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      埃博霉素產(chǎn)生菌的純化及其意義

      2014-11-20 06:45:04任閃閃劉延霆楊聯(lián)合趙博宇牛春玲
      中國(guó)校外教育(下旬) 2014年10期
      關(guān)鍵詞:菌膜濾紙土樣

      任閃閃+劉延霆+楊聯(lián)合+趙博宇+牛春玲

      隨著比紫杉醇臨床效果更佳的埃博霉素被發(fā)現(xiàn),埃博霉素的產(chǎn)生菌——纖維堆囊菌日益引起重視,本文通過(guò)對(duì)其純化方法進(jìn)行探索,簡(jiǎn)化純化步驟,縮短純化周期,為埃博霉素的進(jìn)一步研究奠定基礎(chǔ)。

      埃博霉素 纖維堆囊菌 分離純化

      目前最為知名的抗腫瘤藥物非紫杉醇莫屬。但由于紫杉醇提取于紅豆杉,而紅豆杉又?jǐn)?shù)量有限,后續(xù)資源不足,因此尋找與紫杉醇的代替者就顯得尤為重要。埃博霉素(Epothilones)與紫杉醇的作用機(jī)制相同,埃博霉素A、B和D對(duì)癌細(xì)胞的生物活性與紫杉醇相當(dāng),甚至更強(qiáng),尤其是埃博霉素B,其活性比紫杉醇強(qiáng)10-100倍.但其水溶性更高,分子量更小,結(jié)構(gòu)更簡(jiǎn)單,對(duì)紫杉醇抗性的腫瘤細(xì)胞也有抗性。埃博霉素來(lái)源于粘細(xì)菌的纖維堆囊菌屬。但由于粘細(xì)菌不能以單細(xì)胞的形態(tài)進(jìn)行生長(zhǎng)且生長(zhǎng)緩慢,因此分離純化困難,純化周期長(zhǎng),因此進(jìn)一步探索粘細(xì)菌尤其是纖維堆囊菌的快速分離純化顯得尤為重要。

      1材料與方法

      1.1土樣

      采集河南中醫(yī)學(xué)院的土樣及腐殖質(zhì)。

      1.2主要試劑和儀器設(shè)備

      常規(guī)試劑自上海生工;提取DNA相關(guān)試劑,PCR相關(guān)試劑均購(gòu)自于北京天根生物公司。主要儀器設(shè)備:體式顯微鏡stekeo discovery V8;倒置顯微鏡DP73 TH4-200等。

      1.3分離、純化所需的培養(yǎng)基

      CNST培養(yǎng)基:KNO3 0.5 g/L,Na2HPO4 0.25 g/L,MgSO4·7H2O 1 g/L,F(xiàn)eCl3 0.01 g/L,微量元素液1mL,pH 7.2。

      1.4方法

      1.4.1土樣采集的標(biāo)準(zhǔn)及初步處理

      將采集的有機(jī)質(zhì)含量豐富(富含其它微生物)的土壤樣品,自然風(fēng)干后研成粉末狀,平鋪在滅過(guò)菌的平皿中,用配成適當(dāng)濃度的制霉菌素液(1片/50mL無(wú)菌水)過(guò)夜處理,干燥后二次處理,將二次處理后干燥的土樣裝入滅過(guò)菌的離心管中待用。

      1.4.2纖維堆囊菌分離富集純化及驗(yàn)純

      纖維堆囊菌的分離富集一般用CNST培養(yǎng)基。配制CNST滅菌后待其冷卻至不燙手時(shí),加入30~40U經(jīng)過(guò)過(guò)濾除菌的放線菌酮液,≤40U的青霉素,5~20U的慶大霉素,≤40U的卡那霉素,≤100U的氨芐青霉素,凝固后,貼上1.5~2cm見(jiàn)方的滅菌濾紙片,每皿4張,倒置平板,在超凈臺(tái)中放置1-2天后除去培養(yǎng)基水汽。

