張新新,游婷,劉海霞,印紅
(河北大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,河北保定 071002)
血藍(lán)蛋白是節(jié)肢動物和軟體動物血淋巴中的含銅呼吸蛋白,脫氧狀態(tài)為無色,結(jié)合氧狀態(tài)為藍(lán)色[1].節(jié)肢動物血藍(lán)蛋白由6個相同或相似的分子質(zhì)量在75ku左右的單體組成[2].一個典型的節(jié)肢動物血藍(lán)蛋白亞基分為3個結(jié)構(gòu)域,第1個結(jié)構(gòu)域包括N端的150~180個氨基酸,由6~7個α螺旋組成,并通過超二級結(jié)構(gòu)形成穩(wěn)定的螺旋束;第2個結(jié)構(gòu)域為活性位點,由4個α螺旋束結(jié)合2個銅離子——CuA和CuB,每個α螺旋有3個His殘基與Cu+結(jié)合,這2個Cu+為血藍(lán)蛋白結(jié)合O2所必需;第3個結(jié)構(gòu)域是C端,主要由β折疊結(jié)構(gòu)組成,進一步折疊反平行的7股β桶超二級結(jié)構(gòu)[3-4].每個亞基的3個結(jié)構(gòu)域在六聚體中有序排列.節(jié)肢動物血藍(lán)蛋白屬于一類蛋白質(zhì)家族,其包括酚氧化酶(phenoloxidases,PO)、甲殼類假血藍(lán)蛋白(crustacean pseudo-h(huán)emocyanins,又名cryptocyanin,PHc或Cc)、昆蟲存儲蛋白(insect storage hexamerins,Hx)、雙翅類六聚蛋白受體(dipteran hexamerin receptors,HxR)[5].血藍(lán)蛋白作為三類呼吸功能蛋白之一,不僅承擔(dān)著氧氣傳輸?shù)墓δ?,而且它還具備能量儲存和免疫防御功能[6-7],血藍(lán)蛋白在實驗中顯示出酚氧化酶活性,甚至可以轉(zhuǎn)化為酚氧化酶[8-10].此外,血藍(lán)蛋白可以結(jié)合蛻皮激素而參與其在血淋巴中的運輸[6,11].研究表明,血藍(lán)蛋白廣泛存在于直翅目昆蟲中,但目前相關(guān)研究非常少,迄今只有Sanchez等[12]在美洲沙漠蝗Schistocercaamericana的胚胎中調(diào)取了Hc1的部分序列,Yin等[13]獲取了東亞飛蝗Locustamigratoria manilensisHc1的完整序列.東亞飛蝗Locustamigratoriamanilensis(Mey.)屬于直翅目Orthoptera,蝗總科Aeridoidea,斑翅蝗科Oedipodidae,飛蝗屬LocustaLinnaeus,是一種重要的農(nóng)業(yè)害蟲,是誘發(fā)蝗災(zāi)的一個重要的蝗蟲種類[14].本實驗以東亞飛蝗Locustamigratoriamanilensis為研究對象,在獲得其Hc1的cDNA完整序列和進行初步分析的基礎(chǔ)上[13],進而構(gòu)建Hc1原核表達(dá)載體,重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化到大腸桿菌BL21(DE3)表達(dá)系統(tǒng)中,SDS-PAGE電泳表明:經(jīng)過IPTG誘導(dǎo),目的基因可以高效表達(dá)[16].同時預(yù)測了LmiHc1蛋白的高級結(jié)構(gòu),以期進一步探討直翅目昆蟲Hc1的功能和作用機理,進而為害蟲的生物防治以及昆蟲資源的開發(fā)利用奠定理論基礎(chǔ).
