μL,超純水補(bǔ)足至35μL。所用試劑及引物均購置于北京鼎國生物工程公司。PCR反應(yīng)條件:95℃預(yù)變性5min;95℃變性30s,63℃退火40s以及72℃延伸60s共35個循環(huán);然后72℃延伸10min,最后4℃保存。10g/L的瓊脂糖凝膠電泳檢測PCR產(chǎn)物擴(kuò)增出目的條帶的質(zhì)量。⑤測序:PCR產(chǎn)物經(jīng)純化后由北京鼎國生物工程公司進(jìn)行反向測序。測定結(jié)果出現(xiàn)雙峰,即為該位點(diǎn)的雜合子(AG型)型,出現(xiàn)單峰則為純合子型(AA型或GG型)。

      1.3 數(shù)據(jù)處理 采用SPSS 17.0統(tǒng)計軟件進(jìn)行分析,各組間基因型和等位基因頻率的比較以及Hardy-Weinberg遺傳平衡定律的吻合度檢驗采用χ2檢驗;計量資料以均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差表示,均數(shù)比較采用兩獨(dú)立樣本的t檢驗;多因素調(diào)整采用Logistic回歸分析,計算比值比(odds ratios,OR)和95%可信區(qū)間(confidence intervals,CI)用來檢測 TNF-α基因-308位點(diǎn)多態(tài)性和BA的相關(guān)性。所有統(tǒng)計均為雙側(cè),以P<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。

      2 結(jié) 果

      2.1 Hardy-Weinberg平衡檢驗結(jié)果 根據(jù)測序結(jié)果,統(tǒng)計實驗個體中的AA型、AG型和GG型,經(jīng)卡方檢驗后發(fā)現(xiàn)研究對象處于Hardy-Weinberg平衡(P>0.05),說明本研究采用的研究對象具有群體代表性,可以反映整體維吾爾族、哈薩克族人群基因的分布情況。

      2.2 測序結(jié)果及基因型的判定 測序結(jié)果顯示,TNF-α基因-308位點(diǎn)存在GG、GA和AA 3種基因型,如圖1所示。

      2.3 TNF-α基因-308位點(diǎn)的基因型和等位基因的分布 根據(jù)測序結(jié)果,統(tǒng)計TNF-α基因-308位點(diǎn)的基因型和等位基因頻率(表1)。

      2.4 TNF-α基因-308位點(diǎn)的基因型及等位基因與BA易感性的關(guān)系 以研究對象是否患BA為因變量經(jīng)Logistic回歸分析(協(xié)變量包括年齡、性別、GG、GA、AA基因型),經(jīng)調(diào)整年齡、性別后,維吾爾族及哈薩克族BA組A等位基因頻率均高于對照組,可能與BA的發(fā)病風(fēng)險有關(guān)(OR=0.182,95%CI=0.083~0.398;OR=0.399,95%CI=0.195~0.816),差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05)。提示A等位基因可能是BA的危險因素,可從基因水平上解釋個體間BA易感性存在差異(表2)。

      圖1 新疆維吾爾族、哈薩克族人群中TNF-α基因-308位點(diǎn)的測序結(jié)果Fig.1 TNF alpha gene-308polymorphism of the sequencing results among Xinjiang Uighur and Kazakh

      表1 TNF-α基因-308多態(tài)位點(diǎn)的基因型和等位基因的分布Tab.1 TNF alpha gene-308polymorphic loci of the distribution of genotype and allele [n(%)]

      表2 TNF-α基因-308位點(diǎn)的基因型和等位基因與BA易感性的關(guān)系Tab.2 Relationship of genotypes and alleles of TNF alpha gene-308loci with BA susceptibility

      2.5 不同人群BA組和對照組TNF-α-308位點(diǎn)A等位基因頻率的分布比較 如表3所示,TNF-α-308位點(diǎn) A 等位基因頻率在土耳其人群[17]、蒙古族[5]、漢族[5]、新疆維吾爾族[6]人群BA組和對照組比較均無顯著性差異(P>0.05),TNF-α-308位點(diǎn) A等位基因頻率在韓國人群[2]、本研究維吾爾族及哈薩克族中A等位基因頻率在兩組間有統(tǒng)計學(xué)差異(P<0.05),與BA的發(fā)生存在相關(guān)性。