      將土樣研碎后,適量勻撒在濾紙片上,每個(gè)CNST平板接一個(gè)土樣。先在30℃的培養(yǎng)箱中培養(yǎng)一周,之后將接有土樣的平板置于室溫下繼續(xù)培養(yǎng),在解剖鏡下堅(jiān)持每天觀察,如果濾紙片變橘紅或者橙紅色或者有菌膜出現(xiàn)則用接種鏟將變色部分(此為纖維堆囊菌的子實(shí)體部分)或菌膜轉(zhuǎn)接至新的平板上。對(duì)于纖維堆囊菌的純化,主要是在顯微鏡下轉(zhuǎn)接其子實(shí)體或菌膜,具體方法為:先將在顯微鏡下觀察到的較純的菌膜或子實(shí)體的位置在平皿底部標(biāo)出,之后在超凈臺(tái)中用注射器轉(zhuǎn)接至新的加有各種抗生素的CNST平板上,多次轉(zhuǎn)接后(此時(shí)霉菌的量大大減少),對(duì)菌體(主要是子實(shí)體)進(jìn)行洗滌。

      對(duì)于染菌嚴(yán)重的子實(shí)體,用過(guò)濾好的放線菌酮配成溶液,具體濃度是0.05mg/mL,分裝至各個(gè)1.5mL的離心管中,然后在離心管中接入染菌子實(shí)體,于56~57℃水浴3~4h(個(gè)別染菌嚴(yán)重的子實(shí)體可以提高水浴溫度,但不能超過(guò)57℃),之后將子實(shí)體轉(zhuǎn)接至新的平板,待菌重新長(zhǎng)出。如果仍有染菌,可以多次重復(fù)此步驟。直至可以長(zhǎng)出完整透明的菌膜。

      1.4.3纖維堆囊菌DNA的提取

      采用CTAB法提取菌株DNA,并適當(dāng)稀釋作為模板,進(jìn)行PCR擴(kuò)增菌株16S rDNA序列。所用引物為細(xì)菌常用引物:27f和1492r。PCR 擴(kuò)增程序?yàn)椋?4℃ 5min;94℃ 1min;58℃ 1min;72℃ 3min;30 cycles;72℃ 10min;4℃保溫。

      2實(shí)驗(yàn)結(jié)果

      2.1纖維堆囊菌的分離純化——形態(tài)觀察

      可以觀察到子實(shí)體在濾紙上大量堆積,培養(yǎng)基中3~5成團(tuán),20~200μm,呈黃色、橙紅色、棕黃色、鐵銹色、黑色;營(yíng)養(yǎng)細(xì)胞呈圓柱狀,末端鈍圓,長(zhǎng)2.5~10μm;粘孢子在形態(tài)上與營(yíng)養(yǎng)細(xì)胞區(qū)別小,長(zhǎng)1~3μm;其擴(kuò)展菌膜輻射狀或扇狀,邊緣通常有樹(shù)枝狀或其它不規(guī)則突起。如圖1,符合纖維堆囊菌形態(tài)學(xué)上的特征。

      A B

      C

      圖1 不同生長(zhǎng)周期的纖維堆囊菌(5×)

      A在濾紙上剛剛完成富集;B擴(kuò)展到濾紙邊緣的營(yíng)養(yǎng)細(xì)胞;C營(yíng)養(yǎng)細(xì)胞在瓊脂上完成富集,形成大量子實(shí)體

