馮勁松,李瑋,劉燕,熱米拉,周文文,鄭曉冬
(浙江大學(xué) 生物系統(tǒng)工程與食品科學(xué)學(xué)院,浙江 杭州,310058)
有效霉素A(Validamycin A)又被稱作井岡霉素,是一種安全高效的抗真菌抗生素。目前在我國以及東南亞各主要糧食產(chǎn)區(qū),有效霉素A 作為一種優(yōu)質(zhì)農(nóng)藥在防治水稻、玉米以及小麥紋枯病方面取得了顯著的成效[1]。另外,作為合成抗糖尿病臨床藥物阿卡波糖(拜糖平)和伏格列波糖(倍欣)的重要原料,有效霉素A 的發(fā)酵生產(chǎn)在醫(yī)藥領(lǐng)域也受到了廣泛關(guān)注[2]。目前工業(yè)化發(fā)酵采用的菌株是上海農(nóng)藥所報道的吸水鏈霉菌5008 變種(Streptomyces hygroscopicus 5008),盡管自70 年代開始該菌株使用已有近40 年,但其代謝產(chǎn)物有效霉素A 仍是最為有效、應(yīng)用面積最廣的農(nóng)用抗生素?,F(xiàn)階段我國的年需求量超過6萬t,年產(chǎn)值超5 億元[3-4]。因此如何提高有效霉素A 產(chǎn)量,降低其生產(chǎn)成本仍是當(dāng)前研究的熱點問題。
氨基酸作為重要的生物小分子,在微生物發(fā)酵過程中對菌體生長以及抗生素合成起著關(guān)鍵性作用。作為抗生素合成的前體物質(zhì),氨基酸可以直接參與到抗生素合成途徑中參與合成反應(yīng);氨基酸或其功能肽結(jié)構(gòu)可以作為抗生素合成過程的激活劑或抑制劑對代謝途徑中關(guān)鍵酶的活力進行調(diào)節(jié);作為氮源,培養(yǎng)基中氨基酸的種類與含量也會影響菌體的生長速率;而作為兩性小分子,氨基酸的水解產(chǎn)物會造成培養(yǎng)基中pH 波動,改變微生物的生長環(huán)境。
在發(fā)酵過程中添加氨基酸促進發(fā)酵產(chǎn)量的方法已在很多微生物中進行了應(yīng)用[5-8]。Cheng 等[9]發(fā)現(xiàn)在培養(yǎng)基中添加氨基酸會對鏈霉菌生長以及次級代謝產(chǎn)物合成有著顯著的影響。在吸水鏈霉菌5008的發(fā)酵過程中,其次級代謝物-有效霉素A 的合成會受多方面因素的影響[10-11]。汪世山等[12]利用響應(yīng)面實驗證實以黃豆餅粉作為氮源時,有效霉素A 產(chǎn)量會顯著提高。隨后Wei 等[13]進一步驗證了氮源的種類與含量對有效霉素A 產(chǎn)量影響的作用。有效霉素A 作為氨基糖苷類抗生素,其生物合成必定需要結(jié)合氮源提供的氨基以完成結(jié)構(gòu)轉(zhuǎn)化,所以氨基酸對其生物合成尤為重要,但目前對氨基酸影響有效霉素A 生物合成的研究十分有限。本實驗通過在搖瓶中添加9 種不同種類的氨基酸,研究其對有效霉素A發(fā)酵過程的影響,以便系統(tǒng)地闡述氨基酸對吸水鏈霉菌5008 生長及代謝產(chǎn)物積累的作用,為深入研究有效霉素A 合成過程中氨基的來源提供了實驗依據(jù)。
實驗菌種為吸水鏈霉菌5008(S. hygroscopicus 5008),孢子懸浮于25%甘油中,-20℃保存。
產(chǎn)孢平板培養(yǎng)基(SFM)(g/L):黃豆餅粉20、甘露醇20、瓊脂20。
種子培養(yǎng)基(g/L):玉米粉30、黃豆餅粉22、酵母提取物10、NaCl 2、KH2PO40.8。
發(fā)酵培養(yǎng)基(g/L):玉米粉100、黃豆餅粉25、酵母提取物5、NaCl 1、KH2PO41.5。
種子培養(yǎng):在250 mL 搖瓶中裝入50 mL 種子培養(yǎng)基,121℃滅菌20 min。在超凈工作臺中,接種0.1 mL 孢子懸浮液。培養(yǎng)溫度37℃,轉(zhuǎn)速220 r/min,培養(yǎng)時間1d。