E.coliTrans1-T1,E.coliBL21(DE3)感受態(tài)細(xì)胞購自北京全式金生物技術(shù)有限公司.原核表達(dá)載體pET-DsbA由河北大學(xué)柳峰松老師惠贈.東亞飛蝗由本實驗室飼養(yǎng).LATaq聚合酶、2 000u核酸分子質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)、T4DNA連接酶(快速連接試劑盒)、BamHⅠ,HindⅢ限制性內(nèi)切酶、DNA瓊脂糖凝膠回收試劑盒為Takara公司產(chǎn)品,異丙基硫代P-D-半乳糖苷(IPTG)為AMRESCO產(chǎn)品,質(zhì)粒小量制備試劑盒、蛋白質(zhì)Marker系TransGen產(chǎn)品,其他試劑均為國產(chǎn)分析純.
1.2.1LmiHc1基因的PCR擴增
取東亞飛蝗成蟲1只,迅速解剖去內(nèi)臟后用液氮冷凍組織,用TRIZOL法提取總RNA.RNA經(jīng)過瓊脂糖凝膠電泳,檢測其完整性以及是否有基因組DNA污染;經(jīng)分光光度計測定其濃度.使用TransScriptTMFirst-Strand cDNA Synthesis SuperMix(TransGen)對RNA進行反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)獲取cDNA.
根據(jù)已提交的LmiHc1基因核苷酸序列(GenBank:HQ213937),用Primer 5.0軟件設(shè)計擴增LmiHc1部分基因的一對特異性引物F和R,F(xiàn):5'-CGGCCTACAAGGCCAAGATGAG-3'(下劃線為BamHⅠ酶切位點)R:5'-CCTTACACCTGCACCTCCTCGA-3'(下劃線為HindⅢ酶切位點).引物由上海生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司合成.PCR擴增預(yù)計總長度為750bp.以東亞飛蝗cDNA為模板,F(xiàn),R為引物擴增LmiHc1部分基因.PCR程序:94℃預(yù)變性3min;PCR擴增:94℃變性30s,65℃退火30s,72℃延伸1min,共30個循環(huán);最后72℃終末延伸10min.10g/L瓊脂糖凝膠電泳檢測所擴增片段的正確性,膠回收試劑盒回收目的片段.
1.2.2 重組質(zhì)粒的構(gòu)建
用試劑盒TaKaRa MiniBEST Plasmid Purification Kit Ver.2.0小量提取質(zhì)粒pET-DsbA.質(zhì)粒pETDsbA和目的基因經(jīng)BamHⅠ和HindⅢ雙酶切,回收酶切片段,T4連接酶試劑盒作用下25℃連接2h,轉(zhuǎn)化宿主菌,雙酶切鑒定篩選出陽性克隆.挑取陽性克隆接種到LA(含100μg/mL氨芐青霉素)液體培養(yǎng)基中,大量增菌后,送往深圳華大基因科技有限公司測序.
1.2.3 pET-DsbA/LmiHc1融合蛋白的誘導(dǎo)表達(dá)
將測序正確的陽性重組子質(zhì)粒分別轉(zhuǎn)化表達(dá)宿主菌E.coliBL21(DE3)感受態(tài)細(xì)胞.篩選轉(zhuǎn)化入重組質(zhì)粒的表達(dá)宿主菌,將其接種于LB/Amp+培養(yǎng)基中,37℃過夜震蕩培養(yǎng),然后取1mL過夜培養(yǎng)物接種于新培養(yǎng)基中,37℃220r/min繼續(xù)培養(yǎng)至OD600≈0.6時,取1mL菌液于Eppendorf管中,離心棄上清液,收集菌體作為空誘導(dǎo)對照.在剩下的菌液中加入IPTG至終濃度為1mmol/L,誘導(dǎo)3h,然后取1mL,離心棄上清液收集菌體沉淀,同時取空載pET-DsbA菌作為陰性對照.向沉淀中加入100μL 2×SDS上樣緩沖液,混勻后沸水浴10min,各取5μL進行質(zhì)量濃度為100g/L的SDS-PAGE電泳以檢測目的蛋白的表達(dá)情況.