      2.2纖維堆囊菌的分離純化-分子生物學(xué)鑒定

      純化的纖維堆囊菌16S rDNA序列與NCBI上的基因序列相比較,相似性都在98%以上。

      3討論

      結(jié)合纖維堆囊菌特殊的生長(zhǎng)特點(diǎn):(1)菌體細(xì)胞可聚集形成肉眼可見(jiàn)的子實(shí)體結(jié)構(gòu);(2)在貧瘠的培養(yǎng)基上易形成擴(kuò)展的菌落;(3)粘細(xì)菌的子實(shí)體或粘孢子具有較高的耐熱性。本文創(chuàng)新性地使用了抗生素洗滌法與高溫處理法相結(jié)合,大大提高了純化效率。制霉菌素抑制霉菌的效果很好,但其水溶性較差,而將二甲亞砜作為溶劑加入培養(yǎng)基中又嚴(yán)重影響纖維堆囊菌的生長(zhǎng)且有刺激性氣味。故有必要找出能夠替代制霉菌素的抗生素,最終發(fā)現(xiàn)用水溶性較好且相對(duì)濃度較高的放線菌酮對(duì)子實(shí)體進(jìn)行洗滌,可以達(dá)到同樣的抑制霉菌的效果。結(jié)合纖維堆囊菌的子實(shí)體耐高溫這一相對(duì)優(yōu)勢(shì)生理特點(diǎn)對(duì)其進(jìn)行高溫水浴,在抑制甚至殺死其它雜菌的同時(shí)又不影響纖維堆囊菌的生長(zhǎng)。

      通過(guò)此方法,使纖維堆囊菌的純化時(shí)間由之前的半年甚至一年縮短至一到兩個(gè)月。相對(duì)于微生物的傳統(tǒng)純化方法和粘細(xì)菌的其他純化方法,本文的試驗(yàn)方法簡(jiǎn)單高效,為纖維堆囊菌資源提供更加豐富和多樣的研究材料,同時(shí)也為大量獲得埃博霉素(Epothilones)及其結(jié)構(gòu)類似物提供更多的原始產(chǎn)生菌。

      參考文獻(xiàn):

      [1]Gerth K,B.N., Hoffe C,et al.,EpothiJones A and B:Antifungal and Cytotoxic Compounds from Sorangium cellulosum (Myxobacteria)[J].J Antibiot,1996,(49):560-563.endprint

      隨著比紫杉醇臨床效果更佳的埃博霉素被發(fā)現(xiàn),埃博霉素的產(chǎn)生菌——纖維堆囊菌日益引起重視,本文通過(guò)對(duì)其純化方法進(jìn)行探索,簡(jiǎn)化純化步驟,縮短純化周期,為埃博霉素的進(jìn)一步研究奠定基礎(chǔ)。

      埃博霉素 纖維堆囊菌 分離純化

      目前最為知名的抗腫瘤藥物非紫杉醇莫屬。但由于紫杉醇提取于紅豆杉,而紅豆杉又?jǐn)?shù)量有限,后續(xù)資源不足,因此尋找與紫杉醇的代替者就顯得尤為重要。埃博霉素(Epothilones)與紫杉醇的作用機(jī)制相同,埃博霉素A、B和D對(duì)癌細(xì)胞的生物活性與紫杉醇相當(dāng),甚至更強(qiáng),尤其是埃博霉素B,其活性比紫杉醇強(qiáng)10-100倍.但其水溶性更高,分子量更小,結(jié)構(gòu)更簡(jiǎn)單,對(duì)紫杉醇抗性的腫瘤細(xì)胞也有抗性。埃博霉素來(lái)源于粘細(xì)菌的纖維堆囊菌屬。但由于粘細(xì)菌不能以單細(xì)胞的形態(tài)進(jìn)行生長(zhǎng)且生長(zhǎng)緩慢,因此分離純化困難,純化周期長(zhǎng),因此進(jìn)一步探索粘細(xì)菌尤其是纖維堆囊菌的快速分離純化顯得尤為重要。

      1材料與方法

      1.1土樣

      采集河南中醫(yī)學(xué)院的土樣及腐殖質(zhì)。

      1.2主要試劑和儀器設(shè)備

      常規(guī)試劑自上海生工;提取DNA相關(guān)試劑,PCR相關(guān)試劑均購(gòu)自于北京天根生物公司。主要儀器設(shè)備:體式顯微鏡stekeo discovery V8;倒置顯微鏡DP73 TH4-200等。

      1.3分離、純化所需的培養(yǎng)基

      CNST培養(yǎng)基:KNO3 0.5 g/L,Na2HPO4 0.25 g/L,MgSO4·7H2O 1 g/L,F(xiàn)eCl3 0.01 g/L,微量元素液1mL,pH 7.2。