發(fā)酵培養(yǎng):在250 mL 搖瓶中裝入50 mL 發(fā)酵培養(yǎng)基,121℃滅菌20 min。在超凈工作臺中,接種5 mL 種子培養(yǎng)液。在接種12 h 后,在超凈臺中將滅菌好的氨基酸按照1、10、100 mmol/L 的終濃度加入到發(fā)酵培養(yǎng)基中。每隔24 h,用滅菌槍頭對同一發(fā)酵條件下的3 個搖瓶進行取樣,每次吸取2 mL 培養(yǎng)液于離心管中用于后續(xù)檢測。培養(yǎng)溫度37℃,轉(zhuǎn)速220 r/min,培養(yǎng)時間5d。
1.3.1 有效霉素A 產(chǎn)量測定
本研究結(jié)合相關(guān)文章報道,以0 ~20 g/L 濃度范圍的有效霉素A 純品溶液制作標(biāo)準(zhǔn)曲線,采用高效液相色譜法(HPLC)測定有效霉素A 產(chǎn)量[11]。
吸取2 mL 發(fā)酵液于離心管,10 000 g 離心5 min,吸取0.5 mL 上清液于新離心管。加入0.5 mL氯仿,劇烈振蕩直至形成乳濁液。將乳濁液常溫靜置15 min,12 000 g 離心5 min。上清液用0.22 μm 微孔濾膜過濾,待測。配制液相磷酸鹽溶液:吸取7.8 g/L的NaH2PO4·2H2O 溶液51 mL,吸取17.9 g/L 的Na2HPO4·12H2O 溶液49 mL,去離子水定容到1 000 mL,調(diào)節(jié)pH 到7.0。溶液用0.22 μm 濾膜抽濾后超聲30 min,待用。色譜柱采用Elite Hypersil ODS2 C18column (250 mm×4.6 mm,5 μm),檢測波長為210 nm,流動相為98%的磷酸鹽緩沖液與2%的甲醇,流速為1 mL/min,柱溫為35℃,出峰時間約為8 min。
1.3.2 菌體生長量測定
由于發(fā)酵培養(yǎng)基中用作營養(yǎng)物質(zhì)的玉米粉和黃豆餅粉都是實際生產(chǎn)中使用的固體顆粒材料,所以常規(guī)的干重法并不能準(zhǔn)確反映菌體生長的情況。本實驗采用Bradford 法測量細菌裂解后的蛋白量來反映菌體生長[11-14]。
1.3.3 殘?zhí)呛繙y定
通過計算培養(yǎng)基中各組分的含糖量(玉米粉82.92%,黃豆餅粉24.57%,酵母粉25.89%),得出培養(yǎng)基的初始糖濃度為90.35 g/L,并采用苯酚-濃硫酸法測定殘?zhí)呛浚?0],以反映培養(yǎng)基中總糖利用情況。
1.3.4 三磷酸甘油醛脫氫酶( GAPDH) 與葡萄糖-6-磷酸脫氫酶( G6PD) 活力測定
G6PD 的測定方法參照Lee 的報道并進行修改[15]。GAPDH 的測定方法參照Ralser 和Griffiths 的報道[11,16]。
以上數(shù)據(jù)均是取自3 個獨立樣本的平均值,在SPSS 軟件中采用獨立樣品t 檢驗對數(shù)據(jù)的差異性進行分析,如果P值小于0.05,差異被認為是顯著的。
不同種類、不同添加量的氨基酸添加發(fā)酵實驗結(jié)果如圖1 所示。
圖1 不同氨基酸添加量對有效霉素產(chǎn)量的影響Fig.1 Effect of additive amounts of different amino acids on Val-A production
圖1 結(jié)果表明,所有氨基酸添加發(fā)酵實驗中,當(dāng)氨基酸添加濃度只有1 mmol/L 時,與對照組相比,有效霉素A 產(chǎn)量受到的影響有限;而當(dāng)氨基酸添加濃度達到10 mmol/L 時,除去半胱氨酸與甲硫氨酸添加組,其余組中有效霉素A 產(chǎn)量都有明顯的上升;當(dāng)氨基酸添加濃度提高至100 mmol/L,發(fā)酵產(chǎn)量并未有更為明顯的升高,這說明10 mmol/L 的氨基酸濃度是促進有效霉素A 產(chǎn)量的閾值濃度,并且從成本角度考慮也認為10 mmol/L 是氨基酸添加發(fā)酵策略的最適添加濃度。這一現(xiàn)象與Stirrett[8]和Bouras[17]的研究結(jié)果類似,他們發(fā)現(xiàn)添加氨基酸對抗生素產(chǎn)量的提升作用存在最適濃度,當(dāng)添加量超過這一濃度時,次級代謝產(chǎn)物產(chǎn)量并不會再有顯著提升。隨后在最適添加濃度下,對氨基酸影響有效霉素A 產(chǎn)量的結(jié)果進行分類分析。