對東亞飛蝗cDNA片段進行RT-PCR擴增,PCR產(chǎn)物于10g/L瓊脂糖凝膠電泳,約750bp處可見明亮的特異帶,與預(yù)期條帶大小相符,結(jié)果見圖1.
pET-DsbA質(zhì)粒與LmiHc1PCR擴增產(chǎn)物分別用BamHⅠ、HindⅢ雙酶切,切膠回收后,經(jīng)過10g/L瓊脂糖凝膠電泳檢測,條帶大小正確,且呈現(xiàn)單一條帶,說明雙酶切完全.
隨機挑取6個重組轉(zhuǎn)化的單菌落進行質(zhì)粒提取,經(jīng)過BamHⅠ、HindⅢ雙酶切后電泳檢測,重組質(zhì)粒鑒定后都有750bp左右的目的片段,證明pET-DsbA/LmiHc1原核表達(dá)載體構(gòu)建成功,選取1個質(zhì)粒送測序公司進行測序.
圖1 LmiHc1PCR產(chǎn)物Fig.1 PCR product of LmiHc1
pET-DsbA/LmiHc1轉(zhuǎn)化表達(dá)宿主菌BL21(DE3),經(jīng)過IPTG誘導(dǎo)后,收集菌體沉淀經(jīng)質(zhì)量濃度為100g/L的SDS-PAGE電泳檢測,結(jié)果可見相對分子質(zhì)量25ku處有1條明顯的蛋白條帶,與預(yù)計的融合蛋白分子質(zhì)量大小基本相符,同時作為對照組的pET-DsbA空載體也表達(dá)了分子質(zhì)量約25ku的DsbA蛋白,電泳結(jié)果如圖2所示.
通過前期工作獲得LmiHc1的cDNA完整序列(GenBank:HQ213937)的分析[15],LmiHc1基因全長為2271bp,包含1個2016bp的完整開放閱讀框ORF和1個255bp 3'-UTR,PolyA尾上游15個核苷酸處存在典型的加尾信號AATAAA.
圖2 大腸桿菌BL21(DE3)表達(dá)LmiHc1重組蛋白的SDS-PAGE分析Fig.2 SDS-PAGE analysis of LmiHc1expression of recombinant protein in E.coli BL21(DE3)
蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)(primary structure)是指多肽鏈的氨基酸殘基的排列順序,它是蛋白質(zhì)最基本的結(jié)構(gòu).每一種蛋白質(zhì)分子都有其特有的氨基酸組成和排列順序,由此決定它的特定空間結(jié)構(gòu).
利用Signal P 3.0軟件分析表明,LmiHc1基因編碼的蛋白質(zhì)N端有18個氨基酸的信號肽,成熟蛋白質(zhì)含有654個氨基酸,理論分子質(zhì)量為77.9ku,理論PI為6.06,負(fù)電荷殘基(Asp+Glu)94個(14.0%),正電荷殘基(Arg+Lys)82個(12.2%),疏水性氨基酸(A,I,L,F(xiàn),W,V)有232個,約占34.5%;極性氨基酸(N,C,Q,S,T,Y)150個,占22.3%;在體外哺乳動物網(wǎng)狀細(xì)胞中的估計半衰期為30h,在體外有機體內(nèi)的半衰期大于20h,在大腸桿菌內(nèi)的半衰期大于10h,蛋白的不穩(wěn)定指數(shù)為44.82,屬于不穩(wěn)定蛋白(不穩(wěn)定系數(shù)大于40的為不穩(wěn)定蛋白質(zhì));疏水性指數(shù)為82.93.
蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)(secondary structure)是指氨基酸殘基形成的α螺旋(α-h(huán)elix)、β折疊(β-sheet)、無規(guī)則卷曲(coil)以及基序(motif)等組件.
采用SABLE(http://sable.cchmc.org/)在線工具預(yù)測東亞飛蝗LmiHc1蛋白二級結(jié)構(gòu)(圖3).結(jié)果顯示,LmiHc1蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)為混合型,由α螺旋、β折疊與無規(guī)則卷曲組成.