      1.4方法

      1.4.1土樣采集的標(biāo)準(zhǔn)及初步處理

      將采集的有機(jī)質(zhì)含量豐富(富含其它微生物)的土壤樣品,自然風(fēng)干后研成粉末狀,平鋪在滅過(guò)菌的平皿中,用配成適當(dāng)濃度的制霉菌素液(1片/50mL無(wú)菌水)過(guò)夜處理,干燥后二次處理,將二次處理后干燥的土樣裝入滅過(guò)菌的離心管中待用。

      1.4.2纖維堆囊菌分離富集純化及驗(yàn)純

      纖維堆囊菌的分離富集一般用CNST培養(yǎng)基。配制CNST滅菌后待其冷卻至不燙手時(shí),加入30~40U經(jīng)過(guò)過(guò)濾除菌的放線菌酮液,≤40U的青霉素,5~20U的慶大霉素,≤40U的卡那霉素,≤100U的氨芐青霉素,凝固后,貼上1.5~2cm見(jiàn)方的滅菌濾紙片,每皿4張,倒置平板,在超凈臺(tái)中放置1-2天后除去培養(yǎng)基水汽。

      將土樣研碎后,適量勻撒在濾紙片上,每個(gè)CNST平板接一個(gè)土樣。先在30℃的培養(yǎng)箱中培養(yǎng)一周,之后將接有土樣的平板置于室溫下繼續(xù)培養(yǎng),在解剖鏡下堅(jiān)持每天觀察,如果濾紙片變橘紅或者橙紅色或者有菌膜出現(xiàn)則用接種鏟將變色部分(此為纖維堆囊菌的子實(shí)體部分)或菌膜轉(zhuǎn)接至新的平板上。對(duì)于纖維堆囊菌的純化,主要是在顯微鏡下轉(zhuǎn)接其子實(shí)體或菌膜,具體方法為:先將在顯微鏡下觀察到的較純的菌膜或子實(shí)體的位置在平皿底部標(biāo)出,之后在超凈臺(tái)中用注射器轉(zhuǎn)接至新的加有各種抗生素的CNST平板上,多次轉(zhuǎn)接后(此時(shí)霉菌的量大大減少),對(duì)菌體(主要是子實(shí)體)進(jìn)行洗滌。

      對(duì)于染菌嚴(yán)重的子實(shí)體,用過(guò)濾好的放線菌酮配成溶液,具體濃度是0.05mg/mL,分裝至各個(gè)1.5mL的離心管中,然后在離心管中接入染菌子實(shí)體,于56~57℃水浴3~4h(個(gè)別染菌嚴(yán)重的子實(shí)體可以提高水浴溫度,但不能超過(guò)57℃),之后將子實(shí)體轉(zhuǎn)接至新的平板,待菌重新長(zhǎng)出。如果仍有染菌,可以多次重復(fù)此步驟。直至可以長(zhǎng)出完整透明的菌膜。

      1.4.3纖維堆囊菌DNA的提取

      采用CTAB法提取菌株DNA,并適當(dāng)稀釋作為模板,進(jìn)行PCR擴(kuò)增菌株16S rDNA序列。所用引物為細(xì)菌常用引物:27f和1492r。PCR 擴(kuò)增程序?yàn)椋?4℃ 5min;94℃ 1min;58℃ 1min;72℃ 3min;30 cycles;72℃ 10min;4℃保溫。

      2實(shí)驗(yàn)結(jié)果

      2.1纖維堆囊菌的分離純化——形態(tài)觀察

      可以觀察到子實(shí)體在濾紙上大量堆積,培養(yǎng)基中3~5成團(tuán),20~200μm,呈黃色、橙紅色、棕黃色、鐵銹色、黑色;營(yíng)養(yǎng)細(xì)胞呈圓柱狀,末端鈍圓,長(zhǎng)2.5~10μm;粘孢子在形態(tài)上與營(yíng)養(yǎng)細(xì)胞區(qū)別小,長(zhǎng)1~3μm;其擴(kuò)展菌膜輻射狀或扇狀,邊緣通常有樹(shù)枝狀或其它不規(guī)則突起。如圖1,符合纖維堆囊菌形態(tài)學(xué)上的特征。