在測試的氨基酸中,精氨酸和賴氨酸為堿性。氨基酸;天冬氨酸和谷氨酸為酸性氨基酸;半胱氨酸為極性中性氨基酸;亮氨酸、異亮氨酸、甘氨酸和蛋氨酸均為非極性中性氨基酸。由表1 可知,9 種氨基酸中僅有半胱氨酸對有效霉素產(chǎn)量沒有影響,其他8 種氨基酸均有顯著影響。除甲硫氨酸對有效霉素A 合成表現(xiàn)出較強的抑制作用,其余7 種氨基酸均表現(xiàn)出顯著的促進作用。其中異亮氨酸與亮氨酸對產(chǎn)量提升促進作用最大,與對照相比,分別使有效霉素A 產(chǎn)量提高了48%和43%。根據(jù)氨基酸的酸堿性對有效霉素A 產(chǎn)量影響進行分類分析,結(jié)果顯示中性氨基酸效果最優(yōu),其次為酸性氨基酸,堿性氨基酸效果最差。根據(jù)Jin 等[18]報道,當(dāng)發(fā)酵環(huán)境中pH 較低時會降低有效霉素A 的終產(chǎn)量,但我們通過添加強酸弱堿鹽和強堿弱酸鹽調(diào)節(jié)發(fā)酵過程中pH 模擬該報道結(jié)論,最終產(chǎn)量結(jié)果并未顯示出與氨基酸添加實驗相同的效果,而且氨基酸添加實驗中2 種含硫的中性氨基酸,甲硫氨酸與半胱氨酸也未對有效霉素A 產(chǎn)量產(chǎn)生促進作用,所以推測氨基酸引起的pH 變化并不是影響有效霉素A 產(chǎn)量的唯一因素。
表1 不同種類氨基酸對有效霉素產(chǎn)量的影響Table 1 Effect of different kinds of amino acids on Val-A production
在抗生素發(fā)酵過程中加入前體氮源物質(zhì)提高發(fā)酵效價的報道中,代煥梅等[19]發(fā)現(xiàn)添加絲氨酸會促進菌體生長并提高寧南霉素產(chǎn)量;胡景等[20]發(fā)現(xiàn)在添加氨基酸之后,阿維菌素的產(chǎn)量會隨著菌體生長的促進而得到提高。在確定了氨基酸的最適添加濃度和其對產(chǎn)量影響作用后,我們對10 mmol/L 添加濃度下不同種類氨基酸對菌體生長和糖利用的影響進行考察,如表2 所示,盡管氨基酸會對有效霉素A 產(chǎn)量產(chǎn)生影響,但是與對照組相比,所有氨基酸添加組中鏈霉菌生物量積累并無顯著差異,且整個過程中糖利用也未呈現(xiàn)顯著變化。由此可見,氨基酸添加對有效霉素A 產(chǎn)量的提升作用,不是通過增加細胞量或提高糖利用率實現(xiàn)的,而是通過調(diào)節(jié)胞內(nèi)碳源流向,促進單位細胞中有效霉素A 的合成效率,進而實現(xiàn)了對有效霉素A 產(chǎn)量的提升作用。
表2 不同種類氨基酸對蛋白積累和糖利用的影響Table 2 Effect of different kinds of amino acids on protein accumulation and sugar utilization
曾有報道指出[21]在酵母發(fā)酵過程中經(jīng)過脫氨作用的氨基酸碳骨架可經(jīng)特定的分解代謝途徑直接進入三羧酸循環(huán)(TCA),導(dǎo)致碳代謝流在3-磷酸甘油醛節(jié)點處發(fā)生轉(zhuǎn)移,進而影響次級代謝。由圖2 所示,在吸水鏈霉菌5008 中,磷酸戊糖途徑(PPP)是合成有效霉素A 前體物質(zhì)7-磷酸景天庚酮糖的主要代謝途徑,作為限速酶,6-磷酸葡萄糖脫氫酶(G6PD)的活力直接影響磷酸戊糖途徑中有效霉素A 前體的積累量。此外,糖酵解途徑(EMP)作為胞內(nèi)主要供能途徑與PPP 途徑對碳源存在著競爭關(guān)系,三磷酸甘油醛脫氫酶(GAPDH)是催化EMP 途徑中關(guān)鍵反應(yīng)的限速酶,因此其活力不僅會直接影響菌體生長也會間接影響有效霉素A 前體的合成。我們選定對有效霉A 素產(chǎn)量有明顯影響作用的異亮氨酸與甲硫氨酸發(fā)酵組,對其碳代謝途徑中關(guān)鍵酶活力進行了檢測,以反映氨基酸對碳代謝的影響。