基于查詢序列與已知蛋白序列顯著的相似性(相似度>30%)預(yù)測其蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)的方法稱為同源建模.Swiss-Model是通過完整的同源建模預(yù)測蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)的在線工具.其基本操作步驟如下:首先同源鑒定,Swiss-Model程序使用BLAST在PDB數(shù)據(jù)庫中篩選出符合P值小于10-5(BLAST)及靶序列一致性不小于30%(SLM)的模板序列用于建模;然后,對所得的多模板進行結(jié)構(gòu)比對,剔除不匹配模板;再根據(jù)模板序列與靶序列的局部一致性原理,由ProModⅡ確定其核心骨架以及環(huán)和側(cè)鏈;最后用Gromos程序進一步優(yōu)化能量.
采用Swiss-Model上提供的第1步模式(First Approach Mode)對LmiHc1蛋白序列進行建模(圖4).提交序列后返回結(jié)果顯示:建模為24~669個氨基酸,參考模板為1hcyC,目標(biāo)蛋白與參考蛋白的序列比對的一致性為43.19%,模型評估E值為0.00e-1.
圖3 預(yù)測LmiHc1蛋白二級結(jié)構(gòu)Fig.3 Secondary structure of LmiHc1
圖4 預(yù)測東亞飛蝗LmiHc1蛋白三級結(jié)構(gòu)Fig.4 Tertiary structure of LmiHc1
利用NCBI的CD search分析血藍(lán)蛋白的結(jié)構(gòu)域(圖5),其中Query seq為LmiHc1氨基酸序列,Specific hits指特異性位點,Superfamilies指節(jié)肢動物血藍(lán)蛋白超家族.結(jié)果顯示LmiHc1含有節(jié)肢動物血藍(lán)蛋白家族蛋白所具有的3個結(jié)構(gòu)域:Hemocyanin_N,Hemocyanin_M,Hemocyanin_C.其中Hemocyanin_M為結(jié)合銅離子的結(jié)構(gòu)域.
圖5 LmiHc1蛋白結(jié)構(gòu)域分析Fig.5 LmiHc1protein domain analysis
血藍(lán)蛋白作為3大類呼吸功能蛋白之一,不僅承擔(dān)著氧氣傳輸?shù)墓δ?,而且還具備能量儲存和免疫防御等功能,血藍(lán)蛋白不僅在實驗中顯示出酚氧化酶活性,甚至可以轉(zhuǎn)化為酚氧化酶;此外,血藍(lán)蛋白可以介導(dǎo)蛻皮激素在血淋巴中的轉(zhuǎn)運并參與調(diào)節(jié)蛻皮.近年來,血藍(lán)蛋白的功能、作用機理、進化地位已經(jīng)引起各國學(xué)者的濃厚興趣,血藍(lán)蛋白的新功能及其作用機理仍有待于進一步挖掘和深究.東亞飛蝗Locustamigratoria manilensis是中國飛蝗的3個亞種之一,中國史籍中的蝗災(zāi),主要是東亞飛蝗,先后發(fā)生過800多次,分布于北緯42℃以南的東部季風(fēng)區(qū)的平原地區(qū),北起河北、陜西、山西,南達(dá)海南、廣東、廣西、云南,東至沿海各省及臺灣,西至四川、甘肅南部[15].為了研究東亞飛蝗血藍(lán)蛋白的結(jié)構(gòu)和功能,本文對東亞飛蝗血藍(lán)蛋白亞基1插入合適的載體后導(dǎo)入大腸桿菌進行重組蛋白表達(dá),并對蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)進行了預(yù)測,結(jié)果LmiHc1可以在大腸桿菌中正常表達(dá),為進一步研究其蛋白結(jié)構(gòu)和功能打下了基礎(chǔ),進而為害蟲的生物防治以及昆蟲資源的開發(fā)利用奠定理論基礎(chǔ).
[1] 李曉燕,孫塞,路軍.血藍(lán)蛋白模型化合物的合成和載氧性能[J].山東大學(xué)學(xué)報:自然科學(xué)版,1994,29(2):96-99.LI Xiaoyan,SUN Sai,LU Jun.Synthesis of hemocyanin model compounds and oxygen carrier performance[J].Journal of Shandong University:Natural Science Edition,1994,29(2):96-99.
