張革化, 常利紅, 葉 進(jìn), 莊士民, 王 凱, 黎景佳△
(中山大學(xué)附屬第三醫(yī)院耳鼻咽喉頭頸外科,廣東廣州510630)
表皮生長因子樣結(jié)構(gòu)域7(epidermal growth factor-like domain 7,EGFL7)是由 Soncin 等[1]于 2003年首先發(fā)現(xiàn)的一個(gè)在血管內(nèi)皮細(xì)胞特異性表達(dá)的基因,其編碼蛋白在新生血管“管腔形成”這一關(guān)鍵步驟中發(fā)揮重要作用[2]。在生理情況下,EGFL7在胚胎期、新生兒期的原始內(nèi)皮細(xì)胞、各種血管內(nèi)皮細(xì)胞和妊娠期的子宮中呈高表達(dá),而在幾乎所有成年個(gè)體的成熟組織中EGFL7均表達(dá)下調(diào);某些病理狀態(tài),如腫瘤、血管損傷及炎癥組織中有大量血管新生的現(xiàn)象,其EGFL7的表達(dá)呈明顯上調(diào)[3]。我們前期研究發(fā)現(xiàn),EGFL7在喉鱗狀細(xì)胞癌組織中表達(dá)上調(diào),其表達(dá)水平與喉癌臨床分期、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移和預(yù)后有關(guān),多變量Cox風(fēng)險(xiǎn)比例模型分析表明EGFL7表達(dá)水平是喉癌預(yù)后的獨(dú)立預(yù)測因子,提示EGFL7表達(dá)異常與喉癌的發(fā)生發(fā)展有密切關(guān)系[4]。為進(jìn)一步探討EGFL7表達(dá)對喉癌生物學(xué)行為的影響,本研究擬構(gòu)建穩(wěn)定干擾人EGFL7基因的慢病毒載體,并轉(zhuǎn)染體外培養(yǎng)人喉癌細(xì)胞,為研究EGFL7蛋白參與喉癌發(fā)生發(fā)展的作用機(jī)制奠定基礎(chǔ)。
人胚腎上皮293T細(xì)胞和感受態(tài)大腸桿菌DH5α由中山大學(xué)分子醫(yī)藥生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室提供,人喉表皮樣癌細(xì)胞HEp-2購自中國科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院細(xì)胞資源中心。
pcDNA6.2-GW/EmGFP-miR載體、pcDNA6.2-GW/EmGFP-miR-negative-control載 體、POLOdelivererTM3000、pLenti6.3-MCS/V5-DEST 系列慢病毒表達(dá)載體和慢病毒包裝質(zhì)粒均購自Invitrogen。Polybrene購自Sigma。質(zhì)粒Midi抽提試劑盒購自Qiagen。Blasticidin購自Calbiochem。qPCR SYBR Green Mix購自東盛。DMED培養(yǎng)基、胎牛血清和 Opti-MEM培養(yǎng)基均購自Gibco。
3.1 人EGFL7基因有效干擾靶點(diǎn)的篩選 參考GenBank數(shù)據(jù)庫人EGFL7 cDNA(NM_016215)序列,利用Invitrogen公司的在線設(shè)計(jì)軟件(http://rnaidesigner.invitrogen.com/rnaiexpress/),根據(jù) RNAi設(shè)計(jì)原則[5],設(shè)計(jì)4對EGFL7基因的特異性干擾片段,經(jīng)BLAST分析確認(rèn)其特異性后,由上海銳賽生物技術(shù)有限公司合成。
將合成的4對寡核苷酸的各2條鏈等量混勻,于95℃作用5 min退火,冷卻至室溫形成雙鏈寡核苷酸(ds Oligo),將ds Oligo與線性化的pcDNA6.2-GW/EmGFP-miR RNAi表達(dá)載體連接,轉(zhuǎn)化DH5α感受態(tài)大腸桿菌,經(jīng)壯觀霉素篩選陽性克隆,抽提質(zhì)粒,測序驗(yàn)證插入序列的正確性,4個(gè)候選干擾質(zhì)粒分別命名為pcDNA6.2-GW/EGFL7-1/2/3/4,對照質(zhì)粒為 pcDNA6.2-GW/miR-negative-control。