      表3 不同人群TNF-α基因-308位點(diǎn)的A等位基因與BA易感性的關(guān)系Tab.3 Relationship of A alleles of different groups of TNF alpha gene-308loci with BA susceptibility (%)

      3 討 論

      BA是由多種細(xì)胞特別是肥大細(xì)胞、嗜酸性粒細(xì)胞和T淋巴細(xì)胞等參與的慢性氣道炎癥。近幾年,BA的發(fā)病率逐年升高,尤其是北方地區(qū),風(fēng)沙、花粉、冷空氣等對易感人群的刺激,使BA的發(fā)病率有持續(xù)增高的趨勢。因此,國內(nèi)外對其發(fā)病機(jī)制及其防治的研究成為目前研究的熱點(diǎn)[12]。目前,關(guān)于TNF-α基因-308多態(tài)性與BA相關(guān)性的研究中,不同種族的分析結(jié)果并不一致,有必要繼續(xù)對其他種族TNF-α基因-308多態(tài)性與BA的關(guān)系進(jìn)行研究,以確定其在BA發(fā)生和發(fā)展中的作用。

      新疆維吾爾族、哈薩克族人群至今仍保留有相對完整的隔離遺傳體系,是進(jìn)行復(fù)雜疾病分子流行病學(xué)研究的理想人群。本研究結(jié)果顯示在維吾爾族、哈薩克族人群BA組和對照組中,TNF-α基因-308位點(diǎn)均以GG基因型多見;BA組GA基因型和A等位基因的頻率均高于對照組,且兩組間差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05)。A等位基因可能是BA的危險因素,攜帶GA和AA基因型患者發(fā)病風(fēng)險較高,提示TNF-α基因-308多態(tài)性與新疆維吾爾族、哈薩克族BA的易感性有關(guān)。

      本研究與崔天盆等[10]在澳大利亞兒童中的研究與姜曉萍[13]及翟芝芳等[14]在黑龍江人群和山東地區(qū)漢族人群中研究一致:TNF-α基因-308多態(tài)性與BA的發(fā)病相關(guān)。而與 LOUIS[15]、SHIN[16]及 AYTEKIN等[17]分別對白種人、韓國人群、土耳其人群的研究結(jié)果相反,未發(fā)現(xiàn)與之有關(guān)。這說明TNF-α-308位點(diǎn)在不同人群中的作用機(jī)制或?qū)A的影響不同,可能與人種、民族或地域等差異有關(guān)。

      本研究結(jié)果提示,可通過檢測TNF-α-基因啟動子區(qū)-308位點(diǎn)的基因型來評估維吾爾族、哈薩克族人群患BA的風(fēng)險程度。因此,TNF-α-308A等位基因在臨床上可作為遺傳性標(biāo)記進(jìn)行檢測,在一定程度上發(fā)現(xiàn)和預(yù)防BA的高危人群。在今后的研究中,應(yīng)繼續(xù)擴(kuò)大樣本量,研究不同人群的易感基因,為最終揭示BA發(fā)生發(fā)展的分子機(jī)制,控制BA的發(fā)生提供更多的科學(xué)依據(jù);也為研究維吾爾族、哈薩克族人群中與TNF-α基因多態(tài)性相關(guān)的其他疾病提供了基礎(chǔ)。

      [1]賈南,管立學(xué),李海波,等.TNF-α基因-308G/A多態(tài)性與兒童哮喘的相關(guān)性研究[J].濰坊醫(yī)學(xué)院學(xué)報,2012,34(6):455-457.

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      [5]崔麗英,王宏英.內(nèi)蒙古地區(qū)蒙漢族人群TNF-α基因多態(tài)性與支氣管哮喘的相關(guān)性[J].內(nèi)蒙古醫(yī)學(xué)學(xué)報,2010,32(4):354-357.

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