      A B

      C

      圖1 不同生長(zhǎng)周期的纖維堆囊菌(5×)

      A在濾紙上剛剛完成富集;B擴(kuò)展到濾紙邊緣的營(yíng)養(yǎng)細(xì)胞;C營(yíng)養(yǎng)細(xì)胞在瓊脂上完成富集,形成大量子實(shí)體

      2.2纖維堆囊菌的分離純化-分子生物學(xué)鑒定

      純化的纖維堆囊菌16S rDNA序列與NCBI上的基因序列相比較,相似性都在98%以上。

      3討論

      結(jié)合纖維堆囊菌特殊的生長(zhǎng)特點(diǎn):(1)菌體細(xì)胞可聚集形成肉眼可見(jiàn)的子實(shí)體結(jié)構(gòu);(2)在貧瘠的培養(yǎng)基上易形成擴(kuò)展的菌落;(3)粘細(xì)菌的子實(shí)體或粘孢子具有較高的耐熱性。本文創(chuàng)新性地使用了抗生素洗滌法與高溫處理法相結(jié)合,大大提高了純化效率。制霉菌素抑制霉菌的效果很好,但其水溶性較差,而將二甲亞砜作為溶劑加入培養(yǎng)基中又嚴(yán)重影響纖維堆囊菌的生長(zhǎng)且有刺激性氣味。故有必要找出能夠替代制霉菌素的抗生素,最終發(fā)現(xiàn)用水溶性較好且相對(duì)濃度較高的放線菌酮對(duì)子實(shí)體進(jìn)行洗滌,可以達(dá)到同樣的抑制霉菌的效果。結(jié)合纖維堆囊菌的子實(shí)體耐高溫這一相對(duì)優(yōu)勢(shì)生理特點(diǎn)對(duì)其進(jìn)行高溫水浴,在抑制甚至殺死其它雜菌的同時(shí)又不影響纖維堆囊菌的生長(zhǎng)。

      通過(guò)此方法,使纖維堆囊菌的純化時(shí)間由之前的半年甚至一年縮短至一到兩個(gè)月。相對(duì)于微生物的傳統(tǒng)純化方法和粘細(xì)菌的其他純化方法,本文的試驗(yàn)方法簡(jiǎn)單高效,為纖維堆囊菌資源提供更加豐富和多樣的研究材料,同時(shí)也為大量獲得埃博霉素(Epothilones)及其結(jié)構(gòu)類似物提供更多的原始產(chǎn)生菌。

      參考文獻(xiàn):

      [1]Gerth K,B.N., Hoffe C,et al.,EpothiJones A and B:Antifungal and Cytotoxic Compounds from Sorangium cellulosum (Myxobacteria)[J].J Antibiot,1996,(49):560-563.endprint

      隨著比紫杉醇臨床效果更佳的埃博霉素被發(fā)現(xiàn),埃博霉素的產(chǎn)生菌——纖維堆囊菌日益引起重視,本文通過(guò)對(duì)其純化方法進(jìn)行探索,簡(jiǎn)化純化步驟,縮短純化周期,為埃博霉素的進(jìn)一步研究奠定基礎(chǔ)。

      埃博霉素 纖維堆囊菌 分離純化

      目前最為知名的抗腫瘤藥物非紫杉醇莫屬。但由于紫杉醇提取于紅豆杉,而紅豆杉又?jǐn)?shù)量有限,后續(xù)資源不足,因此尋找與紫杉醇的代替者就顯得尤為重要。埃博霉素(Epothilones)與紫杉醇的作用機(jī)制相同,埃博霉素A、B和D對(duì)癌細(xì)胞的生物活性與紫杉醇相當(dāng),甚至更強(qiáng),尤其是埃博霉素B,其活性比紫杉醇強(qiáng)10-100倍.但其水溶性更高,分子量更小,結(jié)構(gòu)更簡(jiǎn)單,對(duì)紫杉醇抗性的腫瘤細(xì)胞也有抗性。埃博霉素來(lái)源于粘細(xì)菌的纖維堆囊菌屬。但由于粘細(xì)菌不能以單細(xì)胞的形態(tài)進(jìn)行生長(zhǎng)且生長(zhǎng)緩慢,因此分離純化困難,純化周期長(zhǎng),因此進(jìn)一步探索粘細(xì)菌尤其是纖維堆囊菌的快速分離純化顯得尤為重要。