分別取候選干擾質(zhì)粒和對照質(zhì)粒,采用POLOdelivererTM3000 Transfection Reagent轉(zhuǎn)染293T細(xì)胞,于轉(zhuǎn)染后48 h熒光顯微鏡下觀察EmGFP表達(dá)。從干擾質(zhì)粒轉(zhuǎn)染的293T細(xì)胞中抽提總RNA,Nanodrop核酸定量分析儀測定RNA的濃度。按照Fermentas公司的M-MLV操作說明書進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄,以反轉(zhuǎn)錄的cDNA為模板,采用SYBR Green實(shí)時(shí)熒光定量PCR法分別檢測目的基因的表達(dá)(人EGFL7上游引物5’-GATGGCGGGGTGACACTTG-3’,下游引物5’-CACTGTCCACTCCTGTCGGG-3’;人 GAPDH 上游引物 5’-GGGTGTGAACCATGAGAAGTATG-3’,下游引物 5’-GATGGCATGGACTGTGGTCAT-3’),選取干擾效率最高的質(zhì)粒進(jìn)行后續(xù)實(shí)驗(yàn)。
3.2 人EGFL7基因RNAi慢病毒表達(dá)載體的構(gòu)建
以構(gòu)建好的干擾效率最高的 pcDNA6.2-GW/EGFL7為模板,Lenti-Asc1-F/Lenti-Pme1-R為引物(根據(jù) pLenti6.3-MCS/V5-DEST載體結(jié)構(gòu)設(shè)計(jì)),PCR擴(kuò)增EmGFP-EGFL7-miR片段,使目的片段兩末端分別帶上酶切位點(diǎn)Asc I和Pme I。將EGFL7基因PCR產(chǎn)物和pLenti6.3-MCS/V5-DEST慢病毒載體用Asc I和Pme I分別進(jìn)行酶切,T4 DNA ligase連接上述酶切后的PCR產(chǎn)物及慢病毒載體。將10μL連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化DH5α感受態(tài)大腸桿菌,次日挑取單菌落行菌落PCR,將PCR鑒定呈陽性的克隆接種到LB液體培養(yǎng)基中,搖菌過夜,次日抽提質(zhì)粒,送測序驗(yàn)證,命名為 pLenti6.3-EGFL7-miR。
3.3 慢病毒包裝及滴度測定 用Opti-MEM培養(yǎng)基稀釋EGFL7基因pLenti6.3-EGFL7-miR干擾質(zhì)粒和Packaging Mix(Invitrogen)包裝質(zhì)粒,在 POLOdelivererTM3000 Transfection Reagent介導(dǎo)下轉(zhuǎn)染293T細(xì)胞。37℃、5%CO2條件下培養(yǎng)48 h,熒光顯微鏡下觀察轉(zhuǎn)染效率。收獲含病毒的上清液,4℃、3 000 r/min離心10 min,去除細(xì)胞碎片。用0.45μm醋酸纖維素膜的濾器過濾上清液于Beckman SW28離心管中,每管30 mL病毒上清,然后將2 mL 20%蔗糖溶液(PBS配制)輕輕加入上清液的底部,形成一個(gè)蔗糖墊,4℃、25 000 r/min離心3 h。離心完畢后小心取出超速離心管,小心棄去上清液,留下管底少量的半透明或白色沉淀。將超速離心管倒置在吸水紙上晾干,并用Tip頭吸去管壁上多余的液體。100μL冷PBS重懸,并輕輕吹打溶解沉淀,注意避免產(chǎn)生氣泡,分裝后-80℃保存?zhèn)溆谩?/p>
以5×108/L的密度將293T細(xì)胞接種于24孔板。細(xì)胞換液,將梯度稀釋的含病毒培養(yǎng)基分別加入各孔中,同時(shí)加入8 mg/L polybrene以增加干擾效率。感染24 h后,更換完全培養(yǎng)基于37℃、5%CO2條件下繼續(xù)培養(yǎng)。感染72 h后觀察熒光表達(dá)情況,選取合適稀釋度對應(yīng)的孔,對EmGFP陽性細(xì)胞進(jìn)行計(jì)數(shù),并依此計(jì)算待測慢病毒的滴度。
3.4 穩(wěn)定干擾EGFL7表達(dá)的細(xì)胞株篩選 將處于對數(shù)生長期的HEp-2細(xì)胞以密度5×108/L接種于6孔板,37℃、5%CO2條件下培養(yǎng)待細(xì)胞融合度達(dá)到約30% ~50%,分別用pLenti6.3-EGFL7-miR目的病毒和空白病毒顆粒感染HEp-2細(xì)胞(MOI=10),同時(shí)加入8 mg/L polybrene增強(qiáng)感染。慢病毒感染48~72 h后觀察熒光,感染效率大于70%時(shí),加入6 mg/L殺稻瘟菌素(blasticidin,BSD)進(jìn)行藥物篩選,14 d后挑取單克隆,擴(kuò)大培養(yǎng)。SYBR Green實(shí)時(shí)熒光定量PCR法(參考方法3.1)鑒定EGFL7穩(wěn)定干擾的細(xì)胞,命名為 HEp-2pLenti6.3-EGFL7-miR。