圖2 碳代謝與有效霉素A 合成的關(guān)系Fig. 2 Relationship between carbon metabolism and Val-A biosynthesis
由圖3a 所示,異亮氨酸組中,G6PD 活力在發(fā)酵初期就呈現(xiàn)出明顯的升高,在24 h,酶活力提高了41%,在48 h,酶活力也有24%的提高。而甲硫氨酸組卻在48 h 使G6PD 活力抑制了11%。當(dāng)發(fā)酵進入穩(wěn)定期后,菌體生長停滯,所有發(fā)酵組中G6PD 活力大幅度下降,與對照相比不再有差異。與G6PD 相比,作為主要供能途徑的限速酶,GAPDH 在整個生長周期中都保持著較高的活性。由圖3b 所示,氨基酸添加對GAPDH 活力影響不大。在菌體生長前期,GAPDH 活力并沒有展現(xiàn)出與對照組的區(qū)別。但是當(dāng)菌體生長到48 h 向穩(wěn)定期過渡階段,異亮氨酸組中GAPDH 活力開始下降,到72 h,異亮氨酸組中GAPDH 活力受到明顯抑制,與對照組相比其活力降低了13%,到96 h,抑制解除,所有組中GADPH 活力一致。
結(jié)合2 種酶活力變化的結(jié)果分析,異亮氨酸在發(fā)酵初期就對PPP 途徑有明顯的促進作用,但在對數(shù)生長階段并沒有抑制EMP 途徑,所以菌體生長沒有受到影響,當(dāng)進入穩(wěn)定期,菌體內(nèi)次級代謝逐漸增強,在這一階段異亮氨酸抑制了EMP 途徑的活力,使碳代謝從EMP 途徑流向PPP 途徑,促進了有效霉素A前體的轉(zhuǎn)化,提高了有效霉素A 生物合成的效率。而甲硫氨酸在發(fā)酵初期便對PPP 途徑有明顯的抑制作用,但在整個發(fā)酵周期中對EMP 途徑的活力并沒有影響,其通過抑制有效霉素A 合成前體的積累,降低了有效霉素A 的產(chǎn)量。由此推測,氨基酸都是通過調(diào)節(jié)碳代謝途徑中關(guān)鍵酶活力,影響有效霉素A合成前體7-磷酸景天庚酮糖的積累量,從而造成對有效霉素A 生物合成的影響作用(包括異亮氨酸的促進作用與甲硫氨酸的抑制作用)。
圖3 氨基酸對碳代謝途徑的影響Fig.3 Effect of amino acids on carbon metabolic pathway
本研究將不同種類氨基酸添加到吸水鏈霉菌5008 發(fā)酵過程中并對其影響進行檢測,進一步探索了氮源種類和含量對有效霉素A 產(chǎn)量的影響作用,通過篩選氨基酸添加量,發(fā)現(xiàn)氨基酸添加的最適閾值濃度,根據(jù)氨基酸的酸堿性,將其影響進行分類分析,在添加氨基酸的發(fā)酵實驗中,除去半胱氨酸與甲硫氨酸,其余各組都展現(xiàn)了對有效霉素A 產(chǎn)量顯著的促進作用。雖然中性氨基酸會優(yōu)于酸性與堿性氨基酸,但是2 種含硫的中性氨基酸-半胱氨酸與甲硫氨酸并沒有提高有效霉素A 的產(chǎn)量,說明氨基酸引起的pH變化并不是導(dǎo)致有效霉素A 產(chǎn)量提高的原因。隨后為了進一步探索氨基酸的影響作用,對菌體生長和糖利用情況進行了檢測,結(jié)合對碳代謝關(guān)鍵酶活力的分析,發(fā)現(xiàn)氨基酸是通過調(diào)節(jié)碳代謝途徑的活力,實現(xiàn)了碳源從糖酵解途徑到磷酸戊糖途徑代謝流向的變化,從而造成了有效霉素A 前體積累量的改變,影響有效霉素A 的生物合成。此外在有效霉素A 合成過程中,氮的來源尚不清楚,因而氨基酸還可能以氨基氮形式存在,直接參與到次級代謝產(chǎn)物的合成反應(yīng)中,促進有效霉素A 產(chǎn)量的提高。實驗中發(fā)現(xiàn)2 種含硫氨基酸對有效霉素A 合成并無促進作用,且甲硫氨酸還會顯著降低有效霉素A 的產(chǎn)量,這與氨基酸所攜帶基團有著密切關(guān)聯(lián),還需要進一步實驗加以證實。
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