      1材料與方法

      1.1土樣

      采集河南中醫(yī)學(xué)院的土樣及腐殖質(zhì)。

      1.2主要試劑和儀器設(shè)備

      常規(guī)試劑自上海生工;提取DNA相關(guān)試劑,PCR相關(guān)試劑均購(gòu)自于北京天根生物公司。主要儀器設(shè)備:體式顯微鏡stekeo discovery V8;倒置顯微鏡DP73 TH4-200等。

      1.3分離、純化所需的培養(yǎng)基

      CNST培養(yǎng)基:KNO3 0.5 g/L,Na2HPO4 0.25 g/L,MgSO4·7H2O 1 g/L,F(xiàn)eCl3 0.01 g/L,微量元素液1mL,pH 7.2。

      1.4方法

      1.4.1土樣采集的標(biāo)準(zhǔn)及初步處理

      將采集的有機(jī)質(zhì)含量豐富(富含其它微生物)的土壤樣品,自然風(fēng)干后研成粉末狀,平鋪在滅過(guò)菌的平皿中,用配成適當(dāng)濃度的制霉菌素液(1片/50mL無(wú)菌水)過(guò)夜處理,干燥后二次處理,將二次處理后干燥的土樣裝入滅過(guò)菌的離心管中待用。

      1.4.2纖維堆囊菌分離富集純化及驗(yàn)純

      纖維堆囊菌的分離富集一般用CNST培養(yǎng)基。配制CNST滅菌后待其冷卻至不燙手時(shí),加入30~40U經(jīng)過(guò)過(guò)濾除菌的放線菌酮液,≤40U的青霉素,5~20U的慶大霉素,≤40U的卡那霉素,≤100U的氨芐青霉素,凝固后,貼上1.5~2cm見(jiàn)方的滅菌濾紙片,每皿4張,倒置平板,在超凈臺(tái)中放置1-2天后除去培養(yǎng)基水汽。

      將土樣研碎后,適量勻撒在濾紙片上,每個(gè)CNST平板接一個(gè)土樣。先在30℃的培養(yǎng)箱中培養(yǎng)一周,之后將接有土樣的平板置于室溫下繼續(xù)培養(yǎng),在解剖鏡下堅(jiān)持每天觀察,如果濾紙片變橘紅或者橙紅色或者有菌膜出現(xiàn)則用接種鏟將變色部分(此為纖維堆囊菌的子實(shí)體部分)或菌膜轉(zhuǎn)接至新的平板上。對(duì)于纖維堆囊菌的純化,主要是在顯微鏡下轉(zhuǎn)接其子實(shí)體或菌膜,具體方法為:先將在顯微鏡下觀察到的較純的菌膜或子實(shí)體的位置在平皿底部標(biāo)出,之后在超凈臺(tái)中用注射器轉(zhuǎn)接至新的加有各種抗生素的CNST平板上,多次轉(zhuǎn)接后(此時(shí)霉菌的量大大減少),對(duì)菌體(主要是子實(shí)體)進(jìn)行洗滌。

      對(duì)于染菌嚴(yán)重的子實(shí)體,用過(guò)濾好的放線菌酮配成溶液,具體濃度是0.05mg/mL,分裝至各個(gè)1.5mL的離心管中,然后在離心管中接入染菌子實(shí)體,于56~57℃水浴3~4h(個(gè)別染菌嚴(yán)重的子實(shí)體可以提高水浴溫度,但不能超過(guò)57℃),之后將子實(shí)體轉(zhuǎn)接至新的平板,待菌重新長(zhǎng)出。如果仍有染菌,可以多次重復(fù)此步驟。直至可以長(zhǎng)出完整透明的菌膜。