用SPSS 16.0統(tǒng)計(jì)軟件分析。數(shù)據(jù)用均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差(mean±SD)表示,多組間比較采用單因素方差分析(ANOVA)。以P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
針對目的基因EGFL7 cDNA序列,設(shè)計(jì)并合成4對特異性miRNA Oligo,見表1。4對miRNA Oligo退火后形成ds Oligo,與線性化的pcDNA6.2-GW/EmGFP-miR RNAi質(zhì)粒連接,經(jīng)測序驗(yàn)證,質(zhì)粒構(gòu)建成功。
表1 人EGFL7基因4對特異性寡核苷酸干擾序列Table 1.Specific Oligo sequences for human EGFL7 gene RNA interference
4種候選干擾質(zhì)粒和對照質(zhì)粒轉(zhuǎn)染293T細(xì)胞48 h后,熒光顯微鏡下均可觀察到EmGFP表達(dá),見圖1,轉(zhuǎn)染效率達(dá)90%以上。進(jìn)一步采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR法檢測發(fā)現(xiàn),質(zhì)粒pcDNA6.2-GW/EGFL7-1干擾效果欠佳,而質(zhì)粒 pcDNA6.2-GW/EGFL7-2、pcDNA6.2-GW/EGFL7-3 和 pcDNA6.2-GW/EGFL7-4的干擾效應(yīng)均高于50%,其中質(zhì)粒pcDNA6.2-GW/EGFL7-3的干擾效應(yīng)高達(dá)69%,見圖2,故選擇質(zhì)粒pcDNA6.2-GW/EGFL7-3用于后續(xù)實(shí)驗(yàn)。
以干擾效率最高的pcDNA6.2-GW/EGFL7-3為模板,Lenti-Asc1-F/Lenti-Pme1-R為引物,PCR擴(kuò)增EmGFP-EGFL7-miR片段,電泳可見清晰的目的基因條帶,見圖3。EGFL7基因 PCR產(chǎn)物與 pLenti6.3-MCS/V5慢病毒載體經(jīng)雙酶切連接后,轉(zhuǎn)化大腸桿菌,行菌落PCR鑒定陽性克隆(圖4A)。最后,將陽性克隆的菌落接種到LB培養(yǎng)基中,搖菌過夜,抽提質(zhì)粒,再次PCR和酶切鑒定(圖4B),并送測序,證實(shí)干擾靶點(diǎn)插入序列正確。
在 POLOdelivererTM3000介導(dǎo)下將 pLenti6.3-EGFL7-miR重組慢病毒載體和包裝質(zhì)粒共轉(zhuǎn)染293T細(xì)胞,熒光顯微鏡觀察可見大量綠色熒光蛋白的表達(dá)。收集并濃縮病毒后,經(jīng)逐孔稀釋滴度測定法測定病毒滴度為5×1011TU/L。
分別用pLenti6.3-EGFL7-miR病毒和空白病毒感染HEp-2細(xì)胞,于感染后48~72 h加入BSD進(jìn)行藥物篩選,2周后篩選出穩(wěn)定克隆,見圖5。采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR法檢測證實(shí),穩(wěn)定干擾EGFL7基因表達(dá)的HEp-2細(xì)胞與空白病毒穩(wěn)轉(zhuǎn)株細(xì)胞相比,EGFL7 mRNA表達(dá)下降了97%,干擾效果明顯(P<0.05),見圖6。
Figure 1.GFP expression in 293T cells 48 h after transfection(×10).A:non-transfection group;B:negative control group;C:pcDNA6.2-GW/EGFL7-1 transfection group;D:pcDNA6.2-GW/EGFL7-2 transfection group;E:pcDNA6.2-GW/EGFL7-3 transfection group;F:pcDNA6.2-GW/EGFL7-4 transfection group.圖1 4種候選干擾質(zhì)粒轉(zhuǎn)染293T細(xì)胞48 h后綠色熒光蛋白的表達(dá)