[2] HOLDE K E,MILLER K I,DECKER H.Hemocyanins and invertebrate evolution[J].J Biol Chem,2001,276(19):15563-15566.
[3] GAYKEMA W P J,HOL W G J,VEREIFKEN J M,et al.?structure of the copper-containing,oxygen-carrying proteinPanulirusinterruptushaemocyanin[J].Nature,1984,309(5963):23-29.
[4] VOLBEDA A,HOL W G J.Crystal structure of hexameric hemocyanin fromPanulirusinterruptusrefined at 3.2?resolution[J].J Mol Biol,1989,209(2):249-279.
[5] BURMESTER T.Molecular evolution of the arthropod hemocyanin superfamily[J].Mol Biol Evol,2001,18:184-195.
[6] PAUL R J,BERGNER B,et al.Gas transport in the haemolymph of arachnids I.oxygen transport and the physiological role of haemocyanin[J].Exp Biol,1994,188:25-46.
[7] LEI Kaiyun,LI Fang,ZHANG Mingchang,et al.Difference between hemocyanin subunits from shrimpPenaeusjaponicusin anti-WSSV defense[J].Dev Comp Immunol,2008,2(4):10-17.
[8] NAGAI T,KAWABATA S.A link between blood coagulation and prophenoloxidase activation in arthropod host defense[J].J Biol Chem,2000,275:29264-29267.
[9] NAGAI T,OSAKI T,KAWABATA S.Functional conversion of hemocyanin to phenoloxidase by horseshoe crab antimicrobial peptides[J].J Biol Chem,2001,276:27166-27170.
[10] 章躍陵,王三英,劉光明,等.南美白對蝦血藍(lán)蛋白對酚氧化酶活性的影響[J].中國水產(chǎn)科學(xué),2005,12(4):402-406.ZHANG Yueling,WANG Sanying,LIU Guangming,et al.Penaeusvannameihemocyanin effect on phenoloxidase activity[J].Journal of Fisheries of China,2005,12(4):402-406.
[11] JAENICKE E,F(xiàn)êLL R,DECKER H.Spider hemocyanin binds ecdysone and 20-OH-ecdysone[J].J Biol Chem,1999,274(26):34267-34271.
[12] SANCHEZ D,GANFORNINA M D,GUTIERREZ G,et al.Molecular characterization and phylogenetic relationship of a protein with potential oxygen-binding capabilities in the grasshopper embryo.a hemocyanin in insects[J].Molecular Biology and Evolution,1998,15:415-426.
[13] YIN Hong,GUAN Ni,DONG Lijun,et al.Initial analysis of the hemocyanin subunit type 1(Hc1gene)fromLocusta migratoriamanilensis[J].Molecular Biology Reports,2012,39(3):3305-3310.
[14] 朱恩林.中國東亞飛蝗發(fā)生與治理[M].北京:中國農(nóng)業(yè)出版社,1999.ZHU Enlin.The occurrence and treatment of ChinaLocustamigratoriamanilensis[M].Beijing:China Agriculture Press,1999.
[15] 楊美玲.東亞飛蝗對有機磷殺蟲劑的抗性及其機理研究[D].太原:山西大學(xué),2008.YANG Meiling.Study on the resistance and mechanism of organophosphate insecticide forLocustamigratoriamanilensis[D].Taiyuan:Shanxi University,2008.
[16] 柳峰松,李婷,王曉菲,等.中國明對蝦ALFFc基因的原核表達(dá)與抗血清制備[J].河北大學(xué)學(xué)報:自然科學(xué)版,2010,30(1):88-92.LIU Fengsong,LI Ting,WANG Xiaofei,et al.Prokaryotic expression and antiserum preparation of ALFFc in Chinese Shrimp(Fenneropenaeuschinensis)[J].Journal of Hebei University:Natural Science Edition,2010,30(1):88-92.