      1.4.3纖維堆囊菌DNA的提取

      采用CTAB法提取菌株DNA,并適當(dāng)稀釋作為模板,進(jìn)行PCR擴(kuò)增菌株16S rDNA序列。所用引物為細(xì)菌常用引物:27f和1492r。PCR 擴(kuò)增程序?yàn)椋?4℃ 5min;94℃ 1min;58℃ 1min;72℃ 3min;30 cycles;72℃ 10min;4℃保溫。

      2實(shí)驗(yàn)結(jié)果

      2.1纖維堆囊菌的分離純化——形態(tài)觀察

      可以觀察到子實(shí)體在濾紙上大量堆積,培養(yǎng)基中3~5成團(tuán),20~200μm,呈黃色、橙紅色、棕黃色、鐵銹色、黑色;營(yíng)養(yǎng)細(xì)胞呈圓柱狀,末端鈍圓,長(zhǎng)2.5~10μm;粘孢子在形態(tài)上與營(yíng)養(yǎng)細(xì)胞區(qū)別小,長(zhǎng)1~3μm;其擴(kuò)展菌膜輻射狀或扇狀,邊緣通常有樹(shù)枝狀或其它不規(guī)則突起。如圖1,符合纖維堆囊菌形態(tài)學(xué)上的特征。

      A B

      C

      圖1 不同生長(zhǎng)周期的纖維堆囊菌(5×)

      A在濾紙上剛剛完成富集;B擴(kuò)展到濾紙邊緣的營(yíng)養(yǎng)細(xì)胞;C營(yíng)養(yǎng)細(xì)胞在瓊脂上完成富集,形成大量子實(shí)體

      2.2纖維堆囊菌的分離純化-分子生物學(xué)鑒定

      純化的纖維堆囊菌16S rDNA序列與NCBI上的基因序列相比較,相似性都在98%以上。

      3討論

      結(jié)合纖維堆囊菌特殊的生長(zhǎng)特點(diǎn):(1)菌體細(xì)胞可聚集形成肉眼可見(jiàn)的子實(shí)體結(jié)構(gòu);(2)在貧瘠的培養(yǎng)基上易形成擴(kuò)展的菌落;(3)粘細(xì)菌的子實(shí)體或粘孢子具有較高的耐熱性。本文創(chuàng)新性地使用了抗生素洗滌法與高溫處理法相結(jié)合,大大提高了純化效率。制霉菌素抑制霉菌的效果很好,但其水溶性較差,而將二甲亞砜作為溶劑加入培養(yǎng)基中又嚴(yán)重影響纖維堆囊菌的生長(zhǎng)且有刺激性氣味。故有必要找出能夠替代制霉菌素的抗生素,最終發(fā)現(xiàn)用水溶性較好且相對(duì)濃度較高的放線菌酮對(duì)子實(shí)體進(jìn)行洗滌,可以達(dá)到同樣的抑制霉菌的效果。結(jié)合纖維堆囊菌的子實(shí)體耐高溫這一相對(duì)優(yōu)勢(shì)生理特點(diǎn)對(duì)其進(jìn)行高溫水浴,在抑制甚至殺死其它雜菌的同時(shí)又不影響纖維堆囊菌的生長(zhǎng)。

      通過(guò)此方法,使纖維堆囊菌的純化時(shí)間由之前的半年甚至一年縮短至一到兩個(gè)月。相對(duì)于微生物的傳統(tǒng)純化方法和粘細(xì)菌的其他純化方法,本文的試驗(yàn)方法簡(jiǎn)單高效,為纖維堆囊菌資源提供更加豐富和多樣的研究材料,同時(shí)也為大量獲得埃博霉素(Epothilones)及其結(jié)構(gòu)類似物提供更多的原始產(chǎn)生菌。

      參考文獻(xiàn):

      [1]Gerth K,B.N., Hoffe C,et al.,EpothiJones A and B:Antifungal and Cytotoxic Compounds from Sorangium cellulosum (Myxobacteria)[J].J Antibiot,1996,(49):560-563.endprint

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