Figure 2.Relative expression of EGFL7 mRNA after transfection.Mean±SD.n=3.*P <0.05 vs negative control group.圖2 4種候選干擾質(zhì)粒對EGFL7 mRNA表達(dá)的影響
Figure 3.PCR results for pcDNA6.2-GW/EGFL7-3 vector.1:marker;2:PCR product of pcDNA6.2-GW/EGFL7-3 plasmid using Lenti-Asc1-F and Lenti-Pme1-R primers.圖3 pcDNA6.2-GW/EGFL7-3載體的PCR結(jié)果
Figure 4.Identification of the constructed pLenti-6.3-EGFL7-miR vector.A:colony PCR for cloned target gene.1:marker;2 ~8:the groups with transformants of pLenti6.3-EGFL7-miR;9:the group with positive control;10:the group with ddH2O.B:enzyme digestion.1:marker;2:pLenti6.3-EGFL7-miR vector digested by Asc I and Pme I.3:negative vector without digestion.圖4 慢病毒載體的PCR和酶切鑒定
Figure 5.GFP expression in HEp-2 cells 2 weeks after pLenti-6.3-EGFL7-miR transfection(×10).A:non-transfection group;B:negative control group;C:pLenti-6.3-EGFL7-miR transfection group.圖5 慢病毒轉(zhuǎn)染HEp-2細(xì)胞經(jīng)BSD篩選2周后綠色熒光蛋白的表達(dá)
Figure 6.Relative expression of EGFL7 mRNA after pLenti6.3-EGFL7-miR transfection.Mean ±SD.n=3.*P <0.05 vs negative control group.圖6 慢病毒穩(wěn)定轉(zhuǎn)染喉癌HEp-2細(xì)胞后EGFL7 mRNA表達(dá)情況
喉癌是頭頸部常見的惡性腫瘤,也是一種主要經(jīng)過淋巴系統(tǒng)轉(zhuǎn)移的惡性腫瘤。雖然近年來診斷和治療水平均有提高,但喉癌患者的5年生存率并無顯著改善[6],腫瘤的局部復(fù)發(fā)、區(qū)域淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移及遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移是影響喉癌患者預(yù)后的主要因素。研究表明具有不同遺傳背景的惡性腫瘤細(xì)胞侵襲轉(zhuǎn)移的步驟基本相似,包括原發(fā)瘤生長、新生血管形成、腫瘤細(xì)胞脫落、血管或淋巴管轉(zhuǎn)移、轉(zhuǎn)移瘤形成等過程。近年來,國內(nèi)外許多學(xué)者從不同的環(huán)節(jié)和角度探討癌細(xì)胞侵襲和轉(zhuǎn)移的發(fā)生機(jī)制,已證實(shí)血管生成參與腫瘤侵襲轉(zhuǎn)移的多個(gè)關(guān)鍵環(huán)節(jié)[7]:不僅原發(fā)瘤的生長依賴血管生成,癌細(xì)胞從原發(fā)灶脫落進(jìn)入循環(huán)系統(tǒng)發(fā)生轉(zhuǎn)移以及新的轉(zhuǎn)移灶生長也依賴血管生成。
EGFL7是血管管腔形成所必需的因子,其缺乏將導(dǎo)致管腔形成受阻,影響血管功能的完善。哺乳動物EGFL7基因?qū)儆谛』蚣易?,Soncin等[1]用EGFL7探針進(jìn)行熒光原位雜交(FISH)染色顯示人類和小鼠的EGFL7基因分別定位于9號和2號染色體上,編碼一個(gè)相對分子量為30 kD的蛋白,發(fā)揮調(diào)節(jié)內(nèi)皮細(xì)胞黏附、指導(dǎo)內(nèi)皮細(xì)胞遷徙以及抑制血管平滑肌細(xì)胞遷徙的作用。
最初研究表明,EGFL7是胚胎發(fā)育血管形成過程中必不可少的因子[1];隨后的研究證實(shí),在人、小鼠及斑馬魚胚胎期和新生兒期的原始內(nèi)皮細(xì)胞、各種血管內(nèi)皮細(xì)胞及心內(nèi)膜中均可檢測到EGFL7持續(xù)高水平表達(dá)[3];而在幾乎所有成年個(gè)體的成熟組織中EGFL7均表達(dá)下調(diào),在成年小鼠的一些富含血管的器官如肺臟、心臟和腎臟中有部分血管持續(xù)性表達(dá)EGFL7,可能與這些器官在出生后仍然有血管生成和改建有關(guān);在一些增殖性組織,如腫瘤、血管損傷、妊娠期子宮及炎癥組織[8-9]中出現(xiàn)大量血管新生的現(xiàn)象,其EGFL7的表達(dá)呈明顯上調(diào)。我們研究發(fā)現(xiàn),喉癌組織中EGFL7表達(dá)較癌旁非腫瘤喉黏膜組織上調(diào),且其表達(dá)水平與腫瘤臨床分期、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移和預(yù)后有關(guān),是喉癌預(yù)后的獨(dú)立預(yù)測因子[4]。然而,EGFL7究竟在喉癌的發(fā)生發(fā)展中發(fā)揮怎樣的功能,仍不清楚,因此本研究通過構(gòu)建EGFL7基因的RNA干擾(RNA interference,RNAi)載體及穩(wěn)定干擾其表達(dá)的喉癌細(xì)胞克隆亞系,為今后進(jìn)一步開展其功能研究奠定基礎(chǔ)。
RNAi是正常生物體內(nèi)抑制特定基因表達(dá)的一種現(xiàn)象,是指在進(jìn)化過程中高度保守的、由雙鏈RNA誘發(fā)的、同源mRNA高效特異性降解的現(xiàn)象[10]。隨著分子生物學(xué)技術(shù)的發(fā)展,RNAi被廣泛用于特定基因表達(dá)的抑制及“滅活”,成為研究特定基因功能的有效工具[11]。體內(nèi)RNAi表達(dá)載體有質(zhì)粒載體和病毒載體2種,其中病毒載體既能轉(zhuǎn)染分裂細(xì)胞,亦可轉(zhuǎn)染靜止細(xì)胞,既可以瞬時(shí)轉(zhuǎn)染也可以穩(wěn)定轉(zhuǎn)染、并且能提供高的轉(zhuǎn)染效率(接近100%)[12],因此在實(shí)驗(yàn)研究中得到廣泛應(yīng)用。
目前主要有4種類型的病毒載體[13]:逆轉(zhuǎn)錄病毒載體(包括慢病毒載體)、腺病毒載體、腺相關(guān)病毒載體和單純皰疹病毒載體。慢病毒載體是以HIV-1為基礎(chǔ)發(fā)展起來的基因治療載體。有別于一般的逆轉(zhuǎn)錄病毒載體,慢病毒載體是目前感染效率最高的載體,其又可分為整合型載體和非整合型載體兩種不同的類型。整合型慢病毒載體具有將目的基因整合至靶細(xì)胞基因組,可長期表達(dá)、免疫反應(yīng)小等特點(diǎn)[14]。基于慢病毒載體的上述特點(diǎn),我們采用復(fù)制缺陷型慢病毒作為人EGFL7基因RNAi的載體。
本研究通過生物信息學(xué)方法,針對人EGFL7基因序列,設(shè)計(jì)并合成4對EGFL7基因特異性干擾片段,構(gòu)建并篩選出干擾效率最高的質(zhì)粒,再與慢病毒載體進(jìn)行重組,成功構(gòu)建出EGFL7的RNAi慢病毒載體,病毒滴度達(dá)5×1011TU/L。pLenti6.3-EGFL7-miR病毒感染喉癌細(xì)胞HEp-2,經(jīng)BSD篩選2周得到穩(wěn)轉(zhuǎn)株,采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測顯示穩(wěn)定干擾EGFL7基因表達(dá)的HEp-2細(xì)胞與空白病毒穩(wěn)轉(zhuǎn)株細(xì)胞相比,EGFL7 mRNA表達(dá)下降了97%,干擾效果明顯。本研究中穩(wěn)定干擾EGFL7表達(dá)喉癌細(xì)胞亞系的建立為今后深入探討EGFL7蛋白的功能及其與喉癌發(fā)展發(fā)生的關(guān)系奠定了基礎(chǔ)。